单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 327 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2024-08-08 |
In vivo single-cell transcriptomics reveal Klebsiella pneumoniae skews lung macrophages to promote infection
2022-12-07, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.15252/emmm.202216888
PMID:36337046
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研究论文 | 本文揭示了耐药性细菌克雷伯氏肺炎菌如何通过改变肺泡巨噬细胞的极化状态来促进感染的机制 | 首次发现克雷伯氏肺炎菌通过诱导肺泡巨噬细胞向M(Kp)型极化，利用TLR-I型IFN-IL10-STAT6轴重塑巨噬细胞，这是一种新的克服宿主限制的策略 | NA | 阐明耐药性细菌克雷伯氏肺炎菌与宿主防御之间的相互作用机制 | 肺泡巨噬细胞的极化状态及克雷伯氏肺炎菌对其的影响 | 数字病理学 | 肺炎 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及肺泡巨噬细胞和间质巨噬细胞的单细胞转录组数据 |
| 242 | 2024-08-08 |
Targeting of Scavenger Receptors Stabilin-1 and Stabilin-2 Ameliorates Atherosclerosis by a Plasma Proteome Switch Mediating Monocyte/Macrophage Suppression
2022-12-06, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本文研究了通过靶向清道夫受体Stabilin-1和Stabilin-2来减轻动脉粥样硬化的机制，主要通过改变血浆蛋白质组来抑制单核细胞/巨噬细胞的活性 | 首次全面研究了靶向Stabilin-1和Stabilin-2对动脉粥样硬化的影响，并发现了一种新的治疗动脉粥样硬化的方法 | NA | 研究靶向Stabilin-1和Stabilin-2对动脉粥样硬化的影响 | Stabilin-1和Stabilin-2在动脉粥样硬化中的作用 | 心血管疾病 | 动脉粥样硬化 | 血浆蛋白质组学分析，单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质，RNA | ApoE-KO小鼠，Stab1-KO小鼠，Stab2-KO小鼠，Ldlr-KO小鼠 |
| 243 | 2024-08-08 |
Biologic insights from single-cell studies of psoriasis and psoriatic arthritis
2022-12, Expert opinion on biological therapy
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/14712598.2022.2142465
PMID:36317702
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研究论文 | 本文讨论了单细胞技术在银屑病和银屑病关节炎研究中的应用，特别是单细胞RNA测序技术揭示的细胞异质性和相互作用 | 通过单细胞RNA测序技术，识别了多种细胞类型在银屑病发病机制中的辅助作用，并展示了机器学习模型在早期诊断中的潜力 | 文章提到了单细胞研究的局限性和未来挑战，但未具体说明 | 探讨单细胞技术在银屑病和银屑病关节炎病理机制中的应用 | 研究对象包括T细胞、髓样细胞、角质形成细胞、先天淋巴细胞和基质细胞 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | RNA | 22项单细胞研究 |
| 244 | 2024-08-08 |
SREBP2/Rab11s/GLUT1/6 network regulates proliferation and migration of glioblastoma
2022-Dec, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2022.154176
PMID:36327817
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研究论文 | 研究探讨了SREBP2/Rab11s/GLUT1/6网络在胶质母细胞瘤增殖和迁移中的调控作用 | 首次揭示了SREBP2/Rab11/GLUT网络在胶质母细胞瘤细胞生长中的作用，并识别了潜在的治疗靶点 | NA | 研究SREBP2/Rab11s/GLUT1/6网络在胶质母细胞瘤进展中的调控作用 | 胶质母细胞瘤组织和T98G细胞系 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）, 蛋白质印迹（western blotting）, 反转录定量PCR | NA | 基因表达数据 | 胶质母细胞瘤组织和T98G细胞系 |
| 245 | 2024-08-08 |
An artificial LAMA2-GelMA hydrogel microenvironment for the development of pancreatic endocrine progenitors
2022-12, Biomaterials
IF:12.8Q1
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研究论文 | 研究开发了一种基于LAMA2-GelMA的混合水凝胶，作为内分泌谱系形成和成熟的仿生载体，用于改善人胚胎干细胞衍生的β细胞的分化效率和功能。 | 本研究首次开发了LAMA2-GelMA混合水凝胶，通过调节转录因子的表达和整合素-AKT信号传导，显著提高了胰腺内分泌祖细胞的功能和成熟度。 | 研究主要集中在体外和动物模型中，需要进一步的人体试验来验证其临床应用的可行性。 | 旨在开发一种基于蛋白质组学和组织工程的胰腺特异性微环境，用于糖尿病的治疗。 | 研究对象包括胰腺内分泌祖细胞、人胚胎干细胞衍生的β细胞以及LAMA2-GelMA混合水凝胶。 | 组织工程 | 糖尿病 | 单细胞转录组学 | NA | 蛋白质 | 使用小鼠模型进行体内实验，具体样本数量未详细说明。 |
| 246 | 2024-08-08 |
An improved Fuzzy based GWO algorithm for predicting the potential host receptor of COVID-19 infection
2022-12, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2022.106050
PMID:36334362
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研究论文 | 本文通过改进的模糊聚类技术结合灰狼优化算法（GWO），预测COVID-19感染的潜在宿主受体 | 提出了一种结合进化算法变异和交叉操作的改进GWO算法，增强了灰狼种群的遗传多样性，并通过消除弱个体提高了算法的探索和开发能力 | NA | 旨在识别与ACE2和TMPRSS2转录和生物学上相似的新型病毒受体或膜蛋白，以帮助理解COVID-19感染在人类中的趋向性、传播和发病机制 | COVID-19病毒的潜在宿主受体 | 生物信息学 | COVID-19 | 灰狼优化算法（GWO） | 模糊聚类 | 蛋白质表达谱 | 58种新型病毒受体和816种膜蛋白 |
| 247 | 2024-08-08 |
scBPGRN: Integrating single-cell multi-omics data to construct gene regulatory networks based on BP neural network
2022-12, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2022.106249
PMID:36335815
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研究论文 | 提出了一种基于BP神经网络的算法scBPGRN，用于整合单细胞RNA测序数据和DNA甲基化数据构建基因调控网络 | 使用双权极端相关系数衡量因子间的相关性，并利用神经网络计算广义权重来构建基因调控网络 | NA | 通过整合单细胞多组学数据构建包含更多组学信息的基因调控网络，以深入理解癌症的发病机制 | 肝细胞癌（HCC）数据 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, DNA甲基化 | BP神经网络 | 基因调控网络 | 涉及两个亚群的单细胞数据 |
| 248 | 2024-08-08 |
Identification of underexplored mesenchymal and vascular-related cell populations in human skeletal muscle
2022-12-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00364.2022
PMID:36342160
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了人体骨骼肌中的未充分探索的间质细胞群体，特别是血管相关细胞类型。 | 首次在人体骨骼肌中发现并描述了表达pericyte和pan-endothelial基因的endothelial-like pericytes (ELPCs)，并探讨了其在细胞转化中的潜在作用。 | 研究仅限于年轻个体的骨骼肌样本，且样本量较小，可能限制了结果的普遍性。 | 揭示人体骨骼肌中未充分探索的间质细胞群体的特征和功能。 | 人体骨骼肌中的间质细胞群体，特别是血管相关细胞类型。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNAseq) | NA | 基因表达数据 | 约2,000个细胞 |
| 249 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome reveals immunopathological cell composition of skin lesions in subacute cutaneous lupus erythematosus
2022-12, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2022.109172
PMID:36343898
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了亚急性皮肤红斑狼疮（SCLE）皮肤病变中的细胞组成，并与健康对照组进行了比较 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了SCLE中扩展的成纤维细胞和角质形成细胞亚型，以及异常激活的淋巴细胞和炎症性M1巨噬细胞 | NA | 探究亚急性皮肤红斑狼疮（SCLE）的免疫发病机制 | SCLE皮肤病变中的细胞组成 | 数字病理学 | 红斑狼疮 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | SCLE皮肤病变和健康对照组皮肤组织的scRNA-seq数据 |
| 250 | 2024-08-08 |
Protocol to dissociate, process, and analyze the human lung tissue using single-cell RNA-seq
2022-12-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101776
PMID:36313536
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研究论文 | 本文介绍了一种从人类肺部生物样本中获取高质量单细胞转录组数据的方法 | 采用机械和酶解法处理组织，通过荧光激活细胞分选（FACS）富集活细胞，并使用基于液滴的单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术 | NA | 开发一种高效获取人类肺组织单细胞转录组数据的方法 | 人类肺部生物样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 涉及来自核心针活检、细针抽吸、手术切除和胸腔积液的人类肺部生物样本 |
| 251 | 2024-08-08 |
Insights gained from single-cell analysis of immune cells in tofacitinib treatment of Vogt-Koyanagi-Harada disease
2022-12-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.162335
PMID:36301664
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和质谱流式细胞术，首次进行了多模态、高维度的分析，生成了一份关于VKH患者在接受TOFA治疗期间免疫细胞亚群组成、基因特征、富集通路和细胞间相互作用的全面人类免疫图谱 | 首次进行了多模态、高维度的分析，生成了一份全面的人类免疫图谱，并识别出与炎症和JAK相关的两种单核细胞亚群，这些亚群在VKH发病机制和TOFA治疗机制中起重要作用 | NA | 探讨TOFA治疗Vogt-Koyanagi-Harada病（VKH）的具体发病机制和靶向治疗策略 | VKH患者的免疫细胞 | 数字病理学 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术 | NA | 单细胞RNA序列数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 252 | 2024-08-08 |
The Tumor Microenvironment Reprograms Immune Cells
2022-12, Cellular reprogramming
IF:1.2Q4
DOI:10.1089/cell.2022.0047
PMID:36301256
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综述 | 本文综述了肿瘤微环境如何通过创建免疫抑制环境和代谢竞争来重新编程免疫细胞和其他基质细胞，以限制其抗肿瘤能力 | 利用单细胞测序技术分析了肿瘤微环境中免疫细胞和其他基质细胞的肿瘤特异性特征 | NA | 探讨肿瘤细胞如何重新编程肿瘤微环境及外周血中的免疫细胞，以提高当前免疫治疗效率并提出新的抗癌思路 | 肿瘤微环境中的免疫细胞和其他基质细胞 | NA | NA | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA |
| 253 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptional and functional analysis of dopaminergic neurons in organoid-like cultures derived from human fetal midbrain
2022-12-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.200504
PMID:36305490
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，分析了从人类胎儿中脑衍生的类器官培养物中多巴胺能神经元的转录组和功能成熟过程 | 本文首次揭示了3D类器官培养条件比单层培养条件更能有效地生成和维持成熟的多巴胺能神经元 | NA | 研究旨在开发从多能干细胞生成中脑多巴胺神经元的精细分化协议，以应用于疾病模型、诊断、药物筛选和基于细胞的治疗方法 | 人类胎儿中脑衍生的类器官培养物中的多巴胺能神经元 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 6-11周龄的人类胎儿中脑组织 |
| 254 | 2024-08-08 |
Applications of Transcriptomics in the Research of Antibody-Mediated Rejection in Kidney Transplantation: Progress and Perspectives
2022-12-31, Organogenesis
IF:1.6Q4
DOI:10.1080/15476278.2022.2131357
PMID:36259540
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研究论文 | 本文探讨了转录组学方法在肾移植中抗体介导排斥反应研究中的应用及其进展和展望 | 引入单细胞RNA测序技术，提供高分辨率的免疫细胞转录组图谱，以揭示抗体介导排斥反应的发病机制 | 传统的批量转录组方法仅反映平均基因表达，忽略了单个细胞间的转录组异质性 | 改进抗体介导排斥反应的临床诊断标准，并探索新的治疗策略 | 肾移植中的抗体介导排斥反应 | 转录组学 | 肾移植 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及移植肾活检样本 |
| 255 | 2024-08-08 |
IL-13/IL-4 signaling contributes to fibrotic progression of the myeloproliferative neoplasms
2022-12-29, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2022017326
PMID:36283106
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研究论文 | 本文研究了IL-13/IL-4信号通路在骨髓增生性肿瘤纤维化进展中的作用 | 首次揭示了IL-13在骨髓纤维化中的作用，并提出抑制IL-13/IL-4信号通路可能是一种新的治疗策略 | NA | 探讨IL-13/IL-4信号通路在骨髓纤维化进展中的作用及潜在的治疗策略 | 骨髓纤维化小鼠模型及患者样本 | NA | 骨髓增生性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 骨髓纤维化小鼠及患者样本 |
| 256 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing unveils the communications between malignant T and myeloid cells contributing to tumor growth and immunosuppression in cutaneous T-cell lymphoma
2022-12-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2022.215972
PMID:36265653
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了皮肤T细胞淋巴瘤中恶性T细胞与髓系细胞间的相互作用，这些作用促进了肿瘤生长和免疫抑制。 | 首次展示了皮肤T细胞淋巴瘤中恶性T细胞与髓系细胞的相互作用及其对肿瘤微环境的影响，并提出了新的治疗策略。 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据和细胞共培养实验，未来需要更多的临床试验来验证这些发现。 | 揭示皮肤T细胞淋巴瘤中恶性T细胞与髓系细胞的相互作用，并探索新的治疗策略。 | 皮肤T细胞淋巴瘤患者和健康对照者的单细胞RNA测序数据。 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及皮肤T细胞淋巴瘤患者和健康对照者的样本 |
| 257 | 2024-08-08 |
ScRNA-seq and bulk RNA-seq reveal the characteristics of ferroptosis and establish a risk signature in cholangiocarcinoma
2022-Dec-15, Molecular therapy oncolytics
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.omto.2022.09.008
PMID:36284715
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序技术，揭示了胆管癌中铁死亡的特征，并建立了一个风险标志物 | 首次通过scRNA-seq技术分析胆管癌中的免疫微环境和细胞异质性，并发现了与铁死亡相关的细胞间通信 | 研究依赖于公共数据库中的scRNA-seq数据，可能存在数据质量和样本代表性的限制 | 探索胆管癌中铁死亡的特征及其与免疫细胞的关系，并建立一个预测胆管癌预后的风险标志物 | 胆管癌中的铁死亡特征及免疫细胞的浸润情况 | 数字病理学 | 胆管癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 21个细胞集群 |
| 258 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analyses reveal microglia types associated with proliferative retinopathy
2022-12-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.160940
PMID:36264636
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组测序揭示了与增生性视网膜病变相关的微胶质细胞类型及其特征 | 首次全面绘制了正常和氧诱导的增生性视网膜病变小鼠视网膜中所有微胶质细胞群体的图谱，并揭示了几种独特的与增生性视网膜病变相关的微胶质细胞类型及其相关标记物、信号通路和调控元件 | 研究仅限于小鼠模型，未来研究需要进一步验证这些发现是否适用于人类 | 探究与新生血管化相关的微胶质细胞的异质性，并描述其转录组特征和代谢途径 | 微胶质细胞及其在增生性视网膜病变中的作用 | 数字病理学 | 眼科疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 正常空气和氧诱导的增生性视网膜病变小鼠的视网膜样本 |
| 259 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing analysis dissected the osteo-immunology microenvironment and revealed key regulators in osteoporosis
2022-Dec, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2022.109302
PMID:36257255
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了骨质疏松症中的骨免疫微环境，并揭示了关键的调控因子 | 发现了新的巨噬细胞亚型和差异表达基因，并识别了与骨代谢相关的新基因ZFP36L1和DEFA3，以及RETN-CAP1在骨免疫细胞相互作用中的新作用 | NA | 揭示骨质疏松症中骨免疫微环境的关键调控因子和可能的基因靶点及信号通路 | 骨质疏松症中的骨免疫微环境 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 19,102个细胞和4097个动态基因 |
| 260 | 2024-08-08 |
The role of lung macrophages in acute respiratory distress syndrome
2022-Dec, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-022-01645-4
PMID:36264361
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综述 | 本文综述了肺泡巨噬细胞在急性呼吸窘迫综合征（ARDS）中的作用，从解剖位置和细胞起源两个维度进行探讨 | 利用单细胞RNA测序、命运图谱、代谢组学等新技术，更深入地理解肺部巨噬细胞的发展过程、分类和功能 | 不同研究组对治疗反应的差异性和单核/巨噬细胞基因表达的巨大动态变化 | 探讨肺泡巨噬细胞在ARDS中的功能及治疗靶点 | 肺泡巨噬细胞及其在ARDS中的作用 | NA | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序、命运图谱、代谢组学 | NA | 基因表达数据 | NA |