单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 320 篇文献，本页显示第 281 - 300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2024-08-08 |
Uptake of Staphylococcus aureus by keratinocytes is reduced by interferon-fibronectin pathway and filaggrin expression
2022-Nov, The Journal of dermatology
IF:2.9Q2
DOI:10.1111/1346-8138.16546
PMID:35983802
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研究论文 | 研究探讨了金黄色葡萄球菌（S. aureus）在特应性皮炎（AD）患者皮肤中的吸收机制，以及干扰素-纤维连接蛋白途径和丝聚合蛋白表达对角质形成细胞吸收金黄色葡萄球菌的影响。 | 首次揭示了干扰素-γ通过调节纤维连接蛋白和丝聚合蛋白表达，影响角质形成细胞对AD型金黄色葡萄球菌的吸收。 | 研究仅限于细胞水平，未涉及体内实验，且样本量较小。 | 阐明金黄色葡萄球菌在特应性皮炎患者皮肤中的吸收机制及其影响因素。 | 金黄色葡萄球菌、角质形成细胞（HaCaT细胞）、干扰素-γ、白细胞介素-4、白细胞介素-13。 | NA | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 约100个细胞 |
| 282 | 2024-08-08 |
Construction of the prognostic enhancer RNA regulatory network in osteosarcoma
2022-Nov, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2022.101499
PMID:36001923
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研究论文 | 本文构建了基于增强子RNA的预测骨肉瘤患者预后的模型，并探索了骨肉瘤发病机制的相关调控网络 | 首次构建了基于增强子RNA的骨肉瘤预后预测模型，并整合生物信息学分析探索了骨肉瘤发病机制的潜在调控网络 | NA | 预测骨肉瘤患者的预后并探索骨肉瘤发病机制的调控网络 | 骨肉瘤中的差异表达增强子RNA、转录因子及其靶基因 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | limma包（线性模型用于微阵列分析） | 多元风险预测模型 | RNA | 3,981个差异表达靶基因，468个差异表达增强子RNA，51个差异表达转录因子，27个差异表达标志性基因集 |
| 283 | 2024-08-08 |
Comprehensive identification of immuno-related transcriptional signature for active pulmonary tuberculosis by integrated analysis of array and single cell RNA-seq
2022-11, The Journal of infection
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.jinf.2022.08.017
PMID:36007657
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研究论文 | 本文通过综合分析阵列和单细胞RNA测序数据，全面识别了活动性肺结核的免疫相关转录特征，并探索了潜在的诊断标记物。 | 本文首次结合阵列和单细胞RNA测序技术，筛选出与结核病高度相关的三个关键免疫相关枢纽基因，并验证了ADM基因在结核病患者中的显著表达增加。 | 研究样本量较小，需要进一步在大规模队列中验证。 | 旨在识别活动性肺结核的免疫相关转录特征，并探索潜在的诊断标记物。 | 研究对象包括结核病、潜伏性结核感染和健康对照的血液样本。 | 数字病理学 | 肺结核 | 阵列和单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及成人和儿童的结核病、潜伏性结核感染和健康对照的血液样本 |
| 284 | 2024-08-08 |
Characterizing the role of the immune microenvironment in multiple myeloma progression at a single-cell level
2022-11-22, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2022007217
PMID:35977111
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析骨髓细胞，研究多发性骨髓瘤进展中的免疫微环境变化 | 本文结合先前发表的数据集，识别了疾病进展中免疫细胞群的一致性变化 | 患者间细胞群的内在变异性和样本处理及分析方法的差异 | 揭示多发性骨髓瘤从前期阶段到临床阶段进展中的免疫变化，以开发基于免疫的策略 | 骨髓细胞中的免疫细胞群 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 来自前期阶段、意义未明的单克隆γ病、隐匿性多发性骨髓瘤和初诊多发性骨髓瘤的骨髓细胞 |
| 285 | 2024-08-08 |
m6A is required for resolving progenitor identity during planarian stem cell differentiation
2022-11-02, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2021109895
PMID:35971838
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研究论文 | 本文研究了m6A修饰在扁形虫干细胞（neoblasts）分化中的作用，发现m6A对于正确的细胞命运选择和细胞成熟至关重要 | 本文首次揭示了m6A修饰在扁形虫干细胞分化中的关键作用，并发现了m6A与染色质修饰之间的未被重视的联系 | NA | 探究m6A修饰在扁形虫干细胞分化和组织维持中的作用 | 扁形虫干细胞（neoblasts）及其分化过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 超过20,000个细胞和1,000个扁形虫基因表达数据集 |
| 286 | 2024-08-08 |
Identification of Quiescent LGR5+ Stem Cells in the Human Colon
2022-11, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2022.07.081
PMID:35963362
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和基因工程技术，揭示了人类结肠中静止状态的LGR5+干细胞的存在及其在损伤后再生中的作用 | 首次揭示了人类结肠中存在非分裂的LGR5+干细胞，并阐明了其在稳态和损伤后的功能 | NA | 探究人类结肠干细胞在稳态和再生过程中的行为 | 人类和鼠类结肠上皮细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序，基因工程 | NA | RNA | 涉及人类和鼠类的结肠上皮细胞样本 |
| 287 | 2024-08-08 |
A novel high-risk subpopulation identified by CTSL and ZBTB7B in gastric cancer
2022-11, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-022-01936-x
PMID:35941174
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研究论文 | 本研究通过分析胃癌中的CTSL和ZBTB7B基因表达，识别出一个新的高风险亚群，并探讨了其与肿瘤微环境的关系 | 开发了一种基于两个基因的新型肿瘤微环境分子亚型系统，简化了以往复杂的基因签名和检测方法 | NA | 旨在通过简化分子亚型系统，提高胃癌治疗的临床应用性 | 胃癌患者及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序，定量RT-PCR，免疫化学/免疫荧光染色 | NA | 组织或单细胞水平的数据 | 超过2000名患者的数据 |
| 288 | 2024-08-08 |
Clonal germinal center B cells function as a niche for T-cell lymphoma
2022-11-03, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2022015451
PMID:35921527
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研究论文 | 研究使用小鼠模型和人类样本，探讨了TET2突变免疫细胞如何促进血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤（AITL）的发展 | 首次揭示了TET2突变免疫细胞作为AITL发展的生态位，并通过单细胞RNA测序和计算机网络分析，识别了CD40-CD40LG轴在GCB细胞和肿瘤细胞集群交互中的潜在作用 | NA | 探究TET2突变免疫细胞在AITL发展中的机制 | 小鼠模型和人类AITL样本 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 超过50,000个细胞 |
| 289 | 2024-08-08 |
Analyzing the gene regulatory network in hepatitis B patients by single-cell ATAC sequencing
2022-Nov, Clinical rheumatology
IF:2.9Q2
DOI:10.1007/s10067-022-06310-z
PMID:35902485
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研究论文 | 本研究通过单细胞ATAC测序分析慢性乙型肝炎患者的基因调控网络，以揭示其病理生理机制 | 首次使用单细胞ATAC测序技术分析慢性乙型肝炎患者的基因调控网络，为理解疾病发展提供了新的视角 | NA | 旨在通过分析慢性乙型肝炎患者的基因调控网络，揭示其病理生理机制 | 慢性乙型肝炎患者的基因调控网络 | 数字病理学 | 乙型肝炎 | 单细胞ATAC测序 | NA | 基因组数据 | 8016个细胞 |
| 290 | 2024-08-08 |
The scINSIGHT Package for Integrating Single-Cell RNA-Seq Data from Different Biological Conditions
2022-11, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2022.0244
PMID:35920848
|
研究论文 | 介绍了一种名为scINSIGHT的新型单细胞RNA测序数据整合方法及其R包的使用 | scINSIGHT基于一种新颖的非负矩阵分解模型，能够学习不同生物或实验条件下样本中的共同和条件特异性基因模块 | NA | 改进多单细胞样本的整合，识别细胞身份和不同细胞类型或条件下的活跃生物过程 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解 | 基因表达数据 | 多个单细胞样本 |
| 291 | 2024-08-08 |
Identification of an FXR-modulated liver-intestine hybrid state in iPSC-derived hepatocyte-like cells
2022-11, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2022.07.009
PMID:35863491
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研究论文 | 本文通过单细胞和批量RNA测序技术，研究了人诱导多能干细胞（hiPSC）衍生的肝细胞样细胞（HLC）的基因表达模式，并探讨了核受体FXR在HLC功能成熟中的作用 | 发现HLC在单细胞层面表现出一种混合状态，同时表达肝细胞相关基因和肠道基因，并通过FXR表达和激动剂暴露增强了HLC与人类原代肝细胞（PHH）的相似性 | 尽管FXR表达和激动剂暴露能够减少非肝脏基因的表达，但这种减少仅是适度的 | 旨在改善HLC的分化，使其更接近PHH，以用于药物筛选、毒理学和细胞替代疗法 | 人诱导多能干细胞衍生的肝细胞样细胞 | 干细胞研究 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 292 | 2024-08-08 |
The kidney matrisome in health, aging, and disease
2022-11, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2022.06.029
PMID:35870643
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综述 | 本文综述了肾脏基质组在健康、衰老和疾病中的作用 | 通过先进的质谱技术揭示了衰老和疾病中基质组成的分子细节，并探讨了基质变化对物理特性和细胞反应的影响 | 仍存在关于驱动基质组成改变的机制的关键问题 | 理解基质动态过程，以开发对抗基质失调的治疗方法 | 肾脏基质组在健康、衰老和疾病中的作用 | NA | NA | 质谱技术 | NA | 蛋白质组数据 | NA |
| 293 | 2024-08-08 |
Multidimensional Immunophenotyping of Intraductal Papillary Mucinous Neoplasms Reveals Novel T Cell and Macrophage Signature
2022-Nov, Annals of surgical oncology
IF:3.4Q1
DOI:10.1245/s10434-022-12157-0
PMID:35831529
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研究论文 | 本文通过空间转录组学和流式细胞术技术，全面分析了导管内乳头状粘液性肿瘤（IPMN）中的免疫细胞浸润情况 | 发现了IPMN中T细胞和巨噬细胞的新型特征，并揭示了这些细胞在不同程度异型增生区域中的分布差异 | 研究样本量较小，仅包括12名患者的IPMN组织 | 探究导管内乳头状粘液性肿瘤（IPMN）向癌症进展过程中的免疫细胞浸润情况 | 导管内乳头状粘液性肿瘤（IPMN）及其不同程度异型增生区域中的免疫细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学, 流式细胞术 | NA | 转录组数据 | 12名患者的IPMN组织 |
| 294 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic profiling to evaluate the effects of Di(2-ethylhexyl)phthalate exposure on early meiosis of female mouse germ cells
2022-Nov, Chemosphere
IF:8.1Q1
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了母体暴露于邻苯二甲酸二(2-乙基己基)酯(DEHP)后，胎鼠在胚胎第12.5天和第14.5天的卵巢，探讨DEHP对雌性小鼠生殖细胞早期减数分裂的影响。 | 首次通过单细胞转录组测序技术揭示DEHP暴露激活了生殖细胞中与DNA修复相关的通路，增加了DNA损伤相关基因的表达，并改变了生殖细胞的发育轨迹。 | 研究仅限于胎鼠的特定胚胎阶段，且未探讨DEHP对成年小鼠生殖细胞的影响。 | 探讨DEHP暴露对雌性小鼠生殖细胞早期减数分裂分子机制的影响。 | 雌性小鼠的生殖细胞及DEHP暴露对其的影响。 | 数字病理学 | 生殖健康问题 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 胎鼠卵巢样本 |
| 295 | 2024-08-08 |
PTX3 mediates the infiltration, migration, and inflammation-resolving-polarization of macrophages in glioblastoma
2022-11, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.13913
PMID:35855654
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研究论文 | 本文探讨了PTX3在胶质母细胞瘤中对巨噬细胞浸润、迁移和炎症消解极化的作用 | 首次阐明了PTX3在胶质瘤肿瘤微环境中对免疫系统的调节作用 | NA | 研究PTX3在胶质母细胞瘤中的免疫调节作用 | PTX3在胶质母细胞瘤中的表达及其对巨噬细胞功能的影响 | 数字病理学 | 脑癌 | RNA测序, 单细胞测序, 免疫组化 | NA | 基因表达数据, 单细胞数据, 组织切片 | 60个湘雅队列的胶质瘤样本 |
| 296 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic atlas reveals distinct immunological responses between COVID-19 vaccine and natural SARS-CoV-2 infection
2022-11, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.28012
PMID:35859327
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了接种CoronaVac疫苗与自然感染SARS-CoV-2后免疫反应的差异 | 首次揭示了灭活COVID-19疫苗与SARS-CoV-2感染在免疫细胞类型比例、B细胞激活分化及基因表达等方面的不同反应 | 研究样本量较小，仅包括六名接种疫苗的个体和来自单细胞联盟的COVID-19感染患者 | 探究灭活COVID-19疫苗与SARS-CoV-2感染在免疫反应上的差异 | 接种CoronaVac疫苗的个体和SARS-CoV-2感染患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 六名接种疫苗的个体和COVID-19感染患者 |
| 297 | 2024-08-08 |
Diet triggers specific responses of hypothalamic astrocytes in time and region dependent manner
2022-11, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24237
PMID:35802021
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研究论文 | 本研究探讨了高脂肪高糖饮食对下丘脑弓状核（ARC）星形胶质细胞的分子响应，特别是它们在不同时间点的转录组和蛋白质组变化 | 通过单细胞测序和多组学分析，揭示了高脂肪高糖饮食对下丘脑星形胶质细胞的时间和细胞特异性转录组响应，以及空间和分子特征的变化 | NA | 研究高热量饮食对下丘脑星形胶质细胞的分子响应及其时空变化 | 下丘脑弓状核的星形胶质细胞 | NA | NA | RNA测序，蛋白质组学，单细胞测序 | NA | RNA序列，蛋白质数据 | 具体样本数量未明确提及 |
| 298 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome atlas reveals developmental trajectories and a novel metabolic pathway of catechin esters in tea leaves
2022-11, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.13891
PMID:35810348
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研究论文 | 本文通过建立快速原生质体分离方法，研究了16,977个单细胞的转录组，揭示了茶树叶中儿茶素酯的发育轨迹和新陈代谢途径。 | 首次报道了木本作物叶片的单细胞转录组图谱，并发现了植物中儿茶素酯的新陈代谢途径。 | NA | 揭示茶树叶中儿茶素酯的形成机制及其在不同细胞类型中的分布。 | 茶树的1st和3rd叶片的单细胞转录组。 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 16,977个单细胞 |
| 299 | 2024-08-08 |
Comparison of human skin- and nerve-derived Schwann cells reveals many similarities and subtle genomic and functional differences
2022-11, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24242
PMID:35796321
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研究论文 | 比较人皮肤来源和神经来源的施万细胞，揭示了许多相似之处和细微的基因组及功能差异 | 使用单细胞RNA测序和一系列体外及体内实验，探索了皮肤来源和神经来源施万细胞的功能差异 | 文章未提及具体的局限性 | 提高从小块皮肤样本中获取施万细胞的可靠性和特异性，并探索皮肤来源和神经来源施万细胞的功能差异 | 皮肤来源的施万细胞和神经来源的施万细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 |
| 300 | 2024-08-08 |
Soluble TREM2 levels reflect the recruitment and expansion of TREM2+ macrophages that localize to fibrotic areas and limit NASH
2022-11, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2022.06.004
PMID:35750138
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研究论文 | 本研究探讨了骨髓来源的TREM2表达巨噬细胞在非酒精性脂肪性肝炎（NASH）中的功能作用 | 发现系统性可溶性TREM2水平在NASH中的临床相关性，并揭示了TREM2+巨噬细胞在肝纤维化区域的定位及其对NASH的限制作用 | NA | 功能性地表征骨髓来源的TREM2表达巨噬细胞在NASH中的作用 | TREM2表达的巨噬细胞及其在NASH中的功能 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪性肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及小鼠和人类临床队列 |