单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 258 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-08-07 |
Patient-specific modeling of stroma-mediated chemoresistance of pancreatic cancer using a three-dimensional organoid-fibroblast co-culture system
2022-Oct-22, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-022-02519-7
PMID:36273171
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研究论文 | 本文通过建立三维共培养系统，研究了癌症相关成纤维细胞（CAFs）对胰腺癌化疗抵抗的影响。 | 首次使用三维共培养系统，结合单细胞RNA测序，揭示了CAFs诱导的上皮间质转化（EMT）在胰腺癌化疗抵抗中的作用。 | NA | 探讨CAFs在胰腺癌化疗抵抗中的作用及其分子机制。 | 胰腺癌组织、患者来源的肿瘤类器官及匹配的CAFs。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | 三维共培养系统 | 图像数据 | 三个类器官/CAF对 |
| 62 | 2024-08-07 |
PD-L1-directed PlGF/VEGF blockade synergizes with chemotherapy by targeting CD141+ cancer-associated fibroblasts in pancreatic cancer
2022-10-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-33991-6
PMID:36272973
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研究论文 | 本文揭示了化疗在胰腺导管腺癌（PDAC）中上调胎盘生长因子（PlGF），激活癌症相关成纤维细胞（CAFs）导致纤维化相关胶原蛋白沉积的机制，并开发了一种多价VEGF诱饵受体（Ate-Grab），通过PD-L1介导的PlGF/VEGF阻断，与吉西他滨协同作用，减少CD141 CAF群体，从而对抗肿瘤和抗纤维化。 | 开发了一种新的多价VEGF诱饵受体（Ate-Grab），通过PD-L1介导的PlGF/VEGF阻断，与吉西他滨协同作用，减少CD141 CAF群体，为治疗胰腺癌提供了新的组合疗法。 | NA | 阐明化疗诱导的胰腺癌纤维化机制，并探索新的组合治疗策略。 | 胰腺导管腺癌（PDAC）及其相关成纤维细胞（CAFs）。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 63 | 2024-08-07 |
Single cell RNA-seq reveals the CCL5/SDC1 receptor-ligand interaction between T cells and tumor cells in pancreatic cancer
2022-10-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2022.215834
PMID:35917973
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了胰腺癌中T细胞与肿瘤细胞之间的CCL5/SDC1受体-配体相互作用 | 首次全面描绘了胰腺导管腺癌中T细胞的全谱及其与肿瘤细胞的交流，并发现了CCL5通过与SDC1相互作用促进肿瘤细胞迁移 | NA | 旨在识别胰腺导管腺癌中T细胞的全谱及其与肿瘤细胞的交流 | 胰腺导管腺癌中的T细胞及其与肿瘤细胞的相互作用 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个数据集，包括来自本机构和公开数据库的数据 |
| 64 | 2024-08-07 |
Expression of myelin transcription factor 1 and lamin B receptor mediate neural progenitor fate transition in the zebrafish spinal cord pMN domain
2022-10, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2022.102452
PMID:36063998
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，在斑马鱼脊髓pMN域中发现了pMN前体细胞的先前未知的异质性，并鉴定了两种不同的运动神经元谱系。实验验证了转录因子myt1和核内膜整合蛋白lbr在运动神经元发育和神经前体细胞维持中的关键作用。 | 本研究首次揭示了斑马鱼脊髓pMN域中pMN前体细胞的异质性，并鉴定了两种不同的运动神经元谱系，为理解神经前体细胞命运转变的分子编程提供了深入见解。 | NA | 旨在深入理解斑马鱼脊髓pMN域中神经前体细胞命运转变的分子编程。 | 斑马鱼脊髓pMN域中的神经前体细胞及其命运转变。 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 65 | 2024-08-08 |
scEMAIL: Universal and Source-free Annotation Method for scRNA-seq Data with Novel Cell-type Perception
2022-10, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2022.12.008
PMID:36608843
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研究论文 | 提出了一种名为scEMAIL的通用注释框架，用于单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据，能够在不访问源数据的情况下自动检测新型细胞类型 | 设计了一个新型细胞类型感知模块，通过专家集成系统、双峰性测试和自适应阈值来识别新型细胞类型，并使用局部亲和正则化来减轻批次效应 | 未提及具体限制 | 开发一种无需源数据即可自动注释和检测新型细胞类型的方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据 | 未提及具体样本量 |
| 66 | 2024-08-08 |
Characteristic analysis of skin keratinocytes in patients with type 2 diabetes based on the single-cell levels
2022-Oct-20, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000002323
PMID:36583863
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研究论文 | 本研究旨在探索2型糖尿病患者皮肤角质形成细胞在单细胞水平的转录特征，为揭示病理条件下角质形成细胞的病理机制提供实验数据 | 本研究首次在单细胞水平上分析了2型糖尿病患者皮肤角质形成细胞的转录特征，并筛选出一系列差异表达基因 | 研究样本量较小，仅包括两名2型糖尿病患者和一名非糖尿病患者，可能影响结果的普遍性和可靠性 | 探索2型糖尿病患者皮肤角质形成细胞的转录特征 | 2型糖尿病患者的皮肤角质形成细胞 | NA | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两名2型糖尿病患者和一名非糖尿病患者的皮肤组织样本 |
| 67 | 2024-08-08 |
Targeting leptin-positive adipocytes by expressing the Cre recombinase transgene under the endogenous leptin gene
2022-Oct-20, Yi chuan = Hereditas
DOI:10.16288/j.yczz.22-236
PMID:36384730
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研究论文 | 本文报道了构建和验证Lep-Cre小鼠品系，该品系通过CRISPR-Cas9技术编辑内源性Lep基因，生成Lep-肽2A（P2A）-Cre融合基因，用于特异性标记LEP阳性脂肪细胞 | 首次构建了特异性靶向LEP脂肪细胞的Lep-Cre小鼠品系 | 在周围器官中观察到不同程度的泄漏活性，但在下丘脑的室旁核中未观察到 | 研究LEP脂肪细胞的发育和生理 | LEP阳性脂肪细胞 | NA | NA | CRISPR-Cas9技术 | NA | NA | Lep-Cre Rosa26-loxP-Stop-loxP-tdTomato小鼠 |
| 68 | 2024-08-08 |
Identification of novel prognostic biomarkers for osteosarcoma: a bioinformatics analysis of differentially expressed genes in the mesenchymal stem cells from single-cell sequencing data set
2022-Oct, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-22-2370
PMID:36388032
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析单细胞RNA测序数据集，探索了间充质干细胞（MSCs）在高级骨肉瘤（OS）中的特异性差异表达基因（DEGs），并识别了新的预后生物标志物。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序数据集，识别了MSCs与骨形成细胞之间的特异性DEGs，并进一步分析了这些基因的预后价值。 | 本研究主要基于生物信息学分析，需要进一步的实验验证以确认这些基因的预后价值。 | 探索间充质干细胞在骨肉瘤生长和进展中的作用，并识别新的预后生物标志物。 | 间充质干细胞（MSCs）和骨肉瘤细胞中的差异表达基因。 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 分析了来自GSE152048数据集的MSCs特异性DEGs，并进一步验证了GSE42352数据集中的表达情况。 |
| 69 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Analysis Identified ASTN2 as a Migration Biomarker in Adult Glioblastoma
2022-Oct-30, Brain sciences
IF:2.7Q3
DOI:10.3390/brainsci12111472
PMID:36358398
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，在成人胶质母细胞瘤中鉴定了ASTN2作为迁移生物标志物 | 首次报道了ASTN2在胶质母细胞瘤细胞迁移中的作用，并验证了其在临床预后中的不良影响 | NA | 探索成人胶质母细胞瘤中ASTN2的表达及其对细胞迁移能力的影响 | 成人胶质母细胞瘤细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 70 | 2024-08-08 |
A Resilience Related Glial-Neurovascular Network Is Transcriptionally Activated after Chronic Social Defeat in Male Mice
2022-10-27, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11213405
PMID:36359800
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研究论文 | 本研究通过数据驱动的行为分层和单细胞转录组学分析，探讨了慢性社交挫败应激后小鼠海马体的分子机制 | 揭示了慢性应激后海马体在神经免疫反应、血管生成、髓鞘形成和神经发生中的作用，并证明了雷帕霉素作为药物干预可以显著增加应激恢复力 | NA | 理解慢性应激反应的分子过程并探索针对性的干预措施 | 小鼠海马体在慢性社交挫败应激后的分子响应 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 71 | 2024-08-08 |
Multiplexed Digital Spatial Protein Profiling Reveals Distinct Phenotypes of Mononuclear Phagocytes in Livers with Advanced Fibrosis
2022-10-26, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11213387
PMID:36359782
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研究论文 | 本研究利用多重数字空间蛋白质分析技术，揭示了晚期肝纤维化中肝内单核吞噬细胞的独特蛋白质特征 | 首次使用空间定义的基于蛋白质的多重分析技术，展示了早期和晚期肝纤维化中门静脉单核吞噬细胞表型的关键差异 | NA | 旨在通过多重数字空间蛋白质分析技术，推导出预测晚期肝纤维化的独特蛋白质特征 | 肝内单核吞噬细胞在晚期肝纤维化中的表型 | 数字病理学 | 肝病 | 多重数字空间蛋白质分析（Nanostring GeoMX） | NA | 蛋白质数据 | 64个门静脉感兴趣区域（ROIs） |
| 72 | 2024-08-08 |
Prognosis and Immunological Characteristics of PGK1 in Lung Adenocarcinoma: A Systematic Analysis
2022-Oct-25, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14215228
PMID:36358653
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研究论文 | 本文通过系统分析探讨了磷酸甘油酸激酶1（PGK1）在肺腺癌（LUAD）中的预后和免疫学特性 | 首次确定了PGK1在肺腺癌中改变肿瘤微环境（TME）的作用，并揭示了PGK1与多种免疫细胞和免疫检查点的关联 | 需要更多的实验和临床转化研究来验证PGK1在肺腺癌中的作用 | 研究PGK1在肺腺癌中的预后和免疫学特性，探索潜在的免疫代谢联合治疗策略 | 肺腺癌中的PGK1基因及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 肺腺癌 | DNA测序、mRNA测序、甲基化修饰、单细胞RNA测序、蛋白质组学 | NA | 基因组数据、转录组数据、表观遗传数据、蛋白质数据 | 多个独立公共数据集中的大量样本 |
| 73 | 2024-08-08 |
Exploring Transcriptomic Landscapes in Red Blood Cells, in Their Extracellular Vesicles and on a Single-Cell Level
2022-Oct-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms232112897
PMID:36361688
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研究论文 | 本文通过下一代测序和单细胞RNA测序技术，研究了红细胞及其细胞外囊泡的转录组特征 | 首次在单细胞水平上揭示了红细胞中约10%的细胞含有可检测水平的mRNA，并形成了基于转录组的三个亚群 | 文章未明确提及研究的局限性 | 探索红细胞及其细胞外囊泡的转录组特征，并研究这些转录组在细胞间通讯中的作用 | 红细胞及其细胞外囊泡的转录组 | 数字病理学 | NA | 下一代测序, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 74 | 2024-08-08 |
Heterogeneity and Differentiation Trajectories of Infiltrating CD8+ T Cells in Lung Adenocarcinoma
2022-Oct-22, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14215183
PMID:36358600
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析了肺腺癌中浸润性CD8+ T细胞的异质性和分化轨迹 | 首次详细描述了肺腺癌中CD8+ T细胞的分化轨迹和功能状态，并筛选出影响患者预后的关键基因 | 研究仅基于单个数据集，结果的普遍性和可重复性有待进一步验证 | 深入理解肺腺癌中浸润性CD8+ T细胞的异质性和功能耗竭，并寻找潜在的治疗靶点 | 肺腺癌中的CD8+ T细胞及其分化轨迹 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 使用了GSE131907数据集中的样本，并在TCGA样本中进行了验证 |
| 75 | 2024-08-08 |
Severe COVID-19 is associated with fungal colonization of the nasopharynx and potent induction of IL-17 responses in the nasal epithelium
2022-Oct-26, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2022.10.25.22281528
PMID:36324802
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研究论文 | 研究严重COVID-19患者中鼻咽部真菌定植及其与IL-17反应的关系 | 首次详细分析了严重COVID-19患者中鼻咽部真菌定植与IL-17反应的关联，并探讨了免疫反应在疾病进展中的作用 | 研究样本量未具体说明，且未涵盖所有可能的真菌种类 | 探讨严重COVID-19患者中真菌定植与免疫反应的关系 | 严重COVID-19患者的鼻咽部和气管样本 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 具体样本量未在摘要中提及 |
| 76 | 2024-08-08 |
Aberrant Expression of Thymosin Beta-4 Correlates With Advanced Disease and BRAF V600E Mutation in Thyroid Cancer
2022-10, The journal of histochemistry and cytochemistry : official journal of the Histochemistry Society
DOI:10.1369/00221554221138370
PMID:36321670
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研究论文 | 本研究探讨了胸腺素β-4（TMSB4X）在良性和恶性甲状腺肿瘤中的免疫染色模式 | 发现TMSB4X在多种甲状腺癌中异常高表达，并与疾病进展特征相关，可能是BRAF V600E突变的新型下游效应因子 | NA | 研究TMSB4X在甲状腺肿瘤中的表达及其与疾病进展的关系 | 胸腺素β-4在甲状腺良恶性肿瘤中的表达 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织 | 141名分化型甲状腺癌患者 |
| 77 | 2024-08-08 |
Intra-tumor heterogeneity and prognostic risk signature for hepatocellular carcinoma based on single-cell analysis
2022-10, Experimental biology and medicine (Maywood, N.J.)
DOI:10.1177/15353702221110659
PMID:36330895
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析肝细胞癌的肿瘤内异质性，并建立了一个新的九基因预后模型 | 首次基于单细胞RNA测序数据建立了肝细胞癌的九基因预后模型，揭示了肝细胞癌微环境中不同细胞亚群的特征 | NA | 研究肝细胞癌的肿瘤内异质性并建立预后风险模型 | 肝细胞癌及其癌旁组织 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 64,634个单细胞样本，包括13个肝细胞癌样本和8个癌旁样本 |
| 78 | 2024-08-08 |
SIRPα antibody combined with oncolytic virus OH2 protects against tumours by activating innate immunity and reprogramming the tumour immune microenvironment
2022-10-31, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-022-02574-z
PMID:36310169
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研究论文 | 本文首次尝试将溶瘤单纯疱疹病毒2型（OH2）与抗SIRPα抗体联合用于抗肿瘤治疗，并探讨了这种组合对肿瘤免疫微环境的重新编程作用 | 首次将溶瘤病毒OH2与抗SIRPα抗体联合用于抗肿瘤治疗，为溶瘤病毒疗法提供了新策略 | NA | 探讨溶瘤病毒与免疫检查点阻断剂联合治疗的可行性及机制 | 溶瘤病毒OH2与抗SIRPα抗体的联合治疗对肿瘤免疫微环境的影响 | 免疫学 | 肿瘤 | RNA测序和单细胞RNA测序 | NA | 细胞和动物模型数据 | 使用了RAW264.7细胞和小鼠肿瘤模型 |
| 79 | 2024-08-08 |
CD34+ cell atlas of main organs implicates its impact on fibrosis
2022-Oct-31, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-022-04606-6
PMID:36315271
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，构建了主要器官中CD34+细胞的图谱，并探讨了其在生理和病理条件下的作用 | 首次展示了CD34+细胞在生理和病理条件下的异质性，并揭示了其在血管生成和器官纤维化中的双重作用 | NA | 探究CD34+细胞在生理和病理条件下的身份和作用 | CD34+细胞在主要器官中的分布及其在血管生成和器官纤维化中的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 使用了遗传谱系追踪的小鼠模型 |
| 80 | 2024-08-08 |
Revised International Staging System (R-ISS) stage-dependent analysis uncovers oncogenes and potential immunotherapeutic targets in multiple myeloma (MM)
2022-10-31, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.75340
PMID:36315425
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研究论文 | 本研究通过构建单细胞转录组图谱，比较了修订国际分期系统（R-ISS）不同阶段多发性骨髓瘤（MM）患者中的差异表达模式 | 发现了新的细胞毒性浆细胞（PC）群体，以及与不良预后和EB病毒感染相关的恶性PC群体，并验证了RRM2在MM细胞增殖中的作用 | NA | 探索多发性骨髓瘤（MM）中修订国际分期系统（R-ISS）阶段依赖的分析，以发现致癌基因和潜在的免疫治疗靶点 | 多发性骨髓瘤（MM）患者的单细胞转录组 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 收集了多发性骨髓瘤（MM）患者的样本 |