单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 327 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomes from turtle livers reveal sensitivity of hepatic immune cells to bacteria-infection
2022-Dec, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2022.10.033
PMID:36273515
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，分析了中国软壳龟肝脏的细胞组成，并探讨了细菌感染对肝脏免疫细胞的影响 | 首次在单细胞分辨率下全面展示了软壳龟肝脏的免疫景观，并揭示了细菌感染对肝脏免疫细胞数量的影响 | NA | 研究肝脏免疫细胞对细菌感染的响应 | 中国软壳龟的肝脏免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 9938个细胞，来自两个个体（未感染和细菌感染）的肝脏组织 |
| 262 | 2024-08-08 |
Screening target genes for the treatment of PCOS via analysis of single-cell sequencing data
2022-12, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2022.2136401
PMID:36286390
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研究论文 | 本研究通过分析单细胞测序数据，筛选出治疗多囊卵巢综合征（PCOS）的目标基因 | 采用新的生物信息学方法，通过单细胞测序数据分析，筛选出可能的PCOS治疗目标基因 | NA | 识别与PCOS发病机制相关的目标基因，并开发有效的治疗药物 | 多囊卵巢综合征（PCOS）及其相关基因和治疗药物 | 生物信息学 | 生殖系统疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 34个卵母细胞 |
| 263 | 2024-08-08 |
Caspase-Mediated Regulation and Cellular Heterogeneity of the cGAS/STING Pathway in Kaposi's Sarcoma-Associated Herpesvirus Infection
2022-12-20, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.02446-22
PMID:36255240
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研究论文 | 本文研究了Kaposi肉瘤相关疱疹病毒（KSHV）感染中caspase介导的cGAS/STING通路调控及其细胞异质性 | 发现caspase活性在KSHV裂解复制期间抑制DNA传感器cGAS，从而阻断I型IFN的诱导，并通过单细胞RNA测序揭示了IFN-β产生细胞的极小比例足以赋予强大的抗病毒状态 | 对caspase如何拮抗IFN信号传导的具体机制了解不足 | 揭示病毒如何利用细胞I型IFN调控机制进行免疫逃避，并为病毒感染和慢性炎症疾病的治疗提供靶向策略 | Kaposi肉瘤相关疱疹病毒（KSHV）感染中的caspase活性及其对cGAS/STING通路的调控 | NA | Kaposi肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 感染细胞中小于5%的细胞产生IFN |
| 264 | 2024-08-08 |
Recent advances in high-throughput single-cell transcriptomics and spatial transcriptomics
2022-12-06, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d2lc00633b
PMID:36254761
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review | 本文综述了高吞吐量单细胞转录组学和空间转录组学的最新进展 | 介绍了微流控技术和微孔平台在高吞吐量单细胞转录组学中的应用，以及空间转录组学在解码细胞组成、异质性和细胞间通讯中的作用 | 未明确提及具体限制 | 探讨高吞吐量单细胞转录组学和空间转录组学技术的优势、局限性及从这些新技术中获得的新生物学知识 | 单细胞转录组学和空间转录组学技术 | digital pathology | NA | scRNA-seq, spatial transcriptomics | NA | transcriptome | 数千个单个细胞 |
| 265 | 2024-08-08 |
The development of the amnion in mice and other amniotes
2022-12-05, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2021.0258
PMID:36252226
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综述 | 本文综述了羊膜在羊膜动物中的发育过程，特别关注了小鼠中羊膜的非典型发育及其分子特征 | 整合了谱系追踪数据以更好地理解羊膜上皮的时空起源，并利用单细胞转录组数据分析了羊膜上皮和羊膜中胚层的分子特征 | NA | 探讨羊膜的形成及其分子特性 | 羊膜在不同羊膜动物中的发育过程 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 266 | 2024-08-08 |
Research progress of single-cell transcriptome sequencing in autoimmune diseases and autoinflammatory disease: A review
2022-12, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2022.102919
PMID:36242821
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综述 | 本文综述了单细胞转录组测序技术在自身免疫性疾病和自身炎症性疾病中的研究进展 | 单细胞转录组测序技术能够提供无偏倚的结果，通过独立分析组织中的细胞，为识别细胞亚群提供更多mRNA信息，为研究免疫耐受破坏和促炎途径的细胞基础提供了新方法 | NA | 探讨单细胞转录组测序技术在自身免疫性疾病和自身炎症性疾病中的应用，揭示疾病发生发展的机制 | 41种自身免疫性疾病，包括9种系统性自身免疫性疾病和自身炎症性疾病以及32种器官特异性自身免疫性疾病 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 涉及多种组织和细胞类型 |
| 267 | 2024-08-08 |
The characteristics of cerebrospinal fluid anaplastic large cells in a patient with primary leptomeningeal anaplastic large cell lymphoma
2022-Dec-01, Clinica chimica acta; international journal of clinical chemistry
DOI:10.1016/j.cca.2022.09.029
PMID:36243040
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研究论文 | 本文报道了一例原发性软脑膜间变性大细胞淋巴瘤患者的病例，并通过单细胞RNA测序分析了脑脊液中间变性大细胞的转录组特征。 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析脑脊液中间变性大细胞的转录组特征。 | NA | 研究原发性软脑膜间变性大细胞淋巴瘤的诊断和机制。 | 一例26岁中国男性原发性软脑膜间变性大细胞淋巴瘤患者。 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 一例患者 |
| 268 | 2024-08-08 |
Transcriptional noise adjusted for expression levels reveals genes with high transcriptional noise that are highly expressed, functionally related, and co-regulated in yeast
2022-Dec, Current genetics
IF:1.8Q3
DOI:10.1007/s00294-022-01255-x
PMID:36245041
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研究论文 | 本文研究了酵母中基因表达变异与单细胞和非单细胞基因表达研究之间的关系，发现调整表达水平后的转录噪声可以识别出高表达、功能相关且共同调控的基因 | 本文采用线性/自然对数多项式和局部拟合方法调整表达水平后的转录噪声，并分析多个非单细胞RNA-seq数据集，识别出与高CV基因不同的具有高中值转录噪声的基因 | NA | 理解单细胞和非单细胞基因表达研究中变异性的关系及其在生物系统中的作用和机制 | 酵母中的基因表达变异 | 分子生物学 | NA | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 多个非单细胞RNA-seq数据集 |
| 269 | 2024-08-08 |
Small cell carcinoma of the ovary hypercalcemic type (SCCOHT): A review and novel case with dual germline SMARCA4 and BRCA2 mutations
2022-Dec, Gynecologic oncology reports
IF:1.2Q3
DOI:10.1016/j.gore.2022.101077
PMID:36249907
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综述 | 本文综述了卵巢高钙型小细胞癌（SCCOHT）的罕见性和侵袭性，并描述了一例同时携带SMARCA4和BRCA2胚系突变的病例 | 描述了一例罕见的双重胚系突变病例，并分享了原始肿瘤的空间转录组学数据 | NA | 综述SCCOHT的特征并介绍一例新型病例 | 卵巢高钙型小细胞癌及其病例 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 单个病例 |
| 270 | 2024-08-08 |
Anatomical Evidence for Parasympathetic Innervation of the Renal Vasculature and Pelvis
2022-12, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2021111518
PMID:36253054
|
研究论文 | 本文通过解剖学研究方法，包括转基因小鼠模型和免疫染色技术，以及单细胞RNA测序，探讨了肾脏血管和肾盂的副交感神经支配 | 首次提供了肾脏血管和肾盂副交感神经支配的解剖学证据 | NA | 验证肾脏血管和肾盂的副交感神经支配 | 肾脏血管和肾盂的副交感神经 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 使用转基因小鼠模型进行研究 |
| 271 | 2024-08-08 |
Subcapsular Sinus Macrophages Promote Melanoma Metastasis to the Sentinel Lymph Nodes via an IL1α-STAT3 Axis
2022-12-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0225
PMID:36206577
|
研究论文 | 研究了皮肤来源的肿瘤细胞通过淋巴管迁移至前哨淋巴结（sLN）的过程，并探讨了亚被膜窦（SS）中的巨噬细胞通过IL1α-STAT3轴促进黑色素瘤转移的机制 | 发现了亚被膜窦中的巨噬细胞在识别肿瘤抗原后产生促肿瘤的IL1α，并通过单细胞RNA测序揭示了IL1α信号在转移性肿瘤细胞中的STAT3为主要靶点 | NA | 探讨黑色素瘤转移至前哨淋巴结的机制及潜在的免疫治疗策略 | 亚被膜窦中的巨噬细胞、IL1α、STAT3信号通路 | 免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从接受IL1α特异性阻断抗体治疗的动物中获取的微切割转移样本 |
| 272 | 2024-08-08 |
Cellular Landscapes of Nondiseased Human Cardiac Valves From End-Stage Heart Failure-Explanted Heart
2022-12, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.122.318314
PMID:36200446
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研究论文 | 探索来自终末期心力衰竭患者的心脏移植中的非病变人类心脏瓣膜的细胞景观 | 首次使用单细胞RNA测序技术全面分析非病变人类心脏瓣膜叶片的细胞景观，并结合生物信息学方法识别细胞类型、描述细胞功能及研究细胞发育轨迹和相互作用 | 研究仅限于非病变心脏瓣膜，未涉及病变瓣膜的情况 | 探索心脏瓣膜疾病的细胞层面机制，以识别新的治疗靶点 | 来自终末期心力衰竭患者的心脏移植中的非病变人类心脏瓣膜叶片 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 5个主动脉瓣、5个肺动脉瓣、5个三尖瓣和3个二尖瓣，共128,412个细胞 |
| 273 | 2024-08-08 |
Review: Challenges and perspectives in applying single nuclei RNA-seq technology in plant biology
2022-Dec, Plant science : an international journal of experimental plant biology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.plantsci.2022.111486
PMID:36202294
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综述 | 本文综述了单核RNA测序技术在植物生物学中的应用挑战与前景 | 探讨了单细胞转录组在植物细胞发育和环境应激响应中的动态调控 | 讨论了使用植物原生质体与核进行单细胞RNA测序实验的优缺点 | 支持基因功能研究，建立精确的转录程序，预测更准确的基因调控网络，并长期设计新基因途径以增强选定作物性状 | 植物细胞的转录组及其在细胞发育和环境应激中的调控 | NA | NA | 单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多种植物物种和器官的细胞 |
| 274 | 2024-08-08 |
Thyroid hormone regulators in human cerebral cortex development
2022-12-01, The Journal of endocrinology
IF:3.4Q2
DOI:10.1530/JOE-22-0189
PMID:36219489
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review | 本文综述了甲状腺激素在人类大脑皮层发育中的调控作用 | 利用单细胞转录组学方法分析了发育中的人类大脑皮层的单细胞RNA-Seq数据，提供了甲状腺激素转运蛋白、脱碘酶和受体在特定细胞中表达的新见解 | 由于小鼠和人类大脑之间的根本差异，小鼠疾病模型并不完全令人满意 | 探讨甲状腺激素在人类新皮层发育中的病理生理学背景 | 人类大脑皮层发育中的甲状腺激素调控 | NA | NA | 单细胞RNA-Seq | NA | RNA-Seq数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 275 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptomics shows moxibustion promotes hippocampus astrocyte and neuron interaction
2022-Dec-01, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2022.121052
PMID:36220370
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研究论文 | 本研究探讨了艾灸通过促进海马体星形胶质细胞与神经元之间的相互作用，从而改善阿尔茨海默病小鼠的认知功能 | 本研究首次采用空间转录组学技术评估艾灸对阿尔茨海默病小鼠星形胶质细胞与神经元相互作用的影响 | NA | 研究艾灸是否能通过促进星形胶质细胞与神经元之间的相互作用，增强突触可塑性，从而缓解阿尔茨海默病的认知障碍 | 阿尔茨海默病小鼠 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | APP/PS1小鼠 |
| 276 | 2024-08-08 |
Protocol for fast scRNA-seq raw data processing using scKB and non-arbitrary quality control with COPILOT
2022-12-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101729
PMID:36181683
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研究论文 | 描述了一种使用scKB和COPILOT对单细胞RNA测序（scRNA-seq）原始数据进行快速且非任意质量控制的方法 | scKB作为kallisto和bustools的封装脚本，加速了对齐和转录本计数矩阵生成，运行速度显著快于流行的工具Cell Ranger。COPILOT通过比较低质量和高质量细胞的分布，提供了非任意的背景噪声去除 | NA | 简化scRNA-seq数据处理流程，为新用户提供便捷的入门方法 | 单细胞RNA测序的原始数据 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 数据 | NA |
| 277 | 2024-08-08 |
The CC ligand chemokine family members CCL17/CCL22 predict the survival and response to immune checkpoint blockade therapy of patients with head and neck squamous cell carcinoma
2022-12, Current problems in cancer
IF:2.5Q3
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研究论文 | 研究探讨了CCL17和CCL22在头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中的预测价值及其对免疫检查点阻断疗法反应的影响 | 首次阐明了CCL17和CCL22在HNSCC中的预测价值及其对免疫检查点阻断疗法反应的影响 | 研究结果的统计显著性仅处于边缘水平（P值分别为0.057和0.055） | 探究CCL17和CCL22在HNSCC中的预测价值及其对免疫检查点阻断疗法反应的影响 | 头颈部鳞状细胞癌患者 | NA | 头颈部鳞状细胞癌 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 涉及多种癌症类型的样本 |
| 278 | 2024-08-08 |
Expression of periodontitis susceptibility genes in human gingiva using single-cell RNA sequencing
2022-Dec, Journal of periodontal research
IF:3.4Q1
DOI:10.1111/jre.13057
PMID:36170299
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了人类牙龈中与牙周炎易感性相关的基因表达情况 | 结合人类遗传学和单细胞基因组学，通过将变异映射到预测其作用细胞和潜在功能，以更好地理解牙周炎 | 遗传因素与牙周炎发病机制的相关性仅被有限地识别，并且常常验证不足 | 确定牙周炎易感基因的可能细胞类型特异性 | 分析26个通过全基因组关联研究(GWAS)确定的与疾病相关的基因在牙龈黏膜中的表达 | 人类基因组学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 共分析了来自4个不同供体的12,411个细胞 |
| 279 | 2024-08-08 |
Dynamic Ins2 Gene Activity Defines β-Cell Maturity States
2022-12-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db21-1065
PMID:36170671
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研究论文 | 研究使用活细胞成像、FACS和单细胞RNA测序技术，探讨了β细胞中Ins2基因活性的动态变化及其与β细胞成熟状态的关系 | 首次揭示了β细胞中Ins2基因活性存在动态变化，并发现这种变化与β细胞的成熟状态相关 | 研究仅限于Ins2GFP敲入小鼠模型，可能需要进一步在其他模型或人类样本中验证 | 探究β细胞中Ins2基因活性的动态变化及其与β细胞成熟状态的关系 | β细胞中的Ins2基因活性及其与细胞成熟状态的关系 | NA | NA | 活细胞成像、FACS、单细胞RNA测序 | NA | 图像、RNA序列 | 使用Ins2GFP敲入小鼠的β细胞样本，约25%的β细胞表现出较高的Ins2基因活性 |
| 280 | 2024-08-08 |
Carbon ion irradiation plus CTLA4 blockade elicits therapeutic immune responses in a murine tumor model
2022-12-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2022.215928
PMID:36183858
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研究论文 | 研究碳离子放射治疗结合CTLA4阻断在鼠肿瘤模型中诱导治疗性免疫反应的效果 | 首次详细探索了碳离子放射治疗结合CTLA4阻断后肿瘤内免疫细胞组成的改变，并发现这种组合能有效诱导非照射肿瘤的完全排斥 | 研究主要集中在鼠模型上，未来研究需要验证这些发现是否适用于人类 | 探讨碳离子放射治疗结合免疫检查点抑制剂在肿瘤治疗中的免疫学效应 | 鼠Her2+ EO771肿瘤细胞及免疫功能正常的鼠 | 数字病理学 | 肿瘤 | 碳离子放射治疗 | NA | 单细胞RNA测序数据和流式细胞术分析数据 | 免疫功能正常的鼠 |