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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2024-08-07 |
A single-cell analysis reveals tumor heterogeneity and immune environment of acral melanoma
2022-11-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-34877-3
PMID:36433984
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了63,394个细胞,来自5个肢端黑色素瘤和3个皮肤黑色素瘤样本,以探讨肿瘤异质性和免疫环境 | 定义了5个正交功能细胞簇,涉及TGF-beta信号传导、I型干扰素、Wnt信号传导、细胞周期和胆固醇外流信号传导,这些信号与黑色素瘤的良好预后显著相关 | NA | 研究肢端黑色素瘤的肿瘤异质性和免疫环境 | 肢端黑色素瘤和皮肤黑色素瘤样本的细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 63,394个细胞,来自5个肢端黑色素瘤和3个皮肤黑色素瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 102 | 2024-08-07 |
Autophagy-linked plasma and lysosomal membrane protein PLAC8 is a key host factor for SARS-CoV-2 entry into human cells
2022-11-02, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2022110727
PMID:36124427
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研究论文 | 本文通过CRISPR/Cas9基因编辑技术在感染SARS-CoV-2的人类肺癌细胞中进行全基因组功能丧失筛选,揭示了PLAC8和SPNS1作为关键宿主因子影响病毒进入细胞的过程 | 发现了两个新的关键宿主因子PLAC8和SPNS1,并证实它们的功能丧失会损害病毒的进入 | NA | 旨在更好地理解SARS-CoV-2与宿主细胞之间的相互作用,并识别可能用于对抗感染和COVID-19病理的宿主因子 | SARS-CoV-2病毒和人类肺癌细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | CRISPR/Cas9 | NA | RNA-Seq | 八种不同的人类肺癌细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 103 | 2024-08-07 |
Acetyl-Coenzyme A Synthetase 2 Potentiates Macropinocytosis and Muscle Wasting Through Metabolic Reprogramming in Pancreatic Cancer
2022-11, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2022.06.058
PMID:35777482
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研究论文 | 本研究探讨了乙酰辅酶A合成酶2(ACSS2)在胰腺癌中的作用,发现ACSS2通过代谢重编程增强巨胞饮作用并导致肌肉萎缩 | 首次揭示了ACSS2通过激活ZIP4途径促进巨胞饮作用和肌肉萎缩,为胰腺癌提供了额外的营养物质 | NA | 研究ACSS2在胰腺癌中的作用及其对巨胞饮作用和肌肉萎缩的影响 | 胰腺癌患者的样本和基因工程小鼠模型 | 数字病理学 | 胰腺癌 | CRISPR-Cas9系统,单细胞RNA测序,葡聚糖摄取试验,染色质免疫沉淀试验 | NA | 基因表达数据,蛋白质相互作用数据 | 胰腺癌患者样本,基因工程小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 104 | 2024-08-08 |
Sex differences in interindividual gene expression variability across human tissues
2022-Nov, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgac243
PMID:36712323
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研究论文 | 本文分析了GTEx项目中43种组织的RNA-seq数据,研究了基因表达变异性的性别差异及其生物学意义 | 首次系统地探讨了基因表达变异性的性别差异,并发现这些差异与性激素反应、免疫反应等多种生物学功能相关 | NA | 探究性别差异在个体间基因表达变异性中的作用及其生物学和医学意义 | 人类不同组织中的基因表达变异性 | 基因组学 | 甲状腺疾病 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 43种组织 | NA | NA | NA | NA |
| 105 | 2024-08-08 |
Colon-Targeted eNAMPT-Specific Peptide Systems for Treatment of DSS-Induced Acute and Chronic Colitis in Mouse
2022-Nov-30, Antioxidants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antiox11122376
PMID:36552583
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据分析,揭示了NAMPT和CYBB在结肠炎患者和鼠模型中的表达上调,并开发了一种新型重组TK肽rCT-NAMPT,该肽能够靶向结肠并抑制NAMPT与CYBB或TLR4的相互作用,有效减轻DSS诱导的急性和慢性结肠炎。 | 开发了一种新型重组TK肽rCT-NAMPT,该肽具有结肠靶向性并能抑制NAMPT与CYBB或TLR4的相互作用,为结肠炎治疗提供了新的候选药物。 | NA | 研究NAMPT在炎症巨噬细胞中的作用及其在结肠炎治疗中的潜在应用。 | NAMPT和CYBB在结肠炎中的表达及新型重组TK肽rCT-NAMPT的开发与应用。 | NA | 结肠炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 106 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Identifies Master Regulators Affected by Panobinostat in Neuroblastoma Cells
2022-11-29, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13122240
PMID:36553506
|
研究论文 | 本文通过单细胞测序技术研究了泛HDAC抑制剂panobinostat在神经母细胞瘤细胞中的作用,并识别了受其影响的转录调控因子。 | 利用单细胞测序技术在神经母细胞瘤细胞中研究panobinostat的作用,具有前所未有的分辨率。 | NA | 探究panobinostat在神经母细胞瘤细胞中的分子机制和基因调控网络。 | 神经母细胞瘤细胞和panobinostat的作用。 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 107 | 2024-08-08 |
A Dual-Channel Microfluidic Chip for Single Tobacco Protoplast Isolation and Dynamic Capture
2022-Nov-29, Micromachines
IF:3.0Q2
DOI:10.3390/mi13122109
PMID:36557407
|
研究论文 | 本研究设计了一种基于PDMS的双通道微流控芯片,用于单个烟草原生质体的分离和动态捕获 | 本研究提供了一种新的高吞吐量单原生质体研究策略,并为单细胞捕获机制奠定了理论基础 | NA | 研究单个原生质体的分离和捕获,以满足基因功能验证、亚细胞定位和单细胞测序的需求 | 烟草原生质体和聚苯乙烯微球 | 微流控技术 | NA | 微流控芯片 | NA | NA | 单个烟草原生质体的捕获效率为83.33%,入口流速为0.75 μL/min | NA | NA | NA | NA |
| 108 | 2024-08-08 |
Advances in Single-Cell Sequencing Technology and Its Application in Poultry Science
2022-11-25, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13122211
PMID:36553479
|
review | 本文综述了单细胞测序技术及其在禽类科学中的应用 | 单细胞测序技术在禽类科学中的应用潜力 | 单细胞测序技术在禽类科学中的应用报道较少 | 探讨单细胞测序技术在禽类科学中的应用及其创新 | 单细胞测序技术及其在禽类科学中的应用 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 基因、表型和细胞生物学机制 | 单个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 109 | 2024-08-08 |
Microglia-specific transcriptional repression of interferon-regulated genes after prolonged stress in mice
2022-Nov, Neurobiology of stress
IF:4.3Q1
DOI:10.1016/j.ynstr.2022.100495
PMID:36532375
|
研究论文 | 研究探讨了小鼠在长期轻度压力下,小胶质细胞特异性的表观基因组变化及其对干扰素调节基因的转录抑制作用 | 首次揭示了小胶质细胞在长期压力下对干扰素调节基因的转录抑制,且这一现象与干扰素的产生无关,而是可能与Activating Transcription Factor 3 (ATF3)的增加有关 | NA | 探究长期压力下小胶质细胞的表观基因组变化及其对神经炎症的影响 | 小胶质细胞 | 神经科学 | NA | RNA-seq, ATAC-seq | NA | 基因表达数据 | 12周暴露于轻度压力的小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 110 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic, transcriptomic, and metabolomic characterization of human atherosclerosis
2022-Nov, Annals of translational medicine
DOI:10.21037/atm-22-4852
PMID:36544681
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学、转录组学和代谢组学分析,深入探讨了人类动脉粥样硬化的细胞间相互作用和关键基因 | 本研究首次综合分析了单细胞测序数据、主动脉转录组和代谢组数据,揭示了动脉粥样硬化的关键基因和信号通路 | NA | 深入理解动脉粥样硬化斑块形成的细胞间连接和关键中心基因 | 人类动脉粥样硬化的细胞类型、亚型分化轨迹、相互作用网络和重要转录因子 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据、代谢组数据 | 涉及多种细胞类型,包括T细胞、单核细胞、平滑肌细胞、内皮细胞、B细胞、成纤维细胞、浆细胞、肥大细胞、树突状细胞和自然杀伤细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 111 | 2024-08-08 |
Comprehensive Transcriptomic Analysis of VISTA in Acute Myeloid Leukemia: Insights into Its Prognostic Value
2022-Nov-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms232314885
PMID:36499220
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研究论文 | 研究探讨了VISTA在急性髓系白血病中的转录组表达及其对预后的影响 | 首次详细分析了VISTA在急性髓系白血病中的表达模式及其与疾病复发和治疗抵抗的关系 | 研究主要基于公开的骨髓样本数据,可能存在样本选择偏倚 | 探索VISTA作为免疫检查点调节因子在急性髓系白血病患者中产生免疫逃逸环境的作用 | 急性髓系白血病患者的骨髓样本和白血病细胞系 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 批量和单细胞RNA测序 | NA | RNA | 大量健康个体和急性髓系白血病患者的骨髓样本 | NA | NA | NA | NA |
| 112 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-sequencing combined with bulk RNA-sequencing analysis of peripheral blood reveals the characteristics and key immune cell genes of ulcerative colitis
2022-Nov-26, World journal of clinical cases
IF:1.0Q3
DOI:10.12998/wjcc.v10.i33.12116
PMID:36483809
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)结合批量RNA测序(RNA-seq)分析溃疡性结肠炎(UC)患者的外周血细胞亚型,揭示UC的核心基因及其与免疫细胞的关系 | 利用scRNA-seq技术精确获取肠道数千个细胞的基因表达模式,结合WGCNA和LASSO分析,识别出与UC相关的核心基因RhoB、CTSD和ZYX | NA | 旨在识别能够预测UC患者对特定治疗药物反应的临床表型和生物标志物,从而辅助UC的诊断和治疗 | 溃疡性结肠炎(UC)患者的外周血细胞亚型及其核心基因 | 数字病理学 | 消化系统疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),批量RNA测序(RNA-seq) | 加权基因共表达网络分析(WGCNA),最小绝对收缩和选择算子(LASSO) | 基因表达数据 | 约24340个细胞,17种细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 113 | 2024-08-08 |
Caerin 1.1/1.9 Enhances Antitumour Immunity by Activating the IFN-α Response Signalling Pathway of Tumour Macrophages
2022-Nov-24, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14235785
PMID:36497272
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研究论文 | 本研究探讨了caerin 1.1/1.9肽通过激活肿瘤巨噬细胞的IFN-α反应信号通路增强抗肿瘤免疫的效果 | 本研究首次揭示了caerin 1.1/1.9肽通过诱导IL-12分泌的Ly6C+F4/80+巨噬细胞浸润肿瘤,增强IFN-α反应信号,从而清除肿瘤 | 研究主要基于小鼠移植瘤模型和早期宫颈癌患者的单细胞RNA测序数据,可能需要更多临床数据验证 | 探讨caerin 1.1/1.9肽在增强抗肿瘤免疫治疗中的作用 | 肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)和小鼠移植瘤模型 | 免疫学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 包括小鼠移植瘤模型和早期宫颈癌患者的TAMs | NA | NA | NA | NA |
| 114 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Reveals the Regulatory Role of Maresin1 on Neutrophils during Septic Lung Injury
2022-Nov-23, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11233733
PMID:36496993
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术揭示了Maresin1在脓毒性肺损伤中对中性粒细胞的调控作用 | 首次在单细胞水平上揭示了Maresin1对中性粒细胞的调控机制,特别是对Neutrophil-Cxcl3亚群的影响 | 研究仅限于特定的细胞类型和模型,未来需进一步验证在更广泛细胞类型和临床样本中的效果 | 探讨Maresin1在脓毒性肺损伤中对中性粒细胞的调控机制 | 中性粒细胞及其在脓毒性肺损伤中的作用 | 数字病理学 | 肺损伤 | 单细胞测序 | NA | 细胞数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 115 | 2024-08-08 |
Inhibition of the MAPK/c-Jun-EGR1 Pathway Decreases Photoreceptor Cell Death in the rd1 Mouse Model for Inherited Retinal Degeneration
2022-Nov-23, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms232314600
PMID:36498926
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研究论文 | 本研究探讨了早期生长反应因子-1(EGR1)表达对rd1小鼠模型中视网膜色素变性(RP)光感受器细胞死亡的影响及其机制 | 揭示了通过抑制MAPK/c-Jun通路减少EGR1和PARP1表达,从而防止光感受器细胞死亡的新治疗途径 | NA | 研究EGR1在光感受器细胞死亡中的作用及机制 | rd1小鼠模型中的光感受器细胞 | 数字病理学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、染色质免疫沉淀(ChIP)、双荧光素酶报告基因分析、蛋白质印迹(western blotting)、免疫荧光染色、TUNEL检测 | NA | 基因表达数据 | rd1小鼠和同源野生型(WT)小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 116 | 2024-08-08 |
Preventing Surgery-Induced NK Cell Dysfunction Using Anti-TGF-β Immunotherapeutics
2022-Nov-23, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms232314608
PMID:36498937
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研究论文 | 研究使用抗TGF-β免疫疗法预防手术后NK细胞功能障碍 | 首次揭示了手术后TGF-β通过调节NK细胞的信号通路导致IFNγ产生减少,并提出使用抗TGF-β免疫疗法可以预防这种功能障碍 | 研究样本量较小,仅涉及六名结直肠癌患者 | 探讨手术后NK细胞功能障碍的机制及可能的治疗方法 | 手术后患者的NK细胞功能及TGF-β对其的影响 | 免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 六名结直肠癌患者的外周血单个核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 117 | 2024-08-08 |
Bone Marrow Macrophages Induce Inflammation by Efferocytosis of Apoptotic Prostate Cancer Cells via HIF-1α Stabilization
2022-Nov-22, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11233712
PMID:36496973
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析,揭示了骨髓巨噬细胞通过吞噬凋亡的前列腺癌细胞,通过HIF-1α稳定化促进炎症反应的分子机制 | 首次阐明了骨髓巨噬细胞在吞噬凋亡的前列腺癌细胞过程中,HIF-1α的稳定化及其对炎症反应的促进作用 | NA | 探究骨髓巨噬细胞吞噬凋亡的前列腺癌细胞后,HIF-1α稳定化对炎症反应的影响及其分子机制 | 骨髓巨噬细胞、凋亡的前列腺癌细胞、HIF-1α | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 118 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomes and runx2b-/- mutants reveal the genetic signatures of intermuscular bone formation in zebrafish
2022-Nov, National science review
IF:16.3Q1
DOI:10.1093/nsr/nwac152
PMID:36478733
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和runx2b-/-突变体揭示了斑马鱼肌肉间骨形成的遗传特征 | 首次通过单细胞转录组学分析定义了18种不同的细胞类型,并揭示了肌肉间骨来源于肌腱,以及肌腱-成骨细胞系在肌肉间骨形成中的核心作用 | NA | 探究斑马鱼肌肉间骨形成的分子基础 | 斑马鱼的肌肉间骨 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | CRISPR-Cas9 | 转录组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 119 | 2024-08-08 |
Thymic macrophages consist of two populations with distinct localization and origin
2022-11-30, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.75148
PMID:36449334
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术,详细描述了胸腺巨噬细胞的表面表型、转录组特征及其在胸腺中的分布和起源 | 首次揭示了胸腺巨噬细胞由两个不同群体组成,分别位于皮质和髓质及其交界处,并具有不同的胚胎和成年造血干细胞起源 | NA | 研究胸腺巨噬细胞的起源、维持和多样性 | 胸腺巨噬细胞的表型、转录组特征及其在胸腺中的分布和起源 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 成年胸腺中的巨噬细胞群体 | NA | NA | NA | NA |
| 120 | 2024-08-08 |
A single-cell analysis framework allows for characterization of CSF leukocytes and their tissue of origin in multiple sclerosis
2022-11-30, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adc9778
PMID:36449599
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研究论文 | 本文通过深度生成模型整合了41个脑脊液和14个中枢神经系统实质的单细胞RNA测序样本,分析了多发性硬化症中脑脊液白细胞及其来源组织的特点 | 开发了一个基于用户界面的应用程序,用于将新的脑脊液单细胞RNA测序数据映射到细胞身份图谱上 | NA | 研究多发性硬化症中脑脊液白细胞及其来源组织的特点 | 脑脊液和中枢神经系统实质的单细胞RNA测序样本 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | 深度生成模型 | 单细胞RNA测序数据 | 120,629个细胞 | NA | NA | NA | NA |