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当前共找到 277 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2024-08-08 |
Clustering by measuring local direction centrality for data with heterogeneous density and weak connectivity
2022-09-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-33136-9
PMID:36114209
|
研究论文 | 本文提出了一种基于局部方向中心性的边界搜索聚类算法（CDC），用于处理具有异质密度和弱连接性的数据 | CDC算法采用基于K最近邻（KNNs）分布的密度无关度量方法，区分内部点和边界点，通过边界点生成封闭笼子来绑定内部点的连接，从而防止跨集群连接并分离弱连接的集群 | NA | 提高在数据具有异质密度和弱连接性情况下的聚类效果 | 复杂结构集群、单细胞RNA测序和质谱流式细胞术数据中的细胞类型、语音语料库中的说话者识别 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、质谱流式细胞术（CyTOF） | NA | 数据集 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 142 | 2024-08-08 |
The Essential Role of the Choriocapillaris in Vision: Novel Insights from Imaging and Molecular Biology
2022-09-15, Annual review of vision science
IF:5.0Q1
|
研究论文 | 本文探讨了脉络膜毛细血管在视觉中的重要作用，以及通过成像和分子生物学技术对其功能的新见解 | 利用单细胞RNA测序、活体成像和体外细胞模型等先进技术，深入研究了脉络膜及其在正常健康和年龄相关性黄斑变性（AMD）中的作用 | NA | 旨在理解脉络膜毛细血管在正常视觉和年龄相关性黄斑变性中的作用 | 脉络膜毛细血管及其在视觉中的功能 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 143 | 2024-08-08 |
Liver group 2 innate lymphoid cells regulate blood glucose levels through IL-13 signaling and suppression of gluconeogenesis
2022-09-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-33171-6
PMID:36109558
|
研究论文 | 本文研究了肝脏中的第2组先天淋巴细胞（ILC2）通过IL-13信号传导和抑制糖异生作用调节血糖水平 | 首次详细研究了肝脏ILC2在血糖水平调节中的代谢贡献 | NA | 探讨肝脏ILC2在血糖稳态中的作用及其分子机制 | 肝脏中的第2组先天淋巴细胞（ILC2）及其在血糖调节中的作用 | NA | NA | ChIP-seq, ATAC-seq, scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 特定Hnf4a/G6pc高表达的初级肝细胞簇 | NA | NA | NA | NA |
| 144 | 2024-08-08 |
Tmsb10 triggers fetal Leydig differentiation by suppressing the RAS/ERK pathway
2022-09-15, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-03941-5
PMID:36109592
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析胎儿睾丸间质细胞前体细胞，揭示了胸腺素β10（Tmsb10）在胎儿睾丸间质细胞分化中的作用及其分子机制 | 本研究首次揭示了Tmsb10通过抑制RAS/ERK通路促进胎儿睾丸间质细胞分化的机制，并展示了DHH和PDGF在这一过程中的协同作用 | NA | 探讨胎儿睾丸间质细胞分化的分子机制 | 胎儿睾丸间质细胞及其前体细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 145 | 2024-08-08 |
Reduced cell invasion may be a characteristic of placental defects in pregnant women of advanced maternal age at single-cell level
2022 Sept 15, Journal of Zhejiang University. Science. B
DOI:10.1631/jzus.B2101024
PMID:36111571
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和体外穿透实验，探讨了高龄产妇胎盘中滋养细胞侵袭能力下降的机制 | 首次在高龄产妇胎盘中发现滋养细胞侵袭能力下降，并鉴定了与侵袭相关的差异表达基因SERPINE1 | 样本量较小，需要进一步扩大样本验证结果 | 探究高龄产妇胎盘缺陷的细胞机制 | 高龄产妇的胎盘组织和滋养细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 共分析了27,607个细胞，包括来自4名高龄产妇和对照组的胎盘组织，以及来自6名孕妇的滋养细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 146 | 2024-08-08 |
Personalized neoantigen vaccine combined with PD-1 blockade increases CD8+ tissue-resident memory T-cell infiltration in preclinical hepatocellular carcinoma models
2022-09, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-004389
PMID:36113894
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研究论文 | 本研究探讨了个性化新抗原疫苗与PD-1阻断剂联合使用在肝细胞癌模型中增加CD8+组织驻留记忆T细胞浸润的效果及其机制 | 首次详细研究了个性化新抗原疫苗与PD-1阻断剂联合使用在肝细胞癌中的协同作用及其分子机制 | NA | 开发一种临床可用的联合治疗策略，并探索其在肝细胞癌中的潜在抗肿瘤机制 | 肝细胞癌模型中的免疫反应和协同机制 | NA | 肝细胞癌 | 新抗原筛选，单细胞RNA测序，四聚体流式细胞术，免疫荧光 | NA | 单细胞RNA测序数据，流式细胞术数据，免疫荧光图像 | 使用小鼠原位肝细胞癌模型和患者来源的细胞进行研究 | NA | NA | NA | NA |
| 147 | 2024-08-08 |
SPROUT: spectral sparsification helps restore the spatial structure at single-cell resolution
2022-Sep, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqac069
PMID:36128423
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研究论文 | 本文开发了一个名为SPROUT的软件包，用于从转录组数据中重建单细胞分辨率的空间结构，通过减少伪配体-受体亲和力来实现 | SPROUT通过部分相关性、光谱图稀疏化和空间坐标细化来减少细胞间亲和矩阵中的伪亲和力，并将估计的相互作用嵌入到低维空间中，以恢复细胞间结构 | NA | 重建单细胞分辨率的空间结构 | 单细胞转录组数据中的空间结构 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 光谱图稀疏化 | 转录组数据 | 在小鼠海马体和人类器官肿瘤微环境数据集中，形状Pearson相关性范围从0.91到0.97；在人类发育心脏数据集和肿瘤微环境数据集中，细胞类型接近相关性分别为0.68和0.89 | NA | NA | NA | NA |
| 148 | 2024-08-08 |
Probabilistic boolean networks predict transcription factor targets to induce transdifferentiation
2022-Sep-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104951
PMID:36093045
|
研究论文 | 本文开发了一种计算方法，用于找到实现转录因子介导的转分化的最佳干预措施 | 本文采用概率布尔网络（PBNs）从单细胞RNA测序数据中构建模型，以模拟造血转录因子的相互作用，并使用“采样网络”方法构建大型网络 | NA | 寻找实现转录因子介导的转分化的最佳干预措施 | 转录因子和细胞状态 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 概率布尔网络（PBNs） | RNA测序数据 | 两种不同细胞状态的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 149 | 2024-08-08 |
Cell lineage specification and signalling pathway use during development of the lateral plate mesoderm and forelimb mesenchyme
2022-09-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.200702
PMID:36093878
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术，定义了鸡胚胎中侧板中胚层（LPM）的细胞命运决定及其在发育过程中的信号通路 | 本研究揭示了TWIST1在早期肢芽上皮-间充质转化中的潜在驱动作用，并定义了BMP信号在早期肢发育中的新角色 | NA | 探讨侧板中胚层（LPM）早期分化和发育的分子机制 | 鸡胚胎中的侧板中胚层（LPM）及其在肢芽发育中的作用 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 鸡胚胎中的多种细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 150 | 2024-08-08 |
Single-cell profiling reveals molecular basis of malignant phenotypes and tumor microenvironments in small bowel adenocarcinomas
2022-Sep-14, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-022-00434-x
PMID:36104333
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了12例小肠腺癌（SBA）患者的肿瘤样本，揭示了恶性细胞的分子特征及其与肿瘤微环境的相互作用，并预测了针对SBA的潜在药物候选物 | 首次揭示了小肠腺癌中四种主要恶性细胞亚型的分子特征及其进展关系，并发现了EMT特征的癌细胞亚群与高度耗竭的CD8 T细胞之间的配体-受体相互作用 | NA | 揭示小肠腺癌的分子特征及其与肿瘤微环境的相互作用，并寻找潜在的治疗靶点和药物候选物 | 小肠腺癌患者的肿瘤样本及其分子特征 | 数字病理学 | 小肠腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 12例小肠腺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 151 | 2024-08-08 |
A LILRB1 variant with a decreased ability to phosphorylate SHP-1 leads to autoimmune diseases
2022-09-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-19334-x
PMID:36104364
|
研究论文 | 本研究通过全基因组连锁研究和全外显子测序，发现并验证了一个LILRB1基因的错义变异（c.479G>A，p.G160E），该变异导致SHP-1磷酸化能力下降，与家族性自身免疫疾病相关。 | 首次将LILRB1基因与自身免疫疾病联系起来，并揭示了其通过影响SHP-1磷酸化在免疫调节中的作用。 | 研究仅基于一个家族的样本，需要更多样本验证该变异的普遍性和致病性。 | 识别导致家族性自身免疫疾病的遗传变异。 | LILRB1基因变异及其在自身免疫疾病中的作用。 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | 全基因组连锁研究，全外显子测序，流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据，RNA数据 | 一个三代家族中的9名受影响成员 | NA | NA | NA | NA |
| 152 | 2024-08-08 |
Adipocyte mesenchymal transition contributes to mammary tumor progression
2022-09-13, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111362
PMID:36103820
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研究论文 | 本文研究了肥胖与癌症进展之间的关系，特别是脂肪细胞在肿瘤侵袭性乳腺脂肪中的间充质转变及其对肿瘤微环境的影响 | 首次报道了肿瘤侵袭性乳腺脂肪中的脂肪细胞在肿瘤进展期间去分化为成纤维细胞样前体细胞，并揭示了这些去分化脂肪细胞的多能性及其在免疫反应、炎症和细胞外基质重塑中的作用 | NA | 探讨肥胖与癌症进展之间的机制联系，特别是脂肪细胞的间充质转变对肿瘤微环境的影响 | 肿瘤侵袭性乳腺脂肪中的脂肪细胞及其在肿瘤进展中的变化 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 153 | 2024-08-08 |
Biology of lung macrophages in health and disease
2022-09-13, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2022.08.010
PMID:36103853
|
综述 | 本文综述了组织驻留型和招募型肺泡及间质巨噬细胞在肺部稳态和疾病中的作用，并介绍了单细胞RNA测序和空间转录组学技术如何区分这些亚群，揭示巨噬细胞生物学的复杂性。 | 介绍了使用单细胞RNA测序和空间转录组学技术区分组织驻留型和招募型巨噬细胞的新方法。 | NA | 探讨肺部巨噬细胞在健康和疾病状态下的功能及其区分方法。 | 肺部巨噬细胞及其在不同组织状态下的功能。 | NA | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 154 | 2024-08-08 |
sciCAN: single-cell chromatin accessibility and gene expression data integration via cycle-consistent adversarial network
2022-09-12, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-022-00245-6
PMID:36089620
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为sciCAN的对抗方法，用于在无监督方式下整合单细胞染色质可及性和基因表达数据 | sciCAN方法在跨模态数据整合中表现出一致的性能，并且在模态间相互转换的平衡性上优于其他五种现有方法 | NA | 解决单细胞技术中跨模态数据整合的计算挑战 | 单细胞染色质可及性和基因表达数据 | 机器学习 | NA | scATAC-seq, scRNA-seq | GAN | 单细胞数据 | 5个scATAC-seq/scRNA-seq数据集和10X Multiome数据 | NA | NA | NA | NA |
| 155 | 2024-08-08 |
Semibulk RNA-seq analysis as a convenient method for measuring gene expression statuses in a local cellular environment
2022-09-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-19391-2
PMID:36097044
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research paper | 本文介绍了一种名为“semibulk RNA-seq”（sbRNA-seq）的新方法，该方法通过微流控设备将条形码珠和细胞聚集体（半批量）封装在单个液滴中，用于测量局部细胞环境中的基因表达状态 | sbRNA-seq方法在保持空间组织的同时，提供了一种成本低廉、高通量的应用，能够将空间信息与转录组信息关联起来 | NA | 开发一种新的方法来关联空间信息和基因表达信息，特别是在单细胞RNA测序分析中 | 小鼠肾脏样本和人类乳腺癌样本 | digital pathology | breast cancer | RNA-seq | NA | text | 小鼠肾脏样本和人类乳腺癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 156 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptomics
2022-09-12, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2022.08.021
PMID:36099884
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review | 本文讨论了空间转录组学技术在解析肿瘤微环境中的组织和细胞类型相互作用方面的应用 | 空间转录组学技术使科学家能够解析肿瘤微环境中的细胞类型组织和相互作用 | 当前技术挑战是本文讨论的一个方面 | 探讨空间转录组学技术在揭示肿瘤微环境、异质性、肿瘤演化和指导肿瘤治疗中的应用 | 肿瘤微环境中的细胞类型组织和相互作用 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 157 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals common epithelial response patterns in human acute kidney injury
2022-09-09, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-022-01108-9
PMID:36085050
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了人类急性肾损伤中上皮细胞的常见反应模式 | 首次揭示了急性肾损伤中四种不同的、层次互联的受损细胞状态，并关联了氧化应激、缺氧、干扰素反应和上皮-间充质转化等转录组模式 | 样本量较小，且主要集中在严重急性肾损伤患者 | 探究急性肾损伤的细胞机制和肾脏细胞对损伤的反应 | 严重急性肾损伤患者的肾脏组织 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单核转录组学 | NA | 基因表达数据 | 8名严重急性肾损伤患者 | NA | NA | NA | NA |
| 158 | 2024-08-08 |
Myogenesis defects in a patient-derived iPSC model of hereditary GNE myopathy
2022-Sep-09, NPJ Regenerative medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41536-022-00238-3
PMID:36085325
|
研究论文 | 本研究使用患者来源的诱导多能干细胞（iPSC）模型探讨遗传性GNE肌病的机制 | 首次使用iPSC模型重现GNE肌病的关键特征，并揭示了肌生成过程中的缺陷 | NA | 探讨GNE肌病的潜在机制 | 患者来源的iPSC及其衍生的肌肉前体细胞 | 数字病理学 | 遗传性肌肉疾病 | 单细胞RNA测序 | iPSC模型 | 细胞 | 控制组和患者特异性iPSC | NA | NA | NA | NA |
| 159 | 2024-08-08 |
Integrative and comparative single-cell analysis reveals transcriptomic difference between human tumefactive demyelinating lesion and glioma
2022-09-09, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-03900-0
PMID:36085357
|
研究论文 | 本研究通过综合和比较单细胞RNA测序分析，揭示了人类肿瘤样脱髓鞘病变与胶质瘤之间的转录组差异 | 首次在单细胞水平上比较了肿瘤样脱髓鞘病变与胶质瘤的差异，并揭示了特定细胞亚群及其在疾病中的作用 | NA | 旨在比较肿瘤样脱髓鞘病变与胶质瘤在单细胞层面的转录组差异 | 肿瘤样脱髓鞘病变和胶质瘤的细胞 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 (ScRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 160 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals dysregulation of spinal cord cell types in a severe spinal muscular atrophy mouse model
2022-09, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1010392
PMID:36074806
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了严重脊髓性肌肉萎缩症（SMA）小鼠模型中脊髓细胞类型的失调情况 | 首次揭示了SMA小鼠脊髓的单细胞图谱，并提供了对SMA发病机制的新见解 | NA | 探究SMA脊髓中在单细胞水平上的转录组改变 | SMA小鼠模型的脊髓细胞类型及其基因表达变化 | 数字病理学 | 脊髓性肌肉萎缩症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |