单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 327 篇文献，本页显示第 281 - 300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2024-08-08 |
Colorectal cancer organoid models uncover oxaliplatin-resistant mechanisms at single cell resolution
2022-Dec, Cellular oncology (Dordrecht)
DOI:10.1007/s13402-022-00705-5
PMID:36136268
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研究论文 | 本文通过建立结直肠癌患者来源的类器官模型，研究了奥沙利铂耐药的机制 | 首次使用单细胞RNA测序技术解析了奥沙利铂耐药的细胞群体及相关信号通路 | NA | 研究结直肠癌中奥沙利铂耐药的机制 | 结直肠癌患者来源的类器官 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 两株患者来源的类器官 |
| 282 | 2024-08-08 |
Investigate the stemness of adult adipose-derived stromal cells based on single-cell RNA-sequencing
2022-Dec, Cell biology international
IF:3.3Q3
DOI:10.1002/cbin.11898
PMID:36150081
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨了脂肪来源间充质干细胞的干细胞特性及其基因组特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了脂肪来源间充质干细胞的细胞异质性和干细胞基因特征 | 研究样本仅来自一名健康成年志愿者，可能影响结果的普遍性 | 探究脂肪来源间充质干细胞的干细胞特性和基因组特征 | 脂肪来源间充质干细胞的干细胞特性和基因组特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 5325个脂肪来源间充质干细胞样本 |
| 283 | 2024-08-08 |
Anomalous Epithelial Variations and Ectopic Inflammatory Response in Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2022-12, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2021-0555OC
PMID:36108172
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了慢性阻塞性肺疾病（COPD）患者、吸烟但无COPD者和非吸烟者的肺细胞，以识别与COPD进展相关的细胞类型特异性机制和细胞间相互作用 | 发现了COPD患者中增加的独特AT2细胞亚群，并揭示了这些细胞在炎症反应中的特殊分化路径和细胞间相互作用网络 | 由于肺实质和间质结构的复杂性，COPD中持续炎症过程的具体机制仍未完全明了 | 旨在识别推动COPD进展的细胞类型特异性机制和细胞间相互作用 | COPD患者、吸烟但无COPD者和非吸烟者的肺细胞 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 57,918个细胞 |
| 284 | 2024-08-08 |
A transcriptional cross species map of pancreatic islet cells
2022-12, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2022.101595
PMID:36113773
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对来自健康人、猪和鼠的胰腺胰岛内分泌细胞进行了转录组分析，构建了一个跨物种的转录图谱 | 首次系统地描绘了跨物种的胰腺胰岛内分泌细胞的转录异质性和进化保守性，并揭示了人类α-和β-细胞状态的连续转录景观 | 研究主要集中在健康胰岛细胞，未涉及病理状态下的细胞功能 | 旨在精确描述胰腺胰岛内分泌细胞的分子基础，特别是连接动物模型与人类胰岛细胞的关系 | 健康人、猪和鼠的胰腺胰岛内分泌细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过50,000个内分泌细胞 |
| 285 | 2024-08-08 |
Cancer-associated fibroblasts subtypes and role in invasion and metastasis of gastric cancer
2022-Dec, Neoplasma
IF:2.0Q3
DOI:10.4149/neo_2022_220513N511
PMID:36129833
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综述 | 本文综述了癌症相关成纤维细胞（CAFs）的异质性及其在胃癌（GC）侵袭和转移中的作用 | 探讨了单细胞RNA测序技术在分类CAFs中的应用前景，并提出了基于细胞标记和功能的CAFs分选方法 | CAFs的异质性限制了靶向治疗的应用，需要寻找特定的标记物并将其划分为不同的亚群 | 探讨CAFs在胃癌发展中的作用及靶向治疗的可能性 | 癌症相关成纤维细胞（CAFs）及其在胃癌侵袭和转移中的作用 | NA | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 286 | 2024-08-08 |
Hyaluronic acids mediate the infiltration, migration, and M2 polarization of macrophages: evaluating metabolic molecular phenotypes in gliomas
2022-12, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.13315
PMID:36134697
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研究论文 | 本研究系统评估了通过代谢相关通路分类的3068个胶质瘤样本和33个胶质母细胞瘤单细胞测序样本的免疫景观，并验证了代谢集群的分子特征。 | 首次揭示了透明质酸（HA）与胶质瘤免疫浸润之间的显著联系，并发现HA通过IL-1/CHI3L1和TGF-β/CHI3L1轴促进巨噬细胞招募和M2极化。 | NA | 探讨代谢模式与胶质瘤患者生存结果和免疫活性的关系。 | 胶质瘤样本和胶质母细胞瘤单细胞测序样本。 | 数字病理学 | 脑瘤 | 机器学习预测分析（pamr）、代谢组学、RNA测序 | NA | 微阵列数据、单细胞测序数据 | 3068个胶质瘤样本和33个胶质母细胞瘤单细胞测序样本，以及5842个泛癌样本 |
| 287 | 2024-08-08 |
The role of goblet cells and mucus in intestinal homeostasis
2022-12, Nature reviews. Gastroenterology & hepatology
DOI:10.1038/s41575-022-00675-x
PMID:36097076
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综述 | 本文综述了杯状细胞和黏液层在维持肠道稳态中的作用及其在炎症和感染性疾病中的变化 | 通过单细胞RNA测序识别出新的杯状细胞亚群，加深了对它们在肠道稳态中多种贡献的理解 | NA | 探讨杯状细胞和黏液层在维持肠道健康中的作用及其在疾病中的变化 | 杯状细胞和黏液层 | NA | 炎症和感染性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 288 | 2024-08-08 |
Urinary single-cell sequencing captures kidney injury and repair processes in human acute kidney injury
2022-12, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2022.07.032
PMID:36049643
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研究论文 | 本文通过建立尿液单细胞RNA测序流程，分析了来自32名急性肾损伤患者的42,608个单细胞转录组，揭示了肾脏损伤和修复过程中的细胞和分子动态变化 | 首次通过尿液单细胞测序技术，非侵入性地深入了解急性肾损伤的细胞过程，为靶点识别、亚分类和疾病自然进程及干预监测提供了新机会 | NA | 探索急性肾损伤的细胞和分子动态变化 | 急性肾损伤患者的尿液单细胞转录组 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 转录组 | 42,608个单细胞转录组，来自32名患者的40份尿液样本 |
| 289 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq reveals fate determination control of an individual fibre cell initiation in cotton (Gossypium hirsutum)
2022-12, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.13918
PMID:36053965
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了棉花纤维细胞发育过程中的基因表达模式 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了棉花纤维细胞命运决定的调控机制，并提出了单个纤维细胞早期发育的模型 | NA | 揭示棉花纤维细胞从胚珠表皮起始的调控机制 | 棉花纤维细胞的发育过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA序列 | 14,535个细胞 |
| 290 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals intra-tumoral heterogeneity of glioblastoma and a pro-tumor subset of tumor-associated macrophages characterized by EZH2 overexpression
2022-12-01, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2022.166534
PMID:36057370
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了胶质母细胞瘤（GBM）的肿瘤内异质性以及EZH2过表达的肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的促瘤作用 | 首次发现具有胶质-免疫双重特征的MES2样GBM亚群，并揭示了EZH2在肿瘤微环境中的异质性表达及其在TAMs中的促瘤作用 | NA | 全面解析胶质母细胞瘤的分子景观及其在肿瘤微环境中EZH2的异质性分布和潜在作用 | 胶质母细胞瘤样本和肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 8名患者的胶质母细胞瘤样本 |
| 291 | 2024-08-08 |
Glioma stem cell signature predicts the prognosis and the response to tumor treating fields treatment
2022-12, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.13956
PMID:36070228
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习方法，构建了与胶质瘤干细胞相关的风险评分，并评估了其对预后和肿瘤治疗场治疗的反应的预测价值 | 本研究首次构建了由11个胶质瘤干细胞特异性基因组成的胶质瘤干细胞特征，并验证了其在胶质瘤中的预后价值 | NA | 探索胶质瘤干细胞富集的胶质瘤患者的个性化治疗潜力 | 胶质瘤干细胞及其在胶质瘤复发和化疗放疗抵抗中的作用 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序 | LASSO和COX回归 | 基因数据 | NA |
| 292 | 2024-08-08 |
Lung epithelial and myeloid innate immunity in influenza-associated or COVID-19-associated pulmonary aspergillosis: an observational study
2022-12, The Lancet. Respiratory medicine
DOI:10.1016/S2213-2600(22)00259-4
PMID:36029799
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研究论文 | 本研究探讨了流感相关性肺曲霉病（IAPA）和COVID-19相关性肺曲霉病（CAPA）患者中肺上皮和髓系先天免疫的作用。 | 首次详细分析了IAPA和CAPA患者中肺上皮和髓系先天免疫的基因表达和蛋白质水平，揭示了抗真菌免疫的三重缺陷。 | 研究样本量有限，且仅限于特定时间段内入住ICU的患者，可能影响结果的普遍性。 | 探索IAPA和CAPA患者中肺上皮和髓系先天免疫的作用及其病理生理机制。 | IAPA和CAPA患者的肺上皮和髓系先天免疫。 | 数字病理学 | 肺部疾病 | nCounter基因表达分析、蛋白质分析、RNAScope、GeoMx空间转录组学 | NA | 生物样本 | 166名符合条件的患者，其中40名患有IAPA，52名患有流感但无曲霉病，33名患有CAPA，41名患有COVID-19但无曲霉病。 |
| 293 | 2024-08-08 |
The CELLO trial: Protocol of a planned phase 4 study to assess the efficacy of Ocrelizumab in patients with radiologically isolated syndrome
2022-Dec, Multiple sclerosis and related disorders
IF:2.9Q2
DOI:10.1016/j.msard.2022.104143
PMID:36031693
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研究论文 | 本文描述了CELLO临床试验的方案，该试验旨在评估ocrelizumab在放射学孤立综合征（RIS）患者中的疗效。 | 本研究首次在RIS患者中评估ocrelizumab的疗效，并探索与自身免疫相关的生物标志物及免疫恢复情况。 | NA | 研究旨在评估ocrelizumab在RIS患者中的疗效，并识别与自身免疫和免疫恢复相关的生物标志物。 | 放射学孤立综合征（RIS）患者。 | NA | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 生物标志物 | 100名参与者 |
| 294 | 2024-08-08 |
Cryobanking of Human Distal Lung Epithelial Cells for Preservation of Their Phenotypic and Functional Characteristics
2022-12, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2021-0507MA
PMID:36036918
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研究论文 | 本文详细介绍了一种用于保存人远端肺上皮细胞表型和功能特性的低温保存方法 | 该方法能够有效保存远端气体交换区域的功能性上皮细胞类型，这在以往的技术中是缺乏的 | NA | 研究目的是开发一种能够长期保存人远端肺组织细胞功能和分子表型的方法 | 研究对象包括人远端肺上皮细胞及其表型和功能特性 | 数字病理学 | 肺疾病 | 流式细胞术，上皮类器官形成效率分析，单细胞转录组分析 | NA | 细胞 | 包括来自人肺组织的细胞 |
| 295 | 2024-08-08 |
Single-cell phenotypic profiling to identify a set of immune cell protein biomarkers for relapsed and refractory diffuse large B cell lymphoma: A single-center study
2022-12, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1002/JLB.6MA0822-720RR
PMID:36040107
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和质谱流式细胞术，从复发和难治性弥漫大B细胞淋巴瘤患者的18份诊断性外周血单个核细胞样本中，鉴定和验证了mRNA和蛋白质水平的免疫细胞标志物。 | 开发了一套新的复发和难治性弥漫大B细胞淋巴瘤的诊断标志物，通过单细胞分辨率的检测方法，提供了精确的标志物，有助于克服肿瘤间和肿瘤内的异质性。 | NA | 鉴定复发和难治性弥漫大B细胞淋巴瘤的免疫细胞标志物，并验证其在诊断中的应用。 | 复发和难治性弥漫大B细胞淋巴瘤患者的免疫细胞标志物。 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），质谱流式细胞术（CyTOF） | NA | 单细胞数据 | 18份复发和难治性弥漫大B细胞淋巴瘤患者的外周血单个核细胞样本，以及5份健康志愿者的外周血单个核细胞样本。 |
| 296 | 2024-08-08 |
Genomic insights into the phylogeny and biomass-degrading enzymes of rumen ciliates
2022-12, The ISME journal
DOI:10.1038/s41396-022-01306-8
PMID:35986094
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和组装识别流程，获得了52个高质量的瘤胃纤毛虫基因组，解析了其分类和系统发育框架，并揭示了瘤胃纤毛虫广泛的碳水化合物活性酶（CAZymes）以降解各种植物和微生物碳水化合物 | 首次大规模分析了瘤胃纤毛虫的基因组，揭示了其通过水平基因转移和基因家族扩张获得广泛的碳水化合物活性酶，特别是Diplodiniinae和Ophryoscolecinae物种编码的CAZymes数量与肠道真菌相当 | NA | 探究瘤胃纤毛虫的基因组多样性和降解酶的遗传基础 | 瘤胃纤毛虫的基因组和碳水化合物活性酶 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组 | 52个高质量的瘤胃纤毛虫基因组 |
| 297 | 2024-08-08 |
Combined hepatocellular-cholangiocarcinoma derives from liver progenitor cells and depends on senescence and IL-6 trans-signaling
2022-12, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2022.07.029
PMID:35988690
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研究论文 | 本研究探讨了肝前体细胞在肝细胞癌（HCC）和混合型肝细胞癌-胆管癌（cHCC-CCA）中的作用，并揭示了IL-6跨信号传导在此过程中的重要性。 | 首次证明cHCC-CCA肿瘤来源于肝前体细胞，并依赖于衰老细胞中的IL-6通过IL-6跨信号传导途径。 | NA | 确定肝前体细胞是否参与HCC、cHCC-CCA或两种肿瘤的发生。 | 肝前体细胞在肝细胞癌和混合型肝细胞癌-胆管癌中的作用。 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用Mdr2-KOFoxl1-CRE;RosaYFP小鼠模型进行研究。 |
| 298 | 2024-08-08 |
Network analysis reveals different hub genes and molecular pathways for pig in vitro fertilized early embryos and parthenogenotes
2022-Dec, Reproduction in domestic animals = Zuchthygiene
DOI:10.1111/rda.14231
PMID:35997106
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研究论文 | 本文通过加权基因共表达网络分析（WGCNA）研究了体外受精早期胚胎和孤雌激活胚胎的母源到合子过渡（MZT）过程中的功能模块和枢纽基因。 | 首次应用WGCNA分析方法揭示了猪体外受精早期胚胎和孤雌激活胚胎在MZT过程中的不同枢纽基因和分子通路。 | NA | 深入研究猪胚胎中母源到合子过渡（MZT）的调控和功能。 | 猪体外受精早期胚胎和孤雌激活胚胎的母源到合子过渡（MZT）过程中的功能模块和枢纽基因。 | 生物信息学 | NA | 加权基因共表达网络分析（WGCNA） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 45个单细胞RNA测序数据集 |
| 299 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-sequencing dissects cellular heterogeneity and identifies two tumor-suppressing immune cell subclusters in HPV-related cervical adenosquamous carcinoma
2022-12, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.28084
PMID:36000446
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了人乳头瘤病毒（HPV）相关宫颈腺鳞癌的肿瘤内异质性，识别了七个上皮和十一个免疫亚群 | 首次详细解析了HPV相关宫颈腺鳞癌的细胞异质性，并发现了两个具有肿瘤抑制作用的免疫细胞亚群 | 研究样本仅来自两个HPV相关宫颈腺鳞癌样本，可能影响结果的普遍性 | 探究HPV相关宫颈腺鳞癌的肿瘤内异质性，以改进诊断和治疗策略 | HPV相关宫颈腺鳞癌的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 18,046个单细胞样本，以及165名HPV相关宫颈癌患者的数据 |
| 300 | 2024-08-08 |
Contribution of the Opioid System to the Antidepressant Effects of Fluoxetine
2022-12-15, Biological psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1016/j.biopsych.2022.05.030
PMID:35977861
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研究论文 | 本文探讨了阿片系统在氟西汀抗抑郁效果中的作用 | 发现阿片系统在氟西汀治疗反应中的作用，并通过基因表达分析和行为测试验证了这一发现 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探究阿片系统在氟西汀抗抑郁效果中的作用机制 | 小鼠的焦虑和抑郁样行为 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了mu和delta阿片受体敲除小鼠进行行为测试 |