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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2024-08-08 |
Targeting leptin-positive adipocytes by expressing the Cre recombinase transgene under the endogenous leptin gene
2022-Oct-20, Yi chuan = Hereditas
DOI:10.16288/j.yczz.22-236
PMID:36384730
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研究论文 | 本文报道了构建和验证Lep-Cre小鼠品系,该品系通过CRISPR-Cas9技术编辑内源性Lep基因,生成Lep-肽2A(P2A)-Cre融合基因,用于特异性标记LEP阳性脂肪细胞 | 首次构建了特异性靶向LEP脂肪细胞的Lep-Cre小鼠品系 | 在周围器官中观察到不同程度的泄漏活性,但在下丘脑的室旁核中未观察到 | 研究LEP脂肪细胞的发育和生理 | LEP阳性脂肪细胞 | NA | NA | CRISPR-Cas9技术 | NA | NA | Lep-Cre Rosa26-loxP-Stop-loxP-tdTomato小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 82 | 2024-08-08 |
Identification of novel prognostic biomarkers for osteosarcoma: a bioinformatics analysis of differentially expressed genes in the mesenchymal stem cells from single-cell sequencing data set
2022-Oct, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-22-2370
PMID:36388032
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析单细胞RNA测序数据集,探索了间充质干细胞(MSCs)在高级骨肉瘤(OS)中的特异性差异表达基因(DEGs),并识别了新的预后生物标志物。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序数据集,识别了MSCs与骨形成细胞之间的特异性DEGs,并进一步分析了这些基因的预后价值。 | 本研究主要基于生物信息学分析,需要进一步的实验验证以确认这些基因的预后价值。 | 探索间充质干细胞在骨肉瘤生长和进展中的作用,并识别新的预后生物标志物。 | 间充质干细胞(MSCs)和骨肉瘤细胞中的差异表达基因。 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 分析了来自GSE152048数据集的MSCs特异性DEGs,并进一步验证了GSE42352数据集中的表达情况。 | NA | NA | NA | NA |
| 83 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Analysis Identified ASTN2 as a Migration Biomarker in Adult Glioblastoma
2022-Oct-30, Brain sciences
IF:2.7Q3
DOI:10.3390/brainsci12111472
PMID:36358398
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,在成人胶质母细胞瘤中鉴定了ASTN2作为迁移生物标志物 | 首次报道了ASTN2在胶质母细胞瘤细胞迁移中的作用,并验证了其在临床预后中的不良影响 | NA | 探索成人胶质母细胞瘤中ASTN2的表达及其对细胞迁移能力的影响 | 成人胶质母细胞瘤细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 84 | 2024-08-08 |
A Resilience Related Glial-Neurovascular Network Is Transcriptionally Activated after Chronic Social Defeat in Male Mice
2022-10-27, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11213405
PMID:36359800
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研究论文 | 本研究通过数据驱动的行为分层和单细胞转录组学分析,探讨了慢性社交挫败应激后小鼠海马体的分子机制 | 揭示了慢性应激后海马体在神经免疫反应、血管生成、髓鞘形成和神经发生中的作用,并证明了雷帕霉素作为药物干预可以显著增加应激恢复力 | NA | 理解慢性应激反应的分子过程并探索针对性的干预措施 | 小鼠海马体在慢性社交挫败应激后的分子响应 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 85 | 2024-08-08 |
Multiplexed Digital Spatial Protein Profiling Reveals Distinct Phenotypes of Mononuclear Phagocytes in Livers with Advanced Fibrosis
2022-10-26, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11213387
PMID:36359782
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研究论文 | 本研究利用多重数字空间蛋白质分析技术,揭示了晚期肝纤维化中肝内单核吞噬细胞的独特蛋白质特征 | 首次使用空间定义的基于蛋白质的多重分析技术,展示了早期和晚期肝纤维化中门静脉单核吞噬细胞表型的关键差异 | NA | 旨在通过多重数字空间蛋白质分析技术,推导出预测晚期肝纤维化的独特蛋白质特征 | 肝内单核吞噬细胞在晚期肝纤维化中的表型 | 数字病理学 | 肝病 | 多重数字空间蛋白质分析(Nanostring GeoMX) | NA | 蛋白质数据 | 64个门静脉感兴趣区域(ROIs) | NA | NA | NA | NA |
| 86 | 2024-08-08 |
Prognosis and Immunological Characteristics of PGK1 in Lung Adenocarcinoma: A Systematic Analysis
2022-Oct-25, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14215228
PMID:36358653
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研究论文 | 本文通过系统分析探讨了磷酸甘油酸激酶1(PGK1)在肺腺癌(LUAD)中的预后和免疫学特性 | 首次确定了PGK1在肺腺癌中改变肿瘤微环境(TME)的作用,并揭示了PGK1与多种免疫细胞和免疫检查点的关联 | 需要更多的实验和临床转化研究来验证PGK1在肺腺癌中的作用 | 研究PGK1在肺腺癌中的预后和免疫学特性,探索潜在的免疫代谢联合治疗策略 | 肺腺癌中的PGK1基因及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 肺腺癌 | DNA测序、mRNA测序、甲基化修饰、单细胞RNA测序、蛋白质组学 | NA | 基因组数据、转录组数据、表观遗传数据、蛋白质数据 | 多个独立公共数据集中的大量样本 | NA | NA | NA | NA |
| 87 | 2024-08-08 |
Exploring Transcriptomic Landscapes in Red Blood Cells, in Their Extracellular Vesicles and on a Single-Cell Level
2022-Oct-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms232112897
PMID:36361688
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研究论文 | 本文通过下一代测序和单细胞RNA测序技术,研究了红细胞及其细胞外囊泡的转录组特征 | 首次在单细胞水平上揭示了红细胞中约10%的细胞含有可检测水平的mRNA,并形成了基于转录组的三个亚群 | 文章未明确提及研究的局限性 | 探索红细胞及其细胞外囊泡的转录组特征,并研究这些转录组在细胞间通讯中的作用 | 红细胞及其细胞外囊泡的转录组 | 数字病理学 | NA | 下一代测序, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 88 | 2024-08-08 |
Heterogeneity and Differentiation Trajectories of Infiltrating CD8+ T Cells in Lung Adenocarcinoma
2022-Oct-22, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14215183
PMID:36358600
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析了肺腺癌中浸润性CD8+ T细胞的异质性和分化轨迹 | 首次详细描述了肺腺癌中CD8+ T细胞的分化轨迹和功能状态,并筛选出影响患者预后的关键基因 | 研究仅基于单个数据集,结果的普遍性和可重复性有待进一步验证 | 深入理解肺腺癌中浸润性CD8+ T细胞的异质性和功能耗竭,并寻找潜在的治疗靶点 | 肺腺癌中的CD8+ T细胞及其分化轨迹 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 使用了GSE131907数据集中的样本,并在TCGA样本中进行了验证 | NA | NA | NA | NA |
| 89 | 2024-08-08 |
Aberrant Expression of Thymosin Beta-4 Correlates With Advanced Disease and BRAF V600E Mutation in Thyroid Cancer
2022-10, The journal of histochemistry and cytochemistry : official journal of the Histochemistry Society
DOI:10.1369/00221554221138370
PMID:36321670
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研究论文 | 本研究探讨了胸腺素β-4(TMSB4X)在良性和恶性甲状腺肿瘤中的免疫染色模式 | 发现TMSB4X在多种甲状腺癌中异常高表达,并与疾病进展特征相关,可能是BRAF V600E突变的新型下游效应因子 | NA | 研究TMSB4X在甲状腺肿瘤中的表达及其与疾病进展的关系 | 胸腺素β-4在甲状腺良恶性肿瘤中的表达 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织 | 141名分化型甲状腺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 90 | 2024-08-08 |
Intra-tumor heterogeneity and prognostic risk signature for hepatocellular carcinoma based on single-cell analysis
2022-10, Experimental biology and medicine (Maywood, N.J.)
DOI:10.1177/15353702221110659
PMID:36330895
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析肝细胞癌的肿瘤内异质性,并建立了一个新的九基因预后模型 | 首次基于单细胞RNA测序数据建立了肝细胞癌的九基因预后模型,揭示了肝细胞癌微环境中不同细胞亚群的特征 | NA | 研究肝细胞癌的肿瘤内异质性并建立预后风险模型 | 肝细胞癌及其癌旁组织 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 64,634个单细胞样本,包括13个肝细胞癌样本和8个癌旁样本 | NA | NA | NA | NA |
| 91 | 2024-08-08 |
SIRPα antibody combined with oncolytic virus OH2 protects against tumours by activating innate immunity and reprogramming the tumour immune microenvironment
2022-10-31, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-022-02574-z
PMID:36310169
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研究论文 | 本文首次尝试将溶瘤单纯疱疹病毒2型(OH2)与抗SIRPα抗体联合用于抗肿瘤治疗,并探讨了这种组合对肿瘤免疫微环境的重新编程作用 | 首次将溶瘤病毒OH2与抗SIRPα抗体联合用于抗肿瘤治疗,为溶瘤病毒疗法提供了新策略 | NA | 探讨溶瘤病毒与免疫检查点阻断剂联合治疗的可行性及机制 | 溶瘤病毒OH2与抗SIRPα抗体的联合治疗对肿瘤免疫微环境的影响 | 免疫学 | 肿瘤 | RNA测序和单细胞RNA测序 | NA | 细胞和动物模型数据 | 使用了RAW264.7细胞和小鼠肿瘤模型 | NA | NA | NA | NA |
| 92 | 2024-08-08 |
Revised International Staging System (R-ISS) stage-dependent analysis uncovers oncogenes and potential immunotherapeutic targets in multiple myeloma (MM)
2022-10-31, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.75340
PMID:36315425
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研究论文 | 本研究通过构建单细胞转录组图谱,比较了修订国际分期系统(R-ISS)不同阶段多发性骨髓瘤(MM)患者中的差异表达模式 | 发现了新的细胞毒性浆细胞(PC)群体,以及与不良预后和EB病毒感染相关的恶性PC群体,并验证了RRM2在MM细胞增殖中的作用 | NA | 探索多发性骨髓瘤(MM)中修订国际分期系统(R-ISS)阶段依赖的分析,以发现致癌基因和潜在的免疫治疗靶点 | 多发性骨髓瘤(MM)患者的单细胞转录组 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 收集了多发性骨髓瘤(MM)患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 93 | 2024-08-08 |
Characterization of EGFR-reprogrammable temozolomide-resistant cells in a model of glioblastoma
2022-Oct-31, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-022-01230-y
PMID:36316307
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研究论文 | 本文通过建立一个获得性TMZ耐药异种移植模型,研究了MGMT-null实验性胶质母细胞瘤中TMZ耐药细胞的特性 | 本文首次揭示了表皮生长因子受体(EGFR)缺陷和下游信号减弱可能导致三重阳性CSCs亚群的静止表型和化学耐药性,并提出EGF+TMZ联合治疗可能是克服细胞静止和TMZ耐药的有效策略 | NA | 研究TMZ耐药胶质母细胞瘤细胞的特性,并探索克服TMZ耐药的新策略 | TMZ耐药的胶质母细胞瘤细胞 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 细胞 | 使用MGMT-超甲基化U87细胞建立的异种移植模型 | NA | NA | NA | NA |
| 94 | 2024-08-08 |
Sex differences exist in adult heart group 2 innate lymphoid cells
2022-10-31, BMC immunology
IF:2.9Q3
DOI:10.1186/s12865-022-00525-0
PMID:36316644
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研究论文 | 本文研究了成年心脏中第2组先天淋巴细胞(ILC2s)的性别差异 | 首次揭示了心脏ILC2s中存在的性别差异,并探讨了可能的机制 | 研究仅限于小鼠模型,且未探讨人类中的相关性 | 探讨心脏ILC2s在不同性别小鼠中的数量和功能差异 | 小鼠心脏中的第2组先天淋巴细胞(ILC2s) | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括3周和8周龄的野生型(WT)和Rag2-/-小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 95 | 2024-08-08 |
Scoring model based on the signature of non-m6A-related neoantigen-coding lncRNAs assists in immune microenvironment analysis and TCR-neoantigen pair selection in gliomas
2022-10-29, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-022-03713-z
PMID:36309750
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研究论文 | 本文研究了非m6A相关新抗原编码长非编码RNA(lncRNA)在胶质瘤中的作用,并建立了一个新抗原激活评分(NAS)模型来预测患者的生存结果和TCR-新抗原配对选择。 | 本文首次建立了基于非m6A相关新抗原编码lncRNA特征的NAS模型,并验证了其在预测胶质瘤患者生存结果和TCR-新抗原配对选择中的有效性。 | 本文的局限性在于仅分析了13种非m6A相关新抗原编码lncRNA,且模型验证的数据集有限。 | 研究非m6A相关新抗原编码lncRNA在胶质瘤进展中的作用,并探索其在CAR-T细胞疗法中的潜在应用。 | 非m6A相关新抗原编码lncRNA、胶质瘤患者的生存结果、TCR-新抗原配对选择。 | 数字病理学 | 脑瘤 | 机器学习 | NAS模型 | RNA测序数据、单细胞测序数据 | 13种非m6A相关新抗原编码lncRNA,两个RNA-seq数据集和两个单细胞测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 96 | 2024-08-08 |
Reactive Oxygen Species and Oxidative Stress in the Pathogenesis of MAFLD
2022-Oct-28, Journal of clinical and translational hepatology
IF:3.1Q2
DOI:10.14218/JCTH.2022.00067
PMID:36304513
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研究论文 | 本文探讨了代谢相关脂肪性肝病(MAFLD)的发病机制,特别是活性氧(ROS)和氧化应激的作用 | 研究了Nrf2激活、甲状腺激素受体β(THRβ)激动剂和核过氧化物酶体增殖激活受体(PPAR)家族在减少MAFLD中氧化应激和炎症的作用,并采用了多组学策略进行假设自由的分子变化分析 | MAFLD进展的临床和分子成分之间的真正相互作用仍部分未被理解 | 研究MAFLD的发病机制及其与氧化应激的关系 | 代谢相关脂肪性肝病(MAFLD)及其发病机制 | NA | 代谢相关脂肪性肝病 | 多组学分析 | NA | 转录组 | 未具体说明 | NA | NA | NA | NA |
| 97 | 2024-08-08 |
Osteocytes regulate senescence of bone and bone marrow
2022-10-28, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.81480
PMID:36305580
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研究论文 | 研究探讨了成骨细胞在调节骨骼和骨髓衰老中的作用 | 首次证明了成骨细胞通过调节衰老相关分泌表型(SASP)在骨和骨髓细胞谱系规范中发挥关键作用 | NA | 探究成骨细胞在骨和骨髓细胞谱系规范及组织稳态中的调节作用 | 成骨细胞及其在骨骼和骨髓衰老中的作用 | NA | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用条件性删除成骨细胞的鼠模型进行研究 | NA | NA | NA | NA |
| 98 | 2024-08-08 |
Multi-level cellular and functional annotation of single-cell transcriptomes using scPipeline
2022-10-28, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-04093-2
PMID:36307536
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研究论文 | 本文介绍了一个名为scPipeline的单细胞数据分析工具箱,该工具箱基于现有方法,提供模块化工作流程,用于多层次细胞注释和用户友好的分析报告 | scPipeline引入了基于共依赖指数(CDI)的差异表达、使用标记特异性的聚类分辨率优化、基于Miko评分的标记细胞类型注释以及使用无标度共享最近邻网络(SSN)的基因程序发现等新功能 | NA | 开发一个灵活的计算框架,用于深入的单细胞RNA测序分析 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 无标度共享最近邻网络(SSN) | 转录组数据 | 使用多种单细胞RNA测序数据集进行验证 | NA | NA | NA | NA |
| 99 | 2024-08-08 |
Live slow-frozen human tumor tissues viable for 2D, 3D, ex vivo cultures and single-cell RNAseq
2022-10-28, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-04025-0
PMID:36307545
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research paper | 本文展示了从多种实体人癌症中直接慢速冷冻的剩余组织,可以在后续用于不同类型的方法,包括建立2D、3D和体外培养以及单细胞RNA测序 | 本文首次展示了慢速冷冻的人类肿瘤组织可以用于多种生物学方法,包括2D、3D培养和单细胞RNA测序 | NA | 验证慢速冷冻的人类肿瘤组织在不同生物学方法中的应用 | 多种实体人癌症的剩余组织 | digital pathology | NA | single-cell RNA sequencing | NA | tissue | 多种实体人癌症的剩余组织 | NA | NA | NA | NA |
| 100 | 2024-08-08 |
Subcellular spatial transcriptomics identifies three mechanistically different classes of localizing RNAs
2022-10-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-34004-2
PMID:36289223
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研究论文 | 本文通过亚细胞空间转录组学技术,识别了柱状卵泡上皮细胞(FE)顶端和基底域定位的RNA,并分析了介导其定位的机制 | 首次在单一组织中全面分析RNA定位的机制,并发现了至少三种不同的RNA定位机制 | NA | 研究RNA在细胞内的定位机制及其对细胞功能极化的贡献 | RNA在柱状卵泡上皮细胞中的定位及其机制 | NA | NA | 亚细胞空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 柱状卵泡上皮细胞 | NA | NA | NA | NA |