单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 259 篇文献,本页显示第 1 - 20 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-09-13
The Peripheral Immune Landscape in a Patient with Myocarditis after the Administration of BNT162b2 mRNA Vaccine
2022-Oct-31, Molecules and cells IF:3.7Q2
研究论文 该研究通过单细胞RNA测序和单细胞T细胞受体测序分析外周血单个核细胞,描述了BNT162b2 mRNA疫苗接种后发生心肌炎患者的外周免疫图谱变化 首次描述了BNT162b2疫苗接种后心肌炎患者的外周免疫景观变化,发现单核细胞转录组改变最显著,且多个细胞簇中IL7R表达水平升高 仅研究了一例患者,样本量极小,无法代表所有BNT162b2疫苗接种后心肌炎患者 探索BNT162b2 mRNA疫苗接种后心肌炎的发病机制 接种BNT162b2 mRNA疫苗后发生心肌炎的患者的外周血单个核细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 NA 文本 1例患者的外周血单个核细胞 NA 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 NA NA
2 2026-09-07
scRNA-sequencing reveals subtype-specific transcriptomic perturbations in DRG neurons of PirtEGFPf mice in neuropathic pain condition
2022-10-20, eLife IF:6.4Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示了神经病理性疼痛条件下DRG神经元的亚型特异性转录组扰动 首次利用PirtEGFPf小鼠高效纯化DRG神经元并进行scRNA-seq,发现CCI诱导的亚型特异性转录组变化及性别差异,并通过RNAscope和钙成像验证新靶基因功能 未提供具体局限性信息 探究神经病理性疼痛条件下DRG神经元亚型特异性的转录组变化及其功能意义 小鼠腰椎DRG神经元 基因组学 神经病理性疼痛 单细胞RNA测序(scRNA-seq), RNAscope, 钙成像 NA 基因表达数据, 图像 未提供具体样本量信息 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'试剂盒
3 2026-09-07
Characterization of placental and decidual cell development in early pregnancy loss by single-cell RNA sequencing
2022-Oct-08, Cell & bioscience
研究论文 通过单细胞RNA测序表征早期妊娠丢失中胎盘和蜕膜细胞的发育情况。 首次利用单细胞RNA测序对不同类型早期妊娠丢失(散发性和复发性)的绒毛和蜕膜细胞进行详细表征,并揭示了巨噬细胞在早期妊娠丢失中的免疫活性状态。 未提及具体的局限性。 研究早期妊娠丢失中胎盘-蜕膜界面损伤的发病机制。 不同类型早期妊娠丢失(散发性和复发性)和正常早期妊娠的绒毛和蜕膜组织。 单细胞测序 早期妊娠丢失 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 未提及具体样本量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
4 2026-08-28
Treatment with an antigen-specific dual microparticle system reverses advanced multiple sclerosis in mice
2022-10-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究展示了一种抗原特异性双微粒系统可逆转小鼠晚期多发性硬化模型中的后肢瘫痪,通过减少中枢神经系统的免疫细胞浸润、脱髓鞘和炎症反应,并在单细胞水平上揭示了其作用机制 首次证明抗原特异性双微粒系统能在晚期实验性自身免疫性脑脊髓炎中逆转瘫痪,且通过单细胞RNA测序揭示其对多种抗原呈递细胞MHC II通路的影响,并发现B细胞在治疗中的关键作用 研究仅在动物模型中进行,需进一步验证其在人类中的安全性和有效性 开发一种抗原特异性疗法,用于逆转晚期多发性硬化的症状,同时避免系统性免疫抑制的副作用 患有晚期实验性自身免疫性脑脊髓炎的小鼠,涉及免疫细胞如树突状细胞、巨噬细胞、B细胞和小胶质细胞 免疫学 多发性硬化 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠(具体数量未在标题和摘要中提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
5 2026-08-25
Comprehensive multi-omics single-cell data integration reveals greater heterogeneity in the human immune system
2022-Oct-21, iScience IF:4.6Q1
研究论文 开发了一种名为SuPERR的新型多组学单细胞数据分析工作流程,用于整合转录组、蛋白质组和细胞受体库数据,以更准确地识别人类免疫系统中的异质细胞类型 SuPERR通过整合细胞表面蛋白和免疫球蛋白转录计数信息,提高了聚类分辨率和准确性,能发现隐藏的细胞亚群,并有效去除双细胞和防止细胞类型错误分类 未提及 改进多组学单细胞数据集中多样细胞类型的识别和细胞类型分类的准确性 人类免疫系统中的多种免疫细胞类型 机器学习 NA 单细胞转录组学、蛋白质组学、细胞受体库测序 NA 单细胞多组学数据(转录组、蛋白质组、细胞受体库) 未提及 NA 单细胞多组学 NA NA
6 2026-08-25
Decoding the transcriptome of calcified atherosclerotic plaque at single-cell resolution
2022-10-12, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序和系统生物学方法,解析钙化动脉粥样硬化斑块中血管平滑肌细胞和内皮细胞的转录组,揭示解剖位置差异及细胞转分化的潜在驱动因子 首次在单细胞分辨率下对钙化动脉粥样硬化核心和邻近组织进行转录组比较,识别出新的细胞转分化候选驱动基因 仅基于有限样本的观察性研究,未进行功能验证 阐明动脉粥样硬化斑块中不同解剖区域的细胞转录特征,探索疾病进展的潜在机制 接受颈动脉内膜切除术患者的钙化动脉粥样硬化核心斑块和近端邻近颈动脉组织 单细胞转录组学 动脉粥样硬化 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 多个患者(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
7 2026-08-23
Integration of Multiple, Diverse Methods to Identify Biologically Significant Marker Genes
2022-10-15, Journal of molecular biology IF:4.7Q1
研究论文 本研究通过整合多种差异表达分析方法,构建集成策略来识别具有生物学意义的标记基因,以提高单细胞RNA测序数据中细胞类型标记基因的可靠性。 提出了一种集成多种差异表达分析方法的技术,该技术能够稳健地识别标记基因,并通过反义mRNA原位杂交和免疫荧光验证其限制性表达,且易于扩展至更多方法。 验证结果成本高,且集成方法的效果依赖于所选方法的多样性,可能仍有改进空间。 开发一种集成方法,以更可靠地识别单细胞RNA测序数据中的细胞类型标记基因。 单细胞RNA测序数据中的细胞类型标记基因 机器学习 NA 单细胞RNA测序 集成方法 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
8 2026-08-23
Single-cell mapping of regenerative and fibrotic healing responses after musculoskeletal injury
2022-10-11, Stem cell reports IF:5.9Q2
研究论文 本研究通过单细胞测序比较了肌肉骨骼损伤后再生、纤维化和异位骨化三种愈合反应,揭示了共同及特异性的分子通路 首次在单细胞水平上比较再生(P3截指)与纤维化(P2截指)及创伤性异位骨化模型,发现纤维化组织在转录水平上与异位骨化更相似,而非再生组织 摘要未提及具体局限性,可能包括样本量有限、模型仅涉及小鼠等 探究肌肉骨骼损伤后再生与纤维化愈合反应的分子机制,以指导未来的伤口再生策略 小鼠第三指节(P3)和第二指节(P2)截指模型及创伤性异位骨化组织 单细胞测序 肌肉骨骼损伤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未提及具体样本量,涉及P3、P2截指模型及异位骨化组织 NA 单细胞RNA测序 NA NA
9 2026-05-27
Aging compromises human islet beta cell function and identity by decreasing transcription factor activity and inducing ER stress
2022-Oct-07, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序数据分析、转录因子调控网络分析、高分辨率共聚焦显微镜及胰岛素分泌测量,揭示了人类胰岛β细胞在衰老过程中发生的分子和功能变化 首次通过跨人类生命周期的综合分析,揭示了衰老导致β细胞转录因子网络重组、内质网应激激活和胰岛素分泌功能减退的分子机制 研究基于非糖尿病供体样本,可能无法完全代表糖尿病患者的β细胞衰老特征 探究衰老对人类胰岛β细胞功能和特性的影响机制 人类非糖尿病供体的胰岛β细胞 单细胞组学 2型糖尿病 单细胞RNA测序、高分辨率共聚焦显微镜 NA 单细胞转录组数据、图像数据 覆盖人类大部分生命周期的非糖尿病供体样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
10 2026-05-23
Single-cell spatial transcriptomics reveals a dynamic control of metabolic zonation and liver regeneration by endothelial cell Wnt2 and Wnt9b
2022-10-18, Cell reports. Medicine
研究论文 利用单细胞空间转录组学揭示内皮细胞Wnt2和Wnt9b对肝脏代谢分区和再生的动态调控 首次明确证明内皮细胞来源的Wnt2和Wnt9b在肝脏分区与再生中的关键作用,并发现分区过程具有动态性,同时开发四价抗体激活剂为急性肝衰竭提供再生治疗新策略 NA 阐明调控肝脏分区和再生的Wnt信号具体来源及其机制 肝脏内皮细胞、肝细胞、小鼠模型及对乙酰氨基酚中毒急性肝衰竭模型 单细胞组学 急性肝衰竭 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium NA
11 2026-05-06
Polygenic enrichment distinguishes disease associations of individual cells in single-cell RNA-seq data
2022-10, Nature genetics IF:31.7Q1
研究论文 介绍单细胞疾病相关性评分(scDRS),一种将单细胞RNA测序与多基因疾病风险关联的方法 在单细胞水平上独立于注释的细胞类型,通过多基因富集识别疾病相关细胞亚群 未提及明确局限性 建立单细胞基因表达与多基因疾病风险之间的关联,发现新的疾病相关细胞亚群 单细胞基因表达谱 机器学习和生物信息学 多种疾病/性状,包括炎性肠病、精神分裂症和甘油三酯水平相关疾病 scRNA-seq scDRS(单细胞疾病相关性评分) 基因表达数据 74种疾病/性状,130万个单细胞基因表达谱,涵盖31个组织/器官 NA 单细胞RNA测序 NA NA
12 2026-04-08
Elevated pentose phosphate pathway flux supports appendage regeneration
2022-10-25, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本文通过多模态方法研究了非洲爪蟾附肢再生过程中的代谢重编程,发现再生组织通过增强戊糖磷酸途径(PPP)通量来支持细胞增殖和再生 揭示了再生过程中葡萄糖代谢从糖酵解转向戊糖磷酸途径(PPP)的关键代谢重编程机制,并利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)证实了高增殖细胞中PPP酶转录上调 研究主要基于非洲爪蟾模型,结果在哺乳动物或人类中的普适性尚需验证,且未深入探讨PPP调控的具体分子机制 探究再生过程中支持快速组织生长的代谢途径 非洲爪蟾(Xenopus tropicalis)的附肢再生组织 代谢组学与再生生物学 NA 液相色谱-质谱联用(LC-MS)代谢物分析,单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 代谢物数据,单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
13 2026-04-03
Lipopolysaccharide distinctively alters human microglia transcriptomes to resemble microglia from Alzheimer's disease mouse models
2022-10-01, Disease models & mechanisms IF:4.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序,比较了脂多糖(LPS)等免疫刺激对人类诱导多能干细胞来源的小胶质细胞转录组的影响,并发现LPS+IFN-γ刺激能使其转录组特征更接近阿尔茨海默病(AD)小鼠模型中的小胶质细胞 首次系统比较了不同免疫刺激(包括LPS、IFN-γ和ATPγS)对人类iPSC来源小胶质细胞转录组的时序影响,并发现LPS+IFN-γ组合能特异性地诱导其转录组变化与AD小鼠模型中的小胶质细胞特征相似 研究主要基于体外培养的iPSC来源小胶质细胞模型,可能无法完全模拟体内复杂微环境;且仅分析了24小时和48小时两个时间点,缺乏更长期的动态观察 探究不同免疫刺激对人类iPSC来源小胶质细胞转录组的影响,并评估其与阿尔茨海默病病理的相关性 人类诱导多能干细胞(iPSC)来源的小胶质细胞 单细胞转录组学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量,但涉及多个处理组(PGE2、LPS+IFN-γ、ATPγS单独或组合处理)在两个时间点(24小时和48小时)的转录组分析 NA 单细胞RNA-seq NA NA
14 2026-03-02
SARS-CoV-2 infection of human pluripotent stem cell-derived liver organoids reveals potential mechanisms of liver pathology
2022-Oct-21, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究利用人诱导多能干细胞衍生的肝脏类器官模拟SARS-CoV-2感染,揭示了病毒感染导致的肝脏病理机制 首次使用人诱导多能干细胞衍生的肝脏类器官模型研究SARS-CoV-2感染对肝脏的影响,并结合单细胞测序技术揭示了感染细胞与未感染旁观者细胞的转录组变化 研究基于体外类器官模型,可能无法完全模拟体内复杂的肝脏微环境 探究SARS-CoV-2感染导致肝脏病理的潜在分子机制 人诱导多能干细胞衍生的肝脏类器官 单细胞组学 COVID-19 单细胞测序 类器官模型 转录组数据 未明确 NA 单细胞RNA-seq NA NA
15 2026-03-02
Erythroblastic islands foster granulopoiesis in parallel to terminal erythropoiesis
2022-10-06, Blood IF:21.0Q1
研究论文 本研究通过多光谱成像流式细胞术、体外岛重构和单细胞RNA测序,揭示了小鼠骨髓中红系母细胞岛(EBI)不仅是红系终末分化的场所,还支持粒系终末分化,并展示了其巨噬细胞亚群的异质性 首次证明红系母细胞岛(EBI)同时作为红系和粒系终末分化的双重微环境,并揭示了巨噬细胞亚群在病理生理状态下的动态调控机制 研究主要基于小鼠模型,结果在人类中的适用性需进一步验证;单细胞测序样本量有限,可能未完全覆盖所有细胞亚群 探究骨髓中红系母细胞岛(EBI)的精确组成及其在造血微环境中的功能 成年小鼠骨髓中的红系母细胞岛组分细胞,包括巨噬细胞、红系前体细胞和中性粒细胞前体细胞 数字病理学 NA 多光谱成像流式细胞术、体外岛重构、单细胞RNA测序、细胞转录组和表位测序索引 NA 图像、单细胞转录组数据 成年小鼠骨髓样本,通过梯度沉降富集EBI组分细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
16 2025-11-29
Checkpoint Blockade-Induced Dermatitis and Colitis Are Dominated by Tissue-Resident Memory T Cells and Th1/Tc1 Cytokines
2022-10-04, Cancer immunology research IF:8.1Q1
研究论文 本研究通过多参数免疫荧光、空间转录组学和RNA原位杂交技术分析免疫检查点抑制剂引发的皮炎和结肠炎患者组织 首次揭示免疫检查点阻断相关不良反应主要由组织驻留记忆T细胞和Th1/Tc1细胞因子主导,而非传统认为的Th17通路 样本量有限,仅分析了皮炎和结肠炎两种不良反应类型 阐明免疫检查点抑制剂相关不良反应的免疫学机制 免疫检查点抑制剂治疗引发皮炎和结肠炎的患者组织样本 空间转录组学 皮肤炎症和结肠炎 多参数免疫荧光、空间转录组学、RNA原位杂交 NA 组织图像、基因表达数据 未明确说明具体样本数量 NA 空间转录组学 NA NA
17 2025-10-06
Single-Cell RNA-Seq Identifies Dynamic Cardiac Transition Program from ADCs Induced by Leukemia Inhibitory Factor
2022-10-21, Stem cells (Dayton, Ohio)
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示白血病抑制因子诱导的脂肪来源细胞向心脏细胞转变的动态过程 首次在单细胞分辨率下解析ADC向心脏细胞转变的异质性和细胞动力学,发现Nrf2信号通路的瞬时变化是心肌生成起始的关键 研究主要关注LIF诱导的转变过程,其他因子可能的影响尚未探索 探究脂肪来源细胞向心脏细胞转变的机制和细胞异质性 脂肪来源细胞(ADCs)及其向心脏细胞的转变过程 单细胞生物学 心血管疾病 单细胞RNA测序 伪时间分析 单细胞转录组数据 39,432个单细胞转录组 NA 单细胞RNA-seq NA NA
18 2025-10-06
Deterministic programming of human pluripotent stem cells into microglia facilitates studying their role in health and disease
2022-10-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 开发了一种从人类多能干细胞确定性编程为小胶质细胞的方法,用于研究其在健康和疾病中的作用 通过瞬时过表达PU.1和C/EBPβ转录因子,可在16天内从hPSCs获得同质的成熟小胶质细胞群 NA 建立可扩展的人类小胶质细胞来源,研究其在神经系统健康和疾病中的功能 人类多能干细胞(hPSCs)、小胶质样细胞(MGLs)、皮质神经元、脑类器官 干细胞生物学 神经退行性疾病 单细胞RNA测序、细胞编程、共培养系统 NA 转录组数据、形态学数据、功能数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
19 2025-10-06
Loss of non-motor kinesin KIF26A causes congenital brain malformations via dysregulated neuronal migration and axonal growth as well as apoptosis
2022-10-24, Developmental cell IF:10.7Q1
研究论文 本研究揭示了非运动驱动蛋白KIF26A功能丧失通过调节神经元迁移、轴突生长和细胞凋亡导致先天性脑畸形的机制 首次在人类患者中鉴定KIF26A双等位基因功能丧失变异与先天性脑畸形的关联,并利用小鼠和iPSC来源的类器官模型阐明其致病机制 研究主要聚焦于兴奋性神经元,对其他神经元类型的影响尚未充分探索 探究KIF26A在脑发育中的功能及其变异导致先天性脑畸形的分子机制 KIF26A基因变异患者、小鼠模型、人iPSC来源的脑类器官 神经科学 先天性脑畸形 单细胞RNA测序、iPSC类器官培养、基因敲除 基因敲除模型 基因表达数据、形态学数据 患者队列、小鼠模型、人iPSC类器官 NA 单细胞RNA测序 NA NA
20 2025-10-06
Lymphatic migration of unconventional T cells promotes site-specific immunity in distinct lymph nodes
2022-10-11, Immunity IF:25.5Q1
研究论文 本研究揭示了非常规T细胞通过淋巴管迁移至局部引流淋巴结并塑造部位特异性免疫的机制 首次证明组织源性非常规T细胞通过淋巴途径迁移至引流淋巴结,并形成具有组织特异性的免疫反应单元 研究主要基于小鼠模型,人类中的适用性需要进一步验证 探究非常规T细胞在淋巴结部位特异性免疫形成中的作用机制 非常规T细胞和淋巴结免疫微环境 免疫学 NA 单细胞RNA测序, 光谱流式细胞术, 光标记转基因小鼠模型 NA 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
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