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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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121 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-sequencing data analysis reveals a highly correlated triphasic transcriptional response to SARS-CoV-2 infection
2022-11-27, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-04253-4
PMID:36435849
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了SARS-CoV-2感染后的人支气管上皮细胞和结肠及回肠类器官的转录反应 | 揭示了SARS-CoV-2感染后转录反应的非线性模式,包括初始和最终的下调阶段以及中间的上调阶段 | NA | 研究SARS-CoV-2感染后的转录反应机制 | 人支气管上皮细胞和结肠及回肠类器官 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 数千个细胞 |
122 | 2024-08-08 |
Identification of molecular classification and gene signature for predicting prognosis and immunotherapy response in HNSCC using cell differentiation trajectories
2022-11-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-24533-7
PMID:36437265
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研究论文 | 本文旨在探讨细胞分化轨迹在头颈鳞状细胞癌(HNSCC)中的临床意义,通过共识聚类分析识别不同的分子亚型,并基于分化相关基因(DRGs)开发预测HNSCC患者预后的风险模型。 | 本文通过细胞分化轨迹识别了不同的分子亚型,并构建了一个基于差异表达预后DRGs的新型签名,能够预测患者的预后和免疫治疗反应。 | NA | 探索细胞分化轨迹在HNSCC中的临床意义,并开发预测患者预后和免疫治疗反应的分子分类和基因签名。 | 头颈鳞状细胞癌(HNSCC)患者及其分子亚型和预后预测。 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),共识聚类分析,加权相关网络分析(WGCNA),Cox回归分析 | NA | RNA序列数据 | NA |
123 | 2024-08-08 |
Bi-potential hPSC-derived Müllerian duct-like cells for full-thickness and functional endometrium regeneration
2022-Nov-23, NPJ Regenerative medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41536-022-00263-2
PMID:36418304
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研究论文 | 研究首次通过有效协议生成人多能干细胞衍生的Müllerian管样细胞,这些细胞能够分化为子宫内膜上皮和基质细胞,并在体内外重建全层子宫内膜 | 本研究首次生成了人多能干细胞衍生的Müllerian管样细胞,这些细胞具有双向分化潜能,能够重建全层子宫内膜,并显示出在体内修复子宫内膜结构和恢复妊娠功能的能力 | NA | 开发基于干细胞的组织再生策略,用于治疗严重的子宫内膜损伤 | 人多能干细胞衍生的Müllerian管样细胞及其在子宫内膜再生中的应用 | NA | 子宫内膜损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
124 | 2024-08-08 |
Establishment of an ovarian cancer omentum metastasis-related prognostic model by integrated analysis of scRNA-seq and bulk RNA-seq
2022-Nov-23, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-022-01059-0
PMID:36424614
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研究论文 | 本文通过综合分析单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA测序(bulk RNA-seq)数据,建立了一个与卵巢癌网膜转移相关的预后模型。 | 首次在单细胞水平上分析卵巢癌网膜转移,探索和理解细胞功能和遗传水平的网膜转移及预后。 | NA | 建立一个与卵巢癌网膜转移相关的预后模型,并分析这些基因在卵巢癌网膜转移中的潜在机制。 | 卵巢癌网膜转移的细胞类型、分化轨迹、肿瘤微环境及免疫浸润。 | 数字病理学 | 卵巢癌 | scRNA-seq, bulk RNA-seq | LASSO, Cox回归 | 基因表达数据 | 9885个细胞来自6名患者,GSE132342数据集包含3769名患者,TCGA-OV数据集包含379名患者。 |
125 | 2024-08-08 |
How vascular smooth muscle cell phenotype switching contributes to vascular disease
2022-11-21, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-022-00993-2
PMID:36411459
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综述 | 本文综述了血管平滑肌细胞(VSMCs)在血管疾病中的表型转换及其分子机制和功能角色 | 近年来,由于单细胞测序和细胞谱系追踪技术的快速发展,揭示了多种VSMCs表型在血管老化、动脉粥样硬化(AS)和主动脉瘤(AA)中的存在 | NA | 探讨VSMCs表型转换在血管老化、AS和AA中的分子机制及其贡献 | 血管平滑肌细胞的表型转换及其在血管疾病中的作用 | NA | 心血管疾病 | 单细胞测序、细胞谱系追踪 | NA | NA | NA |
126 | 2024-08-08 |
Comprehensive Analysis of Cuproptosis-Related Genes in Prognosis and Immune Infiltration of Hepatocellular Carcinoma Based on Bulk and Single-Cell RNA Sequencing Data
2022-Nov-21, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14225713
PMID:36428805
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研究论文 | 本研究通过大量和单细胞RNA测序数据,构建了一个基于铜死亡相关基因(CRGs)的多基因签名模型,用于预测肝细胞癌(HCC)的预后和免疫浸润特征 | 首次综合分析了CRGs在HCC中的预后潜力和肿瘤免疫微环境(TIME)特征 | NA | 研究CRGs在HCC中的预后价值和免疫微环境特征 | 肝细胞癌(HCC)中的铜死亡相关基因(CRGs) | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA测序 | LASSO Cox回归分析 | RNA测序数据 | 两个队列的数据用于验证 |
127 | 2024-08-08 |
The Molecular Signature of Human Testicular Peritubular Cells Revealed by Single-Cell Analysis
2022-11-19, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11223685
PMID:36429113
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了人类睾丸间质细胞的分子特征 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了人类睾丸间质细胞的分子特征,并识别了四种细胞状态,发现了一些未知功能,如产生视黄酸的能力 | 文中提到体外和体内表达基因的微小差异可能是由于细胞可塑性,但未深入探讨 | 定义和研究人类睾丸间质细胞的特征和功能 | 人类睾丸间质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 从正常精子发生供体的睾丸样本中分离出的培养的人类睾丸间质细胞 |
128 | 2024-08-08 |
Novel Insights into the Sinoatrial Node in Single-Cell RNA Sequencing: From Developmental Biology to Physiological Function
2022-Nov-18, Journal of cardiovascular development and disease
IF:2.4Q2
DOI:10.3390/jcdd9110402
PMID:36421937
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在窦房结发育生物学和生理功能研究中的应用 | 利用单细胞RNA测序技术深入解析窦房结的细胞表型异质性和分子调控机制 | 目前仍面临生成窦房结样起搏细胞以用于生物起搏器的挑战 | 探讨窦房结的结构、发育和功能相关的关键转录网络,以及生物起搏器的潜在未来方向 | 窦房结及其相关起搏细胞的发育和功能 | 发育生物学 | 心脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
129 | 2024-08-08 |
Identification of CD73 as a Novel Biomarker Encompassing the Tumor Microenvironment, Prognosis, and Therapeutic Responses in Various Cancers
2022-Nov-17, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14225663
PMID:36428755
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研究论文 | 本文全面证实了CD73在泛癌肿瘤微环境中的癌免疫学特性,并探讨了其在癌症中的表达模式、突变特征、预后价值、肿瘤免疫浸润及免疫治疗反应 | 首次全面证实CD73在泛癌肿瘤微环境中的癌免疫学特性,并通过多种计算工具探索其在癌症中的多方面作用 | CD73促进肿瘤生长的具体机制仍未完全明确 | 探索CD73在泛癌中的作用及其作为生物标志物的潜力 | CD73在肿瘤微环境中的表达、突变、预后、免疫浸润及治疗反应 | 数字病理学 | 泛癌 | 多重免疫荧光染色、单细胞测序算法 | NA | 组织微阵列数据 | 连续的癌症患者队列 |
130 | 2024-08-08 |
Impact of Siponimod on Enteric and Central Nervous System Pathology in Late-Stage Experimental Autoimmune Encephalomyelitis
2022-Nov-17, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms232214209
PMID:36430692
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研究论文 | 研究了siponimod对晚期实验性自身免疫性脑脊髓炎模型中肠神经系统和中枢神经系统病理的影响 | 首次探讨了siponimod对肠神经系统和中枢神经系统的影响,并使用单细胞RNA测序分析了其对脊髓星形胶质细胞和室管膜细胞的炎症基因表达的影响 | 研究未发现siponimod和fingolimod在中枢神经系统和肠神经系统病理和超微结构病理方面的显著差异 | 探讨siponimod在晚期实验性自身免疫性脑脊髓炎模型中对肠神经系统和中枢神经系统的作用 | siponimod对肠神经系统和中枢神经系统的影响 | NA | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA表达 | 晚期疾病的小鼠模型 |
131 | 2024-08-08 |
Cascade Forest-Based Model for Prediction of RNA Velocity
2022-Nov-15, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules27227873
PMID:36431973
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研究论文 | 本文开发了一种基于级联森林的模型用于预测RNA速度 | 本文提出的级联森林模型在预测RNA速度方面优于其他流行的集成分类器,如XGBoost、RandomForest、LightGBM、NGBoost和TabNet | NA | 预测基于单细胞基因表达数据的RNA速度向量 | 单细胞RNA测序数据中的RNA速度 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序技术(scRNA-seq) | 级联森林模型 | 基因表达数据 | NA |
132 | 2024-08-08 |
Midpalatal Suture: Single-Cell RNA-Seq Reveals Intramembrane Ossification and Piezo2 Chondrogenic Mesenchymal Cell Involvement
2022-11-12, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11223585
PMID:36429014
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索中腭缝的膜内骨化机制及Piezo2软骨生成间充质细胞的作用 | 发现了与机械和外部刺激检测相关的Piezo2表达的软骨生成间充质细胞,为中腭缝为何到成年才闭合提供了潜在的分子和细胞机制 | NA | 创建小鼠中腭缝区域的膜内成骨模型,并探索其成熟和骨化过程的机制 | 中腭缝的膜内骨化和Piezo2软骨生成间充质细胞的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠中腭缝区域的细胞 |
133 | 2024-08-08 |
Identification of Factors Driving Doxorubicin-Resistant Ewing Tumor Cells to Survival
2022-Nov-09, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14225498
PMID:36428591
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和LC-MS/MS定量蛋白质组学技术,探讨了影响多柔比星耐药的尤文肉瘤细胞生存的关键因素 | 本研究首次揭示了尤文肉瘤细胞对多柔比星耐药性的特定转录调控机制,并识别了与肿瘤细胞耐药性和逃避治疗相关的关键蛋白质 | NA | 旨在识别影响尤文肉瘤细胞对多柔比星耐药性的关键蛋白质,以揭示肿瘤复发或转移的机制 | 尤文肉瘤细胞及其对多柔比星的耐药性 | 数字病理学 | 尤文肉瘤 | 单细胞RNA测序,LC-MS/MS | NA | 基因表达数据,蛋白质组数据 | 涉及胚胎成纤维细胞和多柔比星处理及未处理的肿瘤细胞系 |
134 | 2024-08-08 |
Immune Transcriptome Study of Human Nucleated Erythroid Cells from Different Tissues by Single-Cell RNA-Sequencing
2022-11-09, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11223537
PMID:36428967
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了来自成人骨髓、脐带血和胎肝实质的核红细胞的免疫转录组 | 首次揭示了不同组织来源的核红细胞在免疫抑制相关基因表达上的差异 | NA | 研究核红细胞在不同组织中的免疫功能 | 核红细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自成人骨髓、脐带血和胎肝实质的核红细胞 |
135 | 2024-08-08 |
Clinical Implications and Molecular Characterization of Drebrin-Positive, Tumor-Infiltrating Exhausted T Cells in Lung Cancer
2022-Nov-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms232213723
PMID:36430217
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研究论文 | 本研究评估了34例病理分期为I-IIIA的鳞状细胞肺癌手术标本中表达drebrin的肿瘤浸润淋巴细胞(TILs)的临床意义和分子特征 | 首次探讨了表达drebrin的肿瘤浸润淋巴细胞在肺癌中的临床意义和分子特征 | 研究样本量有限,仅包括34例手术标本 | 探讨表达drebrin的肿瘤浸润淋巴细胞在肺癌中的临床意义和分子特征 | 表达drebrin的肿瘤浸润淋巴细胞及其在肺癌中的作用 | 数字病理学 | 肺癌 | 荧光多重免疫组织化学, 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | 34例手术标本 |
136 | 2024-08-08 |
Identification and Isolation of Burst-Forming Unit and Colony-Forming Unit Erythroid Progenitors from Mouse Tissue by Flow Cytometry
2022-11-04, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/64373
PMID:36408979
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研究论文 | 本文通过分析小鼠骨髓的单细胞RNA测序数据,开发了一种新的流式细胞术方法,用于直接前瞻性和完整地分离纯化的小鼠骨髓或脾脏中的BFU-e和CFU-e红系祖细胞。 | 本文首次开发了一种新的流式细胞术方法,能够直接前瞻性和完整地分离纯化的小鼠骨髓或脾脏中的BFU-e和CFU-e红系祖细胞,并识别其他祖细胞亚群。 | NA | 开发一种新的流式细胞术方法,用于直接前瞻性和完整地分离纯化的小鼠骨髓或脾脏中的BFU-e和CFU-e红系祖细胞。 | 小鼠骨髓或脾脏中的BFU-e和CFU-e红系祖细胞及其他祖细胞亚群。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | NA | 基因表达数据 | 小鼠骨髓或脾脏细胞 |
137 | 2024-08-08 |
Re-exploring tissue regeneration by novel spatial transcriptomics technologies
2022-11, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1127
PMID:36424769
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
138 | 2024-08-08 |
Delineating the dynamic evolution from preneoplasia to invasive lung adenocarcinoma by integrating single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics
2022-11, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-022-00896-9
PMID:36434043
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研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,研究了肺腺癌从原位腺癌到微小浸润性腺癌再到浸润性腺癌的动态演变过程 | 首次揭示了肺腺癌从原位腺癌到浸润性腺癌过程中细胞亚群的变化及其空间分布特征 | NA | 阐明肺腺癌从原位腺癌到浸润性腺癌的细胞生态和空间微环境 | 肺腺癌的细胞亚群及其在疾病进展中的变化 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和空间转录组学(ST) | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
139 | 2024-08-08 |
Integrative analysis of multiomics data identifies selenium-related gene ALAD associating with keshan disease
2022-11-20, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 本文通过综合分析多组学数据,发现与克山病相关的硒相关基因ALAD,并探讨其在克山病发病机制中的作用 | 首次证明硒相关基因ALAD对维持正常线粒体活性至关重要,为克山病的硒缺乏假说提供了强有力的分子证据 | NA | 探究克山病的分子机制及硒相关基因ALAD的作用 | 克山病患者及对照组的多组学数据 | 数字病理学 | 克山病 | 全外显子测序 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据 | 68名克山病患者和100名对照组 |
140 | 2024-08-08 |
Characteristics of lymphocyte subset alterations in COVID-19 patients with different levels of disease severity
2022-11-19, Virology journal
IF:4.0Q2
DOI:10.1186/s12985-022-01926-8
PMID:36403042
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研究论文 | 本研究探讨了不同严重程度的COVID-19患者淋巴细胞亚群的变化特征 | 首次详细分析了COVID-19患者中淋巴细胞亚群的变化及其与疾病严重程度的关系 | 研究样本主要集中在武汉火神山医院,可能存在地域性偏差 | 探究COVID-19患者淋巴细胞亚群的变化及其与疾病严重程度的关系 | COVID-19患者的淋巴细胞亚群及其与疾病严重程度的关系 | NA | COVID-19 | 流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 548名住院COVID-19患者和125名住院COVID-19患者的淋巴细胞亚群 |