单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 259 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2024-08-08 |
A Novel Algorithm for Feature Selection Using Penalized Regression with Applications to Single-Cell RNA Sequencing Data
2022-Oct-12, Biology
DOI:10.3390/biology11101495
PMID:36290397
|
研究论文 | 本文分析并比较了多种基于惩罚回归的方法在单细胞RNA测序数据中的特征选择性能，并提出了一种新的算法 | 提出了一种新的特征选择算法，该算法通过选择一小部分基因并应用稀疏组套索（SGL）方法来识别差异表达基因，无需特定领域的基因分组知识 | NA | 研究并改进单细胞RNA测序数据中的特征选择方法 | 单细胞RNA测序数据中的基因（特征）选择 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 惩罚回归方法（如稀疏组套索SGL、岭回归、套索回归等） | 基因表达数据 | 多个单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 122 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomic Profiling in Inherited Retinal Degeneration Reveals Distinct Metabolic Pathways in Rod and Cone Photoreceptors
2022-Oct-12, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms232012170
PMID:36293024
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，在遗传性视网膜变性的背景下，系统地绘制了小鼠视网膜在单细胞水平上的转录变化图谱 | 本研究首次在单细胞水平上揭示了遗传性视网膜变性中杆状和锥状光感受器的特定代谢途径变化 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能不完全适用于人类 | 旨在系统地映射遗传性视网膜变性中发生的转录变化 | 遗传性视网膜变性中的小鼠视网膜细胞 | 数字病理学 | 遗传性视网膜变性 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 43,979个单独细胞，分为20个不同的集群 | NA | NA | NA | NA |
| 123 | 2024-08-08 |
COVID-GWAB: A Web-Based Prediction of COVID-19 Host Genes via Network Boosting of Genome-Wide Association Data
2022-10-09, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom12101446
PMID:36291657
|
研究论文 | 本文介绍了COVID-GWAB，一个基于网络的工具，用于通过整合独立的功能信息来增强COVID-19患者的GWAS信号，并重新优先考虑候选宿主基因 | 通过整合分子相互作用等独立功能信息，增强弱关联信号，克服传统GWAS的统计能力限制 | NA | 研究影响COVID-19易感性和反应的宿主基因遗传因素 | COVID-19患者的宿主基因 | 生物信息学 | COVID-19 | GWAS | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 124 | 2024-08-08 |
Global genome decompaction leads to stochastic activation of gene expression as a first step toward fate commitment in human hematopoietic cells
2022-10, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3001849
PMID:36288293
|
研究论文 | 研究人类造血细胞在分化过程中基因表达激活的机制及其对命运承诺的影响 | 首次揭示了全局基因组解压缩作为命运承诺第一步的随机基因表达激活机制 | 研究主要集中在单个细胞层面，未涉及细胞群体层面的动态变化 | 理解人类造血细胞从多谱系预备状态建立和退出的机制 | 人类脐带血来源的CD34+细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和ATAC-seq | NA | 基因组数据 | 未明确具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 125 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics in planaria: new tools allow new insights into cellular and evolutionary features
2022-10-31, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20210825
PMID:36281987
|
综述 | 本文综述了单细胞转录组学在淡水涡虫中的应用，以及这些新技术如何帮助我们深入理解细胞和进化特征 | 介绍了单细胞转录组学在淡水涡虫中的最新进展和应用，包括板式方法、纳米滴方法和原位条形码方法 | NA | 回顾单细胞转录组学在淡水涡虫中的应用，并展望未来的研究方向 | 淡水涡虫的细胞类型及其分化轨迹 | 生物学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 126 | 2024-08-08 |
An asparagine metabolism-based classification reveals the metabolic and immune heterogeneity of hepatocellular carcinoma
2022-10-25, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-022-01380-z
PMID:36284275
|
研究论文 | 本研究基于天冬酰胺代谢水平对肝细胞癌（HCC）患者进行分类，并探讨其代谢和免疫异质性 | 首次详细探讨了天冬酰胺代谢在HCC中的状态及其相关机制，并发现GOT2作为潜在的预后标志物和治疗靶点 | NA | 探讨肝细胞癌中天冬酰胺代谢的状态及其相关机制，并寻找潜在的预后标志物和治疗靶点 | 肝细胞癌患者及其天冬酰胺代谢水平 | 数字病理学 | 肝癌 | 共识聚类、最小绝对收缩与选择算子回归、基因本体论分析、京都基因与基因组百科全书分析、基因集富集分析、CIBERSORT算法、单细胞RNA测序 | UMAP | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 来自三个队列的HCC样本 | NA | NA | NA | NA |
| 127 | 2024-08-08 |
Combining denoising of RNA-seq data and flux balance analysis for cluster analysis of single cells
2022-Oct-25, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-022-04967-6
PMID:36284276
|
研究论文 | 本文研究了去噪策略在单细胞RNA测序数据预处理中的作用，并将其应用于代谢网络分析和单细胞聚类分析 | 首次探讨了去噪策略在整合单细胞RNA测序数据到代谢网络分析中的应用，并展示了去噪对恢复重要代谢特性的效果 | NA | 研究去噪策略在单细胞RNA测序数据预处理中的作用，并探讨其对代谢表型聚类分析的影响 | 单细胞RNA测序数据的去噪处理及其在代谢网络分析中的应用 | 生物信息学 | NA | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 三个公共单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 128 | 2024-08-08 |
A single-cell transcriptomic inventory of murine smooth muscle cells
2022-10-24, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.09.015
PMID:36283392
|
研究论文 | 本文通过深度单细胞RNA测序结合原位基因和蛋白表达分析，研究了小鼠心脏、主动脉、肺和结肠中平滑肌细胞的分子基础 | 首次揭示了血管、内脏和气道平滑肌细胞之间的高水平差异，以及弹性动脉和肌性动脉平滑肌细胞之间的细微差异 | NA | 探索平滑肌细胞在不同器官系统中的分子差异 | 小鼠的平滑肌细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及心脏、主动脉、肺和结肠四个器官 | NA | NA | NA | NA |
| 129 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic analysis highlights origin and pathological process of human endometrioid endometrial carcinoma
2022-10-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-33982-7
PMID:36273006
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了正常子宫内膜、非典型子宫内膜增生和子宫内膜样子宫内膜癌的细胞，揭示了子宫内膜癌的起源和病理过程 | 本研究首次通过单细胞RNA测序揭示了子宫内膜样子宫内膜癌起源于子宫内膜上皮细胞而非基质细胞，并识别了LCN2+/SAA1/2+细胞作为子宫内膜癌变的一个特征性亚群 | NA | 阐明子宫内膜样子宫内膜癌发展过程中细胞群体的演变 | 正常子宫内膜、非典型子宫内膜增生和子宫内膜样子宫内膜癌的细胞 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 130 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing deconvolutes cellular responses to exercise in human skeletal muscle
2022-10-22, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-04088-z
PMID:36273106
|
研究论文 | 本文利用单细胞测序技术研究了人类骨骼肌在剧烈运动前后细胞组成和细胞类型特异性过程的变化 | 首次通过单细胞测序揭示了运动对骨骼肌细胞类型特异性适应机制的影响 | NA | 探究运动对人类骨骼肌细胞类型特异性适应机制的影响 | 人类骨骼肌细胞在运动前后的变化 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 15个细胞集群，来自6种不同的细胞群体 | NA | NA | NA | NA |
| 131 | 2024-08-08 |
Gossypetin ameliorates 5xFAD spatial learning and memory through enhanced phagocytosis against Aβ
2022-10-21, Alzheimer's research & therapy
DOI:10.1186/s13195-022-01096-3
PMID:36271414
|
研究论文 | 研究探讨了gossypetin通过增强小胶质细胞对Aβ的吞噬作用，改善5xFAD小鼠的空间学习和记忆能力 | gossypetin能够增强小胶质细胞对Aβ的吞噬活性，减少其胶质化，并增加MHC II+小胶质细胞群体 | NA | 探索gossypetin作为治疗阿尔茨海默病（AD）的新型潜在治疗候选药物 | 5xFAD AD模型小鼠 | NA | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 实验涉及5xFAD AD模型小鼠，进行了13周的gossypetin治疗 | NA | NA | NA | NA |
| 132 | 2024-08-08 |
Blood monocyte-derived CD169+ macrophages contribute to antitumor immunity against glioblastoma
2022-10-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-34001-5
PMID:36266311
|
研究论文 | 本文研究了血液单核细胞来源的CD169+巨噬细胞在对抗胶质母细胞瘤（GBM）中的抗肿瘤免疫作用 | 本文首次鉴定了一种促进抗肿瘤微环境的CD169巨噬细胞亚群，并揭示了其通过产生促炎性趋化因子吸引T细胞和NK细胞的机制 | NA | 研究肿瘤相关巨噬细胞（TAM）在胶质母细胞瘤免疫治疗中的作用 | CD169+巨噬细胞及其在胶质母细胞瘤中的作用 | NA | 脑瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组 | 人类和小鼠的胶质瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 133 | 2024-08-08 |
High-resolution single-cell analysis paves the cellular path for brain regeneration in salamanders
2022-Oct-19, Cell regeneration (London, England)
DOI:10.1186/s13619-022-00144-5
PMID:36258096
|
研究论文 | 本研究利用高分辨率单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了蝾螈端脑细胞的分化路径，为理解脊椎动物大脑的进化、发育和再生提供了新见解 | 首次通过高分辨率单细胞RNA测序和空间转录组学技术，详细描述了蝾螈大脑再生的细胞分化路径 | NA | 探索蝾螈大脑再生的分子和细胞机制，以及脊椎动物大脑结构的进化 | 蝾螈端脑细胞的分化路径 | 数字病理学 | NA | 高分辨率单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 134 | 2024-08-08 |
Insights into skeletal stem cells
2022-Oct-19, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-022-00235-8
PMID:36261411
|
综述 | 本文回顾了骨骼干细胞（SSCs）的鉴定和功能研究，讨论了鉴定真正SSCs的原则和方法，并强调了绘制SSCs谱系图谱的开创性发现。 | 利用荧光激活细胞分选、谱系追踪和单细胞测序技术，识别了多种类型的SSCs，并绘制了谱系承诺轨迹，部分揭示了其在生理和病理条件下的特性。 | 文章主要集中在争议和SSC研究中的挑战，未详细说明具体的局限性。 | 回顾和讨论骨骼干细胞的鉴定、功能及其在骨骼系统中的作用。 | 骨骼干细胞及其在长骨、颅面组织和骨膜中的作用。 | NA | NA | 荧光激活细胞分选、谱系追踪、单细胞测序 | NA | 细胞 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 135 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptome profiling of normal human liver
2022-10-19, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-022-01676-w
PMID:36261431
|
研究论文 | 本文通过空间转录组学技术对正常人肝脏组织切片进行了详细研究，提供了肝脏分区在转录水平上的详细信息 | 本文首次提供了来自两个正常人肝脏捐赠者的6581个高质量spot，并对肝细胞进行了四个亚组的分类 | NA | 研究人类肝脏的空间细胞解剖结构，以解决肝脏疾病的细胞起源问题 | 正常人肝脏组织 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 两个正常人肝脏捐赠者的6581个高质量spot | NA | NA | NA | NA |
| 136 | 2024-08-08 |
scRNA-seq generates a molecular map of emerging cell subtypes after sciatic nerve injury in rats
2022-10-19, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-03970-0
PMID:36261573
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，生成了大鼠坐骨神经损伤后新兴细胞亚型的分子图谱 | 首次提供了高分辨率的转录组图谱，揭示了神经损伤后细胞异质性的详细分子特征 | NA | 开发针对外周神经损伤、病毒感染或代谢紊乱引起的神经痛的新疗法 | 大鼠坐骨神经损伤后的细胞亚型及其分子特征 | 数字病理学 | 神经痛 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过110,000个单个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 137 | 2024-08-08 |
Reprogramming of myeloid cells and their progenitors in patients with non-medullary thyroid carcinoma
2022-10-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-33907-4
PMID:36257966
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和功能分析，探讨了非髓性甲状腺癌患者骨髓细胞及其前体细胞在治疗前后的转录和功能变化 | 首次展示了非髓性甲状腺癌患者骨髓细胞及其前体细胞在肿瘤浸润前的转录和功能变化，并揭示了治疗对其的影响 | NA | 研究非髓性甲状腺癌患者骨髓细胞及其前体细胞的转录和功能变化及其对治疗的反应 | 非髓性甲状腺癌患者的骨髓细胞及其前体细胞 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 138 | 2024-08-08 |
Dissecting the genetic and microenvironmental factors of gastric tumorigenesis in mice
2022-10-18, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111482
PMID:36261019
|
研究论文 | 本研究通过基因编辑的小鼠胃类器官生成了一系列原发性胃癌模型，揭示了从异型增生到分化良好和分化不良胃癌的遗传驱动因素，并探讨了微环境在胃癌转移中的关键作用。 | 本研究首次通过基因编辑的小鼠胃类器官模型，详细解析了胃癌发生过程中的遗传和微环境因素，特别是揭示了特定细胞间相互作用在胃癌远端转移中的作用。 | 研究主要在小鼠模型中进行，其结果在人类胃癌中的适用性需要进一步验证。 | 探讨胃癌发生和进展的遗传和微环境机制。 | 小鼠胃癌模型及其遗传和微环境因素。 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 一系列基因编辑的小鼠胃类器官 | NA | NA | NA | NA |
| 139 | 2024-08-08 |
Self-organizing in vitro mouse neural tube organoids mimic embryonic development
2022-10-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.201052
PMID:36268933
|
研究论文 | 本文报道了一种由单个小鼠胚胎干细胞衍生的自组织3D神经管类器官模型，该模型展示了与体内相似的组织结构、细胞类型组成和前后模式 | 首次实现了在哺乳动物模型中实时观察迁移的神经嵴细胞的吞噬作用 | NA | 研究早期神经发育过程中的关键形态发生和细胞类型衍生事件 | 小鼠胚胎干细胞衍生的3D神经管类器官 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组分析 | 3D神经管类器官模型 | 细胞 | 单个小鼠胚胎干细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 140 | 2024-08-08 |
Mapping the adult human esophagus in vivo and in vitro
2022-10-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.200614
PMID:36278875
|
研究论文 | 本文创建了成人食管细胞类型的图谱，并建立了用于研究稳态和损伤的体外食管组织生物库，同时使用成人食管图谱对体外模型进行了基准测试。 | 首次创建了成人食管的单细胞RNA测序参考图谱，并展示了体外培养模型可以用于模拟完整的食管上皮层。 | NA | 研究人类食管的发育、稳态和疾病。 | 成人食管的细胞类型和体外模型。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 55条患者来源的体外培养线 | NA | NA | NA | NA |