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当前共找到 320 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-03-06 |
Multi-omic analyses of changes in the tumor microenvironment of pancreatic adenocarcinoma following neoadjuvant treatment with anti-PD-1 therapy
2022-11-14, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2022.10.001
PMID:36306792
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研究论文 | 本研究通过多组学分析，探讨了胰腺导管腺癌（PDAC）在接受抗PD-1疗法新辅助治疗后肿瘤微环境的变化 | 首次前瞻性收集并应用多组学分析配对治疗前后的PDAC样本，揭示了GVAX疫苗联合nivolumab治疗中三级淋巴聚集体的免疫调节作用、肿瘤相关中性粒细胞密度与生存率的关系，以及CD137表达在T细胞激活中的关键作用 | 研究样本量有限，且为单中心平台研究，可能影响结果的普遍适用性 | 优化PDAC免疫治疗策略，探索抗PD-1疗法（nivolumab）联合GVAX疫苗的敏感性和耐药机制 | 胰腺导管腺癌（PDAC）患者治疗前后的肿瘤标本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 多组学分析，包括bulk RNA测序和单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 配对治疗前后的PDAC标本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2026-03-02 |
Endocardium-to-coronary artery differentiation during heart development and regeneration involves sequential roles of Bmp2 and Cxcl12/Cxcr4
2022-11-21, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.10.007
PMID:36347256
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研究论文 | 本研究通过小鼠遗传学和单细胞RNA测序，揭示了心内膜细胞在心脏发育和再生中分化为冠状动脉的分子机制，特别是Bmp2和Cxcl12/Cxcr4信号通路的顺序作用 | 利用时间特异性谱系追踪和新的CXCR4活性报告小鼠系，精确评估了CXCL12/CXCR4信号在动脉形态发生而非血管生成中的特异性作用，并识别了Bmp2表达过渡群体在中期妊娠中的关键角色 | 研究主要基于小鼠模型，可能不完全适用于人类心脏再生，且未详细探讨成年心脏中的再生潜力 | 探究心内膜细胞分化为冠状动脉的分子机制，以促进心脏损伤后的血管再生 | 小鼠心脏发育过程中的心内膜细胞和冠状动脉内皮细胞 | 发育生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2026-03-02 |
Interactions in CSF1-Driven Tenosynovial Giant Cell Tumors
2022-11-14, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-22-1898
PMID:36007098
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探究了腱鞘巨细胞瘤中的细胞相互作用 | 首次在单细胞水平识别TGCT中的两种复发性肿瘤细胞群，并发现其与正常滑膜细胞高度相似，同时揭示了肿瘤细胞不表达CSF1R，为治疗靶点提供了新见解 | 样本量较小（仅3个TGCT和2个GCTB样本），可能限制结果的普适性 | 探究腱鞘巨细胞瘤中的细胞相互作用及潜在治疗靶点 | 腱鞘巨细胞瘤和骨巨细胞瘤样本中的细胞 | 单细胞组学 | 腱鞘巨细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 长读长RNA测序, 免疫荧光, 免疫组化 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 18,788个单细胞，来自3个TGCT和2个GCTB样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-03-02 |
Tempo: an unsupervised Bayesian algorithm for circadian phase inference in single-cell transcriptomics
2022-11-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-34185-w
PMID:36323668
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Tempo的无监督贝叶斯算法，用于从单细胞转录组数据中推断昼夜节律相位 | Tempo结合了昼夜节钟的领域知识，并量化了相位估计的不确定性，相比现有方法提供了更准确的相位估计和校准良好的不确定性量化 | 未在摘要中明确提及具体限制 | 开发一种计算方法来准确推断单细胞转录组数据中的昼夜节律相位，并量化估计不确定性 | 单细胞转录组数据，特别是与昼夜节律相关的数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯变分推断 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2026-02-17 |
Sex differences in interindividual gene expression variability across human tissues
2022-Nov, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgac243
PMID:36712323
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研究论文 | 本研究通过分析GTEx项目的RNA-seq数据，探讨了人类组织中基因表达变异性的性别差异及其与生物学功能和疾病的关系 | 首次系统性地研究了性别在基因表达变异性方面的差异，并关联到细胞类型特异性表达、性别偏倚疾病（如Graves病）以及进化约束 | 研究主要基于GTEx项目的RNA-seq数据，可能受样本来源和技术平台的限制，且单细胞RNA-seq分析仅针对乳腺上皮细胞 | 探究性别在个体间基因表达变异性上的差异及其生物学意义 | 人类43种组织的RNA-seq数据及乳腺上皮细胞的单细胞RNA-seq数据 | 自然语言处理 | Graves病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 来自GTEx项目的43种组织数据 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2026-02-09 |
Identification and Isolation of Burst-Forming Unit and Colony-Forming Unit Erythroid Progenitors from Mouse Tissue by Flow Cytometry
2022-11-04, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/64373
PMID:36408979
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研究论文 | 本文开发了一种基于流式细胞术的新方法，用于从小鼠骨髓或脾脏中直接、完整地鉴定和分离纯的BFU-e和CFU-e红系祖细胞 | 首次结合单细胞RNA-seq数据分析与细胞命运测定，开发了一种能够直接、完整地分离纯BFU-e和CFU-e祖细胞的流式细胞术方法，并同时鉴定其他祖细胞亚群 | 该方法目前仅在小鼠组织（骨髓和脾脏）中得到验证，尚未在人类或其他物种中应用 | 解决无法直接从新鲜分离的成年小鼠骨髓中前瞻性、完整地分离纯BFU-e和CFU-e祖细胞的技术缺口 | 小鼠骨髓和脾脏中的早期红系祖细胞（BFU-e和CFU-e）及其他造血祖细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA-seq (scRNAseq), 流式细胞术, 细胞命运测定 | NA | 单细胞基因表达数据, 流式细胞术数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2025-11-22 |
Leveraging diverse cell-death patterns to predict the prognosis and drug sensitivity of triple-negative breast cancer patients after surgery
2022-Nov, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1016/j.ijsu.2022.106936
PMID:36341760
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研究论文 | 通过分析12种细胞死亡模式建立细胞死亡指数模型，用于预测三阴性乳腺癌患者术后预后和药物敏感性 | 首次综合12种程序性细胞死亡模式建立预测模型，并识别出两种具有不同生物学过程的三阴性乳腺癌分子亚型 | 研究基于回顾性队列数据，需要前瞻性研究进一步验证 | 预测三阴性乳腺癌患者术后预后和化疗敏感性 | 三阴性乳腺癌患者 | 机器学习 | 乳腺癌 | 机器学习算法，转录组分析 | 无监督聚类模型，nomogram模型 | 转录组数据，基因组数据，临床信息 | 来自TCGA-BRCA、METABRIC、GSE58812、GSE21653、GSE176078、GSE75688和KM-plotter等多个队列的数据 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2025-11-13 |
Excessive IL-10 and IL-18 trigger hemophagocytic lymphohistiocytosis-like hyperinflammation and enhanced myelopoiesis
2022-11, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2022.06.017
PMID:35792218
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研究论文 | 本研究探讨了IL-10和IL-18在触发噬血细胞性淋巴组织细胞增生症样超炎症反应中的协同作用 | 首次揭示IL-10和IL-18共同升高足以驱动HLH样超炎症综合征，并证明IL-10阻断具有保护作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床转化需进一步验证 | 研究IL-10和IL-18在超炎症反应中的协同作用机制 | 87例继发性HLH患者、转基因小鼠模型、培养的巨噬细胞 | 免疫学 | 噬血细胞性淋巴组织细胞增生症 | 单细胞RNA测序、细胞培养、转基因模型 | 转基因小鼠模型 | RNA测序数据、细胞表型数据 | 87例HLH患者样本及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9 | 2025-10-06 |
CXCL12 defines lung endothelial heterogeneity and promotes distal vascular growth
2022-11-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.200909
PMID:36239312
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示肺内皮细胞异质性，发现CXCL12信号对远端血管发育的关键作用 | 首次利用Cxcl12转基因小鼠报告系统结合单细胞测序技术解析肺动脉内皮细胞的功能异质性 | 研究局限于小鼠胚胎发育模型，尚未在人类样本中验证 | 探索肺血管系统在胚胎发育过程中的形态发生和生长机制 | 小鼠肺内皮细胞，特别是Cxcl12-DsRed+动脉内皮细胞 | 单细胞生物学 | 儿科肺疾病 | 单细胞RNA测序，转基因报告系统，基因本体分析，组织学分析 | NA | 基因表达数据，组织图像 | 转基因小鼠肺内皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2025-10-06 |
CRISPRi screens in human iPSC-derived astrocytes elucidate regulators of distinct inflammatory reactive states
2022-11, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-022-01180-9
PMID:36303069
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研究论文 | 本研究通过CRISPRi筛选和单细胞转录组学系统解析了人类iPSC来源星形胶质细胞炎症反应状态的调控机制 | 首次建立人iPSC来源星形胶质细胞的CRISPRi筛选平台，发现STAT3调控两种不同炎症反应状态的新机制 | 研究主要基于体外细胞模型，体内验证数据相对有限 | 系统研究炎症性星形胶质细胞反应状态的分子调控机制 | 人诱导多能干细胞分化的星形胶质细胞 | 单细胞生物学 | 神经退行性疾病 | CRISPR干扰筛选,单细胞RNA测序 | CRISPRi | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2025-10-06 |
MuSiC2: cell-type deconvolution for multi-condition bulk RNA-seq data
2022-11-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac430
PMID:36208175
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研究论文 | 提出MuSiC2方法用于多条件下批量RNA-seq数据的细胞类型反卷积分析 | 扩展MuSiC方法，通过迭代估计程序解决批量RNA-seq数据与单细胞参考数据临床条件不匹配时的细胞类型比例估计偏差问题 | 需要至少一个与单细胞参考数据不同的临床条件，且依赖参考数据的质量 | 开发适用于多临床条件下批量RNA-seq数据的细胞类型反卷积方法 | 人类胰岛和视网膜组织的批量RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, scRNA-seq | 迭代估计算法 | 基因表达数据 | 两个批量RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2025-10-06 |
A multi-use deep learning method for CITE-seq and single-cell RNA-seq data integration with cell surface protein prediction and imputation
2022-Nov, Nature machine intelligence
IF:18.8Q1
DOI:10.1038/s42256-022-00545-w
PMID:36873621
|
研究论文 | 提出一种名为sciPENN的多功能深度学习方法，用于整合CITE-seq和单细胞RNA-seq数据，并实现细胞表面蛋白预测和填补 | 开发支持多种功能的一体化深度学习框架，包括数据整合、蛋白表达预测与填补、不确定性量化及细胞类型标签转移 | NA | 解决CITE-seq和单细胞RNA-seq数据整合中的计算挑战，提高数据利用效率 | 单细胞多组学数据 | 机器学习 | 免疫相关疾病，流感，COVID-19 | CITE-seq，单细胞RNA-seq | 深度学习 | 单细胞RNA和蛋白表达数据 | NA | NA | 单细胞多组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2025-10-06 |
A dietary change to a high-fat diet initiates a rapid adaptation of the intestine
2022-11-15, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111641
PMID:36384107
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研究论文 | 本研究通过生理指标和单细胞转录组学揭示了高脂饮食对肠道上皮细胞的快速适应性反应 | 首次系统揭示了肠道上皮细胞在饮食改变后1天内的快速转录组适应机制 | 研究仅关注短期反应，长期影响仍需进一步探索 | 探究饮食改变对肠道上皮细胞的即时响应机制 | 小鼠肠道上皮细胞 | 单细胞生物学 | 代谢性疾病 | 单细胞转录组学，计算轨迹分析 | NA | 转录组数据，生理指标数据 | 高脂饮食处理的小鼠肠道样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2025-10-06 |
ClampFISH 2.0 enables rapid, scalable amplified RNA detection in situ
2022-11, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-022-01653-6
PMID:36280724
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研究论文 | 介绍了一种名为clampFISH 2.0的新型原位RNA检测方法，能够快速、可扩展地检测和扩增RNA信号 | 采用反向挂锁设计，可同时高效检测多种RNA物种并指数级扩增信号，相比前代方法显著减少时间和成本 | NA | 开发高效的多重RNA原位检测和信号扩增技术 | RNA分子在单细胞和组织切片中的检测 | 空间转录组学 | NA | clampFISH 2.0, 原位RNA标记 | NA | RNA检测信号 | 超过100万个细胞 | NA | 空间转录组学, 多重信号扩增, 顺序检测 | NA | NA |
| 15 | 2025-10-06 |
mTORC1 links pathology in experimental models of Still's disease and macrophage activation syndrome
2022-11-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-34480-6
PMID:36443301
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研究论文 | 本研究揭示了mTORC1在斯蒂尔病和巨噬细胞活化综合征病理机制中的核心作用 | 首次证明mTORC1的异常激活是连接斯蒂尔病和巨噬细胞活化综合征的关键分子机制 | 主要基于小鼠模型研究，人类样本验证相对有限 | 探究mTORC1在斯蒂尔病和巨噬细胞活化综合征发病机制中的作用 | 小鼠模型和斯蒂尔病患者样本 | 分子病理学 | 斯蒂尔病, 巨噬细胞活化综合征 | 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas基因编辑, 转录组分析 | NA | 基因表达数据, 转录组数据 | 小鼠模型和人类患者样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 16 | 2025-10-06 |
Reprogramming Müller glia to regenerate ganglion-like cells in adult mouse retina with developmental transcription factors
2022-11-25, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abq7219
PMID:36417510
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研究论文 | 本研究通过过表达发育转录因子将成年小鼠视网膜中的Müller胶质细胞重编程为神经节样细胞 | 首次证明通过靶向过表达发育性视网膜神经节细胞转录因子可在成年哺乳动物视网膜中实现特定类型神经元再生 | 研究仅限于小鼠模型，再生细胞的长期功能和整合能力仍需进一步验证 | 探索特定转录因子组合引导Müller胶质细胞向特定视网膜神经元类型再生的能力 | 成年小鼠视网膜Müller胶质细胞 | 神经再生 | 青光眼 | 免疫组织化学，单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序，电生理学 | NA | 基因表达数据，染色质可及性数据，电生理数据 | 工程化小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 17 | 2025-10-06 |
Protein aggregation and calcium dysregulation are hallmarks of familial Parkinson's disease in midbrain dopaminergic neurons
2022-Nov-24, NPJ Parkinson's disease
DOI:10.1038/s41531-022-00423-7
PMID:36424392
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研究论文 | 本研究利用人诱导多能干细胞揭示了家族性帕金森病中脑多巴胺能神经元内蛋白质聚集和钙信号失调的早期病理事件 | 首次在人类神经元分化早期阶段发现β-折叠富集寡聚体形成，证明蛋白质错误折叠是驱动疾病的最早关键事件而非晚期标志 | 研究基于体外干细胞分化模型，可能无法完全模拟体内神经元的复杂微环境 | 解析SNCA基因突变导致帕金森病的分子事件时序 | 人诱导多能干细胞分化的中脑多巴胺能神经元 | 神经退行性疾病研究 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序,蛋白质组学,电生理记录 | 干细胞分化模型 | 基因表达数据,蛋白质数据,电生理数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis of senescent epithelia reveals targetable mechanisms promoting fibrosis
2022-11-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.154124
PMID:36509292
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研究论文 | 通过单细胞分析揭示衰老上皮细胞促进纤维化的机制并发现潜在治疗靶点 | 首次在两种小鼠损伤模型中系统表征衰老上皮细胞，发现PDIA3是促进纤维化的关键蛋白并验证其治疗潜力 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探究衰老细胞在器官纤维化中的作用机制并寻找治疗靶点 | 小鼠肾脏损伤模型和人类肾脏、肝脏疾病样本 | 单细胞生物学 | 肾脏纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 两种小鼠损伤模型及人类疾病样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2025-10-06 |
Systematic single-cell pathway analysis to characterize early T cell activation
2022-11-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111697
PMID:36417885
|
研究论文 | 开发了一个用于单细胞通路分析的开源R包SCPA，并应用于早期T细胞激活的特征分析 | 开发了敏感且无分布限制的统计框架用于多样本分布测试，首次系统性地表征了早期T细胞激活过程中的通路活动 | NA | 开发单细胞通路分析工具并揭示T细胞激活的调控机制 | T细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 统计框架 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2025-10-06 |
PPMS: A framework to Profile Primary MicroRNAs from Single-cell RNA-sequencing datasets
2022-11-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac419
PMID:36209413
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研究论文 | 开发了一种从单细胞RNA测序数据中分析初级microRNAs的计算框架PPMS | 首个能够在单细胞类型分辨率下分析和定量初级microRNAs的计算方法 | NA | 开发能够从单细胞RNA测序数据中分析初级microRNAs的计算工具 | 初级microRNAs（pri-miRNAs） | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，单核RNA测序 | 计算框架 | RNA测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, single-nuclei RNA-seq | NA | NA |