单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 320 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 221 | 2024-08-08 |
Integration of single-cell transcriptome and chromatin accessibility of early gonads development among goats, pigs, macaques, and humans
2022-11-01, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111587
PMID:36323261
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研究论文 | 本文通过整合单细胞转录组和染色质可及性分析，研究了山羊、猪、猕猴和人类早期性腺发育中的原始生殖细胞（PGCs）和体细胞的调控特征 | 本文首次在非啮齿动物和人类中整合单细胞转录组和染色质可及性分析，揭示了进化保守和物种特异性的基因表达、信号通路和细胞间相互作用 | NA | 研究非啮齿动物和人类早期性腺发育中的关键标记物和调控特征 | 山羊、猪、猕猴和人类的早期性腺 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析，染色质可及性分析 | NA | 转录组数据，染色质可及性数据 | 山羊、猪、猕猴和人类的早期性腺样本 | NA | NA | NA | NA |
| 222 | 2024-08-08 |
[Bioinformatics analysis of the molecular mechanism of Qibaipingfei Capsule in the regulation of chronic obstructive pulmonary disease related immune cells]
2022-Nov, Xi bao yu fen zi mian yi xue za zhi = Chinese journal of cellular and molecular immunology
PMID:36328424
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研究论文 | 通过分析慢性阻塞性肺疾病（COPD）肺组织单细胞转录组测序（scRNA-seq）数据和七白平肺胶囊的药理作用，探讨七白平肺胶囊调节COPD相关免疫细胞的分子机制 | 构建了“活性分子-免疫细胞-靶基因”网络，并利用GO、KEGG和PPI分析了靶基因的分子机制 | NA | 探究七白平肺胶囊调节COPD相关免疫细胞的分子机制 | 七白平肺胶囊对COPD相关免疫细胞的影响 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 223 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing analysis reveals the relationship of bone marrow and osteopenia in STZ-induced type 1 diabetic mice
2022-11, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2022.01.006
PMID:36328744
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了STZ诱导的1型糖尿病小鼠骨髓细胞与骨质疏松之间的关系 | 首次通过单细胞RNA测序分析揭示了STZ诱导的1型糖尿病小鼠骨髓免疫细胞的特征和异质性 | NA | 旨在展示骨髓细胞的特征并揭示骨髓与骨质疏松在STZ诱导的1型糖尿病小鼠中的关系 | 健康小鼠和STZ诱导的1型糖尿病小鼠的骨髓细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从健康小鼠和STZ诱导的1型糖尿病小鼠的股骨和胫骨中收集的骨髓细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 224 | 2024-08-08 |
Imaging-based spatial transcriptomics goes electric
2022-11, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-022-01678-x
PMID:36329278
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 225 | 2024-08-08 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal the fibrosis-related immune landscape of biliary atresia
2022-11, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1070
PMID:36333281
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，探讨了胆道闭锁（BA）中纤维化相关的免疫景观 | 首次揭示了胆道闭锁肝脏纤维化微环境中富集的免疫细胞亚群及其关键相关通路和分子 | NA | 研究胆道闭锁中炎症和纤维化之间的关系 | 胆道闭锁患者和对照组的肝脏样本 | 数字病理学 | 胆道疾病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 14个样本（胆道闭锁：6个；对照：8个） | NA | NA | NA | NA |
| 226 | 2024-08-08 |
The transcriptional profile of keloidal Schwann cells
2022-11, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-022-00874-1
PMID:36333467
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研究论文 | 本研究重新分析了已发表的单细胞RNA测序（scRNA-seq）研究中的瘢痕瘤、健康皮肤和正常疤痕数据，以更详细地确定瘢痕瘤特异性施万细胞类型的特定基因表达谱 | 确认了修复样、促纤维化施万细胞类型在所有三个研究数据集中的存在，并识别了这些施万细胞的特定基因集 | NA | 确定瘢痕瘤特异性施万细胞类型的特定基因表达谱 | 瘢痕瘤、健康皮肤和正常疤痕中的施万细胞 | 数字病理学 | 瘢痕瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 瘢痕瘤、健康皮肤和正常疤痕的数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 227 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals variable trajectories of CSPCs in the progression of osteoarthritis
2022-Nov, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2022.e11148
PMID:36339749
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组学揭示了骨关节炎进展中软骨源性干细胞/祖细胞（CSPCs）的变异轨迹 | 首次在单细胞水平上分析了骨关节炎进展中CSPCs的细胞功能和命运变化，并探索了CSPCs在骨关节炎进展中的动态变化 | 研究依赖于从Gene Expression Omnibus数据库下载的数据，可能存在数据质量和代表性的限制 | 理解骨关节炎病理过程中CSPCs的变化模式，以开发针对骨关节炎的干细胞疗法 | 骨关节炎患者的软骨源性干细胞/祖细胞（CSPCs） | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | Seurat包 | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 228 | 2024-08-08 |
Prostaglandin E2 synchronizes lunar-regulated beach spawning in grass puffers
2022-11-21, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2022.09.062
PMID:36306789
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研究论文 | 本研究探讨了草河豚在月相周期下海滩产卵的同步机制 | 首次揭示了前列腺素E2（PGE）在月相周期下同步草河豚海滩产卵行为中的作用 | NA | 理解草河豚在月相周期下海滩产卵的机制 | 草河豚的垂体和下丘脑 | NA | NA | RNA测序（RNA-seq） | NA | RNA | 2个月内每周收集的雄性草河豚的垂体和下丘脑样本 | NA | NA | NA | NA |
| 229 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome profiling reveals heterogeneous neutrophils with prognostic values in sepsis
2022-Nov-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105301
PMID:36304125
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术对近300,000个人类外周血细胞进行转录组分析，揭示了具有预后价值的异质性中性粒细胞 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细划分了中性粒细胞的四种亚型，并发现其中一种亚型Neu1与脓毒性休克显著相关，其基因表达模块Neu1_C具有高预测性 | NA | 研究中性粒细胞在脓毒症中的异质性及其作为预后生物标志物的潜力 | 人类外周血细胞中的中性粒细胞 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 近300,000个人类外周血细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 230 | 2024-08-08 |
Characterization of the tumour microenvironment phenotypes in malignant tissues and pleural effusion from advanced osteoblastic osteosarcoma patients
2022-11, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1072
PMID:36305631
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了晚期成骨性骨肉瘤患者恶性组织和胸腔积液中的肿瘤微环境表型 | 首次提供了晚期成骨性骨肉瘤患者胸腔积液和原发肿瘤的细胞图谱 | NA | 探究成骨性骨肉瘤患者胸腔积液中的细胞环境，并寻找潜在的治疗靶点 | 成骨性骨肉瘤患者的胸腔积液和肿瘤组织 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 27,260个细胞来自7个胸腔积液样本，91,186个细胞来自8个骨肉瘤组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 231 | 2024-08-08 |
Identification of MRAP protein family as broad-spectrum GPCR modulators
2022-11, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1091
PMID:36314066
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，揭示了MRAP蛋白家族作为广谱GPCR调节因子的作用，并重新定义了其在两个主要内分泌器官中的复杂GPCR网络。 | 本研究首次全面阐明了MRAP蛋白家族在两个主要内分泌器官中的复杂GPCR网络，并重新定义了MRAP蛋白家族作为广谱GPCR调节因子的作用。 | NA | 研究MRAP蛋白家族在两个主要内分泌器官中的GPCR调节作用。 | MRAP1和MRAP2蛋白及其在GPCR调节中的作用。 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | RNA-seq | 涉及人鼠组织的多组RNA-seq数据和单细胞数据 | NA | NA | NA | NA |
| 232 | 2024-08-08 |
Identification of a rare Gli1+ progenitor cell population contributing to liver regeneration during chronic injury
2022-Nov-01, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-022-00474-3
PMID:36316325
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研究论文 | 本文识别了一种罕见的Gli1+前体细胞群，该细胞群在慢性肝损伤期间有助于肝再生 | 发现了一种新的双表型细胞群EpCAMGli1，该细胞群具有上皮和间充质双重身份，并能促进肝细胞再生 | NA | 研究慢性肝损伤后肝细胞再生的新来源 | Gli1+前体细胞群及其在肝再生中的作用 | NA | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 233 | 2024-08-08 |
Consecutive BNT162b2 mRNA vaccination induces short-term epigenetic memory in innate immune cells
2022-11-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.163347
PMID:36282593
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研究论文 | 本研究探讨了BNT162b2 mRNA疫苗接种后先天免疫细胞的表观遗传记忆效应 | 首次揭示了BNT162b2 mRNA疫苗接种后先天免疫细胞的表观遗传变化及其短暂性 | 研究仅关注了接种后4周内的表观遗传变化，未探讨更长时间的影响 | 探究BNT162b2 mRNA疫苗接种后先天免疫反应的表观遗传调控及其持久性 | 先天免疫细胞，特别是单核细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 质谱流式细胞术、RNA-Seq、ATAC-Seq | NA | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 234 | 2024-08-08 |
Genome-wide Mendelian randomization and single-cell RNA sequencing analyses identify the causal effects of COVID-19 on 41 cytokines
2022-11-17, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elac033
PMID:36281737
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研究论文 | 本研究通过整合COVID-19和41种细胞因子的全基因组关联研究数据，采用孟德尔随机化分析方法，确定了COVID-19对某些细胞因子的因果效应，并利用单细胞RNA测序数据探讨了潜在的分子机制 | 本研究首次结合孟德尔随机化和单细胞RNA测序技术，揭示了COVID-19对特定细胞因子的因果效应及其分子机制 | 研究仅分析了41种细胞因子，可能未涵盖所有与COVID-19相关的细胞因子 | 探讨COVID-19对细胞因子的因果效应及其分子机制 | COVID-19患者中的41种细胞因子及其分子机制 | 基因组学 | COVID-19 | 孟德尔随机化分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据，单细胞RNA数据 | 涉及COVID-19患者和41种细胞因子的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 235 | 2024-08-08 |
Histone Lactylation Boosts Reparative Gene Activation Post-Myocardial Infarction
2022-11-11, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.122.320488
PMID:36268709
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研究论文 | 本研究探讨了心肌梗死后组蛋白乳酸化在修复基因表达中的作用 | 首次揭示了组蛋白乳酸化在心肌梗死后早期和远程激活修复基因表达中的作用 | NA | 研究组蛋白乳酸化在心肌梗死后修复反应中的作用 | 心肌梗死后的单核细胞和巨噬细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序、Western blotting、免疫荧光染色、CUT&Tag、RNA-seq、染色质免疫沉淀-qPCR、逆转录-qPCR | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 236 | 2024-08-08 |
Deciphering the roadmap of in vivo reprogramming toward pluripotency
2022-11-08, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2022.09.009
PMID:36270281
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析胰腺细胞在重编程过程中的标记物，揭示了从腺泡细胞到多能性的轨迹 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别了胰腺细胞重编程过程中的中间状态标记物，并发现这些标记物在胃、结肠和培养的成纤维细胞中也存在 | NA | 揭示体内重编程向多能性转变的路径 | 胰腺细胞重编程过程中的细胞状态和标记物 | 干细胞研究 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 237 | 2024-08-08 |
Profiling transcriptional heterogeneity of epithelium, fibroblasts, and immune cells in esophageal squamous cell carcinoma by single-cell RNA sequencing
2022-11, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202200898R
PMID:36260317
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了食管鳞状细胞癌中的上皮细胞、成纤维细胞和免疫细胞的转录异质性 | 揭示了肿瘤内和肿瘤间上皮细胞的异质性，以及成纤维细胞亚型在食管鳞状细胞癌进展中的重要作用 | NA | 深入理解食管鳞状细胞癌的复杂肿瘤微环境和细胞异质性 | 食管鳞状细胞癌中的上皮细胞、成纤维细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 25,796个免疫细胞和8,197个非免疫细胞来自三个原发性肿瘤和配对正常样本 | NA | NA | NA | NA |
| 238 | 2024-08-08 |
Shared and distinct biological circuits in effector, memory and exhausted CD8+ T cells revealed by temporal single-cell transcriptomics and epigenetics
2022-11, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-022-01338-4
PMID:36271148
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研究论文 | 本文通过时间序列单细胞转录组学和表观遗传学分析，揭示了效应性、记忆性和耗竭性CD8+ T细胞中的共享和独特生物电路 | 发现了新的T细胞亚群，包括表达自然杀伤细胞相关基因的亚群和多个独特的TCF-1干细胞/祖细胞样亚群，并揭示了PD-1通路阻断后T细胞亚群的重塑 | NA | 阐明CD8+ T细胞发育路径中的分子电路及其异质性 | 效应性、记忆性和耗竭性CD8+ T细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 239 | 2024-08-08 |
Geometric engineering of organoid culture for enhanced organogenesis in a dish
2022-11, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-022-01643-8
PMID:36280722
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research paper | 本文介绍了一种简便且可扩展的工程方法，用于促进长期器官发生和器官成熟。 | 重新设计了传统的器官培养配置，开发了一个平台，可以将单次注射的干细胞悬液转化为可以长期维持的放射状器官阵列，无需传代。 | NA | 开发一种平台技术，用于在体外工程化更真实的类器官结构。 | 肠道器官、炎症性肠病（IBD）患者来源的器官模型、血管化可灌注的人体肠样。 | digital pathology | inflammatory bowel disease | single-cell RNA sequencing | NA | organoid | NA | NA | NA | NA | NA |
| 240 | 2024-08-08 |
Differential plasticity and fate of brain-resident and recruited macrophages during the onset and resolution of neuroinflammation
2022-11-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2022.09.005
PMID:36228615
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研究论文 | 本研究探讨了神经炎症发生和消退过程中，大脑常驻和招募的巨噬细胞的命运和可塑性 | 揭示了大脑常驻巨噬细胞和招募巨噬细胞在感染和疾病消退过程中的不同反应和动态变化 | NA | 研究神经炎症过程中大脑常驻和招募巨噬细胞的命运和可塑性 | 大脑常驻的微胶质细胞、边界相关巨噬细胞（BAMs）和招募的巨噬细胞 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达 | NA | NA | NA | NA | NA |