单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 277 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2024-08-07 |
Single Cell RNA-Seq Identifies Immune-Related Prognostic Model and Key Signature-SPP1 in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2022-Sep-29, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13101760
PMID:36292645
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术，结合在线数据库中的多个PDAC数据集，构建了一个基于免疫相关特征的胰腺导管腺癌（PDAC）预后模型 | 首次利用scRNA-seq技术识别出PDAC中的恶性导管细胞标记物，并开发了一种结合风险评分、N阶段和边缘状态的简易诺模图 | NA | 开发胰腺导管腺癌的早期诊断和预后评估的可靠生物标志物 | 胰腺导管腺癌（PDAC）患者的免疫相关预后模型和关键特征SPP1 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 多个PDAC数据集和TCGA_PAAD数据集 |
| 82 | 2024-08-07 |
Multiple Perspectives Reveal the Role of DNA Damage Repair Genes in the Molecular Classification and Prognosis of Pancreatic Adenocarcinoma
2022-Sep-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms231810231
PMID:36142142
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研究论文 | 本研究通过转录组和基因组分析探讨了胰腺腺癌（PAAD）中DNA损伤修复（DDR）和免疫微环境的多样性，并基于DDR和免疫特征建立了一个5基因预后标志（DPRS），用于临床上区分高风险和低风险组。 | 本研究首次构建了一个基于DDR和免疫的胰腺腺癌风险评分模型，并验证了其在预测患者预后和药物反应中的可行性。 | NA | 研究胰腺腺癌中DNA损伤修复基因的作用及其在分子分类和预后中的角色。 | 胰腺腺癌患者及其DNA损伤修复和免疫微环境。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 转录组分析、基因组分析、单细胞测序、免疫组化 | NA | 基因表达数据 | 多个胰腺腺癌患者样本 |
| 83 | 2024-08-07 |
Increased expression of METTL3 in pancreatic cancer tissues associates with poor survival of the patients
2022-Sep-05, World journal of surgical oncology
IF:2.5Q1
DOI:10.1186/s12957-022-02743-7
PMID:36058919
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研究论文 | 本研究探讨了甲基转移酶样3（METTL3）在人胰腺癌（PC）组织中的表达及其对患者生存的临床意义 | 首次详细分析了METTL3在胰腺癌组织中的表达水平及其与患者生存率的关系 | 研究依赖于公开数据库的数据，可能存在样本选择偏倚 | 研究METTL3在胰腺癌中的预后价值和临床意义 | 胰腺癌组织中METTL3的表达及其对患者生存的影响 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 免疫组化, scRNA-seq | Cox模型分析 | mRNA表达数据 | 使用了TCGA, GTEx, 和GEO数据库中的样本 |
| 84 | 2024-08-07 |
Spatially restricted drivers and transitional cell populations cooperate with the microenvironment in untreated and chemo-resistant pancreatic cancer
2022-09, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01157-1
PMID:35995947
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研究论文 | 本研究通过单细胞/核RNA测序、蛋白质组学、空间转录组学和细胞成像技术，分析了31名胰腺癌患者的83个空间样本，揭示了胰腺导管腺癌的复杂亚结构及其与化疗耐药性的关系 | 本研究首次展示了化疗耐药样本中炎症性癌症相关成纤维细胞的富集及其上调金属硫蛋白的情况，为胰腺导管腺癌的治疗提供了新的见解 | NA | 深入理解胰腺导管腺癌肿瘤的复杂亚结构，以帮助改善患者的治疗 | 胰腺导管腺癌肿瘤的亚群及其与化疗耐药性的关系 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞/核RNA测序、蛋白质组学、空间转录组学、细胞成像 | NA | 空间样本 | 31名患者，83个空间样本 |
| 85 | 2024-08-08 |
Construction of a three commitment points for S phase entry cell cycle model and immune-related ceRNA network to explore novel therapeutic options for psoriasis
2022-09-15, Mathematical biosciences and engineering : MBE
DOI:10.3934/mbe.2022630
PMID:36654055
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研究论文 | 本文构建了S期进入细胞周期的三个承诺点（CP1-3）模型和免疫相关的ceRNA网络，以探索银屑病的新治疗方案 | 首次探索了ceRNA调控机制在银屑病中角质形成细胞与免疫系统相互作用中的作用，并基于ceRNA网络筛选潜在的治疗药物 | NA | 探索银屑病中角质形成细胞增殖和分化的机制及ceRNA网络在其中的作用，并寻找新的治疗药物 | 银屑病中的角质形成细胞和免疫系统 | 生物信息学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序，基因集富集分析，分子对接 | NA | 基因表达数据 | 基于银屑病皮肤活检的单细胞RNA测序数据 |
| 86 | 2024-08-08 |
Unravelling Tumour Microenvironment in Melanoma at Single-Cell Level and Challenges to Checkpoint Immunotherapy
2022-Sep-28, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13101757
PMID:36292642
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综述 | 本文综述了黑色素瘤肿瘤微环境在单细胞水平上的复杂性及其对免疫检查点疗法的挑战 | 强调了使用单细胞测序和空间平台解析肿瘤异质性的机会 | 并非所有癌症患者都能对免疫疗法产生长期持久的反应，且部分患者会产生耐药性 | 探讨肿瘤异质性和微环境复杂性对当前癌症免疫疗法研究的主要挑战 | 黑色素瘤的肿瘤微环境及其对免疫疗法的影响 | NA | 黑色素瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因组和转录组数据 | NA |
| 87 | 2024-08-08 |
Gene Signatures of T-Cell Activation Can Serve as Predictors of Functionality for SARS-CoV-2-Specific T-Cell Receptors
2022-Sep-27, Vaccines
IF:5.2Q1
DOI:10.3390/vaccines10101617
PMID:36298482
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研究论文 | 本研究展示了基于近期肽刺激诱导的T细胞激活基因签名来区分高度功能性和旁观者TCR的可能性 | 本研究通过CRISPR-Cas9介导的基因编辑和单细胞RNA测序，验证了T细胞激活基因签名可以准确识别和预测SARS-CoV-2特异性TCR | NA | 探索T细胞在控制SARS-CoV-2感染中的功能，并提高抗原特异性TCR库功能分析的通量 | SARS-CoV-2特异性T细胞受体（TCR）的功能性 | 生物技术 | NA | CRISPR-Cas9, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |
| 88 | 2024-08-08 |
Identification of the Thyrotropin-Releasing Hormone (TRH) as a Novel Biomarker in the Prognosis for Acute Myeloid Leukemia
2022-Sep-23, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom12101359
PMID:36291567
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，发现促甲状腺素释放激素（TRH）作为急性髓系白血病（AML）的新型生物标志物，并探讨其在AML患者中的表达模式及临床意义 | 首次揭示TRH作为AML的生物标志物，并验证其在不同AML患者群体中的表达差异 | 对TRH在AML中的临床和遗传特征理解不足 | 探索TRH作为AML预后标志物的潜在价值 | 急性髓系白血病患者 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括TCGA AML数据集及三个其他AML队列（Beat AML n=223，GSE6891 n=461，GSE17855 n=237） |
| 89 | 2024-08-08 |
Single Cell Sequencing Reveals Mechanisms of Persistent Truncus Arteriosus Formation after PDGFRα and PDGFRβ Double Knockout in Cardiac Neural Crest Cells
2022-Sep-23, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13101708
PMID:36292593
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研究论文 | 本文通过构建持久性动脉干（PTA）小鼠模型，研究了心脏神经嵴细胞中PDGFRα和PDGFRβ双敲除后导致PTA的机制 | 利用单细胞RNA测序技术，揭示了双敲除组中心脏神经嵴细胞衍生细胞在心脏流出道的分隔和重塑过程中的异常 | NA | 探讨心脏神经嵴细胞中PDGFRα和PDGFRβ双敲除后导致持久性动脉干形成的机制 | 心脏神经嵴细胞及其在心脏流出道的分隔和重塑过程中的作用 | 数字病理学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 90 | 2024-08-08 |
FTH1- and SAT1-Induced Astrocytic Ferroptosis Is Involved in Alzheimer's Disease: Evidence from Single-Cell Transcriptomic Analysis
2022-Sep-22, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ph15101177
PMID:36297287
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析探讨了阿尔茨海默病中星形胶质细胞铁死亡的作用及其分子机制 | 首次揭示了FTH1和SAT1在星形胶质细胞中诱导的铁死亡与阿尔茨海默病病理过程的关系 | 研究主要基于数据库中的单细胞RNA测序数据，未来需通过实验进一步验证 | 探索阿尔茨海默病中星形胶质细胞的铁死亡机制及其对疾病进程的影响 | 阿尔茨海默病患者和健康对照者的脑组织细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自Gene Expression Omnibus (GEO)数据库的阿尔茨海默病患者和健康对照者的样本 |
| 91 | 2024-08-08 |
Exploring biomarkers and transcriptional factors in type 2 diabetes by comprehensive bioinformatics analysis on RNA-Seq and scRNA-Seq data
2022-Sep, Annals of translational medicine
DOI:10.21037/atm-22-4303
PMID:36267740
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研究论文 | 本研究通过综合生物信息学分析RNA-Seq和scRNA-Seq数据，探索了2型糖尿病的生物标志物和转录因子 | 本研究通过结合转录组和单细胞测序数据，为2型糖尿病的分子机制和诊断提供了新的见解 | NA | 探索2型糖尿病的生物标志物和转录因子 | 2型糖尿病患者和健康人群的RNA-Seq和scRNA-Seq数据 | 生物信息学 | 2型糖尿病 | RNA-Seq, scRNA-Seq | LASSO算法, ROC分析 | 基因表达数据 | GSE41762数据集包括健康和2型糖尿病患者的RNA-seq数据，E-MTAB-5061数据集包括1,515个2型糖尿病细胞和1,817个健康细胞 |
| 92 | 2024-08-08 |
Exploring Precise Medication Strategies for OSCC Based on Single-Cell Transcriptome Analysis from a Dynamic Perspective
2022-Sep-30, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14194801
PMID:36230722
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA-Seq数据的静态和动态分析方法，全面剖析口腔鳞状细胞癌（OSCC）的复杂异质性和进化过程，并提出精确治疗策略。 | 首次引入患者伪时间评分概念，量化动态发展过程中的异质性水平，评估其与生存状态的关系，并据此调整药物治疗策略。 | NA | 从动态角度理解癌症发展，制定精确治疗措施。 | 口腔鳞状细胞癌（OSCC）患者及其治疗策略。 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 93 | 2024-08-08 |
An Integrative Analysis of Identified Schizophrenia-Associated Brain Cell Types and Gene Expression Changes
2022-Sep-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms231911581
PMID:36232882
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研究论文 | 本研究利用人类背外侧前额叶皮层的大量RNA-seq数据，通过RNA-seq反卷积算法CIBERSORTx生成精神分裂症（SCZ）大脑单细胞RNA-seq数据，全面分析了SCZ相关的大脑细胞类型和基因表达变化。 | 本研究首次通过RNA-seq反卷积算法CIBERSORTx生成SCZ大脑单细胞RNA-seq数据，揭示了SCZ相关的大脑细胞类型和基因表达变化的细胞异质性和分子机制。 | NA | 理解精神分裂症（SCZ）相关的大脑细胞类型和基因表达变化 | 精神分裂症（SCZ）患者的大脑细胞类型和基因表达 | 数字病理学 | 精神分裂症 | RNA-seq | CIBERSORTx | RNA-seq数据 | NA |
| 94 | 2024-08-08 |
Single-Cell Gene Expression Analysis Revealed Immune Cell Signatures of Delta COVID-19
2022-09-21, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11192950
PMID:36230912
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研究论文 | 本研究通过单细胞基因表达分析揭示了Delta COVID-19的免疫细胞特征 | 本研究首次揭示了Delta变异株特有的免疫相关分子因子，特别是大量具有特定基因表达特征的单核细胞 | NA | 理解与COVID-19变异株相关的免疫反应，以辅助开发治疗和诊断策略 | COVID-19患者的血液单核细胞及不同严重程度的病毒变异株 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 不同严重程度的COVID-19患者血液单核细胞样本 |
| 95 | 2024-08-08 |
Spatial Transcriptomics Analysis Reveals that CCL17 and CCL22 are Robust Indicators of a Suppressive Immune Environment in Angioimmunoblastic T Cell Lymphoma (AITL)
2022-09-29, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2709270
PMID:36224014
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研究论文 | 本研究首次使用空间转录组学方法分析了血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤（AITL）的免疫微环境，发现CCL17和CCL22是抑制性免疫环境的强指标 | 首次应用空间转录组学技术研究AITL的肿瘤免疫微环境，揭示了CCL17和CCL22在AITL中的上调现象 | 化疗方案CHOP诱导的完全缓解持续时间仍是一个问题 | 研究AITL的免疫微环境并探索潜在的治疗方法 | 血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤（AITL）的免疫微环境 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 96 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptomic profiling of coronary endothelial cells in SARS-CoV-2 myocarditis
2022-Sep-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2022.09.25.509426
PMID:36203548
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研究论文 | 本文利用数字空间转录组学技术研究了严重COVID-19患者冠状动脉内皮细胞和心肌细胞的转录组特征 | 首次揭示了SARS-CoV-2感染引起的独特心肌转录组编程，且这种编程独立于局部病毒负荷 | 研究样本量较小，且未涉及更大冠状动脉血管的转录组分析 | 探讨严重COVID-19患者冠状动脉内皮细胞和心肌细胞的转录组变化 | 严重COVID-19患者的冠状动脉内皮细胞和心肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 4例对照组和8例COVID-19患者的心脏组织 |
| 97 | 2024-08-08 |
Analysis of antitumor immunity in mouse glioma microenvironment through intercellular communication
2022-Sep, Journal of cancer research and therapeutics
IF:1.4Q4
DOI:10.4103/jcrt.jcrt_852_22
PMID:36204889
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研究论文 | 本研究通过分析细胞间通讯，描绘了小鼠胶质瘤微环境中的抗肿瘤免疫图谱 | 描述了之前被低估的浸润性T细胞与脑细胞群之间的复杂通讯 | NA | 旨在通过分析细胞间通讯，描绘胶质瘤微环境中的抗肿瘤免疫图谱 | 小鼠胶质瘤微环境中的细胞间通讯 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因组数据 | 新鲜的小鼠胶质瘤样本 |
| 98 | 2024-08-08 |
Therapeutic implications of mitochondrial stress-induced proteasome inhibitor resistance in multiple myeloma
2022-09-30, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abq5575
PMID:36170375
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研究论文 | 本文探讨了线粒体应激诱导的蛋白酶体抑制剂抗性在多发性骨髓瘤中的治疗意义 | 首次揭示了电子传递链抑制促进蛋白酶体抑制剂抗性的机制，并提出了针对线粒体代谢状态的联合治疗方案 | NA | 研究多发性骨髓瘤中代谢状态与治疗抗性的关联 | 多发性骨髓瘤患者及细胞模型 | NA | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及CoMMpass试验中的患者样本 |
| 99 | 2024-08-08 |
Rapid and sensitive single-cell RNA sequencing with SHERRY2
2022-09-30, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-022-01416-x
PMID:36175891
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SHERRY2的单细胞RNA测序优化协议，无需第二链cDNA合成，具有高灵敏度和准确性 | SHERRY2利用Tn5转座酶直接切割和标记DNA/RNA异源双链，避免了预扩增和序列依赖性偏差 | NA | 开发一种新型单细胞RNA测序方法，提高测序的灵敏度和准确性 | 单细胞RNA测序技术 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 数千个细胞 |
| 100 | 2024-08-08 |
In vivo generation of bone marrow from embryonic stem cells in interspecies chimeras
2022-Sep-30, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.74018
PMID:36178184
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研究论文 | 本文通过胚胎互补技术，在鼠-鼠嵌合体中从胚胎干细胞生成骨髓细胞系，并分析了其基因表达特征和细胞表面标记 | 首次在鼠-鼠嵌合体中成功生成功能性骨髓，并展示了胚胎干细胞衍生的造血干细胞的长期重建潜力 | 该方法目前仅在鼠-鼠嵌合体中验证，尚未在其他物种中进行测试 | 加速未来针对致命疾病的细胞疗法的开发 | 胚胎干细胞衍生的骨髓细胞系及其在嵌合体中的功能 | 干细胞研究 | NA | 荧光激活细胞分选分析，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 使用了鼠胚胎干细胞和鼠-鼠嵌合体 |