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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2024-08-05 |
Activated B cells suppress T-cell function through metabolic competition
2022-12, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2022-005644
PMID:36543374
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研究论文 | 本研究揭示了活化B细胞的代谢活性对T细胞功能的抑制作用 | 首次揭示了活化B细胞的代谢活性对免疫调节及抗肿瘤T细胞反应的抑制作用 | 该研究可能未涵盖所有类型的肿瘤及B细胞的不同表现 | 探讨活化B细胞通过代谢竞争抑制T细胞功能的机制 | 活化B细胞及其对T细胞的影响 | 免疫学 | 黑色素瘤 | 质量细胞术和单细胞RNA测序 | NA | 临床样本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 82 | 2024-08-05 |
High-throughput total RNA sequencing in single cells using VASA-seq
2022-12, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01361-8
PMID:35760914
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研究论文 | 本文开发了VASA-seq技术,以检测单细胞中的整体转录组 | VASA-seq能够捕获所有RNA分子的总转录组,克服了传统方法无法检测许多长非编码 RNA及非多腺苷酸化转录本的限制 | 本文未提到具体的限制因素 | 研究单细胞转录组,并分析不同发育阶段的RNA动态 | 在小鼠胚胎的胚胎发生和器官发生早期阶段研究超过30,000个单细胞 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | RNA数据 | 超过30,000个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 83 | 2024-08-05 |
Cell types and molecular architecture of the Octopus bimaculoides visual system
2022-12-05, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2022.10.015
PMID:36318923
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研究论文 | 该论文呈现了章鱼视觉系统的单细胞分子图谱 | 首次系统性描绘了章鱼视网膜的细胞类型及其分子特征 | 研究可能在未覆盖的细胞类型和功能连接性方面存在局限 | 探索章鱼视觉系统的细胞类型和分子架构 | 章鱼的视觉神经元及其分子特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序,RNA原位杂交 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 84 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing: promises and challenges for human genetics
2022-Dec, Medizinische Genetik : Mitteilungsblatt des Berufsverbandes Medizinische Genetik e.V
IF:0.8Q4
DOI:10.1515/medgen-2022-2156
PMID:38836091
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综述 | 这篇文章描述了单细胞测序在人的遗传学中的现状及其应用 | 该技术承诺在宏观规模上功能性地注释人类基因组中的每个区域及其所有可能的变异 | 文章未具体提及单细胞测序的局限性 | 研究单细胞测序在人的遗传学中的作用和应用 | 讨论该技术如何应用于表征和监测疾病,开发人类细胞图谱,以及注释基因组 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 85 | 2024-08-05 |
The Vasculature in Pulmonary Fibrosis
2022-Dec, Current tissue microenvironment reports
DOI:10.1007/s43152-022-00040-9
PMID:36712832
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review | 本文回顾了特发性肺纤维化(IPF)中血管的变化及其对纤维化病理生理的影响 | 此文通过单细胞RNA测序的进展,更好地表征了肺内皮细胞类型,并识别了IPF患者的血管变化 | 需要更多的研究来进一步定义这些血管变化的功能角色 | 研究血管在特发性肺纤维化中的作用及其变化 | 特发性肺纤维化患者的肺组织 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织 | 涉及特发性肺纤维化患者的肺组织 | NA | NA | NA | NA |
| 86 | 2024-08-05 |
Multiplex immunofluorescence-guided laser capture microdissection for spatial transcriptomics of metastatic melanoma tissues
2022-12-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101698
PMID:36149794
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研究论文 | 本文描述了一种优化和简化的多重免疫荧光引导的激光捕获显微切割流程 | 这一流程能够基于细胞表型和组织定位收集个体细胞以进行转录组分析 | 该方法主要描述于黑色素瘤组织的应用,尽管也适用于其他类型的组织 | 研究该流程在转录组分析中的应用 | 研究对象包括CD3+ T细胞、CD14+单核细胞/巨噬细胞和黑色素瘤细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 下一代RNA测序 | NA | 转录组 | 非解离的转移性黑色素瘤组织中的细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 87 | 2024-08-05 |
LDL delivery of microbial small RNAs drives atherosclerosis through macrophage TLR8
2022-12, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-022-01030-7
PMID:36474072
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研究论文 | 本研究表明微生物小RNA(msRNA)通过低密度脂蛋白(LDL)驱动促炎性巨噬细胞极化和细胞因子分泌。 | 确定了LDL-msRNA作为动脉粥样硬化相关炎症的诱因,揭示了LDL在胆固醇运输之外的其他功能。 | NA | 研究微生物小RNA在动脉粥样硬化中通过巨噬细胞TLR8的作用机制。 | 聚焦于巨噬细胞表型及其在动脉粥样硬化病理中的作用。 | 数字病理学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | NA | 小鼠模型中的不同动脉粥样硬化模型 | NA | NA | NA | NA |
| 88 | 2024-08-05 |
Determination of the nanoparticle- and cell-specific toxicological mechanisms in 3D liver spheroids using scRNAseq analysis
2022-Dec, Nano today
IF:13.2Q1
DOI:10.1016/j.nantod.2022.101652
PMID:36911538
|
研究论文 | 本研究探讨了纳米颗粒在3D肝脏类球体中对肝细胞的毒理学机制 | 使用单细胞RNA测序(scRNAseq)分析不同纳米材料对肝细胞和库普弗细胞的特异性毒性反应 | 未提及具体的局限性 | 研究纳米颗粒对肝细胞的影响及其毒理学机制 | 3D肝脏类球体中的肝细胞和库普弗细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | NA | 基因表达数据 | 三种不同材料成分的体外3D肝脏类球体模型 | NA | NA | NA | NA |
| 89 | 2024-08-07 |
The challenges and opportunities of scRNA-seq in COVID-19 research and clinical translation
2022-12-15, Virology journal
IF:4.0Q2
DOI:10.1186/s12985-022-01923-x
PMID:36522785
|
评论 | 本文讨论了单细胞RNA测序在COVID-19研究中的应用,以及其在加速基础研究和治疗开发方面的挑战和前景 | 单细胞RNA测序技术在COVID-19研究中提高了对疾病发病机制和免疫特性的理解 | 讨论了当前利用单细胞RNA测序技术的挑战和局限性 | 加速COVID-19和其他新兴传染病的基本研究和治疗开发 | COVID-19和其他新兴传染病 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 90 | 2024-08-07 |
Protocol to obtain high-quality single-cell RNA-sequencing data from mouse liver cells using centrifugation
2022-12-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101824
PMID:36386875
|
研究论文 | 本文介绍了一种使用离心法从鼠肝细胞中获取高质量单细胞RNA测序数据的方法 | 提出了一种新的离心法来获取可存活的肝细胞和非实质性肝细胞,以避免使用荧光激活细胞分选(FACS)导致的细胞死亡问题 | NA | 开发一种新的方法来获取高质量的肝细胞单细胞RNA测序数据 | 鼠肝细胞,特别是肝细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 91 | 2024-08-07 |
DeepVelo: Single-cell transcriptomic deep velocity field learning with neural ordinary differential equations
2022-Dec-02, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abq3745
PMID:36449617
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研究论文 | 本文介绍了一种基于神经网络的常微分方程模型DeepVelo,用于模拟单细胞转录组动力学 | DeepVelo能够通过描述单细胞内连续时间的基因表达变化,来模拟复杂的转录组动力学 | NA | 研究单细胞转录组动力学,并探索细胞状态的不稳定性及发育驱动基因 | 单细胞基因表达数据和RNA速度 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 神经网络 | 基因表达数据 | 使用来自不同测序平台的公共数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 92 | 2024-08-07 |
The vascular phenotype of BPD: new basic science insights-new precision medicine approaches
2022-Dec-22, Pediatric research
IF:3.1Q1
DOI:10.1038/s41390-022-02428-7
PMID:36550351
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研究论文 | 本文探讨了支气管肺发育不良(BPD)的血管表型,并提出了基于细胞和微小RNA的精准医疗方法 | 利用单细胞RNA测序技术深入研究了BPD-PH中发育性内皮细胞耗竭,并提出了基于外泌体和微小RNA的治疗策略 | 需要更多关于中断通路、干预时机和递送方式的研究 | 探索BPD中血管表型的分子机制,并开发新的治疗策略 | BPD患儿的肺血管发育和肺动脉高压 | 生物医学 | 新生儿疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 93 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing analyses: interference by the genes that encode the B-cell and T-cell receptors
2022-Dec-06, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elac044
PMID:36473726
|
研究论文 | 本文研究了单细胞RNA测序数据中B细胞和T细胞受体编码基因对无监督聚类和下游分析的影响 | 首次系统分析了包含与排除B细胞和T细胞受体编码基因对单细胞RNA测序数据分析的影响 | 仅限于B细胞和T细胞的研究,未涉及其他细胞类型 | 探讨B细胞和T细胞受体编码基因在单细胞RNA测序中的作用 | B细胞和T细胞 | 基因组学 | 自身免疫病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 94 | 2024-08-07 |
Langerhans cells are essential components of the angiogenic niche during murine skin repair
2022-12-19, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.11.012
PMID:36493773
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析小鼠皮肤伤口愈合过程中的早期血管生成微环境,揭示朗格汉斯细胞在皮肤修复中的血管生成作用 | 首次揭示朗格汉斯细胞在皮肤修复中的血管生成作用,扩展了其在抗原呈递和T细胞免疫之外的功能 | NA | 研究朗格汉斯细胞在小鼠皮肤修复中的血管生成作用 | 小鼠皮肤伤口愈合过程中的朗格汉斯细胞和血管生成 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠皮肤伤口样本 | NA | NA | NA | NA |
| 95 | 2024-08-07 |
Long read single cell RNA sequencing reveals the isoform diversity of Plasmodium vivax transcripts
2022-12, PLoS neglected tropical diseases
IF:3.4Q1
DOI:10.1371/journal.pntd.0010991
PMID:36525464
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研究论文 | 本研究利用Pacific Biosciences化学方法对单细胞寄生虫进行scRNA-seq库测序,以表征全长Plasmodium vivax转录本 | 首次使用长读长测序技术在单细胞水平上表征Plasmodium vivax的转录本多样性 | NA | 旨在揭示Plasmodium vivax转录本的异构体多样性 | Plasmodium vivax转录本的异构体多样性 | 测序技术 | 疟疾 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),Pacific Biosciences(PacBio)化学 | NA | 转录组数据 | 多个单细胞寄生虫样本 | NA | NA | NA | NA |
| 96 | 2024-08-07 |
Titration of 124 antibodies using CITE-Seq on human PBMCs
2022-12-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-24371-7
PMID:36460735
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研究论文 | 研究使用CITE-Seq技术在人外周血单个核细胞(PBMCs)上滴定124种抗体的最佳浓度 | 首次系统地评估了188种CITE-Seq抗体在PBMCs上的检测能力,并找到了最佳的染色浓度 | 研究仅限于人外周血单个核细胞,未涉及其他细胞类型 | 确定哪些CITE-Seq抗体能在PBMCs上检测到其抗原,并找到最佳的染色浓度 | 188种CITE-Seq抗体及其在PBMCs上的检测能力 | 单细胞测序 | NA | CITE-Seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 人外周血单个核细胞(PBMCs) | NA | NA | NA | NA |
| 97 | 2024-08-07 |
An extensive bioinformatics study on the role of mitochondrial solute carrier family 25 in PC and its mechanism behind affecting immune infiltration and tumor energy metabolism
2022-12-13, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-022-03756-2
PMID:36514121
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研究论文 | 本研究通过lasso方法构建了一个基于SLC25A成员的胰腺癌(PC)新型预后风险模型,并探讨了其在肿瘤免疫学和能量代谢中的作用 | 首次构建了基于SLC25A成员的胰腺癌预后风险模型,并揭示了SLC25A11、SLC25A29和SLC25A44在肿瘤能量代谢和免疫浸润中的作用 | NA | 探讨线粒体溶质载体家族25(SLC25A)成员在胰腺癌中的生物学作用及其影响免疫浸润和肿瘤能量代谢的机制 | SLC25A成员在胰腺癌中的作用及其机制 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(ScRNA-seq) | lasso方法 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 98 | 2024-08-07 |
Cancer immunotherapies transition endothelial cells into HEVs that generate TCF1+ T lymphocyte niches through a feed-forward loop
2022-12-12, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2022.11.002
PMID:36423635
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学、内皮细胞命运图谱和功能性多重免疫分析,展示了抗血管生成免疫调节疗法如何通过淋巴毒素/淋巴毒素β受体信号传导诱导后毛细血管静脉向炎症性高内皮小静脉(HEVs)的转分化 | 本文首次揭示了肿瘤HEVs通过淋巴毒素/淋巴毒素β受体信号传导促进肿瘤内淋巴细胞流入和形成允许性淋巴细胞微环境的新机制 | 本文未详细探讨肿瘤HEVs在不同类型癌症中的普遍性和具体作用机制 | 探讨肿瘤相关三级淋巴样结构(TA-TLLSs)的形成机制及其在免疫治疗中的作用 | 肿瘤内皮细胞、淋巴细胞及其相互作用 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞转录组学、内皮细胞命运图谱、功能性多重免疫分析 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 99 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis reveals nanosecond pulsed electric field ablation induced myeloid cells remodeling in pancreatic cancer
2022-Dec, Bioelectrochemistry (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.bioelechem.2022.108266
PMID:36179391
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了纳米秒脉冲电场(nsPEF)处理后胰腺癌小鼠模型中骨髓细胞的表型和功能变化 | 首次详细描述了nsPEF处理对胰腺癌中肿瘤浸润性骨髓细胞的重组作用 | NA | 探究nsPEF治疗对胰腺癌中骨髓细胞的影响及其对肿瘤免疫的调控作用 | 胰腺癌小鼠模型中的骨髓细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | Panc02胰腺癌小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 100 | 2024-08-07 |
IRF1 expression might be a biomarker of CD8+ T cell infiltration in cutaneous melanoma
2022-12, Expert review of clinical immunology
IF:3.9Q2
DOI:10.1080/1744666X.2022.2141228
PMID:36300336
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研究论文 | 本研究旨在探讨皮肤黑色素瘤中干扰素调节因子(IRF)基因的表达模式及其与CD8+ T细胞浸润的关联,以及在黑色素瘤和非黑色素瘤细胞中的潜在调控网络 | 发现IRF1表达与CD8+ T细胞浸润的强关联,并识别出四个关键的CpG位点可能调控IRF1的转录 | NA | 探索皮肤黑色素瘤中IRF基因的表达与CD8+ T细胞浸润的关系及其调控网络 | 皮肤黑色素瘤中的IRF基因表达及CD8+ T细胞浸润 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA Pan-Cancer、GTEx项目、Human Protein Atlas和Jerby-Arnon et al. 2018的数据集 | NA | NA | NA | NA |