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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2024-08-08 |
A single-cell atlas of the cycling murine ovary
2022-10-07, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.77239
PMID:36205477
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术,分析了成年小鼠卵巢中超过34,000个细胞的转录组,描述了在正常动情周期和其他生殖状态下发生的转录变化,构建了一个全面的小鼠卵巢细胞类型和状态的动态图谱 | 首次构建了小鼠卵巢在动情周期中的单细胞转录组图谱,揭示了细胞状态的动态变化和旁分泌因子在此过程中的作用 | NA | 研究小鼠卵巢在动情周期中的细胞状态动态变化及其调控机制 | 小鼠卵巢中的细胞类型及其在动情周期中的转录变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 超过34,000个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 162 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing uncovers a neuron-like macrophage subset associated with cancer pain
2022-10-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abn5535
PMID:36206343
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了与癌症疼痛相关的一种神经样巨噬细胞亚群,并探讨了其在肿瘤神经发生中的作用机制 | 首次发现巨噬细胞向神经样细胞转化的现象(MNT),并证实其直接促进肿瘤神经发生 | NA | 探索肿瘤相关巨噬细胞在促进肿瘤神经发生中的作用机制 | 肿瘤相关巨噬细胞及其在癌症疼痛中的作用 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 涉及肺腺癌模型中的巨噬细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 163 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing analysis of shrimp immune cells identifies macrophage-like phagocytes
2022-Oct-06, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.80127
PMID:36200862
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了虾的免疫细胞,识别出一种新的巨噬细胞样吞噬细胞亚型 | 本研究首次在虾的血液中发现了一种新的巨噬细胞样细胞亚型,称为单核细胞血细胞2(MH2),该亚型具有吞噬功能并表达与哺乳动物巨噬细胞相似的标记基因 | NA | 揭示无脊椎动物先天免疫细胞的多样性和功能 | 虾的免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 三种主要的细胞类型:前血细胞、单核血细胞和粒细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 164 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals functionally specialized vascular endothelium in brain
2022-10-05, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.57520
PMID:36197007
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析小鼠大脑皮层在发育、成年、衰老和神经炎症过程中的非神经细胞群体,揭示了大脑血管内皮细胞的功能特化 | 发现了反应性内皮小静脉,这是一种特化的后毛细血管内皮细胞隔室,具有一致表达的细胞粘附分子、优先的白细胞迁移、与血管周围巨噬细胞群体的关联以及启动中枢神经系统免疫反应的内皮激活等特征 | NA | 研究大脑血管内皮细胞的异质性及其在神经炎症和衰老中的分子改变 | 小鼠大脑皮层的非神经细胞群体 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 165 | 2024-08-08 |
Single-cell dissection of remodeled inflammatory ecosystem in primary and metastatic gallbladder carcinoma
2022-Oct-05, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-022-00445-8
PMID:36198671
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了慢性胆囊炎、原发性胆囊癌及其转移病灶的细胞生态系统重塑情况 | 首次全面揭示了从炎症到癌症再到转移过程中,胆囊癌的细胞和微环境的重编程机制 | NA | 旨在更好地表征从炎症到癌症再到转移的进展过程 | 慢性胆囊炎、原发性胆囊癌及其匹配的转移病灶 | 数字病理学 | 胆囊癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 6例慢性胆囊炎、12例未经治疗的胆囊癌和6例匹配的转移病灶 | NA | NA | NA | NA |
| 166 | 2024-08-08 |
Helicobacter pylori shows tropism to gastric differentiated pit cells dependent on urea chemotaxis
2022-10-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-33165-4
PMID:36198679
|
研究论文 | 本文研究了致癌细菌幽门螺杆菌(H. pylori)对胃分化沟细胞的趋向性,发现其偏好附着于胃单位沟区域的分化细胞 | 首次揭示了幽门螺杆菌对胃分化沟细胞的偏好附着性,并发现这种附着依赖于细菌对宿主细胞释放的尿素的趋化性 | NA | 探究幽门螺杆菌对胃分化沟细胞的趋向性及其机制 | 幽门螺杆菌、胃分化沟细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 167 | 2024-08-08 |
SLAMF7 modulates B cells and adaptive immunity to regulate susceptibility to CNS autoimmunity
2022-Oct-03, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-022-02594-9
PMID:36199066
|
研究论文 | 研究探讨了SLAMF7基因在调节中枢神经系统(CNS)自身免疫和B细胞功能中的作用 | 发现了SLAMF7在CNS免疫调节和B细胞功能中的新角色,揭示了SLAMF7与多发性硬化症(MS)遗传关联的基础 | NA | 探究SLAMF7基因如何影响多发性硬化症的易感性和免疫功能 | SLAMF7基因、B细胞、T细胞和CNS免疫细胞 | NA | 多发性硬化症 | 光谱细胞仪、BioPlex分析、单细胞RNA测序 | NA | 免疫细胞数据 | WT和SLAMF7-/-小鼠模型,以及人类脑脊液(CSF)免疫细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 168 | 2024-08-08 |
A model-based constrained deep learning clustering approach for spatially resolved single-cell data
2022-10, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.276477.121
PMID:36198490
|
研究论文 | 本研究开发了一种名为Deep Spatially constrained Single-cell Clustering (DSSC)的深度学习方法,用于对空间解析单细胞RNA测序数据进行聚类 | DSSC是首个能够利用空间坐标和标记基因信息指导细胞/位点聚类的模型 | NA | 开发一种新的计算方法来充分利用空间解析单细胞RNA测序技术的潜力 | 空间解析单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 图形神经网络模型 | 深度嵌入聚类 | 单细胞RNA测序数据 | 不同数据集,包括模拟数据和真实数据,涵盖多种细胞类型/组织结构和/或细胞类型/组织空间依赖性 | NA | NA | NA | NA |
| 169 | 2024-08-08 |
Revealing the heterogeneity of CD4+ T cells through single-cell transcriptomics
2022-10, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2022.08.010
PMID:36205449
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)在分析CD4 T细胞表型和克隆型中的应用 | scRNA-seq能够从单个T细胞中获取配对的T细胞受体和转录组信息,并阐明CD4 T细胞与其环境中的其他细胞之间的相互作用 | scRNA-seq在分析CD4 T细胞时存在固有的挑战,尽管已有技术解决方案出现 | 探讨scRNA-seq在健康和疾病中对CD4 T细胞作用的进一步理解 | CD4 T细胞的表型和克隆型 | 基因表达研究 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 单个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 170 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq keeps cells alive
2022-10, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01515-8
PMID:36207601
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 171 | 2024-08-08 |
SLC7A5 is a lung adenocarcinoma-specific prognostic biomarker and participates in forming immunosuppressive tumor microenvironment
2022-Oct, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2022.e10866
PMID:36217463
|
研究论文 | 研究确定了SLC7A5作为肺腺癌特异性预后氨基酸转运蛋白,并探讨了其在形成免疫抑制性肿瘤微环境中的作用 | 首次揭示SLC7A5在肺腺癌中的特异性预后价值及其在免疫抑制性肿瘤微环境形成中的作用 | NA | 探讨SLC7A5作为肺腺癌特异性预后生物标志物的潜力及其在肿瘤微环境中的作用 | SLC7A5在肺腺癌中的表达、预后价值及其对免疫细胞浸润和免疫治疗反应的影响 | 数字病理学 | 肺癌 | 机器学习, 单细胞测序, 甲基化测序 | NA | 基因表达数据, 甲基化数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 172 | 2024-08-08 |
Comprehensive multi-omics single-cell data integration reveals greater heterogeneity in the human immune system
2022-Oct-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105123
PMID:36185375
|
研究论文 | 本文开发了一种名为SuPERR的新分析流程,用于提高多组学单细胞数据集中细胞类型识别的分辨率和准确性 | SuPERR流程能够更精确地去除细胞双联体,并通过整合细胞表面蛋白和免疫球蛋白转录本计数信息,防止细胞类型错误分类 | NA | 旨在深入理解人类免疫系统的多样性和异质性 | 人类免疫系统的细胞类型及其在不同组织和疾病背景下的多样性 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学、蛋白质组学和细胞受体组库 | NA | 多组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 173 | 2024-08-08 |
Multi-Omics Analysis Reveals the Unexpected Immune Regulatory Effects of Arsenene Nanosheets in Tumor Microenvironment
2022-Oct-12, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.2c10743
PMID:36166745
|
研究论文 | 本研究探讨了砷烯纳米片在肿瘤微环境中的免疫调节作用及其机制 | 首次发现砷烯纳米片能够通过激活T细胞受体信号通路和抑制肿瘤细胞的DNA复制及TCA循环途径,重塑肿瘤微环境,增强抗肿瘤免疫反应 | NA | 揭示砷烯纳米片在肿瘤微环境中的免疫调节机制 | 砷烯纳米片及其在肿瘤微环境中的作用 | 纳米医学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序,蛋白质组学分析 | NA | 细胞 | 具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 174 | 2024-08-08 |
Conservation at the uterine-placental interface
2022-10-11, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2210633119
PMID:36191208
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,分析了早期和晚期妊娠阶段大鼠子宫-胎盘界面入侵滋养层细胞及其他细胞群体的转录组特征 | 发现大鼠入侵滋养层细胞的转录本在人类胎盘的入侵绒毛外滋养层细胞中具有保守性 | NA | 探究子宫-胎盘界面中滋养层细胞与母体细胞的相互作用及其对胎儿生长的影响 | 大鼠子宫-胎盘界面中的入侵滋养层细胞及其他细胞群体 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 早期(妊娠第15.5天)和晚期(妊娠第19.5天)的大鼠子宫-胎盘界面细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 175 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing resolves the landscape of immune cells and regulatory mechanisms in HIV-infected immune non-responders
2022-10-04, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-022-05225-6
PMID:36195585
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单细胞ATAC测序(scATAC-seq)分析了来自HIV-1感染的免疫非应答者(INR)和应答者(IR)的外周血单个核细胞(PBMCs),揭示了INR中黏膜相关不变T细胞(MAIT)低表达及其与受损线粒体功能和凋亡信号相关的转录特征。 | 首次通过单细胞测序技术详细解析了HIV感染后免疫非应答者的免疫细胞图谱及其调控机制,特别是发现了MAIT细胞在INR中的功能障碍及其与线粒体功能的关系。 | 研究样本仅限于外周血单个核细胞,未涉及其他组织或器官的细胞,可能限制了对HIV感染后免疫重建失败机制的全面理解。 | 探究HIV感染后免疫非应答者免疫重建失败的机制。 | HIV-1感染的免疫非应答者(INR)和应答者(IR)的外周血单个核细胞(PBMCs)。 | 数字病理学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),单细胞ATAC测序(scATAC-seq) | NA | 细胞 | 来自免疫非应答者(INR)和应答者(IR)的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 176 | 2024-08-08 |
Multicellular immune dynamics implicate PIM1 as a potential therapeutic target for uveitis
2022-10-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-33502-7
PMID:36195600
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析实验性自身免疫性葡萄膜炎(EAU),揭示了疾病进展中的细胞组成和转录调控变化,并发现PIM1分子与疾病相关 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了葡萄膜炎中细胞动态变化,并识别出PIM1作为潜在治疗靶点 | NA | 探究葡萄膜炎的细胞动态和发病机制,并寻找潜在的治疗靶点 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎(EAU)和人类葡萄膜炎(VKH) | NA | 葡萄膜炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 177 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptomics tools allow for regional exploration of heterogeneous muscle pathology in the pre-clinical rabbit model of rotator cuff tear
2022-Oct-04, Journal of orthopaedic surgery and research
IF:2.8Q1
DOI:10.1186/s13018-022-03326-8
PMID:36195913
|
研究论文 | 本文评估了空间转录组技术在兔肩袖撕裂模型中探索异质性骨骼肌组织区域细胞活动的潜力和挑战 | 使用3' Visium空间转录组技术,能够在先前获取的组织中探索空间转录模式,并与底层组织学相关联 | 肌肉纤维过长,难以被单细胞液滴包围,且单核转录组学受肌肉纤维多核化的影响 | 评估空间转录组技术在理解异质性骨骼肌组织区域细胞活动中的潜力和挑战 | 兔肩袖撕裂模型的肌肉组织 | 数字病理学 | 肌肉疾病 | 3' Visium空间转录组技术 | NA | 转录组数据 | 健康对照组和手术后2周及16周的组织样本,以及储存超过6年的组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 178 | 2024-08-08 |
The heterogeneity of mammalian utricular cells over the course of development
2022-10, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1052
PMID:36178017
|
研究论文 | 本文通过单细胞测序技术研究了从新生期到成年期小鼠椭圆囊细胞的异质性,并追踪了新毛细胞的来源 | 发现新毛细胞主要通过Sox9+前体细胞分化产生,而非有丝分裂增殖 | NA | 探究哺乳动物椭圆囊细胞在发育过程中的命运及其特征 | 小鼠椭圆囊中的毛细胞和支持细胞 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 包括新生期和成年期的小鼠椭圆囊样本,具体为P2、P7和P30的小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 179 | 2024-08-08 |
Cell Heterogeneity Uncovered by Single-Cell RNA Sequencing Offers Potential Therapeutic Targets for Ischemic Stroke
2022-Oct-01, Aging and disease
IF:7.0Q1
DOI:10.14336/AD.2022.0212
PMID:36186129
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在揭示缺血性中风中细胞异质性和潜在治疗靶点方面的应用 | 利用单细胞RNA测序技术无偏倚地确定高分辨率的细胞异质性,并识别细胞标记,揭示了细胞类型特异性基因表达模式中的主要脑簇以及细胞特异性亚簇及其在不同通路中的功能 | NA | 旨在启发新的研究,并为探索单细胞水平上缺血性中风的潜在病理机制和新型治疗策略提供方向 | 缺血性中风中的脑细胞和外周免疫细胞 | 数字病理学 | 中风 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 180 | 2024-08-08 |
Fast and interpretable consensus clustering via minipatch learning
2022-10, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1010577
PMID:36191044
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研究论文 | 本文提出了一种快速且可解释的共识聚类方法IMPACC,通过使用微小块(minipatches)学习来提高聚类的准确性、稳定性和计算效率 | IMPACC方法通过从观测和特征的微小子集中集成聚类共现,显著减少了计算时间,并开发了自适应采样方案以提高可靠性和解释性 | NA | 解决共识聚类在处理大规模生物信息学数据时的计算效率低下和缺乏解释性的问题 | 大规模生物信息学数据,如单细胞测序数据 | 生物信息学 | NA | 共识聚类 | NA | 数据集 | 多种真实大规模生物信息学数据集 | NA | NA | NA | NA |