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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2024-08-08 |
Microenvironment components and spatially resolved single-cell transcriptome atlas of breast cancer metastatic axillary lymph nodes
2022-Sep-25, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2022131
PMID:36148946
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序(scRNA-seq)和空间转录组学,探讨了乳腺癌转移性腋窝淋巴结的转录组特征及其空间组织 | 首次在腋窝淋巴结肿瘤微环境中整合scRNA-seq和空间转录组学,提供了深入研究乳腺癌淋巴结转移的系统方法 | NA | 探讨乳腺癌细胞对淋巴结微环境成分和空间转录组图谱的影响 | 乳腺癌转移性腋窝淋巴结的转录组特征及其空间组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 六个手术切除的淋巴结样本及一个阳性淋巴结 | NA | NA | NA | NA |
| 122 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis reveals that cancer-associated fibroblasts stimulate oral squamous cell carcinoma invasion via the TGF-β/Smad pathway
2022-Sep-25, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2022132
PMID:36148955
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研究论文 | 本文通过单细胞分析揭示了癌症相关成纤维细胞(CAFs)通过TGF-β/Smad途径促进口腔鳞状细胞癌(OSCC)侵袭的机制 | 首次发现CAFs是TGF-β1的主要来源,并通过TGF-β1/Smad途径促进OSCC侵袭 | 研究仅限于14个OSCC肿瘤样本,可能无法完全代表所有OSCC病例 | 探讨CAFs与口腔鳞状细胞癌侵袭之间的关系及其分子机制 | 口腔鳞状细胞癌(OSCC)及其微环境中的癌症相关成纤维细胞(CAFs) | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 14个OSCC肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 123 | 2024-08-08 |
Correction to: Integrating spatial transcriptomics with single-cell transcriptomics reveals a spatiotemporal gene landscape of the human developing kidney
2022-Sep-25, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-022-00878-4
PMID:36155632
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 124 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA transcriptome analysis of CNS immune cells reveals CXCL16/CXCR6 as maintenance factors for tissue-resident T cells that drive synapse elimination
2022-Sep-24, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-022-01111-0
PMID:36153630
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了小鼠WNV恢复后前脑中的免疫细胞,揭示了CXCL16/CXCR6作为维持组织驻留T细胞并驱动突触消除的关键因子。 | 首次识别并验证了CXCL16/CXCR6在维持WNV特异性CD8 TRM细胞中的作用,并揭示了其在微胶质激活和持续突触消除中的重要性。 | NA | 探讨RNA病毒感染后中枢神经系统中T细胞与微胶质细胞相互作用的信号机制。 | 小鼠WNV恢复后的前脑免疫细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 125 | 2024-08-08 |
Comparative profiling of single-cell transcriptome reveals heterogeneity of tumor microenvironment between solid and acinar lung adenocarcinoma
2022-09-23, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-022-03620-3
PMID:36138435
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序数据比较分析,揭示了实体型和腺泡型肺腺癌肿瘤微环境的异质性 | 发现了实体型肺腺癌肿瘤微环境中缺氧和酸性环境最为严重,并识别出可能的治疗靶点MTHFD2 | NA | 旨在通过单细胞水平的研究,揭示不同组织学亚型肺腺癌的肿瘤微环境特征,以发现潜在的治疗靶点和联合治疗策略 | 肺腺癌的不同组织学亚型 | 数字病理学 | 肺腺癌 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 多个肺腺癌样本,包括独立免疫组化验证队列 | NA | NA | NA | NA |
| 126 | 2024-08-08 |
Chromatin organizer SATB1 controls the cell identity of CD4+ CD8+ double-positive thymocytes by regulating the activity of super-enhancers
2022-09-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-33333-6
PMID:36138028
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研究论文 | 本文探讨了染色质组织因子SATB1通过调控超级增强子的活性,控制CD4+ CD8+双阳性胸腺细胞的细胞身份 | 首次揭示了SATB1在染色质结构层面全局调控双阳性胸腺细胞超级增强子的作用,从而促进双阳性细胞身份的建立 | NA | 探索SATB1在双阳性胸腺细胞中调控基因表达的机制 | CD4+ CD8+双阳性胸腺细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序, Hi-C | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 127 | 2024-08-08 |
Integration of Bulk and Single-Cell RNA-Seq Data to Construct a Prognostic Model of Membrane Tension-Related Genes for Colon Cancer
2022-Sep-19, Vaccines
IF:5.2Q1
DOI:10.3390/vaccines10091562
PMID:36146640
|
研究论文 | 本研究通过整合批量和单细胞RNA测序数据,构建了一个基于膜张力相关基因的结肠癌预后模型 | 开发了一个新的4-MTRG标志物,用于预测结肠癌患者的临床结果,并发现TIMP1可能是结肠癌进展的敏感调节因子 | NA | 旨在从膜张力相关基因中识别结肠癌的预后标志物,并探讨其在疾病中的意义 | 结肠癌患者的预后标志物 | 数字病理学 | 结肠癌 | RNA测序 | LASSO-Cox回归 | RNA测序数据 | 从TCGA数据库获取的批量RNA测序数据,以及单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 128 | 2024-08-08 |
Drepmel-A Multi-Omics Melanoma Drug Repurposing Resource for Prioritizing Drug Combinations and Understanding Tumor Microenvironment
2022-09-16, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11182894
PMID:36139469
|
research paper | 本文开发了一个名为DRepMel的Shiny应用程序,用于基于多组学药物再利用计算方法,从两组独立患者队列的全外显子和RNA测序数据中,为黑色素瘤患者提供合理的联合治疗预测 | DRepMel不仅提供了强大的预测资源,还利用黑色素瘤患者的单细胞RNA测序数据,识别了潜在的治疗对肿瘤微环境的影响 | NA | 开发一个全面的计算资源,用于定义合理的联合治疗方案 | 黑色素瘤患者及其治疗方案 | digital pathology | 黑色素瘤 | 全外显子测序, RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 两组独立患者队列 | NA | NA | NA | NA |
| 129 | 2024-08-08 |
Understanding Mammalian Hair Follicle Ecosystems by Single-Cell RNA Sequencing
2022-Sep-14, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani12182409
PMID:36139270
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综述 | 本文综述了通过单细胞RNA测序技术在毛囊发育中主要细胞类型的研究进展,特别强调了单细胞技术发现的新毛囊亚群 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了毛囊细胞的新亚群,提供了对毛囊功能的多样化见解 | 讨论了单细胞RNA测序观察中的问题及其当前解决方案 | 重新认识各种组织和器官,特别是毛囊的细胞异质性 | 毛囊及其细胞类型 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 130 | 2024-08-08 |
Loss of Serpina1 in Mice Leads to Altered Gene Expression in Inflammatory and Metabolic Pathways
2022-Sep-09, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms231810425
PMID:36142337
|
研究论文 | 研究Serpina1基因在老鼠中的缺失对炎症和代谢途径基因表达的影响 | 首次探讨了Serpina1基因敲除对老鼠肝脏中炎症、脂质代谢和胆固醇代谢相关基因表达的影响 | 研究仅限于老鼠模型,尚未在人类中验证 | 探讨Serpina1基因敲除对肝脏基因表达的影响及其在人类治疗中的潜在应用 | Serpina1基因敲除的老鼠肝脏 | NA | 慢性肝病,慢性阻塞性肺病 | RNA测序 | NA | RNA | 年龄和性别匹配的C57BL/6野生型和Serpina1敲除老鼠,年龄8至14周 | NA | NA | NA | NA |
| 131 | 2024-08-08 |
An Innovative Approach to Tissue Processing and Cell Sorting of Fixed Cells for Subsequent Single-Cell RNA Sequencing
2022-Sep-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms231810233
PMID:36142141
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研究论文 | 本文开发了一种新的组织处理和固定细胞分选方法,用于后续的单细胞RNA测序 | 提出了一种新的组织处理和细胞固定方法,该方法兼容FACS分选和后续的单细胞RNA测序,且不影响结果质量 | 目前处理、染色和保存新鲜细胞的方法非常有限,且需要昂贵的细胞分选设备 | 开发一种方法,允许细胞在固定和储存后进行FACS分选,用于单细胞RNA测序,而不影响结果质量 | 胰腺导管腺癌样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 使用小鼠胰腺癌模型Pan02进行评估 | NA | NA | NA | NA |
| 132 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing: A cutting edge tool in molecular medical research
2022-Sep, Medical journal, Armed Forces India
DOI:10.1016/j.mjafi.2022.08.006
PMID:36147383
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在分子医学研究中的应用及其对疾病相关细胞的时空分析 | 单细胞测序技术通过分析单个细胞而非整个组织,提供了更深入的时空分析,增强了数据的精确性 | 该技术产生大量数据,需要特定的处理和定制的生物信息学分析 | 阐明健康和疾病中的细胞间遗传、表观遗传、转录组和蛋白质组异质性 | 单细胞测序技术及其在医学研究中的应用 | 分子医学 | NA | 单细胞测序 | NA | DNA序列、RNA序列、miRNA、表观遗传修饰DNA或染色质DNA | 大量单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 133 | 2024-08-08 |
[Clonal Evolution in the Tumor Microenvironment]
2022-Sep, Gan to kagaku ryoho. Cancer & chemotherapy
PMID:36156003
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研究论文 | 本文探讨了肿瘤微环境中克隆进化的机制及其在癌症免疫治疗中的应用 | 利用单细胞测序技术分析肿瘤细胞和免疫细胞的克隆进化,以及新技术允许在保留组织位置信息的同时进行空间分析 | NA | 阐明肿瘤微环境中的克隆进化,以开发预测治疗效果的生物标志物和新型疗法 | 肿瘤细胞和免疫细胞的克隆进化 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 使用来自同一患者的治疗前和治疗后样本 | NA | NA | NA | NA |
| 134 | 2024-08-08 |
Malignant clonal evolution drives multiple myeloma cellular ecological diversity and microenvironment reprogramming
2022-09-22, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-022-01648-z
PMID:36131282
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞RNA测序和单分子长读长基因组测序数据,构建了多发性骨髓瘤患者的骨髓细胞生态景观,分析了恶性克隆演化模式及其对肿瘤微环境的影响 | 首次在单细胞水平上描述了多发性骨髓瘤的恶性克隆演化模式,并揭示了克隆演化与肿瘤微环境之间的交互关系 | NA | 探讨多发性骨髓瘤的恶性克隆演化及其对肿瘤微环境的影响,为个性化精准治疗策略提供理论依据 | 多发性骨髓瘤患者的骨髓细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序,单分子长读长基因组测序 | NA | 基因组数据 | 所有多发性骨髓瘤患者 | NA | NA | NA | NA |
| 135 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome reveals cellular hierarchies and guides p-EMT-targeted trial in skull base chordoma
2022-Sep-20, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-022-00459-2
PMID:36127333
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了颅底脊索瘤的细胞层次结构,并探索了新的治疗靶点 | 首次对颅底脊索瘤进行单细胞RNA测序,并发现了与放射抵抗性相关的干细胞样细胞簇和部分上皮-间质转化(p-EMT)相关的恶性细胞特征 | 研究样本仅包括三名颅底脊索瘤患者,临床试验的样本量较小 | 揭示颅底脊索瘤的细胞层次结构并探索新的治疗靶点 | 颅底脊索瘤的单细胞转录组 | 数字病理学 | 颅底脊索瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 90,691个单细胞样本,三名颅底脊索瘤患者参与临床试验 | NA | NA | NA | NA |
| 136 | 2024-08-08 |
Combining single-cell RNA sequencing of peripheral blood mononuclear cells and exosomal transcriptome to reveal the cellular and genetic profiles in COPD
2022-Sep-20, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-022-02182-8
PMID:36127695
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和外泌体转录组测序,揭示了慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者外周血单个核细胞(PBMCs)和外泌体的细胞及遗传特征 | 首次结合单细胞RNA测序和外泌体转录组测序,探讨了COPD患者外周免疫状态与外泌体之间的关系,并构建了竞争性内源RNA(ceRNA)和蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络 | 研究样本量较小,仅包括六名COPD患者和四名健康对照 | 探讨COPD患者外周免疫状态与外泌体之间的关系及其在疾病发展中的作用 | COPD患者的外周血单个核细胞(PBMCs)和外泌体 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序,外泌体转录组测序 | NA | RNA | 六名COPD患者和四名健康对照 | NA | NA | NA | NA |
| 137 | 2024-08-08 |
Single-cell and WGCNA uncover a prognostic model and potential oncogenes in colorectal cancer
2022-Sep-19, Biological procedures online
IF:3.7Q1
DOI:10.1186/s12575-022-00175-x
PMID:36117173
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序(scRNA-seq)和批量转录组测序(bulk RNA-seq)数据构建了一个结直肠癌(CRC)的预后模型,并发现了潜在的新癌基因。 | 首次基于scRNA-seq和bulk RNA-seq数据构建了CRC的预后模型,并鉴定了四个先前未报告的新癌基因(MPZ, SCARA3, MPP2 和 PBXIP1)。 | NA | 开发新的CRC理解方法并构建预后模型。 | 结直肠癌(CRC)的预后和潜在治疗靶点。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序(scRNA-seq),批量转录组测序(bulk RNA-seq) | 风险模型 | 基因表达数据 | 43,851个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 138 | 2024-08-08 |
Identification of immune and stromal cell infiltration-related gene signature for prognosis prediction in acute lymphoblastic leukemia
2022-09-19, Aging
DOI:10.18632/aging.204292
PMID:36126190
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研究论文 | 本研究针对急性淋巴细胞白血病(ALL),通过生物信息学分析构建了一个基于免疫/间质细胞浸润相关基因(ISCIRG)的预后预测模型 | 首次描述了基于ISCIRG的预后标志物,用于ALL的预后预测 | NA | 研究ISCIRGs在ALL中的作用及对患者临床护理的意义 | 急性淋巴细胞白血病患者 | 数字病理学 | 白血病 | RNA-seq | LASSO和多元Cox回归分析 | RNA-seq数据 | 444名患者,包括437个批量和7个单细胞RNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 139 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveal cellular diversity of aortic valve and the immunomodulation by PPARγ during hyperlipidemia
2022-09-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-33202-2
PMID:36115863
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组学分析揭示了主动脉瓣的细胞多样性以及PPARγ在血脂异常中的免疫调节作用 | 首次通过单细胞RNA测序分析揭示了血脂异常条件下主动脉瓣细胞的异质性及其表型变化,并发现PPARγ激活在保护主动脉瓣免受炎症中的作用 | NA | 探讨血脂异常与主动脉瓣炎症之间的关系,并研究PPARγ在其中的免疫调节作用 | 主动脉瓣的细胞多样性及PPARγ在血脂异常中的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及血脂异常小鼠及非钙化的人类主动脉瓣样本 | NA | NA | NA | NA |
| 140 | 2024-08-08 |
Dendritic cell-derived IL-27 p28 regulates T cell program in pathogenicity and alleviates acute graft-versus-host disease
2022-09-16, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-022-01147-z
PMID:36109504
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研究论文 | 本研究探讨了树突状细胞来源的IL-27 p28在急性移植物抗宿主病中的作用 | 首次揭示了IL-27 p28在调节Treg细胞功能和效应T细胞反应中的具体机制 | 研究主要基于小鼠模型,需要进一步在人类中验证 | 探究IL-27 p28在急性移植物抗宿主病中的作用及其机制 | IL-27 p28在树突状细胞中的缺乏对T细胞功能的影响 | 免疫学 | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型及人类血清样本 | NA | NA | NA | NA |