单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 320 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics defines an improved, validated monoculture protocol for differentiation of human iPSC to microglia
2022-11-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-23477-2
PMID:36376339
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学技术，优化并验证了一种从人诱导多能干细胞（iPSC）分化为小胶质细胞的单培养协议 | 本文通过系统评估培养基成分、涂层和生长因子，优化了培养基配方，产生了转录和功能上都相关的小胶质细胞 | NA | 开发一种真实的人工体外模型，用于研究人类小胶质细胞的生理功能 | 人诱导多能干细胞（iPSC）分化为小胶质细胞的过程 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 跨两个实验室验证 |
| 162 | 2024-08-08 |
Shape-aware stochastic neighbor embedding for robust data visualisations
2022-Nov-14, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-022-05028-8
PMID:36376789
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研究论文 | 本文提出了一种基于形状感知图距离的t-SNE算法改进方法，用于增强高维数据可视化的鲁棒性和准确性 | 通过引入形状感知图距离，改进了t-SNE算法在表示集群间层次关系和避免虚假模式方面的不足 | NA | 旨在改进t-SNE算法在高维数据可视化中的性能，特别是在揭示集群结构和层次关系方面 | 高维单细胞转录组数据和MNIST图像数据 | 计算机视觉 | NA | t-SNE | NA | 图像 | 涉及单细胞转录组数据和MNIST图像数据 |
| 163 | 2024-08-08 |
Tissue dissociation for single-cell and single-nuclei RNA sequencing for low amounts of input material
2022-Nov-12, Frontiers in zoology
IF:2.6Q1
DOI:10.1186/s12983-022-00472-x
PMID:36371195
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研究论文 | 本文评估了从小型组织样本中分离单细胞和单核的不同方法，并展示了这些方法在单细胞和单核RNA测序中的应用。 | 提出了适用于少量输入材料的两种分离协议，即单细胞和单核的分离方法，并比较了单细胞RNA测序（scRNAseq）和单核RNA测序（snRNAseq）的数据。 | NA | 探索在组织材料有限的情况下，如何有效地进行单细胞和单核RNA测序。 | 果蝇的眼触角成虫盘组织样本。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq），单核RNA测序（snRNAseq） | NA | RNA | 小型组织样本 |
| 164 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis reveals cellular heterogeneity in mouse intra- and extra articular ligaments
2022-11-12, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-04196-w
PMID:36371589
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了小鼠前交叉韧带（ACL）和内侧副韧带（MCL）的转录组特征，揭示了这两种韧带细胞的异质性 | 首次详细描述了ACL和MCL中三种表达不同胶原蛋白的成纤维细胞类型的异质性，并发现了与年龄相关的细胞组成和基因表达变化 | NA | 探究小鼠前交叉韧带和内侧副韧带细胞的异质性，为韧带损伤的治疗提供潜在的治疗靶点 | 小鼠前交叉韧带（ACL）和内侧副韧带（MCL）的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |
| 165 | 2024-08-08 |
Downregulation of zinc finger protein 71 in laryngeal squamous cell carcinoma tissues and its potential molecular mechanism and clinical significance: a study based on immunohistochemistry staining and data mining
2022-Nov-11, World journal of surgical oncology
IF:2.5Q1
DOI:10.1186/s12957-022-02823-8
PMID:36369089
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研究论文 | 本研究探讨了锌指蛋白71（ZNF71）在喉鳞状细胞癌（LSCC）组织中的表达及其潜在分子机制和临床意义 | 首次报道了ZNF71在LSCC中的确切表达水平及其分子机制 | 需要进一步研究以验证ZNF71下调对LSCC进展的影响 | 探究ZNF71在LSCC中的表达及其分子机制和临床意义 | ZNF71在LSCC组织中的表达水平及其对LSCC进展的影响 | 数字病理学 | 喉癌 | 免疫组织化学染色（IHC）、基因芯片、高通量测序、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 组织样本、基因表达数据 | 33个LSCC样本和29个非LSCC样本用于IHC分析，313个LSCC样本和192个非LSCC样本用于基因芯片和高通量测序分析 |
| 166 | 2024-08-08 |
A flexible cross-platform single-cell data processing pipeline
2022-11-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-34681-z
PMID:36369450
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研究论文 | 介绍了一种名为UniverSC的通用单细胞RNA测序数据处理工具，支持基于任何唯一分子标识符的平台，并提供跨平台的图形用户界面 | UniverSC工具支持多种平台，并提供了一个图形用户界面，使得非生物信息学专业的研究人员也能进行数据处理 | NA | 开发一种通用的单细胞RNA测序数据处理工具，以简化数据处理过程 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA |
| 167 | 2024-08-08 |
Droplet Microfluidics Enables Tracing of Target Cells at the Single-Cell Transcriptome Resolution
2022-Nov-10, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering9110674
PMID:36354585
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研究论文 | 本文开发了一种基于液滴微流控技术的全液滴方法，用于TCR-T细胞的监测，实现了从液滴筛选到单细胞转录组测序的一体化流程 | 本文提出的全液滴方法避免了传统方法中液滴破乳和重新封装的繁琐操作，提高了操作的便捷性和芯片的市场化进程 | NA | 开发一种高效、便捷的单细胞转录组测序技术，用于监测TCR-T细胞，推动过继性T细胞免疫治疗的发展 | TCR-T细胞 | 生物技术 | NA | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | TCR-T细胞 |
| 168 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals cellular heterogeneity and molecular stratification of cervical cancer
2022-11-10, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-04142-w
PMID:36357663
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了宫颈癌的细胞异质性和分子分层 | 首次揭示了宫颈癌细胞的广泛异质性，并识别了不同亚型的宫颈癌及其预后特征 | NA | 探究宫颈癌的细胞异质性和分子分层，为精准预后和治疗分层提供基础 | 宫颈癌及其配对的正常邻近非肿瘤样本 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 57,669个细胞，来自三个宫颈癌肿瘤及其配对的正常邻近非肿瘤样本 |
| 169 | 2024-08-08 |
Pan-cancer analysis of UBE2T with a focus on prognostic and immunological roles in lung adenocarcinoma
2022-Nov-10, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-022-02226-z
PMID:36357897
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研究论文 | 本文通过分析UBE2T在33种肿瘤类型中的表达及其对预后的影响，探讨了其在肺癌腺癌中的功能和免疫学作用 | 首次进行了UBE2T在泛癌中的功能、预后和预测意义的分析 | NA | 研究UBE2T在多种癌症中的作用及其对预后和免疫治疗反应的预测价值 | UBE2T基因在泛癌中的表达及其对肺癌腺癌预后和免疫学影响 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | LASSO Cox回归模型 | 基因表达数据 | 33种肿瘤类型的数据，以及TCGA和ICGC数据库中的肺癌腺癌患者数据 |
| 170 | 2024-08-08 |
Dysregulation of neuroprotective astrocytes, a spectrum of microglial activation states, and altered hippocampal neurogenesis are revealed by single-cell RNA sequencing in prion disease
2022-11-09, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-022-01450-4
PMID:36352465
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，分析了感染朊病毒并出现临床症状的小鼠大脑皮层和海马区的单细胞转录组图谱，揭示了神经保护性星形胶质细胞的失调、微胶质细胞激活状态的多样性以及海马神经发生的变化。 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了朊病毒疾病中大脑细胞类型及其亚型的转录特征，特别是星形胶质细胞和微胶质细胞的功能变化。 | 研究仅限于小鼠模型，可能需要进一步的人体研究来验证这些发现。 | 旨在通过单细胞RNA测序技术深入理解朊病毒疾病中的细胞互作和神经退行性变的机制。 | 感染朊病毒的小鼠大脑皮层和海马区的单细胞转录组。 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 转录组 | 147,536个单细胞转录组 |
| 171 | 2024-08-08 |
Single cell sequencing reveals that CD39 inhibition mediates changes to the tumor microenvironment
2022-11-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-34495-z
PMID:36347860
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术分析，发现CD39抑制剂能改变膀胱癌的肿瘤微环境，从而限制肿瘤生长并提高携带肿瘤小鼠的总体生存率 | 首次通过单细胞转录组分析确定CD39为膀胱癌的治疗靶点，并发现CD39抑制剂能增加肿瘤内NK细胞、cDC1和CD8+ T细胞的数量，减少Treg细胞的数量 | 研究未探讨CD39抑制剂与其他免疫检查点抑制剂联合使用的协同效应 | 探索CD39作为膀胱癌免疫治疗新靶点的潜力 | 膀胱癌及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及皮下肿瘤模型和原位膀胱癌模型中的小鼠样本 |
| 172 | 2024-08-08 |
Laying the foundation for single-cell studies in bats
2022-11-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2022.10.010
PMID:36351371
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学技术研究了Eonycteris spelaea蝙蝠肺组织中的免疫细胞谱，揭示了Pteropine orthoreovirus (PRV3M)感染后的体内免疫反应 | 首次在蝙蝠中应用单细胞转录组学技术，为未来比较免疫学研究提供了范例 | NA | 探索蝙蝠作为病毒宿主的免疫反应机制 | Eonycteris spelaea蝙蝠肺组织中的免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 173 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis of the in vivo response to viral infection in the cave nectar bat Eonycteris spelaea
2022-11-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2022.10.008
PMID:36351376
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术分析了洞果蝠在体内感染双链RNA病毒后的免疫反应 | 首次详细描述了洞果蝠在病毒感染后肺部免疫细胞的动态变化及其分子机制 | NA | 探究洞果蝠在病毒感染后的免疫反应机制 | 洞果蝠的肺部免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 174 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome profiling and chromatin accessibility reveal an exhausted regulatory CD4+ T cell subset in systemic lupus erythematosus
2022-11-08, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111606
PMID:36351407
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研究论文 | 本研究通过ATAC-seq和单细胞转录组测序技术，分析了系统性红斑狼疮（SLE）患者和健康对照者的外周CD4 T细胞的异质性，揭示了Treg细胞的转录功能障碍及其与疾病严重性的关联。 | 本研究首次揭示了SLE患者中具有功能性衰竭特征的CCR7CD74 Treg亚群，为理解SLE的发病机制提供了新的视角。 | NA | 探索系统性红斑狼疮（SLE）中CD4 T细胞的调控组异质性及其与疾病发生的关系。 | 系统性红斑狼疮（SLE）患者和健康对照者的外周CD4 T细胞。 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | ATAC-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 72名SLE患者和30名健康对照者的外周CD4 T细胞 |
| 175 | 2024-08-08 |
Progesterone Promotes In Vitro Maturation of Domestic Dog Oocytes Leading to Successful Live Births
2022-Nov-03, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life12111778
PMID:36362933
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研究论文 | 本研究探讨了孕酮在体外成熟犬卵母细胞中的作用，并通过优化体外成熟系统成功获得了活体犬。 | 首次通过添加孕酮优化犬卵母细胞的体外成熟系统，成功获得活体犬，并建立了一种新的低成本犬只生产方法。 | NA | 研究孕酮在犬卵母细胞体外成熟中的作用，并优化体外成熟系统以提高效率和降低成本。 | 犬卵母细胞的体外成熟及其质量评估。 | 生物医学研究 | NA | 体外受精和单细胞RNA测序 | NA | 卵母细胞 | 使用了不同孕酮浓度的微滴培养的犬卵母细胞 |
| 176 | 2024-08-08 |
Gonadal Sex Differentiation and Ovarian Organogenesis along the Cortical-Medullary Axis in Mammals
2022-Nov-02, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms232113373
PMID:36362161
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综述 | 本文综述了哺乳动物沿着皮质-髓质轴的性腺性别分化和卵巢器官发生的机制 | 揭示了支持细胞系的双波增殖及其在性腺性别分化早期阶段和围产期阶段的形成过程中的细胞和分子事件 | NA | 探讨性腺性别分化沿着皮质-髓质轴的机制，并比较不同哺乳动物卵巢皮质和髓质区域的特征 | 哺乳动物的性腺性别分化和卵巢器官发生 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组 | NA |
| 177 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptomics with light barcodes in intact tissues
2022-11, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01577-8
PMID:36347989
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 178 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq relates GWAS variants to disease risk
2022-11, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01570-1
PMID:36347991
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 179 | 2024-08-08 |
Cross-protection against African swine fever virus upon intranasal vaccination is associated with an adaptive-innate immune crosstalk
2022-11, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1010931
PMID:36350837
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研究论文 | 本研究探讨了通过鼻内疫苗接种非洲猪瘟病毒（ASFV）后诱导的免疫反应及其对病毒的交叉保护作用 | 首次详细描述了鼻内接种BA71ΔCD2突变病毒后，从适应性免疫到先天免疫的正反馈机制，以及这种机制如何促进对ASFV的交叉保护 | NA | 研究非洲猪瘟病毒的免疫保护机制，为开发有效疫苗提供理论基础 | 非洲猪瘟病毒及接种疫苗后的猪免疫细胞反应 | NA | 非洲猪瘟 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 接种疫苗的猪的血液和淋巴结细胞 |
| 180 | 2024-08-08 |
A spatiotemporally resolved single-cell atlas of the Plasmodium liver stage
2022-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-05406-5
PMID:36352220
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序和单分子转录成像技术，研究了鼠疟原虫在肝脏阶段与宿主肝细胞的时空表达程序 | 首次揭示了肝细胞分区对寄生虫分子水平发育的影响，并识别了不同区域中寄生虫基因表达的差异 | NA | 旨在深入理解疟原虫肝脏阶段的感染机制 | 鼠疟原虫Plasmodium berghei ANKA及其宿主肝细胞 | 数字病理学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序，单分子转录成像 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未明确提及 |