单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
81	2024-08-07	Anti-CTLA-4 antibodies drive myeloid activation and reprogram the tumor microenvironment through FcγR engagement and type I interferon signaling 2022-11, Nature cancer IF:23.5Q1 DOI:10.1038/s43018-022-00447-1 PMID:36302895	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析了抗CTLA-4抗体通过FcγR结合和I型干扰素信号传导重编程肿瘤微环境的影响	发现FcγR结合和I型干扰素信号传导在抗CTLA-4治疗中的重要作用，支持开发具有这些特性的优化免疫治疗剂	NA	探讨抗CTLA-4抗体的作用机制及其对肿瘤微环境的影响	抗CTLA-4抗体、FcγR结合、I型干扰素信号传导、肿瘤微环境	免疫学	肿瘤	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
82	2024-08-07	RNA-seq characterization of histamine-releasing mast cells as potential therapeutic target of osteoarthritis 2022-Nov, Clinical immunology (Orlando, Fla.) DOI:10.1016/j.clim.2022.109117 PMID:36109004	研究论文	本研究通过RNA测序分析和药物阻断组胺活性，探讨肥大细胞在骨关节炎中的作用	首次通过单细胞RNA测序和批量RNA测序，结合流式细胞术和免疫组化分析，对骨关节炎中的肥大细胞进行详细表征	研究主要基于小鼠模型，未来需在人体中进一步验证	进一步阐明肥大细胞在骨关节炎中的作用及其作为治疗靶点的潜力	骨关节炎的滑膜组织和滑液中的肥大细胞	数字病理学	骨关节炎	RNA测序	NA	RNA	包括40名骨关节炎患者和使用组胺H1受体拮抗剂西替利嗪治疗的小鼠模型
83	2024-08-07	Decoding the Spermatogenesis Program: New Insights from Transcriptomic Analyses 2022-11-30, Annual review of genetics IF:8.7Q1 DOI:10.1146/annurev-genet-080320-040045 PMID:36070560	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术研究了精细的细胞图谱，揭示了测试中已知和新型细胞类型及其功能状态，为跨物种比较提供了参考系统	利用单细胞RNA测序技术提供了对测试细胞类型多样性和分子特征的深入见解，并构建了精细的细胞图谱	目前缺乏高分辨率数据来探索组织环境中生殖细胞与体细胞的相互作用	旨在通过单细胞研究提高对配子发生机制的理解，以探索不孕的潜在原因并开发新的治疗干预措施	研究对象为精子的发生过程及其细胞和分子特征	NA	不孕症	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	未具体说明样本数量
84	2024-08-07	Estimating Metastatic Risk of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma at Single-Cell Resolution 2022-Nov-30, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms232315020 PMID:36499343	研究论文	本研究提出了一种基于单细胞RNA测序数据评估胰腺导管腺癌转移风险的方法scMetR	首次提出scMetR方法，通过单细胞RNA测序数据评估肿瘤细胞的转移风险，并识别转移特征基因	NA	探索胰腺导管腺癌的转移风险评估方法	胰腺导管腺癌的肿瘤细胞及其转移风险	数字病理学	胰腺癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
85	2024-08-07	A single-cell analysis reveals tumor heterogeneity and immune environment of acral melanoma 2022-11-25, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-022-34877-3 PMID:36433984	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析了63,394个细胞，来自5个肢端黑色素瘤和3个皮肤黑色素瘤样本，以探讨肿瘤异质性和免疫环境	定义了5个正交功能细胞簇，涉及TGF-beta信号传导、I型干扰素、Wnt信号传导、细胞周期和胆固醇外流信号传导，这些信号与黑色素瘤的良好预后显著相关	NA	研究肢端黑色素瘤的肿瘤异质性和免疫环境	肢端黑色素瘤和皮肤黑色素瘤样本的细胞	数字病理学	黑色素瘤	单细胞RNA测序	NA	细胞	63,394个细胞，来自5个肢端黑色素瘤和3个皮肤黑色素瘤样本
86	2024-08-07	Ornithine decarboxylase supports ILC3 responses in infectious and autoimmune colitis through positive regulation of IL-22 transcription 2022-Nov-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2214900119 PMID:36279426	研究论文	本文研究了鸟氨酸脱羧酶（ODC1）通过正向调节IL-22转录在感染性和自身免疫性结肠炎中支持ILC3反应的作用	首次揭示了ILC3通过聚胺生物合成途径进行代谢适应，并发现ODC1在这一过程中的关键作用	NA	探讨ILC3在感染性和自身免疫性结肠炎中的代谢适应及其对IL-22产生的影响	ILC3细胞及其在结肠炎中的作用	免疫学	自身免疫性疾病	单细胞RNA测序和代谢组学分析	NA	RNA序列和代谢数据	NA
87	2024-08-07	Autophagy-linked plasma and lysosomal membrane protein PLAC8 is a key host factor for SARS-CoV-2 entry into human cells 2022-11-02, The EMBO journal DOI:10.15252/embj.2022110727 PMID:36124427	研究论文	本文通过CRISPR/Cas9基因编辑技术在感染SARS-CoV-2的人类肺癌细胞中进行全基因组功能丧失筛选，揭示了PLAC8和SPNS1作为关键宿主因子影响病毒进入细胞的过程	发现了两个新的关键宿主因子PLAC8和SPNS1，并证实它们的功能丧失会损害病毒的进入	NA	旨在更好地理解SARS-CoV-2与宿主细胞之间的相互作用，并识别可能用于对抗感染和COVID-19病理的宿主因子	SARS-CoV-2病毒和人类肺癌细胞	数字病理学	肺癌	CRISPR/Cas9	NA	RNA-Seq	八种不同的人类肺癌细胞系
88	2024-08-07	Acetyl-Coenzyme A Synthetase 2 Potentiates Macropinocytosis and Muscle Wasting Through Metabolic Reprogramming in Pancreatic Cancer 2022-11, Gastroenterology IF:25.7Q1 DOI:10.1053/j.gastro.2022.06.058 PMID:35777482	研究论文	本研究探讨了乙酰辅酶A合成酶2（ACSS2）在胰腺癌中的作用，发现ACSS2通过代谢重编程增强巨胞饮作用并导致肌肉萎缩	首次揭示了ACSS2通过激活ZIP4途径促进巨胞饮作用和肌肉萎缩，为胰腺癌提供了额外的营养物质	NA	研究ACSS2在胰腺癌中的作用及其对巨胞饮作用和肌肉萎缩的影响	胰腺癌患者的样本和基因工程小鼠模型	数字病理学	胰腺癌	CRISPR-Cas9系统，单细胞RNA测序，葡聚糖摄取试验，染色质免疫沉淀试验	NA	基因表达数据，蛋白质相互作用数据	胰腺癌患者样本，基因工程小鼠模型
89	2024-08-08	A multi-use deep learning method for CITE-seq and single-cell RNA-seq data integration with cell surface protein prediction and imputation 2022-Nov, Nature machine intelligence IF:18.8Q1 DOI:10.1038/s42256-022-00545-w PMID:36873621	research paper	本文介绍了一种名为sciPENN的多用途深度学习方法，用于CITE-seq和单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据集成，以及细胞表面蛋白表达预测和插补	sciPENN方法支持CITE-seq和scRNA-seq数据集成，蛋白质表达预测，蛋白质表达插补，预测和插补不确定性的量化，以及从CITE-seq到scRNA-seq的细胞类型标签转移	NA	克服CITE-seq和scRNA-seq数据集成中的计算挑战，提高信息内容	CITE-seq和scRNA-seq数据集成的多用途深度学习方法	machine learning	NA	CITE-seq, scRNA-seq	deep learning	single-cell multi-omics data	多个数据集
90	2024-08-08	Sex differences in interindividual gene expression variability across human tissues 2022-Nov, PNAS nexus IF:2.2Q1 DOI:10.1093/pnasnexus/pgac243 PMID:36712323	研究论文	本文分析了GTEx项目中43种组织的RNA-seq数据，研究了基因表达变异性的性别差异及其生物学意义	首次系统地探讨了基因表达变异性的性别差异，并发现这些差异与性激素反应、免疫反应等多种生物学功能相关	NA	探究性别差异在个体间基因表达变异性中的作用及其生物学和医学意义	人类不同组织中的基因表达变异性	基因组学	甲状腺疾病	RNA-seq	NA	基因表达数据	43种组织
91	2024-08-08	Colon-Targeted eNAMPT-Specific Peptide Systems for Treatment of DSS-Induced Acute and Chronic Colitis in Mouse 2022-Nov-30, Antioxidants (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/antiox11122376 PMID:36552583	研究论文	本文通过单细胞RNA测序数据分析，揭示了NAMPT和CYBB在结肠炎患者和鼠模型中的表达上调，并开发了一种新型重组TK肽rCT-NAMPT，该肽能够靶向结肠并抑制NAMPT与CYBB或TLR4的相互作用，有效减轻DSS诱导的急性和慢性结肠炎。	开发了一种新型重组TK肽rCT-NAMPT，该肽具有结肠靶向性并能抑制NAMPT与CYBB或TLR4的相互作用，为结肠炎治疗提供了新的候选药物。	NA	研究NAMPT在炎症巨噬细胞中的作用及其在结肠炎治疗中的潜在应用。	NAMPT和CYBB在结肠炎中的表达及新型重组TK肽rCT-NAMPT的开发与应用。	NA	结肠炎	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
92	2024-08-08	Single-Cell Sequencing Identifies Master Regulators Affected by Panobinostat in Neuroblastoma Cells 2022-11-29, Genes IF:2.8Q2 DOI:10.3390/genes13122240 PMID:36553506	研究论文	本文通过单细胞测序技术研究了泛HDAC抑制剂panobinostat在神经母细胞瘤细胞中的作用，并识别了受其影响的转录调控因子。	利用单细胞测序技术在神经母细胞瘤细胞中研究panobinostat的作用，具有前所未有的分辨率。	NA	探究panobinostat在神经母细胞瘤细胞中的分子机制和基因调控网络。	神经母细胞瘤细胞和panobinostat的作用。	数字病理学	神经母细胞瘤	单细胞测序	NA	基因表达数据	具体样本数量未在摘要中提及
93	2024-08-08	A Dual-Channel Microfluidic Chip for Single Tobacco Protoplast Isolation and Dynamic Capture 2022-Nov-29, Micromachines IF:3.0Q2 DOI:10.3390/mi13122109 PMID:36557407	研究论文	本研究设计了一种基于PDMS的双通道微流控芯片，用于单个烟草原生质体的分离和动态捕获	本研究提供了一种新的高吞吐量单原生质体研究策略，并为单细胞捕获机制奠定了理论基础	NA	研究单个原生质体的分离和捕获，以满足基因功能验证、亚细胞定位和单细胞测序的需求	烟草原生质体和聚苯乙烯微球	微流控技术	NA	微流控芯片	NA	NA	单个烟草原生质体的捕获效率为83.33%，入口流速为0.75 μL/min
94	2024-08-08	Advances in Single-Cell Sequencing Technology and Its Application in Poultry Science 2022-11-25, Genes IF:2.8Q2 DOI:10.3390/genes13122211 PMID:36553479	review	本文综述了单细胞测序技术及其在禽类科学中的应用	单细胞测序技术在禽类科学中的应用潜力	单细胞测序技术在禽类科学中的应用报道较少	探讨单细胞测序技术在禽类科学中的应用及其创新	单细胞测序技术及其在禽类科学中的应用	NA	NA	单细胞测序	NA	基因、表型和细胞生物学机制	单个细胞
95	2024-08-08	Microglia-specific transcriptional repression of interferon-regulated genes after prolonged stress in mice 2022-Nov, Neurobiology of stress IF:4.3Q1 DOI:10.1016/j.ynstr.2022.100495 PMID:36532375	研究论文	研究探讨了小鼠在长期轻度压力下，小胶质细胞特异性的表观基因组变化及其对干扰素调节基因的转录抑制作用	首次揭示了小胶质细胞在长期压力下对干扰素调节基因的转录抑制，且这一现象与干扰素的产生无关，而是可能与Activating Transcription Factor 3 (ATF3)的增加有关	NA	探究长期压力下小胶质细胞的表观基因组变化及其对神经炎症的影响	小胶质细胞	神经科学	NA	RNA-seq, ATAC-seq	NA	基因表达数据	12周暴露于轻度压力的小鼠
96	2024-08-08	Single-cell transcriptomic, transcriptomic, and metabolomic characterization of human atherosclerosis 2022-Nov, Annals of translational medicine DOI:10.21037/atm-22-4852 PMID:36544681	研究论文	本研究通过单细胞转录组学、转录组学和代谢组学分析，深入探讨了人类动脉粥样硬化的细胞间相互作用和关键基因	本研究首次综合分析了单细胞测序数据、主动脉转录组和代谢组数据，揭示了动脉粥样硬化的关键基因和信号通路	NA	深入理解动脉粥样硬化斑块形成的细胞间连接和关键中心基因	人类动脉粥样硬化的细胞类型、亚型分化轨迹、相互作用网络和重要转录因子	数字病理学	心血管疾病	单细胞测序	NA	转录组数据、代谢组数据	涉及多种细胞类型，包括T细胞、单核细胞、平滑肌细胞、内皮细胞、B细胞、成纤维细胞、浆细胞、肥大细胞、树突状细胞和自然杀伤细胞
97	2024-08-08	Comprehensive Transcriptomic Analysis of VISTA in Acute Myeloid Leukemia: Insights into Its Prognostic Value 2022-Nov-28, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms232314885 PMID:36499220	研究论文	研究探讨了VISTA在急性髓系白血病中的转录组表达及其对预后的影响	首次详细分析了VISTA在急性髓系白血病中的表达模式及其与疾病复发和治疗抵抗的关系	研究主要基于公开的骨髓样本数据，可能存在样本选择偏倚	探索VISTA作为免疫检查点调节因子在急性髓系白血病患者中产生免疫逃逸环境的作用	急性髓系白血病患者的骨髓样本和白血病细胞系	数字病理学	急性髓系白血病	批量和单细胞RNA测序	NA	RNA	大量健康个体和急性髓系白血病患者的骨髓样本
98	2024-08-08	Single-cell RNA-sequencing combined with bulk RNA-sequencing analysis of peripheral blood reveals the characteristics and key immune cell genes of ulcerative colitis 2022-Nov-26, World journal of clinical cases IF:1.0Q3 DOI:10.12998/wjcc.v10.i33.12116 PMID:36483809	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）结合批量RNA测序（RNA-seq）分析溃疡性结肠炎（UC）患者的外周血细胞亚型，揭示UC的核心基因及其与免疫细胞的关系	利用scRNA-seq技术精确获取肠道数千个细胞的基因表达模式，结合WGCNA和LASSO分析，识别出与UC相关的核心基因RhoB、CTSD和ZYX	NA	旨在识别能够预测UC患者对特定治疗药物反应的临床表型和生物标志物，从而辅助UC的诊断和治疗	溃疡性结肠炎（UC）患者的外周血细胞亚型及其核心基因	数字病理学	消化系统疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（RNA-seq）	加权基因共表达网络分析（WGCNA），最小绝对收缩和选择算子（LASSO）	基因表达数据	约24340个细胞，17种细胞类型
99	2024-08-08	Caerin 1.1/1.9 Enhances Antitumour Immunity by Activating the IFN-α Response Signalling Pathway of Tumour Macrophages 2022-Nov-24, Cancers IF:4.5Q1 DOI:10.3390/cancers14235785 PMID:36497272	研究论文	本研究探讨了caerin 1.1/1.9肽通过激活肿瘤巨噬细胞的IFN-α反应信号通路增强抗肿瘤免疫的效果	本研究首次揭示了caerin 1.1/1.9肽通过诱导IL-12分泌的Ly6C+F4/80+巨噬细胞浸润肿瘤，增强IFN-α反应信号，从而清除肿瘤	研究主要基于小鼠移植瘤模型和早期宫颈癌患者的单细胞RNA测序数据，可能需要更多临床数据验证	探讨caerin 1.1/1.9肽在增强抗肿瘤免疫治疗中的作用	肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）和小鼠移植瘤模型	免疫学	宫颈癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA	包括小鼠移植瘤模型和早期宫颈癌患者的TAMs
100	2024-08-08	Single-Cell Sequencing Reveals the Regulatory Role of Maresin1 on Neutrophils during Septic Lung Injury 2022-Nov-23, Cells IF:5.1Q2 DOI:10.3390/cells11233733 PMID:36496993	研究论文	本研究利用单细胞测序技术揭示了Maresin1在脓毒性肺损伤中对中性粒细胞的调控作用	首次在单细胞水平上揭示了Maresin1对中性粒细胞的调控机制，特别是对Neutrophil-Cxcl3亚群的影响	研究仅限于特定的细胞类型和模型，未来需进一步验证在更广泛细胞类型和临床样本中的效果	探讨Maresin1在脓毒性肺损伤中对中性粒细胞的调控机制	中性粒细胞及其在脓毒性肺损伤中的作用	数字病理学	肺损伤	单细胞测序	NA	细胞数据	具体样本数量未在摘要中提及