单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 277 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2024-08-08 |
Boosting single-cell gene regulatory network reconstruction via bulk-cell transcriptomic data
2022-09-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac389
PMID:36070863
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研究论文 | 本文探讨了利用大量细胞的转录组数据来辅助单细胞基因调控网络（GRN）重建的可能性 | 提出了一种基于轴向变换器的弱监督学习框架，结合单细胞和大量细胞数据来推断细胞类型特异性的GRN，并展示了其在阿尔茨海默病风险基因的转录因子识别和潜在调控方面的应用 | NA | 研究如何利用大量细胞数据来提高单细胞GRN预测的准确性 | 单细胞和大量细胞的基因调控网络 | 基因组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 轴向变换器 | 转录组数据 | 未具体说明 |
| 162 | 2024-08-08 |
SCDD: a novel single-cell RNA-seq imputation method with diffusion and denoising
2022-09-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac398
PMID:36070866
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研究论文 | 本文提出了一种新的单细胞RNA测序插补方法SCDD，结合扩散和去噪技术，以解决单细胞RNA测序数据分析中的过平滑问题 | SCDD方法通过扩散策略进行初步插补，并结合图卷积神经网络和收缩自编码器进行去噪，有效抑制了过平滑问题 | NA | 解决单细胞RNA测序数据插补中的过平滑问题，提高下游分析效果 | 单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图卷积神经网络，收缩自编码器 | RNA测序数据 | 大规模单细胞 |
| 163 | 2024-08-08 |
CD8 memory precursor cell generation is a continuous process
2022-Sep-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104927
PMID:36065187
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研究论文 | 本研究通过分析急性感染后扩增阶段的单细胞RNA测序数据，研究了记忆前体细胞的生成过程，特别是CD8 T细胞的发育轨迹。 | 发现记忆前体细胞是连续生成的，并且随着时间的推移数量逐渐增加，同时在后期时间点，与效应功能相关的基因表达也在记忆前体细胞中升高。 | NA | 研究记忆前体细胞的生成过程及其动态变化。 | CD8 T细胞的记忆前体细胞生成过程。 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 包含CD8 T细胞的单细胞RNA测序数据 |
| 164 | 2024-08-08 |
Protocol for the isolation of CD8+ tumor-infiltrating lymphocytes from human tumors and their characterization by single-cell immune profiling and multiome
2022-09-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101649
PMID:36065294
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研究论文 | 本文介绍了一种从人类肿瘤中分离CD8+肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）并进行单细胞免疫谱和多组学分析的协议 | 本文建立了一种新的协议，通过单细胞RNA测序与VDJ分析和染色质结构分析相结合，用于肿瘤中CD8 TILs的特征描述 | NA | 理解肿瘤浸润淋巴细胞群体的异质性和人类癌症中的免疫生物学，以建立有效的免疫疗法 | 人类肿瘤中的CD8+肿瘤浸润淋巴细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序，VDJ分析，染色质结构分析 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 165 | 2024-08-08 |
Whole-genome CRISPR screening identifies genetic manipulations to reduce immune rejection of stem cell-derived islets
2022-09-13, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2022.08.002
PMID:36055241
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研究论文 | 本研究通过全基因组CRISPR筛选，识别出减少干细胞衍生胰岛免疫排斥的遗传操作 | 首次通过单细胞RNA测序和全基因组CRISPR筛选，揭示了干细胞衍生胰岛在免疫环境中的免疫原性机制，并找到了通过基因编辑减少免疫排斥的方法 | 研究主要在人源化小鼠模型中进行，需要进一步在临床前模型中验证 | 旨在通过遗传修饰减少干细胞衍生胰岛的免疫排斥，以实现胰岛素依赖型糖尿病的细胞替代治疗 | 人类胚胎干细胞衍生的胰岛（SC-islets）及其在免疫环境中的免疫原性 | 基因编辑 | 糖尿病 | CRISPR筛选，单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据，RNA序列数据 | 涉及干细胞衍生胰岛与异基因外周血单个核细胞（PBMCs）的相互作用 |
| 166 | 2024-08-08 |
Induction of a colitogenic phenotype in Th1-like cells depends on interleukin-23 receptor signaling
2022-09-13, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2022.08.007
PMID:36070768
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研究论文 | 本研究探讨了白细胞介素-23受体（IL-23R）在Th1样细胞中诱导结肠炎表型的作用 | 首次揭示了IL-23R在Th1样细胞中的作用，并证明了IL-23R信号传导是Th1样细胞诱导组织炎症的致病驱动因素 | NA | 研究IL-23R在Th1样细胞中诱导炎症和自身免疫的作用 | Th1样细胞和IL-23R | 免疫学 | 结肠炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用eGFP报告小鼠和T细胞适应性转移结肠炎模型进行体内外研究 |
| 167 | 2024-08-08 |
Clinical application of advanced multi-omics tumor profiling: Shaping precision oncology of the future
2022-09-12, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2022.08.011
PMID:36055231
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综述 | 本文综述了多组学肿瘤分析的最新进展，重点关注空间基因组学、染色质组织、空间转录组学和蛋白质组学、液体活检以及体外药物反应建模 | 介绍了通过下一代DNA测序技术识别治疗靶点和分子生物标志物，以及多组学数据在精准治疗中的整合 | 高分辨率肿瘤分析和多组学数据整合在精准治疗中的临床转化和实施面临重大挑战 | 总结多组学肿瘤分析的最新进展，并探讨其在未来精准治疗中的应用前景 | 多组学肿瘤分析技术及其在精准治疗中的应用 | NA | NA | 下一代DNA测序技术 | NA | 多组学数据 | NA |
| 168 | 2024-08-08 |
Injury-induced pulmonary tuft cells are heterogenous, arise independent of key Type 2 cytokines, and are dispensable for dysplastic repair
2022-09-08, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.78074
PMID:36073526
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研究论文 | 本文通过批量和单细胞转录组学技术，研究了流感损伤后肺部畸胎区域的毛细胞的多样性和发展机制 | 发现了肺部毛细胞的发展不依赖于关键的2型细胞因子信号，与肠道毛细胞的发展机制不同 | 文章未详细探讨毛细胞在肺部健康和疾病中的具体功能 | 揭示肺部毛细胞在肺损伤后的多样性和发展机制 | 肺部毛细胞及其在肺损伤后的发展 | NA | 肺部疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及流感损伤和博来霉素损伤的肺部样本 |
| 169 | 2024-08-08 |
Beiging of perivascular adipose tissue regulates its inflammation and vascular remodeling
2022-09-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-32658-6
PMID:36071032
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研究论文 | 研究显示血管损伤诱导周围血管脂肪组织（PVAT）发生棕色脂肪样表型变化（beiging），这种变化精细调控炎症反应，从而作为保护机制影响血管重塑 | 首次揭示了PVAT的beiging现象在血管炎症和重塑中的关键作用，并发现NRG4在beige脂肪细胞中的表达调控巨噬细胞的替代激活 | NA | 探讨PVAT在血管炎症和重塑中的作用机制 | 周围血管脂肪组织（PVAT）及其在血管损伤后的炎症和重塑反应 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用小鼠模型和急性主动脉夹层患者的人体组织样本 |
| 170 | 2024-08-08 |
Long read genome assemblies complemented by single cell RNA-sequencing reveal genetic and cellular mechanisms underlying the adaptive evolution of yak
2022-09-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-32164-9
PMID:36068211
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研究论文 | 本研究通过长读取基因组组装和单细胞RNA测序，揭示了野牦牛和家牦牛适应高海拔环境的遗传和细胞机制 | 首次构建了牦牛和牛肺组织的单细胞基因表达图谱，并识别了牦牛特有的内皮细胞亚型 | NA | 探究牦牛适应极端高海拔环境的遗传和细胞基础 | 野牦牛和家牦牛的基因组和肺组织 | 基因组学 | NA | 长读取测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 两个野牦牛和家牦牛的染色体级别基因组，以及牦牛和牛的肺组织样本 |
| 171 | 2024-08-08 |
Identification of HBEGF+ fibroblasts in the remission of rheumatoid arthritis by integrating single-cell RNA sequencing datasets and bulk RNA sequencing datasets
2022-09-06, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-022-02902-x
PMID:36068607
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研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序数据集和批量RNA测序数据集，识别出在类风湿性关节炎缓解期起作用的HBEGF+成纤维细胞。 | 首次描述了特定成纤维细胞亚群在类风湿性关节炎缓解期的贡献，并发现HBEGF+成纤维细胞在关节炎缓解中的作用。 | NA | 探讨成纤维细胞亚群在类风湿性关节炎过程中的作用，为预测生物标志物和阐明关节炎缓解机制提供依据。 | 类风湿性关节炎患者的成纤维细胞及其在关节炎缓解中的作用。 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（bulk RNA-seq） | NA | RNA序列数据 | 三个来自类风湿性关节炎患者的单细胞RNA数据集，以及不同条件下（健康、骨关节炎、类风湿性关节炎、治疗前后）的批量RNA测序数据集。 |
| 172 | 2024-08-08 |
Landscape and age dynamics of immune cells in the Egyptian rousette bat
2022-09-06, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111305
PMID:36070695
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和免疫染色技术，研究了埃及果蝠在不同年龄阶段的免疫细胞景观及其年龄动态变化 | 首次深入研究了埃及果蝠的细胞免疫特征及其与年龄的关系，揭示了不同年龄阶段免疫细胞的分布和功能变化 | NA | 探索埃及果蝠免疫细胞的年龄动态及其对病毒的耐受机制 | 埃及果蝠的免疫细胞及其在不同年龄阶段的变化 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 幼年、亚成年和成年阶段的埃及果蝠 |
| 173 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq data analysis characterizing bronchoalveolar epithelial cells in patients with SARS-CoV-2 infection
2022-Sep-05, Journal of inflammation (London, England)
DOI:10.1186/s12950-022-00310-1
PMID:36064702
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了SARS-CoV-2感染患者的支气管肺泡上皮细胞变化及其与免疫细胞的相互作用 | 首次详细描述了SARS-CoV-2感染后支气管肺泡上皮细胞的11个集群及其与免疫细胞的信号通路和相互作用 | 研究仅限于特定细胞类型和样本，可能需要更多样本和细胞类型以验证结果 | 探究SARS-CoV-2感染后支气管肺泡上皮细胞的变化及其与免疫细胞的相互作用 | SARS-CoV-2感染患者的支气管肺泡上皮细胞及其与免疫细胞的相互作用 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 不同严重程度的SARS-CoV-2感染患者和健康人的支气管肺泡灌洗液样本 |
| 174 | 2024-08-08 |
Msx1+ stem cells recruited by bioactive tissue engineering graft for bone regeneration
2022-09-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-32868-y
PMID:36064711
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研究论文 | 本研究展示了神经营养补充剂在体外促进间充质基质细胞的强大扩增，并通过体内移植含有神经营养补充剂的3D打印水凝胶移植物，促进了关键大小骨缺损的全层再生 | 研究发现了在颅骨愈合过程中生成的一种独特的体内干细胞/祖细胞图谱，并观察到移植后的局部Msx1+骨骼干细胞的扩增 | NA | 研究旨在解决关键大小骨缺损的再生问题 | 间充质基质细胞和Msx1+骨骼干细胞 | 生物工程 | 骨骼疾病 | 3D打印 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 175 | 2024-08-08 |
Endothelial versus pronephron fate decision is modulated by the transcription factors Cloche/Npas4l, Tal1, and Lmo2
2022-Sep-02, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abn2082
PMID:36044573
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研究论文 | 本文研究了转录因子Npas4l、Tal1和Lmo2在调节内皮细胞与前肾小管细胞命运决定中的作用 | 通过生成敲入报告基因的斑马鱼模型，揭示了Npas4l/Tal1/Lmo2在早期侧板中胚层中调控内皮细胞与前肾小管细胞命运决定的机制 | NA | 探究内皮细胞与其他细胞系分离的机制及其调控因子 | 斑马鱼胚胎中的内皮前体细胞及其衍生物 | NA | NA | 单细胞转录组学、活体成像、creERT2基于的谱系追踪 | NA | 基因表达数据 | 野生型和突变型斑马鱼胚胎 |
| 176 | 2024-08-08 |
Autoreactive napsin A-specific T cells are enriched in lung tumors and inflammatory lung lesions during immune checkpoint blockade
2022-09-02, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abn9644
PMID:36054337
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研究论文 | 本文通过DITAS方法识别与非小细胞肺癌(NSCLC)相关的自身抗原，特别是napsin A，并探讨其在免疫检查点阻断(ICB)治疗中的作用 | 首次描述了DITAS方法用于识别肿瘤相关自身抗原，并验证了napsin A作为NSCLC中的自身抗原，其在ICB治疗中引发强烈的CD8 T细胞反应 | NA | 研究ICB治疗中肿瘤与正常细胞共表达蛋白作为自身抗原的可能性，并探讨其在NSCLC中的作用 | 非小细胞肺癌患者在接受ICB治疗后的免疫反应及自身抗原napsin A的作用 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及NSCLC患者的血液和肿瘤样本 |
| 177 | 2024-08-08 |
Embryonic and neonatal waves generate distinct populations of hepatic ILC1s
2022-09-02, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abo6641
PMID:36054340
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研究论文 | 本文通过命运图谱和单细胞转录组学研究了小鼠1组先天淋巴细胞（ILC1s）的起源和更新 | 揭示了ILC1s在胚胎和新生儿时期的不同发展波，以及它们在肝脏中的持久性和特定发育程序 | NA | 探索1组先天淋巴细胞的发育过程及其与细胞身份和功能的关系 | 小鼠的1组先天淋巴细胞（ILC1s） | NA | NA | 命运图谱和单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 178 | 2024-08-08 |
scMTD: a statistical multidimensional imputation method for single-cell RNA-seq data leveraging transcriptome dynamic information
2022-Sep-02, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-022-00886-4
PMID:36056412
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研究论文 | 本文介绍了一种基于统计模型的多维插补算法scMTD，用于恢复单细胞RNA测序数据中的基因表达水平和生物信号 | scMTD算法利用细胞水平、基因水平和转录组动态信息，通过识别局部细胞邻居和特定基因共表达网络来恢复scRNA-seq数据 | NA | 开发一种有效的插补方法，以恢复单细胞RNA测序数据中的生物信号 | 单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 统计模型 | 转录组数据 | NA |
| 179 | 2024-08-08 |
Intestinal cellular heterogeneity and disease development revealed by single-cell technology
2022-Sep-01, Cell regeneration (London, England)
DOI:10.1186/s13619-022-00127-6
PMID:36045190
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在理解肠道细胞特性、时空演变及肠道疾病发展中的应用 | 利用单细胞技术深入解析肠道上皮细胞的异质性及其在疾病发展中的作用 | NA | 探讨肠道上皮细胞的分子特性及其维持稳态的机制 | 肠道上皮细胞及其在疾病发展中的作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 分子数据 | NA |
| 180 | 2024-08-08 |
Heterogeneity and transcriptome changes of human CD8+ T cells across nine decades of life
2022-09-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-32869-x
PMID:36050300
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研究论文 | 研究分析了人类CD8+ T细胞在九个生命十年中的异质性和转录组变化 | 使用单细胞RNA测序技术，结合横断面和纵向样本，识别了十一种CD8 T细胞亚群及其随年龄变化的动态 | NA | 探究随着年龄增长，CD8 T细胞功能下降的机制 | 人类CD8+ T细胞的异质性和转录组变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 转录组数据 | 跨九个生命十年的样本 |