单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 259 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2024-09-06 |
Single-cell transcriptomic profiling reveals the tumor heterogeneity of small-cell lung cancer
2022-10-05, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-022-01150-4
PMID:36195615
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术分析了小细胞肺癌的肿瘤异质性 | 揭示了小细胞肺癌中恶性细胞的多样性状态，并发现了非神经内分泌肿瘤与免疫检查点抑制剂反应的关系 | 样本量相对较小，仅包括11名患者 | 深入理解小细胞肺癌的生物学特性，并为开发新的治疗方法提供基础 | 小细胞肺癌患者的原发肿瘤和匹配的正常邻近组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 约5000个单细胞，来自11名小细胞肺癌患者 |
| 42 | 2024-09-06 |
Scalable workflow for characterization of cell-cell communication in COVID-19 patients
2022-10, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1010495
PMID:36197936
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研究论文 | 本文开发了一种可扩展的工作流程，用于识别COVID-19患者中不同疾病结果下细胞间的差异性相互作用 | 提出了一个通用且可扩展的工作流程，用于分析COVID-19患者中细胞间相互作用的差异 | 研究仅基于公开的单细胞RNA测序数据集，可能无法完全代表所有COVID-19患者的细胞间相互作用 | 理解COVID-19患者中细胞间相互作用的模式，并探索这些模式与疾病严重程度的关系 | COVID-19患者的细胞间相互作用 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 211个个体样本 |
| 43 | 2024-09-06 |
Variant calling enhances the identification of cancer cells in single-cell RNA sequencing data
2022-10, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1010576
PMID:36191033
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研究论文 | 本文通过结合变异检测和潜在驱动变异的识别，扩展了现有方法，以提高单细胞RNA测序数据中癌细胞的识别 | 本文创新性地将变异检测引入单细胞RNA测序数据分析，以识别潜在的驱动变异，从而提高癌细胞的识别准确性 | 本文未详细讨论变异检测方法的具体局限性，以及在不同类型癌症样本中的适用性 | 本文旨在通过结合变异检测，扩展现有方法以提高单细胞RNA测序数据中癌细胞的识别 | 本文研究对象为单细胞RNA测序数据中的癌细胞和正常细胞 | 基因组学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 44 | 2024-09-06 |
The Polar Fox Lagoon in Siberia harbours a community of Bathyarchaeota possessing the potential for peptide fermentation and acetogenesis
2022-Oct, Antonie van Leeuwenhoek
DOI:10.1007/s10482-022-01767-z
PMID:35947314
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研究论文 | 研究分析了西伯利亚北极狐泻湖沉积物中十九个Bathyarchaeota的草图基因组，揭示了这些古菌在低温缺氧环境中的代谢潜力 | 首次详细分析了北极狐泻湖沉积物中Bathyarchaeota的基因组，揭示了其潜在的肽发酵和乙酸生成能力 | 缺乏对这些古菌代谢途径的完整理解，特别是氢代谢和共生关系的证据不足 | 研究Bathyarchaeota在北极狐泻湖沉积物中的代谢潜力及其对温室气体排放的影响 | 北极狐泻湖沉积物中的Bathyarchaeota | NA | NA | 宏基因组学和单细胞测序 | NA | 基因组 | 十九个草图基因组 |
| 45 | 2024-09-06 |
Fast and highly sensitive full-length single-cell RNA sequencing using FLASH-seq
2022-10, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01312-3
PMID:35637419
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研究论文 | 介绍了一种名为FLASH-seq的单细胞全长RNA测序方法，该方法比Smart-seq3具有更高的灵敏度和更短的操作时间 | FLASH-seq方法能够在约4.5小时内完成整个测序过程，易于自动化和小型化，减少资源消耗，并能使用独特分子标识符（UMIs）进行分子计数，同时减少链入侵伪影 | NA | 开发一种快速且高灵敏度的单细胞全长RNA测序方法 | 单细胞RNA测序方法的灵敏度和操作时间 | 基因测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 46 | 2024-08-05 |
CTpathway: a CrossTalk-based pathway enrichment analysis method for cancer research
2022-10-13, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-022-01119-6
PMID:36229842
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研究论文 | CTpathway是一种基于交叉通路的通路富集分析方法，适用于癌症研究 | CTpathway整合了路径交叉、分子相互作用和网络拓扑等关键路径特征，从而提供了一种新的PEA方法 | 现有的PEA方法未能充分整合必要的路径特征，导致许多风险路径未被调查 | 研究通路富集分析方法以识别癌症的风险路径 | 通过基因差异表达和交叉效应分析风险基因及其富集的风险路径 | 数字病理学 | 癌症 | RNA-seq | NA | 基因表达谱 | 超过8300个表达谱覆盖十种癌症组织和血液样本 |
| 47 | 2024-08-05 |
Anti-diabetic drug canagliflozin hinders skeletal muscle regeneration in mice
2022-Oct, Acta pharmacologica Sinica
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41401-022-00878-7
PMID:35217814
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研究论文 | 这篇文章探讨了抗糖尿病药物canagliflozin对小鼠骨骼肌再生的影响 | 首次揭示了canagliflozin在骨骼肌再生中的负面作用以及LARS2在肌肉干细胞中的关键角色 | 主要研究了小鼠模型，可能无法完全反映人类的情况 | 研究canagliflozin对小鼠缺血性下肢肌肉再生的影响 | 小鼠和C2C12肌母细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 肌肉组织和细胞数据 | 小鼠模型和细胞实验的具体样本量未提及 |
| 48 | 2024-08-05 |
High-resolution transcriptomics informs glial pathology in human temporal lobe epilepsy
2022-10-23, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-022-01453-1
PMID:36274170
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研究论文 | 本研究验证了一种从人类大脑皮层中同时分离神经元、星形胶质细胞和少突胶质前体细胞的方法，并研究了与颞叶癫痫相关的转录组特征 | 首次揭示了颞叶癫痫中特异性混合胶质亚群的存在，并表明其表达反应性星形胶质细胞和少突胶质细胞的特征 | 样本数量较小，可能影响结果的广泛适用性 | 研究癫痫中的神经元和胶质细胞之间的复杂相互作用及其转录组特征 | 从癫痫手术样本中分离的神经元和胶质细胞群体 | 数字病理学 | 癫痫 | RNA-seq，单细胞RNA-seq (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 包含四个额外的人类TLE样本和对照样本 |
| 49 | 2024-08-05 |
Delineating the transcriptional landscape and clonal diversity of virus-specific CD4+ T cells during chronic viral infection
2022-10-18, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.80079
PMID:36255051
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研究论文 | 本文研究了慢性病毒感染过程中病毒特异性CD4 T细胞的转录景观和克隆多样性 | 识别了在感染高峰期形成的Th1、Tfh和记忆样T细胞亚群中多个转录明显不同的状态，包括一个新的具有细胞杀伤特征的Slamf7亚群 | 尚未充分研究细胞内因子如TCR使用对CD4 T细胞命运承诺的影响 | 探究慢性病毒感染中CD4 T细胞的转录特征及其克隆多样性 | 病毒特异性CD4 T细胞，孤立于慢性淋巴细胞脉络膜脑膜炎病毒感染的小鼠 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞T细胞受体测序（scTCR-seq） | NA | NA | NA |
| 50 | 2024-08-05 |
Comprehensive Characterization of the Multiple Myeloma Immune Microenvironment Using Integrated scRNA-seq, CyTOF, and CITE-seq Analysis
2022-10, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-22-0022
PMID:36969740
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研究论文 | 本文对多发性骨髓瘤的免疫微环境进行了全面表征 | 结合使用了单细胞RNA测序、质谱细胞术和CITE-seq分析，揭示了不同检测方法之间的一致性和差异性 | 缺乏对更多样本的分析，且结果需要在更大规模的项目中进一步验证 | 理解多发性骨髓瘤骨髓样本中免疫细胞的特征 | 来自18名患者的多发性骨髓瘤骨髓样本中的免疫细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序, CyTOF, CITE-seq | NA | RNA | 18名患者的骨髓样本 |
| 51 | 2024-08-05 |
Zebrafish neuromesodermal progenitors undergo a critical state transition in vivo
2022-Oct-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105216
PMID:36274939
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研究论文 | 本文评估了斑马鱼神经中胚层祖细胞在脊肠和旁轴中胚层分化前的转变状态模型 | 本研究通过构建复合基因表达图谱，展示了细胞群体异质性在关键时间点的变化，为转变状态模型提供了支持 | 研究仅集中于斑马鱼，可能无法直接推广到其他物种 | 探讨神经中胚层祖细胞的基因表达变化与分化之间的关系 | 斑马鱼神经中胚层祖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了一个18ss的单细胞RNA测序数据集 |
| 52 | 2024-08-05 |
Imputation of Human Primary Osteoblast Single Cell RNA-Seq Data Identified Three Novel Osteoblastic Subtypes
2022-10-31, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2710295
PMID:36336853
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研究论文 | 该文章主要探讨了人类原代成骨细胞的单细胞RNA测序数据，识别出了三种新的成骨细胞亚型 | 文章创新点在于通过impute方法发现了三种新的成骨细胞亚型，包括成骨细胞祖细胞和两种未确定的成骨细胞 | 研究可能受到样本类型和数量的限制，导致结果的普遍性尚待验证 | 研究的目的是深入了解人类成骨细胞的异质性及其潜在生物功能 | 研究对象为新鲜分离的人类成骨细胞 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 新鲜分离的人类成骨细胞样本数据集 |
| 53 | 2024-08-05 |
SARS-CoV-2 infection of human pluripotent stem cell-derived liver organoids reveals potential mechanisms of liver pathology
2022-Oct-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105146
PMID:36128218
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研究论文 | 本文探讨了SARS-CoV-2感染对人类诱导多能干细胞衍生肝脏类器官的影响以及潜在的肝脏病理机制 | 利用单细胞测序技术揭示了SARS-CoV-2感染肝脏细胞及未感染旁观细胞的转录组变化 | NA | 研究SARS-CoV-2感染对肝脏的影响及其潜在机制 | 人类诱导多能干细胞衍生的肝脏类器官 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | 肝脏类器官 | 转录组数据 | NA |
| 54 | 2024-08-05 |
Multi-apical polarity of alveolar stem cells and their dynamics during lung development and regeneration
2022-Oct-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105114
PMID:36185377
|
研究论文 | 本研究探讨了肺泡干细胞的多顶端极性及其在肺发育和再生中的动态变化 | 首次揭示了肺泡类型2上皮细胞（AT2s）可以具有多个顶端极性结构 | 未深入探讨多顶端极性的具体机制与影响因素 | 了解AT2s在肺发育与再生过程中的动态变化和功能 | 主要研究肺泡类型2上皮细胞（AT2s） | 数字病理学 | NA | 厚组织成像和电子显微镜 | NA | 细胞转录组数据 | NA |
| 55 | 2024-08-05 |
FXYD3 facilitates Na+ and liquid absorption across human airway epithelia by increasing the transport capacity of the Na/K ATPase
2022-Oct-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00047.2022
PMID:35993520
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研究论文 | 本研究探讨了FXYD3在增加人类气道上皮Na+和液体吸收中的作用 | 首次确定了FXYD3作为Na/K ATPase的γ亚基在气道上皮细胞中的定位和功能 | 研究仅限于单细胞RNA测序和体外实验，未在体内验证FXYD3的作用 | 探讨FXYD3在气道上皮细胞中对Na+和液体吸收的影响 | 人类气道上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和免疫组化 | NA | 细胞数据 | NA |
| 56 | 2024-08-05 |
Defining mast cell differentiation and heterogeneity through single-cell transcriptomics analysis
2022-10, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2022.08.011
PMID:36205448
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research paper | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了肥大细胞的分化及其异质性 | 揭示了肥大细胞的多样性超出了传统使用的蛋白酶差异，并强调了微环境信号对肥大细胞发展的影响 | 未提及具体的样本数据或实验限制 | 探讨肥大细胞前体的分化特征及健康与疾病中的肥大细胞异质性 | 肥大细胞及其前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 细胞数据 | NA |
| 57 | 2024-08-07 |
Author Correction: Combined protein and transcript single-cell RNA sequencing in human peripheral blood mononuclear cells
2022-Oct-20, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-022-01440-x
PMID:36266696
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 58 | 2024-08-05 |
Immunosuppressive TREM2(+) macrophages are associated with undesirable prognosis and responses to anti-PD-1 immunotherapy in non-small cell lung cancer
2022-Oct, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-022-03173-w
PMID:35278107
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研究论文 | 这项研究探讨了TREM2阳性巨噬细胞在非小细胞肺癌中的免疫抑制作用及其与免疫治疗反应的关系 | 首次识别出TREM2阳性巨噬细胞亚型与免疫疗法反应相关，并揭示其在肿瘤进展中的作用 | 未在外周血中发现TREM2+ TAMs，可能限制了其作为通用生物标志物的适用性 | 研究TAM亚型与非小细胞肺癌免疫治疗反应之间的关系 | 涉及341个手术样本和40个接受免疫治疗的NSCLC患者的组织样本 | 数字病理学 | 非小细胞肺癌 | 单细胞测序 | NA | 组织样本 | 341个手术样本和40个免疫治疗组织样本 |
| 59 | 2024-08-05 |
Integrated analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing identifies a signature based on B cell marker genes to predict prognosis and immunotherapy response in lung adenocarcinoma
2022-Oct, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-022-03143-2
PMID:35152302
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研究论文 | 研究分析了B细胞标记基因的表达谱，并基于这些基因构建了肺腺癌的预后标记。 | 提出了一种基于B细胞标记基因的新型预后标记，能够有效预测肺腺癌患者的生存率和免疫治疗反应。 | 研究可能存在样本来源的限制，尽管已在多个独立队列中进行验证。 | 探索B细胞标记基因在肺腺癌中的表达特征，并构建预后标记。 | 研究对象为1268名不同队列的肺腺癌患者。 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 1268名肺腺癌患者 |
| 60 | 2024-08-07 |
Single-cell profiling identifies mechanisms of inflammatory heterogeneity in chronic rhinosinusitis
2022-10, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-022-01312-0
PMID:36138182
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了健康个体和三种慢性鼻窦炎亚型患者的鼻黏膜细胞，识别了与慢性鼻窦炎亚型发病机制相关的特定细胞亚群和分子 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了慢性鼻窦炎亚型的异质性免疫微环境和发病机制，并发现了潜在的治疗靶点 | 研究主要集中在小鼠模型和体外实验，需要进一步的人体临床试验验证 | 深入理解慢性鼻窦炎的异质性免疫微环境和发病机制，并探索潜在的治疗方法 | 健康个体和慢性鼻窦炎患者的鼻黏膜细胞 | 数字病理学 | 慢性鼻窦炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 健康个体和三种慢性鼻窦炎亚型患者的鼻黏膜细胞 |