单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 327 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2024-08-08 |
Monocytes deposit migrasomes to promote embryonic angiogenesis
2022-12, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-022-01026-3
PMID:36443426
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research paper | 研究报告了在鸡胚绒毛尿囊膜中，高迁移性细胞在毛细血管形成区域巡逻并沉积migrasomes，这些细胞被鉴定为单核细胞，其migrasomes富含促血管生成因子，促进胚胎血管生成。 | 首次发现单核细胞通过沉积富含促血管生成因子的migrasomes来促进胚胎血管生成。 | NA | 探讨单核细胞在胚胎血管生成中的作用及其机制。 | 单核细胞、migrasomes、胚胎血管生成。 | NA | NA | 单细胞测序、定量质谱分析。 | NA | 细胞、蛋白质。 | 鸡胚绒毛尿囊膜中的细胞样本。 |
| 202 | 2024-08-08 |
A unified computational framework for single-cell data integration with optimal transport
2022-12-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-35094-8
PMID:36456571
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研究论文 | 本文介绍了一种名为uniPort的统一单细胞数据整合框架，结合了耦合变分自编码器和最小批量不平衡最优传输方法，用于处理异质性单细胞多组学数据和空间转录组数据 | uniPort框架能够同时嵌入异质性单细胞多组学数据到一个共享的潜在空间，并提供灵活的标签转移框架来解卷积异质性空间转录组数据 | NA | 开发一种新的计算框架，用于整合异质性单细胞多组学数据和空间转录组数据 | 单细胞转录组学、染色质可及性和空间转录组数据 | 计算机视觉 | NA | 最优传输 | 耦合变分自编码器 | 单细胞多组学数据 | 多种数据集，包括单细胞转录组学、染色质可及性和空间转录组数据 |
| 203 | 2024-08-08 |
Macrophages regulate vascular smooth muscle cell function during atherosclerosis progression through IL-1β/STAT3 signaling
2022-12-01, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-04255-2
PMID:36456628
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研究论文 | 本研究通过scRNA-seq分析人颈动脉斑块的近端相邻（PA）和动脉粥样硬化核心（AC）区域，揭示了巨噬细胞样血管平滑肌细胞（VSMCs）的功能改变及其在动脉粥样硬化进展中的作用。 | 首次揭示了IL-1β通过STAT3信号通路介导巨噬细胞与巨噬细胞样VSMCs之间的细胞交流，并促进了后者的粘附、炎症和凋亡。 | NA | 探讨巨噬细胞在动脉粥样硬化进展中对血管平滑肌细胞功能的影响及其分子机制。 | 人颈动脉斑块中的血管平滑肌细胞和巨噬细胞。 | NA | 心血管疾病 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 人颈动脉斑块的近端相邻（PA）和动脉粥样硬化核心（AC）区域样本 |
| 204 | 2024-08-08 |
Selective targeting of visceral adiposity by polycation nanomedicine
2022-12, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-022-01249-3
PMID:36456644
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研究论文 | 本文开发了一种基于聚阳离子的纳米药物P-G3，通过腹腔注射选择性靶向内脏脂肪，有效抑制肥胖小鼠的内脏脂肪积累，增加能量消耗，并缓解相关的代谢功能障碍。 | P-G3通过调节营养感应信号通路，解偶联脂肪细胞脂质合成与储存和脂肪细胞发育，创造出功能正常但缺乏肥大生长的脂肪细胞。 | NA | 开发一种新的纳米药物，专门针对内脏脂肪进行治疗，以解决肥胖这一全球性健康问题。 | 肥胖小鼠的内脏脂肪和相关代谢功能。 | NA | 肥胖 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 肥胖小鼠 |
| 205 | 2024-08-08 |
A phylogenetic approach to inferring the order in which mutations arise during cancer progression
2022-12, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1010560
PMID:36459515
|
研究论文 | 本文提出了一种新方法，利用单细胞测序的噪声数据推断个体肿瘤中体细胞突变的发生顺序 | 该方法在模型中同时考虑了肿瘤内体细胞突变的进化过程和单细胞测序数据收集过程中的技术误差，通过模拟分析显示其显著优于现有方法 | 单细胞测序的错误率较高，这使得任务变得复杂 | 旨在提高突变顺序预测的准确性并量化预测突变顺序的不确定性 | 研究对象包括结直肠癌和前列腺癌患者 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞测序 | NA | 数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 206 | 2024-08-08 |
Increased post-mitotic senescence in aged human neurons is a pathological feature of Alzheimer's disease
2022-12-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2022.11.010
PMID:36459967
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研究论文 | 研究探讨了阿尔茨海默病（AD）患者大脑中神经元衰老标记物的表达增加及其病理意义 | 首次揭示了AD患者神经元中存在特定的衰老样状态，并提出了针对这些衰老样神经元的治疗策略 | NA | 探究阿尔茨海默病中神经元衰老的特征及其对疾病发展的影响 | 阿尔茨海默病患者的神经元及其衰老标记物 | NA | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 207 | 2024-08-08 |
A mineralizing pool of Gli1-expressing progenitors builds the tendon enthesis and demonstrates therapeutic potential
2022-12-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2022.11.007
PMID:36459968
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，分析了小鼠肌腱附着点在出生后不同阶段的发育转录组，并探讨了Gli1表达的前体细胞在肌腱附着点再生中的治疗潜力。 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了肌腱附着点发育过程中的六种常驻细胞类型及其转录因子调节网络和时间调控，并证明了Gli1表达的前体细胞在肌腱附着点再生中的治疗潜力。 | NA | 探究肌腱附着点的发育机制，并评估Gli1表达的前体细胞在肌腱附着点再生中的治疗效果。 | 小鼠肌腱附着点的发育过程及其细胞类型。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠肌腱附着点在出生后不同阶段的样本 |
| 208 | 2024-08-08 |
Cdx1b protects intestinal cell fate by repressing signaling networks for liver specification
2022-12, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2022.11.006
PMID:36460297
|
研究论文 | 本文研究了斑马鱼cdx1b基因在肠道发育中的作用，通过RNA测序和单细胞测序揭示了cdx1b缺失导致肠道细胞向肝细胞样细胞转变的现象。 | 首次在斑马鱼模型中观察到cdx1b缺失导致肠道细胞向肝细胞样细胞转变的现象，并揭示了Cdx1b通过抑制肝脏特异性转录因子和信号通路来维持肠道命运的作用机制。 | NA | 探究Cdx1b在斑马鱼肠道发育中的作用及其机制。 | 斑马鱼cdx1b基因及其在肠道发育中的功能。 | 发育生物学 | NA | RNA测序（RNA-seq）和单细胞测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列数据 | 从突变斑马鱼胚胎中分离的肠道样本 |
| 209 | 2024-08-08 |
Comparison of cell type distribution between single-cell and single-nucleus RNA sequencing: enrichment of adherent cell types in single-nucleus RNA sequencing
2022-12, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-022-00892-z
PMID:36460793
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研究论文 | 本研究比较了单细胞和单核RNA测序在结肠和肝脏组织中的细胞类型分布差异 | 发现单核RNA测序在特定细胞类型分析中提供了更多信息 | 研究仅限于结肠和肝脏组织，未涵盖其他组织类型 | 探讨单细胞和单核RNA测序方法的特性和差异 | 结肠和肝脏组织的细胞类型分布 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 单核RNA测序 (snRNA-seq) | NA | RNA | 结肠和肝脏组织样本 |
| 210 | 2024-08-08 |
Fibronectin 1 derived from tumor-associated macrophages and fibroblasts promotes metastasis through the JUN pathway in hepatocellular carcinoma
2022-Dec, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2022.109420
PMID:36461607
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析探索了肿瘤相关巨噬细胞和成纤维细胞衍生的纤连蛋白1（FN1）通过JUN途径促进肝细胞癌（HCC）转移的具体机制 | 首次揭示了FN1通过JUN-Hippo信号通路影响HCC的转录组特征和转移，并通过泛癌分析验证了该机制的普遍性 | NA | 探索肿瘤微环境中细胞间通讯对转移的调控机制 | 肝细胞癌（HCC）及其肿瘤微环境中的细胞间通讯 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、ATAC测序、RNA测序、甲基化测序 | 神经网络模型 | 基因组数据 | 数据来自GEO和TCGA数据库，具体样本数量未详细说明 |
| 211 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing in Rheumatic Diseases: New Insights from the Perspective of the Cell Type
2022-Dec-01, Aging and disease
IF:7.0Q1
DOI:10.14336/AD.2022.0323
PMID:36465169
|
研究论文 | 本文探讨了单细胞测序技术在风湿病研究中的应用，特别是从细胞类型的角度提供的新见解 | 利用单细胞测序技术识别风湿病患者组织中的多种细胞亚型 | 细胞亚型的异质性使得实现个体化精准医疗仍有很长的路要走 | 提高风湿病诊断的准确性和治疗的有效性 | 风湿病患者组织中的细胞亚型及其功能 | NA | 风湿病 | 单细胞测序 | NA | 基因组、转录组、表观遗传学和蛋白质组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 212 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals a Population of Smooth Muscle Cells Responsible for Atherogenesis
2022-Dec-01, Aging and disease
IF:7.0Q1
DOI:10.14336/AD.2022.0313
PMID:36465170
|
研究论文 | 本研究利用3S-ASCVD犬模型，结合批量RNA测序和单细胞RNA测序，揭示了参与动脉粥样硬化发展的平滑肌细胞群体 | 首次在3S-ASCVD犬模型中发现TNC平滑肌细胞在动脉粥样硬化发展中的重要作用，并发现这些细胞在人类动脉粥样硬化易发部位的存在 | NA | 探究动脉粥样硬化发展的区域倾向性差异及其背后的细胞机制 | 3S-ASCVD犬模型中的动脉粥样硬化易发和抵抗动脉，以及人类动脉粥样硬化易发部位 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 3S-ASCVD犬模型 |
| 213 | 2024-08-08 |
High-level of intratumoral GITR+ CD4 T cells associate with poor prognosis in gastric cancer
2022-Dec-22, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105529
PMID:36419848
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析了胃癌患者中GITR+ CD4 T细胞的表达模式及其与预后的关系 | 揭示了GITR+ CD4 T细胞在胃癌中的免疫抑制作用及其与预后的关联，并发现Treg细胞中GITR蛋白的分布受微环境影响 | NA | 探讨GITR在胃癌中的表达模式及其对预后的影响 | 胃癌患者的GITR+ CD4 T细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 214 | 2024-08-08 |
Expression and regulatory characteristics of peripheral blood immune cells in primary Sjögren's syndrome patients using single-cell transcriptomic
2022-Dec-22, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105509
PMID:36425764
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研究论文 | 本研究使用单细胞转录组学技术分析了原发性干燥综合征患者外周血单个核细胞的免疫细胞亚群表达及调控特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了原发性干燥综合征患者外周血单个核细胞中CD14单核细胞的转录因子表达及目标基因调控情况，并提出了基于表达的CD56CD16 NK细胞分类系统 | 研究样本量较小，仅包括三名患者和三名健康对照 | 探讨原发性干燥综合征患者外周血免疫细胞亚群的表达及调控特性 | 原发性干燥综合征患者及健康对照的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 68,500个外周血单个核细胞，来自三名原发性干燥综合征患者和三名健康对照 |
| 215 | 2024-08-08 |
Neuronal cell types, projections, and spatial organization of the central amygdala
2022-Dec-22, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105497
PMID:36425768
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研究论文 | 本文通过结合单细胞RNA测序、多重荧光杂交、免疫组织化学和远距离投射映射，对中央杏仁核（CEA）的细胞类型进行了“自下而上”的理解 | 本文识别了两种在先前研究中未被解决的主要细胞类型，并揭示了与表达相关的新型CEA子域 | NA | 研究中央杏仁核的细胞类型、投射和空间组织 | 中央杏仁核的细胞类型和电路 | NA | NA | 单细胞RNA测序、多重荧光杂交、免疫组织化学 | NA | 细胞 | 涵盖了所有CEA神经元的三分之一 |
| 216 | 2024-08-08 |
High precision, high throughput generation of droplets containing single cells
2022-12-06, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d2lc00841f
PMID:36416090
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研究论文 | 本文介绍了一种简单的被动微流控系统，能够高效地生成包含单细胞的液滴，具有极高的吞吐量和极低的错误率 | 该技术克服了单细胞封装过程中的随机性问题，显著提高了效率和吞吐量，并增强了组合液滴实验的可预测性 | NA | 开发一种高精度、高吞吐量的单细胞液滴生成技术 | 单细胞封装技术及其在单细胞测序、稀有细胞分离、免疫学或癌症生物学中的多细胞/珠研究中的应用 | 微流控技术 | NA | 微流控技术 | NA | NA | 每分钟生成超过22,000个单细胞加载的液滴 |
| 217 | 2024-08-08 |
The kidney-more than the sum of its cellular parts
2022-12, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2022.08.032
PMID:36411017
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研究论文 | 本文探讨了肾脏作为一个复杂器官，其细胞间相互作用对生理和病理生理的影响，并利用单细胞测序技术和空间转录组学等方法来解析这些相互作用 | 利用单细胞测序技术和空间转录组学等先进技术，解析肾脏细胞间复杂的生理和病理生理相互作用，并发现新的生物标志物和治疗选项 | NA | 解析肾脏细胞间相互作用的复杂生理和病理生理机制 | 肾脏及其细胞间的相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序技术，空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 218 | 2024-08-08 |
Urinary single-cell transcriptomics: a promising noninvasive method for assessing acute kidney injury
2022-12, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2022.09.006
PMID:36411018
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研究论文 | 探讨利用尿液单细胞RNA测序评估人类急性肾损伤的可行性 | 提出了一种新的非侵入性方法——尿液单细胞RNA测序，用于评估急性肾损伤，可能发现新的生物标志物和治疗靶点 | NA | 探索非侵入性方法获取肾脏内部信息，以理解急性肾损伤的机制 | 急性肾损伤患者尿液中的单细胞 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 219 | 2024-08-08 |
Empagliflozin reduces kidney fibrosis and improves kidney function by alternative macrophage activation in rats with 5/6-nephrectomy
2022-Dec, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2022.113947
PMID:36411661
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了SGLT2抑制剂empagliflozin在5/6肾切除大鼠模型中对肾脏纤维化和肾功能的改善作用及其机制。 | 首次揭示了empagliflozin通过抑制CD206+CD68+ M2巨噬细胞极化，靶向mTOR和自噬途径，以及减弱CD8+效应T细胞的炎症信号，来改善肾脏功能和形态。 | NA | 探讨empagliflozin在5/6肾切除大鼠中改善肾脏功能和减少纤维化的机制。 | 5/6肾切除大鼠的肾脏细胞。 | 数字病理学 | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个5/6肾切除大鼠的肾脏样本 |
| 220 | 2024-08-08 |
A single-cell human islet interactome atlas identifies disrupted autocrine and paracrine communications in type 2 diabetes
2022-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqac084
PMID:36415826
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学数据分析，构建了人类胰岛互作图谱，并探讨了其在2型糖尿病中的变化 | 首次构建了人类胰岛互作图谱模型，识别了2型糖尿病中失调的自分泌和旁分泌通信 | NA | 研究胰岛细胞间的协同通信，并探讨其在2型糖尿病中的变化 | 2型糖尿病患者和非糖尿病患者的胰岛细胞 | NA | 2型糖尿病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 3046个细胞，分为7种细胞类型 |