单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1191 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2024-08-07 |
Inhibition of anti-tumor immunity by melanoma cell-derived Activin-A depends on STING
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1335207
PMID:38304252
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研究论文 | 本文研究了黑色素瘤细胞分泌的Activin-A通过STING途径抑制抗肿瘤免疫的机制 | 发现Activin-A诱导的免疫逃避与多种细胞类型的促炎性干扰素特征相关，并揭示了STING在其中的关键作用 | NA | 探讨Activin-A在黑色素瘤中的作用及其对免疫疗法的影响 | 黑色素瘤细胞、CD8 T细胞及免疫微环境 | 肿瘤学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用突变型YUMM3.3小鼠黑色素瘤细胞进行同基因移植实验 |
| 202 | 2024-08-07 |
A vein wall cell atlas of murine venous thrombosis determined by single-cell RNA sequencing
2023-01-31, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-04492-z
PMID:36721040
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了小鼠下腔静脉在血栓形成24小时后的细胞图谱 | 首次在单细胞水平上描述了急性静脉血栓形成期间静脉壁的转录组变化，为早期病理事件提供了新见解 | NA | 探讨深静脉血栓的细胞和分子机制 | 小鼠下腔静脉在血栓形成后的细胞类型和转录组变化 | 数字病理学 | 静脉血栓 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠下腔静脉样本 |
| 203 | 2024-08-07 |
CD31 promotes diffuse large B-cell lymphoma metastasis by upregulating OPN through the AKT pathway and inhibiting CD8+ T cells through the mTOR pathway
2023, American journal of translational research
IF:1.7Q4
PMID:37193155
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研究论文 | 本研究探讨了CD31在弥漫大B细胞淋巴瘤（DLBCL）转移中的作用及其机制 | 首次揭示了CD31通过上调OPN和抑制CD8+ T细胞在DLBCL转移中的作用 | NA | 探究DLBCL侵袭机制及CD31在其中的作用 | DLBCL细胞、CD31、CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 实时聚合酶链反应、蛋白质印迹、免疫荧光、免疫组化染色、RNA测序 | NA | RNA | 40名新诊断的DLBCL患者 |
| 204 | 2024-08-04 |
Revolutionizing cancer immunotherapy in solid tumor: CAR engineering and single-cell sequencing insights
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1310285
PMID:38090577
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mini-review | 这篇文章探讨了嵌合抗原受体（CAR）细胞疗法在实体肿瘤治疗中的进展及单细胞RNA测序（scRNA-seq）的应用 | 结合scRNA-seq与CAR疗法，提供了对CAR细胞生物特性及肿瘤免疫逃逸的新见解，推动癌症免疫治疗的创新 | 主要面临识别可靠的肿瘤相关抗原和肿瘤微环境复杂性的问题 | 研究CAR细胞疗法在实体肿瘤中的应用以及scRNA-seq的潜力 | CAR-T细胞和实体肿瘤 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞数据 | NA |
| 205 | 2024-08-04 |
An integrated analysis of bulk and single-cell sequencing data reveals that EMP1+/COL3A1+ fibroblasts contribute to the bone metastasis process in breast, prostate, and renal cancers
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1313536
PMID:38187400
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研究论文 | 本研究通过综合分析大规模测序和单细胞RNA转录组数据，揭示了EMP1+/COL3A1+成纤维细胞在乳腺癌、前列腺癌和肾癌的骨转移过程中的作用 | 首次调查了成纤维细胞与多种肿瘤微环境中的骨转移过程之间的关系 | 尚未明确骨转移机制的所有细节 | 探索不同肿瘤的骨转移相关特征 | 乳腺癌、前列腺癌和肾癌样本中的成纤维细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌、前列腺癌、肾癌 | 大规模测序和单细胞RNA测序 | NA | RNA转录组数据 | 乳腺癌、前列腺癌和肾癌的骨转移样本 |
| 206 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveals heterogeneity in esophageal squamous epithelial cells and constructs models for predicting patient prognosis and immunotherapy
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1322147
PMID:38098487
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研究论文 | 该文章探讨了食管鳞状上皮细胞异质性，并建立了预测患者预后和免疫治疗模型 | 通过单细胞转录组学揭示了恶性上皮细胞亚群的异质性，并建立了与生存相关的预后模型 | 样本量和所用数据集的选择可能限制了结果的普遍适用性 | 全面探索食管鳞状细胞癌微环境中恶性鳞状上皮细胞亚群的异质性 | 主要研究食管鳞状细胞癌患者中的恶性鳞状上皮细胞及其与肿瘤微环境的相互作用 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA数据 | TCGA和GSE53624队列的样本 |
| 207 | 2024-08-07 |
Single-cell landscape of immune cells during the progression from HBV infection to HBV cirrhosis and HBV-associated hepatocellular carcinoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1320414
PMID:38116005
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了不同疾病阶段的人类肝脏免疫微环境，揭示了HBV感染至HBV相关肝硬化和肝细胞癌过程中免疫细胞的变化 | 首次详细描述了从HBV感染到肝硬化和肝细胞癌进展过程中肝脏免疫微环境的单细胞景观，并识别了两个相关的免疫细胞亚群Macrophage-CD9/IL18和macrophage-CD9/IFI6 | 研究样本量相对较小，可能需要进一步扩大样本量以验证结果的普遍性 | 探究HBV相关肝脏疾病进展过程中肝脏免疫环境的变化 | HBV感染、HBV肝硬化和HBV相关肝细胞癌患者的肝脏免疫细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 118,455个免疫细胞，来自6名健康个体、4名HBV感染患者、5名HBV肝硬化患者和3名HBV相关肝细胞癌患者 |
| 208 | 2024-08-07 |
Unraveling the enigma of B cells in diffuse large B-cell lymphoma: unveiling cancer stem cell-like B cell subpopulation at single-cell resolution
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1310292
PMID:38149239
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据和多种生物信息学工具，全面分析了弥漫大B细胞淋巴瘤中的B细胞亚群，特别是揭示了一种具有癌症干细胞特性的B细胞亚群 | 首次在单细胞分辨率下揭示了弥漫大B细胞淋巴瘤中存在具有癌症干细胞特性的B细胞亚群，并探讨了其与不良预后的关联 | 研究样本量较小，且仅限于DLBCL和正常淋巴组织，未来需扩大样本量和涵盖更多类型的淋巴瘤 | 揭示弥漫大B细胞淋巴瘤中癌症干细胞样B细胞亚群的特性和其在疾病进展中的作用 | 弥漫大B细胞淋巴瘤中的B细胞亚群及其与癌症干细胞的关系 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 230个DLBCL组织样本和3个DLBCL样本及1个正常淋巴组织样本 |
| 209 | 2024-08-07 |
Interferon response and profiling of interferon response genes in peripheral blood of vaccine-naive COVID-19 patients
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1315602
PMID:38268924
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研究论文 | 本研究旨在通过分析COVID-19患者外周血中的干扰素（IFN）反应基因表达，深入了解COVID-19感染期间的系统性干扰素反应 | 首次在未接种疫苗的COVID-19患者中研究了干扰素反应基因的表达，并利用单细胞RNA测序数据分析了特定细胞类型在干扰素反应中的作用 | 样本仅限于疾病发作后10天内的血液样本，且未考虑接种疫苗后的情况 | 研究COVID-19患者在自然感染期间的先天免疫反应，特别是干扰素反应 | COVID-19患者和健康对照组的外周血样本 | 数字病理学 | COVID-19 | RNA测序 | NA | RNA | 105名COVID-19患者和30名健康对照 |
| 210 | 2024-08-07 |
Effect of sodium stibogluconate in recruiting and awakening immune cells in the pleural fluid of pancreatic cancer: preparation for immunotherapy
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1315468
PMID:38313432
|
研究论文 | 研究钠锑葡萄糖酸盐（SSG）在胰腺癌患者的胸腔积液中招募和唤醒免疫细胞的效果，为免疫治疗做准备 | 首次使用单细胞RNA测序（scRNA-seq）研究SSG在胰腺癌胸腔积液中的免疫激活作用 | 研究仅限于胰腺癌患者的胸腔积液，未涉及其他类型的癌症或疾病 | 探讨SSG在胰腺癌胸腔积液中激活免疫细胞的机制，为免疫治疗提供新策略 | 胰腺癌患者的胸腔积液中的免疫细胞 | 免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中明确 |
| 211 | 2024-08-04 |
Current annotation strategies for T cell phenotyping of single-cell RNA-seq data
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1306169
PMID:38187377
|
综述 | 本文评估了当前单细胞RNA测序数据中T细胞表型注释的策略 | 提出了对T细胞及其亚群体的自动注释策略，并指出了现有工具中缺失的关键信息 | 缺乏金标准的细胞表型注释方法，导致对T细胞亚型的标记仍然存在问题 | 研究单细胞RNA测序中T细胞的表型注释方法 | 针对T细胞及其亚群体的注释工具和策略 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 212 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing analysis related to sphingolipid metabolism guides immunotherapy and prognosis of skin cutaneous melanoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1304466
PMID:38077400
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研究论文 | 本文探讨了与皮肤黑色素瘤相关的鞘脂代谢基因，以开发患者预后的指标 | 本文通过单细胞测序分析识别了与免疫微环境相关的关键预后基因，提出了一种基于SRG的风险标志 | 鞘脂代谢在黑色素瘤中的具体作用和机制尚不完全明确 | 开发一个与皮肤黑色素瘤患者预后相关的指标 | 研究对象为皮肤黑色素瘤患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | scRNA-seq | LASSO和Cox回归 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的黑色素瘤患者的单细胞测序数据 |
| 213 | 2024-08-07 |
Expansion of CD4+ cytotoxic T lymphocytes with specific gene expression patterns may contribute to suppression of tumor immunity in oral squamous cell carcinoma: single-cell analysis and in vitro experiments
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1305783
PMID:38077321
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、T细胞受体和B细胞受体序列分析以及多色免疫荧光染色，探讨了CD4+细胞毒性T淋巴细胞（CTLs）在口腔鳞状细胞癌（OSCC）中的免疫抑制作用及其与B细胞的相互作用。 | 本研究首次详细描述了CD4+ CTLs在OSCC中的独特基因表达模式及其与B细胞的潜在相互作用，为癌症免疫治疗提供了新的见解。 | 研究主要集中在体外实验和单细胞分析，尚未进行临床试验验证其在实际治疗中的效果。 | 深入理解CD4+ T细胞和B细胞在口腔鳞状细胞癌中的作用，以促进癌症免疫治疗的发展。 | CD4+ T细胞、CD8+ T细胞和B细胞在口腔鳞状细胞癌中的免疫反应和效应功能。 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序、T细胞受体和B细胞受体序列分析、多色免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据 | 多个口腔鳞状细胞癌病变中的免疫细胞样本 |
| 214 | 2024-08-04 |
Identifying the programmed cell death index of hepatocellular carcinoma for prognosis and therapy response improvement by machine learning: a bioinformatics analysis and experimental validation
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1298290
PMID:38170006
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研究论文 | 本研究探讨了程序性细胞死亡与肝细胞癌之间的关联，并构建了用于预后和治疗反应预测的程序性死亡指数。 | 提出了一种基于机器学习的整合框架来构建程序性死亡指数（PCDI），超越了以往的预后模型。 | 研究可能存在数据来源的局限性，未提供样本具体数量的信息。 | 阐明程序性细胞死亡与肝细胞癌之间的关系，以改善临床管理及个体化治疗。 | 肝细胞癌患者，关注程序性死亡相关基因及其临床特征。 | 生物信息学 | 肝癌 | 单细胞测序，蛋白质组学 | 机器学习 | 基因数据，蛋白质组学数据 | NA |
| 215 | 2024-08-07 |
Immune and oxidative stress disorder in ovulation-dysfunction women revealed by single-cell transcriptome
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1297484
PMID:38116006
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了排卵功能障碍女性中免疫和氧化应激紊乱的情况 | 首次系统性地分析了排卵功能障碍女性中免疫图谱的变化，并揭示了cDC介导的信号通路对炎症反应的重要贡献 | NA | 深入了解排卵功能障碍的机制，为更好的诊断和治疗提供依据 | 排卵功能障碍女性中的免疫细胞和氧化应激 | NA | 排卵功能障碍 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | 80,689个PBMCs样本 |
| 216 | 2024-08-07 |
Lineage tracing of T cell differentiation from T-iPSC by 2D feeder-free culture and 3D organoid culture
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1303713
PMID:38162650
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研究论文 | 本研究通过2D无饲养层培养和3D类器官培养追踪T细胞分化，分析了T-iPS-T细胞在不同培养阶段的单细胞水平数据，并识别了关键基因用于CD4+ T-iPS-T细胞的诱导。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术，比较了2D无饲养层培养和3D类器官培养中T-iPS-T细胞的关键基因，为CD4+ T细胞的生成提供了新的见解。 | 研究主要集中在T-iPS-T细胞的基因表达分析，未涉及这些细胞在免疫治疗中的实际应用效果。 | 旨在通过追踪T细胞分化过程，优化T-iPS-T细胞的培养条件，以促进其在免疫治疗中的应用。 | 研究对象为从抗原特异性T细胞衍生的诱导多能干细胞（T-iPS-T细胞）。 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 涉及多个T-iPS-T细胞样本和人类胸腺细胞数据集 |
| 217 | 2024-08-07 |
Elucidating common pathogenic transcriptional networks in infective endocarditis and sepsis: integrated insights from biomarker discovery and single-cell RNA sequencing
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1298041
PMID:38332910
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研究论文 | 本研究通过微阵列数据和单细胞RNA测序数据，揭示了感染性心内膜炎和脓毒症在转录水平上的共同致病机制，并发现了相关的生物标志物。 | 首次综合利用微阵列和单细胞RNA测序技术，揭示了感染性心内膜炎和脓毒症的共同致病机制，并发现了新的治疗靶点。 | 数据量有限，实验验证不足。 | 旨在揭示感染性心内膜炎和脓毒症的共同致病机制，并发现新的治疗靶点和生物标志物。 | 感染性心内膜炎和脓毒症的共同致病机制及相关的生物标志物。 | 数字病理学 | 感染性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 |
| 218 | 2024-08-04 |
Cellular and transcriptome signatures unveiled by single-cell RNA-Seq following ex vivo infection of murine splenocytes with Borrelia burgdorferi
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1296580
PMID:38149246
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠脾细胞在Borrelia burgdorferi感染后的特征 | 首次利用GFP标记的Borrelia burgdorferi对小鼠脾细胞进行单细胞RNA测序分析，揭示了免疫响应的分子和细胞特征 | 研究结果主要基于小鼠模型，可能无法完全转化至人类 | 揭示Borrelia burgdorferi感染后宿主的免疫反应和相关生物标志物 | 感染Borrelia burgdorferi的小鼠脾细胞 | 数字病理学 | 莱姆病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从小鼠中分离的GFP+和GFP-脾细胞 |
| 219 | 2024-08-07 |
Multi-omics analyses unravel DNA damage repair-related clusters in breast cancer with experimental validation
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1297180
PMID:38022619
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了乳腺癌中与DNA损伤修复（DDR）相关的特征，并通过实验验证了其分类 | 本研究首次构建了DDR分类，并通过多层队列分析验证了DDR评分，揭示了恶性细胞在单细胞水平上对DDR评分的贡献 | NA | 研究乳腺癌中DNA损伤修复的异质性，并探索其个性化分子和临床病理机制 | 乳腺癌中的DNA损伤修复相关特征 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 多组学分析 | NA | 转录组学、基因组学、单细胞转录组数据 | 276个DDR相关基因，多个公共数据集包括SCAN-B数据集、METABRIC数据库和TCGA-BRCA数据库 |
| 220 | 2024-08-04 |
Integrative analysis of disulfidptosis and immune microenvironment in hepatocellular carcinoma: a putative model and immunotherapeutic strategies
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1294677
PMID:38235128
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研究论文 | 本文研究了肝细胞癌中二硫键死亡及其免疫微环境的整合分析 | 建立了一个新模型以预测肝细胞癌患者的预后，并探讨了可能的治疗靶点 | NA | 探索肝细胞癌细胞的二硫键死亡及其与免疫微环境的关系 | 肝细胞癌细胞及其免疫微环境 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序, 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 结合了多个RNA测序数据集 |