单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 258 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing: Unravelling the Bone One Cell at a Time
2022-10, Current osteoporosis reports
IF:4.2Q1
DOI:10.1007/s11914-022-00735-w
PMID:35915289
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综述 | 本文综述了使用单细胞RNA测序和新兴的空间RNA测序技术在骨骼研究中的最新发现 | 单细胞RNA测序揭示了骨骼细胞谱系中新的和转录上不同的细胞集群，空间转录组学方法提供了不同细胞群的定位信息 | NA | 总结近期使用单细胞RNA测序和空间RNA测序技术在骨骼研究中的发现，描述不同骨骼驻留细胞类型及其分子程序 | 骨骼中的不同细胞类型及其分子程序 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 222 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis of fractional CO2 laser efficiency in treating a mouse model of alopecia
2022-10, Lasers in surgery and medicine
IF:2.2Q2
DOI:10.1002/lsm.23590
PMID:35916125
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了分次二氧化碳激光治疗小鼠模型脱发的分子和细胞机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术，详细分析了激光照射后皮肤中细胞群及其基因表达的变化 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证其效果 | 探究分次二氧化碳激光治疗脱发的有效条件及其分子和细胞机制 | 小鼠模型的脱发治疗 | 数字病理学 | 皮肤病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型的皮肤样本 |
| 223 | 2024-08-08 |
A Bayesian modified Ising model for identifying spatially variable genes from spatial transcriptomics data
2022-10-15, Statistics in medicine
IF:1.8Q1
DOI:10.1002/sim.9530
PMID:35871762
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研究论文 | 本文介绍了一种基于贝叶斯修正伊辛模型的方法，用于从空间转录组学数据中识别表现出空间相关表达模式的基因 | 本文提出的方法通过使用伊辛模型的能量相互作用参数来表征空间表达模式，并采用辅助变量马尔可夫链蒙特卡罗算法从模型中难以处理的归一化常数的后验分布中采样，从而能够捕捉更多类型的空间模式 | NA | 旨在克服现有基于高斯过程的地统计模型在识别复杂空间模式方面的局限性 | 空间转录组学数据中的空间变异基因 | 生物信息学 | NA | 空间分子剖面技术 | 伊辛模型 | 转录组数据 | 两个真实空间转录组学数据集 |
| 224 | 2024-08-08 |
Gastric Microbiome Alterations Are Associated with Decreased CD8+ Tissue-Resident Memory T Cells in the Tumor Microenvironment of Gastric Cancer
2022-10-04, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0107
PMID:35881964
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研究论文 | 本研究探讨了胃癌患者胃微生物群的变化及其与免疫失调的可能关联 | 发现胃癌微生物群中Oceanobacter、Methylobacterium和Syntrophomonas属的富集与CD8+组织驻留记忆T细胞频率的反向相关性，以及Methylobacterium在胃癌发生中的潜在作用 | NA | 研究胃癌患者胃微生物群的变化及其与免疫失调的关联 | 胃癌患者的胃微生物群及肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胃癌 | 16S rRNA基因测序、单细胞测序、免疫组织化学、多重免疫荧光染色、流式细胞术 | NA | 微生物群数据、组织样本 | 53名胃癌患者和30名慢性胃炎患者的肿瘤微生物群及胃黏膜组织微生物群 |
| 225 | 2024-08-08 |
Single-cell immunoprofiling after immunotherapy for allergic rhinitis reveals functional suppression of pathogenic TH2 cells and clonal conversion
2022-10, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2022.06.024
PMID:35863510
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研究论文 | 本文通过单细胞免疫分析技术，研究了日本杉花粉症患者在接受舌下免疫疗法（SLIT）前后特定T细胞的变化及其作用机制 | 首次结合单细胞RNA测序和序列分析技术，揭示了SLIT通过促进病原性TH2细胞上MSC的表达并抑制其功能，从而影响过敏性鼻炎的治疗效果 | NA | 全面研究特定抗原T细胞在接受舌下免疫疗法前后在过敏性鼻炎治疗中的作用和变化 | 日本杉花粉症患者的特定T细胞 | 免疫学 | 过敏性鼻炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 包括参与SLIT片剂II/III期试验的患者和门诊患者 |
| 226 | 2024-08-08 |
Dimensionality Reduction of Single-Cell RNA Sequencing Data by Combining Entropy and Denoising AutoEncoder
2022-10, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2022.0118
PMID:35834604
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研究论文 | 本文通过结合熵和去噪自编码器的方法，对单细胞RNA测序数据进行降维 | 提出了一种新的降维方法，结合了熵和去噪自编码器的优势 | NA | 研究如何有效地对单细胞RNA测序数据进行降维 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | RNA测序 | 去噪自编码器 | RNA测序数据 | NA |
| 227 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing in oral science: Current awareness and perspectives
2022-Oct, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13287
PMID:35842899
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在口腔科学中的发展与应用 | 首次全面回顾单细胞RNA测序在口腔科学领域的应用 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在口腔疾病、组织发育和再生研究中的应用前景 | 口腔科学中的组织发育、牙齿和颌疾病、颌面部肿瘤、感染等领域 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 数千个细胞 |
| 228 | 2024-08-08 |
Determinants of Dental Pulp Stem Cell Heterogeneity
2022-Oct, Journal of endodontics
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.joen.2022.06.013
PMID:35809811
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综述 | 本文综述了影响牙髓干细胞再生特性的异质性决定因素 | 单细胞RNA测序有望阐明牙髓干细胞的异质性，并有助于建立标准化技术 | 临床应用中缺乏一致和可靠的结果可能是由于牙髓干细胞群体的异质性 | 提供关于牙髓干细胞异质性决定因素的叙述性综述 | 牙髓干细胞的异质性 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 229 | 2024-08-08 |
A probabilistic gene expression barcode for annotation of cell types from single-cell RNA-seq data
2022-10-14, Biostatistics (Oxford, England)
DOI:10.1093/biostatistics/kxac021
PMID:35770795
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研究论文 | 本文介绍了一种利用单细胞RNA测序数据进行细胞类型注释的概率基因表达条形码方法 | 提出了一种统计方法，该方法利用公共数据集结合数千个基因信息，使用潜在变量模型定义细胞类型特异性条形码并考虑批次效应，从而概率性地注释细胞类型身份 | 当前方法依赖已知标记基因或因研究间系统差异（批次效应）导致的过拟合问题 | 开发一种数据驱动的细胞类型注释方法，以克服大规模细胞注释的实验技术限制 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 潜在变量模型 | 基因表达数据 | 涉及数千个基因和多个数据集 |
| 230 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing analysis of T helper cell differentiation and heterogeneity
2022-10, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
DOI:10.1016/j.bbamcr.2022.119321
PMID:35779629
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学方法分析了人类外周血中分离的T辅助细胞在体外细胞因子介导分化下的表型多样性 | 本文采用了结合Seurat、Nebulosa、GGplot等多种生物信息学工具的综合分析方法，揭示了T辅助细胞表型的高表达相似性和特定标记基因的表达 | 单细胞分析的通用流程通常不足以适用于所有细胞类型 | 分析T辅助细胞的多样性和分化 | 人类外周血中的T辅助细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 人类外周血中的T细胞 |
| 231 | 2024-08-08 |
Complement C1QC as a potential prognostic marker and therapeutic target in colon carcinoma based on single-cell RNA sequencing and immunohistochemical analysis
2022-Oct-23, Bosnian journal of basic medical sciences
IF:3.1Q2
DOI:10.17305/bjbms.2022.7309
PMID:35765947
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和免疫组化分析，探讨了C1QC作为结肠癌的潜在预后标志物和治疗靶点 | 首次揭示了C1QC在结肠癌中的关键调控作用，并验证了其作为潜在免疫治疗靶点的可能性 | 研究主要基于数据库数据和分子对接分析，需要进一步的临床试验验证 | 探索结肠癌中免疫细胞浸润及其基因调控，为诊断和治疗提供新视角 | 结肠癌中的免疫细胞浸润及其基因调控 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 使用了来自GEO数据库的单细胞RNA测序表达谱和TCGA结肠癌数据集 |
| 232 | 2024-08-08 |
Distinct Transcriptional Programs in Ascitic and Solid Cancer Cells Induce Different Responses to Chemotherapy in High-Grade Serous Ovarian Cancer
2022-10-04, Molecular cancer research : MCR
IF:4.1Q2
DOI:10.1158/1541-7786.MCR-21-0565
PMID:35749080
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，分析了高级别浆液性卵巢癌（HGSOC）患者在不同疾病阶段的细胞，揭示了腹水和实体癌细胞在转录组水平上的显著差异及其对化疗的不同反应 | 发现了新的癌症相关成纤维细胞亚型，该亚型在化疗后显著富集，并提出了基于肿瘤异质性的新型治疗策略 | NA | 探究高级别浆液性卵巢癌治疗抵抗的机制，并寻找新的治疗策略 | 高级别浆液性卵巢癌患者的腹水和实体癌细胞及其对化疗的反应 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过十万细胞 |
| 233 | 2024-08-08 |
Immune mechanisms linking metabolic injury to inflammation and fibrosis in fatty liver disease - novel insights into cellular communication circuits
2022-10, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2022.06.012
PMID:35750137
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综述 | 本文综述了非酒精性脂肪肝病（NAFLD）中免疫机制与代谢损伤、炎症和纤维化的关联，并探讨了细胞通信电路的新见解。 | 近年来，单细胞RNA测序和高维多组学（蛋白质组学、脂质组学）以及空间转录组学的应用，极大地推进了对健康和疾病中肝脏免疫细胞亚群复杂异质性的理解。 | NA | 旨在强调NAFLD中与炎症相关的最新发现，讨论免疫细胞亚群在疾病不同阶段（包括疾病消退期）的作用，并整合驱动炎症的多系统。 | NAFLD中的免疫机制和细胞通信电路。 | NA | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序、高维多组学（蛋白质组学、脂质组学）、空间转录组学 | NA | RNA | NA |
| 234 | 2024-08-08 |
A Survey of the Metabolic Landscape of the Developing Cerebellum at Single-Cell Resolution
2022-Oct, Cerebellum (London, England)
DOI:10.1007/s12311-022-01415-2
PMID:35767214
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综述 | 本文探讨并比较了从发育中的人类小脑及其体外合成对应物（干细胞衍生的cerebellar organoids）获得的单细胞RNA测序数据，重点关注关键代谢途径基因的表达 | 利用单细胞RNA测序技术，可视化组织中亚群的关键转录特征，并比较了体外模型与原生组织的代谢状态 | 体外模型与原生组织之间存在差异，这些差异可能影响对分化后代谢状态的理解 | 理解体外小脑模型的状态，这对于模拟各种细胞类型对小脑疾病的易感性至关重要 | 发育中的人类小脑及其体外合成对应物（干细胞衍生的cerebellar organoids） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 235 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq dissecting heterogeneity of tumor cells and comprehensive dynamics in tumor microenvironment during lymph nodes metastasis in gastric cancer
2022-10-15, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.34172
PMID:35716132
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了胃癌原发肿瘤和转移淋巴结中的肿瘤细胞异质性及肿瘤微环境动态变化 | 首次全面揭示了胃癌原发肿瘤和转移淋巴结中肿瘤细胞和肿瘤微环境的异质性，并识别出具有淋巴结转移潜力的胃癌细胞亚型 | NA | 揭示胃癌淋巴结转移过程中肿瘤细胞的动态变化及潜在机制 | 胃癌原发肿瘤和转移淋巴结的肿瘤细胞及肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 胃癌原发肿瘤和转移淋巴结的组织样本 |
| 236 | 2024-08-08 |
A map of the spatial distribution and tumour-associated macrophage states in glioblastoma and grade 4 IDH-mutant astrocytoma
2022-10, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.5984
PMID:35723032
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研究论文 | 本研究旨在解析高级别胶质瘤中肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的转录状态、空间分布及临床病理意义 | 首次揭示了IDH突变型4级星形细胞瘤中TAMs的多样性及其功能状态，并探讨了其在肿瘤微环境中的空间分布和临床相关性 | 研究样本量较小，仅包括四例人类胶质母细胞瘤和三例IDH突变型4级星形细胞瘤 | 探讨高级别胶质瘤中TAMs的多样性及其在肿瘤微环境中的作用和临床意义 | 高级别胶质瘤中的肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）及其在IDH突变型4级星形细胞瘤中的多样性 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 24,227个髓系细胞 |
| 237 | 2024-08-08 |
Development of a novel signature derived from single cell RNA-sequencing for preoperative prediction of lymph node metastasis in head and neck squamous cell carcinoma
2022-10, Head & neck
DOI:10.1002/hed.27126
PMID:35726502
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据开发并验证了一种用于头颈部鳞状细胞癌患者术前预测淋巴结转移的LNM特征 | 首次利用单细胞RNA测序数据开发了一种新的LNM特征，用于术前预测头颈部鳞状细胞癌患者的淋巴结转移 | NA | 开发并验证一种用于术前预测头颈部鳞状细胞癌患者淋巴结转移的LNM特征 | 头颈部鳞状细胞癌患者的淋巴结转移 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO | RNA测序数据 | NA |
| 238 | 2024-08-08 |
Regional and age-related diversity of human mature oligodendrocytes
2022-10, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24230
PMID:35735919
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了人成熟少突胶质细胞（MOLs）在不同脑区和年龄段的异质性 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了人成熟少突胶质细胞在不同脑区和年龄段的转录异质性 | 研究仅限于特定脑区和脊髓样本，可能无法全面代表所有脑区的少突胶质细胞异质性 | 探讨人成熟少突胶质细胞在不同脑区和年龄段的异质性 | 人成熟少突胶质细胞（MOLs） | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自皮质/皮质下、室下带脑组织样本和胸腰椎脊髓样本的细胞 |
| 239 | 2024-08-08 |
Estimating intraclonal heterogeneity and subpopulation changes from bulk expression profiles in CMap
2022-10, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202101299
PMID:35688486
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研究论文 | 本文提出了一种计算框架Premnas，用于从CMap中的L1000批量表达谱估计未确定亚群的丰度，以理解药物和疾病相关的治疗途径和生物过程 | Premnas框架通过从单细胞RNA-seq数据中学习的亚群表示，直接从L1000谱估计亚群丰度，恢复了扰动后亚群变化的信息 | 由于L1000测定法的批量级表达谱性质，内克隆异质性和亚群组成变化在很大程度上被忽视 | 提高CMap中扰动连接的可解释性和可重复性 | CMap库中的批量表达谱数据 | 生物信息学 | NA | L1000测定法，单细胞RNA-seq | 原型分析 | 表达谱 | NA |
| 240 | 2024-08-08 |
c-Rel-dependent monocytes are potent immune suppressor cells in cancer
2022-10, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1002/JLB.1MA0422-518RR
PMID:35694784
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学和基因敲除方法，描述了一类由转录因子c-Rel编程的鼠和人类髓源抑制细胞，命名为rel依赖性单核细胞（rMos），这些细胞在肿瘤生长中通过强烈抑制T细胞功能和表现出强烈的迁移表型来促进肿瘤生长。 | 本文首次描述了由c-Rel调控的rel依赖性单核细胞，这些细胞表达高水平的促炎细胞因子IL-1β和低水平的抑制分子精氨酸酶1，通过c-Rel增强体控制单核细胞特征基因的表达。 | NA | 研究c-Rel依赖性单核细胞在肿瘤免疫抑制中的作用及其机制。 | 鼠和人类的髓源抑制细胞，特别是c-Rel依赖性单核细胞。 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞转录组学，基因敲除 | NA | 基因表达数据 | 鼠和人类样本 |