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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2024-08-08 |
Loss of CASZ1 tumor suppressor linked to oncogenic subversion of neuroblastoma core regulatory circuitry
2022-10-15, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-022-05314-6
PMID:36243768
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研究论文 | 本文研究了神经母细胞瘤中核心调控电路(CRC)的癌基因颠覆与肿瘤抑制因子CASZ1丢失之间的关系 | 首次揭示了CASZ1肿瘤抑制因子与神经母细胞瘤核心调控电路之间的负反馈调节机制 | NA | 探讨CASZ1肿瘤抑制因子在神经母细胞瘤中的作用及其与核心调控电路的关系 | 神经母细胞瘤中的CASZ1肿瘤抑制因子和核心调控电路 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, ChIP-seq | NA | RNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 142 | 2024-08-08 |
Alignment of single-cell trajectory trees with CAPITAL
2022-10-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-33681-3
PMID:36241645
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CAPITAL的方法,用于通过树对齐比较单细胞轨迹,能够自动比较分支轨迹 | CAPITAL方法能够实现复杂伪时间轨迹的全局对齐,特别是在处理分支轨迹方面相较于现有工具的创新 | NA | 开发一种新的方法来对齐不同单细胞RNA-seq数据集中的复杂伪时间轨迹 | 单细胞RNA-seq数据集中的伪时间轨迹 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 树对齐 | 数据集 | 合成数据集和真实骨髓细胞数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 143 | 2024-08-08 |
CellCallEXT: Analysis of Ligand-Receptor and Transcription Factor Activities in Cell-Cell Communication of Tumor Immune Microenvironment
2022-Oct-10, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14194957
PMID:36230879
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研究论文 | 本文介绍了CellCallEXT工具,该工具通过整合配体-受体(L-R)和转录因子(TF)活动信息,分析肿瘤免疫微环境中的细胞间通信 | CellCallEXT扩展了CellCall的功能,能够处理两种条件的比较,并整合了Reactome数据库和L-R-TF信号传导及基因调控数据集 | CellCall受限于组织中基因表达的特异性,且无法直接处理两种条件的比较 | 开发和验证一种新的工具,用于分析基于单细胞RNA测序数据的疾病中细胞间通信 | 肿瘤和免疫细胞微环境中的细胞间通信及相关的基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 涉及来自腺苷脱氨酶2缺乏症患者的scRNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA |
| 144 | 2024-08-08 |
Early Mechanisms of Chemoresistance in Retinoblastoma
2022-Oct-10, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14194966
PMID:36230889
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研究论文 | 本文研究了视网膜母细胞瘤对卡铂化疗产生早期耐药的分子机制 | 利用单细胞下一代RNA测序和单细胞条形码技术,发现了卡铂诱导的快速转录组重编程与PI3K-AKT通路目标的上调有关 | NA | 探讨视网膜母细胞瘤对卡铂化疗早期耐药的分子机制 | 低代次的人类视网膜母细胞瘤细胞 | NA | 视网膜母细胞瘤 | 单细胞下一代RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 145 | 2024-08-08 |
Single-Cell Identification of Melanoma Biomarkers in Circulating Tumor Cells
2022-Oct-08, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14194921
PMID:36230844
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研究论文 | 本文探讨了循环肿瘤细胞(CTCs)作为黑色素瘤生物标志物的潜力,并介绍了一种可行的单细胞CTC分离和分析方法 | 提出了一种临床可行的单细胞CTC分离和分析方法,克服了以往的限制 | NA | 研究黑色素瘤CTCs作为生物标志物的潜力 | 黑色素瘤患者的循环肿瘤细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 来自黑色素瘤患者的循环肿瘤细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 146 | 2024-08-08 |
Global Transcriptional and Epigenetic Reconfiguration during Chemical Reprogramming of Human Retinal Pigment Epithelial Cells into Photoreceptor-like Cells
2022-10-06, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11193146
PMID:36231108
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研究论文 | 本文通过使用小分子化合物直接将人胎儿视网膜色素上皮细胞重编程为化学诱导的类光感受器细胞,并进行了转录组和表观遗传学的多组学分析 | 首次展示了通过小分子化合物有效诱导视网膜色素上皮细胞转化为类光感受器细胞,并揭示了这一过程中的转录和表观遗传变化 | 当前的重编程效率仍然较低,且分子机制尚未完全阐明 | 探讨视网膜色素上皮细胞向类光感受器细胞重编程的分子机制,为视网膜退行性疾病的治疗提供新的细胞来源 | 人胎儿视网膜色素上皮细胞及其重编程后的类光感受器细胞 | 数字病理学 | 视网膜退行性疾病 | RNA测序、甲基化测序 | NA | 转录组数据、表观遗传数据 | 涉及大量和单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 147 | 2024-08-08 |
Spatial Transcriptomic Analysis Reveals Associations between Genes and Cellular Topology in Breast and Prostate Cancers
2022-Oct-04, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14194856
PMID:36230778
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研究论文 | 本文通过空间转录组学分析,揭示了乳腺癌和前列腺癌中基因与细胞拓扑结构之间的关联 | 首次通过空间转录组学技术,探讨了细胞基因表达与其空间关系之间的联系 | NA | 研究乳腺癌和前列腺癌中基因表达与细胞空间关系之间的关联 | 乳腺癌和前列腺癌中的基因与细胞拓扑结构 | 数字病理学 | 乳腺癌, 前列腺癌 | 空间转录组学 | NA | 图像, 基因表达数据 | 700个图像拓扑特征在乳腺癌和前列腺癌空间转录组样本中 | NA | NA | NA | NA |
| 148 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analyses reveal distinct gene expression signatures of severe COVID-19 in the presence of clonal hematopoiesis
2022-10, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-022-00866-1
PMID:36229591
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析,揭示了克隆性造血(CHIP)在严重COVID-19患者中通过特定的基因表达程序影响免疫反应的机制 | 首次揭示了CHIP突变通过改变染色质结构,增强IFN-γ介导的炎症反应,从而增加严重COVID-19的风险 | NA | 探究CHIP在严重COVID-19中的免疫学特征及基因表达调控机制 | 严重COVID-19患者的单细胞转录组及CHIP相关的基因表达 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 外周血单个核细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 149 | 2024-08-08 |
Plap-1 lineage tracing and single-cell transcriptomics reveal cellular dynamics in the periodontal ligament
2022-10-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.201203
PMID:36245218
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研究论文 | 本研究通过Plap-1谱系追踪和单细胞转录组学揭示了牙周韧带中的细胞动态 | 首次鉴定了牙周韧带特异性细胞外基质蛋白Plap-1,并通过遗传谱系追踪和单细胞图谱定义了牙周韧带中的多种细胞群体及其在组织稳态和修复中的作用 | NA | 阐明牙周韧带中各种细胞类型的特征及其谱系层次 | 牙周韧带中的细胞类型及其在组织稳态和修复中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 150 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome profiling reveals the key role of ZNF683 in natural killer cell exhaustion in multiple myeloma
2022-10, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1065
PMID:36245253
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析和体外实验,揭示了ZNF683在多发性骨髓瘤中自然杀伤细胞耗竭的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序和体外实验验证了ZNF683在多发性骨髓瘤中自然杀伤细胞耗竭的分子机制 | 研究样本仅包括10名新诊断的多发性骨髓瘤患者和三名健康志愿者,可能影响结果的普遍性 | 旨在揭示和验证多发性骨髓瘤中自然杀伤细胞耗竭的分子调控因子,并为新的免疫疗法提供潜在目标 | 多发性骨髓瘤患者的骨髓和外周血样本中的自然杀伤细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 10名新诊断的多发性骨髓瘤患者和3名健康志愿者的骨髓和外周血样本 | NA | NA | NA | NA |
| 151 | 2024-08-08 |
IgE type multiple myeloma exhibits hypermutated phenotype and tumor reactive T cells
2022-10, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2022-005815
PMID:36252999
|
研究论文 | 本文通过综合分析DNA和单细胞RNA测序数据,全面剖析了IgE型kappa多发性骨髓瘤的基因组和免疫组库特征,并与非IgE型多发性骨髓瘤样本进行比较 | 揭示了IgE型多发性骨髓瘤独特的病理生理机制,并提出了针对高肿瘤突变负荷多发性骨髓瘤的个性化新表位靶向细胞治疗的新机会 | NA | 研究IgE型多发性骨髓瘤的遗传和免疫学特征,探索其治疗新策略 | IgE型kappa多发性骨髓瘤 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | DNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 免疫组库数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 152 | 2024-08-08 |
BATF epigenetically and transcriptionally controls the activation program of regulatory T cells in human tumors
2022-10-14, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abk0957
PMID:36206353
|
研究论文 | 本文研究了BATF在人肺肿瘤微环境中对调节性T细胞的表观遗传和转录调控作用 | 首次揭示了BATF通过表观遗传调控激活相关基因表达,从而影响T细胞在肿瘤微环境中的分化和功能 | NA | 探讨BATF在肿瘤微环境中对调节性T细胞分化和功能的调控机制 | 人肺肿瘤中的调节性T细胞及其表观遗传和转录调控 | 数字病理学 | 肺癌 | ATAC测序、单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 153 | 2024-08-08 |
Upper cortical layer-driven network impairment in schizophrenia
2022-10-14, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abn8367
PMID:36223459
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研究论文 | 本研究通过单核RNA测序和免疫组织化学分析,探讨了精神分裂症患者大脑皮质上层的神经网络损伤 | 首次通过单核RNA测序和空间转录组学技术,详细分析了精神分裂症患者大脑皮质上层神经元的转录组变化 | 研究样本仅限于精神分裂症患者和匹配的控制组,可能需要更多样化的样本以验证结果的普遍性 | 揭示精神分裂症对大脑皮质上层神经网络的影响 | 精神分裂症患者和匹配的控制组的大脑皮质上层神经元 | 数字病理学 | 精神分裂症 | 单核RNA测序 (snRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 超过220,000个神经元样本 | NA | NA | NA | NA |
| 154 | 2024-08-08 |
Pro-inflammatory megakaryocyte gene expression in murine models of breast cancer
2022-10-14, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abo5224
PMID:36223471
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research paper | 本研究使用自发性的乳腺癌小鼠模型,发现肿瘤负荷减少了巨核细胞的数量和大小,并干扰了多倍体化。单细胞RNA测序显示,肿瘤小鼠的巨核细胞表现出促炎性表型,蛋白质S100A8/A9和脂质运载蛋白-2水平在血小板中也增加,表明肿瘤诱导的巨核细胞改变传递给了血小板后代,促进了体外肿瘤细胞侵袭和肿瘤细胞肺部定植。 | 首次证明乳腺癌诱导的巨核细胞改变,导致血小板成分的质变,可能反馈促进肿瘤转移。 | NA | 研究乳腺癌对血小板产生巨核细胞的影响。 | 乳腺癌小鼠模型的巨核细胞和血小板。 | NA | breast cancer | single-cell RNA sequencing | NA | RNA | 肿瘤小鼠和野生型小鼠的巨核细胞和血小板。 | NA | NA | NA | NA |
| 155 | 2024-08-08 |
Decoding the transcriptome of calcified atherosclerotic plaque at single-cell resolution
2022-10-12, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-04056-7
PMID:36224302
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序和系统生物学方法分析了钙化动脉粥样硬化斑块中血管平滑肌细胞和内皮细胞的转录组特征 | 揭示了动脉粥样硬化斑块中细胞表达的炎症介质和基质分泌基因的解剖学区分,并识别了可能驱动细胞转分化的新候选基因 | NA | 探索动脉粥样硬化斑块的病理生理机制,并建立针对疾病进展的特定部位干预策略 | 钙化动脉粥样硬化斑块中的血管平滑肌细胞和内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 来自接受颈动脉内膜切除术患者的钙化动脉粥样硬化斑块和匹配的近端邻近颈动脉组织 | NA | NA | NA | NA |
| 156 | 2024-08-08 |
A single cell transcriptional roadmap of human pacemaker cell differentiation
2022-10-11, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.76781
PMID:36217819
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和轨迹推断,构建了人类诱导多能干细胞向窦房结样心肌细胞分化的转录变化和谱系决策路线图 | 首次揭示了人类起搏细胞分化过程中的分子机制,特别是SANCM和前心外膜细胞谱系的分离由WNT信号决定,以及TGFβ和WNT信号在过渡型和头部SANCM亚型分支中的作用 | NA | 揭示人类起搏细胞分化的分子过程 | 人类诱导多能干细胞向窦房结样心肌细胞的分化 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 157 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals the role of Macrophage-Naïve CD4 + T cell interaction in the immunosuppressive microenvironment of primary liver carcinoma
2022-10-11, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-022-03675-2
PMID:36221095
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研究论文 | 本研究利用单细胞和批量转录组数据,探讨了肝癌中免疫细胞间的重要相互作用及其靶向药物 | 揭示了巨噬细胞与幼稚CD4+ T细胞相互作用在肝癌免疫抑制微环境中的关键作用,并预测了相关药物 | 相关机制需要在实验和队列研究中进一步验证 | 研究肝癌中免疫细胞间的相互作用及其靶向药物 | 肝癌中的免疫细胞及其相互作用 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 31名处于健康、肝炎、肝硬化和癌症四种不同状态的患者 | NA | NA | NA | NA |
| 158 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic profiling for inferring tumor origin and mechanisms of therapeutic resistance
2022-Oct-10, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-022-00314-3
PMID:36210388
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术分析头颈鳞状细胞癌(HNSCC)患者的肿瘤样本,以推断肿瘤起源和治疗抵抗机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了HNSCC对检查点抑制剂治疗抵抗的机制,并证实了肿瘤的转移性质 | 研究样本仅来自单一患者,可能限制了结果的普遍性 | 识别HNSCC对检查点抑制剂治疗的反应和抵抗驱动因素 | 头颈鳞状细胞癌(HNSCC)患者的肿瘤样本 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 两个反应性病变和一个进展性病变 | NA | NA | NA | NA |
| 159 | 2024-08-08 |
Combination of oral STING agonist MSA-2 and anti-TGF-β/PD-L1 bispecific antibody YM101: a novel immune cocktail therapy for non-inflamed tumors
2022-10-08, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-022-01363-8
PMID:36209176
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研究论文 | 本文研究了口服STING激动剂MSA-2与抗TGF-β/PD-L1双特异性抗体YM101联合治疗非炎症性肿瘤的新型免疫鸡尾酒疗法 | MSA-2与YM101联合使用在增强天然和适应性免疫、促进抗原呈递、改善T细胞迁移和趋化性以及上调肿瘤浸润淋巴细胞数量和活性方面显示出协同效应 | NA | 探索MSA-2与YM101联合使用在非炎症性肿瘤模型中的抗肿瘤免疫增强效果 | 非炎症性肿瘤模型 | 免疫学 | 肿瘤 | 流式细胞术, RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 细胞, 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 160 | 2024-08-08 |
Characterization of placental and decidual cell development in early pregnancy loss by single-cell RNA sequencing
2022-Oct-08, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-022-00904-5
PMID:36209198
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,分析了早期妊娠丢失中绒毛和蜕膜细胞的发育情况 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了不同形式的早期妊娠丢失中绒毛和蜕膜细胞的独特基因表达特征 | NA | 旨在更好地理解早期妊娠丢失的病理机制 | 早期妊娠丢失中的绒毛和蜕膜细胞 | 数字病理学 | 妊娠疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 不同形式的早期妊娠丢失及正常妊娠的绒毛和蜕膜组织 | NA | NA | NA | NA |