单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1191 篇文献，本页显示第 281 - 300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals common and unique gene expression profiles in primary CD4+ T cells latently infected with HIV under different conditions
2023, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2023.1286168
PMID:38156317
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了在不同条件下潜伏感染HIV的CD4+ T细胞的基因表达谱 | 研究揭示了在不同条件下潜伏感染HIV的CD4+ T细胞的共同和独特基因表达模式 | NA | 识别潜伏感染HIV的单个CD4+ T细胞的基因表达谱，并探索这些基因表达谱以优先考虑未来实验验证的基因 | 潜伏感染HIV的CD4+ T细胞 | 数字病理学 | HIV | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 282 | 2024-08-07 |
Comparing engineered nuclear-localized reporter cassettes
2023, microPublication biology
DOI:10.17912/micropub.biology.001014
PMID:38021170
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研究论文 | 本文通过CRISPR/Cas9基因编辑技术，为6种不同的神经肽编码基因生成了报告基因等位基因，并比较了不同报告基因盒的表达水平 | 首次比较了不同核定位报告基因盒在神经肽基因表达分析中的应用效果 | NA | 分析神经肽基因表达的动态变化及其调控机制 | 6种不同的神经肽编码基因 | 基因工程 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | 基因表达数据 | 6种不同的神经肽编码基因 |
| 283 | 2024-08-07 |
A Comparison of the Various Methods for Selecting Features for Single-Cell RNA Sequencing Data in Alzheimer's Disease
2023, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-031-31982-2_27
PMID:37486500
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研究论文 | 本文比较了用于阿尔茨海默病中单细胞RNA测序数据特征选择的不同方法 | 本文采用了专门为单细胞RNA测序设计的特征选择算法，并将其应用于阿尔茨海默病的研究 | NA | 研究旨在评估和比较不同标记基因选择方法在阿尔茨海默病中的性能 | 阿尔茨海默病中的单细胞RNA测序数据 | 生物医学研究 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 支持向量机 (SVM), k-最近邻算法 (k-NN), 线性判别分析 (LDA) | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 284 | 2024-08-07 |
Construction and evaluation of endometriosis diagnostic prediction model and immune infiltration based on efferocytosis-related genes
2023, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2023.1298457
PMID:38370978
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研究论文 | 本研究构建并评估了基于吞噬作用相关基因的子宫内膜异位症诊断预测模型及免疫浸润 | 本研究首次识别并验证了与子宫内膜异位症相关的13个吞噬作用相关差异表达基因，并构建了诊断模型 | 研究主要基于公共数据库和机器学习技术，临床样本验证有限 | 旨在识别子宫内膜异位症的诊断标志物并构建诊断模型 | 子宫内膜异位症及其相关的吞噬作用相关基因 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO和SVM回归模型 | 基因表达数据 | 涉及多个公共数据库中的数据集 |
| 285 | 2024-08-04 |
Molecular and spatial signatures of mouse brain aging at single-cell resolution
2023-01-05, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2022.12.010
PMID:36580914
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研究论文 | 本研究生成了小鼠大脑衰老的高分辨率细胞图谱 | 首次通过空间分辨的单细胞转录组学量化了小鼠大脑在衰老过程中细胞类型的基因表达和空间组织变化 | 主要集中在前额叶皮层和纹状体，可能不代表大脑其他区域的变化 | 理解与衰老相关的细胞和分子结构变化机制 | 小鼠大脑的非神经细胞和神经元 | 数字病理学 | 老年疾病 | 空间分辨的单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 多个小鼠样本 |
| 286 | 2024-08-04 |
Reactive astrogliosis in the era of single-cell transcriptomics
2023, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2023.1173200
PMID:37153637
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综述 | 本文概述了通过单细胞转录组学定义的反应性星形胶质细胞群体在多种神经病理中的作用 | 揭示了反应性星形胶质细胞在神经病理中的多样性及其时间和空间上的不同表达模式 | 未详细探讨特定疾病模型中的机制，可能影响对复杂病理的理解 | 探讨反应性星形胶质细胞在不同神经病理中的作用及其转录组特征 | 反应性星形胶质细胞及其在神经病理中的表现 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 多种神经病理的数据集，具体样本量未明确 |
| 287 | 2024-08-07 |
Mechanisms underlying the therapeutic effects of cinobufagin in treating melanoma based on network pharmacology, single-cell RNA sequencing data, molecular docking, and molecular dynamics simulation
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1315965
PMID:38348352
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研究论文 | 本研究旨在预测蟾毒灵在黑色素瘤中的潜在作用靶点，通过网络药理学、单细胞RNA测序数据、分子对接和分子动力学模拟等方法进行分析 | 本研究结合多种先进技术，如单细胞RNA测序和分子动力学模拟，以揭示蟾毒灵治疗黑色素瘤的新机制 | 研究结论缺乏相关实验数据支持，需要进一步实验验证 | 预测蟾毒灵在黑色素瘤中的潜在作用靶点 | 蟾毒灵在黑色素瘤中的作用机制 | 分子生物学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 分子对接, 分子动力学模拟 | NA | 基因表达数据 | 使用GSE46517和GSE215120数据集中的样本 |
| 288 | 2024-08-04 |
A cellular hierarchy of Notch and Kras signaling controls cell fate specification in the developing mouse salivary gland
2023-01-23, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.12.009
PMID:36693323
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研究论文 | 该文章探讨了小鼠唾液腺发育中Notch和Kras信号通路如何控制细胞命运规范。 | 研究首次揭示了在小鼠唾液腺发育过程中，Notch和Kras信号如何通过不同的表达影响细胞谱系的分离和管状模式的形成。 | 该研究主要专注于小鼠模型，尚需验证其在其他物种或人类中的适用性。 | 理解Notch和Kras信号在小鼠唾液腺发育中的作用及其对细胞命运的影响。 | 小鼠唾液腺发育中的细胞谱系及其信号通路。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 三维重构和细胞谱系追踪 | NA |
| 289 | 2024-08-05 |
Spatial Transcriptomics in Kidney Tissue
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3179-9_17
PMID:37423994
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研究论文 | 本文介绍了在肾脏组织中应用空间转录组测序(ST-seq)的方法 | 结合组织学与RNA测序，提供组织内转录组表达的空间背景信息 | 未提及具体的局限性 | 探索空间转录组测序在肾脏组织中的应用 | 小鼠和人类肾脏组织 | 数字病理学 | NA | 空间转录组测序 | NA | 组织样本 | 小鼠和人类肾脏组织样本 |
| 290 | 2024-08-04 |
A Novel Molecular Classification Method for Glioblastoma Based on Tumor Cell Differentiation Trajectories
2023, Stem cells international
IF:3.8Q2
DOI:10.1155/2023/2826815
PMID:37964983
|
研究论文 | 本文提出了一种基于肿瘤细胞分化轨迹的新的胶质母细胞瘤分子分类方法 | 探索了基于单细胞转录组测序(scRNA-seq)数据的分化轨迹推断在胶质母细胞瘤分子分类中的应用 | 该研究仅使用了10个胶质母细胞瘤样本的单细胞数据，并在公共队列中验证其结果 | 研究新的胶质母细胞瘤分子分类，以便于治疗选择和提高癌症患者的反应率 | 10个胶质母细胞瘤样本的单细胞转录组测序数据 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞转录组测序(串行单细胞RNA测序) | NA | 基因表达数据 | 10个胶质母细胞瘤样本 |
| 291 | 2024-08-04 |
Tsp-1+ microglia attenuate retinal neovascularization by maintaining the expression of Smad3 in endothelial cells through exosomes with decreased miR-27a-5p
2023, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.84236
PMID:37441592
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研究论文 | 本文探讨了微胶质细胞通过调节Smad3的表达而影响视网膜新血管生成的机制 | 揭示了Tsp-1/miR-27a-5p/Smad3轴在微胶质细胞相关和外泌体介导的抗血管生成调控中的新机制 | 文章中未提到实验样本的多样性和长期效果的观察 | 研究视网膜微胶质细胞在病理性新血管生成中的作用及其机制 | 小鼠视网膜中微胶质细胞和内皮细胞 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序，外泌体分离，miRNA测序，荧光素酶报告试验 | NA | RNA数据 | 小鼠视网膜样本 |
| 292 | 2024-08-04 |
Ferritin light chain promotes the reprogramming of glioma immune microenvironment and facilitates glioma progression
2023, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.82975
PMID:37441589
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研究论文 | 这篇文章研究了铁蛋白轻链（FTL）如何促进胶质瘤的免疫微环境重编程和胶质瘤进展 | 本研究首次揭示了FTL在胶质瘤免疫微环境中的作用机制，并探索了抑制FTL对改进抗PD-1治疗效果的潜在策略 | 尚不清楚FTL在胶质瘤免疫微环境中的所有调控机制，未来研究需要进一步验证 | 研究FTL在胶质瘤免疫微环境中的作用以及其对胶质瘤进展的影响 | 研究对象为胶质瘤相关的巨噬细胞（TAMs）及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 胶质瘤 | RNA测序 | NA | 生物信息学数据 | 在胶质瘤的TAMs中分析了bulk和单细胞RNA-seq水平的样本 |
| 293 | 2024-08-07 |
Microtubule stabilization targeting regenerative chondrocyte cluster for cartilage regeneration
2023, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.85077
PMID:37351173
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研究论文 | 本研究旨在探索骨关节炎（OA）病理条件下软骨细胞（CHs）再生的潜在机制及其治疗策略 | 发现微管稳定化在促进软骨再生中的作用，并揭示了其通过抑制YAP活性来实现的效果 | NA | 探索软骨细胞在骨关节炎病理条件下的再生机制及其治疗策略 | 从不同OA阶段的人体软骨中分离出的软骨细胞 | NA | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人源性软骨细胞及大鼠软骨损伤模型 |
| 294 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing identifies critical transcription factors of tumor cell invasion induced by hypoxia microenvironment in glioblastoma
2023, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.81407
PMID:37441593
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，研究了低氧微环境对胶质母细胞瘤细胞侵袭的影响，并识别了关键的转录因子 | 提出了一个数据驱动的建模框架CHPF，用于预测细胞低氧状态，并揭示了低氧亚群中具有高度侵袭潜力的关键调控因子 | NA | 阐明低氧对胶质母细胞瘤侵袭的影响 | 胶质母细胞瘤细胞及其在低氧微环境中的侵袭行为 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | 数据驱动的建模框架 | 转录组 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 295 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis of castration-resistant prostate cancers to identify potential biomarkers for diagnosis and prognosis of neuroendocrine prostate cancer
2023, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
PMID:37970364
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研究论文 | 本文通过单细胞分析去势抵抗性前列腺癌，旨在识别神经内分泌前列腺癌的潜在诊断和预后生物标志物。 | 本文首次采用重新聚类特定细胞类型的方法，研究神经内分泌前列腺癌的异质性，并识别出三种神经内分泌状态，其中N-Myc和REST在介导谱系可塑性和分类神经内分泌表型中起中心作用。 | 文章指出，前列腺癌中神经内分泌细胞的高异质性和低比例限制了传统批量RNA测序和单细胞RNA测序在寻找更好生物标志物方面的应用。 | 识别神经内分泌前列腺癌的潜在诊断和预后生物标志物。 | 去势抵抗性前列腺癌样本中的神经内分泌细胞。 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个去势抵抗性前列腺癌样本 |
| 296 | 2024-08-07 |
Exosomal proteomics identifies RAB13 as a potential regulator of metastasis for HCC
2023-01-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000006
PMID:36633475
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研究论文 | 本研究通过生物信息学方法和体内外实验，首次鉴定了RAB13作为肝细胞癌（HCC）来源外泌体中调控转移的关键蛋白 | 首次发现RAB13在HCC转移中的调控作用，并通过体内外实验验证了其功能 | NA | 探索癌症细胞来源的外泌体蛋白在肿瘤转移中的生物学功能和分子机制 | 肝细胞癌（HCC）的转移机制 | 数字病理学 | 肝癌 | 批量基因表达分析、单细胞RNA测序数据分析、基因集富集分析 | NA | RNA测序数据 | 包括体外HCC细胞系和体内移植瘤小鼠模型 |
| 297 | 2024-08-07 |
A comprehensive single cell data analysis of lymphoblastoid cells reveals the role of super-enhancers in maintaining EBV latency
2023-01, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.28362
PMID:36453088
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据分析了淋巴母细胞中的Epstein-Barr病毒（EBV）生命周期，揭示了超级增强子在维持EBV潜伏期中的作用 | 发现了两个新的细胞簇，它们在EBV裂解基因表达上有所不同，并且通过CRISPR-mediated扰动证明了宿主超级增强子及其目标基因对于维持EBV潜伏期是必需的 | NA | 探究EBV在淋巴母细胞中的生命周期及其与宿主基因表达的关系 | 淋巴母细胞中的Epstein-Barr病毒（EBV） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 九个公开可用的淋巴母细胞系 |
| 298 | 2024-08-04 |
Human neural stem cells restore spatial memory in a transgenic Alzheimer's disease mouse model by an immunomodulating mechanism
2023, Frontiers in aging neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.3389/fnagi.2023.1306004
PMID:38155736
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研究论文 | 这篇文章探讨了人类神经干细胞在阿尔茨海默病模型小鼠中通过免疫调节机制恢复空间记忆的作用 | 研究首次揭示了人类神经干细胞通过调节小胶质细胞介导的神经炎症改善空间记忆的机制 | 该研究未能观察到淀粉样斑块负荷的变化 | 阐明人类神经干细胞在阿尔茨海默病治疗中的作用机制 | 采用5XFAD小鼠模型研究人类神经干细胞的治疗效果 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 研究使用了5XFAD小鼠作为实验对象 |
| 299 | 2024-08-07 |
Loss of Cadherin-11 in pancreatic ductal adenocarcinoma alters tumor-immune microenvironment
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1286861
PMID:37954069
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研究论文 | 研究了Cadherin-11在胰腺导管腺癌中的缺失如何改变肿瘤免疫微环境 | 首次详细阐明了Cadherin-11缺失对胰腺导管腺癌肿瘤微环境的影响，特别是对癌症相关成纤维细胞和免疫细胞的影响 | 研究主要基于小鼠模型，可能与人类胰腺导管腺癌存在差异 | 探讨Cadherin-11缺失对胰腺导管腺癌进展和抗肿瘤免疫反应的影响 | 胰腺导管腺癌中的Cadherin-11及其对肿瘤微环境的影响 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | KPC肿瘤携带的小鼠模型，包括Cadherin-11表达和缺失的小鼠 |
| 300 | 2024-08-07 |
Development and function of chicken XCR1+ conventional dendritic cells
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1273661
PMID:37954617
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序等技术，详细描述了鸡脾脏中XCR1阳性常规树突状细胞的发育和功能 | 首次详细描述了鸡脾脏中XCR1阳性常规树突状细胞的特征，并揭示了其在抗原呈递和T细胞反应中的作用 | NA | 研究鸡脾脏中常规树突状细胞的特征及其在免疫反应中的作用 | 鸡脾脏中的XCR1阳性常规树突状细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | CRISPR-Cas9 | RNA | 鸡脾脏中的多个单细胞样本 |