单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 327 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing for the Detection of Clonotypic V(D)J Rearrangements in Multiple Myeloma
2022-Dec-10, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms232415691
PMID:36555330
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研究论文 | 本文探讨了通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）检测多发性骨髓瘤（MM）中克隆型V(D)J重排序列的可行性 | scRNA-seq分析在识别克隆性生产重排方面比标准方法更有效，避免了高突变区域中共识引物错配的限制 | NA | 验证单细胞RNA测序在检测多发性骨髓瘤中克隆型V(D)J重排序列的准确性和有效性 | 多发性骨髓瘤患者的骨髓样本中的CD138细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 19个含有浆细胞紊乱的骨髓抽吸样本 |
| 142 | 2024-08-08 |
Comparative Analysis of mRNA and miRNA Expression between Dermal Papilla Cells and Hair Matrix Cells of Hair Follicles in Yak
2022-12-09, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11243985
PMID:36552749
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研究论文 | 本研究比较了牦牛毛囊中真皮乳头细胞和毛母质细胞的mRNA和miRNA表达差异，以分析这两种细胞在毛囊发育中的分子相互作用基础 | 本研究结合了10×基因组单细胞转录组数据，鉴定了39个牦牛真皮乳头细胞的标记基因，并筛选出123个相对特异性表达的miRNAs，其中包括与毛囊发育相关的miR-143、miR-214、miR-125b、miR-31和miR-200 | NA | 探讨牦牛毛囊中真皮乳头细胞和毛母质细胞在毛囊发育中的分子机制 | 牦牛毛囊中的真皮乳头细胞和毛母质细胞 | NA | NA | 10×基因组单细胞转录组 | NA | mRNA和miRNA | NA |
| 143 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing of the Testis of Ciona intestinalis Reveals the Dynamic Transcriptional Profile of Spermatogenesis in Protochordates
2022-12-08, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11243978
PMID:36552742
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研究论文 | 本研究首次对Ciona intestinalis的睾丸进行单细胞RNA测序，揭示了原索动物精子发生过程中的动态转录谱 | 首次在原索动物中进行单细胞RNA测序，揭示了精子发生过程中的基因表达和转录调控动态 | 研究仅限于Ciona intestinalis，且部分特定基因的功能需要进一步验证 | 探究原索动物精子发生的基因调控机制 | Ciona intestinalis的睾丸中的6832个生殖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 6832个生殖细胞 |
| 144 | 2024-08-08 |
Baicalein Relieves Ferroptosis-Mediated Phagocytosis Inhibition of Macrophages in Ovarian Endometriosis
2022-Dec-07, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb44120422
PMID:36547083
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研究论文 | 本文研究了铁过载在卵巢子宫内膜异位症中对巨噬细胞的影响，并探讨了黄芩素在缓解铁死亡介导的巨噬细胞吞噬功能抑制中的作用 | 首次揭示了铁死亡在卵巢子宫内膜异位症中通过影响巨噬细胞的吞噬功能和促进血管生成细胞因子的产生，从而促进疾病发展的机制 | NA | 探讨铁过载在卵巢子宫内膜异位症中对巨噬细胞的影响及黄芩素的潜在治疗作用 | 卵巢子宫内膜异位症中的巨噬细胞及黄芩素的作用 | NA | 妇科疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及卵巢子宫内膜异位症患者的巨噬细胞和THP-1细胞 |
| 145 | 2024-08-08 |
Diversity of Circulating NKT Cells in Defense against Carbapenem-Resistant Klebsiella Pneumoniae Infection
2022-Dec-07, Journal of personalized medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jpm12122025
PMID:36556247
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了在碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌（CRKP）感染过程中，外周血中NK和NKT细胞的免疫反应 | 首次详细描述了NKT细胞亚群在CRKP感染过程中的免疫作用机制 | 研究样本量较小，仅涉及3名患者 | 探讨NKT细胞在防御碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌感染中的作用 | 外周血中的NK和NKT细胞 | NA | 肺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 血液样本 | 3名CRKP感染患者 |
| 146 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing of Malignant Ascites Reveals Transcriptomic Remodeling of the Tumor Microenvironment during the Progression of Epithelial Ovarian Cancer
2022-12-02, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13122276
PMID:36553542
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析了五名上皮性卵巢癌患者的恶性腹水样本，揭示了肿瘤微环境在疾病进展中的转录组重塑 | 研究首次详细描述了恶性腹水中肿瘤微环境在卵巢癌进展中的动态变化，包括癌细胞状态的转变和相关生物通路的激活 | 研究样本量较小，仅基于五个患者的样本，可能影响结果的普遍性 | 探索上皮性卵巢癌患者恶性腹水中肿瘤微环境在肿瘤进展和复发中的调控机制 | 上皮性卵巢癌患者的恶性腹水样本 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序 | 无监督深度嵌入单细胞聚类算法 | 转录组数据 | 4680个单细胞，来自五个上皮性卵巢癌患者（三个诊断样本和两个复发样本） |
| 147 | 2024-08-08 |
scDSSC: Deep Sparse Subspace Clustering for scRNA-seq Data
2022-12, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1010772
PMID:36534702
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研究论文 | 本文提出了一种结合噪声降低和维度降低的深度稀疏子空间聚类方法scDSSC，用于单细胞RNA测序数据，该方法通过显式建模scRNA-seq数据生成，同时学习特征表示和聚类 | scDSSC方法在多种scRNA-seq数据集上显著提高了聚类性能，并增强了聚类和下游分析的可解释性 | NA | 旨在改进单细胞RNA测序数据的聚类分析 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 深度稀疏子空间聚类 | 单细胞RNA测序数据 | 数千至数万个细胞 |
| 148 | 2024-08-08 |
Impact of CD4 T cells on intratumoral CD8 T-cell exhaustion and responsiveness to PD-1 blockade therapy in mouse brain tumors
2022-12, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2022-005293
PMID:36543376
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研究论文 | 本文研究了CD4 T细胞对小鼠脑肿瘤中肿瘤内CD8 T细胞耗竭和PD-1阻断疗法反应性的影响 | 首次描述了功能失调的CD4 T细胞与终末期CD8 T细胞耗竭的关联，并展示了CD40激动剂与PD-1阻断疗法的协同作用 | NA | 探究CD4 T细胞对CD8 T细胞耗竭和PD-1阻断疗法反应性的影响 | 小鼠脑肿瘤模型中的CD4和CD8 T细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 雌性C57/BL6小鼠的肿瘤浸润淋巴细胞 |
| 149 | 2024-08-08 |
Modeling resistance of colorectal peritoneal metastases to immune checkpoint blockade in humanized mice
2022-12, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2022-005345
PMID:36543378
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研究论文 | 本文通过将患者来源的器官样移植到人源化小鼠的盲肠中，创建了一个新的MSI-H CRC肿瘤自发多器官转移模型，并分析了免疫检查点阻断治疗的效果及其与肿瘤免疫环境的关系。 | 结合器官样和人源化小鼠技术，提供了一个新的自发多器官转移模型，并提供了B细胞在抗CTLA-4治疗后产生部位依赖性抗肿瘤免疫中的关键作用的实证。 | NA | 研究免疫检查点阻断治疗在MSI-H CRC肿瘤中的效果及其机制。 | MSI-H CRC肿瘤的自发多器官转移及其对免疫检查点阻断治疗的反应。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 免疫组织化学、流式细胞术和单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 患者来源的器官样移植到人源化小鼠的盲肠中 |
| 150 | 2024-08-08 |
Characterizing Macrophages Diversity in COVID-19 Patients Using Deep Learning
2022-12-01, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13122264
PMID:36553530
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研究论文 | 本研究利用深度学习技术分析了COVID-19患者的单细胞RNA测序数据，以识别与疾病严重程度相关的分子状态 | 本研究首次使用图卷积神经网络模型来预测COVID-19感染的严重程度，并展示了高预测准确率 | NA | 旨在通过计算方法识别与COVID-19感染严重程度相关的分子状态，以理解关键免疫反应的差异 | COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液样本中的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | 图卷积神经网络 | 基因表达数据 | 12个支气管肺泡灌洗液样本，包含63,734个细胞，每个细胞有23,916个基因 |
| 151 | 2024-08-08 |
The Sum of Two Halves May Be Different from the Whole-Effects of Splitting Sequencing Samples Across Lanes
2022-12-01, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13122265
PMID:36553532
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研究论文 | 本文探讨了将样本分批进行高通量测序（HTS）时，跨测序道分割样本对结果的影响 | 系统性地分析了测序设计中被忽略的变异来源，并展示了这种分割对批量和单细胞测序数据分析的定性和定量影响 | 文章未详细说明解决这些问题的具体方法或技术 | 研究测序设计中的变异来源及其对结果稳健性和可重复性的影响 | 批量mRNA测序、批量ChIP测序和单细胞测序数据 | 高通量测序 | NA | 高通量测序（HTS） | NA | 序列数据 | 未具体说明样本数量 |
| 152 | 2024-08-08 |
Global Characteristics and Dynamics of Single Immune Cells After Myocardial Infarction
2022-12-20, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.122.027228
PMID:36515244
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了心肌梗死后小鼠心脏中CD45阳性免疫细胞的异质性和动态变化 | 首次揭示了心肌梗死后免疫细胞亚群的复杂转录谱、通路、细胞相互作用网络及转录调控因子，并发现Fos/AP-1调控网络在炎症反应中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证这些发现 | 探究心肌梗死后免疫细胞的异质性和动态变化，并寻找潜在的治疗干预靶点 | 小鼠心脏中的CD45阳性免疫细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 30,135个CD45免疫细胞 |
| 153 | 2024-08-08 |
Construction and experimental validation of a B cell senescence-related gene signature to evaluate prognosis and immunotherapeutic sensitivity in bladder cancer
2022-Dec-17, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-022-00936-7
PMID:36527532
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研究论文 | 本研究构建并验证了一个与B细胞衰老相关的基因特征，用于评估膀胱癌的预后和免疫治疗敏感性 | 首次构建了一个B细胞衰老相关基因特征，用于评估膀胱癌的预后和免疫治疗敏感性，并通过多个大型队列验证了其可靠性和稳健性 | NA | 阐明B细胞衰老相关基因在膀胱癌中的预后价值 | B细胞衰老相关基因在膀胱癌中的预后和免疫治疗敏感性 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | 随机森林算法 | 基因表达数据 | 训练数据集来自癌症基因组图谱膀胱癌队列，验证数据集包括来自GEO的三个队列、35个临床样本和体外细胞实验 |
| 154 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing and lineage tracing confirm mesenchyme to epithelial transformation (MET) contributes to repair of the endometrium at menstruation
2022-Dec-16, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.77663
PMID:36524724
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研究论文 | 本研究使用小鼠模型和三种转基因小鼠系，通过单细胞RNA测序技术，探讨了子宫内膜修复过程中上皮细胞是否源自子宫内膜间质中的间充质细胞类型 | 首次发现了一群对损伤有响应的、可塑性强的子宫内膜间质成纤维细胞，这些细胞在子宫内膜修复过程中有助于快速恢复完整的上皮层 | NA | 验证间充质到上皮转化（MET）在子宫内膜月经修复中的作用 | 子宫内膜修复过程中的间充质细胞和上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了三种转基因小鼠系 |
| 155 | 2024-08-08 |
Loss of Y in leukocytes as a risk factor for critical COVID-19 in men
2022-12-14, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-022-01144-5
PMID:36514076
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研究论文 | 本研究探讨了染色体Y丢失（LOY）在男性COVID-19重症风险中的作用，通过分析公开的单细胞RNA测序数据和来自重症监护室（ICU）的COVID-19患者的血液样本，发现LOY与COVID-19的严重程度和死亡率相关。 | 首次揭示了LOY与急性、危及生命的传染病之间的联系，并强调了LOY作为影响骨髓细胞系的最显著克隆突变。 | NA | 探讨染色体Y丢失（LOY）在男性COVID-19重症风险中的作用。 | LOY在COVID-19重症男性患者中的分布及其与疾病严重程度的关系。 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据 | 211名在重症监护室（ICU）接受治疗的COVID-19患者 |
| 156 | 2024-08-08 |
TATTOO-seq delineates spatial and cell type-specific regulatory programs in the developing limb
2022-Dec-14, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.add0695
PMID:36516250
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研究论文 | 本文开发并应用了一种无偏的空间分辨单细胞转录组学方法，以识别在鼠肢体发育过程中特化细胞类型出现及其空间整合的遗传程序 | 本文创新性地使用了一种无偏的空间分辨单细胞转录组学方法，揭示了细胞类型特异性和空间位置相关的转录因子表达模式 | NA | 研究胚胎发育中细胞分化和空间组织的遗传调控机制 | 鼠肢体发育中的细胞类型和空间组织 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 157 | 2024-08-08 |
A multiple sclerosis-protective coding variant reveals an essential role for HDAC7 in regulatory T cells
2022-12-14, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abl3651
PMID:36516268
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研究论文 | 本文研究了一种保护性的组蛋白去乙酰化酶7（HDAC7）变异体在调节性T细胞中的作用，并探讨了其在多发性硬化症（MS）中的潜在保护机制。 | 首次揭示了HDAC7在调节性T细胞中的关键作用，并通过体内外模型验证了其对多发性硬化症的保护作用。 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步的人体临床试验验证。 | 探讨HDAC7变异体在多发性硬化症中的保护作用及其机制。 | HDAC7变异体在调节性T细胞中的功能及其对多发性硬化症的影响。 | 免疫学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及小鼠模型和体外功能 assay 的细胞样本 |
| 158 | 2024-08-08 |
A pan-cancer analysis of the FAT1 in human tumors
2022-12-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-26008-1
PMID:36517565
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研究论文 | 本研究探讨了FAT1在33种肿瘤中的潜在致癌作用，基于The Cancer Genome Atlas和Gene Expression Omibus数据集 | 首次进行了FAT1在多种癌症中的泛癌研究，提供了对FAT1致癌作用的全面理解 | NA | 探索FAT1在多种肿瘤中的致癌作用 | FAT1基因在33种肿瘤中的表达及其与肿瘤预后的关系 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 33种肿瘤样本 |
| 159 | 2024-08-08 |
Locally organised and activated Fth1hi neutrophils aggravate inflammation of acute lung injury in an IL-10-dependent manner
2022-12-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-35492-y
PMID:36513690
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，识别了脂多糖诱导的小鼠急性肺损伤肺部中两种转录和功能异质性的中性粒细胞群体，并探讨了它们在急性肺损伤中的作用 | 首次揭示了急性肺损伤中肺部中性粒细胞的表型异质性，并发现了Fth1 Neu亚型在炎症反应中的重要作用 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证结果 | 探讨急性肺损伤中中性粒细胞的表型异质性及其在疾病发展中的作用 | 急性肺损伤中的中性粒细胞 | NA | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠肺部组织样本 |
| 160 | 2024-08-08 |
Single-cell microglial transcriptomics during demyelination defines a microglial state required for lytic carcass clearance
2022-12-13, Molecular neurodegeneration
IF:14.9Q1
DOI:10.1186/s13024-022-00584-2
PMID:36514132
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了在脱髓鞘过程中小胶质细胞的转录组变化，并探讨了小胶质细胞在清除溶解的细胞残骸中的作用。 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了在脱髓鞘过程中小胶质细胞的特定转录组状态，并证明了小胶质细胞在清除溶解的细胞残骸中的重要作用。 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能需要进一步的人体研究来验证结果。 | 探讨小胶质细胞在脱髓鞘过程中的响应和调控机制。 | 小胶质细胞在脱髓鞘过程中的转录组变化及其在清除细胞残骸中的作用。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了基因命运图谱的小胶质细胞样本 |