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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-11-29 |
Checkpoint Blockade-Induced Dermatitis and Colitis Are Dominated by Tissue-Resident Memory T Cells and Th1/Tc1 Cytokines
2022-10-04, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0362
PMID:35977003
|
研究论文 | 本研究通过多参数免疫荧光、空间转录组学和RNA原位杂交技术分析免疫检查点抑制剂引发的皮炎和结肠炎患者组织 | 首次揭示免疫检查点阻断相关不良反应主要由组织驻留记忆T细胞和Th1/Tc1细胞因子主导,而非传统认为的Th17通路 | 样本量有限,仅分析了皮炎和结肠炎两种不良反应类型 | 阐明免疫检查点抑制剂相关不良反应的免疫学机制 | 免疫检查点抑制剂治疗引发皮炎和结肠炎的患者组织样本 | 空间转录组学 | 皮肤炎症和结肠炎 | 多参数免疫荧光、空间转录组学、RNA原位杂交 | NA | 组织图像、基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA-Seq Identifies Dynamic Cardiac Transition Program from ADCs Induced by Leukemia Inhibitory Factor
2022-10-21, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxac048
PMID:35896368
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示白血病抑制因子诱导的脂肪来源细胞向心脏细胞转变的动态过程 | 首次在单细胞分辨率下解析ADC向心脏细胞转变的异质性和细胞动力学,发现Nrf2信号通路的瞬时变化是心肌生成起始的关键 | 研究主要关注LIF诱导的转变过程,其他因子可能的影响尚未探索 | 探究脂肪来源细胞向心脏细胞转变的机制和细胞异质性 | 脂肪来源细胞(ADCs)及其向心脏细胞的转变过程 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | 39,432个单细胞转录组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2025-10-06 |
Aging compromises human islet beta cell function and identity by decreasing transcription factor activity and inducing ER stress
2022-Oct-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abo3932
PMID:36197983
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了衰老导致人类胰岛β细胞功能衰退和身份特征改变的分子机制 | 首次系统揭示衰老过程中β细胞转录因子网络重组、内质网应激激活与细胞功能衰退的关联机制 | 研究主要基于观察性数据,需要进一步实验验证因果关系 | 探究衰老对人类胰岛β细胞功能和分子特征的影响 | 非糖尿病供体的胰岛β细胞 | 单细胞生物学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序, 转录因子调控网络分析, 高分辨率共聚焦显微镜, 胰岛素分泌检测 | NA | 单细胞转录组数据, 显微镜图像, 生理功能数据 | 覆盖人类大部分生命周期的非糖尿病供体样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2025-10-06 |
Deterministic programming of human pluripotent stem cells into microglia facilitates studying their role in health and disease
2022-10-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2123476119
PMID:36251998
|
研究论文 | 开发了一种从人类多能干细胞确定性编程为小胶质细胞的方法,用于研究其在健康和疾病中的作用 | 通过瞬时过表达PU.1和C/EBPβ转录因子,可在16天内从hPSCs获得同质的成熟小胶质细胞群 | NA | 建立可扩展的人类小胶质细胞来源,研究其在神经系统健康和疾病中的功能 | 人类多能干细胞(hPSCs)、小胶质样细胞(MGLs)、皮质神经元、脑类器官 | 干细胞生物学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序、细胞编程、共培养系统 | NA | 转录组数据、形态学数据、功能数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2025-10-06 |
Loss of non-motor kinesin KIF26A causes congenital brain malformations via dysregulated neuronal migration and axonal growth as well as apoptosis
2022-10-24, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.09.011
PMID:36228617
|
研究论文 | 本研究揭示了非运动驱动蛋白KIF26A功能丧失通过调节神经元迁移、轴突生长和细胞凋亡导致先天性脑畸形的机制 | 首次在人类患者中鉴定KIF26A双等位基因功能丧失变异与先天性脑畸形的关联,并利用小鼠和iPSC来源的类器官模型阐明其致病机制 | 研究主要聚焦于兴奋性神经元,对其他神经元类型的影响尚未充分探索 | 探究KIF26A在脑发育中的功能及其变异导致先天性脑畸形的分子机制 | KIF26A基因变异患者、小鼠模型、人iPSC来源的脑类器官 | 神经科学 | 先天性脑畸形 | 单细胞RNA测序、iPSC类器官培养、基因敲除 | 基因敲除模型 | 基因表达数据、形态学数据 | 患者队列、小鼠模型、人iPSC类器官 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2025-10-06 |
Lymphatic migration of unconventional T cells promotes site-specific immunity in distinct lymph nodes
2022-10-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2022.07.019
PMID:36002023
|
研究论文 | 本研究揭示了非常规T细胞通过淋巴管迁移至局部引流淋巴结并塑造部位特异性免疫的机制 | 首次证明组织源性非常规T细胞通过淋巴途径迁移至引流淋巴结,并形成具有组织特异性的免疫反应单元 | 研究主要基于小鼠模型,人类中的适用性需要进一步验证 | 探究非常规T细胞在淋巴结部位特异性免疫形成中的作用机制 | 非常规T细胞和淋巴结免疫微环境 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序, 光谱流式细胞术, 光标记转基因小鼠模型 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2025-10-06 |
Mouse embryo model derived exclusively from embryonic stem cells undergoes neurulation and heart development
2022-10-06, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2022.08.013
PMID:36084657
|
研究论文 | 开发了一种完全由胚胎干细胞构建的小鼠胚胎模型,能够实现神经管形成和心脏发育 | 首次通过转录因子介导的诱导,建立了能够重建着床后胚胎多能性ESC谱系和两个胚外谱系的统一模型 | 模型在某些方面与自然胚胎程序存在差异 | 开发能够更全面模拟小鼠胚胎发育的体外模型 | 小鼠胚胎干细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2025-10-06 |
Polygenic enrichment distinguishes disease associations of individual cells in single-cell RNA-seq data
2022-10, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01167-z
PMID:36050550
|
研究论文 | 提出单细胞疾病相关性评分方法,将单细胞RNA测序数据与多基因疾病风险在单细胞分辨率下关联 | 开发了独立于细胞类型注释的单细胞疾病相关性评分方法,能够识别GWAS疾病相关基因过度表达的单个细胞 | NA | 建立单细胞RNA测序数据与多基因疾病风险的关联分析方法 | 74种疾病/性状和130万个单细胞基因表达谱,涵盖31个组织/器官 | 单细胞基因组学 | 炎症性肠病,精神分裂症,代谢疾病 | 单细胞RNA测序,全基因组关联研究 | scDRS | 单细胞基因表达数据 | 130万个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2025-10-06 |
Lipopolysaccharide distinctively alters human microglia transcriptomes to resemble microglia from Alzheimer's disease mouse models
2022-10-01, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.049349
PMID:36254682
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序比较了不同刺激条件下人iPSC来源小胶质细胞的转录组变化,发现LPS+IFN-γ处理能使其转录组特征更接近阿尔茨海默病小鼠模型中的小胶质细胞 | 首次系统比较了不同免疫刺激对人iPSC来源小胶质细胞转录组的影响,并发现LPS能特异性诱导其转录组特征向AD小鼠模型小胶质细胞转变 | 研究仅观察了24小时和48小时两个时间点的转录组变化,未涉及更长期的效应 | 探究不同免疫刺激对人iPSC来源小胶质细胞转录组的影响及其与阿尔茨海默病的相关性 | 人诱导多能干细胞来源的小胶质细胞 | 单细胞转录组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2025-10-06 |
A cellular hierarchy in melanoma uncouples growth and metastasis
2022-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-05242-7
PMID:36131018
|
研究论文 | 本研究通过整合多种技术揭示了黑色素瘤中生长与转移由不同细胞群体支持的细胞层级模型 | 发现了黑色素瘤中生长能力与转移能力分别由不同细胞群体承担,且这些表型能力可通过特定微环境信号动态获得 | 研究主要基于小鼠模型,人类黑色素瘤中的适用性需要进一步验证 | 探索黑色素瘤细胞状态多样性的起源以及生长与转移的细胞基础 | 黑色素瘤细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组学,空间转录组学,谱系追踪,定量建模 | 层级模型 | 单细胞基因表达数据,空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 11 | 2025-10-07 |
Spatiotemporal transcriptomics reveals pathogenesis of viral myocarditis
2022-Oct, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-022-00138-1
PMID:36970396
|
研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组学技术,构建了新生小鼠病毒性心肌炎的高分辨率时空转录组图谱 | 首次创建了呼肠孤病毒诱导心肌炎的高分辨率时空转录组图谱,揭示了心肌炎区域和边界区的空间限制性基因表达模式 | 研究仅限于新生小鼠模型,未在人类样本中验证 | 揭示病毒性心肌炎的发病机制 | 新生小鼠心脏组织和肠道组织 | 空间转录组学 | 病毒性心肌炎 | 单细胞转录组测序, 空间转录组测序 | NA | 转录组数据 | 感染后三个时间点收集的小鼠心脏和肠道样本 | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 12 | 2025-10-07 |
Venus: An efficient virus infection detection and fusion site discovery method using single-cell and bulk RNA-seq data
2022-10, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1010636
PMID:36301997
|
研究论文 | 开发了一种名为Venus的高效计算方法,用于检测病毒感染并发现病毒整合位点 | 提出首个能够同时处理单细胞和批量组织RNA-seq数据的病毒检测与整合位点发现流程 | NA | 开发高效的病毒检测和整合位点发现计算方法 | 病毒感染的组织/细胞类型 | 生物信息学 | 病毒感染 | RNA-seq | 计算流程 | RNA-seq数据 | 多种病毒数据集(HBV-肝细胞癌、HIV感染等) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2025-10-07 |
Opposing roles of hepatic stellate cell subpopulations in hepatocarcinogenesis
2022-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-05289-6
PMID:36198802
|
研究论文 | 本研究揭示了肝星状细胞不同亚群在肝癌发生中的双重作用机制 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定肝星状细胞亚群,并发现其从肝癌保护向促进的动态转换机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证仍需进一步扩展 | 探究肝星状细胞在肝细胞癌发生发展过程中的功能作用 | 肝星状细胞亚群及其与肝细胞的相互作用 | 单细胞生物学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,遗传消融技术 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型和人类肝星状细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2025-10-07 |
Severe COVID-19 is associated with fungal colonization of the nasopharynx and potent induction of IL-17 responses in the nasal epithelium
2022-Oct-26, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2022.10.25.22281528
PMID:36324802
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现重症COVID-19与鼻咽部真菌定植及鼻腔上皮IL-17反应增强相关 | 首次在单细胞水平揭示重症COVID-19患者鼻咽部真菌定植与IL-17免疫应答的关联 | 样本量有限,真菌检测方法可能存在灵敏度限制 | 探讨COVID-19严重程度与呼吸道真菌定植及局部免疫应答的关系 | COVID-19患者的鼻咽部和气管样本 | 单细胞转录组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 先前研究队列的子集(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2025-10-07 |
CD34+ cell atlas of main organs implicates its impact on fibrosis
2022-Oct-31, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-022-04606-6
PMID:36315271
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和遗传谱系追踪揭示CD34+细胞在生理和病理条件下的异质性及其在血管生成和器官纤维化中的作用 | 首次系统描绘CD34+细胞在不同器官中的细胞图谱,并发现表达Pi16的CD34+细胞可转化为肌成纤维细胞参与器官纤维化 | 研究主要基于小鼠模型,在人类中的适用性需要进一步验证 | 阐明CD34+细胞在生理和病理条件下的身份和功能 | CD34+细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 遗传谱系追踪 | 遗传谱系追踪小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2025-10-07 |
Integrative insights and clinical applications of single-cell sequencing in cancer immunotherapy
2022-Oct-31, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-022-04608-4
PMID:36316529
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综述 | 概述单细胞测序技术在癌症免疫治疗中的整合见解与临床应用进展 | 系统阐述单细胞测序如何揭示肿瘤微环境复杂性及推动个体化免疫治疗方案开发 | 单细胞技术的临床转化研究尚不深入,尤其在免疫治疗应用方面仍需突破 | 探讨单细胞测序技术对癌症免疫治疗的机制解析和临床指导价值 | 肿瘤微环境中的细胞异质性、细胞组成与相互作用、肿瘤耐药机制 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 基因组、转录组、表观基因组、蛋白质组、多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 17 | 2025-10-07 |
SK3 in POMC neurons plays a sexually dimorphic role in energy and glucose homeostasis
2022-Oct-09, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-022-00907-2
PMID:36210455
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研究论文 | 本研究揭示了POMC神经元中SK3通道在能量和葡萄糖稳态中具有性别二态性作用 | 首次发现SK3在POMC神经元中对能量和葡萄糖稳态的调控存在性别差异,且与体重控制无关 | 研究仅限于小鼠模型,具体分子机制尚未完全阐明 | 探究POMC神经元中SK3通道在能量和葡萄糖稳态中的性别二态性作用 | 小鼠POMC神经元 | 神经科学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序,Cre-loxP基因敲除技术,电生理记录 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,电生理数据,行为学数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2025-10-07 |
Systematic Comparison of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma Models Identifies a Conserved Highly Plastic Basal Cell State
2022-Oct-04, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-1742
PMID:35952360
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研究论文 | 通过单细胞基因组学系统比较胰腺导管腺癌模型,发现了一个高度可塑性的保守基底细胞状态 | 首次系统比较不同生长条件下PDAC肿瘤细胞的异质性,发现原位移植能恢复肿瘤异质性并鉴定出具有上皮-间质基因共表达特征的高度可塑性基底细胞状态 | 研究主要基于模型系统,需要进一步验证在人类患者中的临床相关性 | 理解胰腺导管腺癌中细胞异质性和可塑性的机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)肿瘤细胞 | 单细胞基因组学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组测序,谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据 | 多种体外和体内生长条件下的PDAC模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 19 | 2025-10-07 |
Single-cell atlas of multilineage cardiac organoids derived from human induced pluripotent stem cells
2022-Oct, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnac002
PMID:39871934
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析解析人多能干细胞来源的多谱系心脏类器官的发育过程 | 首次建立包含心肌细胞、内皮细胞和平滑肌细胞的多谱系心脏类器官模型,并揭示3D微环境促进心肌细胞成熟的分子机制 | 研究主要基于体外类器官模型,在体验证仅使用大鼠心肌梗死模型 | 探索人多能干细胞来源心脏类器官的发育机制及其在心脏修复中的应用 | 人诱导多能干细胞来源的多谱系心脏类器官 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2024-10-12 |
Single-cell spatial transcriptomics reveals a dynamic control of metabolic zonation and liver regeneration by endothelial cell Wnt2 and Wnt9b
2022-10-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2022.100754
PMID:36220068
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研究论文 | 研究揭示了内皮细胞Wnt2和Wnt9b在肝区带形成和再生中的动态调控作用 | 首次明确内皮细胞Wnt2和Wnt9b在肝区带形成和再生中的关键作用,并展示了Wnt激活剂作为急性肝衰竭再生疗法的潜力 | NA | 探讨Wnt2和Wnt9b在肝区带形成和再生中的作用 | 内皮细胞Wnt2和Wnt9b在肝区带形成和再生中的调控机制 | NA | NA | 单细胞分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |