单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 258 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2024-08-08 |
Loss of apelin blocks the emergence of sprouting angiogenesis in experimental tumors
2022-10, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202200616RR
PMID:36165236
|
研究论文 | 研究探讨了apelin在肿瘤生长和血管生成中的作用，特别是在VEGF信号抑制后的影响 | 发现apelin的缺失可以延缓肿瘤生长并减少血管密度，为抗血管生成治疗提供了新的潜在靶点 | NA | 识别VEGF途径抑制后的替代促血管生成途径，以开发更有效的抗血管生成疗法 | apelin在肿瘤生长和血管生成中的作用 | 肿瘤学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型中的Lewis肺腺癌1和B16F10黑色素瘤 |
| 182 | 2024-08-08 |
Progressively Decreased HCN1 Channels Results in Cone Morphological Defects in Diabetic Retinopathy
2022-10-26, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.2550-21.2022
PMID:36123121
|
研究论文 | 本研究报告了在糖尿病视网膜病变中，HCN1通道的逐渐减少导致视锥细胞形态缺陷，并使用斑马鱼模型进行了系统性的单细胞转录组分析。 | 首次揭示了HCN1通道在糖尿病视网膜病变中的作用，并提出了视锥细胞在不同葡萄糖水平下的两种新型细胞状态。 | NA | 探讨糖尿病视网膜病变中视锥细胞形态缺陷的分子机制。 | 糖尿病视网膜病变中的视锥细胞及其HCN1通道表达。 | NA | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 斑马鱼模型 |
| 183 | 2024-08-08 |
Unraveling unique features of plasma cell clones in POEMS syndrome with single-cell analysis
2022-10-24, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.151482
PMID:36129760
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了POEMS综合征患者的骨髓浆细胞，识别出具有特定Igλ轻链序列的POEMS克隆，并探讨了其特征和病理机制 | 首次成功通过单细胞RNA测序技术分离和鉴定了POEMS综合征中的浆细胞克隆，揭示了其独特的分子特征 | 研究样本量较小，可能需要进一步扩大样本以验证结果的普遍性 | 揭示POEMS综合征中浆细胞克隆的独特特征及其病理机制 | POEMS综合征患者的骨髓浆细胞 | 数字病理学 | 浆细胞疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自POEMS综合征患者的骨髓浆细胞样本 |
| 184 | 2024-08-08 |
Inhibition of APOC1 promotes the transformation of M2 into M1 macrophages via the ferroptosis pathway and enhances anti-PD1 immunotherapy in hepatocellular carcinoma based on single-cell RNA sequencing
2022-10, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2022.102463
PMID:36108528
|
research paper | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了APOC1抑制在肝细胞癌中通过铁死亡途径促进M2巨噬细胞向M1型转化，并增强抗PD1免疫治疗的效果。 | 首次揭示了APOC1在肝细胞癌中的过度表达及其通过铁死亡途径影响巨噬细胞表型的机制，为抗PD1免疫治疗提供了新的策略。 | 研究样本量较小，仅包括四例肝细胞癌病例和两例非癌对照，可能影响结果的普遍性。 | 探讨APOC1抑制在肝细胞癌治疗中的作用及其机制。 | 肝细胞癌中的巨噬细胞表型转化及其与抗PD1免疫治疗的关系。 | digital pathology | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 212,494个细胞，包括四例肝细胞癌病例和两例非癌对照的免疫细胞。 |
| 185 | 2024-08-08 |
Downregulation of zinc finger protein 71 expression in oral squamous cell carcinoma tissues and its underlying molecular mechanism
2022-Oct, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2022.154109
PMID:36115333
|
研究论文 | 本研究探讨了锌指蛋白71（ZNF71）在口腔鳞状细胞癌（OSCC）组织中的表达水平及其潜在的分子机制 | 首次描述了ZNF71在OSCC中的表达状态及其分子机制 | 需要进一步研究以验证ZNF71下调对OSCC启动和促进的影响 | 旨在确定ZNF71在OSCC组织中的特定表达水平并解释其在OSCC发病机制中的潜在分子机制 | 口腔鳞状细胞癌组织中ZNF71的表达及其分子机制 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 免疫组织化学染色，单细胞RNA测序，高通量RNA测序 | NA | 蛋白质，mRNA | 116例OSCC样本和29例非OSCC样本用于免疫组织化学染色，7例OSCC样本用于单细胞RNA测序，893例OSCC样本和301例非OSCC样本用于高通量RNA测序 |
| 186 | 2024-08-08 |
Chemically-induced osteogenic cells for bone tissue engineering and disease modeling
2022-10, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
研究论文 | 本文报道了将人纤维母细胞重编程为化学诱导的成骨细胞（ciOG），并探讨了ciOG在骨修复和疾病治疗中的应用潜力 | 使用化学混合物RepSox、forskolin和phenamil激活RUNX2表达，成功将纤维母细胞诱导为成骨细胞，并在免疫缺陷小鼠的异位部位形成矿化组织 | NA | 研究化学诱导的成骨细胞在骨组织工程和疾病模型中的应用 | 人纤维母细胞、化学诱导的成骨细胞（ciOG） | 组织工程 | NA | RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 187 | 2024-08-08 |
A cellular hierarchy in melanoma uncouples growth and metastasis
2022-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-05242-7
PMID:36131018
|
研究论文 | 本文通过结合小鼠遗传学、单细胞和空间转录组学、谱系追踪和定量建模，揭示了黑色素瘤中肿瘤生长的层次模型，该模型反映了胚胎神经嵴细胞命运指定和分化的细胞和分子逻辑。 | 本文首次展示了黑色素瘤细胞在空间上定位的血管周围微环境中，通过内皮细胞建立的细胞间通讯途径获得肿瘤发生能力，并揭示了支持生长和转移的细胞池是不同的。 | NA | 研究黑色素瘤中细胞状态多样性的起源和程度，以及生长和转移扩散是否由重叠或不同的黑色素瘤亚群支持。 | 黑色素瘤细胞的生长和转移机制。 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞和空间转录组学 | 定量建模 | 转录组数据 | 涉及小鼠模型和黑色素瘤细胞样本 |
| 188 | 2024-08-08 |
A machine learning-based method for automatically identifying novel cells in annotating single-cell RNA-seq data
2022-10-31, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac617
PMID:36083008
|
研究论文 | 本文开发了一种基于自动编码器和迭代特征选择的方法，用于自动识别单细胞RNA测序数据中的新型细胞 | 该方法通过迭代选择显示双峰模式的特征并使用所选特征重新聚类细胞，能够准确识别训练数据中不存在的新型细胞 | NA | 开发一种新的方法来自动识别单细胞RNA测序数据中的新型细胞 | 单细胞RNA测序数据中的新型细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 自动编码器 | 数据 | 五个真实的单细胞RNA测序数据集 |
| 189 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals skewed cellular communication and phenotypic shift in pulmonary artery remodeling
2022-10-24, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.153471
PMID:36099047
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了肺动脉重塑过程中细胞组成的改变及其对细胞间通信网络的影响 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了肺动脉重塑过程中的细胞和分子变化，特别是平滑肌细胞的异质性和表型转变 | NA | 探究肺动脉重塑过程中不同细胞群体的贡献及其分子机制 | 肺动脉重塑过程中的细胞组成和细胞间通信网络 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 来自肺动脉高压和捐赠肺的肺动脉样本 |
| 190 | 2024-08-08 |
Mouse embryo model derived exclusively from embryonic stem cells undergoes neurulation and heart development
2022-10-06, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2022.08.013
PMID:36084657
|
研究论文 | 本文开发了一种基于胚胎干细胞的体外模型，该模型通过转录因子介导的诱导，重构了多能胚胎干细胞谱系和两个胚外谱系，模拟了从胚胎发育第5.5天到第8.5天的发育事件。 | 该模型成功模拟了胚胎发育的关键阶段，包括原肠形成、前后轴形成、脑部和跳动心脏结构的形成，以及胚外组织的发育，如卵黄囊和绒毛膜。 | 模型与自然胚胎发育程序在某些时间和位置存在差异。 | 克服现有体外模型无法完全模拟胚胎与胚外组织间相互作用的局限，开发一种新的胚胎干细胞体外模型。 | 胚胎干细胞及其在体外模型中的发育过程。 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 191 | 2024-08-08 |
SD2: spatially resolved transcriptomics deconvolution through integration of dropout and spatial information
2022-10-31, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac605
PMID:36063455
|
研究论文 | 本文提出了一种新的空间转录组解卷积方法SD2，通过整合空间信息和考虑dropout特征，提高了组织全景图的分辨率 | SD2方法通过提取基于dropout的基因作为信息特征，并利用图卷积神经网络预测细胞类型组成，显著提高了性能 | NA | 探索细胞间相互作用和人类疾病细胞靶点，提高空间转录组数据的解析度 | 空间转录组数据中的细胞类型组成 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 图卷积神经网络 | 基因表达数据 | 模拟seqFISH+数据集和三个真实世界数据集 |
| 192 | 2024-08-08 |
Jag2b-Notch3/1b-mediated neuron-to-glia crosstalk controls retinal gliogenesis
2022-10-06, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202254922
PMID:36047082
|
研究论文 | 本文报道了光感受器细胞衍生的Jag2b在斑马鱼发育中的视网膜中对Notch依赖的Müller胶质细胞（MG）生成的作用 | 揭示了Jag2b与Notch3/Notch1b相互作用介导的神经元与胶质细胞之间的对话，确保了MG的不可逆分化，为发育中的脊椎动物中枢神经系统结构中胶质细胞命运的时间性指定提供了新的机制性见解 | NA | 研究神经元对胶质细胞生成的影响 | 斑马鱼视网膜中的光感受器细胞和Müller胶质细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 193 | 2024-08-08 |
S100A10 might be a novel prognostic biomarker for head and neck squamous cell carcinoma based on bioinformatics analysis
2022-10, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2022.106000
PMID:36049414
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析探讨了S100A10作为头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）新型预后生物标志物的潜力 | 首次揭示了S100A10在HNSCC中的表达水平与患者总体生存率的关系，并通过单细胞RNA测序分析了其在肿瘤发展中的具体作用 | NA | 探索S100A10作为HNSCC预后生物标志物的可能性及其在肿瘤发展中的作用 | S100A10在HNSCC中的表达及其对患者预后的影响 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA表达数据 | 涉及HNSCC患者的mRNA表达水平数据 |
| 194 | 2024-08-08 |
The progressive application of single-cell RNA sequencing technology in cardiovascular diseases
2022-Oct, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2022.113604
PMID:36057222
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在心血管疾病研究中的应用及其数据分析过程 | 介绍了单细胞RNA测序技术如何通过高吞吐量分析单细胞，揭示细胞异质性，识别罕见细胞类型，并构建人类心脏细胞图谱 | 讨论了单细胞RNA测序技术的不足，并探讨了其与空间组学技术结合的可能性 | 总结单细胞测序技术在心血管疾病研究中的最新发现，并探讨其未来应用方向 | 心血管疾病及其发病机制中的细胞类型和细胞异质性 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 涉及大量单细胞样本 |
| 195 | 2024-08-08 |
Intestinal epithelial organoids: regeneration and maintenance of the intestinal epithelium
2022-10, Current opinion in genetics & development
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.gde.2022.101977
PMID:36058061
|
研究论文 | 本文综述了肠道上皮类器官在肠道上皮再生和维持中的作用及其在再生疗法中的应用 | 利用单细胞转录组学和表观遗传分析等技术，对肠道上皮细胞类型及其周围间质微环境进行了遗传学特征分析，并结合基因组工程、遗传谱系追踪和组织移植技术，推动了基于类器官的再生疗法的发展 | NA | 探讨肠道上皮自我更新在稳态和再生中的机制，并展望未来类器官医学的发展 | 肠道上皮细胞及其再生和维持机制 | 数字病理学 | 短肠综合征 | 单细胞转录组学、表观遗传分析 | NA | 基因组数据 | NA |
| 196 | 2024-08-08 |
FastMix: a versatile data integration pipeline for cell type-specific biomarker inference
2022-10-14, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac585
PMID:36018232
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为FastMix的新型分析管道，用于计算免疫学，整合流式细胞术、bulk转录组学和临床协变量，以识别细胞类型特异性基因表达特征和生物标志物基因 | FastMix通过线性混合效应模型（LMER）解决了基因表达和流式细胞术整合分析中的'大p，小n'问题，并引入了基于矩的估计器，减少了参数估计中的偏差并提高了效率 | NA | 开发一种数据整合管道，用于分析流式细胞术和转录组学数据，结合实验变量进行生物标志物推断 | 流式细胞术和转录组学数据 | 计算免疫学 | NA | 流式细胞术，bulk转录组学 | 线性混合效应模型（LMER） | 基因表达数据，流式细胞术数据 | 涉及两个疫苗研究的实际数据 |
| 197 | 2024-08-08 |
Sex-dependent differential transcript expression in the placenta of growth restricted infants
2022-10, Placenta
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.placenta.2022.08.004
PMID:36031700
|
研究论文 | 研究探讨了在宫内生长受限婴儿的胎盘中，性别特异性基因表达的变化 | 首次识别了与宫内生长受限婴儿相关的403个候选转录本，其中103个显示性别特异性表达 | 研究仅基于12个胎盘样本，样本量较小 | 旨在评估宫内生长受限婴儿胎盘中性别特异性基因表达的变化 | 人类胎盘组织样本 | 基因表达 | 宫内生长受限 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 12个胎盘样本 |
| 198 | 2024-08-08 |
Tracking Regulatory T Cell Development in the Thymus Using Single-Cell RNA Sequencing/TCR Sequencing
2022-10-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2200089
PMID:36038290
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序（scRNA-Seq）和TCR测序技术，追踪小鼠胸腺中调节性T细胞（T）的发育过程 | 本研究首次详细描述了调节性T细胞在胸腺中的发育路径，并通过scRNA-Seq和TCR-Seq技术揭示了多个发育阶段和TCR库的多样性 | NA | 研究调节性T细胞在胸腺中的发育过程及其分子机制 | 小鼠胸腺中的CD4CD8双阳性胸腺细胞、CD4单阳性胸腺细胞、CD25FOXP3CD73 T前体细胞等 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、TCR测序 | NA | RNA序列 | 多种胸腺细胞亚群 |
| 199 | 2024-08-08 |
Single-cell mutation calling and phylogenetic tree reconstruction with loss and recurrence
2022-10-14, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac577
PMID:36000873
|
研究论文 | 本文介绍了一种方法，通过建模噪声过程并允许突变在肿瘤进化过程中丢失或重新出现，联合调用每个细胞中的突变，重建细胞间的系统发育关系，并确定突变丢失和重新出现的位置 | 提出了一个贝叶斯方法，能够准确调用突变并量化预测的确定性，同时展示了允许突变丢失或重新出现的优势 | NA | 理解每个患者的肿瘤组成和进化历史，为个性化治疗提供关键信息 | 肿瘤细胞的异质性和进化过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | 贝叶斯模型 | 单细胞测序数据 | NA |
| 200 | 2024-08-08 |
propeller: testing for differences in cell type proportions in single cell data
2022-10-14, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac582
PMID:36005887
|
研究论文 | 本文介绍了propeller方法，用于检测单细胞数据中细胞类型比例在不同实验条件下的差异 | propeller方法利用生物复制来发现细胞类型比例在组间的统计显著差异，并展示了其在多种场景下的良好表现 | NA | 开发一种统计方法来准确识别单细胞RNA测序数据中细胞类型组成的统计显著变化 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型比例 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 数据 | 数千到数百万的单细胞 |