本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-08-05 |
SARS-CoV-2 infection of human pluripotent stem cell-derived liver organoids reveals potential mechanisms of liver pathology
2022-Oct-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105146
PMID:36128218
|
研究论文 | 本文探讨了SARS-CoV-2感染对人类诱导多能干细胞衍生肝脏类器官的影响以及潜在的肝脏病理机制 | 利用单细胞测序技术揭示了SARS-CoV-2感染肝脏细胞及未感染旁观细胞的转录组变化 | NA | 研究SARS-CoV-2感染对肝脏的影响及其潜在机制 | 人类诱导多能干细胞衍生的肝脏类器官 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | 肝脏类器官 | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 62 | 2024-08-05 |
Multi-apical polarity of alveolar stem cells and their dynamics during lung development and regeneration
2022-Oct-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105114
PMID:36185377
|
研究论文 | 本研究探讨了肺泡干细胞的多顶端极性及其在肺发育和再生中的动态变化 | 首次揭示了肺泡类型2上皮细胞(AT2s)可以具有多个顶端极性结构 | 未深入探讨多顶端极性的具体机制与影响因素 | 了解AT2s在肺发育与再生过程中的动态变化和功能 | 主要研究肺泡类型2上皮细胞(AT2s) | 数字病理学 | NA | 厚组织成像和电子显微镜 | NA | 细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 63 | 2024-08-05 |
FXYD3 facilitates Na+ and liquid absorption across human airway epithelia by increasing the transport capacity of the Na/K ATPase
2022-Oct-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00047.2022
PMID:35993520
|
研究论文 | 本研究探讨了FXYD3在增加人类气道上皮Na+和液体吸收中的作用 | 首次确定了FXYD3作为Na/K ATPase的γ亚基在气道上皮细胞中的定位和功能 | 研究仅限于单细胞RNA测序和体外实验,未在体内验证FXYD3的作用 | 探讨FXYD3在气道上皮细胞中对Na+和液体吸收的影响 | 人类气道上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和免疫组化 | NA | 细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 64 | 2024-08-05 |
Defining mast cell differentiation and heterogeneity through single-cell transcriptomics analysis
2022-10, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2022.08.011
PMID:36205448
|
research paper | 本研究通过单细胞转录组分析,探讨了肥大细胞的分化及其异质性 | 揭示了肥大细胞的多样性超出了传统使用的蛋白酶差异,并强调了微环境信号对肥大细胞发展的影响 | 未提及具体的样本数据或实验限制 | 探讨肥大细胞前体的分化特征及健康与疾病中的肥大细胞异质性 | 肥大细胞及其前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 65 | 2024-08-07 |
Author Correction: Combined protein and transcript single-cell RNA sequencing in human peripheral blood mononuclear cells
2022-Oct-20, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-022-01440-x
PMID:36266696
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 66 | 2024-08-05 |
Immunosuppressive TREM2(+) macrophages are associated with undesirable prognosis and responses to anti-PD-1 immunotherapy in non-small cell lung cancer
2022-Oct, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-022-03173-w
PMID:35278107
|
研究论文 | 这项研究探讨了TREM2阳性巨噬细胞在非小细胞肺癌中的免疫抑制作用及其与免疫治疗反应的关系 | 首次识别出TREM2阳性巨噬细胞亚型与免疫疗法反应相关,并揭示其在肿瘤进展中的作用 | 未在外周血中发现TREM2+ TAMs,可能限制了其作为通用生物标志物的适用性 | 研究TAM亚型与非小细胞肺癌免疫治疗反应之间的关系 | 涉及341个手术样本和40个接受免疫治疗的NSCLC患者的组织样本 | 数字病理学 | 非小细胞肺癌 | 单细胞测序 | NA | 组织样本 | 341个手术样本和40个免疫治疗组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 67 | 2024-08-05 |
Integrated analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing identifies a signature based on B cell marker genes to predict prognosis and immunotherapy response in lung adenocarcinoma
2022-Oct, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-022-03143-2
PMID:35152302
|
研究论文 | 研究分析了B细胞标记基因的表达谱,并基于这些基因构建了肺腺癌的预后标记。 | 提出了一种基于B细胞标记基因的新型预后标记,能够有效预测肺腺癌患者的生存率和免疫治疗反应。 | 研究可能存在样本来源的限制,尽管已在多个独立队列中进行验证。 | 探索B细胞标记基因在肺腺癌中的表达特征,并构建预后标记。 | 研究对象为1268名不同队列的肺腺癌患者。 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 1268名肺腺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 68 | 2024-08-07 |
Single-cell profiling identifies mechanisms of inflammatory heterogeneity in chronic rhinosinusitis
2022-10, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-022-01312-0
PMID:36138182
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了健康个体和三种慢性鼻窦炎亚型患者的鼻黏膜细胞,识别了与慢性鼻窦炎亚型发病机制相关的特定细胞亚群和分子 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了慢性鼻窦炎亚型的异质性免疫微环境和发病机制,并发现了潜在的治疗靶点 | 研究主要集中在小鼠模型和体外实验,需要进一步的人体临床试验验证 | 深入理解慢性鼻窦炎的异质性免疫微环境和发病机制,并探索潜在的治疗方法 | 健康个体和慢性鼻窦炎患者的鼻黏膜细胞 | 数字病理学 | 慢性鼻窦炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 细胞 | 健康个体和三种慢性鼻窦炎亚型患者的鼻黏膜细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 69 | 2024-08-07 |
Dysregulated Cell-Cell Communication Characterizes Pulmonary Fibrosis
2022-10-21, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11203319
PMID:36291184
|
研究论文 | 本研究使用NicheNet R包和公开的单细胞RNA测序数据,探讨了基因变异如何影响肺纤维化的发生,并分析了肺泡上皮细胞在不同环境中的变化 | 本研究首次验证了肺泡上皮细胞类型I的丢失与肺纤维化中单细胞RNA转录组的关系,并发现了ADAM17蛋白在肺纤维化中的潜在作用 | NA | 探讨基因变异如何影响肺纤维化的发生 | 肺泡上皮细胞在不同环境中的变化 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 控制组、基因变异组和纤维化环境中的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 70 | 2024-08-07 |
Elevated pentose phosphate pathway flux supports appendage regeneration
2022-10-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111552
PMID:36288713
|
research paper | 本文研究了Xenopus tropicalis附肢再生过程中的代谢重编程,特别是戊糖磷酸途径(PPP)的作用。 | 首次详细描述了再生组织中葡萄糖流向PPP的增加,以及PPP在促进细胞增殖和再生中的关键作用。 | NA | 探究再生过程中支持快速生长的代谢途径。 | Xenopus tropicalis的附肢再生过程。 | NA | NA | 液相色谱-质谱联用(LC-MS)、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 代谢物、RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 71 | 2024-08-07 |
Integration of Multiple, Diverse Methods to Identify Biologically Significant Marker Genes
2022-10-15, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2022.167754
PMID:35868363
|
研究论文 | 本文探讨了通过整合多种不同方法来识别生物学上重要的标记基因 | 本文提出了一种集成多种差异表达分析方法的技术,以更稳健地识别标记细胞的基因 | 目前尚未有单一的最佳方法出现,且验证这些分析结果的成本较高 | 利用单细胞RNA测序更好地理解生物学特性 | 识别可靠标记不同细胞类型的基因 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 72 | 2024-08-07 |
Erythroblastic islands foster granulopoiesis in parallel to terminal erythropoiesis
2022-10-06, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2022015724
PMID:35862735
|
研究论文 | 本文通过多光谱成像流式细胞术、体外岛重建和单细胞RNA测序等方法,研究了成年小鼠骨髓中的红细胞岛(EBI)成分细胞,发现EBI中的CD11b+细胞是与骨髓EBI巨噬细胞特异性相关的嗜中性粒细胞前体,表明红细胞(髓细胞)岛是终末粒细胞生成和红细胞生成的场所。 | 首次揭示了红细胞岛在终末粒细胞生成和红细胞生成中的双重作用,并展示了巨噬细胞在优化红细胞或嗜中性粒细胞生产中的适应性。 | NA | 研究红细胞岛在终末粒细胞生成和红细胞生成中的作用及其在不同生理病理状态下的调节机制。 | 成年小鼠骨髓中的红细胞岛成分细胞及其在粒细胞生成和红细胞生成中的作用。 | NA | NA | 多光谱成像流式细胞术、体外岛重建、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 成年小鼠骨髓中的红细胞岛成分细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 73 | 2024-08-07 |
The Peripheral Immune Landscape in a Patient with Myocarditis after the Administration of BNT162b2 mRNA Vaccine
2022-Oct-31, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.14348/molcells.2022.0031
PMID:35904026
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和单细胞T细胞受体测序分析,首次描述了接种BNT162b2 mRNA疫苗后发生心肌炎患者的周围免疫景观变化 | 首次使用单细胞RNA测序和单细胞T细胞受体测序分析来描述接种BNT162b2 mRNA疫苗后心肌炎患者的周围免疫景观变化 | 研究样本仅为单一患者,可能影响结果的普遍性 | 探究BNT162b2 mRNA疫苗接种后心肌炎的发病机制 | 接种BNT162b2 mRNA疫苗后发生心肌炎患者的周围免疫景观 | NA | 心肌炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 单一患者 | NA | NA | NA | NA |
| 74 | 2024-08-07 |
223Ra Induces Transient Functional Bone Marrow Toxicity
2022-10, Journal of nuclear medicine : official publication, Society of Nuclear Medicine
IF:9.1Q1
DOI:10.2967/jnumed.121.263310
PMID:35177425
|
研究论文 | 本研究探讨了223Ra治疗对骨髓生物学的影响,通过结合流式细胞术、单细胞RNA测序、三维多光子显微镜和骨髓移植分析 | 本研究首次全面解释了223Ra对骨髓细胞的可逆效应,并排除了长期骨髓毒性 | NA | 研究223Ra治疗对骨髓功能的影响及其安全性 | 骨髓生物学和骨髓细胞 | NA | 前列腺癌 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、三维多光子显微镜 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 75 | 2024-08-07 |
Patient-specific modeling of stroma-mediated chemoresistance of pancreatic cancer using a three-dimensional organoid-fibroblast co-culture system
2022-Oct-22, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-022-02519-7
PMID:36273171
|
研究论文 | 本文通过建立三维共培养系统,研究了癌症相关成纤维细胞(CAFs)对胰腺癌化疗抵抗的影响。 | 首次使用三维共培养系统,结合单细胞RNA测序,揭示了CAFs诱导的上皮间质转化(EMT)在胰腺癌化疗抵抗中的作用。 | NA | 探讨CAFs在胰腺癌化疗抵抗中的作用及其分子机制。 | 胰腺癌组织、患者来源的肿瘤类器官及匹配的CAFs。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | 三维共培养系统 | 图像数据 | 三个类器官/CAF对 | NA | NA | NA | NA |
| 76 | 2024-08-07 |
PD-L1-directed PlGF/VEGF blockade synergizes with chemotherapy by targeting CD141+ cancer-associated fibroblasts in pancreatic cancer
2022-10-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-33991-6
PMID:36272973
|
研究论文 | 本文揭示了化疗在胰腺导管腺癌(PDAC)中上调胎盘生长因子(PlGF),激活癌症相关成纤维细胞(CAFs)导致纤维化相关胶原蛋白沉积的机制,并开发了一种多价VEGF诱饵受体(Ate-Grab),通过PD-L1介导的PlGF/VEGF阻断,与吉西他滨协同作用,减少CD141 CAF群体,从而对抗肿瘤和抗纤维化。 | 开发了一种新的多价VEGF诱饵受体(Ate-Grab),通过PD-L1介导的PlGF/VEGF阻断,与吉西他滨协同作用,减少CD141 CAF群体,为治疗胰腺癌提供了新的组合疗法。 | NA | 阐明化疗诱导的胰腺癌纤维化机制,并探索新的组合治疗策略。 | 胰腺导管腺癌(PDAC)及其相关成纤维细胞(CAFs)。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 77 | 2024-08-07 |
Single cell RNA-seq reveals the CCL5/SDC1 receptor-ligand interaction between T cells and tumor cells in pancreatic cancer
2022-10-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2022.215834
PMID:35917973
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了胰腺癌中T细胞与肿瘤细胞之间的CCL5/SDC1受体-配体相互作用 | 首次全面描绘了胰腺导管腺癌中T细胞的全谱及其与肿瘤细胞的交流,并发现了CCL5通过与SDC1相互作用促进肿瘤细胞迁移 | NA | 旨在识别胰腺导管腺癌中T细胞的全谱及其与肿瘤细胞的交流 | 胰腺导管腺癌中的T细胞及其与肿瘤细胞的相互作用 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个数据集,包括来自本机构和公开数据库的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 78 | 2024-08-07 |
Expression of myelin transcription factor 1 and lamin B receptor mediate neural progenitor fate transition in the zebrafish spinal cord pMN domain
2022-10, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2022.102452
PMID:36063998
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,在斑马鱼脊髓pMN域中发现了pMN前体细胞的先前未知的异质性,并鉴定了两种不同的运动神经元谱系。实验验证了转录因子myt1和核内膜整合蛋白lbr在运动神经元发育和神经前体细胞维持中的关键作用。 | 本研究首次揭示了斑马鱼脊髓pMN域中pMN前体细胞的异质性,并鉴定了两种不同的运动神经元谱系,为理解神经前体细胞命运转变的分子编程提供了深入见解。 | NA | 旨在深入理解斑马鱼脊髓pMN域中神经前体细胞命运转变的分子编程。 | 斑马鱼脊髓pMN域中的神经前体细胞及其命运转变。 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 79 | 2024-08-08 |
scEMAIL: Universal and Source-free Annotation Method for scRNA-seq Data with Novel Cell-type Perception
2022-10, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2022.12.008
PMID:36608843
|
研究论文 | 提出了一种名为scEMAIL的通用注释框架,用于单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据,能够在不访问源数据的情况下自动检测新型细胞类型 | 设计了一个新型细胞类型感知模块,通过专家集成系统、双峰性测试和自适应阈值来识别新型细胞类型,并使用局部亲和正则化来减轻批次效应 | 未提及具体限制 | 开发一种无需源数据即可自动注释和检测新型细胞类型的方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据 | 未提及具体样本量 | NA | NA | NA | NA |
| 80 | 2024-08-08 |
Characteristic analysis of skin keratinocytes in patients with type 2 diabetes based on the single-cell levels
2022-Oct-20, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000002323
PMID:36583863
|
研究论文 | 本研究旨在探索2型糖尿病患者皮肤角质形成细胞在单细胞水平的转录特征,为揭示病理条件下角质形成细胞的病理机制提供实验数据 | 本研究首次在单细胞水平上分析了2型糖尿病患者皮肤角质形成细胞的转录特征,并筛选出一系列差异表达基因 | 研究样本量较小,仅包括两名2型糖尿病患者和一名非糖尿病患者,可能影响结果的普遍性和可靠性 | 探索2型糖尿病患者皮肤角质形成细胞的转录特征 | 2型糖尿病患者的皮肤角质形成细胞 | NA | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两名2型糖尿病患者和一名非糖尿病患者的皮肤组织样本 | NA | NA | NA | NA |