单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 327 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2024-08-08 |
Onepot-Seq: capturing single-cell transcriptomes simultaneously in a continuous medium via transient localization of mRNA
2022-12-09, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac665
PMID:35953080
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Onepot-Seq的无设备方法，用于在连续流体介质中同时捕获单细胞转录组 | Onepot-Seq利用裂解后mRNA的短暂定位，无需复杂设备即可捕获单细胞转录组 | NA | 开发一种无需复杂设备的新方法，以扩大单细胞RNA测序的应用范围 | 单细胞转录组 | 生物技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 混合物种实验中获得了高质量的单细胞数据 |
| 302 | 2024-08-08 |
Preparation of Intact Nuclei for Single-Nucleus Omics Using Frozen Cell Suspensions from Mutant Embryos of Xenopus tropicalis
2022-12-01, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.prot107825
PMID:35953244
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研究论文 | 本文介绍了一种从冷冻细胞悬液中分离高质量核的方法，用于单核转录组学分析 | 开发了一种新协议，可以从冷冻细胞悬液中分离出高质量的核，并用于单核RNA测序 | NA | 研究突变和野生型胚胎在未分化阶段的基因表达差异，以及突变对发育轨迹或先天性疾病表型的影响 | Xenopus tropicalis的突变和野生型胚胎 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（RNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 少量单个胚胎悬液 |
| 303 | 2024-08-08 |
Intestinal Epithelial Responses to IL-17 in Adult Stem Cell-derived Human Intestinal Organoids
2022-Dec-05, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjac101
PMID:35927216
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研究论文 | 研究IL-17在成人干细胞衍生的肠道类器官中的作用及其对肠道上皮细胞的影响 | 首次揭示IL-17通过诱导肠道干细胞和肠上皮细胞的焦亡以及杯状细胞的黏液分泌和上皮细胞的IgA转运，发挥保护和病理作用 | 研究主要集中在体外类器官模型，可能与体内环境存在差异 | 探讨IL-17在肠道上皮细胞中的保护和病理作用机制 | 成人干细胞衍生的肠道类器官 | NA | 炎症性肠病 | RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未具体说明样本数量 |
| 304 | 2024-08-08 |
A multi-omic single cell sequencing approach to develop a CD8 T cell specific gene signature for anti-PD1 response in solid tumors
2022-Dec-01, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.34218
PMID:35932450
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研究论文 | 本文通过多组学单细胞测序方法，开发了一种针对CD8 T细胞的基因特征，用于预测实体肿瘤中抗PD1治疗的反应 | 本文利用单细胞RNA测序和单细胞TCR测序技术，揭示了抗PD1反应者和非反应者小鼠肿瘤模型中扩展的TCR克隆型的保守和独特的转录组特征 | NA | 开发一种新的生物标志物，用于预测免疫检查点阻断治疗在实体肿瘤中的反应 | CD8 T细胞在抗PD1治疗中的基因特征 | 数字病理学 | 实体肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 多个人类恶性肿瘤和小鼠同基因肿瘤模型 |
| 305 | 2024-08-08 |
Single-cell Sequencing Reveals Clearance of Blastula Chromosomal Mosaicism in In Vitro Fertilization Babies
2022-12, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2022.07.004
PMID:35944838
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学测序分析了七名在胚胎期检测到染色体嵌合体的婴儿，发现胚胎期的染色体嵌合现象可能在发育过程中自行纠正 | 首次通过单细胞多组学测序证实胚胎期染色体嵌合体在出生后可能自行纠正，为胚胎移植提供了新的评估依据 | 研究样本量较小，需要进一步扩大样本验证结果的普遍性 | 探讨胚胎期染色体嵌合体在出生后的染色体状态 | 七名在胚胎期检测到染色体嵌合体的婴儿及其外周血细胞 | NA | NA | 单细胞多组学测序 | NA | 基因组数据和转录组数据 | 1616个外周血细胞来自七名婴儿和三名对照婴儿 |
| 306 | 2024-08-08 |
Mutations in OOEP and NLRP5 identified in infertile patients with early embryonic arrest
2022-12, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1002/humu.24448
PMID:35946397
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研究论文 | 本研究通过全外显子测序分析了118名经历反复胚胎植入前停滞的中国不孕患者，发现了OOEP和NLRP5基因的新变异，这些变异与早期胚胎停滞有关 | 首次证明了OOEP基因的双等位变异也能导致人类早期胚胎停滞，扩展了与早期胚胎发生相关的SCMC基因的遗传变异谱 | NA | 探究与早期胚胎停滞相关的新基因变异 | OOEP和NLRP5基因在不孕患者中的变异及其对胚胎发育的影响 | NA | 不孕症 | 全外显子测序，单细胞RNA测序 | NA | 基因序列数据，RNA表达数据 | 118名不孕患者及其胚胎 |
| 307 | 2024-08-08 |
The M3 Muscarinic Acetylcholine Receptor Promotes Epidermal Differentiation
2022-12, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2022.06.013
PMID:35870560
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研究论文 | 研究M3毒蕈碱乙酰胆碱受体如何调控表皮结构和功能 | 首次揭示了乙酰胆碱如何控制表皮分化，并为未来在皮肤病学中评估胆碱能药物的治疗潜力奠定了基础 | NA | 研究M3毒蕈碱乙酰胆碱受体在表皮分化中的作用及其细胞和分子机制 | M3毒蕈碱乙酰胆碱受体在表皮细胞中的表达和功能 | NA | 自身免疫性水疱病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | Chmr3新生小鼠的表皮细胞 |
| 308 | 2024-08-08 |
The Value of Single-cell Technologies in Solid Organ Transplantation Studies
2022-12-01, Transplantation
IF:5.3Q1
DOI:10.1097/TP.0000000000004237
PMID:35876376
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综述 | 本文综述了单细胞技术在实体器官移植研究中的应用和价值 | 单细胞技术为实体器官移植后的免疫反应机制提供了深入的见解 | 文章讨论了单细胞技术在实体器官移植研究中面临的挑战 | 探讨单细胞技术在实体器官移植研究中的应用，以更好地理解排斥和耐受的免疫机制 | 单细胞技术在实体器官移植中的应用，包括免疫细胞亚群的特征识别和生物标志物的鉴定 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 309 | 2024-08-08 |
Epigenetic Regulation of Profibrotic Macrophages in Systemic Sclerosis-Associated Interstitial Lung Disease
2022-12, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42286
PMID:35849803
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研究论文 | 本研究探讨了系统性硬化症相关间质性肺病（SSc-ILD）中促纤维化分泌磷蛋白1（SPP1）表达的巨噬细胞的转录组和染色质结构变化，以揭示其在促进纤维化中的作用及相关的转录因子。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序和染色质可及性测序技术，详细分析了SSc-ILD中SPP1巨噬细胞的转录组和染色质结构变化，并预测了调控这些巨噬细胞分化的转录因子。 | 研究仅限于5个肺样本，样本量较小，可能影响结果的普遍性和可靠性。 | 旨在揭示SSc-ILD中促纤维化SPP1巨噬细胞的转录组和染色质结构变化，并识别相关的转录因子，为治疗SSc-ILD提供新的靶点。 | 系统性硬化症相关间质性肺病（SSc-ILD）中的促纤维化SPP1表达巨噬细胞。 | 数字病理学 | 间质性肺病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq），染色质可及性测序 | NA | 基因表达数据 | 11个SSc-ILD和健康对照肺样本，5个肺样本用于染色质可及性测序 |
| 310 | 2024-08-08 |
Different Molecular Features of Epithelioid and Giant Cells in Foreign Body Reaction Identified by Single-Cell RNA Sequencing
2022-12, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2022.06.014
PMID:35853485
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间测序技术，分析了海绵和丝绸引起的外来体反应中的上皮细胞和巨细胞的分子特征 | 首次揭示了上皮细胞和巨细胞在外来体反应中的独特分子特征，并识别了巨细胞特异性标记基因 | NA | 探索上皮细胞和巨细胞在外来体反应中的分子特征，以促进皮肤外来体反应的预防和治疗管理策略 | 上皮细胞和巨细胞在外来体反应中的分子特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括小鼠和人类组织中的多种细胞类型 |
| 311 | 2024-08-08 |
Comparative Spatial Transcriptomic and Single-Cell Analyses of Human Nail Units and Hair Follicles Show Transcriptional Similarities between the Onychodermis and Follicular Dermal Papilla
2022-12, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2022.06.022
PMID:35853486
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研究论文 | 本研究利用数字空间分析和单细胞RNA测序技术，比较了人类指甲单元和毛囊的空间转录组和单细胞分析，发现甲床和毛囊真皮乳头在转录水平上具有相似性 | 首次揭示了甲床中的特定间充质细胞群——甲床成纤维细胞的存在，并发现甲床和毛囊真皮乳头在Wnt和骨形态发生蛋白信号分子表达上的相似性 | NA | 探讨人类指甲单元和毛囊的转录组相似性及其生物学意义 | 人类指甲单元和毛囊 | 数字病理学 | NA | 数字空间分析，单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 312 | 2024-08-08 |
The role of toll-like receptors (TLRs) in pan-cancer
2022-12, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2022.2095664
PMID:35801728
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研究论文 | 本研究分析了Toll样受体（TLRs）在泛癌数据集中的mRNA水平表达及其与癌症发生、进展和临床预后的关联 | 本研究通过多组学分析，揭示了TLRs作为癌症发生和进展的生物标志物、潜在的抗肿瘤治疗靶点以及预后生物标志物的可能性 | NA | 分析TLRs在泛癌数据集中的临床重要性及其与癌症发生、进展和临床预后的关联 | TLRs在泛癌数据集中的表达及其与癌症发生、进展和临床预后的关联 | NA | 泛癌 | 单细胞测序 | NA | mRNA | NA |
| 313 | 2024-08-08 |
Frequent aneuploidy in primary human T cells after CRISPR-Cas9 cleavage
2022-12, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01377-0
PMID:35773341
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，研究了在转染CRISPR-Cas9和指导RNA的人类原代T细胞中，针对T细胞受体（TCR）链和其他基因的基因编辑结果 | 发现CRISPR-Cas9切割后，人类原代T细胞中染色体14的丢失和染色体7的截断是常见现象 | 文章指出，染色体异常与细胞增殖减少、p53激活和细胞死亡有关，需要在临床方案中进行监测和最小化 | 研究CRISPR-Cas9在人类原代T细胞中的基因编辑效果及其对染色体结构的影响 | 人类原代T细胞中的T细胞受体（TCR）链和其他基因 | 基因编辑 | NA | 单细胞RNA测序，荧光原位杂交，数字滴液PCR | CRISPR-Cas9 | RNA | 涉及的细胞数量未在摘要中明确提及 |
| 314 | 2024-08-08 |
Mediators of Capillary-to-Venule Conversion in the Chronic Inflammatory Skin Disease Psoriasis
2022-12, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2022.05.1089
PMID:35777499
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研究论文 | 本研究利用5'单细胞RNA测序技术，研究了慢性炎症性皮肤病银屑病中直接从患者和健康人皮肤中分离出的不同亚群的血液血管和淋巴管内皮细胞的转录组改变 | 本研究首次详细描绘了银屑病中重塑的真皮血管结构，并揭示了内皮细胞特定的分子重编程以及与细胞粘附和细胞外基质组织相关的基因调控网络的失调 | NA | 深入了解银屑病中血管正常化作为管理策略的潜力 | 银屑病患者的血液血管和淋巴管内皮细胞 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 5'单细胞RNA测序 | NA | RNA | 直接从银屑病患者和健康人皮肤中分离出的不同亚群的血液血管和淋巴管内皮细胞 |
| 315 | 2024-08-08 |
Deconvolution analysis of cell-type expression from bulk tissues by integrating with single-cell expression reference
2022-12, Genetic epidemiology
IF:1.7Q3
DOI:10.1002/gepi.22494
PMID:35788983
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研究论文 | 本文开发了固定和混合模型，通过整合单细胞RNA测序参考数据，从大量组织样本中重建细胞表达分数 | 提出了混合效应模型，该模型在估计细胞表达分数的基准评估中与CIBERSORTx算法表现相似，并在实际数据分析中表现更优 | NA | 解析细胞类型组织组成，以理解表型变异和影响复杂特征疾病易感性的关键因素 | 大量组织样本的细胞组成 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 混合效应模型 | 转录组数据 | NA |
| 316 | 2024-08-08 |
Inflammatory type 2 conventional dendritic cells contribute to murine and human cholangitis
2022-12, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2022.06.025
PMID:35798133
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研究论文 | 本文研究了2型常规树突状细胞在鼠和人类胆管炎中的作用 | 首次揭示了2型常规树突状细胞在胆管炎中的选择性肝内扩张及其促炎作用 | NA | 探讨树突状细胞在胆管损伤免疫反应中的作用 | 鼠和人类胆管炎中的树突状细胞 | NA | 胆管炎 | 流式细胞术，免疫荧光显微镜，单细胞转录组学 | NA | 细胞 | 鼠模型和人类PSC患者的肝脏样本 |
| 317 | 2024-08-08 |
Dynamic immune ecosystem of dengue infection revealed by single-cell sequencing
2022-12, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1002/JLB.6MA0622-738RR
PMID:35766188
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术分析了登革热感染患者的免疫细胞类型及其动态变化 | 首次揭示了登革热感染过程中免疫生态系统的动态变化，并发现了关键的转录因子和信号通路 | NA | 深入理解登革热感染的发病机制并开发有效的治疗策略 | 登革热感染患者的免疫细胞及其动态变化 | 数字病理学 | 登革热 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 13127个细胞，来自10名登革热感染患者 |
| 318 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptional profiling reveals heterogeneity and developmental trajectories of Ewing sarcoma
2022-Dec, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-022-04073-3
PMID:35713707
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了尤文肉瘤的异质性和发育轨迹 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了尤文肉瘤的细胞起源和发育轨迹，并发现了JAK1基因在肿瘤发生中的重要作用 | 研究仅使用了4个尤文肉瘤肿瘤组织样本，样本量较小可能影响结果的普遍性 | 探究尤文肉瘤的异质性和发育轨迹，并寻找潜在的治疗靶点 | 尤文肉瘤肿瘤细胞的起源和发育过程 | 数字病理学 | 尤文肉瘤 | 单细胞RNA测序 | K-最近邻算法 | 转录组数据 | 4个尤文肉瘤肿瘤组织样本 |
| 319 | 2024-08-08 |
Dysregulated Th1 cells in lung squamous cell carcinoma
2022-12, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1002/JLB.1MA0422-208R
PMID:35686499
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫荧光染色技术，分析了肺鳞状细胞癌（LUSC）中Th1细胞的功能失调情况 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了LUSC中Th1细胞功能下降与内质网应激的相关性 | 研究样本量较小，需要进一步扩大样本量以验证结果的普遍性 | 探讨肺鳞状细胞癌中Th1细胞的功能状态及其与肿瘤微环境的关系 | 肺鳞状细胞癌患者的Th1细胞和CD8 T细胞 | 数字病理学 | 肺鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 8名LUSC患者组织样本，32名LUSC患者免疫荧光染色样本 |
| 320 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomic Atlas of Gingival Mucosa in Type 2 Diabetes
2022-12, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345221092752
PMID:35656582
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了2型糖尿病背景下牙龈黏膜的转录组图谱 | 揭示了2型糖尿病中牙龈黏膜的异质性，特别是免疫样成纤维细胞在糖尿病牙龈中的作用 | NA | 探讨2型糖尿病对牙龈屏障功能的影响及其潜在机制 | 2型糖尿病小鼠的牙龈组织 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | leptin受体缺陷小鼠的牙龈组织样本 |