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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-01-03 |
Deciphering the immune landscape of head and neck squamous cell carcinoma: A single-cell transcriptomic analysis of regulatory T cell responses to PD-1 blockade therapy
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0295863
PMID:38096229
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析,探讨了PD-1阻断疗法(Nivolumab)对头颈鳞状细胞癌中调节性T细胞(Treg)的影响 | 首次在单细胞水平上揭示了Nivolumab治疗后HNSCC肿瘤微环境中Treg数量增加、抑制活性增强的机制,并识别了CD44-SSP1轴、NKG2C/D-HLA-E轴及KRAS信号通路等关键变化 | 样本量较小(仅4名供体的8个组织),且为观察性研究,需进一步验证机制 | 研究PD-1阻断疗法如何影响HNSCC肿瘤微环境中的Treg细胞 | 头颈鳞状细胞癌(HNSCC)患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 4名HNSCC供体的8个组织(治疗前后配对样本) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2026-01-01 |
Longitudinal multi-functional analysis identified responses of T cells, B cells, and monocytes as hallmarks of immunotherapy tolerance in patients with merkel cell carcinoma
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0293922
PMID:37983224
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了默克尔细胞癌患者外周血中免疫细胞的动态变化,揭示了免疫治疗耐受的机制 | 采用纵向多组学方法,结合单细胞RNA测序和批量RNA数据验证,识别了T细胞耗竭、B细胞失调和单细胞亚群变化作为免疫逃逸的关键标志 | 样本量较小(仅基于四名患者的时间点数据),且主要依赖外周血分析,可能未完全反映肿瘤微环境的变化 | 探究默克尔细胞癌患者免疫治疗耐受的细胞机制和免疫逃逸条件 | 默克尔细胞癌患者的外周血免疫细胞 | 数字病理学 | 皮肤癌(默克尔细胞癌) | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 四名患者的外周血样本,采集自四个时间点 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2025-12-24 |
Systematic single cell RNA sequencing analysis reveals unique transcriptional regulatory networks of Atoh1-mediated hair cell conversion in adult mouse cochleae
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0284685
PMID:38079436
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了成年小鼠耳蜗中Atoh1介导的毛细胞转换过程中的独特转录调控网络 | 采用多种高通量测序分析工具(WGCNA、SCENIC、ARACNE和VIPER)构建独立的表达模块,并识别出多个转换阶段,发现了包括Nhlh1、Lhx3、Barhl1和Nfia在内的关键调控因子 | 研究基于现有数据集(Yamashita等人,2018年)进行分析,可能受限于原始数据的质量和样本量,且主要关注成年小鼠模型,结果在人类或其他哺乳动物中的适用性需进一步验证 | 探究成年哺乳动物耳蜗中毛细胞再生的调控机制,特别是Atoh1诱导的支持细胞向毛细胞转换过程 | 成年小鼠耳蜗中的支持细胞和毛细胞 | 单细胞转录组学 | 听力损失 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序数据 | 基于Yamashita等人(2018年)和Kolla等人(2020年)的公开数据集,具体样本数量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2025-12-23 |
Identification and validation of prognostic and tumor microenvironment characteristics of necroptosis index and BIRC3 in clear cell renal cell carcinoma
2023, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.16643
PMID:38130918
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研究论文 | 本研究通过分析TCGA和GEO数据库,识别了与坏死性凋亡相关的基因簇和预后模型,并验证了枢纽基因BIRC3在透明细胞肾细胞癌中的表达及其对细胞增殖、迁移和侵袭的调控作用 | 首次构建了基于坏死性凋亡相关基因的预后模型,并深入探讨了BIRC3基因在ccRCC免疫微环境中的关键作用 | 研究主要依赖公共数据库数据,缺乏大规模临床样本验证,且实验部分仅限于细胞系水平 | 探索坏死性凋亡在透明细胞肾细胞癌中的调控机制及其临床意义 | 透明细胞肾细胞癌患者数据、细胞系及单细胞测序数据 | 生物信息学 | 肾癌 | 单细胞测序、定量实时PCR、CCK8实验、transwell实验、伤口愈合实验 | LASSO回归模型 | 基因表达数据、单细胞测序数据 | TCGA和GEO数据库中的ccRCC患者数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2025-12-23 |
Proximal tubule cells in blood and urine as potential biomarkers for kidney disease biopsy
2023, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.16499
PMID:38077419
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,分析了肾炎患者的肾脏组织、外周血单核细胞和尿液中的细胞异质性,发现近端小管细胞在血液和尿液中的存在可作为肾脏疾病潜在的微创诊断标志物 | 首次通过单细胞RNA测序在肾炎患者的外周血和尿液中鉴定出近端小管细胞,并发现其与肾脏组织中的炎症性近端小管细胞具有高度相似的基因表达谱,提出了替代侵入性肾活检的潜在微创诊断方法 | 研究样本量较小(仅4名患者),且仅针对肾炎患者,结果在其他肾脏疾病中的普适性有待验证 | 探索肾脏疾病的病理机制并开发微创诊断方法 | 肾炎患者的肾脏组织、外周血单核细胞和尿液样本 | 单细胞组学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 4名肾炎患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2025-12-20 |
Identification of cytokine-induced cell communications by pan-cancer meta-analysis
2023, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.16221
PMID:38054018
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和泛癌水平转录组学整合,识别了细胞因子介导的细胞间通讯,并构建了全面的细胞因子-受体图谱 | 开发了一种单细胞方法主动表达62对细胞因子-受体对,揭示了稳定的细胞因子介导的细胞通讯,涉及84种细胞因子和受体,并在泛癌水平进行了整合分析 | 研究基于转录组学数据,可能未完全捕捉蛋白质水平的相互作用;样本量虽大,但某些癌症类型可能代表性不足 | 揭示不同癌症中细胞因子介导的细胞间通讯机制及其在癌症发展和治疗反应中的作用 | 41,900个细胞,涵盖25种癌症类型,以及来自TCGA的10,967个样本,涉及32种癌症类型 | 生物信息学 | 泛癌 | 单细胞转录组学,泛癌meta分析,功能富集分析,共突变分析 | NA | 单细胞转录组数据,TCGA突变数据,临床生存数据 | 41,900个细胞(25种癌症类型),10,967个样本(32种TCGA癌症类型) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2025-12-20 |
Elucidating the role of nicotinamide N-methyltransferase-p53 axis in the progression of chronic kidney disease
2023, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.16301
PMID:37953778
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研究论文 | 本研究探讨了烟酰胺N-甲基转移酶(NNMT)在慢性肾病(CKD)进展中的作用,特别是其通过p53轴促进肾间质纤维化的机制 | 首次通过单细胞转录组测序(scRNA-seq)发现NNMT在纤维母细胞中特异性增加,并揭示了NNMT通过调节p53的DNA甲基化和磷酸化促进纤维化的新机制 | 研究主要基于小鼠UUO模型和体外细胞实验,尚未在人类临床样本中验证,且NNMT的具体下游信号通路仍需进一步阐明 | 阐明NNMT在慢性肾病肾间质纤维化中的作用机制,并探索其作为治疗靶点的潜力 | 小鼠(UUO模型)和培养的肾间质纤维母细胞(NRK-49F) | 数字病理学 | 慢性肾病 | 单细胞转录组测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 小鼠肾脏组织(UUO与假手术组对比)及培养细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2025-12-13 |
Dipeptidyl peptidase 4 inhibition sensitizes radiotherapy by promoting T cell infiltration
2023, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2023.2268257
PMID:37849962
|
研究论文 | 本研究揭示了放疗未能有效诱导T细胞浸润的机制,并提出通过抑制DPP4来增强放疗疗效的策略 | 首次发现树突状细胞在放疗后高表达DPP4是限制T细胞浸润的关键因素,并提出DPP4抑制剂联合放疗可增强抗肿瘤免疫 | 研究主要基于临床前模型,尚未在大型临床试验中验证;机制研究主要聚焦于DPP4对趋化因子的调控 | 探究放疗联合免疫治疗的增效机制,寻找增强放疗诱导抗肿瘤免疫应答的新策略 | 肺癌和黑色素瘤患者样本、肿瘤微环境中的免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 肺癌、黑色素瘤 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据、临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2025-12-07 |
Colorectal Cancer Metastases in the Liver Establish Immunosuppressive Spatial Networking between Tumor-Associated SPP1+ Macrophages and Fibroblasts
2023-01-04, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-22-2041
PMID:36239989
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间成像技术,揭示了结直肠癌肝转移微环境中SPP1+巨噬细胞与成纤维细胞之间的免疫抑制性空间网络 | 首次在结直肠癌肝转移微环境中鉴定出具有代谢改变和泡沫细胞特征的SPP1+巨噬细胞,并发现其与成纤维细胞通过配体-受体对形成空间邻近的互作网络,共同促进免疫抑制 | 研究主要基于微卫星稳定型结直肠癌肝转移样本,可能不适用于其他亚型;样本量相对有限,需要更大队列验证 | 表征结直肠癌肝转移肿瘤微环境的细胞组成和相互作用,以理解免疫抑制机制 | 结直肠癌肝转移组织、配对正常肝组织及外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、多重空间成像、批量基因表达与细胞反卷积分析 | NA | 单细胞转录组数据、空间成像数据、批量基因表达数据 | 一系列微卫星稳定型结直肠癌肝转移样本及配对组织 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 10 | 2025-12-02 |
Multimodal characterization of antigen-specific CD8 + T cells across SARS-CoV-2 vaccination and infection
2023-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.24.525203
PMID:36747786
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研究论文 | 本文利用多模态测序技术对BNT162b2疫苗接种前后的循环白细胞进行纵向分析,揭示了抗原特异性CD8+ T细胞的亚群特征及其与临床预后的关联 | 首次结合转录组、染色质可及性、免疫表型和T细胞受体测序等多模态数据,系统表征了疫苗诱导的SARS-CoV-2抗原特异性CD8+ T细胞,并发现其频率可预测COVID-19临床结局 | 研究主要基于疫苗接种后的时间点分析,对感染后长期动态的覆盖有限;样本量相对较小,且未涵盖不同人群的异质性 | 深入表征SARS-CoV-2感染或疫苗接种后T细胞免疫应答,特别是抗原特异性CD8+ T细胞的特征 | 人类循环白细胞,特别是CD8+ T细胞亚群 | 免疫学 | COVID-19 | 多模态测序技术,包括scRNA-seq、ATAC-seq、T细胞受体测序和DNA寡核苷酸标记的肽-MHC多聚体技术 | NA | 单细胞多组学数据 | 疫苗接种前后采集的纵向人类白细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 11 | 2025-11-15 |
Apoptosis recognition receptors regulate skin tissue repair in mice
2023-Jan-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.17.523241
PMID:36711968
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了凋亡识别受体在小鼠皮肤组织修复中的调控机制 | 首次在皮肤伤口炎症期间系统描绘细胞动态图谱,发现Axl和Timd4两种凋亡清除受体在组织修复中具有不同作用机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类糖尿病足伤口数据相对有限 | 探究凋亡细胞识别和清除机制如何调控组织修复过程 | 小鼠皮肤伤口模型和人类糖尿病足伤口 | 单细胞组学 | 皮肤创伤/糖尿病足 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2025-10-16 |
A Novel Prognostic Pyroptosis-Related Gene Signature Correlates to Oxidative Stress and Immune-Related Features in Gliomas
2023, Oxidative medicine and cellular longevity
DOI:10.1155/2023/4256116
PMID:36778205
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研究论文 | 构建并验证了一个基于焦亡相关基因的胶质瘤预后模型 | 首次将焦亡相关基因与胶质瘤预后关联,并构建了包含9个基因的预后特征 | 研究基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 开发胶质瘤预后预测工具并探索潜在治疗靶点 | 胶质瘤患者和U87胶质瘤细胞系 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序,LASSO-Cox回归,Kaplan-Meier分析,KEGG/GO富集分析 | 预后风险模型 | 基因表达数据,临床数据 | TCGA和CGGA队列的胶质瘤患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2025-10-05 |
A spatially resolved atlas of the human lung characterizes a gland-associated immune niche
2023-01, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01243-4
PMID:36543915
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研究论文 | 本研究通过多组学单细胞技术和空间转录组学构建了人类肺部空间分辨图谱,揭示了气管粘膜下腺中的免疫细胞生存微环境 | 发现了气管粘膜下腺中IgA浆细胞的生存微环境,并证明腺上皮细胞通过表达CCL28、APRIL和IL-6招募B细胞和IgA浆细胞,促进其局部存活和抗体分泌 | NA | 重新定义肺和气管的组织结构,解析人类肺部的空间组织结构 | 健康人类肺部的五个近端到远端位置 | 空间转录组学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 多组学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 人类肺部五个解剖位置的样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 14 | 2025-10-05 |
Melatonin modulates the hypothalamic-pituitary neuroendocrine axis to regulate physiological color change in teleost fish
2023, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.81055
PMID:37324950
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研究论文 | 本研究揭示褪黑素通过激活多种受体调控下丘脑-垂体神经内分泌轴,介导硬骨鱼生理性体色变化的分子机制 | 首次在海洋硬骨鱼中系统解析褪黑素信号系统的多重细胞内信号通路,并发现MT/MCH和MT/(TAC1+CRH)/MSH两条新型调控通路 | 研究仅聚焦于大黄鱼这一特定物种,其发现是否适用于其他硬骨鱼类仍需验证 | 探究褪黑素信号系统在硬骨鱼生理性体色变化中的调控机制 | 大黄鱼(海洋硬骨鱼)及其褪黑素受体信号通路 | 神经内分泌学 | NA | 单细胞RNA测序,药理学实验,配体-受体相互作用分析 | NA | 基因表达数据,空间表达模式数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA-seq methods to interrogate virus-host interactions
2023-01, Seminars in immunopathology
IF:7.9Q1
DOI:10.1007/s00281-022-00972-2
PMID:36414692
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综述 | 总结单细胞RNA测序技术及其在病毒-宿主相互作用研究中的应用 | 系统梳理了scRNA-seq技术在解析病毒基因组与宿主反应异质性、感染细胞与旁观者细胞差异反应及细胞间通讯网络方面的创新应用 | NA | 探讨单细胞RNA测序方法在病毒-宿主相互作用研究中的应用 | 病毒与宿主细胞的相互作用机制 | 自然语言处理 | 传染病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 16 | 2025-10-05 |
RNA Sequencing and Spatial Transcriptomics in Traumatic Spinal Cord Injury (Review)
2023, Sovremennye tekhnologii v meditsine
DOI:10.17691/stm2023.15.6.08
PMID:39944372
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综述 | 总结基于单细胞和单核RNA测序的转录组分析技术在创伤性脊髓损伤细胞特征鉴定和研究中的进展 | 整合单细胞RNA测序与空间转录组学技术,精确定位脊髓损伤区域并在细胞分子水平分析病理图像 | 需要更多人类细胞群体特异性数据与实验模型数据的比较分析 | 理解脊髓功能机制并建立治疗靶点 | 创伤性脊髓损伤中的细胞类型和神经组织细胞 | 空间转录组学 | 创伤性脊髓损伤 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,空间转录组学 | NA | 转录组数据,空间信息 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 17 | 2025-10-06 |
Role of mitochondria-bound HK2 in rheumatoid arthritis fibroblast-like synoviocytes
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1103231
PMID:37529037
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研究论文 | 本研究探讨线粒体结合型HK2在类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞表型调控中的关键作用 | 首次揭示线粒体定位的HK2通过调控细胞侵袭和迁移能力影响RA病理进程,并提出靶向线粒体HK2解离的新治疗策略 | 研究主要基于体外细胞实验和小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证 | 阐明线粒体结合型HK2在类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞表型调控中的分子机制 | 类风湿关节炎患者的成纤维样滑膜细胞和关节炎小鼠模型 | 分子生物学 | 类风湿关节炎 | 共聚焦显微镜、腺病毒感染、单细胞RNA测序、基因表达分析 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2025-10-06 |
Adult skin fibroblast state change in murine wound healing
2023-01-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-27152-4
PMID:36650180
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研究论文 | 通过分析小鼠皮肤伤口愈合的单细胞RNA测序数据,鉴定出一个在伤口愈合过程中显著增加的成纤维细胞亚群,并发现其与上皮间质转化和血管生成相关 | 首次在伤口愈合过程中识别出具有特定基因特征的成纤维细胞亚群,并通过药物数据库筛选出可能促进或延缓伤口愈合的候选药物 | 研究仅基于小鼠模型数据,尚未进行实验验证 | 探究皮肤伤口愈合过程中成纤维细胞的异质性变化 | 小鼠正常和受伤皮肤组织 | 单细胞转录组学 | 皮肤伤口愈合 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个小鼠皮肤伤口愈合时间点的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2025-10-06 |
Spatial Transcriptomics in Kidney Tissue
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3179-9_17
PMID:37423994
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研究论文 | 详细介绍空间转录组测序技术在肾脏组织中的应用方法 | 整合组织学与RNA测序,在完整组织空间背景下解析转录组表达 | NA | 开发和应用空间转录组测序技术于肾脏组织研究 | 小鼠和人类肾脏组织 | 空间转录组学 | 肾脏疾病 | 空间转录组测序 | NA | 空间转录组数据,H&E图像 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium Spatial Tissue Optimization, Visium Spatial Gene Expression | Visium空间组织优化协议和Visium空间基因表达协议 |
| 20 | 2025-10-06 |
A single-cell RNA sequencing atlas of circulating leukocytes from healthy and osteosarcoma affected dogs
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1162700
PMID:37275879
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了健康犬和骨肉瘤患犬循环白细胞图谱,并分析骨肉瘤对免疫细胞转录组的影响 | 首次构建犬类循环白细胞的单细胞RNA测序图谱,揭示了CD4 T细胞亚型的显著异质性,并发现骨肉瘤患犬中髓源性抑制细胞比例增加 | 样本量相对有限(健康犬7只,骨肉瘤患犬10只),且受犬类特异性试剂限制 | 深入表征犬类免疫细胞异质性,建立转化医学相关的动物模型 | 健康犬和骨肉瘤患犬的循环白细胞 | 单细胞测序 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 17只犬(7只健康犬,10只骨肉瘤患犬) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |