单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1191 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2024-08-04 |
A spatially resolved atlas of the human lung characterizes a gland-associated immune niche
2023-01, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01243-4
PMID:36543915
|
研究论文 | 本研究通过多组学单细胞和空间转录组学深入分析了健康人类肺部的组织结构和免疫微环境 | 本文发现了新的与腺体相关的免疫细胞栖息地，并对其在呼吸健康中的重要性进行了验证 | 研究主要集中于健康人类肺部，可能不适用于肺病患者的分析 | 重新定义人类肺部和气道的组织结构 | 健康人类肺部的不同位置的单细胞类型及其空间背景 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | NA | 五个健康人类肺部近远区域的位置 |
| 242 | 2024-08-04 |
Single-cell and bulk RNA sequencing analysis of B cell marker genes in TNBC TME landscape and immunotherapy
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1245514
PMID:38111587
|
研究论文 | 本研究旨在通过分析三阴性乳腺癌（TNBC）患者的B细胞标记基因来调查其预后特征 | 建立了基于B细胞标记基因的肿瘤微环境预测模型，以预测TNBC患者的预后和免疫治疗反应 | 鉴于样本量仅限于四个TNBC患者，可能限制了结果的普遍适用性 | 探索三阴性乳腺癌患者的预后特征 | 四名TNBC患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | RNA测序 | NA | 细胞和基因表达数据 | 参与研究的样本量为四名TNBC患者的22,106个细胞和20,556个基因 |
| 243 | 2024-08-04 |
A New Understanding, Guided by Single-Cell Sequencing, of the Establishment and Maintenance of the Ovarian Reserve in Mammals
2023, Sexual development : genetics, molecular biology, evolution, endocrinology, embryology, and pathology of sex determination and differentiation
IF:2.4Q2
DOI:10.1159/000526426
PMID:36122567
|
review | 本综述详细介绍了卵巢储备的建立和维持的关键阶段 | 本文突出了几个重大的单细胞测序研究，这些研究显著推动了我们对卵巢储备新分子调节因子的知识 | NA | 探索与卵巢储备建立和维持相关的细胞和分子动态 | 卵巢中的原始卵泡及其相关阶段 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 244 | 2024-08-07 |
Loss of CFTR function in macrophages alters the cell transcriptional program and delays lung resolution of inflammation
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1242381
PMID:38035088
|
研究论文 | 本文研究了囊性纤维化（CF）中CFTR基因功能丧失对巨噬细胞的影响及其对肺部炎症消退的延迟作用 | 首次报道了CFTR功能丧失在巨噬细胞中引起的细胞转录程序改变，以及这种改变对肺部炎症消退的影响 | NA | 探讨CFTR功能丧失与中性粒细胞性炎症之间的关系 | CFTR基因功能丧失对巨噬细胞和肺部炎症的影响 | NA | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 245 | 2024-08-04 |
Single-cell profiling identifies ACE+ granuloma macrophages as a nonpermissive niche for intracellular bacteria during persistent Salmonella infection
2023-01-06, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.add4333
PMID:36608122
|
研究论文 | 本研究揭示了ACE+ granuloma巨噬细胞在持久性沙门氏菌感染中作为非允许性细胞生态位的作用 | 首次通过单细胞转录组分析揭示了ACE巨噬细胞的功能多样性及其在细菌持久感染中的角色 | 研究仅限于小鼠模型，可能无法完全反映人类感染中的机制 | 探讨巨噬细胞在沙门氏菌持久感染中的功能及其异质性 | 沙门氏菌感染的小鼠模型中的巨噬细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 246 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveals peripheral immune responses in non-segmental vitiligo
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1221260
PMID:38077333
|
研究论文 | 这项研究使用单细胞RNA测序揭示了非分段性白癜风患者的外周免疫反应 | 首次系统性研究了非分段性白癜风患者外周血液中循环免疫细胞的类型和功能 | 样本量较小，仅包括五个白癜风患者和三个健康对照组 | 研究白癜风患者外周免疫反应的机制 | 五个进展性非分段性白癜风患者和三个健康对照者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 白癜风 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 五个白癜风患者，三个健康对照 |
| 247 | 2024-08-07 |
A novel signature predicts prognosis and immunotherapy in lung adenocarcinoma based on cancer-associated fibroblasts
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1201573
PMID:37325647
|
研究论文 | 本研究旨在探讨肺腺癌中癌症相关成纤维细胞（CAFs）的特征，并开发一种风险标志物以预测肺腺癌患者的预后 | 本研究开发了一种新的风险标志物，结合临床病理特征的诺模图，用于预测肺腺癌的预后和免疫治疗反应 | 研究结果需要在体内实验中进一步验证 | 研究肺腺癌中CAFs的特征，并开发一种风险标志物以预测患者的预后 | 肺腺癌中的癌症相关成纤维细胞（CAFs） | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序 | Lasso回归 | RNA测序数据 | 1731个差异表达基因（DEGs）中的492个基因用于构建风险标志物 |
| 248 | 2024-08-07 |
Identification of the immune-associated characteristics and predictive biomarkers of keratoconus based on single-cell RNA-sequencing and bulk RNA-sequencing
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1220646
PMID:37965330
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（bulk RNA-seq）数据，探讨了圆锥角膜（KC）的免疫相关特征及其预测性生物标志物。 | 首次综合利用scRNA-seq和bulk RNA-seq技术，结合机器学习算法，识别出与KC进展相关的关键免疫细胞簇和预测性基因标志物。 | 研究依赖于现有的数据库和公开的测序数据，可能存在样本选择偏倚；机器学习模型的泛化能力需进一步验证。 | 旨在探讨圆锥角膜是否为炎症性疾病，并识别其免疫相关特征和预测性生物标志物。 | 圆锥角膜的免疫细胞簇和相关基因表达模式。 | 数字病理学 | 圆锥角膜 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（bulk RNA-seq） | 随机森林（RF），支持向量机（SVM），最小绝对收缩和选择算子（LASSO）回归分析 | RNA序列数据 | 涉及多个细胞簇和1362个差异表达基因（DEGs） |
| 249 | 2024-08-07 |
Differential in vivo labeling with barcoded antibodies allows for simultaneous transcriptomic profiling of airway, lung tissue and intravascular immune cells
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1227175
PMID:38094305
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于条形码抗体差异标记的方法，用于同时分析气道、肺组织和血管内免疫细胞的转录组特征 | 该方法不仅提供了基本的空间信息，还允许直接比较不同解剖部位的细胞，并且比传统的单细胞RNA测序方法更节省时间和成本 | NA | 开发一种新的方法来同时分析气道、肺组织和血管内免疫细胞的转录组特征 | 气道、肺组织和血管内免疫细胞的转录组特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 在小鼠细菌性肺感染的临床前模型中进行了可行性验证 |
| 250 | 2024-08-05 |
Central role of lung macrophages in SARS-CoV-2 physiopathology: a cross-model single-cell RNA-seq perspective
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1197588
PMID:37350967
|
研究论文 | 本研究探讨了肺巨噬细胞在SARS-CoV-2生理病理学中的核心作用 | 通过跨物种单细胞RNA测序分析揭示了细胞因子产生的巨噬细胞与肺泡细胞在病毒转录本中的主要贡献 | 尚未深入理解细胞因子生产的触发和解决机制，以及其与感染细胞之间的关系 | 研究SARS-CoV-2感染中肺巨噬细胞的作用及其与COVID-19严重性之间的关系 | 主要研究Syrian hamsters和African green monkeys中的巨噬细胞和肺泡细胞 | 数字病理学 | 肺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | Syrian hamsters和African green monkeys的样本 |
| 251 | 2024-08-07 |
A novel DNA damage repair-related gene signature predicting survival, immune infiltration and drug sensitivity in cervical cancer based on single cell sequencing
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1198391
PMID:37449209
|
研究论文 | 本研究基于单细胞测序数据，开发了一种与DNA损伤修复（DDR）相关的基因签名，用于预测宫颈癌（CC）的生存、免疫浸润和药物敏感性。 | 构建了一种新的DDR相关基因签名，该签名在预测宫颈癌预后方面表现优于其他临床特征。 | 需要进一步的实验验证ITGB1在宫颈癌细胞DDR能力中的作用机制。 | 开发一种DDR相关基因签名，用于评估宫颈癌的预后。 | 宫颈癌及其相关的DNA损伤修复机制。 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归分析 | 基因表达数据 | 使用了来自GSE168652和TCGA-CESC队列的数据，具体样本数量未在摘要中明确。 |
| 252 | 2024-08-05 |
Ethylnitrosourea-induced gliomas: a song in the attic?
2023, Aging pathobiology and therapeutics
DOI:10.31491/apt.2023.06.111
PMID:38487310
|
研究论文 | 这篇文章探讨了乙基亚硝脲诱导的胶质瘤及其相关的分子机制。 | 强调了乙基亚硝脲诱导的胶质瘤模型在理解胶质瘤的发展和干预方法方面的重要性，尽管近年来转基因小鼠模型更为流行。 | 关于乙基亚硝脲诱导的胶质瘤的科学价值相对被低估，可能导致其研究受到限制。 | 旨在揭示胶质瘤发生的分子机制并寻找干预措施以减少胶质瘤的发生和生长。 | 研究对象为乙基亚硝脲诱导的胶质瘤动物模型及其细胞过程。 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 空间转录组学 | 实验鼠胶质瘤模型 | NA | NA |
| 253 | 2024-08-07 |
18F-FDG PET Visualizes Systemic STING Agonist-Induced Lymphocyte Activation in Preclinical Models
2023-01, Journal of nuclear medicine : official publication, Society of Nuclear Medicine
IF:9.1Q1
DOI:10.2967/jnumed.122.264121
PMID:35738905
|
研究论文 | 本研究探讨了系统性STING激动剂激活后免疫细胞的代谢变化是否可以通过PET成像技术可视化 | 揭示了STING信号传导与免疫代谢之间先前未知的联系，并提出F-FDG PET可能是一种广泛适用的方法，用于测量系统性STING激动剂的药效学效应 | NA | 研究系统性STING激动剂激活后免疫细胞的代谢变化及其在肿瘤治疗中的应用 | C57BL/6小鼠及携带前列腺或胰腺癌肿瘤的小鼠 | 数字病理学 | 前列腺癌 | F-FDG PET成像 | NA | 单细胞RNA测序和流式细胞术数据 | C57BL/6小鼠及携带前列腺或胰腺癌肿瘤的小鼠 |
| 254 | 2024-08-07 |
Acute irradiation causes a long-term disturbance in the heterogeneity and gene expression profile of medullary thymic epithelial cells
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1186154
PMID:38022666
|
研究论文 | 研究急性辐射对髓质胸腺上皮细胞异质性和基因表达谱的长期影响 | 首次展示了急性全身辐射对髓质胸腺上皮细胞异质性和基因表达的长期影响 | 研究仅限于急性辐射后的短期观察，未涉及长期恢复过程的详细分析 | 探讨急性辐射后胸腺恢复过程中髓质胸腺上皮细胞亚群的频率和特性是否恢复 | 髓质胸腺上皮细胞及其在胸腺恢复中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个髓质胸腺上皮细胞样本 |
| 255 | 2024-08-05 |
Integrated single-cell and bulk characterization of cuproptosis key regulator PDHB and association with tumor microenvironment infiltration in clear cell renal cell carcinoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1132661
PMID:37350959
|
研究论文 | 本研究探讨了cuproptosis关键调节因子PDHB在透明细胞肾癌中的生物功能及其与肿瘤微环境浸润的关系 | 揭示了PDHB作为cuproptosis相关中心基因在ccRCC中的重要性，并探讨其在临床治疗中的潜在应用 | 研究可能未深入探讨cuproptosis与其他肿瘤类型的关系 | 旨在发现cuproptosis调节因子的生物学功能，以指导临床治疗 | 主要研究对象为透明细胞肾癌（ccRCC）患者中的PDHB基因 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序和大规模转录组数据 | NA | 基因表达数据 | 包括ccRCC组织和正常配对组织 |
| 256 | 2024-08-04 |
Roles of immune microenvironment in the female reproductive maintenance and regulation: novel insights into the crosstalk of immune cells
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1109122
PMID:38223507
|
研究论文 | 本文探讨了免疫微环境在女性生殖维持与调节中的作用 | 通过单细胞测序技术揭示了免疫细胞的分布图，为免疫细胞在女性生殖中的作用提供了新见解 | 本文未提及具体的实验数据与样本量 | 构建女性生殖过程中免疫微环境的全面描述 | 关注女性生殖过程中免疫细胞的动态作用 | 数字病理学 | 女性生殖健康 | 单细胞测序（scRNA-seq） | NA | NA | NA |
| 257 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing analysis identifies one subpopulation of endothelial cells that proliferates and another that undergoes the endothelial-mesenchymal transition in regenerating pig hearts
2023, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2023.1257669
PMID:38288246
|
研究论文 | 本研究利用自编码器算法分析新生猪心脏中内皮细胞的单核RNA测序数据，识别出五种内皮细胞集群，其中VEC1集群表达增殖相关标记，而VEC3集群富集了调节细胞间连接和促进内皮间质转化的基因 | 首次在再生猪心脏中发现内皮细胞的两种不同响应机制：增殖和内皮间质转化，并揭示了这些过程在心肌再生中的潜在作用 | 研究仅限于新生猪模型，且样本量较小，需要进一步在更多种类的动物模型和更大样本量中验证 | 探讨内皮细胞在心肌再生中的作用及其分子机制 | 新生猪心脏中的内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单核RNA测序 | 自编码器 | RNA测序数据 | 新生猪心脏样本 |
| 258 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA-seq revealing the immune features of donor liver during liver transplantation
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1096733
PMID:36845096
|
研究论文 | 本研究揭示了肝移植过程中供体肝脏的免疫特征 | 使用单细胞RNA测序和TCR/BCR谱序列分析供体肝脏免疫细胞的表达和分布 | 样本数量较少，仅分析了三对供体肝脏的免疫特征 | 探讨肝移植过程中免疫细胞的变化及其与移植排斥反应的关联 | 三对供体肝脏的免疫细胞及其TCR/BCR谱 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和TCR/BCR谱序列 | NA | 转录组数据 | 三对供体肝脏样本 |
| 259 | 2024-08-07 |
Shared immune metabolic reprogramming between COVID-19 patients in the intensive care unit and ischemic stroke: a pilot study
2023, Archives of medical science : AMS
IF:3.0Q1
DOI:10.5114/aoms/172161
PMID:38058697
|
研究论文 | 本研究探讨了COVID-19和缺血性中风之间的共享基因特征 | 通过结合现有的批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，更全面地理解了代谢失调的作用，并使用机器学习方法识别了潜在的诊断模型 | NA | 研究COVID-19和缺血性中风之间的共享基因特征 | COVID-19患者和缺血性中风患者 | NA | COVID-19, 缺血性中风 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | 机器学习 | RNA测序数据 | 19个上调差异表达基因和24个下调基因 |
| 260 | 2024-08-07 |
The immune-metabolic crosstalk between CD3+C1q+TAM and CD8+T cells associated with relapse-free survival in HCC
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1033497
PMID:36845133
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了肝细胞癌（HCC）中免疫细胞间的免疫代谢交叉对话，特别是CD3+C1q+肿瘤相关巨噬细胞（TAM）与CD8+ CCL4+T细胞之间的相互作用。 | 本研究首次鉴定了CD3+C1q+TAM这一新群体，并揭示了其通过C1q信号通路诱导的代谢和表观遗传重编程影响T细胞免疫，进而可能影响肿瘤预后。 | NA | 揭示肝细胞癌中免疫细胞间的免疫代谢交叉对话，并提供调控免疫抑制性肿瘤微环境的策略。 | 肝细胞癌（HCC）中的免疫细胞及其相互作用。 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 组织 | 配对的肿瘤和肿瘤周围组织 |