单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 320 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-10-07 |
Heterogeneity and Molecular Markers for CNS Glial Cells Revealed by Single-Cell Transcriptomics
2022-Nov, Cellular and molecular neurobiology
IF:3.6Q2
DOI:10.1007/s10571-021-01159-3
PMID:34704168
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综述 | 本文通过单细胞转录组学技术系统总结了中枢神经系统主要胶质细胞的分子标记及其异质性特征 | 从单细胞转录组层面系统揭示胶质细胞在不同物种、CNS区域、发育阶段和病理状态下的异质性特征 | NA | 总结中枢神经系统胶质细胞的分子标记和异质性特征 | 星形胶质细胞、少突胶质细胞和小胶质细胞等中枢神经系统胶质细胞 | 单细胞组学 | 阿尔茨海默病、脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 42 | 2025-10-07 |
Here and there a trophoblast, a transcriptional evaluation of trophoblast cell models
2022-Nov-08, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-022-04589-4
PMID:36346530
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综述 | 本文通过整合评估人滋养层干细胞模型与体内样本的转录组数据，分析这些模型的适用性 | 首次系统整合人滋养层干细胞模型、人类囊胚样结构、干细胞和胚胎的单细胞RNA测序数据，评估模型对早期滋养层发育的再现能力 | 基于现有转录组数据的回顾性分析，缺乏实验验证 | 评估人滋养层干细胞模型的转录组特征及其在再现早期滋养层发育方面的适用性 | 人滋养层干细胞模型、人类囊胚样结构、干细胞和胚胎样本 | 发育生物学 | 生殖医学 | 单细胞RNA测序，转录组分析 | NA | 转录组数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 43 | 2024-12-06 |
APOE4 impairs myelination via cholesterol dysregulation in oligodendrocytes
2022-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-05439-w
PMID:36385529
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研究论文 | 研究探讨了APOE4基因对人类大脑的影响，特别是通过胆固醇稳态失调影响少突胶质细胞的髓鞘形成 | 首次通过单细胞转录组学分析揭示了APOE4对人类大脑所有细胞类型的广泛基因表达变化，并建立了APOE4、胆固醇、髓鞘形成和记忆之间的功能联系 | 研究主要基于死后人脑样本和诱导多能干细胞衍生的细胞，可能存在样本量和实验条件的限制 | 深入了解APOE4基因对人类大脑的影响，特别是其对髓鞘形成和记忆的影响，为阿尔茨海默病的治疗提供新的机会 | APOE4基因携带者和非携带者的死后人脑样本，诱导多能干细胞衍生的细胞，以及靶向替换小鼠 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组学分析，组织学和脂质组学分析 | NA | 基因表达数据，组织学和脂质组学数据 | 死后人脑样本，诱导多能干细胞衍生的细胞，靶向替换小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 44 | 2024-11-06 |
Network analysis between neuron dysfunction and neuroimmune response based on neural single-cell transcriptome of COVID-19 patients
2022-11, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2022.106055
PMID:36137317
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研究论文 | 研究基于COVID-19患者神经单细胞转录组数据，分析神经元功能障碍与神经免疫反应之间的网络关系 | 首次揭示了星形胶质细胞在COVID-19感染中的免疫相关因子表达，并分析了其与微胶质细胞和兴奋性神经元的相互作用 | 研究主要基于单细胞转录组数据，缺乏功能实验验证 | 探讨COVID-19感染引起的神经元功能障碍与神经免疫反应之间的关系 | COVID-19患者的内侧前额叶皮层单细胞数据 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | 风险模型 | RNA-seq和scRNA-seq数据 | 涉及COVID-19患者的外周血和多组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 45 | 2024-11-02 |
Epigenetic Mechanisms of Brain Sexual Differentiation
2022-11-01, Cold Spring Harbor perspectives in biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a039099
PMID:35817509
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review | 本文讨论了围产期雌二醇信号如何组织啮齿动物大脑中的细胞和分子性别差异 | 本文介绍了最近发现的由雌激素受体α（ERα）激活的基因调控程序，展示了真正的表观遗传机制 | NA | 探讨早期激素信号对大脑的持久影响及其机制 | 啮齿动物大脑中的性别差异 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 46 | 2024-10-17 |
Macrophages in intestinal fibrosis and regression
2022-11, Cellular immunology
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.cellimm.2022.104614
PMID:36182587
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综述 | 本文综述了肠道巨噬细胞在肠道纤维化和消退中的作用 | 基于最新进展的谱系追踪和单细胞测序技术，详细描述了肠道巨噬细胞的特征，并提出了针对巨噬细胞的潜在抗肠道纤维化疗法 | NA | 探讨肠道巨噬细胞在肠道纤维化和消退中的作用，并提出潜在的治疗策略 | 肠道巨噬细胞及其在肠道纤维化中的作用 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 47 | 2024-09-30 |
SOTIP is a versatile method for microenvironment modeling with spatial omics data
2022-11-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-34867-5
PMID:36443314
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SOTIP的多任务分析方法，用于整合空间组学数据中的微环境及其相互关系，并进行空间异质性量化、空间域识别等下游任务 | SOTIP方法创新地将微环境及其相互关系整合到一个统一的图中，能够进行多种下游分析任务，并揭示了空间异质性模式 | NA | 开发一种能够整合空间组学数据中微环境及其相互关系的多任务分析方法 | 小鼠大脑皮层和人类三阴性乳腺癌的空间转录组和蛋白质组数据 | 空间组学 | 三阴性乳腺癌 | 空间组学 | 图模型 | 空间组学数据 | 两个独立的小鼠大脑皮层空间转录组数据集和人类三阴性乳腺癌空间蛋白质组数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 48 | 2024-09-28 |
Integrating Single-Cell Transcriptome and Network Analysis to Characterize the Therapeutic Response of Chronic Myeloid Leukemia
2022-Nov-18, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms232214335
PMID:36430822
|
研究论文 | 本文通过整合单细胞转录组和网络分析，研究了慢性髓性白血病（CML）对酪氨酸激酶抑制剂（TKI）治疗的反应机制 | 本文首次结合单细胞RNA测序和转录调控网络分析，揭示了CML干细胞对TKI治疗的不同反应机制，并识别了新的治疗反应基因标记 | 本文主要集中在CML干细胞的研究，未涵盖其他类型的白血病细胞 | 研究CML患者对TKI治疗的反应机制，识别新的治疗反应基因标记 | CML干细胞及其对TKI治疗的反应 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | CML患者的干细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 49 | 2024-09-25 |
A prebiotic diet modulates microglial states and motor deficits in α-synuclein overexpressing mice
2022-11-08, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.81453
PMID:36346385
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研究论文 | 研究了富含纤维的饮食对α-突触核蛋白过度表达小鼠的微胶质细胞功能和运动障碍的影响 | 揭示了饮食与运动症状在微胶质细胞依赖性交互作用中的新机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨富含纤维的饮食对帕金森病样症状和病理的影响 | α-突触核蛋白过度表达的小鼠 | NA | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | α-突触核蛋白过度表达的小鼠和野生型小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 50 | 2024-09-23 |
Targeted Assessment of Mucosal Immune Gene Expression Predicts Clinical Outcomes in Children with Ulcerative Colitis
2022-Nov-23, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjac075
PMID:35665804
|
研究论文 | 本文研究了靶向基因表达面板在预测儿童溃疡性结肠炎临床结果中的应用 | 首次使用靶向基因表达面板预测儿童溃疡性结肠炎的临床结果，并探讨了预测基因在发病机制中的潜在作用 | 研究样本仅限于新诊断的儿童溃疡性结肠炎患者，且结果主要基于52周的随访数据 | 确定靶向基因表达面板是否能预测儿童溃疡性结肠炎的临床结果，并探讨预测基因的潜在致病作用 | 313例新诊断的儿童溃疡性结肠炎患者的直肠RNA样本 | 数字病理学 | 消化系统疾病 | 实时PCR微流体阵列，RNA测序 | NA | RNA | 313例新诊断的儿童溃疡性结肠炎患者的直肠RNA样本 | NA | NA | NA | NA |
| 51 | 2024-09-23 |
Ischemic Stroke Impacts the Gut Microbiome, Ileal Epithelial and Immune Homeostasis
2022-Nov-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105437
PMID:36388972
|
研究论文 | 本文研究了缺血性中风对肠道微生物群、回肠上皮细胞和免疫稳态的影响 | 首次揭示了中风通过炎症机制影响回肠上皮细胞的分子和代谢途径 | NA | 探讨缺血性中风对肠道微生物群和回肠上皮细胞的影响及其分子机制 | 肠道微生物群、回肠上皮细胞、免疫细胞 | NA | 中风 | 多组学方法、单细胞RNA测序 | NA | 转录组、代谢组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 52 | 2024-09-23 |
Transcriptional Profiling of Phagocytic Leukocytes and Microglia Reveals a Critical Role for Reactive Oxygen Species in Biofilm Containment during Staphylococcus aureus Craniotomy Infection
2022-11-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2200503
PMID:36426943
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研究论文 | 研究探讨了在金黄色葡萄球菌颅骨切开术感染中，吞噬性白细胞和微胶质细胞的转录谱，并揭示了活性氧在生物膜控制中的关键作用 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析了吞噬性和非吞噬性细胞的转录特征，并发现活性氧在控制金黄色葡萄球菌生物膜中的重要作用 | 研究主要基于小鼠模型，结果的临床相关性需要进一步验证 | 探讨金黄色葡萄球菌颅骨切开术感染中吞噬性白细胞和微胶质细胞的转录特征及其在生物膜控制中的作用 | 吞噬性白细胞、微胶质细胞、金黄色葡萄球菌 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型，包括NADPH氧化酶2敲除小鼠和野生型小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 53 | 2024-09-23 |
Monocyte/Macrophage Heterogeneity during Skin Wound Healing in Mice
2022-11-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2200365
PMID:36426946
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序技术探索小鼠皮肤伤口愈合过程中单核细胞/巨噬细胞的异质性和状态转换 | 首次使用单细胞RNA测序技术全面探索皮肤伤口愈合过程中单核细胞/巨噬细胞的异质性和状态转换 | 研究仅限于C57BL/6小鼠模型，结果可能不适用于其他物种 | 深入了解皮肤伤口愈合过程中单核细胞/巨噬细胞的异质性和功能 | 小鼠皮肤伤口愈合过程中的单核细胞/巨噬细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 2813个高质量细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 54 | 2024-09-23 |
Multiomic analysis reveals conservation of cancer-associated fibroblast phenotypes across species and tissue of origin
2022-11-14, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2022.09.015
PMID:36270275
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研究论文 | 本文通过多组学分析揭示了癌症相关成纤维细胞表型在不同物种和组织来源中的保守性 | 本文首次通过配对的染色质可及性和转录组分析，综合分析了癌症相关成纤维细胞的亚群，并识别出三种超群：稳态样、机械应答和免疫调节型成纤维细胞 | NA | 研究癌症相关成纤维细胞的异质性及其在不同物种和组织中的保守性 | 癌症相关成纤维细胞及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、染色质可及性分析 | NA | 转录组、蛋白质组 | 多个组织类型和物种的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 55 | 2024-09-23 |
Cellular and molecular profiles of larval and adult Xenopus corneal epithelia resolved at the single-cell level
2022-11, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2022.08.007
PMID:36049533
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了青蛙角膜上皮细胞在幼体和成体阶段的细胞和分子特征 | 揭示了角膜发育和成熟过程中细胞多样性的增加以及转录组、基因调控网络和细胞间通讯动力学的显著变化，并识别出潜在的幼体和成体角膜上皮干细胞 | NA | 探索角膜上皮干细胞及其增殖后代在维持角膜透明度和稳态中的作用 | 青蛙幼体和成体角膜上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 幼体和成体青蛙角膜细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 56 | 2024-09-23 |
Directed differentiation of human pluripotent stem cells into diverse organ-specific mesenchyme of the digestive and respiratory systems
2022-11, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-022-00733-3
PMID:35978039
|
研究论文 | 本文描述了一种将人类多能干细胞定向分化为消化和呼吸系统中多种器官特异性间充质的协议 | 利用单细胞转录组学揭示的小鼠前肠器官发生中的信号网络和分子标记，成功将人类多能干细胞分化为多种器官特异性间充质 | 目前主要集中在间充质的生成，尚未涉及复杂人体组织的工程化 | 开发一种将人类多能干细胞定向分化为消化和呼吸系统中多种器官特异性间充质的方法 | 人类多能干细胞及其分化产物 | 再生医学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 细胞 | 4-7天的培养时间，不同类型的间充质细胞比例为60-90%纯度的肝隔膜横纹肌样细胞，70-80%纯度的肝样成纤维细胞，以及约35%的呼吸样、胃样或食管样间充质细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 57 | 2024-09-17 |
Identification of visual cortex cell types and species differences using single-cell RNA sequencing
2022-11-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-34590-1
PMID:36371428
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了133,454个猕猴视觉皮层细胞，识别了多种细胞类型及其在不同物种间的基因表达差异 | 本文首次建立了大规模的猕猴视觉皮层单细胞RNA测序数据集，并发现了两种新的细胞类型，以及不同物种间在突触可塑性和神经调节相关基因表达上的差异 | 本文仅分析了猕猴、人类和小鼠的视觉皮层细胞，未涉及其他物种 | 研究灵长类视觉皮层的细胞类型及其在不同物种间的差异 | 猕猴、人类和小鼠的视觉皮层细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 133,454个猕猴视觉皮层细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 58 | 2024-09-14 |
Single-Cell Transcriptomic Census of Endothelial Changes Induced by Matrix Stiffness and the Association with Atherosclerosis
2022-Nov-17, Advanced functional materials
IF:18.5Q1
DOI:10.1002/adfm.202203069
PMID:36816792
|
研究论文 | 研究了基质硬度对内皮细胞向间充质细胞转化的影响及其与动脉粥样硬化的关联 | 首次在单细胞分辨率下研究了基质硬度对内皮细胞向间充质细胞转化的调控作用，并揭示了新的间充质-内皮反向转化轨迹 | 研究主要基于体外模型，可能无法完全反映体内复杂的相互作用 | 探讨基质硬度对内皮细胞可塑性和动脉粥样硬化进展的影响 | 人冠状动脉内皮细胞及其在不同基质硬度下的转录特征 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 人冠状动脉内皮细胞在生理和病理基质硬度下的培养样本 | NA | NA | NA | NA |
| 59 | 2024-09-11 |
Podocalyxin-Like Protein 1 Regulates Pluripotency through the Cholesterol Biosynthesis Pathway
2022-Nov-14, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202205451
PMID:36373710
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研究论文 | 研究了膜蛋白podocalyxin-like蛋白1（PODXL）通过胆固醇生物合成途径调节多能性的机制 | 首次报道了膜蛋白PODXL调节从头胆固醇生物合成，并发现人类多能干细胞（hPSCs）对胆固醇耗竭比成纤维细胞更敏感 | NA | 揭示信号机制对扩展多能干细胞（EPSC）状态和原始多能性的关键作用，以理解胚胎发育 | 膜蛋白PODXL在扩展和原始多能性中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 60 | 2024-09-10 |
scGNN 2.0: a graph neural network tool for imputation and clustering of single-cell RNA-Seq data
2022-11-30, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac684
PMID:36250784
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研究论文 | 本文介绍了scGNN 2.0，一个用于单细胞RNA-Seq数据插补和聚类的图神经网络工具 | scGNN 2.0通过简化闭环架构显著提高了计算速度，并在细胞聚类和插补性能上有所提升 | NA | 改进单细胞RNA-Seq数据分析中的基因表达插补和细胞聚类方法 | 单细胞RNA-Seq数据 | 机器学习 | NA | 图神经网络 | 图神经网络 | 基因表达数据 | 八个数据集 | NA | NA | NA | NA |