单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 320 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2024-08-08 |
Identification and characterization of stem cells in mammalian esophageal stratified squamous epithelia
2022-11-17, Journal of molecular cell biology
IF:5.3Q2
DOI:10.1093/jmcb/mjac038
PMID:35709398
|
研究论文 | 本研究通过体内外实验，利用5-溴-2'-脱氧尿苷标记追踪、全基因组DNA甲基化和单细胞RNA测序技术，鉴定和表征了哺乳动物食管复层鳞状上皮中的干细胞群体 | 首次鉴定出食管复层鳞状上皮中含高水平的半桥粒（HDs）和低水平的Wnt信号的慢循环/静止干细胞群体，并揭示了HDs和Wnt信号在定义基底层干细胞中的关键作用 | NA | 探究食管复层鳞状上皮中干细胞的鉴定和表征 | 哺乳动物食管复层鳞状上皮中的干细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组DNA甲基化数据 | 使用大鼠进行体内外实验 |
| 302 | 2024-08-08 |
Antiretroviral therapy restores the homeostatic state of microglia in SIV-infected rhesus macaques
2022-11, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1002/JLB.3HI0422-635R
PMID:35686500
|
研究论文 | 本研究使用SIV感染的恒河猴模型，通过单细胞RNA测序、生物信息学和通路分析，探讨了联合抗逆转录病毒治疗（cART）对脑微胶质细胞稳态恢复的影响 | 本研究首次揭示了cART治疗能够恢复SIV感染恒河猴脑微胶质细胞的稳态，减少了炎症反应 | 研究仅限于SIV感染的恒河猴模型，尚未在人类中验证 | 测试联合抗逆转录病毒治疗是否能使SIV感染的脑微胶质细胞恢复到更接近稳态的状态 | SIV感染的恒河猴脑微胶质细胞 | NA | HIV/SIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | SIV感染的恒河猴脑微胶质细胞在不同条件下的样本 |
| 303 | 2024-08-08 |
Interferon-stimulated and metallothionein-expressing macrophages are associated with acute and chronic allograft dysfunction after lung transplantation
2022-11, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2022.05.005
PMID:35691795
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了稳定和急性肺同种异体移植物功能障碍（ALAD）患者的支气管肺泡灌洗细胞以及慢性肺同种异体移植物功能障碍（CLAD）的肺组织细胞，识别了与肺移植后急性及慢性功能障碍相关的特定巨噬细胞亚群。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术，揭示了肺移植后肺巨噬细胞的广泛异质性，并识别了与同种异体移植物功能障碍相关的特定巨噬细胞亚群，为治疗提供了潜在靶点。 | NA | 确定肺同种异体移植物功能障碍中的关键细胞元素，特别是巨噬细胞。 | 稳定和急性肺同种异体移植物功能障碍患者的支气管肺泡灌洗细胞以及慢性肺同种异体移植物功能障碍的肺组织细胞。 | 数字病理学 | 肺移植 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 细胞 | 稳定和ALAD患者的支气管肺泡灌洗细胞，以及4个慢性肺同种异体移植物功能障碍的肺组织细胞。 |
| 304 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing to explore composition of peripheral blood NK cells in patients with chronic myeloid leukemia in treatment-free remission
2022-11, Leukemia & lymphoma
IF:2.2Q3
DOI:10.1080/10428194.2022.2086243
PMID:35695125
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索治疗无复发生存期慢性髓性白血病患者外周血NK细胞的组成 | 首次通过单细胞RNA测序分析确定了在治疗无复发生存期慢性髓性白血病患者中，成熟和终末期、CD56亮和过渡期NK细胞亚群在维持无复发生存状态中的关键作用 | NA | 探索NK细胞亚群及其基因表达在维持治疗无复发生存状态中的作用 | 慢性髓性白血病患者的外周血NK细胞 | 数字病理学 | 慢性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括健康对照组和治疗无复发生存期患者的外周血单个核细胞 |
| 305 | 2024-08-08 |
Global characterization of megakaryocytes in bone marrow, peripheral blood, and cord blood by single-cell RNA sequencing
2022-11, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-022-00476-z
PMID:35650393
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，对骨髓、外周血和脐血中的巨核细胞（MK）进行了全局特征分析 | 发现了巨核细胞在不同来源中的分布差异及其与免疫功能和非小细胞肺癌的关联 | NA | 探究巨核细胞在不同来源中的异质性及其潜在功能 | 骨髓、外周血和脐血中的巨核细胞及其亚型 | 数字病理学 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 132个样本，包含1.2百万个单细胞转录组数据 |
| 306 | 2024-08-08 |
Genome architecture used to supplement species delineation in two cryptic marine ciliates
2022-Nov, Molecular ecology resources
IF:5.5Q1
DOI:10.1111/1755-0998.13664
PMID:35675173
|
研究论文 | 本研究旨在确定哪些分类学方法能够阐明两种隐秘纤毛虫物种之间的清晰且可量化的差异，并测试基因组结构作为新的诊断特征在区分其他无法区分的分类群中的效用。 | 本研究首次使用单细胞'组学分析（单细胞转录组学和基因组学）来阐明和比较两种隐秘纤毛虫物种之间的微核基因组结构模式，并设计了物种特异性引物作为独特的“结构条形码”。 | 本研究仅限于两种隐秘纤毛虫物种，且主要依赖于基因组结构分析，未涉及其他可能的分类学方法。 | 确定分类学方法的有效性，并测试基因组结构在区分隐秘纤毛虫物种中的应用。 | 两种隐秘纤毛虫物种Schmidingerella arcuata和Schmidingerella meunieri。 | 基因组学 | NA | 单细胞转录组学和基因组学 | NA | 基因组数据 | 两种纤毛虫物种的11种猎物处理中的9种无法区分生长反应。 |
| 307 | 2024-08-08 |
Periodontal tissue stem cells and mesenchymal stem cells in the periodontal ligament
2022-Nov, The Japanese dental science review
DOI:10.1016/j.jdsr.2022.04.001
PMID:35607404
|
综述 | 本文综述了牙周韧带中牙周组织干细胞和间充质干细胞的最新发现，并讨论了未来牙周再生治疗的研究方向 | 利用遗传谱系追踪、标记保留细胞鉴定和单细胞转录组分析等干细胞生物学进展，分析牙周韧带中的组织干细胞 | 牙周韧带中的组织干细胞尚未得到充分研究，可能与间充质干细胞不同 | 总结牙周韧带中干细胞群体的最新发现，并探讨牙周再生治疗的未来研究方向 | 牙周组织干细胞和牙周韧带中的间充质干细胞 | NA | NA | 遗传谱系追踪、标记保留细胞鉴定、单细胞转录组分析 | NA | NA | NA |
| 308 | 2024-08-08 |
A novel oncolytic virus induces a regional cytokine storm and safely eliminates malignant ascites of colon cancer
2022-11, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.4772
PMID:35510373
|
研究论文 | 本研究评估了溶瘤单纯疱疹病毒2型（OH2）是否能安全消除结肠癌恶性腹水及其通过何种特定机制发挥抗肿瘤免疫作用 | 发现OH2能通过诱导局部细胞因子风暴，主要通过IL-6过度分泌，安全消除结肠癌恶性腹水，并在早期抗肿瘤免疫反应中显著改变免疫微环境 | NA | 评估OH2安全消除结肠癌恶性腹水的能力及其抗肿瘤免疫的具体机制 | 结肠癌恶性腹水及其免疫微环境 | NA | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用CT26细胞建立腹水小鼠模型进行实验 |
| 309 | 2024-08-08 |
CHRNA5 Is Overexpressed in Patients with Psoriasis and Promotes Psoriasis-Like Inflammation in Mouse Models
2022-11, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2022.04.014
PMID:35513071
|
研究论文 | 本研究探讨了CHRNA5在银屑病发展及发病机制中的作用 | 首次证实CHRNA5在银屑病中的高表达，并揭示了CHRNA5敲除通过MAPK激酶激酶-1/c-Jun N端激酶‒MAPK/NF-κB通路调节炎症反应 | NA | 研究CHRNA5在银屑病中的作用及其机制 | 银屑病患者组织及咪喹莫特诱导的小鼠模型 | NA | 银屑病 | 单细胞测序 | NA | 组织样本 | 涉及银屑病患者组织及Chrna5敲除小鼠模型 |
| 310 | 2024-08-08 |
Viral receptor profiles of masked palm civet revealed by single-cell transcriptomics
2022-11, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2022.04.009
PMID:35490934
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 311 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq analysis of testicular somatic cell development in pigs
2022-11, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2022.03.014
PMID:35436608
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了关中黑猪在不同年龄阶段的睾丸体细胞发育情况 | 首次在分子水平上详细描述了猪睾丸体细胞的发育和成熟过程，并发现了Sertoli细胞的新标记基因PRND | 研究仅限于关中黑猪，且样本年龄点有限 | 探究猪睾丸体细胞在不同发育阶段的分子特征及其在精子发生中的作用 | 关中黑猪的睾丸体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 五个年龄段的关中黑猪睾丸样本 |
| 312 | 2024-08-08 |
YY1 safeguard multidimensional epigenetic landscape associated with extended pluripotency
2022-11-28, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac230
PMID:35425987
|
研究论文 | 本研究探讨了YY1在扩展多能干细胞（EPSCs）中的转录调控机制及其对表观遗传景观的影响 | 发现YY1在EPSCs中绑定到特定的开放染色质区域，其缺失导致基因表达模式更接近胚胎干细胞（ESCs），并触发一系列表观遗传交叉活动 | NA | 揭示YY1在扩展多能性相关的多维表观遗传交叉中的关键调节作用 | 扩展多能干细胞（EPSCs）和YY1蛋白 | 表观遗传学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 313 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals cell type diversity of human prostate
2022-11, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2022.03.009
PMID:35395421
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术分析了四种人前列腺组织的细胞组成 | 首次鉴定出18种具有独特基因表达特征和特性的细胞类型，并发现其中一种上皮细胞群与免疫功能相关 | NA | 揭示人类前列腺中细胞类型的多样性及其在前列腺疾病和癌症发展中的作用 | 人类前列腺组织中的细胞类型及其在前列腺癌发展中的作用 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 四种人前列腺组织 |
| 314 | 2024-08-08 |
Cellular heterogeneity and transcriptomic profiles during intrahepatic cholangiocarcinoma initiation and progression
2022-11, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1002/hep.32483
PMID:35340039
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了肝内胆管癌（ICC）在不同阶段的转录组特征，揭示了细胞异质性和关键调节因子在ICC起始和进展中的作用 | 首次揭示了锌指蛋白Zmiz1和Ybx1作为核心转录因子在应激反应和ICC增殖亚型中的作用，并证实了纤维母细胞-内皮细胞相互作用促进ICC发展的机制 | NA | 旨在揭示肝内胆管癌的起源、细胞异质性和关键调节因子在ICC起始和进展中的作用 | 肝内胆管癌（ICC）及其相关细胞类型 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 使用了AKT/Notch细胞内域诱导的小鼠ICC组织样本，包括早期、中期和晚期阶段 |
| 315 | 2024-08-08 |
Mapping the developing human cardiac endothelium at single-cell resolution identifies MECOM as a regulator of arteriovenous gene expression
2022-11-10, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvac023
PMID:35212715
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了人类胎儿心脏内皮细胞的转录组，揭示了内皮细胞亚型的多样性和转录动态，并识别出MECOM作为动静脉基因表达的调节因子 | 首次在单细胞分辨率下描绘了人类胎儿心脏内皮细胞的转录组，揭示了内皮细胞亚型的多样性和转录动态，并发现了MECOM在动静脉基因表达中的调节作用 | 研究主要基于人类胎儿心脏内皮细胞，未涉及成人心脏内皮细胞，且数据比较仅限于小鼠心脏发育 | 旨在通过单细胞RNA测序技术揭示人类胎儿心脏内皮细胞的细胞异质性和转录动态，以深入理解心脏血管发育 | 人类胎儿心脏内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过10,000个胎儿心脏内皮细胞 |
| 316 | 2024-08-08 |
Interleukin-23 receptor expressing γδ T cells locally promote early atherosclerotic lesion formation and plaque necrosis in mice
2022-11-10, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvab359
PMID:34897380
|
研究论文 | 研究探讨了白细胞介素-23受体（IL-23R）在γδ T细胞中的表达及其在动脉粥样硬化早期病变形成和斑块坏死中的作用。 | 首次详细研究了IL-23R在γδ T细胞中的表达及其在动脉粥样硬化中的具体作用。 | 研究主要在老鼠模型中进行，其结果在人类中的适用性需要进一步验证。 | 研究IL-23R在γδ T细胞中的表达及其在动脉粥样硬化中的作用，探索其作为治疗靶点的可能性。 | 主要研究对象为表达IL-23R的γδ T细胞和动脉粥样硬化病变。 | 心血管疾病 | 动脉粥样硬化 | scRNA-seq | NA | 细胞 | 使用了Ldlr-/-Il23rgfp/+和Ldlr-/-Tcrδ-/-两种基因改造的小鼠模型 |
| 317 | 2024-08-08 |
Effectively Clustering Single Cell RNA Sequencing Data by Sparse Representation
2022 Nov-Dec, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2021.3128576
PMID:34788219
|
研究论文 | 本文提出了一种新的单细胞RNA测序数据聚类方法SPARC，通过稀疏表示系数来测量细胞间的关系，并开发了一种异常值检测方法以辅助参数选择 | SPARC方法引入了一种新的相似性度量，利用每个细胞相对于其他细胞的稀疏表示系数来衡量细胞间的关系，并开发了异常值检测方法以帮助参数选择 | NA | 研究如何更有效地对单细胞RNA测序数据进行聚类分析 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 十二个真实数据集 |
| 318 | 2024-08-08 |
scCDG: A Method Based on DAE and GCN for scRNA-Seq Data Analysis
2022 Nov-Dec, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2021.3126641
PMID:34752401
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于去噪自编码器和图卷积网络的单细胞RNA测序数据分析方法scCDG | 提出了一种新的方法scCDG，结合去噪自编码器和图卷积网络，有效处理单细胞RNA测序数据中的大量噪声 | NA | 旨在改进单细胞RNA测序数据的细胞类型识别和聚类分析 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | DAE, GCN | RNA测序数据 | 七个真实单细胞RNA测序数据集 |
| 319 | 2024-08-08 |
Heterogeneity and Molecular Markers for CNS Glial Cells Revealed by Single-Cell Transcriptomics
2022-Nov, Cellular and molecular neurobiology
IF:3.6Q2
DOI:10.1007/s10571-021-01159-3
PMID:34704168
|
综述 | 本文综述了通过单细胞转录组学技术揭示的中枢神经系统（CNS）胶质细胞的异质性和分子标志物 | 利用单细胞测序技术（scRNA-seq）从转录组层面扩展了对胶质细胞异质性的理解 | NA | 总结CNS中主要胶质细胞的标志基因，并揭示其在不同物种、CNS区域、发育阶段和病理状态下的异质性 | 中枢神经系统中的胶质细胞，包括星形胶质细胞、少突胶质细胞和微胶质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | NA |
| 320 | 2024-08-08 |
Accurate Estimation of Single-Cell Differentiation Potency Based on Network Topology and Gene Ontology Information
2022 Nov-Dec, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2021.3112951
PMID:34529570
|
研究论文 | 本文提出了一种新的中心性度量方法NCG，结合网络拓扑属性和基因本体功能相似性分数来估计单细胞的分化潜能 | NCG度量方法结合了网络拓扑特性和基因功能信息，提高了单细胞分化潜能估计的可靠性和鲁棒性 | NA | 开发一种新的方法来准确估计单细胞的分化潜能 | 单细胞的分化潜能 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因本体信息 | NA |