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当前共找到 259 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2024-08-08 |
Sex-dependent differential transcript expression in the placenta of growth restricted infants
2022-10, Placenta
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.placenta.2022.08.004
PMID:36031700
|
研究论文 | 研究探讨了在宫内生长受限婴儿的胎盘中，性别特异性基因表达的变化 | 首次识别了与宫内生长受限婴儿相关的403个候选转录本，其中103个显示性别特异性表达 | 研究仅基于12个胎盘样本，样本量较小 | 旨在评估宫内生长受限婴儿胎盘中性别特异性基因表达的变化 | 人类胎盘组织样本 | 基因表达 | 宫内生长受限 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 12个胎盘样本 | NA | NA | NA | NA |
| 202 | 2024-08-08 |
Tracking Regulatory T Cell Development in the Thymus Using Single-Cell RNA Sequencing/TCR Sequencing
2022-10-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2200089
PMID:36038290
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序（scRNA-Seq）和TCR测序技术，追踪小鼠胸腺中调节性T细胞（T）的发育过程 | 本研究首次详细描述了调节性T细胞在胸腺中的发育路径，并通过scRNA-Seq和TCR-Seq技术揭示了多个发育阶段和TCR库的多样性 | NA | 研究调节性T细胞在胸腺中的发育过程及其分子机制 | 小鼠胸腺中的CD4CD8双阳性胸腺细胞、CD4单阳性胸腺细胞、CD25FOXP3CD73 T前体细胞等 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、TCR测序 | NA | RNA序列 | 多种胸腺细胞亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 203 | 2024-08-08 |
Single-cell mutation calling and phylogenetic tree reconstruction with loss and recurrence
2022-10-14, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac577
PMID:36000873
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研究论文 | 本文介绍了一种方法，通过建模噪声过程并允许突变在肿瘤进化过程中丢失或重新出现，联合调用每个细胞中的突变，重建细胞间的系统发育关系，并确定突变丢失和重新出现的位置 | 提出了一个贝叶斯方法，能够准确调用突变并量化预测的确定性，同时展示了允许突变丢失或重新出现的优势 | NA | 理解每个患者的肿瘤组成和进化历史，为个性化治疗提供关键信息 | 肿瘤细胞的异质性和进化过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | 贝叶斯模型 | 单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 204 | 2024-08-08 |
propeller: testing for differences in cell type proportions in single cell data
2022-10-14, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac582
PMID:36005887
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研究论文 | 本文介绍了propeller方法，用于检测单细胞数据中细胞类型比例在不同实验条件下的差异 | propeller方法利用生物复制来发现细胞类型比例在组间的统计显著差异，并展示了其在多种场景下的良好表现 | NA | 开发一种统计方法来准确识别单细胞RNA测序数据中细胞类型组成的统计显著变化 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型比例 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 数据 | 数千到数百万的单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 205 | 2024-08-08 |
Phosphatase control of cytokine-mediated overproduction of galactose-deficient IgA1, the main autoantigen in IgA nephropathy
2022-10, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2022.102883
PMID:35987175
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研究论文 | 本文研究了磷酸酶在细胞因子介导的过量产生缺乏半乳糖的IgA1（IgA肾病的主要自身抗原）中的调控作用 | 发现了IgA1分泌细胞中C1GALT1表达减少的亚群，这些细胞在细胞因子刺激下表现出异常的细胞因子信号传导调控，可能导致IgA肾病中自身抗原的过量产生 | NA | 探讨IgA肾病中自身抗原过量产生的机制 | IgA肾病患者的外周血单个核细胞（PBMCs）和健康对照者的PBMCs | NA | 肾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 来自IgA肾病患者和健康对照者的PBMCs | NA | NA | NA | NA |
| 206 | 2024-08-08 |
Intestinal single-cell atlas reveals novel lymphocytes in pigs with similarities to human cells
2022-10, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202201442
PMID:35995567
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，在猪的回肠中鉴定了26种细胞类型，并与人和小鼠的回肠细胞进行了比较 | 发现了猪特有的淋巴细胞亚群，并定义了猪的外周和回肠先天淋巴细胞的基因特征，揭示了与人类先天淋巴细胞的相似性 | NA | 深入理解猪的肠道淋巴细胞，以提高其在生物医学模型中的实用性 | 猪的肠道淋巴细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 猪的回肠中的26种细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 207 | 2024-08-08 |
A novel approach to single-cell analysis reveals intrinsic differences in immune marker expression in unstimulated BALB/c and C57BL/6 macrophages
2022-10, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.14478
PMID:36001069
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研究论文 | 本文通过一种新的单细胞RNA测序分析方法，揭示了未刺激的BALB/c和C57BL/6小鼠巨噬细胞在免疫标记表达上的内在差异。 | 本文采用了一种新的单细胞RNA测序分析方法，能够揭示未刺激巨噬细胞在基因表达上的差异。 | NA | 探讨巨噬细胞在未刺激状态下基因表达的差异及其对免疫反应的影响。 | BALB/c和C57BL/6小鼠的未刺激巨噬细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | BALB/c和C57BL/6小鼠的未刺激巨噬细胞群体 | NA | NA | NA | NA |
| 208 | 2024-08-08 |
CTSB+ macrophage repress memory immune hub in the liver metastasis site of colorectal cancer patient revealed by multi-omics analysis
2022-10-20, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2022.06.037
PMID:35964553
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了结直肠癌肝转移部位中CTSB+巨噬细胞抑制记忆免疫中枢的作用。 | 发现记忆CD8 T细胞、B细胞和CTSB+巨噬细胞在肝转移部位富集，形成记忆免疫中枢，对抗肿瘤反应具有重要意义。 | NA | 识别结直肠癌肝转移的潜在免疫调节机制。 | 结直肠癌及其肝转移部位的肿瘤微环境中的关键细胞群体。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序和多重免疫组织化学 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 209 | 2024-08-08 |
Inhibition of Arid1a increases stem/progenitor cell-like properties of liver cancer
2022-10-10, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2022.215869
PMID:35964817
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研究论文 | 本文研究了Arid1a敲除对肝癌细胞分化状态的影响，并通过单细胞RNA测序和批量RNA测序分析了其对细胞干性和分化相关基因表达的影响。 | 首次证明了Arid1a缺失通过重塑染色质可及性，增加肝癌干细胞/祖细胞样细胞的数量，从而促进肝癌发展。 | NA | 探讨Arid1a在肝癌发病机制中的作用及其对细胞干性和分化状态的影响。 | 肝癌细胞中的Arid1a基因及其对细胞干性和分化状态的影响。 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 批量RNA测序 (RNA-seq) | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 210 | 2024-08-08 |
TDO2+ myofibroblasts mediate immune suppression in malignant transformation of squamous cell carcinoma
2022-10-03, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI157649
PMID:35972800
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析口腔鳞状细胞癌（OSCC）及其癌前病变和正常组织的免疫景观变化，发现TDO2+肌成纤维细胞在免疫抑制中的作用 | 首次鉴定出表达色氨酸2,3-双加氧酶（TDO2）的肌成纤维细胞亚群，并揭示其在口腔鳞状细胞癌恶性转化中的免疫抑制作用 | NA | 揭示口腔鳞状细胞癌恶性转化过程中的免疫学变化，为免疫治疗提供新靶点 | 口腔鳞状细胞癌（OSCC）及其癌前病变和正常组织的细胞 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 细胞 | 131,702个细胞，来自13个OSCC癌组织、3个癌前口腔白斑样本和8个邻近正常样本 | NA | NA | NA | NA |
| 211 | 2024-08-08 |
Biallelic variants in ADAMTS15 cause a novel form of distal arthrogryposis
2022-10, Genetics in medicine : official journal of the American College of Medical Genetics
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.gim.2022.07.012
PMID:35962790
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研究论文 | 本文通过家系遗传学、外显子测序和疾病特异性面板测序，鉴定了ADAMTS15基因的双等位变异导致的一种新型远端关节弯曲症 | 发现了ADAMTS15基因的双等位变异与新型远端关节弯曲症的关联 | NA | 旨在识别一种新型远端关节弯曲症的遗传原因 | ADAMTS15基因变异及其在受影响个体中的表达模式 | NA | 远端关节弯曲症 | 外显子测序、原位杂交、RNAscope | NA | 基因组数据、单细胞测序数据 | 5名受影响个体来自4个无关联的近亲家庭 | NA | NA | NA | NA |
| 212 | 2024-08-08 |
Early atherogenesis: new insights from new approaches
2022-10-01, Current opinion in lipidology
IF:3.8Q1
DOI:10.1097/MOL.0000000000000843
PMID:35979994
|
研究论文 | 本文综述了近期在理解动脉粥样硬化初始阶段的细胞和分子机制方面的概念和技术进展 | 通过单细胞RNA测序和CyTOF等无偏倚单细胞方法，深入探讨了正常内膜和动脉粥样硬化病变的细胞组成 | 关于高胆固醇血症如何启动早期炎症事件的具体细节尚未完全阐明 | 探讨动脉粥样硬化初始阶段的细胞和分子机制 | 动脉粥样硬化的初始阶段，包括内膜脂质积累、炎症和病变生长 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、CyTOF | NA | 转录组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 213 | 2024-08-08 |
Construction and verification of a hypoxia-related nine-gene prognostic model in uveal melanoma based on integrated single-cell and bulk RNA sequencing analyses
2022-10, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2022.109214
PMID:35981602
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研究论文 | 本文构建并验证了一个基于单细胞和批量RNA测序分析的与缺氧相关的九基因预后模型，用于葡萄膜黑色素瘤 | 首次基于单细胞和批量RNA测序数据集，通过综合分析识别出47个与缺氧相关的共同差异表达基因，并建立了九基因预后模型 | NA | 研究目的是构建和验证一个与缺氧相关的九基因预后模型，以预测葡萄膜黑色素瘤患者的预后并指导个性化治疗 | 葡萄膜黑色素瘤患者及其预后 | 数字病理学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序 | LASSO-Cox回归模型 | RNA测序数据 | 使用了来自Gene Expression Omnibus（GEO）的单细胞测序数据集和来自癌症基因组图谱（TCGA）的批量RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 214 | 2024-08-08 |
Inverse weighting method with jackknife variance estimator for differential expression analysis of single-cell RNA sequencing data
2022-Oct, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 本文提出了一种逆非丢失概率加权方法，用于校正单细胞RNA测序数据中由于信息性丢失事件引起的差异表达分析偏差 | 本文提出的方法在所有场景下在AUC、敏感性、特异性和FDR方面表现最佳 | NA | 校正单细胞RNA测序数据中的差异表达分析偏差 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 线性回归、广义线性回归和混合回归 | RNA测序数据 | 使用小鼠胚胎干细胞和成纤维细胞进行实验，以及一个真实数据集的随机分割 | NA | NA | NA | NA |
| 215 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA and protein profiling of immune cells from the mouse brain and its border tissues
2022-10, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-022-00716-4
PMID:35931780
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研究论文 | 本文提供了一种单细胞多组学分析大脑免疫组分的详细协议 | 结合了高维流式细胞术和基于液滴的单细胞RNA测序，以及CITE-seq技术，实现了高通量且无偏倚的蛋白质表达筛选与转录组分析 | 实验操作需要专业训练，计算分析需要生物信息学和R编程背景 | 深入理解大脑免疫景观，为神经系统疾病的新治疗策略提供依据 | 小鼠大脑及其边界组织的免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，CITE-seq | NA | RNA和蛋白质 | 小鼠大脑及其边界组织的免疫细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 216 | 2024-08-08 |
Characteristics of plaque lipid-associated macrophages and their possible roles in the pathogenesis of atherosclerosis
2022-10-01, Current opinion in lipidology
IF:3.8Q1
DOI:10.1097/MOL.0000000000000842
PMID:35942822
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综述 | 本文通过比较斑块泡沫巨噬细胞与其他疾病相关巨噬细胞的基因表达谱，探讨了它们在动脉粥样硬化发病机制中的作用 | 将斑块泡沫巨噬细胞命名为斑块脂质相关巨噬细胞（PLAMs），并发现其高表达与吞噬/内吞作用、溶酶体、脂质代谢和氧化磷酸化相关的基因 | NA | 重新审视斑块泡沫巨噬细胞在动脉粥样硬化发病机制中的作用 | 斑块泡沫巨噬细胞的基因表达谱及其在动脉粥样硬化中的功能 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 217 | 2024-08-08 |
Cluster-independent marker feature identification from single-cell omics data using SEMITONES
2022-10-14, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac639
PMID:35909238
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SEMITONES的方法，用于从单细胞组学数据中进行无聚类标记特征识别 | SEMITONES是一种无聚类标记识别方法，不依赖细胞的聚类分配，适用于发育数据等复杂情况 | NA | 开发一种无需细胞聚类的新方法，用于从单细胞组学数据中识别细胞身份标记 | 人类造血系统的单细胞数据以及空间转录组数据 | 单细胞组学 | NA | SEMITONES | NA | 单细胞数据 | 使用了多个模拟和精选的数据集进行验证 | NA | NA | NA | NA |
| 218 | 2024-08-08 |
Tyrosine Kinase Inhibition Alters Intratumoral CD8+ T-cell Subtype Composition and Activity
2022-10-04, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-21-1039
PMID:35917579
|
研究论文 | 研究酪氨酸激酶抑制剂（TKI）对肿瘤内CD8+ T细胞亚型组成和活性的影响 | 发现TKI与IL15超激动剂（IL15SA）联合使用可恢复肿瘤内效应CD8+ T细胞功能和CD8+ T细胞内PI3K信号传导，从而增强肿瘤破坏 | 尽管联合使用TKI和免疫检查点阻断（ICB）在晚期GIST中取得了一定效果，但治疗效果仍然有限 | 探讨TKI对肿瘤内CD8+ T细胞亚型组成和活性的影响，并评估联合治疗策略的效果 | 胃肠间质瘤（GIST）中的CD8+ T细胞亚型和活性 | 数字病理学 | 胃肠间质瘤 | RNA测序（RNA-seq），单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | RNA | 使用了基因工程小鼠模型和人类GIST样本 | NA | NA | NA | NA |
| 219 | 2024-08-08 |
Constitutive programmed death ligand 1 expression protects gastric G-cells from Helicobacter pylori-induced inflammation
2022-Oct, Helicobacter
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/hel.12917
PMID:35899973
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研究论文 | 研究胃肠道化生（GIM）患者组织在幽门螺杆菌感染后是否通过PD-L1表达逃避免疫监视 | 发现G-细胞在幽门螺杆菌感染期间通过PD-L1表达得到保护，而GIM本身不表达PD-L1 | NA | 探究GIM患者组织在幽门螺杆菌感染后是否通过PD-L1表达逃避免疫监视 | GIM患者的组织样本 | NA | 胃肠道疾病 | 免疫组织化学染色，多重免疫荧光染色，单细胞测序 | NA | 组织样本 | 来自已知GIM患者的一组样本 | NA | NA | NA | NA |
| 220 | 2024-08-08 |
Research strategies for single-cell transcriptome analysis in plant leaves
2022-10, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.15927
PMID:35904970
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在植物叶片研究中的进展，并探讨了相关的分析方法及当前研究中遇到的困难和问题 | NA | 植物单细胞研究面临细胞分离、细胞类型注释、细胞功能分析和细胞间通信网络等挑战，且缺乏可靠稳定的分析方法和标准 | 总结植物叶片中单细胞转录组分析的研究进展，并探讨未来的发展方向 | 植物叶片的单细胞转录组 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |