单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 320 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2024-08-08 |
A Myb enhancer-guided analysis of basophil and mast cell differentiation
2022-11-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-34906-1
PMID:36400777
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研究论文 | 本文通过分析Myb基因的-68增强子，揭示了其在嗜碱性粒细胞和肥大细胞分化中的作用 | 首次识别了Myb基因的-68增强子，并展示了其如何标记嗜碱性粒细胞和肥大细胞，以及如何通过单细胞RNA测序揭示这些细胞的分化轨迹 | NA | 深入理解MYB表达在细胞系相关方式中的调控机制 | Myb基因的-68增强子在嗜碱性粒细胞和肥大细胞分化中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 142 | 2024-08-08 |
SIGIRR deficiency contributes to CD4 T cell abnormalities by facilitating the IL1/C/EBPβ/TNF-α signaling axis in rheumatoid arthritis
2022-11-18, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-022-00563-9
PMID:36401167
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研究论文 | 本研究探讨了SIGIRR在类风湿关节炎中对记忆CD4 T细胞的作用及其分子机制 | 首次揭示了SIGIRR通过调控IL-1/C/EBPβ/TNF-α信号轴在类风湿关节炎中对记忆CD4 T细胞的影响 | NA | 研究SIGIRR在类风湿关节炎中对记忆CD4 T细胞的作用及其分子机制 | SIGIRR在记忆CD4 T细胞中的分布和表达，以及其对类风湿关节炎疾病活动的影响 | 免疫学 | 类风湿关节炎 | 单细胞转录组学、批量RNA测序、流式细胞术 | NA | RNA | 健康人群和类风湿关节炎患者的记忆CD4 T细胞，以及AIA小鼠模型 |
| 143 | 2024-08-08 |
Integrating Single-cell RNA-seq to construct a Neutrophil prognostic model for predicting immune responses in non-small cell lung cancer
2022-11-18, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-022-03723-x
PMID:36401283
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据构建了一个针对非小细胞肺癌中中性粒细胞的预后模型，以预测患者的免疫反应和预后 | 首次构建了基于中性粒细胞分化相关基因的预后风险模型，并成功预测了患者的总生存时间和免疫治疗反应 | NA | 探索非小细胞肺癌免疫微环境中的复杂通讯网络，明确免疫细胞与肿瘤之间的相互作用 | 非小细胞肺癌中的中性粒细胞及其在免疫反应中的作用 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | Elastic Net和多元Cox回归模型 | RNA序列数据 | 分析了来自非小细胞肺癌样本的28个主要细胞集群 |
| 144 | 2024-08-08 |
Systematic investigation of imprinted gene expression and enrichment in the mouse brain explored at single-cell resolution
2022-Nov-17, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-022-08986-8
PMID:36384442
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据，系统研究了小鼠大脑中印记基因的表达和富集情况 | 首次正式测试了印记基因在大脑中的过度表达，并确定了特定脑区和神经元亚群中的富集情况 | NA | 探讨印记基因在大脑中的表达和富集情况，以及其对神经系统和行为的影响 | 小鼠大脑中的印记基因 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 13个单细胞RNA测序数据集 |
| 145 | 2024-08-08 |
Prescreening of tumor samples for tumor-centric transcriptome analyses of lung adenocarcinoma
2022-Nov-17, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-022-10317-9
PMID:36397035
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研究论文 | 本文开发了一种针对肺腺癌的肿瘤细胞预筛选策略，以确保在单细胞RNA测序分析中包含肿瘤细胞 | 提出了使用CEACAM5和HMGB3作为基于RT-PCR的预筛选标记物，以促进肺腺癌的肿瘤中心单细胞RNA测序分析 | NA | 开发一种预筛选策略，以确保在肿瘤中心的单细胞RNA测序分析中包含肿瘤细胞 | 肺腺癌的肿瘤细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | 使用了肺癌细胞系、正常与肺癌组织以及有无转移的淋巴结活检样本 |
| 146 | 2024-08-08 |
Innate immune imprints in SARS-CoV-2 Omicron variant infection convalescents
2022-11-16, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-022-01237-y
PMID:36379915
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序、表面蛋白质组分析和血浆细胞因子定量，描绘了SARS-CoV-2 Omicron变异株感染康复者的先天免疫景观 | 首次详细描述了Omicron感染康复者中免疫细胞的印迹特征，包括单核细胞反应和细胞因子响应 | NA | 探究SARS-CoV-2 Omicron变异株感染康复者的先天免疫印迹特征 | SARS-CoV-2 Omicron变异株感染康复者的免疫细胞和细胞因子 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序，表面蛋白质组分析，细胞因子定量 | NA | 细胞和分子数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 147 | 2024-08-08 |
Mechanisms of cooperative cell-cell interactions in skeletal muscle regeneration
2022-Nov-16, Inflammation and regeneration
IF:5.0Q1
DOI:10.1186/s41232-022-00234-6
PMID:36380396
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综述 | 本文综述了骨骼肌再生过程中细胞间相互作用的机制，特别关注骨骼肌干细胞的作用 | 利用单细胞测序技术识别了与肌肉再生相关的新细胞亚群及其调控机制 | NA | 探讨骨骼肌再生过程中细胞间相互作用的机制 | 骨骼肌干细胞、免疫细胞、成纤维脂肪祖细胞和血管内皮细胞 | NA | NA | 单细胞测序技术 | NA | 细胞数据 | NA |
| 148 | 2024-08-08 |
Ascertaining cells' synaptic connections and RNA expression simultaneously with barcoded rabies virus libraries
2022-11-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-34334-1
PMID:36384944
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SBARRO的方法，利用单细胞RNA测序揭示基于条形码狂犬病毒路径的单突触关系，并描述了体外多种小鼠脑细胞类型的突触网络 | SBARRO方法能够同时确定细胞的突触连接和RNA表达，通过追踪个体狂犬病毒克隆在细胞间的传播，为神经回路的突触组织提供了新的研究机会 | NA | 开发一种新方法来系统描述突触网络及其分子特性 | 小鼠脑细胞类型的突触网络及其分子特性 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 数千个突触关系 |
| 149 | 2024-08-08 |
Differential effects of periodontal microbiome on the rheumatoid factor induction during rheumatoid arthritis pathogenesis
2022-11-16, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-21788-y
PMID:36385263
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研究论文 | 本研究探讨了牙周微生物群在类风湿关节炎发病过程中对类风湿因子诱导的影响 | 首次通过16S rRNA测序和单细胞RNA测序分析，揭示了不同牙周细菌种类对类风湿因子诱导的差异性影响 | 研究主要集中在小鼠模型和临床患者的牙周微生物群分析，未来需进一步验证在更广泛人群中的适用性 | 探究牙周微生物群与类风湿因子在类风湿关节炎发病中的关系 | 类风湿关节炎患者和胶原诱导关节炎小鼠的牙周微生物群及类风湿因子状态 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 16S rRNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 微生物群数据, 基因表达数据 | 包括类风湿关节炎患者和胶原诱导关节炎小鼠的样本 |
| 150 | 2024-08-08 |
Tissue-specific transcriptional profiles and heterogeneity of natural killer cells and group 1 innate lymphoid cells
2022-11-15, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2022.100812
PMID:36384102
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和CITE-seq技术探讨了自然杀伤细胞（NK细胞）和第1型先天淋巴细胞（ILC1s）在不同组织中的异质性 | 首次揭示了NK细胞和ILC1s在不同组织中的转录特征和异质性，并鉴定了区分这些细胞亚群的关键基因 | NA | 探索NK细胞和ILC1s在不同组织中的异质性及其转录特征 | 自然杀伤细胞（NK细胞）和第1型先天淋巴细胞（ILC1s） | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序，CITE-seq | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 151 | 2024-08-08 |
CD8+ T cell metabolic rewiring defined by scRNA-seq identifies a critical role of ASNS expression dynamics in T cell differentiation
2022-11-15, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111639
PMID:36384124
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了CD8 T细胞在体外激活和分化过程中的代谢重编程，并发现ASNS表达动态在T细胞分化中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了CD8 T细胞在激活和分化过程中对非必需氨基酸合成与摄取的依赖性变化，并发现ASNS表达动态对T细胞分化的调控作用 | NA | 研究CD8 T细胞在免疫应答中的代谢重编程及其对T细胞分化的影响 | CD8 T细胞的代谢重编程和ASNS表达动态 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 152 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of multiple myelomas refines the molecular features of bortezomib treatment responsiveness
2022-11, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-022-00884-z
PMID:36380017
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究多发性骨髓瘤患者骨髓抽吸物，分析博来霉素治疗反应的分子特征 | 使用单细胞RNA测序技术识别了与博来霉素反应相关的细胞类型和基因网络，并建立了一个结合临床变量和基因表达的模型来预测治疗反应 | 研究样本量相对较小，且未涵盖所有可能的细胞类型和基因表达模式 | 探索多发性骨髓瘤中博来霉素治疗反应的分子机制 | 多发性骨髓瘤患者的骨髓抽吸物中的肿瘤细胞和肿瘤微环境细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 18名未经治疗的多发性骨髓瘤患者 |
| 153 | 2024-08-08 |
Effect of the intratumoral microbiota on spatial and cellular heterogeneity in cancer
2022-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-05435-0
PMID:36385528
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研究论文 | 本文通过应用原位空间分析技术和单细胞RNA测序，揭示了口腔鳞状细胞癌和结直肠癌中肿瘤内微生物群的空间、细胞和分子相互作用 | 开发了一种名为INVADEseq的单细胞RNA测序方法，并首次展示了细菌群落占据的微环境与恶性细胞的关联 | NA | 研究肿瘤内微生物群对肿瘤空间和细胞异质性的影响 | 口腔鳞状细胞癌和结直肠癌中的肿瘤内微生物群及其与宿主细胞的相互作用 | 数字病理学 | 口腔癌，结直肠癌 | 10x Visium空间转录组学，GeoMx数字空间分析，单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 患者肿瘤样本 |
| 154 | 2024-08-08 |
Human striatal organoids derived from pluripotent stem cells recapitulate striatal development and compartments
2022-11, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3001868
PMID:36395338
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研究论文 | 本文开发了一种从人类多能干细胞构建人纹状体类器官的方法，这些类器官能够部分复制胎儿纹状体的发育并形成纹状体和基质样隔间。 | 首次成功从人类多能干细胞中构建出能够复制胎儿纹状体发育的人纹状体类器官，并展示了其在神经电路研究和治疗策略测试中的应用潜力。 | NA | 解码与纹状体相关的神经疾病的发病机制并开发治疗策略。 | 人纹状体类器官及其在神经电路和治疗策略研究中的应用。 | NA | 神经疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 类器官 | NA |
| 155 | 2024-08-08 |
How is spatial transcriptomics influencing cancer research and diagnostics?
2022-11, BioTechniques
IF:2.2Q4
DOI:10.2144/btn-2022-0111
PMID:36398881
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研究论文 | 本文探讨了空间转录组学在肿瘤生物学和诊断研究中的应用 | 空间转录组学自2016年开发以来，其受欢迎程度持续上升 | NA | 研究空间转录组学在癌症研究和诊断中的影响 | 空间转录组学在肿瘤生物学和诊断研究中的应用 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 156 | 2024-08-08 |
Single-cell profiling of vascular endothelial cells reveals progressive organ-specific vulnerabilities during obesity
2022-11, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-022-00674-x
PMID:36400935
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了肥胖不同阶段雄性小鼠七个器官的约375,000个血管内皮细胞的转录组，揭示了肥胖对内皮细胞的器官特异性影响 | 首次揭示了肥胖对不同器官内皮细胞亚型的特异性影响，并发现肥胖诱导的转录组异常在持续肥胖中加剧，且部分可通过饮食干预和体重减轻缓解 | 研究仅限于雄性小鼠，且未探讨性别差异对结果的影响 | 探究肥胖对不同器官内皮细胞的影响及其潜在的器官特异性脆弱性 | 肥胖不同阶段雄性小鼠的七个器官内皮细胞 | 数字病理学 | 肥胖 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 约375,000个内皮细胞 |
| 157 | 2024-08-08 |
Polony gels enable amplifiable DNA stamping and spatial transcriptomics of chronic pain
2022-11-23, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2022.10.021
PMID:36368323
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研究论文 | 本文介绍了一种大规模可扩展的印章方法，用于制造含有独特条形码的约1微米克隆DNA集群的聚合物凝胶阵列，并利用这些凝胶开发了一种名为Pixel-seq的单细胞空间转录组测定法，应用于小鼠的旁臂核并分析了神经性疼痛调节的转录组和细胞间通信的变化。 | 提出了一种新的聚合物凝胶印章方法，相比依赖测序的阵列制造方法，成本降低了至少35倍，时间缩短至约7小时。 | NA | 开发一种成本效益高、通量大的方法来获取复杂组织中空间解析的组学数据。 | 小鼠的旁臂核组织，以及神经性疼痛调节的转录组和细胞间通信。 | 分子生物学 | 神经性疼痛 | 聚合物凝胶印章技术 | NA | 转录组数据 | 小鼠的旁臂核组织样本 |
| 158 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing unveils key contributions of immune cell populations in cancer-associated adipose wasting
2022-Nov-15, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-022-00466-3
PMID:36376273
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术，揭示了癌症相关恶病质（CAC）中脂肪组织损失的免疫细胞群体的关键作用 | 首次全面分析了CAC患者和非CAC患者的白色脂肪组织中的间质血管部分细胞组成，并发现了脂肪前体细胞和免疫细胞的库房特异性和疾病特异性集群及发育轨迹 | NA | 揭示癌症相关恶病质中慢性炎症和脂肪消耗的因果机制 | 癌症相关恶病质患者的白色脂肪组织中的免疫细胞和脂肪前体细胞 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | CAC患者和非CAC患者的白色脂肪组织样本 |
| 159 | 2024-08-08 |
AQP5 complements LGR5 to determine the fates of gastric cancer stem cells through regulating ULK1 ubiquitination
2022-Nov-14, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-022-02532-w
PMID:36372898
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研究论文 | 本文通过单细胞测序和多种生物技术手段，研究了AQP5作为胃癌干细胞（GC-CSCs）的特定表面标记物，并探讨了AQP5与LGR5共同调控GC-CSCs恶性生物功能及其机制。 | 首次报道AQP5作为GC-CSCs的特定表面标记物，并揭示了AQP5通过诱导ULK1的K63介导的泛素化来激活自噬的机制。 | NA | 旨在识别和验证胃癌干细胞的特定表面标记物，并探讨其生物学功能和分子机制。 | 胃癌干细胞及其表面标记物AQP5和LGR5。 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序、转录组测序、蛋白质组检测、质谱分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | 来自胃癌患者的细胞样本 |
| 160 | 2024-08-08 |
Region-specific denoising identifies spatial co-expression patterns and intra-tissue heterogeneity in spatially resolved transcriptomics data
2022-11-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-34567-0
PMID:36376296
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研究论文 | 本文开发了一种计算工具MIST，用于检测分子区域并进行基于区域的缺失值插补，以分析空间转录组学数据 | MIST工具能够准确恢复空间转录组学中的缺失值，并有助于识别组织内部的异质性和恢复空间基因共表达信号 | NA | 开发和验证一种新的计算工具，用于分析空间转录组学数据中的分子区域和缺失值插补 | 空间转录组学数据中的分子区域和缺失值 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 多个由10x Visium空间转录组学生成的数据集 |