单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 328 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-12-09 |
A human fetal lung cell atlas uncovers proximal-distal gradients of differentiation and key regulators of epithelial fates
2022-Dec-08, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2022.11.005
PMID:36493756
|
研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA与ATAC测序、高通量空间转录组学和单细胞成像技术，构建了一个人类胎儿肺发育的多组学细胞图谱 | 结合单细胞方法与空间分析，首次全面描绘了人类肺发育中上皮、间充质、内皮及红细胞/白细胞等细胞区室，并识别了包括发育特异性分泌祖细胞和与人类小细胞肺癌相关的神经内分泌细胞亚型在内的新细胞状态 | NA | 构建人类胎儿肺发育的多组学细胞图谱，以揭示细胞分化梯度和关键调控因子 | 人类胎儿肺组织（孕后5-22周） | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 高通量空间转录组学, 单细胞成像 | NA | 单细胞多组学数据, 空间转录组数据, 成像数据 | 涵盖孕后5-22周的人类胎儿肺组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2 | 2025-10-05 |
A mineralizing pool of Gli1-expressing progenitors builds the tendon enthesis and demonstrates therapeutic potential
2022-12-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2022.11.007
PMID:36459968
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠肌腱附着点发育过程中的细胞类型和转录调控机制，并验证了Gli1表达祖细胞的治疗潜力 | 首次在单细胞分辨率下定义了小鼠肌腱附着点的发育转录组，识别了六种驻留细胞类型及其转录调控网络，并证实Gli1谱系细胞具有克隆性和多能性 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类或其他物种中验证 | 探索肌腱附着点的发育机制并开发促进其再生的治疗方法 | 小鼠肌腱附着点发育过程中的细胞类型和Gli1谱系细胞 | 单细胞生物学 | 肌腱附着点损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠产后发育阶段的肌腱附着点组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2025-10-05 |
Mouse primordial germ-cell-like cells lack piRNAs
2022-12-05, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.11.004
PMID:36473462
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和小RNA测序发现体外分化的小鼠原始生殖细胞样细胞缺乏piRNAs | 首次证明体外分化的第6天小鼠原始生殖细胞样细胞尚未建立功能性piRNA通路 | 研究仅关注第6天的mPGCLCs，未覆盖更长的分化时间点 | 探究小鼠原始生殖细胞样细胞中piRNA通路的发育状态 | 小鼠原始生殖细胞样细胞(mPGCLCs) | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA-seq, RT-qPCR, 小RNA-seq | NA | RNA测序数据 | 多个第6天mPGCLC细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq, 小RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2025-10-06 |
Graph deep learning for the characterization of tumour microenvironments from spatial protein profiles in tissue specimens
2022-12, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-022-00951-w
PMID:36357512
|
研究论文 | 利用图神经网络分析组织样本中的空间蛋白质谱以表征肿瘤微环境 | 提出基于空间蛋白质谱的局部子图建模方法，能捕捉与临床结果相关的独特细胞相互作用 | 方法验证仅限于头颈癌和结直肠癌样本，需进一步扩展验证 | 开发基于图深度学习的肿瘤微环境表征方法以预测患者预后 | 人类头颈癌和结直肠癌组织样本 | 计算机视觉 | 头颈癌,结直肠癌 | 多重免疫荧光成像 | 图神经网络(GNN) | 空间蛋白质谱图像 | NA | NA | 多重免疫荧光成像 | NA | 40重免疫荧光成像 |
| 5 | 2025-10-06 |
Amyloid-beta and tau pathologies act synergistically to induce novel disease stage-specific microglia subtypes
2022-12-17, Molecular neurodegeneration
IF:14.9Q1
DOI:10.1186/s13024-022-00589-x
PMID:36536457
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了淀粉样蛋白-β和tau病理在阿尔茨海默病进展中协同诱导新型疾病阶段特异性小胶质细胞亚型 | 首次发现Aβ和tau病理协同作用在疾病不同阶段诱导特异性小胶质细胞亚型EADAM和LADAM，并鉴定Siglec基因作为AD进展的生物标志物 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证仍需扩展 | 探究阿尔茨海默病中Aβ和tau病理如何协同调控小胶质细胞亚型 | AD模型小鼠的小胶质细胞及人类颞上回和内嗅皮层组织 | 单细胞基因组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, snRNA-Seq | NA | 单细胞转录组数据 | AD模型小鼠及不同Braak分期的人类脑组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2025-10-06 |
Comparison of oocyte vitrification using a semi-automated or a manual closed system in human siblings: survival and transcriptomic analyses
2022-Dec-05, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-022-01064-3
PMID:36464714
|
研究论文 | 比较半自动与手动封闭系统对人类姐妹卵母细胞玻璃化冷冻的效果，包括存活率和转录组分析 | 首次使用单细胞RNA-seq技术评估卵母细胞玻璃化冷冻的转录组后果，并比较新型半自动化系统与传统手动方法的差异 | 研究样本量有限，且不同研究间未观察到一致的转录组特征 | 评估半自动化卵母细胞玻璃化冷冻系统的效率及其对卵母细胞转录组的影响 | 人类姐妹卵母细胞 | 生殖医学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA-seq, 玻璃化冷冻技术 | NA | 基因表达数据, 形态测量数据 | 人类姐妹卵母细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2025-10-06 |
Cerebrospinal fluid immune dysregulation during healthy brain aging and cognitive impairment
2022-12-22, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2022.11.019
PMID:36516855
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析脑脊液免疫系统在健康脑老化和认知障碍期间的变化 | 首次在单细胞水平揭示脑脊液免疫系统随年龄和认知状态的变化，发现单核细胞脂质转运基因表达模式改变及CXCL16-CXCR6信号通路在认知障碍中的作用 | 样本量相对有限（共59名受试者），未涵盖更广泛年龄范围或不同神经退行性疾病类型 | 探究脑脊液免疫系统在健康脑老化和认知障碍期间的调控机制 | 45名54-82岁认知正常受试者和14名认知障碍受试者的脑脊液样本 | 单细胞基因组学 | 认知障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 59名受试者（45名认知正常，14名认知障碍） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2025-10-06 |
Delivery of costimulatory blockade to lymph nodes promotes transplant acceptance in mice
2022-12-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI159672
PMID:36519543
|
研究论文 | 本研究探索了通过淋巴结靶向纳米递送抗CD40L抗体促进小鼠心脏移植耐受的机制 | 首次发现成纤维网状细胞在抗CD40L诱导移植耐受中的关键作用，并开发了MECA-79修饰的纳米颗粒实现淋巴结特异性递送 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在大型动物或人体中验证 | 研究淋巴结靶向递送共刺激阻断剂促进心脏移植耐受的机制 | 小鼠心脏移植模型 | 免疫学 | 器官移植排斥 | 单细胞RNA测序, 纳米颗粒递送技术 | NA | 基因表达数据, 移植存活数据 | 小鼠实验模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2025-10-06 |
Processing and cryopreservation of human ureter tissues for single-cell and spatial transcriptomics assays
2022-12-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101854
PMID:36595885
|
研究论文 | 本文介绍了用于单细胞和空间转录组学分析的人类输尿管组织处理与冷冻保存优化方案 | 开发了针对人类输尿管组织的单细胞悬液制备和冷冻保存优化方案，以及适用于10x Genomics Visium空间基因表达平台的组织冷冻保存方法 | NA | 建立人类输尿管组织的单细胞和空间转录组学分析样本制备标准流程 | 人类输尿管组织（来自膀胱切除术后） | 单细胞测序技术 | 泌尿系统疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Genomics Visium空间基因表达平台 |
| 10 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptional profiling reveals heterogeneity and developmental trajectories of Ewing sarcoma
2022-Dec, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-022-04073-3
PMID:35713707
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示尤文肉瘤的异质性、发育轨迹及其与神经嵴细胞起源的关系 | 首次在单细胞分辨率揭示尤文肉瘤的发育轨迹异质性，发现JAK1基因在肿瘤发生中的关键作用及潜在治疗价值 | 样本量较小（仅4个肿瘤组织），需要更大规模验证 | 探究尤文肉瘤的细胞异质性、发育轨迹和肿瘤发生机制 | 尤文肉瘤肿瘤组织样本 | 单细胞转录组学 | 尤文肉瘤 | 单细胞RNA测序 | K-近邻算法, Monocle2伪时间轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 4个尤文肉瘤肿瘤组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2025-10-06 |
Mitochondrial dysfunction induces ALK5-SMAD2-mediated hypovascularization and arteriovenous malformations in mouse retinas
2022-12-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-35262-w
PMID:36496409
|
研究论文 | 本研究揭示了线粒体功能障碍通过ALK5-SMAD2信号通路导致小鼠视网膜血管发育异常和动静脉畸形的机制 | 首次发现线粒体功能障碍通过诱导SMAD2线粒体定位和MAPKs介导的磷酸化增强ALK5-SMAD2信号通路，导致视网膜血管异常 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类疾病中验证 | 探究线粒体功能障碍导致视网膜血管发育异常的分子机制 | 内皮细胞特异性缺失Tfam、Cox10或Trx2基因的小鼠视网膜 | 分子生物学 | 视网膜血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、组织学图像 | 三种不同基因敲除小鼠品系的视网膜样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2025-10-06 |
Ovarian cancer mutational processes drive site-specific immune evasion
2022-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-05496-1
PMID:36517593
|
研究论文 | 本研究通过整合分析揭示了卵巢癌突变过程如何驱动特定部位的免疫逃逸机制 | 首次系统性地将突变过程、解剖部位与肿瘤微环境免疫状态联系起来，揭示了不同突变类型肿瘤的免疫特征差异 | 样本量相对有限（42例患者），且仅针对初治患者进行研究 | 评估突变过程和解剖部位如何决定肿瘤微环境的免疫状态 | 42例初治高级别浆液性卵巢癌患者的160个肿瘤部位 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 全基因组测序, 单细胞RNA测序, 数字组织病理学, 多重免疫荧光 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 图像数据 | 42例患者共160个肿瘤部位 | NA | 单细胞RNA测序, 全基因组测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 13 | 2025-10-06 |
Caspase-Mediated Regulation and Cellular Heterogeneity of the cGAS/STING Pathway in Kaposi's Sarcoma-Associated Herpesvirus Infection
2022-12-20, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.02446-22
PMID:36255240
|
研究论文 | 本研究揭示了卡波西肉瘤相关疱疹病毒通过半胱天冬酶活性抑制cGAS/STING通路以逃逸宿主免疫的新机制 | 首次发现半胱天冬酶在KSHV裂解复制期间抑制DNA感受器cGAS，并通过单细胞RNA测序揭示仅极少数细胞产生IFN-β即可建立有效抗病毒状态 | 对半胱天冬酶如何特异性拮抗KSHV感染期间IFN信号通路的分子机制理解仍不完整 | 阐明病毒利用宿主半胱天冬酶逃逸先天免疫的分子机制 | 卡波西肉瘤相关疱疹病毒感染的细胞 | 病毒免疫学 | 卡波西肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2025-10-06 |
Human B-cell subset identification and changes in inflammatory diseases
2022-12-31, Clinical and experimental immunology
IF:3.4Q3
DOI:10.1093/cei/uxac104
PMID:36617261
|
综述 | 本文回顾了人类血液中B细胞亚群的识别方法及其在炎症性疾病中的变化 | 系统总结了高维表型工具（如质谱流式细胞术和单细胞RNA测序）在揭示B细胞异质性方面的最新进展 | 不同研究对B细胞亚群的识别和命名仍存在不确定性和差异 | 阐明人类血液B细胞亚群的识别标准及其在炎症性疾病中的变化 | 人类血液中的B细胞亚群 | 免疫学 | 炎症性疾病 | 质谱流式细胞术, 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2025-10-06 |
Diverse monogenic subforms of human spermatogenic failure
2022-12-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-35661-z
PMID:36572685
|
研究论文 | 通过外显子组测序和单细胞RNA测序分析，揭示了人类非梗阻性无精子症的多种单基因亚型 | 首次系统性地识别了21个与非梗阻性无精子症相关的基因，并建立了基于分子表达模式的疾病亚型分类框架 | 样本量相对有限，部分基因功能尚未完全阐明 | 探索非梗阻性无精子症的遗传基础并建立新的疾病分类体系 | 1000多例临床诊断的非梗阻性无精子症患者和11587例可育对照 | 遗传学 | 男性不育症 | 外显子组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 2072例病例和11587例对照 | NA | 外显子组测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 16 | 2025-10-06 |
Notch-dependent cooperativity between myeloid lineages promotes Langerhans cell histiocytosis pathology
2022-12-23, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.add3330
PMID:36525505
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和蛋白质分析揭示了朗格汉斯细胞组织细胞增生症中DC2和DC3/单核细胞谱系间Notch依赖性协同作用机制 | 提出了LCH的双重起源模型，发现MAPK通路激活发生在DC2和DC3/单核细胞谱系命运决定之前，并揭示了谱系间Notch依赖性协同作用 | 未明确说明样本规模和具体实验设计的局限性 | 探究朗格汉斯细胞组织细胞增生症的发病机制和细胞间相互作用 | 朗格汉斯细胞组织细胞增生症病变组织中的异常分化单核吞噬细胞 | 单细胞生物学 | 朗格汉斯细胞组织细胞增生症 | 单细胞RNA测序, 蛋白质分析, 高内涵成像, 谱系追踪 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据, 影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing and lineage tracing confirm mesenchyme to epithelial transformation (MET) contributes to repair of the endometrium at menstruation
2022-Dec-16, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.77663
PMID:36524724
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和谱系追踪证实间质细胞向上皮细胞转化参与子宫内膜修复过程 | 首次发现一群对创伤有反应的可塑性子宫内膜间质成纤维细胞，能够通过间质-上皮转化参与腔上皮的快速修复 | 研究基于小鼠模型，需要在人类子宫内膜中进一步验证 | 研究子宫内膜修复过程中新形成腔上皮细胞的来源 | 小鼠子宫内膜间质细胞 | 单细胞生物学 | 子宫内膜疾病 | 单细胞RNA测序, 谱系追踪, 轨迹分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 三种转基因小鼠品系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2025-10-06 |
Mapping single-cell transcriptomes in the intra-tumoral and associated territories of kidney cancer
2022-12-12, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2022.11.001
PMID:36423636
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序研究肾癌肿瘤内及周边区域的细胞组成和功能状态 | 首次在肾癌中结合单细胞转录组、全外显子组和空间转录组分析，揭示了CD8 T细胞耗竭状态与组织定位的关系，并发现了肿瘤-正常组织界面特有的上皮-间质转化元程序 | 样本量相对较小（12例患者），需要在更大队列中验证发现 | 解析肾癌肿瘤微环境中癌细胞特性与多细胞互作关系 | 肾癌患者肿瘤核心、肿瘤-正常组织界面、正常周围组织和外周血样本 | 单细胞生物学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序，全外显子组测序，空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据，基因组数据，空间转录组数据 | 12例肾癌患者，超过270,000个单细胞转录组和100个显微切割全外显子组 | NA | 单细胞RNA-seq，全外显子组测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 19 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing for the Detection of Clonotypic V(D)J Rearrangements in Multiple Myeloma
2022-Dec-10, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms232415691
PMID:36555330
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序检测多发性骨髓瘤中的克隆型V(D)J重排 | 首次将标准10x Genomics方案应用于单细胞水平检测表达型V(D)J序列，克服了高突变区域共识引物错配限制 | 样本量较小（仅19例），需要在更大队列中验证 | 开发通过单细胞RNA测序检测多发性骨髓瘤克隆型V(D)J重排的方法 | 多发性骨髓瘤患者的恶性浆细胞 | 单细胞测序 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序，V(D)J测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 19例浆细胞疾病患者的骨髓穿刺样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序，单细胞V(D)J测序 | 10x Chromium | 标准10x Genomics单细胞RNA测序方案 |
| 20 | 2025-10-06 |
Increased post-mitotic senescence in aged human neurons is a pathological feature of Alzheimer's disease
2022-12-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2022.11.010
PMID:36459967
|
研究论文 | 本研究揭示了阿尔茨海默病患者神经元中衰老标志物增加的现象及其病理特征 | 首次在终末分化的人类神经元中发现衰老样状态，并证明其与阿尔茨海默病病理相关 | 研究主要基于体外诱导神经元模型，需要进一步在体验证 | 探究神经元衰老样状态在阿尔茨海默病发病机制中的作用 | 阿尔茨海默病患者脑组织、直接诱导神经元、脑脊液和人类星形胶质细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组测序、表观遗传分析、分子生物标志物检测 | 直接诱导神经元模型 | 转录组数据、表观遗传数据、分子生物标志物数据 | 阿尔茨海默病患者脑组织和诱导神经元 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |