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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-12-13 |
Dipeptidyl peptidase 4 inhibition sensitizes radiotherapy by promoting T cell infiltration
2023, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2023.2268257
PMID:37849962
|
研究论文 | 本研究揭示了放疗未能有效诱导T细胞浸润的机制,并提出通过抑制DPP4来增强放疗疗效的策略 | 首次发现树突状细胞在放疗后高表达DPP4是限制T细胞浸润的关键因素,并提出DPP4抑制剂联合放疗可增强抗肿瘤免疫 | 研究主要基于临床前模型,尚未在大型临床试验中验证;机制研究主要聚焦于DPP4对趋化因子的调控 | 探究放疗联合免疫治疗的增效机制,寻找增强放疗诱导抗肿瘤免疫应答的新策略 | 肺癌和黑色素瘤患者样本、肿瘤微环境中的免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 肺癌、黑色素瘤 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据、临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2025-12-07 |
Colorectal Cancer Metastases in the Liver Establish Immunosuppressive Spatial Networking between Tumor-Associated SPP1+ Macrophages and Fibroblasts
2023-01-04, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-22-2041
PMID:36239989
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间成像技术,揭示了结直肠癌肝转移微环境中SPP1+巨噬细胞与成纤维细胞之间的免疫抑制性空间网络 | 首次在结直肠癌肝转移微环境中鉴定出具有代谢改变和泡沫细胞特征的SPP1+巨噬细胞,并发现其与成纤维细胞通过配体-受体对形成空间邻近的互作网络,共同促进免疫抑制 | 研究主要基于微卫星稳定型结直肠癌肝转移样本,可能不适用于其他亚型;样本量相对有限,需要更大队列验证 | 表征结直肠癌肝转移肿瘤微环境的细胞组成和相互作用,以理解免疫抑制机制 | 结直肠癌肝转移组织、配对正常肝组织及外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、多重空间成像、批量基因表达与细胞反卷积分析 | NA | 单细胞转录组数据、空间成像数据、批量基因表达数据 | 一系列微卫星稳定型结直肠癌肝转移样本及配对组织 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 3 | 2025-12-02 |
Multimodal characterization of antigen-specific CD8 + T cells across SARS-CoV-2 vaccination and infection
2023-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.24.525203
PMID:36747786
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研究论文 | 本文利用多模态测序技术对BNT162b2疫苗接种前后的循环白细胞进行纵向分析,揭示了抗原特异性CD8+ T细胞的亚群特征及其与临床预后的关联 | 首次结合转录组、染色质可及性、免疫表型和T细胞受体测序等多模态数据,系统表征了疫苗诱导的SARS-CoV-2抗原特异性CD8+ T细胞,并发现其频率可预测COVID-19临床结局 | 研究主要基于疫苗接种后的时间点分析,对感染后长期动态的覆盖有限;样本量相对较小,且未涵盖不同人群的异质性 | 深入表征SARS-CoV-2感染或疫苗接种后T细胞免疫应答,特别是抗原特异性CD8+ T细胞的特征 | 人类循环白细胞,特别是CD8+ T细胞亚群 | 免疫学 | COVID-19 | 多模态测序技术,包括scRNA-seq、ATAC-seq、T细胞受体测序和DNA寡核苷酸标记的肽-MHC多聚体技术 | NA | 单细胞多组学数据 | 疫苗接种前后采集的纵向人类白细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 4 | 2025-11-15 |
Apoptosis recognition receptors regulate skin tissue repair in mice
2023-Jan-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.17.523241
PMID:36711968
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了凋亡识别受体在小鼠皮肤组织修复中的调控机制 | 首次在皮肤伤口炎症期间系统描绘细胞动态图谱,发现Axl和Timd4两种凋亡清除受体在组织修复中具有不同作用机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类糖尿病足伤口数据相对有限 | 探究凋亡细胞识别和清除机制如何调控组织修复过程 | 小鼠皮肤伤口模型和人类糖尿病足伤口 | 单细胞组学 | 皮肤创伤/糖尿病足 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2025-10-16 |
A Novel Prognostic Pyroptosis-Related Gene Signature Correlates to Oxidative Stress and Immune-Related Features in Gliomas
2023, Oxidative medicine and cellular longevity
DOI:10.1155/2023/4256116
PMID:36778205
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研究论文 | 构建并验证了一个基于焦亡相关基因的胶质瘤预后模型 | 首次将焦亡相关基因与胶质瘤预后关联,并构建了包含9个基因的预后特征 | 研究基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 开发胶质瘤预后预测工具并探索潜在治疗靶点 | 胶质瘤患者和U87胶质瘤细胞系 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序,LASSO-Cox回归,Kaplan-Meier分析,KEGG/GO富集分析 | 预后风险模型 | 基因表达数据,临床数据 | TCGA和CGGA队列的胶质瘤患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2025-10-05 |
A spatially resolved atlas of the human lung characterizes a gland-associated immune niche
2023-01, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01243-4
PMID:36543915
|
研究论文 | 本研究通过多组学单细胞技术和空间转录组学构建了人类肺部空间分辨图谱,揭示了气管粘膜下腺中的免疫细胞生存微环境 | 发现了气管粘膜下腺中IgA浆细胞的生存微环境,并证明腺上皮细胞通过表达CCL28、APRIL和IL-6招募B细胞和IgA浆细胞,促进其局部存活和抗体分泌 | NA | 重新定义肺和气管的组织结构,解析人类肺部的空间组织结构 | 健康人类肺部的五个近端到远端位置 | 空间转录组学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 多组学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 人类肺部五个解剖位置的样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 7 | 2025-10-05 |
Melatonin modulates the hypothalamic-pituitary neuroendocrine axis to regulate physiological color change in teleost fish
2023, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.81055
PMID:37324950
|
研究论文 | 本研究揭示褪黑素通过激活多种受体调控下丘脑-垂体神经内分泌轴,介导硬骨鱼生理性体色变化的分子机制 | 首次在海洋硬骨鱼中系统解析褪黑素信号系统的多重细胞内信号通路,并发现MT/MCH和MT/(TAC1+CRH)/MSH两条新型调控通路 | 研究仅聚焦于大黄鱼这一特定物种,其发现是否适用于其他硬骨鱼类仍需验证 | 探究褪黑素信号系统在硬骨鱼生理性体色变化中的调控机制 | 大黄鱼(海洋硬骨鱼)及其褪黑素受体信号通路 | 神经内分泌学 | NA | 单细胞RNA测序,药理学实验,配体-受体相互作用分析 | NA | 基因表达数据,空间表达模式数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA-seq methods to interrogate virus-host interactions
2023-01, Seminars in immunopathology
IF:7.9Q1
DOI:10.1007/s00281-022-00972-2
PMID:36414692
|
综述 | 总结单细胞RNA测序技术及其在病毒-宿主相互作用研究中的应用 | 系统梳理了scRNA-seq技术在解析病毒基因组与宿主反应异质性、感染细胞与旁观者细胞差异反应及细胞间通讯网络方面的创新应用 | NA | 探讨单细胞RNA测序方法在病毒-宿主相互作用研究中的应用 | 病毒与宿主细胞的相互作用机制 | 自然语言处理 | 传染病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9 | 2025-10-05 |
RNA Sequencing and Spatial Transcriptomics in Traumatic Spinal Cord Injury (Review)
2023, Sovremennye tekhnologii v meditsine
DOI:10.17691/stm2023.15.6.08
PMID:39944372
|
综述 | 总结基于单细胞和单核RNA测序的转录组分析技术在创伤性脊髓损伤细胞特征鉴定和研究中的进展 | 整合单细胞RNA测序与空间转录组学技术,精确定位脊髓损伤区域并在细胞分子水平分析病理图像 | 需要更多人类细胞群体特异性数据与实验模型数据的比较分析 | 理解脊髓功能机制并建立治疗靶点 | 创伤性脊髓损伤中的细胞类型和神经组织细胞 | 空间转录组学 | 创伤性脊髓损伤 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,空间转录组学 | NA | 转录组数据,空间信息 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 10 | 2025-10-06 |
Role of mitochondria-bound HK2 in rheumatoid arthritis fibroblast-like synoviocytes
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1103231
PMID:37529037
|
研究论文 | 本研究探讨线粒体结合型HK2在类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞表型调控中的关键作用 | 首次揭示线粒体定位的HK2通过调控细胞侵袭和迁移能力影响RA病理进程,并提出靶向线粒体HK2解离的新治疗策略 | 研究主要基于体外细胞实验和小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证 | 阐明线粒体结合型HK2在类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞表型调控中的分子机制 | 类风湿关节炎患者的成纤维样滑膜细胞和关节炎小鼠模型 | 分子生物学 | 类风湿关节炎 | 共聚焦显微镜、腺病毒感染、单细胞RNA测序、基因表达分析 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2025-10-06 |
Adult skin fibroblast state change in murine wound healing
2023-01-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-27152-4
PMID:36650180
|
研究论文 | 通过分析小鼠皮肤伤口愈合的单细胞RNA测序数据,鉴定出一个在伤口愈合过程中显著增加的成纤维细胞亚群,并发现其与上皮间质转化和血管生成相关 | 首次在伤口愈合过程中识别出具有特定基因特征的成纤维细胞亚群,并通过药物数据库筛选出可能促进或延缓伤口愈合的候选药物 | 研究仅基于小鼠模型数据,尚未进行实验验证 | 探究皮肤伤口愈合过程中成纤维细胞的异质性变化 | 小鼠正常和受伤皮肤组织 | 单细胞转录组学 | 皮肤伤口愈合 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个小鼠皮肤伤口愈合时间点的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2025-10-06 |
Spatial Transcriptomics in Kidney Tissue
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3179-9_17
PMID:37423994
|
研究论文 | 详细介绍空间转录组测序技术在肾脏组织中的应用方法 | 整合组织学与RNA测序,在完整组织空间背景下解析转录组表达 | NA | 开发和应用空间转录组测序技术于肾脏组织研究 | 小鼠和人类肾脏组织 | 空间转录组学 | 肾脏疾病 | 空间转录组测序 | NA | 空间转录组数据,H&E图像 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium Spatial Tissue Optimization, Visium Spatial Gene Expression | Visium空间组织优化协议和Visium空间基因表达协议 |
| 13 | 2025-10-06 |
A single-cell RNA sequencing atlas of circulating leukocytes from healthy and osteosarcoma affected dogs
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1162700
PMID:37275879
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了健康犬和骨肉瘤患犬循环白细胞图谱,并分析骨肉瘤对免疫细胞转录组的影响 | 首次构建犬类循环白细胞的单细胞RNA测序图谱,揭示了CD4 T细胞亚型的显著异质性,并发现骨肉瘤患犬中髓源性抑制细胞比例增加 | 样本量相对有限(健康犬7只,骨肉瘤患犬10只),且受犬类特异性试剂限制 | 深入表征犬类免疫细胞异质性,建立转化医学相关的动物模型 | 健康犬和骨肉瘤患犬的循环白细胞 | 单细胞测序 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 17只犬(7只健康犬,10只骨肉瘤患犬) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2025-10-06 |
The integrated single-cell analysis developed a lactate metabolism-driven signature to improve outcomes and immunotherapy in lung adenocarcinoma
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1154410
PMID:37033259
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞分析构建了乳酸代谢驱动的特征模型,用于改善肺腺癌患者的预后和免疫治疗效果 | 首次利用单细胞RNA测序分析结合乳酸代谢相关基因构建预后模型,并验证了AHSA1基因在肺腺癌中的作用 | 需要更多外部数据集验证模型的普适性,实验验证仅限于AHSA1基因 | 构建基于乳酸代谢相关基因的预后模型,改善肺腺癌患者的治疗结果和免疫治疗效果 | 肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, AUCell算法, 相关性分析, Cox回归, Lasso回归 | 预后风险模型 | 基因表达数据 | 多个外部独立数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2025-10-06 |
A novel liver zonation phenotype-associated molecular classification of hepatocellular carcinoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1140201
PMID:36936935
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研究论文 | 基于肝分区特征建立了一种新的肝细胞癌分子分型系统 | 首次鉴定94个人类肝细胞特异性分区标志物,并基于这些标志物将肝细胞癌分为三个具有不同预后和免疫特征的亚型 | 研究依赖于公共数据库的回顾性数据,需要进一步实验验证 | 探索肝细胞癌的肝分区特征并建立新的分子分型系统 | 肝细胞癌患者样本 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,RNA测序,微阵列分析 | 非负矩阵分解共识聚类 | 基因表达数据 | 训练集616例HCC样本,验证集285例HCC样本 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq,微阵列 | NA | NA |
| 16 | 2025-10-06 |
HIV-1 activates oxidative phosphorylation in infected CD4 T cells in a human tonsil explant model
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1172938
PMID:37325659
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研究论文 | 本研究通过人类扁桃体离体模型探索HIV-1感染在淋巴组织中诱导的特定转录组变化 | 首次在人类扁桃体离体模型中揭示HIV-1感染的CD4+ T细胞氧化磷酸化基因上调及巨噬细胞的NLRP3炎症小体通路激活 | 研究基于离体模型,可能无法完全反映体内复杂环境;样本来源有限 | 探究HIV-1感染在淋巴组织不同细胞类型中诱导的转录组变化及其与慢性炎症的关系 | 健康人类供体的扁桃体组织中的CD4+ T细胞和巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | HIV感染/艾滋病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康人类供体的扁桃体组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2025-10-06 |
Exploring the optimization of autoencoder design for imputing single-cell RNA sequencing data
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.07.041
PMID:37671239
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研究论文 | 通过实证研究探索自编码器设计对单细胞RNA测序数据插补性能的影响 | 首次系统研究自编码器架构和超参数选择对scRNA-seq数据插补性能的影响,发现与计算机视觉领域不同的最佳实践 | 研究结果基于实证分析,缺乏理论证明 | 优化自编码器设计以提高单细胞RNA测序数据插补性能 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 自编码器 | 基因表达数据 | 多个真实和模拟的scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2025-10-06 |
Enteroendocrine Cells Protect the Stem Cell Niche by Regulating Crypt Metabolism in Response to Nutrients
2023, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.12.016
PMID:36608902
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研究论文 | 本研究揭示了肠内分泌细胞通过调节隐窝代谢向干细胞巢传递营养信息的重要机制 | 首次证明肠内分泌细胞作为营养传感器,通过调节隐窝代谢向肠道干细胞巢传递营养状态信息 | 研究主要基于小鼠模型和人类肠道类器官,需要进一步验证在完整生理系统中的功能 | 探究肠内分泌细胞在调节肠道干细胞巢代谢和功能中的作用 | 小鼠肠道上皮细胞、人类肠道类器官、肠道干细胞 | 细胞生物学 | 代谢性疾病 | 间接热量测定、1H-NMR代谢组学、线粒体活体成像、单细胞测序 | NA | 代谢数据、成像数据、基因表达数据 | 转基因小鼠模型和人类多能干细胞来源的肠道类器官 | 10x Genomics, Agilent Technologies | 单细胞RNA测序, 代谢分析 | 10x Chromium, Seahorse生物分析仪 | 10x Genomics单细胞测序平台,Agilent Seahorse XF分析仪 |
| 19 | 2025-10-06 |
A novel cuproptosis-related gene signature of prognosis and immune microenvironment in head and neck squamous cell carcinoma cancer
2023-Jan, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-022-04471-7
PMID:36376617
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研究论文 | 本研究构建了一个铜死亡相关基因特征模型,用于预测头颈鳞状细胞癌患者的预后和免疫微环境 | 首次系统评估头颈鳞状细胞癌中铜死亡相关基因的差异表达和遗传改变,并构建了基于10个CRG的风险预测模型 | 研究基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 评估铜死亡相关基因在头颈鳞状细胞癌中的预后价值和免疫微环境关联 | 头颈鳞状细胞癌患者组织和细胞 | 生物信息学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞测序,基因表达分析,拷贝数变异分析 | Cox回归分析,lasso回归 | 基因表达数据,临床数据,单细胞测序数据 | 来自公共数据库的头颈鳞状细胞癌和正常组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 20 | 2025-10-06 |
CD73-generated extracellular adenosine promotes resolution of neutrophil-mediated tissue injury and restrains metaplasia in pancreatitis
2023-01, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202201537R
PMID:36468677
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研究论文 | 本研究探讨CD73通过产生细胞外腺苷在胰腺炎中促进中性粒细胞介导的组织损伤修复和抑制化生的作用机制 | 首次揭示CD73缺失导致胰腺炎中持续化生和炎症的机制,并证明中性粒细胞清除可显著减少化生 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类患者中验证 | 阐明CD73在胰腺炎炎症消退和组织修复中的作用机制 | CD73基因敲除小鼠和野生型C57BL/6小鼠 | 分子病理学 | 胰腺炎 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学 | NA | 基因表达数据,组织图像数据 | CD73敲除和野生型小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |