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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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201 | 2024-08-04 |
Corrigendum: Application of single-cell sequencing to the research of tumor microenvironment
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1345222
PMID:38116015
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更正 | 本文更正了关于单细胞测序在肿瘤微环境研究中的应用的文章 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
202 | 2024-08-04 |
Identification of TRDV-TRAJ V domains in human and mouse T-cell receptor repertoires
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1286688
PMID:38077312
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研究论文 | 本文描述了在人类和小鼠T细胞受体库中识别含有TRDV基因的两种T细胞受体 | 首次在小鼠和人类中识别到包括TRDV基因的TRA链,展示了这些TRDV基因对TRA多样性的贡献 | TRDV-TRA链在最终结果中被排除,可能导致对其丰富性的低估 | 研究TRDV基因在T细胞受体中的角色及其对TRA多样性的影响 | 人类和小鼠的T细胞受体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 21个来自人类和23个来自小鼠的单细胞RNA-seq数据集 |
203 | 2024-08-04 |
Application of single-cell sequencing to the research of tumor microenvironment
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1285540
PMID:37965341
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综述 | 本文总结了单细胞测序及肿瘤微环境分析的最新进展 | 结合单细胞测序和肿瘤微环境分析为揭示肿瘤发展和进展的分子机制提供了独特机会 | NA | 探讨单细胞测序在肿瘤微环境研究中的应用 | 肿瘤微环境及其与单细胞测序的关系 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因组,转录组和表观基因组 | NA |
204 | 2024-08-04 |
Examining the function of macrophage oxidative stress response and immune system in glioblastoma multiforme through analysis of single-cell transcriptomics
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1288137
PMID:38274828
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研究论文 | 该论文探讨了巨噬细胞在胶质母细胞瘤中的氧化应激反应和免疫系统的功能 | 首次通过单细胞转录组分析揭示了巨噬细胞在胶质母细胞瘤微环境中的中心角色及其潜在的极化机制 | 对现有巨噬细胞在胶质母细胞瘤作用机制的理解仍然有限 | 旨在重新定义胶质母细胞瘤肿瘤核心和周边区域内的细胞景观 | 研究对象为胶质母细胞瘤中的巨噬细胞及其相关亚群体 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | NA | NA |
205 | 2024-08-04 |
Genetic and immunological insights into COVID-19 with acute myocardial infarction: integrated analysis of mendelian randomization, transcriptomics, and clinical samples
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1286087
PMID:38022594
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研究论文 | 本文探讨了COVID-19与急性心肌梗死之间的遗传和免疫学关联 | 采用两样本孟德尔随机化和机器学习发现TLR4和ABCA1作为相关性中心基因,具有高诊断价值 | 未能确认COVID-19与急性心肌梗死之间的直接因果关系 | 理解COVID-19与急性心肌梗死之间的分子机制 | 研究COVID-19患者中急性心肌梗死的遗传和免疫特征 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 机器学习 | 基因组数据, 临床血样本 | 在研究中包含了多样本的RNA-seq数据和临床血液样本 |
206 | 2024-08-07 |
Crosstalk of disulfidptosis-related subtypes, establishment of a prognostic signature and immune infiltration characteristics in bladder cancer based on a machine learning survival framework
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1180404
PMID:37152941
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研究论文 | 本研究探讨了胱硫醚病相关基因(DRGs)对膀胱癌(BLCA)预后的影响,并开发了一种基于机器学习生存框架的预测模型,用于评估患者的预后、免疫特征和治疗反应 | 本研究首次将胱硫醚病相关基因与膀胱癌的预后和免疫浸润特征联系起来,并开发了一种新的预测模型 | NA | 研究胱硫醚病相关基因在膀胱癌中的作用,并开发一种新的预测模型以指导临床管理和个性化治疗 | 膀胱癌患者及其胱硫醚病相关基因的表达和突变特征 | 机器学习 | 膀胱癌 | RNA测序 | 机器学习算法 | RNA-Seq数据 | 三个膀胱癌队列 |
207 | 2024-08-07 |
The slan antigen identifies the prototypical non-classical CD16+-monocytes in human blood
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1287656
PMID:37965335
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研究论文 | 本文通过转录组和蛋白质组分析,研究了人外周血中slan抗原阳性的非经典CD16+单核细胞的特征 | 证明了slan+/NC-单核细胞比slan-/NC-单核细胞更能代表典型的非经典单核细胞 | NA | 探讨slan抗原阳性的非经典单核细胞是否代表典型的非经典单核细胞 | 人外周血中的slan+/NC-和slan-/NC-单核细胞 | NA | NA | RNA测序,蛋白质组分析 | NA | 转录组数据,蛋白质数据 | NA |
208 | 2024-08-07 |
Spatial modelling of the tumor microenvironment from multiplex immunofluorescence images: methods and applications
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1288802
PMID:38179056
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研究论文 | 本文探讨了通过多重免疫荧光(mIF)图像的空间建模方法来研究肿瘤微环境(TME)中的细胞相互作用及其在临床应用中的潜力 | 本文引入了多种数学模型,这些模型最初用于景观生态学和地理信息研究,现在应用于肿瘤微环境分析,以评估细胞群的空间聚集性 | NA | 提高基于免疫疗法的临床试验的成功率 | 肿瘤微环境中的细胞相互作用及其对治疗反应的影响 | 数字病理学 | NA | 多重免疫荧光(mIF) | 数学模型 | 图像 | 组织样本来自基线和治疗期间不同时间点的患者 |
209 | 2024-08-07 |
An integrative analysis of single-cell and bulk transcriptome and bidirectional mendelian randomization analysis identified C1Q as a novel stimulated risk gene for Atherosclerosis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1289223
PMID:38179058
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研究论文 | 本研究通过综合分析单细胞和批量转录组数据,并使用双向孟德尔随机化分析,确定了C1Q作为动脉粥样硬化的新风险基因 | 本研究首次通过单细胞RNA测序和批量RNA分析确定了C1Q相关的关键基因,并使用双向孟德尔随机化分析验证了C1Q与动脉粥样硬化的关联 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序和批量RNA分析确定C1Q相关的关键基因,以更有效地诊断和预测动脉粥样硬化患者,并研究C1Q与动脉粥样硬化(缺血性中风)的关联 | C1Q相关基因在人类动脉粥样硬化斑块中的作用 | 基因组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 机器学习模型 | 转录组数据 | 使用了来自RAW264.7巨噬细胞和apoE-/-小鼠的样本 |
210 | 2024-08-04 |
Integrated analysis of single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq reveals RNA N6-methyladenosine modification associated with prognosis and drug resistance in acute myeloid leukemia
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1281687
PMID:38022588
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研究论文 | 本文探讨了RNA N6-甲基腺苷修饰与急性髓系白血病的预后和耐药性的关系 | 该研究首次揭示了m6A修饰在急性髓系白血病中的作用,识别出与预后相关的特定亚型 | 研究仅基于m6A修饰情况,未深入探讨其他可能影响结果的因素 | 研究m6A修饰模式及其在急性髓系白血病中的临床意义 | 急性髓系白血病患者的细胞样本 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 基于急性髓系白血病患者的样本,具体样本数量未提及 |
211 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing analysis reveals the heterogeneity of IL-10 producing regulatory B cells in lupus-prone mice
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1282770
PMID:38155972
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了易患狼疮小鼠中IL-10产生调节性B细胞的异质性 | 首次详细描述了狼疮易感小鼠中调节性B细胞亚群在疾病进展不同阶段的基因表达变化 | 研究仅限于狼疮易感小鼠模型,可能不完全适用于人类疾病 | 探讨调节性B细胞在狼疮发病机制中的作用 | 狼疮易感小鼠的调节性B细胞 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 狼疮易感小鼠的脾脏Breg亚群 |
212 | 2024-08-07 |
NMF Clustering: Accessible NMF-based Clustering Utilizing GPU Acceleration
2023, Journal of bioinformatics and systems biology : Open access
DOI:10.26502/jbsb.5107072
PMID:38390437
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研究论文 | 本文介绍了一种基于非负矩阵分解(NMF)的聚类方法,利用GPU加速技术提高计算效率 | 通过使用CuPy库和消息传递接口(MPI)在GPU计算节点上实现NMF聚类,显著减少了计算时间 | NA | 旨在解决NMF算法在处理大规模基因表达数据时的计算密集问题 | 大规模RNA测序和单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | 非负矩阵分解(NMF) | NA | 基因表达数据 | 涉及数万个基因的数据集 |
213 | 2024-08-04 |
Distinct mast cell subpopulations within and around lymphatic vessels regulate lymph flow and progression of inflammatory-erosive arthritis in TNF-transgenic mice
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1275871
PMID:38155962
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研究论文 | 本文探讨了小鼠模型中肥大细胞对淋巴管功能和炎症侵蚀性关节炎的影响 | 首次阐明了不同肥大细胞亚群对关节淋巴流动及炎症-侵蚀性关节炎进展的调控作用 | 研究主要集中在TNF转基因小鼠上,缺乏对其他模型的验证 | 研究肥大细胞在肿瘤坏死因子转基因小鼠中对关节淋巴管功能和炎症-侵蚀性关节炎的作用 | TNF转基因小鼠和各种基因缺失小鼠,用于评估肥大细胞的作用 | 数字病理学 | 炎症性关节炎 | 单细胞RNA测序和免疫荧光显微镜 | TNF转基因小鼠 | 组织学和生物信息学数据 | TNF-tg小鼠、WT小鼠及cKit缺失小鼠共计数十只 |
214 | 2024-08-05 |
The utilization of single-cell sequencing technology in investigating the immune microenvironment of ccRCC
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1276658
PMID:38090562
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评论 | 本文回顾了单细胞测序技术在研究ccRCC免疫微环境中的应用。 | 文章创新地强调了单细胞测序技术如何揭示肿瘤微环境中特定细胞特征的重要性。 | 以往的先进测序方法忽视了特定较少的细胞特征,可能未能全面反映肿瘤微环境的复杂性。 | 探讨ccRCC中肿瘤微环境的特性及其免疫浸润的最新进展。 | ccRCC中肿瘤微环境和免疫浸润相关的细胞特征。 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞特征数据 | NA |
215 | 2024-08-05 |
Identification of drug candidates targeting monocyte reprogramming in people living with HIV
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1275136
PMID:38077315
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研究论文 | 本文探讨了针对HIV感染者单核细胞重编程的药物候选物的识别 | 利用单细胞RNA测序技术识别用于逆转HIV感染者单核细胞转录表型的药物候选物 | 样本数量较小,仅限于200-HIV队列研究的部分参与者 | 评估组学技术在HIV感染者大规模队列中的应用可行性 | HIV感染者和健康对照者中的免疫细胞 | 数字病理学 | HIV | 单细胞RNA-seq、流式细胞术、蛋白质组学、ATAC-seq | NA | 血液样本 | 少量血液样本来自HIV感染者及健康对照者 |
216 | 2024-08-05 |
Comprehensive analysis of mitophagy-related genes in NSCLC diagnosis and immune scenery: based on bulk and single-cell RNA sequencing data
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1276074
PMID:38155968
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研究论文 | 本研究系统分析了线粒体自噬与非小细胞肺癌(NSCLC)之间的关系 | 通过机器学习选择六个与线粒体自噬相关的特征基因并构建了NSCLC的诊断模型 | NA | 探索线粒体自噬在NSCLC中的潜在机制以及其与免疫微环境的关系 | 非小细胞肺癌患者的线粒体自噬相关基因 | 数字病理学 | 非小细胞肺癌 | RNA测序 | 机器学习模型 | 单细胞数据与大规模RNA测序数据 | NA |
217 | 2024-08-07 |
Comprehensive analysis of necroptosis-related genes in renal ischemia-reperfusion injury
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1279603
PMID:37965311
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研究论文 | 本研究对肾移植中缺血再灌注损伤相关的坏死性凋亡基因进行了综合分析,并探讨了其在延迟移植物功能中的作用。 | 研究首次系统地分析了坏死性凋亡相关基因在肾缺血再灌注损伤中的表达和功能,并开发了一个预测延迟移植物功能的模型。 | 研究主要基于基因表达数据和单细胞RNA测序数据,可能需要更多的临床数据来进一步验证和优化模型。 | 旨在识别和功能表征肾移植中与坏死性凋亡相关的基因,并探讨其在免疫反应和缺血再灌注损伤进展中的作用。 | 肾移植中的缺血再灌注损伤及其相关的坏死性凋亡基因。 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括预处理和再灌注后的肾活检样本,以及IRI小鼠模型 |
218 | 2024-08-07 |
Elaboration and validation of a prognostic signature associated with disulfidoptosis in lung adenocarcinoma, consolidated with integration of single-cell RNA sequencing and bulk RNA sequencing techniques
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1278496
PMID:37965333
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序技术,详细阐述并验证了与硫化物凋亡相关的肺腺癌预后标志物 | 首次将单细胞RNA测序与批量RNA测序技术结合,探索与硫化物凋亡相关的基因,并构建预后风险标志物 | NA | 旨在通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序技术,揭示与硫化物凋亡相关的基因,并预测肺腺癌患者的临床预后 | 肺腺癌(LUAD)及其与硫化物凋亡相关的基因 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA测序(bulk RNA-seq) | LASSO-Cox回归模型 | RNA序列数据 | 使用GSE149655数据集的肺腺癌和正常样本,具体样本数量未详述 |
219 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomic atlas throughout anti-BCMA CAR-T therapy in patients with multiple myeloma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1278749
PMID:38035111
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,分析了多发性骨髓瘤患者在接受抗BCMA CAR-T治疗过程中骨髓和外周血样本的转录组图谱 | 揭示了复发患者肿瘤细胞中HSP90B1和HSPA5的高表达以及内质网应激和未折叠蛋白反应途径的显著富集 | NA | 探究多发性骨髓瘤患者在接受抗BCMA CAR-T治疗后的免疫细胞变化及其与复发的关系 | 多发性骨髓瘤患者在接受抗BCMA CAR-T治疗过程中的骨髓和外周血细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 24个骨髓或外周血样本,共分析了59,725个骨髓细胞和72,479个外周血细胞 |
220 | 2024-08-07 |
Single cell transcriptome analyses reveal the roles of B cells in fructose-induced hypertension
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1279439
PMID:38045685
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了B细胞在果糖诱导的高血压中的作用 | 首次揭示了B细胞在果糖诱导的高血压中的重要作用,并发现了B细胞与Tfh细胞及干扰素途径的激活之间的关联 | 研究仅限于Dahl盐敏感性雄性大鼠,结果的普遍性有待进一步验证 | 探讨B细胞在果糖诱导的高血压发展中的作用 | Dahl盐敏感性雄性大鼠的肠黏膜细胞和外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组 | 8周龄Dahl盐敏感性雄性大鼠,分为两组,每组给予不同处理,共进行4周的实验 |