单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 320 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome profiling reveals heterogeneous neutrophils with prognostic values in sepsis
2022-Nov-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105301
PMID:36304125
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术对近300,000个人类外周血细胞进行转录组分析，揭示了具有预后价值的异质性中性粒细胞 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细划分了中性粒细胞的四种亚型，并发现其中一种亚型Neu1与脓毒性休克显著相关，其基因表达模块Neu1_C具有高预测性 | NA | 研究中性粒细胞在脓毒症中的异质性及其作为预后生物标志物的潜力 | 人类外周血细胞中的中性粒细胞 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 近300,000个人类外周血细胞 |
| 222 | 2024-08-08 |
Adult human kidney organoids originate from CD24+ cells and represent an advanced model for adult polycystic kidney disease
2022-11, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01202-z
PMID:36303074
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研究论文 | 本文报道了成人肾脏类器官来源于CD24+细胞，并展示了其在成人多囊肾病模型中的高级应用 | 首次揭示了成人肾脏类器官（tubuloids）来源于特定的CD24上皮亚群，并展示了其在模拟常染色体显性多囊肾病（ADPKD）中的应用 | NA | 研究成人肾脏类器官的细胞起源及其在成人多囊肾病模型中的应用 | 成人肾脏类器官（tubuloids）及其在成人多囊肾病中的应用 | 数字病理学 | 多囊肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 涉及CRISPR-Cas9基因编辑的PKD1和PKD2敲除类器官以及人类ADPKD和对照组织 |
| 223 | 2024-08-08 |
Characterization of the tumour microenvironment phenotypes in malignant tissues and pleural effusion from advanced osteoblastic osteosarcoma patients
2022-11, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1072
PMID:36305631
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了晚期成骨性骨肉瘤患者恶性组织和胸腔积液中的肿瘤微环境表型 | 首次提供了晚期成骨性骨肉瘤患者胸腔积液和原发肿瘤的细胞图谱 | NA | 探究成骨性骨肉瘤患者胸腔积液中的细胞环境，并寻找潜在的治疗靶点 | 成骨性骨肉瘤患者的胸腔积液和肿瘤组织 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 27,260个细胞来自7个胸腔积液样本，91,186个细胞来自8个骨肉瘤组织样本 |
| 224 | 2024-08-08 |
Identification of MRAP protein family as broad-spectrum GPCR modulators
2022-11, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1091
PMID:36314066
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，揭示了MRAP蛋白家族作为广谱GPCR调节因子的作用，并重新定义了其在两个主要内分泌器官中的复杂GPCR网络。 | 本研究首次全面阐明了MRAP蛋白家族在两个主要内分泌器官中的复杂GPCR网络，并重新定义了MRAP蛋白家族作为广谱GPCR调节因子的作用。 | NA | 研究MRAP蛋白家族在两个主要内分泌器官中的GPCR调节作用。 | MRAP1和MRAP2蛋白及其在GPCR调节中的作用。 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | RNA-seq | 涉及人鼠组织的多组RNA-seq数据和单细胞数据 |
| 225 | 2024-08-08 |
Identification of a rare Gli1+ progenitor cell population contributing to liver regeneration during chronic injury
2022-Nov-01, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-022-00474-3
PMID:36316325
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研究论文 | 本文识别了一种罕见的Gli1+前体细胞群，该细胞群在慢性肝损伤期间有助于肝再生 | 发现了一种新的双表型细胞群EpCAMGli1，该细胞群具有上皮和间充质双重身份，并能促进肝细胞再生 | NA | 研究慢性肝损伤后肝细胞再生的新来源 | Gli1+前体细胞群及其在肝再生中的作用 | NA | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 226 | 2024-08-08 |
Consecutive BNT162b2 mRNA vaccination induces short-term epigenetic memory in innate immune cells
2022-11-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.163347
PMID:36282593
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研究论文 | 本研究探讨了BNT162b2 mRNA疫苗接种后先天免疫细胞的表观遗传记忆效应 | 首次揭示了BNT162b2 mRNA疫苗接种后先天免疫细胞的表观遗传变化及其短暂性 | 研究仅关注了接种后4周内的表观遗传变化，未探讨更长时间的影响 | 探究BNT162b2 mRNA疫苗接种后先天免疫反应的表观遗传调控及其持久性 | 先天免疫细胞，特别是单核细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 质谱流式细胞术、RNA-Seq、ATAC-Seq | NA | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 227 | 2024-08-08 |
Genome-wide Mendelian randomization and single-cell RNA sequencing analyses identify the causal effects of COVID-19 on 41 cytokines
2022-11-17, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elac033
PMID:36281737
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研究论文 | 本研究通过整合COVID-19和41种细胞因子的全基因组关联研究数据，采用孟德尔随机化分析方法，确定了COVID-19对某些细胞因子的因果效应，并利用单细胞RNA测序数据探讨了潜在的分子机制 | 本研究首次结合孟德尔随机化和单细胞RNA测序技术，揭示了COVID-19对特定细胞因子的因果效应及其分子机制 | 研究仅分析了41种细胞因子，可能未涵盖所有与COVID-19相关的细胞因子 | 探讨COVID-19对细胞因子的因果效应及其分子机制 | COVID-19患者中的41种细胞因子及其分子机制 | 基因组学 | COVID-19 | 孟德尔随机化分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据，单细胞RNA数据 | 涉及COVID-19患者和41种细胞因子的样本 |
| 228 | 2024-08-08 |
Histone Lactylation Boosts Reparative Gene Activation Post-Myocardial Infarction
2022-11-11, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.122.320488
PMID:36268709
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研究论文 | 本研究探讨了心肌梗死后组蛋白乳酸化在修复基因表达中的作用 | 首次揭示了组蛋白乳酸化在心肌梗死后早期和远程激活修复基因表达中的作用 | NA | 研究组蛋白乳酸化在心肌梗死后修复反应中的作用 | 心肌梗死后的单核细胞和巨噬细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序、Western blotting、免疫荧光染色、CUT&Tag、RNA-seq、染色质免疫沉淀-qPCR、逆转录-qPCR | NA | 转录组数据 | NA |
| 229 | 2024-08-08 |
Deciphering the roadmap of in vivo reprogramming toward pluripotency
2022-11-08, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2022.09.009
PMID:36270281
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析胰腺细胞在重编程过程中的标记物，揭示了从腺泡细胞到多能性的轨迹 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别了胰腺细胞重编程过程中的中间状态标记物，并发现这些标记物在胃、结肠和培养的成纤维细胞中也存在 | NA | 揭示体内重编程向多能性转变的路径 | 胰腺细胞重编程过程中的细胞状态和标记物 | 干细胞研究 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 230 | 2024-08-08 |
Profiling transcriptional heterogeneity of epithelium, fibroblasts, and immune cells in esophageal squamous cell carcinoma by single-cell RNA sequencing
2022-11, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202200898R
PMID:36260317
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了食管鳞状细胞癌中的上皮细胞、成纤维细胞和免疫细胞的转录异质性 | 揭示了肿瘤内和肿瘤间上皮细胞的异质性，以及成纤维细胞亚型在食管鳞状细胞癌进展中的重要作用 | NA | 深入理解食管鳞状细胞癌的复杂肿瘤微环境和细胞异质性 | 食管鳞状细胞癌中的上皮细胞、成纤维细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 25,796个免疫细胞和8,197个非免疫细胞来自三个原发性肿瘤和配对正常样本 |
| 231 | 2024-08-08 |
Shared and distinct biological circuits in effector, memory and exhausted CD8+ T cells revealed by temporal single-cell transcriptomics and epigenetics
2022-11, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-022-01338-4
PMID:36271148
|
研究论文 | 本文通过时间序列单细胞转录组学和表观遗传学分析，揭示了效应性、记忆性和耗竭性CD8+ T细胞中的共享和独特生物电路 | 发现了新的T细胞亚群，包括表达自然杀伤细胞相关基因的亚群和多个独特的TCF-1干细胞/祖细胞样亚群，并揭示了PD-1通路阻断后T细胞亚群的重塑 | NA | 阐明CD8+ T细胞发育路径中的分子电路及其异质性 | 效应性、记忆性和耗竭性CD8+ T细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 232 | 2024-08-08 |
Geometric engineering of organoid culture for enhanced organogenesis in a dish
2022-11, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-022-01643-8
PMID:36280722
|
research paper | 本文介绍了一种简便且可扩展的工程方法，用于促进长期器官发生和器官成熟。 | 重新设计了传统的器官培养配置，开发了一个平台，可以将单次注射的干细胞悬液转化为可以长期维持的放射状器官阵列，无需传代。 | NA | 开发一种平台技术，用于在体外工程化更真实的类器官结构。 | 肠道器官、炎症性肠病（IBD）患者来源的器官模型、血管化可灌注的人体肠样。 | digital pathology | inflammatory bowel disease | single-cell RNA sequencing | NA | organoid | NA |
| 233 | 2024-08-08 |
ClampFISH 2.0 enables rapid, scalable amplified RNA detection in situ
2022-11, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-022-01653-6
PMID:36280724
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为clampFISH 2.0的方法，该方法通过倒置的padlock设计，能够高效检测多种RNA种类并同时指数级放大其信号，同时减少了时间成本 | clampFISH 2.0方法通过倒置的padlock设计，实现了对多种RNA种类的高效检测和信号指数级放大，同时减少了时间和成本 | NA | 开发一种能够快速、可扩展地检测RNA并放大信号的新方法 | 多种RNA种类及其在单细胞中的表达水平 | NA | NA | clampFISH 2.0 | NA | RNA | 超过100万细胞 |
| 234 | 2024-08-08 |
Differential plasticity and fate of brain-resident and recruited macrophages during the onset and resolution of neuroinflammation
2022-11-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2022.09.005
PMID:36228615
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研究论文 | 本研究探讨了神经炎症发生和消退过程中，大脑常驻和招募的巨噬细胞的命运和可塑性 | 揭示了大脑常驻巨噬细胞和招募巨噬细胞在感染和疾病消退过程中的不同反应和动态变化 | NA | 研究神经炎症过程中大脑常驻和招募巨噬细胞的命运和可塑性 | 大脑常驻的微胶质细胞、边界相关巨噬细胞（BAMs）和招募的巨噬细胞 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达 | NA |
| 235 | 2024-08-08 |
Molecular pathology of Usher 1B patient-derived retinal organoids at single cell resolution
2022-11-08, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2022.09.006
PMID:36240775
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研究论文 | 本研究分析了从Usher 1B患者诱导的多能干细胞生成的3D视网膜类器官，以单细胞分辨率揭示了MYO7A突变相关的视网膜色素变性的分子病理机制。 | 首次使用患者来源的视网膜类器官模型，揭示了Usher 1B相关视网膜色素变性的分子机制，特别是MYO7A在杆状光感受器和Müller胶质细胞中的表达及其对细胞死亡的防御机制。 | 研究仅限于单一患者来源的类器官，可能需要更多样本以验证结果的普遍性。 | 揭示Usher 1B相关视网膜色素变性的分子病理机制，为开发治疗策略提供基础。 | 从Usher 1B患者诱导的多能干细胞生成的3D视网膜类器官。 | 数字病理学 | 视网膜色素变性 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 单一患者来源的视网膜类器官 |
| 236 | 2024-08-08 |
CCR2 is expressed by tendon resident macrophage and T cells, while CCR2 deficiency impairs tendon healing via blunted involvement of tendon-resident and circulating monocytes/macrophages
2022-11, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202201162R
PMID:36250393
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研究论文 | 本研究探讨了趋化因子受体2（CCR2）在肌腱愈合中的作用，特别是在肌腱驻留巨噬细胞和T细胞中的表达及其缺乏对肌腱愈合的影响 | 首次揭示了CCR2在成年稳态和愈合过程中在肌腱中的存在，并通过单细胞RNA测序确定了这些细胞为肌腱驻留巨噬细胞和T细胞 | NA | 阐明肌腱驻留与循环来源巨噬细胞的功能差异 | CCR2报告和敲除小鼠的肌腱愈合表型 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | CCR2报告和敲除小鼠 |
| 237 | 2024-08-08 |
Integrative transcriptome analysis reveals TEKT2 and PIAS2 involvement in diabetic nephropathy
2022-11, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202200740RR
PMID:36251411
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研究论文 | 本文通过整合大量和单细胞转录组数据集，揭示了与糖尿病肾病（DN）发展相关的TEKT2和PIAS2基因的作用机制 | 首次通过整合大量和单细胞转录组数据，发现并验证了TEKT2和PIAS2基因在糖尿病肾病中的作用 | NA | 揭示糖尿病肾病的新机制，特别是在足细胞中的作用 | 糖尿病肾病患者和糖尿病小鼠的肾脏组织 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | 4个肾小球和4个肾小管数据集 |
| 238 | 2024-08-08 |
SCOTv2: Single-Cell Multiomic Alignment with Disproportionate Cell-Type Representation
2022-Nov, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2022.0270
PMID:36251763
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研究论文 | 本文介绍了SCOTv2方法，用于处理单细胞多组学数据中细胞类型不均衡的问题，通过使用不平衡的Gromov-Wasserstein最优传输进行单细胞对齐 | SCOTv2方法通过使用不平衡的Gromov-Wasserstein最优传输，有效处理了单细胞实验中细胞类型不均衡和样本大小差异的问题 | NA | 开发一种新的单细胞多组学数据对齐方法，以解决现有算法在非共测序单细胞实验中表现不佳的问题 | 单细胞多组学数据的对齐 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | 最优传输 | 单细胞数据 | 五个非共测序数据集（模拟和真实世界） |
| 239 | 2024-08-08 |
GM-CSF-activated human dendritic cells promote type 1 T follicular helper cell polarization in a CD40-dependent manner
2022-11-01, Journal of cell science
IF:3.3Q3
DOI:10.1242/jcs.260298
PMID:36254574
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和蛋白质验证，发现GM-CSF激活的人类树突状细胞能够促进幼稚CD4+ T细胞向Tfh1细胞分化 | 首次揭示了GM-CSF激活的树突状细胞通过CD40依赖性方式促进Tfh1细胞分化的细胞和分子机制 | NA | 探究人类Tfh1细胞分化的细胞和分子要求 | 人类血液中的CD1c+树突状细胞和幼稚CD4+ T细胞 | 免疫学 | 感染性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及COVID-19轻症患者和潜伏性结核感染患者的血液样本 |
| 240 | 2024-08-08 |
scHiCPTR: unsupervised pseudotime inference through dual graph refinement for single-cell Hi-C data
2022-11-30, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac670
PMID:36205615
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研究论文 | 本文介绍了scHiCPTR，一种基于图的无监督流程，用于从单细胞Hi-C接触矩阵中推断伪时间 | scHiCPTR通过双图优化过程优化图结构，有助于减少噪声导致的虚假细胞连接，并确定全局发育方向性 | NA | 研究如何利用单细胞Hi-C接触矩阵构建伪时间路径，以沿着发育轨迹对细胞进行排序 | 单细胞Hi-C接触矩阵 | 生物信息学 | NA | 单细胞Hi-C技术 | 图模型 | 矩阵数据 | NA |