单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
241	2024-08-08	PRMT1 is required for the generation of MHC-associated microglia and remyelination in the central nervous system 2022-10, Life science alliance IF:3.3Q1 DOI:10.26508/lsa.202201467 PMID:35705491	研究论文	本文通过使用铜唑（CPZ）饮食诱导的去髓鞘和再髓鞘化小鼠模型，发现PRMT1是中枢神经系统再髓鞘化所需的MHC相关小胶质细胞群体的驱动因子	首次鉴定PRMT1为调控再髓鞘化小胶质细胞激活的关键因子	NA	研究PRMT1在中枢神经系统再髓鞘化中的作用	PRMT1在小胶质细胞中的作用及其对再髓鞘化的影响	神经科学	多发性硬化症	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	使用CPZ饮食诱导的小鼠模型
242	2024-08-08	The clinical and bioinformatics analysis for the role of antihypertension drugs on mortality among patients with hypertension hospitalized with COVID-19 2022-10, Journal of medical virology IF:6.8Q1 DOI:10.1002/jmv.27914 PMID:35656698	研究论文	本研究探讨了不同类别降压药物对患有高血压并因COVID-19住院患者死亡率的影响	首次通过单细胞RNA测序分析，揭示了血管紧张素II受体阻滞剂和钙通道阻滞剂显著提高生存率，而血管紧张素转换酶抑制剂/β阻滞剂/利尿剂药物对COVID-19导致的死亡率无影响	研究样本仅来自武汉地区，且时间范围有限，可能影响结果的普遍性	研究不同降压药物对COVID-19患者死亡率的影响	患有高血压并因COVID-19住院的患者	生物信息学	高血压	单细胞RNA测序	NA	基因数据	278名患有高血压并确诊COVID-19的患者
243	2024-08-08	Recombinant multimeric dog allergen prevents airway hyperresponsiveness in a model of asthma marked by vigorous TH 2 and TH 17 cell responses 2022-10, Allergy IF:12.6Q1 DOI:10.1111/all.15399 PMID:35657107	研究论文	研究通过建立狗过敏的小鼠模型，评估重组多聚体蛋白Can f 1-2-4-6在预防狗过敏原引起的炎症反应中的效果	首次使用重组多聚体蛋白Can f 1-2-4-6在狗过敏模型中诱导耐受，减少气道高反应性和2型炎症	研究仅在动物模型中进行，尚未在人类中验证	探讨狗过敏原引起的炎症反应及重组多聚体蛋白Can f 1-2-4-6的预防效果	狗过敏的小鼠模型及重组多聚体蛋白Can f 1-2-4-6	NA	哮喘	scRNA-Seq	NA	基因表达数据	小鼠模型
244	2024-08-08	Autoreactive CD8 T cells in NOD mice exhibit phenotypic heterogeneity but restricted TCR gene usage 2022-10, Life science alliance IF:3.3Q1 DOI:10.26508/lsa.202201503 PMID:35667687	研究论文	本研究使用单细胞RNA和T细胞受体测序（scRNA-seq和scTCR-seq）分析了非肥胖糖尿病小鼠胰岛和脾脏中的自身反应性CD8 T细胞，发现这些细胞在表型上具有异质性，但在TCR基因使用上受限	首次详细描述了自身反应性CD8 T细胞在非肥胖糖尿病小鼠中的克隆异质性和TCR基因使用的限制性	研究仅限于非肥胖糖尿病小鼠模型，可能需要进一步研究以验证这些发现是否适用于人类或其他动物模型	探讨非肥胖糖尿病小鼠中自身反应性CD8 T细胞的表型和克隆异质性	非肥胖糖尿病小鼠的胰岛和脾脏中的自身反应性CD8 T细胞	免疫学	1型糖尿病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞T细胞受体测序（scTCR-seq）	NA	RNA和T细胞受体序列	多个非肥胖糖尿病小鼠的胰岛和脾脏样本
245	2024-08-08	Dissecting B/Plasma Cells in Periodontitis at Single-Cell/Bulk Resolution 2022-10, Journal of dental research IF:5.7Q1 DOI:10.1177/00220345221099442 PMID:35620808	研究论文	本研究通过单细胞和整体组织水平分析，揭示了牙周炎中B/浆细胞的浸润过程及其在分子诊断中的潜在应用	首次在单细胞水平上对牙周炎中的15种免疫细胞类型进行分类，并进行了细胞间通信分析，揭示了B/浆细胞在牙周炎中的两种不同细胞命运	研究主要集中在免疫细胞和分子水平，对牙周炎的宏观和组织学层面的理解仍有待深入	探讨牙周炎中B/浆细胞的浸润过程及其在分子诊断中的应用	牙周炎中的B/浆细胞及其与其他免疫细胞的相互作用	数字病理学	牙周病	单细胞转录组分析	机器学习	转录组数据	68名健康个体与235名牙周炎患者的大规模公共队列，以及12名健康个体与7名牙周炎患者的独立验证队列
246	2024-08-08	Scalable single-cell RNA sequencing from full transcripts with Smart-seq3xpress 2022-10, Nature biotechnology IF:33.1Q1 DOI:10.1038/s41587-022-01311-4 PMID:35637418	研究论文	本文介绍了Smart-seq3xpress方法，该方法通过简化Smart-seq3协议，减少了试剂使用并提高了细胞通量，实现了高细胞通量的单细胞RNA测序，同时保持了全转录本覆盖。	Smart-seq3xpress方法在保持高细胞通量的同时，提供了全转录本覆盖，揭示了细胞类型相关的异构体变异。	NA	开发一种新的单细胞RNA测序方法，以提高细胞通量并保持全转录本覆盖。	外周血单个核细胞	基因组学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	外周血单个核细胞
247	2024-08-08	Single-cell analysis implicates TH17-to-TH2 cell plasticity in the pathogenesis of palmoplantar pustulosis 2022-10, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jaci.2022.04.027 PMID:35568077	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析了掌跖脓疱病（PPP）患者的皮肤活检样本和外周血单个核细胞，揭示了TH17向TH2细胞可塑性在PPP发病机制中的作用。	首次通过单细胞RNA测序技术揭示了PPP患者中TH17向TH2细胞的可塑性，并验证了这一发现。	研究仅限于皮肤活检样本和外周血单个核细胞的分析，未涉及其他组织或细胞类型。	探究掌跖脓疱病（PPP）的免疫途径和发病机制。	掌跖脓疱病（PPP）患者的皮肤活检样本和外周血单个核细胞。	数字病理学	皮肤疾病	单细胞RNA测序（RNA-Seq）、流式细胞术、免疫荧光显微镜	NA	RNA	涉及健康个体和PPP患者的皮肤活检样本及外周血单个核细胞。
248	2024-08-08	Identification of islet cell characteristics in humans with type 2 diabetes by single-cell sequencing 2022-Oct, Journal of diabetes investigation IF:3.1Q2 DOI:10.1111/jdi.13833 PMID:35578579	研究论文	本文通过单细胞测序技术研究了2型糖尿病患者胰岛细胞的特征	首次通过单细胞测序技术识别了2型糖尿病状态下人类β细胞中调节蛋白活性的改变	实验在人体胰腺β细胞中的应用存在困难，限制了治疗选项的开发	探索逆转或保护β细胞免于失败的策略	2型糖尿病患者的胰岛细胞	数字病理学	糖尿病	单细胞测序	NA	细胞	具体样本数量未在摘要中提及
249	2024-08-08	DIALOGUE maps multicellular programs in tissue from single-cell or spatial transcriptomics data 2022-10, Nature biotechnology IF:33.1Q1 DOI:10.1038/s41587-022-01288-0 PMID:35513526	research paper	本文介绍了一种名为DIALOGUE的方法，用于从单细胞或空间转录组数据中系统地揭示组织中的多细胞程序（MCPs）	DIALOGUE方法能够从空间数据或单细胞数据中识别与动物行为相关的MCPs，并在未见数据上恢复空间属性，优于其他方法和指标	NA	旨在解码组织中细胞的功能相互作用	多细胞程序（MCPs）及其在健康和疾病中的多细胞调控分析	digital pathology	lung cancer, Alzheimer's disease, ulcerative colitis	single-cell RNA sequencing, spatial transcriptomics	NA	spatial data, single-cell data	包括小鼠的多个脑区（下丘脑、小脑、视觉皮层和大脑皮层）以及人类肺癌数据
250	2024-08-08	A variety of 'exhausted' T cells in the tumor microenvironment 2022-10-05, International immunology IF:4.8Q2 DOI:10.1093/intimm/dxac013 PMID:35460561	综述	本文综述了肿瘤微环境中各种'耗竭'T细胞亚群的最新见解	探讨了CD4+ T细胞和Treg细胞在肿瘤微环境中的耗竭现象，以及单细胞RNA测序揭示的具有细胞毒活性的CD4+ T细胞的耗竭情况	NA	揭示新的治疗靶点和策略，以诱导强大的抗肿瘤免疫反应	肿瘤微环境中的耗竭T细胞亚群	免疫学	癌症	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
251	2024-08-08	Fibroblast-Secreted Phosphoprotein 1 Mediates Extracellular Matrix Deposition and Inhibits Smooth Muscle Cell Contractility in Marfan Syndrome Aortic Aneurysm 2022-Oct, Journal of cardiovascular translational research IF:2.4Q3 DOI:10.1007/s12265-022-10239-8 PMID:35414038	研究论文	本文研究了纤维母细胞分泌的磷蛋白1（Spp1）在马方综合征（MFS）胸主动脉瘤（TAA）中对细胞外基质（ECM）沉积和抑制平滑肌细胞收缩性的作用。	通过转录组测序和单细胞测序数据分析，发现了Spp1在MFS TAA中的增加，并探讨了其通过Itga8/Itgb1调节纤维母细胞和平滑肌细胞间通信的机制。	NA	探讨马方综合征胸主动脉瘤中细胞外基质稳态破坏的机制。	纤维母细胞分泌的磷蛋白1（Spp1）及其在马方综合征胸主动脉瘤中的作用。	NA	马方综合征	转录组测序，单细胞测序	NA	基因表达数据	使用Fbn1小鼠模型和MFS患者的样本
252	2024-08-08	Landscape of T Cells in NK-AML(M4/M5) Revealed by Single-Cell Sequencing 2022-10, Journal of leukocyte biology IF:3.6Q2 DOI:10.1002/JLB.5A0721-396RR PMID:35258858	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和T细胞受体（TCR）测序，揭示了正常核型急性髓系白血病（NK-AML）M4/M5亚型患者骨髓中T细胞的景观	首次通过单细胞测序技术详细描述了NK-AML患者中T细胞的基因表达特征和发育轨迹，特别是黏膜相关不变T细胞（MAITs）的优先富集和克隆扩增	研究样本仅包括5名NK-AML患者和1名正常供体，样本量较小可能影响结果的普遍性	深入理解NK-AML患者的肿瘤浸润T细胞，为免疫治疗和改善患者预后提供依据	NK-AML（M4/M5）患者的骨髓细胞及其T细胞	数字病理学	血液肿瘤	单细胞RNA测序，单细胞T细胞受体（TCR）测序	NA	基因表达数据，TCR数据	5名NK-AML（M4/M5）患者和1名正常供体
253	2024-08-08	Effects of Immune Cells on Intestinal Stem Cells: Prospects for Therapeutic Targets 2022-10, Stem cell reviews and reports IF:4.5Q2 DOI:10.1007/s12015-022-10347-7 PMID:35279803	综述	本文综述了免疫细胞对肠道干细胞（ISCs）的影响及其在免疫介导疾病治疗中的潜在应用	探讨了免疫细胞通过调节ISCs的凋亡或存活来影响肠道上皮完整性的机制，并提出了基于ISCs开发新型有效治疗策略的可能性	NA	探讨免疫细胞对肠道干细胞的影响及其在治疗免疫介导疾病中的潜在应用	肠道干细胞（ISCs）和免疫细胞	NA	炎症性肠病和移植物抗宿主病	肠道类器官培养系统和单细胞RNA测序	NA	NA	NA
254	2024-08-08	Single-cell profiling of human CD127+ innate lymphoid cells reveals diverse immune phenotypes in hepatocellular carcinoma 2022-10, Hepatology (Baltimore, Md.) DOI:10.1002/hep.32444 PMID:35243668	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析了人肝细胞癌（HCC）患者中的CD127+先天淋巴细胞（ILCs），揭示了ILCs在HCC中的免疫表型多样性及其与疾病预后的关联	首次报道了B细胞在ILC2细胞炎症分化中的新功能，以及B细胞衍生的ICOSL信号通过增加IL-13产生加剧炎症的作用	NA	探讨先天淋巴细胞在肝细胞癌中的免疫表型特征及其与疾病预后的关系	人肝细胞癌患者的CD127+先天淋巴细胞	数字病理学	肝细胞癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	3433个ILCs
255	2024-08-08	CXCL13 is expressed in a subpopulation of neuroendocrine cells in the murine trachea and lung 2022-Oct, Cell and tissue research IF:3.2Q3 DOI:10.1007/s00441-021-03552-2 PMID:34762185	研究论文	本文研究了小鼠气管和肺中神经内分泌细胞亚群中CXCL13的表达情况	首次鉴定了在小鼠气管上皮中的孤立神经内分泌细胞中CXCL13的高表达，并指出了这些细胞在支气管相关淋巴组织形成和B细胞稳态中的潜在免疫调节作用	NA	评估CXCL13在神经内分泌细胞中的表达，并探讨其在免疫调节中的作用	小鼠气管和肺中的神经内分泌细胞	数字病理学	小细胞肺癌	RT-PCR, 免疫组化, 免疫电子显微镜, 单细胞RNA测序	NA	mRNA序列数据	小鼠气管上皮细胞中的神经内分泌细胞（约70% CXCL13）和肺内支气管上皮细胞中的神经内分泌细胞（<10% CXCL13）
256	2024-08-08	Identification of Monocytes Associated with Severe COVID-19 in the PBMCs of Severely Infected Patients Through Single-Cell Transcriptome Sequencing 2022-Oct, Engineering (Beijing, China) DOI:10.1016/j.eng.2021.05.009 PMID:34150352	研究论文	本研究通过单细胞转录组测序分析了严重COVID-19患者外周血样本中的单核细胞特征	发现了两种与严重COVID-19相关的新型单核细胞亚群：Mono 0和Mono 5，这些亚群表现出促纤维化和促炎症特征	样本量相对较小，需要进一步的大规模研究验证	探究严重COVID-19中单核细胞的免疫学特征及其与疾病机制的关系	严重COVID-19患者的单核细胞	数字病理学	COVID-19	单细胞转录组测序	NA	转录组数据	6名健康对照和14名COVID-19患者样本
257	2024-08-09	Evolutionary Multiobjective Clustering Algorithms With Ensemble for Patient Stratification 2022-Oct, IEEE transactions on cybernetics IF:9.4Q1 DOI:10.1109/TCYB.2021.3069434 PMID:33961576	研究论文	本文提出了两种新的基于集合的进化多目标聚类算法（NSGA-II-ECFE和MOEA/D-ECFE），用于解决患者分层问题，通过四个聚类有效性指标作为目标函数	开发了一种有效的集合构建方法以增强集合多样性，并提出了集合聚类适应度评估（ECFE）方法来评估集合，通过测量这四个目标函数下的共识聚类	NA	解决患者分层中的亚型诊断问题，构建具有高诊断能力和良好泛化能力的分层模型	患者分层问题	机器学习	NA	进化多目标聚类算法	NSGA-II-ECFE, MOEA/D-ECFE	数据集	55个合成数据集和35个真实患者分层数据集，以及五个癌症相关的单细胞RNA-seq数据集
258	2024-08-09	Neuraminidase inhibitors rewire neutrophil function in vivo in murine sepsis and ex vivo in COVID-19 2022-Oct-14, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2020.11.12.379115 PMID:33200130	研究论文	研究报告了抗病毒神经氨酸酶抑制剂在体内外调节中性粒细胞功能的作用，特别是在小鼠脓毒症和COVID-19患者中的应用	首次揭示了神经氨酸酶抑制剂通过限制宿主神经氨酸酶活性、表面唾液酸释放、ROS产生和中性粒细胞释放的NETs，来控制感染和提高宿主生存率	NA	探讨神经氨酸酶抑制剂在严重感染中调节中性粒细胞功能的作用	小鼠脓毒症模型和COVID-19患者的血液细胞	NA	脓毒症, COVID-19	单细胞RNA测序	NA	RNA	公开数据集中的呼吸道样本