单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 328 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2024-08-08 |
A two-stage digestion of whole murine knee joints for single-cell RNA sequencing
2022-Dec, Osteoarthritis and cartilage open
DOI:10.1016/j.ocarto.2022.100321
PMID:36474787
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研究论文 | 本文介绍了一种两阶段消化协议，用于从整个小鼠膝关节中提取细胞进行单细胞RNA测序 | 开发了一种快速的两阶段消化协议，以克服在准备适用于单细胞RNA测序的细胞悬液时遇到的技术挑战 | NA | 研究关节病理学中整个膝关节细胞的单细胞RNA测序应用 | 小鼠膝关节中的细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 多个小鼠的膝关节 | NA | NA | NA | NA |
| 202 | 2024-08-08 |
[Research Progress of Single-cell Transcriptome Sequencing Technology in Physiological Hematopoiesis--Review]
2022-Dec, Zhongguo shi yan xue ye xue za zhi
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综述 | 本文综述了近年来大规模单细胞转录组测序技术在生理性造血领域的研究进展 | 单细胞转录组测序技术为研究者提供了一个独特的视角，使得绘制生物体造血发育的最详细细胞命运转变图成为可能 | 由于技术限制，难以追踪造血器官中单细胞的造血活动 | 探讨单细胞转录组测序技术在生理性造血领域的应用 | 生理性造血过程中的细胞分化路径 | 数字病理学 | 血液肿瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组 | 大规模单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 203 | 2024-08-08 |
Evaluation of pulmonary single-cell identity specificity in scRNA-seq analysis
2022-12, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1132
PMID:36495131
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 204 | 2024-08-08 |
ACAP1 Deficiency Predicts Inferior Immunotherapy Response in Solid Tumors
2022-Dec-01, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14235951
PMID:36497434
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研究论文 | 本研究探讨了ACAP1在淋巴细胞中的表达及其对免疫治疗反应的影响 | 首次全面分析了ACAP1在肿瘤浸润淋巴细胞中的表达及其对免疫治疗反应的影响 | NA | 研究ACAP1在淋巴细胞中的功能及其对免疫治疗反应的预测作用 | ACAP1在淋巴细胞中的表达及其对免疫治疗反应的影响 | 数字病理学 | 肿瘤 | RNA测序, 单细胞测序, 免疫治疗队列, 基因集富集分析(GSEA) | NA | 基因组数据 | 多个批量RNA测序数据集, 单细胞测序数据集, 免疫治疗队列 | NA | NA | NA | NA |
| 205 | 2024-08-08 |
Naïve B cells with low differentiation improve the immune reconstitution of HIV-infected patients
2022-Dec-22, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105559
PMID:36465118
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了健康对照组、HIV感染的免疫应答者和非应答者的B细胞受体（BCR）谱和B细胞亚型，发现幼稚B细胞和记忆B细胞的基因片段使用主导，且BCR谱的多样性在免疫非应答者中降低。 | 研究发现幼稚B细胞的低分化与良好的免疫状态相关，并揭示了B细胞周期中免疫特异性基因IgD细胞在免疫非应答者中的降解机制。 | NA | 理解HIV感染后B细胞介导的免疫反应在免疫重建中的作用 | HIV感染患者的B细胞亚型和BCR谱 | 免疫学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及健康对照组、HIV感染的免疫应答者和非应答者的外周血单个核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 206 | 2024-08-08 |
B cell expansion hinders the stroma-epithelium regenerative cross talk during mucosal healing
2022-12-13, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2022.11.002
PMID:36462502
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研究论文 | 本文通过纵向研究肠道损伤和再生过程中的免疫细胞组成，揭示了B细胞在黏膜愈合过程中的作用及其对上皮-间质细胞相互作用的影响 | 首次通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了B细胞在肠道黏膜愈合中的具体作用机制 | NA | 探究影响肠道再生的细胞机制，特别是在黏膜愈合过程中B细胞的作用 | 肠道黏膜愈合过程中的免疫细胞组成及B细胞的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 207 | 2024-08-08 |
Robust Graph Regularized NMF with Dissimilarity and Similarity Constraints for ScRNA-seq Data Clustering
2022-Dec-12, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.2c01305
PMID:36459053
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研究论文 | 本文提出了一种新的单细胞RNA测序（ScRNA-seq）数据表示模型，称为具有不相似性和相似性约束的鲁棒图正则化非负矩阵分解（RGNMF-DS），用于ScRNA-seq数据聚类 | 采用互补的正则化器（相似和不相似正则化器）来指导矩阵分解，并构建图正则化器以发现ScRNA-seq数据中隐藏的局部几何结构，同时采用-范数来测量重建误差，从而提高模型对噪声的鲁棒性 | NA | 解决直接聚类ScRNA-seq数据时由于其高维度和噪声导致的性能不佳问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（ScRNA-seq） | 非负矩阵分解（NMF） | 基因表达数据 | 多个ScRNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 208 | 2024-08-08 |
Interferon-dependent SLC14A1+ cancer-associated fibroblasts promote cancer stemness via WNT5A in bladder cancer
2022-12-12, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2022.11.005
PMID:36459995
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析膀胱癌患者样本，发现一种由干扰素信号诱导的、高表达尿素转运蛋白SLC14A1的癌症相关成纤维细胞亚群，该亚群通过WNT5A旁分泌途径促进膀胱癌细胞的干细胞特性 | 首次报道了SLC14A1+癌症相关成纤维细胞在膀胱癌中的作用及其通过WNT5A途径促进干细胞特性的机制 | NA | 探讨癌症相关成纤维细胞在膀胱癌治疗反应和患者预后中的作用 | 膀胱癌患者的癌症相关成纤维细胞及其对癌细胞干细胞特性的影响 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 膀胱癌患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 209 | 2024-08-08 |
Targeting HER3 or MEK overcomes acquired Trastuzumab resistance in HER2-positive gastric cancer-derived xenograft
2022-Dec-03, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-022-01259-z
PMID:36463209
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研究论文 | 本研究通过建立胃癌PDX模型，探讨了HER2阳性胃癌对Trastuzumab产生耐药性的机制，并验证了联合使用HER3靶向抗体或MEK抑制剂作为克服耐药性的策略。 | 首次通过单细胞转录组测序、蛋白质组学和基因组变异分析全面描绘了Trastuzumab耐药性的分子机制，并验证了联合治疗策略的有效性。 | 研究仅限于动物模型，尚未在临床试验中验证。 | 探讨HER2阳性胃癌对Trastuzumab产生耐药性的机制，并寻找克服耐药性的新策略。 | HER2阳性胃癌及其对Trastuzumab的耐药性。 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 两个PDX模型（176P和176R） | NA | NA | NA | NA |
| 210 | 2024-08-08 |
m6A epitranscriptomic modification regulates neural progenitor-to-glial cell transition in the retina
2022-12-02, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.79994
PMID:36459087
|
研究论文 | 本研究使用视网膜特异性条件性敲除小鼠模型，探讨了m6A表观转录组修饰在视网膜神经前体细胞向胶质细胞转变中的作用 | 揭示了m6A表观转录组修饰通过调控前体细胞转录本的降解，精细调节视网膜前体细胞向Müller胶质细胞的转录组转变 | NA | 探讨m6A表观转录组修饰在视网膜发育中的功能 | 视网膜神经前体细胞和Müller胶质细胞 | 表观遗传学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），MeRIP-seq | NA | RNA | 视网膜特异性条件性敲除小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 211 | 2024-08-08 |
Personalized health risk assessment based on single-cell RNA sequencing analysis of a male with 45, X/48, XYYY karyotype
2022-12-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-25308-w
PMID:36460769
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研究论文 | 本文报道了一名具有罕见45, X/48, XYYY核型的14岁男孩，通过单细胞RNA测序分析评估其长期健康风险，特别是癌症风险 | 利用单细胞RNA测序技术首次详细分析了该核型患者的免疫细胞基因表达差异，并通过数字滴液PCR在DNA水平上验证了这些结果 | 研究样本数量有限，仅基于单一病例 | 评估具有45, X/48, XYYY核型个体的长期健康风险，特别是癌症风险 | 具有罕见45, X/48, XYYY核型的14岁男孩 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 单一病例 | NA | NA | NA | NA |
| 212 | 2024-08-08 |
Monocytes deposit migrasomes to promote embryonic angiogenesis
2022-12, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-022-01026-3
PMID:36443426
|
research paper | 研究报告了在鸡胚绒毛尿囊膜中，高迁移性细胞在毛细血管形成区域巡逻并沉积migrasomes，这些细胞被鉴定为单核细胞，其migrasomes富含促血管生成因子，促进胚胎血管生成。 | 首次发现单核细胞通过沉积富含促血管生成因子的migrasomes来促进胚胎血管生成。 | NA | 探讨单核细胞在胚胎血管生成中的作用及其机制。 | 单核细胞、migrasomes、胚胎血管生成。 | NA | NA | 单细胞测序、定量质谱分析。 | NA | 细胞、蛋白质。 | 鸡胚绒毛尿囊膜中的细胞样本。 | NA | NA | NA | NA |
| 213 | 2024-08-08 |
A unified computational framework for single-cell data integration with optimal transport
2022-12-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-35094-8
PMID:36456571
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研究论文 | 本文介绍了一种名为uniPort的统一单细胞数据整合框架，结合了耦合变分自编码器和最小批量不平衡最优传输方法，用于处理异质性单细胞多组学数据和空间转录组数据 | uniPort框架能够同时嵌入异质性单细胞多组学数据到一个共享的潜在空间，并提供灵活的标签转移框架来解卷积异质性空间转录组数据 | NA | 开发一种新的计算框架，用于整合异质性单细胞多组学数据和空间转录组数据 | 单细胞转录组学、染色质可及性和空间转录组数据 | 计算机视觉 | NA | 最优传输 | 耦合变分自编码器 | 单细胞多组学数据 | 多种数据集，包括单细胞转录组学、染色质可及性和空间转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 214 | 2024-08-08 |
Macrophages regulate vascular smooth muscle cell function during atherosclerosis progression through IL-1β/STAT3 signaling
2022-12-01, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-04255-2
PMID:36456628
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研究论文 | 本研究通过scRNA-seq分析人颈动脉斑块的近端相邻（PA）和动脉粥样硬化核心（AC）区域，揭示了巨噬细胞样血管平滑肌细胞（VSMCs）的功能改变及其在动脉粥样硬化进展中的作用。 | 首次揭示了IL-1β通过STAT3信号通路介导巨噬细胞与巨噬细胞样VSMCs之间的细胞交流，并促进了后者的粘附、炎症和凋亡。 | NA | 探讨巨噬细胞在动脉粥样硬化进展中对血管平滑肌细胞功能的影响及其分子机制。 | 人颈动脉斑块中的血管平滑肌细胞和巨噬细胞。 | NA | 心血管疾病 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 人颈动脉斑块的近端相邻（PA）和动脉粥样硬化核心（AC）区域样本 | NA | NA | NA | NA |
| 215 | 2024-08-08 |
Selective targeting of visceral adiposity by polycation nanomedicine
2022-12, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-022-01249-3
PMID:36456644
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研究论文 | 本文开发了一种基于聚阳离子的纳米药物P-G3，通过腹腔注射选择性靶向内脏脂肪，有效抑制肥胖小鼠的内脏脂肪积累，增加能量消耗，并缓解相关的代谢功能障碍。 | P-G3通过调节营养感应信号通路，解偶联脂肪细胞脂质合成与储存和脂肪细胞发育，创造出功能正常但缺乏肥大生长的脂肪细胞。 | NA | 开发一种新的纳米药物，专门针对内脏脂肪进行治疗，以解决肥胖这一全球性健康问题。 | 肥胖小鼠的内脏脂肪和相关代谢功能。 | NA | 肥胖 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 肥胖小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 216 | 2024-08-08 |
A phylogenetic approach to inferring the order in which mutations arise during cancer progression
2022-12, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1010560
PMID:36459515
|
研究论文 | 本文提出了一种新方法，利用单细胞测序的噪声数据推断个体肿瘤中体细胞突变的发生顺序 | 该方法在模型中同时考虑了肿瘤内体细胞突变的进化过程和单细胞测序数据收集过程中的技术误差，通过模拟分析显示其显著优于现有方法 | 单细胞测序的错误率较高，这使得任务变得复杂 | 旨在提高突变顺序预测的准确性并量化预测突变顺序的不确定性 | 研究对象包括结直肠癌和前列腺癌患者 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞测序 | NA | 数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 217 | 2024-08-08 |
Cdx1b protects intestinal cell fate by repressing signaling networks for liver specification
2022-12, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2022.11.006
PMID:36460297
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研究论文 | 本文研究了斑马鱼cdx1b基因在肠道发育中的作用，通过RNA测序和单细胞测序揭示了cdx1b缺失导致肠道细胞向肝细胞样细胞转变的现象。 | 首次在斑马鱼模型中观察到cdx1b缺失导致肠道细胞向肝细胞样细胞转变的现象，并揭示了Cdx1b通过抑制肝脏特异性转录因子和信号通路来维持肠道命运的作用机制。 | NA | 探究Cdx1b在斑马鱼肠道发育中的作用及其机制。 | 斑马鱼cdx1b基因及其在肠道发育中的功能。 | 发育生物学 | NA | RNA测序（RNA-seq）和单细胞测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列数据 | 从突变斑马鱼胚胎中分离的肠道样本 | NA | NA | NA | NA |
| 218 | 2024-08-08 |
Comparison of cell type distribution between single-cell and single-nucleus RNA sequencing: enrichment of adherent cell types in single-nucleus RNA sequencing
2022-12, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-022-00892-z
PMID:36460793
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研究论文 | 本研究比较了单细胞和单核RNA测序在结肠和肝脏组织中的细胞类型分布差异 | 发现单核RNA测序在特定细胞类型分析中提供了更多信息 | 研究仅限于结肠和肝脏组织，未涵盖其他组织类型 | 探讨单细胞和单核RNA测序方法的特性和差异 | 结肠和肝脏组织的细胞类型分布 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 单核RNA测序 (snRNA-seq) | NA | RNA | 结肠和肝脏组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 219 | 2024-08-08 |
Fibronectin 1 derived from tumor-associated macrophages and fibroblasts promotes metastasis through the JUN pathway in hepatocellular carcinoma
2022-Dec, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2022.109420
PMID:36461607
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研究论文 | 本研究通过多组学分析探索了肿瘤相关巨噬细胞和成纤维细胞衍生的纤连蛋白1（FN1）通过JUN途径促进肝细胞癌（HCC）转移的具体机制 | 首次揭示了FN1通过JUN-Hippo信号通路影响HCC的转录组特征和转移，并通过泛癌分析验证了该机制的普遍性 | NA | 探索肿瘤微环境中细胞间通讯对转移的调控机制 | 肝细胞癌（HCC）及其肿瘤微环境中的细胞间通讯 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、ATAC测序、RNA测序、甲基化测序 | 神经网络模型 | 基因组数据 | 数据来自GEO和TCGA数据库，具体样本数量未详细说明 | NA | NA | NA | NA |
| 220 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing in Rheumatic Diseases: New Insights from the Perspective of the Cell Type
2022-Dec-01, Aging and disease
IF:7.0Q1
DOI:10.14336/AD.2022.0323
PMID:36465169
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研究论文 | 本文探讨了单细胞测序技术在风湿病研究中的应用，特别是从细胞类型的角度提供的新见解 | 利用单细胞测序技术识别风湿病患者组织中的多种细胞亚型 | 细胞亚型的异质性使得实现个体化精准医疗仍有很长的路要走 | 提高风湿病诊断的准确性和治疗的有效性 | 风湿病患者组织中的细胞亚型及其功能 | NA | 风湿病 | 单细胞测序 | NA | 基因组、转录组、表观遗传学和蛋白质组数据 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |