单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1189 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2024-08-05 |
Immunologic barriers in liver transplantation: a single-cell analysis of the role of mesenchymal stem cells
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1274982
PMID:38143768
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研究论文 | 本研究分析了可能指示肝移植排斥或耐受的生物标志物及其机制 | 首次探讨了免疫抑制剂与间充质干细胞联合治疗对肝移植耐受性的影响 | 研究仅在特定的动物模型中进行，可能无法完全外推至临床 | 研究肝移植耐受的生物标志物和相关机制 | Lewis-Lewis和F344-Lewis大鼠模型 | 数字病理 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | Lewis-Lewis和F344-Lewis大鼠 |
| 222 | 2024-08-07 |
Comprehensive analyses for the coagulation and macrophage-related genes to reveal their joint roles in the prognosis and immunotherapy of lung adenocarcinoma patients
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1273422
PMID:38022584
|
研究论文 | 本研究通过综合分析凝血和巨噬细胞相关基因，揭示它们在肺腺癌患者预后和免疫治疗中的联合作用 | 构建了一个风险评分模型，用于预测肺腺癌患者的预后和免疫治疗临床结果 | NA | 探索与凝血过程和肿瘤相关巨噬细胞浸润相关的肺腺癌新型生物标志物 | 肺腺癌患者的凝血和巨噬细胞相关基因 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 风险评分模型 | RNA-seq数据 | 涉及33个凝血和巨噬细胞相关基因，其中19个用于构建风险评分模型，最终包含10个与生存相关的基因 |
| 223 | 2024-08-07 |
The Simple prEservatioN of Single cElls method for cryopreservation enables the generation of single-cell immune profiles from whole blood
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1271800
PMID:38090590
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Simple prEservatioN of Single cElls (SENSE)的单步骤全血单细胞冷冻保存方法，用于生成高质量的单细胞免疫图谱。 | SENSE方法简化了传统的多步骤单细胞悬液制备和冷冻保存过程，无需特殊设备和专业人员，提高了T细胞富集度，适用于临床应用。 | SENSE方法在髓系细胞中存在批次效应，需要进一步优化。 | 开发一种简便的单细胞冷冻保存方法，以促进临床转化研究。 | 全血样本中的单细胞悬液及其免疫图谱。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 单细胞数据 | 6份全血样本 |
| 224 | 2024-08-07 |
Distinct regulatory machineries underlying divergent chromatin landscapes distinguish innate lymphoid cells from T helper cells
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1271879
PMID:38106414
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研究论文 | 本研究通过综合分析294个批量RNA测序结果，利用scRNA-seq算法，探讨了先天淋巴细胞（ILCs）与T辅助细胞（Th细胞）在染色质景观和转录调控机制上的差异 | 发现了区分ILCs和Th细胞的两个基因集，以及区分不同免疫反应的三个基因集；通过染色质可及性分析，揭示了ILCs和Th细胞在转录调控上的差异 | NA | 探讨先天淋巴细胞与T辅助细胞在转录调控和染色质景观上的主要区别 | 先天淋巴细胞（ILCs）和T辅助细胞（Th细胞） | 免疫学 | NA | RNA测序（RNA-seq） | scRNA-seq算法 | RNA序列 | 294个批量RNA测序结果 |
| 225 | 2024-08-07 |
The mosquito effect: regulatory and effector T cells acquire cytoplasmic material from tumor cells through intercellular transfer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1272918
PMID:38179041
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研究论文 | 本文介绍了一种新的肿瘤小鼠模型，其中肿瘤细胞表达可溶性超亮荧光蛋白ZsGreen，用于检测和测量肿瘤细胞向浸润免疫细胞的细胞质转移 | 首次提出并命名了肿瘤浸润T细胞的“蚊子效应”，即T细胞通过细胞间转移从肿瘤细胞获取细胞质材料的现象 | 由于缺乏强有力的模型，免疫系统中这种转移的功能影响和分子机制仍大多未知 | 研究肿瘤细胞与免疫细胞间的细胞质转移现象及其对T细胞功能的影响 | 肿瘤细胞、T调节细胞、效应CD8 T细胞及髓系细胞 | 免疫学 | 肿瘤 | scRNA-seq | NA | 荧光蛋白ZsGreen | 小鼠模型 |
| 226 | 2024-08-07 |
Construction of a cross-species cell landscape at single-cell level
2023-01-25, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac633
PMID:35929025
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术构建了跨物种的细胞图谱，涵盖了小鼠、斑马鱼和果蝇等多个生命阶段。 | 首次实现了跨物种的细胞景观动态比较，并识别了生命周期中变化的特征和共同通路。 | NA | 研究不同物种的细胞异质性及其在生命周期中的变化。 | 小鼠、斑马鱼和果蝇的细胞景观。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞数据 | 超过260万个单细胞 |
| 227 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA-seq analyses inform necroptosis-associated myeloid lineages influence the immune landscape of pancreas cancer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1263633
PMID:38149248
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研究论文 | 研究揭示了胰腺癌中与坏死性凋亡相关的髓系细胞谱系对免疫环境的影响 | 首次识别出与坏死性凋亡相关的10个基因以及三种髓系细胞亚群体 | 未提及研究的局限性 | 探讨胰腺导管腺癌中肿瘤浸润髓系细胞的特性和影响 | 16名胰腺导管腺癌患者的肿瘤和正常组织细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | scRNA-seq | NA | 细胞 | 12个原发肿瘤组织和4个转移肿瘤组织，3个正常胰腺组织，以及PBMC样本 |
| 228 | 2024-08-07 |
Myeloid PFKFB3-mediated glycolysis promotes kidney fibrosis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1259434
PMID:38035106
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研究论文 | 本研究探讨了髓系细胞中糖酵解途径在肾脏纤维化发展中的作用 | 首次揭示了髓系细胞中糖酵解途径在肾脏纤维化中的作用，并提出靶向髓系糖酵解是一种新的抑制肾脏纤维化的方法 | 研究主要基于小鼠模型，未来需在人类样本中验证其有效性和安全性 | 研究髓系细胞中糖酵解途径在肾脏纤维化中的作用 | 髓系细胞中的糖酵解途径及其在肾脏纤维化中的作用 | NA | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型中的髓系细胞 |
| 229 | 2024-08-07 |
Chemical immune conization of precancerous cervical lesions awakens immune cells and restores normal HPV negative and abnormal proliferation
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1259723
PMID:38235142
|
研究论文 | 研究使用半抗原增强的肿瘤内化疗（HEIC）治疗宫颈癌前病变和HPV感染的效果 | 提出了一种新的治疗策略，即通过半抗原增强的肿瘤内化疗来激活免疫细胞，防止宫颈癌前细胞的异常增殖 | 研究仅基于单一患者的细胞样本，可能需要进一步的临床试验来验证其普遍性和有效性 | 探讨半抗原增强的肿瘤内化疗对宫颈癌前病变和HPV感染的治疗效果 | 宫颈癌前病变组织和HPV感染 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组 | 40,239个细胞 |
| 230 | 2024-08-07 |
Novel tumor-associated macrophage populations and subpopulations by single cell RNA sequencing
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1264774
PMID:38347955
|
综述 | 本文通过单细胞RNA测序技术探讨了四种新型肿瘤相关巨噬细胞亚群在不同实体瘤中的核心基因特征及其功能 | 利用单细胞RNA测序技术识别与特定功能相关的肿瘤相关巨噬细胞亚群 | 单细胞RNA测序识别的细胞类型和亚群与其实际功能之间可能存在潜在的脱节 | 探讨肿瘤相关巨噬细胞在不同实体瘤中的亚群及其功能 | 肿瘤相关巨噬细胞及其亚群 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 不同实体瘤组织中的多个样本 |
| 231 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals subtype-specific molecular profiles in Nrf2-deficient macrophages from murine atherosclerotic aortas
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1249379
PMID:37965327
|
研究论文 | 本研究分析了小鼠动脉粥样硬化主动脉中缺乏Nrf2的巨噬细胞亚群的转录组 | 揭示了Nrf2缺乏导致的巨噬细胞亚型特异性转录组变化与炎症、铁稳态和细胞损伤或死亡途径之间的联系 | 仅使用了特定的小鼠模型，可能限制了结果的普遍适用性 | 研究Nrf2在小鼠动脉粥样硬化中的具体作用 | 来自小鼠动脉粥样硬化主动脉的不同Nrf2缺乏的巨噬细胞亚群 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA表达数据 | 实验中使用了Cdh5表达细胞中的Nrf2失活小鼠和适当的对照小鼠 |
| 232 | 2024-08-07 |
Entropy sorting of single-cell RNA sequencing data reveals the inner cell mass in the human pre-implantation embryo
2023-01-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2022.09.007
PMID:36240776
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研究论文 | 本文介绍了一种名为熵排序（ES）的数学框架，用于从单细胞RNA测序数据中区分出指示细胞身份的基因，并在人类胚胎植入前阶段的单细胞RNA测序数据中成功识别出内细胞团（ICM）。 | ES方法无需用户定义的显著性阈值，通过量化特征间观察到的相关性是更可能由于随机机会还是依赖关系来区分基因，实现了无监督的细胞身份基因识别。 | NA | 解决单细胞基因表达分析中区分技术或生物噪声与有意义的细胞异质性的挑战。 | 人类胚胎植入前阶段的单细胞RNA测序数据。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 |
| 233 | 2024-08-04 |
A spatially resolved atlas of the human lung characterizes a gland-associated immune niche
2023-01, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01243-4
PMID:36543915
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研究论文 | 本研究通过多组学单细胞和空间转录组学深入分析了健康人类肺部的组织结构和免疫微环境 | 本文发现了新的与腺体相关的免疫细胞栖息地，并对其在呼吸健康中的重要性进行了验证 | 研究主要集中于健康人类肺部，可能不适用于肺病患者的分析 | 重新定义人类肺部和气道的组织结构 | 健康人类肺部的不同位置的单细胞类型及其空间背景 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | NA | 五个健康人类肺部近远区域的位置 |
| 234 | 2024-08-04 |
Single-cell and bulk RNA sequencing analysis of B cell marker genes in TNBC TME landscape and immunotherapy
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1245514
PMID:38111587
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研究论文 | 本研究旨在通过分析三阴性乳腺癌（TNBC）患者的B细胞标记基因来调查其预后特征 | 建立了基于B细胞标记基因的肿瘤微环境预测模型，以预测TNBC患者的预后和免疫治疗反应 | 鉴于样本量仅限于四个TNBC患者，可能限制了结果的普遍适用性 | 探索三阴性乳腺癌患者的预后特征 | 四名TNBC患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | RNA测序 | NA | 细胞和基因表达数据 | 参与研究的样本量为四名TNBC患者的22,106个细胞和20,556个基因 |
| 235 | 2024-08-04 |
A New Understanding, Guided by Single-Cell Sequencing, of the Establishment and Maintenance of the Ovarian Reserve in Mammals
2023, Sexual development : genetics, molecular biology, evolution, endocrinology, embryology, and pathology of sex determination and differentiation
IF:2.4Q2
DOI:10.1159/000526426
PMID:36122567
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review | 本综述详细介绍了卵巢储备的建立和维持的关键阶段 | 本文突出了几个重大的单细胞测序研究，这些研究显著推动了我们对卵巢储备新分子调节因子的知识 | NA | 探索与卵巢储备建立和维持相关的细胞和分子动态 | 卵巢中的原始卵泡及其相关阶段 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 236 | 2024-08-07 |
Loss of CFTR function in macrophages alters the cell transcriptional program and delays lung resolution of inflammation
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1242381
PMID:38035088
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研究论文 | 本文研究了囊性纤维化（CF）中CFTR基因功能丧失对巨噬细胞的影响及其对肺部炎症消退的延迟作用 | 首次报道了CFTR功能丧失在巨噬细胞中引起的细胞转录程序改变，以及这种改变对肺部炎症消退的影响 | NA | 探讨CFTR功能丧失与中性粒细胞性炎症之间的关系 | CFTR基因功能丧失对巨噬细胞和肺部炎症的影响 | NA | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 237 | 2024-08-04 |
Single-cell profiling identifies ACE+ granuloma macrophages as a nonpermissive niche for intracellular bacteria during persistent Salmonella infection
2023-01-06, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.add4333
PMID:36608122
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研究论文 | 本研究揭示了ACE+ granuloma巨噬细胞在持久性沙门氏菌感染中作为非允许性细胞生态位的作用 | 首次通过单细胞转录组分析揭示了ACE巨噬细胞的功能多样性及其在细菌持久感染中的角色 | 研究仅限于小鼠模型，可能无法完全反映人类感染中的机制 | 探讨巨噬细胞在沙门氏菌持久感染中的功能及其异质性 | 沙门氏菌感染的小鼠模型中的巨噬细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 238 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveals peripheral immune responses in non-segmental vitiligo
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1221260
PMID:38077333
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研究论文 | 这项研究使用单细胞RNA测序揭示了非分段性白癜风患者的外周免疫反应 | 首次系统性研究了非分段性白癜风患者外周血液中循环免疫细胞的类型和功能 | 样本量较小，仅包括五个白癜风患者和三个健康对照组 | 研究白癜风患者外周免疫反应的机制 | 五个进展性非分段性白癜风患者和三个健康对照者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 白癜风 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 五个白癜风患者，三个健康对照 |
| 239 | 2024-08-07 |
A novel signature predicts prognosis and immunotherapy in lung adenocarcinoma based on cancer-associated fibroblasts
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1201573
PMID:37325647
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研究论文 | 本研究旨在探讨肺腺癌中癌症相关成纤维细胞（CAFs）的特征，并开发一种风险标志物以预测肺腺癌患者的预后 | 本研究开发了一种新的风险标志物，结合临床病理特征的诺模图，用于预测肺腺癌的预后和免疫治疗反应 | 研究结果需要在体内实验中进一步验证 | 研究肺腺癌中CAFs的特征，并开发一种风险标志物以预测患者的预后 | 肺腺癌中的癌症相关成纤维细胞（CAFs） | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序 | Lasso回归 | RNA测序数据 | 1731个差异表达基因（DEGs）中的492个基因用于构建风险标志物 |
| 240 | 2024-08-07 |
Identification of the immune-associated characteristics and predictive biomarkers of keratoconus based on single-cell RNA-sequencing and bulk RNA-sequencing
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1220646
PMID:37965330
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（bulk RNA-seq）数据，探讨了圆锥角膜（KC）的免疫相关特征及其预测性生物标志物。 | 首次综合利用scRNA-seq和bulk RNA-seq技术，结合机器学习算法，识别出与KC进展相关的关键免疫细胞簇和预测性基因标志物。 | 研究依赖于现有的数据库和公开的测序数据，可能存在样本选择偏倚；机器学习模型的泛化能力需进一步验证。 | 旨在探讨圆锥角膜是否为炎症性疾病，并识别其免疫相关特征和预测性生物标志物。 | 圆锥角膜的免疫细胞簇和相关基因表达模式。 | 数字病理学 | 圆锥角膜 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（bulk RNA-seq） | 随机森林（RF），支持向量机（SVM），最小绝对收缩和选择算子（LASSO）回归分析 | RNA序列数据 | 涉及多个细胞簇和1362个差异表达基因（DEGs） |