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当前共找到 259 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2024-08-08 |
CaSee: A lightning transfer-learning model directly used to discriminate cancer/normal cells from scRNA-seq
2022-10, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-022-02478-5
PMID:36192479
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研究论文 | 本研究开发了一种名为pan-Cancer Seeker（CaSee）的转移学习模型，用于直接从scRNA-seq表达矩阵中区分癌细胞和正常细胞 | CaSee是首个直接用于scRNA-seq表达矩阵中区分癌细胞和正常细胞的工具，相较于需要相应参考细胞的拷贝数变异（CNV）方法，具有更广泛的应用领域和更高的效率 | NA | 开发一种基于深度学习的泛癌细胞鉴别模型，以区分癌细胞和正常细胞 | scRNA-seq表达矩阵中的癌细胞和正常细胞 | 基因组学 | 癌症 | scRNA-seq | 转移学习模型 | 表达矩阵 | 在11个回顾性队列和1个独立数据集的多中心数据评估中展示了优异的性能 | NA | NA | NA | NA |
| 182 | 2024-08-08 |
Single-cell mapping of regenerative and fibrotic healing responses after musculoskeletal injury
2022-10-11, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2022.08.011
PMID:36150381
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术比较了再生性和纤维化愈合反应在肌肉骨骼损伤后的差异 | 研究发现纤维化的P2 DTA模型与异位骨化（HO）的转录相似度高于再生性的P3 DTA模型，表明基因表达与愈合结果的相关性大于与损伤类型或细胞来源的相关性 | NA | 指导未来伤口再生策略 | 肌肉骨骼损伤后的再生性和纤维化愈合反应 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及第三指节元素（P3）和第二指节元素（P2）的指尖截肢（DTA）模型以及异位骨化（HO）模型 | NA | NA | NA | NA |
| 183 | 2024-08-08 |
Highly sensitive single-cell chromatin accessibility assay and transcriptome coassay with METATAC
2022-10-04, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2206450119
PMID:36161934
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研究论文 | 本文介绍了一种高灵敏度的单细胞染色质可及性检测方法METATAC及其与转录组共检测技术 | METATAC方法能够检测大量单细胞中的可及位点，并与自动化兼容，同时与高灵敏度单细胞RNA测序方法MALBAC-DT结合，开发了联合ATAC-RNA检测技术M2C-seq | NA | 提高单细胞染色质可及性和转录组检测的灵敏度和效率 | 单细胞染色质可及性和基因表达的关系 | 单细胞组学 | NA | scATAC-seq, scRNA-seq | NA | 染色质可及性数据, 转录组数据 | 小鼠大脑皮层细胞, 早期小鼠胚胎细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 184 | 2024-08-08 |
Single cell RNA-seq analysis identifies ferroptotic chondrocyte cluster and reveals TRPV1 as an anti-ferroptotic target in osteoarthritis
2022-Oct, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2022.104258
PMID:36137413
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，识别出铁死亡性软骨细胞簇，并揭示TRPV1作为抗铁死亡靶点在骨关节炎中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序分析识别出骨关节炎中铁死亡性软骨细胞簇，并发现TRPV1作为抗铁死亡的新靶点 | 研究主要集中在体外和动物模型中，需要进一步的人体临床试验验证 | 探讨软骨细胞铁死亡在骨关节炎发病机制中的作用及其分子特征和潜在治疗靶点 | 骨关节炎患者的软骨细胞和软骨组织 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 17,638个软骨细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 185 | 2024-08-08 |
Integrating microarray-based spatial transcriptomics and single-cell RNA-sequencing reveals tissue architecture in esophageal squamous cell carcinoma
2022-Oct, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2022.104281
PMID:36162205
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研究论文 | 本研究通过整合基于微阵列的空间转录组学和单细胞RNA测序技术，揭示了食管鳞状细胞癌中的组织结构 | 首次通过多模态交叉分析整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据，精确注释了肿瘤和间质区域的细胞组成 | 研究样本仅来自三位食管鳞状细胞癌患者，可能限制了结果的普遍性 | 揭示食管鳞状细胞癌肿瘤微环境中不同细胞亚群的空间景观及其潜在的细胞间交流 | 食管鳞状细胞癌的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序, 微阵列空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 三位食管鳞状细胞癌患者的组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 186 | 2024-08-08 |
Unique Cell Subpopulations and Disease Progression Markers in Canines with Atopic Dermatitis
2022-10-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2200304
PMID:36165204
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术，在犬类特应性皮炎模型中探索健康皮肤与特应性皮炎皮肤之间的分子和细胞差异 | 首次在犬类特应性皮炎模型中发现γδ T细胞的富集，以及特应性皮炎中显著的-阳性成纤维细胞亚群，这些可能与皮肤炎症有关 | NA | 揭示特应性皮炎在分子和细胞层面的差异，并寻找可能的疾病进展标志物 | 犬类特应性皮炎的皮肤细胞 | 数字病理学 | 特应性皮炎 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 187 | 2024-08-08 |
Loss of apelin blocks the emergence of sprouting angiogenesis in experimental tumors
2022-10, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202200616RR
PMID:36165236
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研究论文 | 研究探讨了apelin在肿瘤生长和血管生成中的作用，特别是在VEGF信号抑制后的影响 | 发现apelin的缺失可以延缓肿瘤生长并减少血管密度，为抗血管生成治疗提供了新的潜在靶点 | NA | 识别VEGF途径抑制后的替代促血管生成途径，以开发更有效的抗血管生成疗法 | apelin在肿瘤生长和血管生成中的作用 | 肿瘤学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型中的Lewis肺腺癌1和B16F10黑色素瘤 | NA | NA | NA | NA |
| 188 | 2024-08-08 |
Progressively Decreased HCN1 Channels Results in Cone Morphological Defects in Diabetic Retinopathy
2022-10-26, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.2550-21.2022
PMID:36123121
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研究论文 | 本研究报告了在糖尿病视网膜病变中，HCN1通道的逐渐减少导致视锥细胞形态缺陷，并使用斑马鱼模型进行了系统性的单细胞转录组分析。 | 首次揭示了HCN1通道在糖尿病视网膜病变中的作用，并提出了视锥细胞在不同葡萄糖水平下的两种新型细胞状态。 | NA | 探讨糖尿病视网膜病变中视锥细胞形态缺陷的分子机制。 | 糖尿病视网膜病变中的视锥细胞及其HCN1通道表达。 | NA | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 斑马鱼模型 | NA | NA | NA | NA |
| 189 | 2024-08-08 |
Unraveling unique features of plasma cell clones in POEMS syndrome with single-cell analysis
2022-10-24, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.151482
PMID:36129760
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了POEMS综合征患者的骨髓浆细胞，识别出具有特定Igλ轻链序列的POEMS克隆，并探讨了其特征和病理机制 | 首次成功通过单细胞RNA测序技术分离和鉴定了POEMS综合征中的浆细胞克隆，揭示了其独特的分子特征 | 研究样本量较小，可能需要进一步扩大样本以验证结果的普遍性 | 揭示POEMS综合征中浆细胞克隆的独特特征及其病理机制 | POEMS综合征患者的骨髓浆细胞 | 数字病理学 | 浆细胞疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自POEMS综合征患者的骨髓浆细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 190 | 2024-08-08 |
Inhibition of APOC1 promotes the transformation of M2 into M1 macrophages via the ferroptosis pathway and enhances anti-PD1 immunotherapy in hepatocellular carcinoma based on single-cell RNA sequencing
2022-10, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2022.102463
PMID:36108528
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research paper | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了APOC1抑制在肝细胞癌中通过铁死亡途径促进M2巨噬细胞向M1型转化，并增强抗PD1免疫治疗的效果。 | 首次揭示了APOC1在肝细胞癌中的过度表达及其通过铁死亡途径影响巨噬细胞表型的机制，为抗PD1免疫治疗提供了新的策略。 | 研究样本量较小，仅包括四例肝细胞癌病例和两例非癌对照，可能影响结果的普遍性。 | 探讨APOC1抑制在肝细胞癌治疗中的作用及其机制。 | 肝细胞癌中的巨噬细胞表型转化及其与抗PD1免疫治疗的关系。 | digital pathology | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 212,494个细胞，包括四例肝细胞癌病例和两例非癌对照的免疫细胞。 | NA | NA | NA | NA |
| 191 | 2024-08-08 |
Downregulation of zinc finger protein 71 expression in oral squamous cell carcinoma tissues and its underlying molecular mechanism
2022-Oct, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2022.154109
PMID:36115333
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研究论文 | 本研究探讨了锌指蛋白71（ZNF71）在口腔鳞状细胞癌（OSCC）组织中的表达水平及其潜在的分子机制 | 首次描述了ZNF71在OSCC中的表达状态及其分子机制 | 需要进一步研究以验证ZNF71下调对OSCC启动和促进的影响 | 旨在确定ZNF71在OSCC组织中的特定表达水平并解释其在OSCC发病机制中的潜在分子机制 | 口腔鳞状细胞癌组织中ZNF71的表达及其分子机制 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 免疫组织化学染色，单细胞RNA测序，高通量RNA测序 | NA | 蛋白质，mRNA | 116例OSCC样本和29例非OSCC样本用于免疫组织化学染色，7例OSCC样本用于单细胞RNA测序，893例OSCC样本和301例非OSCC样本用于高通量RNA测序 | NA | NA | NA | NA |
| 192 | 2024-08-08 |
Chemically-induced osteogenic cells for bone tissue engineering and disease modeling
2022-10, Biomaterials
IF:12.8Q1
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研究论文 | 本文报道了将人纤维母细胞重编程为化学诱导的成骨细胞（ciOG），并探讨了ciOG在骨修复和疾病治疗中的应用潜力 | 使用化学混合物RepSox、forskolin和phenamil激活RUNX2表达，成功将纤维母细胞诱导为成骨细胞，并在免疫缺陷小鼠的异位部位形成矿化组织 | NA | 研究化学诱导的成骨细胞在骨组织工程和疾病模型中的应用 | 人纤维母细胞、化学诱导的成骨细胞（ciOG） | 组织工程 | NA | RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 193 | 2024-08-08 |
A machine learning-based method for automatically identifying novel cells in annotating single-cell RNA-seq data
2022-10-31, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac617
PMID:36083008
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研究论文 | 本文开发了一种基于自动编码器和迭代特征选择的方法，用于自动识别单细胞RNA测序数据中的新型细胞 | 该方法通过迭代选择显示双峰模式的特征并使用所选特征重新聚类细胞，能够准确识别训练数据中不存在的新型细胞 | NA | 开发一种新的方法来自动识别单细胞RNA测序数据中的新型细胞 | 单细胞RNA测序数据中的新型细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 自动编码器 | 数据 | 五个真实的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 194 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals skewed cellular communication and phenotypic shift in pulmonary artery remodeling
2022-10-24, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.153471
PMID:36099047
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了肺动脉重塑过程中细胞组成的改变及其对细胞间通信网络的影响 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了肺动脉重塑过程中的细胞和分子变化，特别是平滑肌细胞的异质性和表型转变 | NA | 探究肺动脉重塑过程中不同细胞群体的贡献及其分子机制 | 肺动脉重塑过程中的细胞组成和细胞间通信网络 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 来自肺动脉高压和捐赠肺的肺动脉样本 | NA | NA | NA | NA |
| 195 | 2024-08-08 |
SD2: spatially resolved transcriptomics deconvolution through integration of dropout and spatial information
2022-10-31, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac605
PMID:36063455
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研究论文 | 本文提出了一种新的空间转录组解卷积方法SD2，通过整合空间信息和考虑dropout特征，提高了组织全景图的分辨率 | SD2方法通过提取基于dropout的基因作为信息特征，并利用图卷积神经网络预测细胞类型组成，显著提高了性能 | NA | 探索细胞间相互作用和人类疾病细胞靶点，提高空间转录组数据的解析度 | 空间转录组数据中的细胞类型组成 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 图卷积神经网络 | 基因表达数据 | 模拟seqFISH+数据集和三个真实世界数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 196 | 2024-08-08 |
Jag2b-Notch3/1b-mediated neuron-to-glia crosstalk controls retinal gliogenesis
2022-10-06, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202254922
PMID:36047082
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研究论文 | 本文报道了光感受器细胞衍生的Jag2b在斑马鱼发育中的视网膜中对Notch依赖的Müller胶质细胞（MG）生成的作用 | 揭示了Jag2b与Notch3/Notch1b相互作用介导的神经元与胶质细胞之间的对话，确保了MG的不可逆分化，为发育中的脊椎动物中枢神经系统结构中胶质细胞命运的时间性指定提供了新的机制性见解 | NA | 研究神经元对胶质细胞生成的影响 | 斑马鱼视网膜中的光感受器细胞和Müller胶质细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 197 | 2024-08-08 |
S100A10 might be a novel prognostic biomarker for head and neck squamous cell carcinoma based on bioinformatics analysis
2022-10, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2022.106000
PMID:36049414
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析探讨了S100A10作为头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）新型预后生物标志物的潜力 | 首次揭示了S100A10在HNSCC中的表达水平与患者总体生存率的关系，并通过单细胞RNA测序分析了其在肿瘤发展中的具体作用 | NA | 探索S100A10作为HNSCC预后生物标志物的可能性及其在肿瘤发展中的作用 | S100A10在HNSCC中的表达及其对患者预后的影响 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA表达数据 | 涉及HNSCC患者的mRNA表达水平数据 | NA | NA | NA | NA |
| 198 | 2024-08-08 |
The progressive application of single-cell RNA sequencing technology in cardiovascular diseases
2022-Oct, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2022.113604
PMID:36057222
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在心血管疾病研究中的应用及其数据分析过程 | 介绍了单细胞RNA测序技术如何通过高吞吐量分析单细胞，揭示细胞异质性，识别罕见细胞类型，并构建人类心脏细胞图谱 | 讨论了单细胞RNA测序技术的不足，并探讨了其与空间组学技术结合的可能性 | 总结单细胞测序技术在心血管疾病研究中的最新发现，并探讨其未来应用方向 | 心血管疾病及其发病机制中的细胞类型和细胞异质性 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 涉及大量单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 199 | 2024-08-08 |
Intestinal epithelial organoids: regeneration and maintenance of the intestinal epithelium
2022-10, Current opinion in genetics & development
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.gde.2022.101977
PMID:36058061
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研究论文 | 本文综述了肠道上皮类器官在肠道上皮再生和维持中的作用及其在再生疗法中的应用 | 利用单细胞转录组学和表观遗传分析等技术，对肠道上皮细胞类型及其周围间质微环境进行了遗传学特征分析，并结合基因组工程、遗传谱系追踪和组织移植技术，推动了基于类器官的再生疗法的发展 | NA | 探讨肠道上皮自我更新在稳态和再生中的机制，并展望未来类器官医学的发展 | 肠道上皮细胞及其再生和维持机制 | 数字病理学 | 短肠综合征 | 单细胞转录组学、表观遗传分析 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 200 | 2024-08-08 |
FastMix: a versatile data integration pipeline for cell type-specific biomarker inference
2022-10-14, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac585
PMID:36018232
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研究论文 | 本文介绍了一种名为FastMix的新型分析管道，用于计算免疫学，整合流式细胞术、bulk转录组学和临床协变量，以识别细胞类型特异性基因表达特征和生物标志物基因 | FastMix通过线性混合效应模型（LMER）解决了基因表达和流式细胞术整合分析中的'大p，小n'问题，并引入了基于矩的估计器，减少了参数估计中的偏差并提高了效率 | NA | 开发一种数据整合管道，用于分析流式细胞术和转录组学数据，结合实验变量进行生物标志物推断 | 流式细胞术和转录组学数据 | 计算免疫学 | NA | 流式细胞术，bulk转录组学 | 线性混合效应模型（LMER） | 基因表达数据，流式细胞术数据 | 涉及两个疫苗研究的实际数据 | NA | NA | NA | NA |