单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1191 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2024-08-07 |
Acute irradiation causes a long-term disturbance in the heterogeneity and gene expression profile of medullary thymic epithelial cells
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1186154
PMID:38022666
|
研究论文 | 研究急性辐射对髓质胸腺上皮细胞异质性和基因表达谱的长期影响 | 首次展示了急性全身辐射对髓质胸腺上皮细胞异质性和基因表达的长期影响 | 研究仅限于急性辐射后的短期观察，未涉及长期恢复过程的详细分析 | 探讨急性辐射后胸腺恢复过程中髓质胸腺上皮细胞亚群的频率和特性是否恢复 | 髓质胸腺上皮细胞及其在胸腺恢复中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个髓质胸腺上皮细胞样本 |
| 262 | 2024-08-05 |
Integrated single-cell and bulk characterization of cuproptosis key regulator PDHB and association with tumor microenvironment infiltration in clear cell renal cell carcinoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1132661
PMID:37350959
|
研究论文 | 本研究探讨了cuproptosis关键调节因子PDHB在透明细胞肾癌中的生物功能及其与肿瘤微环境浸润的关系 | 揭示了PDHB作为cuproptosis相关中心基因在ccRCC中的重要性，并探讨其在临床治疗中的潜在应用 | 研究可能未深入探讨cuproptosis与其他肿瘤类型的关系 | 旨在发现cuproptosis调节因子的生物学功能，以指导临床治疗 | 主要研究对象为透明细胞肾癌（ccRCC）患者中的PDHB基因 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序和大规模转录组数据 | NA | 基因表达数据 | 包括ccRCC组织和正常配对组织 |
| 263 | 2024-08-04 |
Roles of immune microenvironment in the female reproductive maintenance and regulation: novel insights into the crosstalk of immune cells
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1109122
PMID:38223507
|
研究论文 | 本文探讨了免疫微环境在女性生殖维持与调节中的作用 | 通过单细胞测序技术揭示了免疫细胞的分布图，为免疫细胞在女性生殖中的作用提供了新见解 | 本文未提及具体的实验数据与样本量 | 构建女性生殖过程中免疫微环境的全面描述 | 关注女性生殖过程中免疫细胞的动态作用 | 数字病理学 | 女性生殖健康 | 单细胞测序（scRNA-seq） | NA | NA | NA |
| 264 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing analysis identifies one subpopulation of endothelial cells that proliferates and another that undergoes the endothelial-mesenchymal transition in regenerating pig hearts
2023, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2023.1257669
PMID:38288246
|
研究论文 | 本研究利用自编码器算法分析新生猪心脏中内皮细胞的单核RNA测序数据，识别出五种内皮细胞集群，其中VEC1集群表达增殖相关标记，而VEC3集群富集了调节细胞间连接和促进内皮间质转化的基因 | 首次在再生猪心脏中发现内皮细胞的两种不同响应机制：增殖和内皮间质转化，并揭示了这些过程在心肌再生中的潜在作用 | 研究仅限于新生猪模型，且样本量较小，需要进一步在更多种类的动物模型和更大样本量中验证 | 探讨内皮细胞在心肌再生中的作用及其分子机制 | 新生猪心脏中的内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单核RNA测序 | 自编码器 | RNA测序数据 | 新生猪心脏样本 |
| 265 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA-seq revealing the immune features of donor liver during liver transplantation
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1096733
PMID:36845096
|
研究论文 | 本研究揭示了肝移植过程中供体肝脏的免疫特征 | 使用单细胞RNA测序和TCR/BCR谱序列分析供体肝脏免疫细胞的表达和分布 | 样本数量较少，仅分析了三对供体肝脏的免疫特征 | 探讨肝移植过程中免疫细胞的变化及其与移植排斥反应的关联 | 三对供体肝脏的免疫细胞及其TCR/BCR谱 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和TCR/BCR谱序列 | NA | 转录组数据 | 三对供体肝脏样本 |
| 266 | 2024-08-07 |
Shared immune metabolic reprogramming between COVID-19 patients in the intensive care unit and ischemic stroke: a pilot study
2023, Archives of medical science : AMS
IF:3.0Q1
DOI:10.5114/aoms/172161
PMID:38058697
|
研究论文 | 本研究探讨了COVID-19和缺血性中风之间的共享基因特征 | 通过结合现有的批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，更全面地理解了代谢失调的作用，并使用机器学习方法识别了潜在的诊断模型 | NA | 研究COVID-19和缺血性中风之间的共享基因特征 | COVID-19患者和缺血性中风患者 | NA | COVID-19, 缺血性中风 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | 机器学习 | RNA测序数据 | 19个上调差异表达基因和24个下调基因 |
| 267 | 2024-08-07 |
The immune-metabolic crosstalk between CD3+C1q+TAM and CD8+T cells associated with relapse-free survival in HCC
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1033497
PMID:36845133
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了肝细胞癌（HCC）中免疫细胞间的免疫代谢交叉对话，特别是CD3+C1q+肿瘤相关巨噬细胞（TAM）与CD8+ CCL4+T细胞之间的相互作用。 | 本研究首次鉴定了CD3+C1q+TAM这一新群体，并揭示了其通过C1q信号通路诱导的代谢和表观遗传重编程影响T细胞免疫，进而可能影响肿瘤预后。 | NA | 揭示肝细胞癌中免疫细胞间的免疫代谢交叉对话，并提供调控免疫抑制性肿瘤微环境的策略。 | 肝细胞癌（HCC）中的免疫细胞及其相互作用。 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 组织 | 配对的肿瘤和肿瘤周围组织 |
| 268 | 2024-08-04 |
Distinct roles for interleukin-23 receptor signaling in regulatory T cells in sporadic and inflammation-associated carcinogenesis
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1276743
PMID:38375204
|
研究论文 | 本研究定义了调节性T细胞中IL-23受体信号在散发性和与炎症相关的结直肠癌中的贡献 | 揭示了IL-23R在调节性T细胞中对结直肠癌发展的细胞特异性影响，特别是在炎症相关和散发性癌症中的不同作用 | 研究主要在小鼠模型中进行，可能无法完全反映人类疾病的复杂性 | 阐明IL-23R信号在调节性T细胞中对结直肠癌的作用 | 小鼠中调节性T细胞的IL-23R信号及其在结肠炎相关癌症和散发性结直肠癌中的功能 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因组数据 | 小鼠模型中有多个样本，不同实验组之间的数量未具体说明 |
| 269 | 2024-08-04 |
Evaluation of zero counts to better understand the discrepancies between bulk and single-cell RNA-Seq platforms
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.09.035
PMID:37841335
|
研究论文 | 文章探讨了批量RNA测序与单细胞RNA测序之间的差异以及零计数的影响 | 发现RNA完整性、基因长度及转录本数量对零计数的影响，为跨平台表达偏移修正开发新方法提供了基础 | 仅通过四组配对数据分析，样本量或数据丰富性可能有限 | 旨在理解批量与单细胞RNA测序在表达测量上的差异 | 研究对象为测序平台的技术和生物因素以及基因和生物通路 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | 机器学习模型 | 转录组数据 | 四组配对数据集，每组含多个样本 |
| 270 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing provides novel insights to pathologic pathways in abdominal aortic aneurysm
2023, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2023.1172080
PMID:37288252
|
review | 本文综述了利用单细胞RNA测序技术在腹主动脉瘤发病机制研究中的应用 | 单细胞RNA测序技术提供了无偏见的、全局性的转录组特征视图，有助于识别腹主动脉瘤形成的关键通路 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在腹主动脉瘤分析中的应用趋势和未来潜力 | 腹主动脉瘤的发病机制 | digital pathology | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA |
| 271 | 2024-08-07 |
Cellular and Transcriptional Dynamics during Brown Adipose Tissue Regeneration under Acute Injury
2023, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0268
PMID:38434240
|
research paper | 本文建立了一种新的棕色脂肪组织（BAT）损伤与再生模型（BAT-IR），并通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序研究了BAT在急性损伤后的细胞和转录组动态变化。 | 首次详细描述了BAT在急性损伤后的再生过程，并鉴定了参与再生的特定纤维脂肪生成和髓系祖细胞群。 | NA | 探究棕色脂肪组织在急性损伤后的再生机制。 | 棕色脂肪组织（BAT）及其在急性损伤后的再生过程。 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 272 | 2024-08-05 |
Impact of disulfidptosis-associated clusters on breast cancer survival rates and guiding personalized treatment
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1256132
PMID:38116315
|
研究论文 | 本研究开发了一个与二硫化死亡相关的预后预测工具以指导乳腺癌患者的个性化治疗 | 首次将二硫化死亡及其相关基因与乳腺癌生存率关联，构建了预后模型 | 需要进一步研究以阐明不同风险组的免疫机制 | 研究乳腺癌与二硫化死亡的关系及其对生存率的影响 | 乳腺癌患者的样本数据及相关基因的表达情况 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序和转录组测序 | Cox和Lasso回归模型 | 基因表达数据 | 基于单细胞分析识别的21个细胞簇，包含多种细胞类型 |
| 273 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing analysis of lung cells in COVID-19 patients with diabetes, hypertension, and comorbid diabetes-hypertension
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1258646
PMID:38144556
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序分析了COVID-19患者中糖尿病、高血压及其合并症患者的肺细胞状态 | 首次揭示了SARS-CoV-2感染下糖尿病和高血压患者肺部纤维母细胞亚群的上调现象，并发现了KREMEN1可能是纤维母细胞激活的受体 | 研究仅限于特定的疾病组合和药物治疗效果的初步评估 | 探讨SARS-CoV-2感染下糖尿病、高血压及其合并症患者的肺细胞状态和潜在治疗靶点 | COVID-19患者中糖尿病、高血压及其合并症患者的肺细胞 | 数字病理学 | 糖尿病, 高血压, COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及糖尿病、高血压及其合并症的COVID-19患者肺样本 |
| 274 | 2024-08-04 |
Wnt signal-dependent antero-posterior specification of early-stage CNS primordia modeled in EpiSC-derived neural stem cells
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1260528
PMID:38405136
|
研究论文 | 本文研究了早期中枢神经系统（CNS）前后轴的特征化过程，利用来源于EpiSC的神经干细胞模型。 | 该研究展示了Wnt信号在中枢神经系统前后轴特征化中所起的重要作用，特别是在不同Wnt信号强度影响转瞬细胞的区域特征化方面。 | 研究未展示后续中枢神经系统区域的特征，可能限制了对后部更后部区域的理解。 | 研究中胚胎早期CNS前后规格化过程中的分子机制。 | 使用小鼠源的EpiSC导出的神经干细胞进行实验和分析。 | 数字病理学 | NA | 微阵列和单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 六个神经干细胞系 |
| 275 | 2024-08-07 |
Identification of zona pellucida defects revealed a novel loss-of-function mutation in ZP2 in humans and rats
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1169378
PMID:37293489
|
研究论文 | 本研究通过全外显子测序和桑格测序，在一位具有薄透明带（ZP）表型的不孕女性中鉴定出一个新的ZP2基因无义突变，并探讨了ZP缺陷对卵母细胞基因转录的影响。 | 发现了与薄透明带和自然受精失败相关的新ZP2基因突变，并揭示了ZP完整性破坏对TGF-β信号通路的影响。 | NA | 旨在鉴定导致不孕的ZP2基因致病变异，并研究ZP缺陷对卵母细胞基因转录的影响。 | 不孕女性及其卵母细胞，以及Zp2mut/mut大鼠模型。 | 生殖生物学 | 不孕症 | 全外显子测序，桑格测序，免疫荧光（IF），单细胞RNA测序，定量实时PCR（qRT-PCR） | NA | 基因组数据，转录组数据 | 一位不孕女性，Zp2mut/mut大鼠模型中的卵母细胞 |
| 276 | 2024-08-04 |
Patient-Induced Pluripotent Stem Cell-Derived Hepatostellate Organoids Establish a Basis for Liver Pathologies in Telomeropathies
2023, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2023.06.003
PMID:37302654
|
研究论文 | 研究利用患者诱导多能干细胞衍生的肝星状细胞类器官探讨端粒病中的肝脏病理机制 | 首次利用同源诱导多能干细胞衍生的类器官模型建立端粒病相关肝病的研究基础 | 尚未明确端粒功能障碍引发肝病的具体机制 | 探索端粒病中肝脏病理的机制 | 利用人类诱导多能干细胞研究有端粒病突变的肝脏细胞 | 数字病理学 | 端粒病 | CRISPR/Cas9 | 类器官 | 单细胞转录组数据 | NA |
| 277 | 2024-08-07 |
Integrative analysis implicates the significance of m6A in the liver fibrosis of biliary atresia by regulating THY1
2023-01-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000004
PMID:36633486
|
研究论文 | 本研究全面评估了m6A在胆道闭锁（BA）中的表达情况，并探讨了m6A通过调控THY1在BA引起的肝纤维化中的作用 | 首次揭示了m6A在BA中的重要作用，并提出了通过靶向m6A/THY1轴来缓解BA引起的肝纤维化的新疗法 | NA | 探讨m6A在胆道闭锁肝纤维化中的作用及其调控机制 | m6A在胆道闭锁中的表达及其对THY1的调控作用 | 数字病理学 | 胆道疾病 | 甲基化RNA免疫沉淀测序（MeRIP-seq） | NA | RNA序列 | 涉及大量阵列（GSE46960, GSE15235）和单细胞RNA测序（GSE136103）数据，以及体外培养的LX-2细胞和原代HSCs |
| 278 | 2024-08-07 |
Adult skin fibroblast state change in murine wound healing
2023-01-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-27152-4
PMID:36650180
|
研究论文 | 本研究分析了小鼠正常和受伤皮肤在伤口愈合第4天的单细胞RNA测序数据，以探讨伤口愈合增殖期中成纤维细胞的异质性 | 发现了在受伤皮肤中显著增加的特定成纤维细胞亚群（cluster 3），并识别出可能促进伤口愈合的候选药物 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证这些发现 | 研究伤口愈合过程中成纤维细胞的异质性及其对伤口愈合的影响 | 小鼠正常和受伤皮肤的成纤维细胞 | NA | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 小鼠正常和受伤皮肤的样本 |
| 279 | 2024-08-04 |
A Comprehensive narrative review of transcriptomics and epigenomics of gallbladder cancer
2023-Jan-01, Journal of cancer research and therapeutics
IF:1.4Q4
DOI:10.4103/jcrt.jcrt_1823_23
PMID:38384011
|
review | 本综述分析了胆囊癌的转录组学和表观基因组学研究 | 该文章通过对2010年至2023年间已发布的高通量测序研究的分析，揭示了胆囊癌的基因与表观基因特征 | 当前研究基于已发布的文献，可能会有限制于数据的可用性和质量 | 研究胆囊癌的分子机制，开发诊断生物标志物和靶向治疗方法 | 胆囊癌相关的转录组和表观基因组特征 | 数字病理学 | 胆囊癌 | 下一代测序（NGS），RNA测序，单细胞测序，微阵列技术 | NA | 基因组数据 | NA |
| 280 | 2024-08-07 |
Gut microbiome dysbiosis in men who have sex with men increases HIV infection risk through immunity homeostasis alteration
2023, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2023.1260068
PMID:38035339
|
研究论文 | 本研究旨在比较HIV感染者与男男性行为者（MSM）肠道微生物群变化的差异，并揭示MSM相关肠道微生物群失调对免疫系统的影响 | 本研究首次揭示了MSM相关肠道微生物群失调通过影响免疫稳态增加HIV感染风险 | 需要进一步研究阐明MSM肠道微生物群失调调节HIV易感性的机制 | 比较HIV感染者与MSM肠道微生物群变化的差异，并揭示MSM相关肠道微生物群失调对免疫系统的影响 | HIV感染者与男男性行为者（MSM）的肠道微生物群 | NA | HIV感染 | 生物信息学技术，单细胞RNA测序数据分析 | NA | 基因和代谢物数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |