单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 277 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2024-08-07 |
Early life stress exacerbates obesity in adult female mice via mineralocorticoid receptor-dependent increases in adipocyte triglyceride and glycerol content
2022-Sep-01, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2022.120718
PMID:35714704
|
研究论文 | 本研究探讨了早期生活压力通过矿物皮质激素受体依赖性增加脂肪细胞甘油三酯和甘油含量，加剧成年雌性小鼠肥胖的现象。 | 本研究首次揭示了早期生活压力通过矿物皮质激素受体影响脂肪细胞功能，加剧肥胖的具体机制。 | 研究主要集中在雌性小鼠上，未来研究可以扩展到雄性小鼠或其他动物模型，以验证结果的普遍性。 | 旨在理解母体分离和早期断奶对脂肪组织基本稳态功能的具体影响，并探究这种影响是否通过矿物皮质激素受体介导。 | 研究对象包括雌性小鼠的卵巢白色脂肪组织，以及分离的前脂肪细胞和成熟脂肪细胞。 | NA | 肥胖 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组学数据，脂质组学数据 | 具体样本数量未在摘要中明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 82 | 2024-08-07 |
Combined protein and transcript single-cell RNA sequencing in human peripheral blood mononuclear cells
2022-09-01, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-022-01382-4
PMID:36045343
|
研究论文 | 本文开发了一种结合蛋白质和转录组单细胞RNA测序（scRNA-seq）的方法，用于分析人外周血单个核细胞（PBMCs）。 | 该研究首次实现了在PBMCs中同时进行蛋白质和转录组的单细胞RNA测序，这种方法比传统的流式细胞术、质谱细胞术或仅转录组的scRNA-seq具有更高的分辨率。 | NA | 开发一种新的单细胞RNA测序方法，以提高临床研究中PBMCs分析的分辨率和应用范围。 | 人外周血单个核细胞（PBMCs） | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | Seurat UMAPs 和 Louvain 聚类 | 细胞 | 31名参与者，共测序41,611个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 83 | 2024-08-07 |
SECANT: a biology-guided semi-supervised method for clustering, classification, and annotation of single-cell multi-omics
2022-Sep, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgac165
PMID:36157595
|
研究论文 | 本文开发了一种名为SECANT的生物学指导半监督方法，用于单细胞多组学数据的聚类、分类和注释 | SECANT的创新点包括使用表面蛋白数据中识别的可靠细胞类型标签作为细胞聚类的指导，为每个细胞群提供一般注释，利用具有不确定或缺失细胞类型标签的细胞提高性能，以及准确预测scRNA-seq数据的可靠细胞类型 | NA | 开发一种新的方法来分析单细胞多组学数据，特别是CITE-seq数据 | 单细胞多组学数据，特别是CITE-seq数据 | 生物信息学 | NA | CITE-seq | NA | 单细胞多组学数据 | 多个组织的公共和内部数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 84 | 2024-08-07 |
Establishment of the large-scale longitudinal multi-omics dataset in COVID-19 patients: data profile and biospecimen
2022-Sep, BMB reports
IF:2.9Q3
PMID:35996834
|
研究论文 | 本文建立了COVID-19患者的大规模纵向多组学数据集，并提供了数据概况和生物样本信息 | 本研究收集了300名COVID-19患者和120名健康对照的全面生物样本和纵向多组学数据，包括全基因组测序、单细胞RNA测序结合T细胞受体和B细胞受体测序等 | NA | 旨在帮助管理当前和未来的病毒介导的流行病，并促进对COVID-19感染中涉及的生物相互作用的理解 | COVID-19患者的生物样本和多组学数据 | 数字病理学 | COVID-19 | 全基因组测序、单细胞RNA测序结合T细胞受体和B细胞受体测序、批量TCR/BCR测序、细胞因子 profiling | NA | 生物样本和多组学数据 | 300名COVID-19患者和120名健康对照 | NA | NA | NA | NA |
| 85 | 2024-08-07 |
Imipridones affect tumor bioenergetics and promote cell lineage differentiation in diffuse midline gliomas
2022-09-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noac041
PMID:35157764
|
research paper | 研究伊米普利酮类药物对弥漫中线胶质瘤的肿瘤生物能量学和细胞谱系分化的影响 | 首次详细描述了ONC201及其衍生物ONC206在弥漫中线胶质瘤中的抗癌机制，包括对肿瘤细胞代谢和线粒体损伤的影响，以及诱导细胞谱系分化的能力 | NA | 探究伊米普利酮类药物ONC201和ONC206在弥漫中线胶质瘤中的抗癌机制 | 弥漫中线胶质瘤的细胞和动物模型，以及患者样本 | digital pathology | 脑癌 | Seahorse XF Cell Mito Stress Test, MitoSOX, TMRM assay, 电子显微镜成像, bulk和单细胞RNA-seq | NA | 细胞, 动物模型, 患者样本 | 体外模型18个, 体内模型包括小鼠和斑马鱼, 患者样本20个 | NA | NA | NA | NA |
| 86 | 2024-08-07 |
Transcriptional Heterogeneity of Cellular Senescence in Cancer
2022-Sep-30, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.14348/molcells.2022.0036
PMID:35983702
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在解析癌症细胞衰老相关基因表达异质性中的应用 | 利用scRNA-seq技术揭示了癌症细胞中衰老相关基因表达的多样性及其在肿瘤恶性转化中的作用 | NA | 探讨衰老细胞在肿瘤恶性转化中的作用及衰老相关基因在肿瘤微环境中的功能 | 癌症细胞及肿瘤微环境中的基质细胞 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 87 | 2024-08-07 |
Multi-context genetic modeling of transcriptional regulation resolves novel disease loci
2022-09-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-33212-0
PMID:36171194
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为CONTENT的新方法，该方法利用多上下文表达研究中的个体内部相关性，通过跨上下文的错误发现校正提高功率，并生成上下文特定和上下文共享的表达成分。 | CONTENT方法通过利用跨上下文的相关结构，提高了遗传预测基因的数量，并在转录组关联研究中增加了位点-表型关联的发现数量。 | NA | 提高转录组关联研究（TWAS）的解释和发现与复杂性状相关基因的能力。 | 多组织和单细胞RNA-seq数据集。 | 基因组学 | NA | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 涉及多组织和单细胞数据集，具体样本数量未详细说明。 | NA | NA | NA | NA |
| 88 | 2024-08-07 |
Cell type-specific inference of differential expression in spatial transcriptomics
2022-09, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-022-01575-3
PMID:36050488
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为C-SIDE的统计方法，用于在空间转录组学中识别细胞类型特异性的差异表达基因 | C-SIDE方法考虑了其他细胞类型的定位，并能应用于多种情境，如病理、解剖区域、细胞间相互作用和细胞微环境 | NA | 开发一种新的统计方法，用于在空间转录组学中准确识别细胞类型特异性的差异表达基因 | 空间转录组学中的差异表达基因 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学技术 | NA | 转录组数据 | 使用了Slide-seq、MERFISH和Visium数据集进行模拟和验证实验 | NA | NA | NA | NA |
| 89 | 2024-08-07 |
Singling out motor neurons in the age of single-cell transcriptomics
2022-09, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2022.03.016
PMID:35487823
|
research paper | 本文讨论了利用单细胞转录组学技术揭示成年动物运动神经元内在异质性的新兴技术及其对疾病和脊髓损伤的潜在影响 | 利用高吞吐量的单细胞转录组学技术，快速分离和分析运动神经元核，揭示了骨骼和自主神经系统的显著转录多样性 | NA | 定义成年运动系统中运动神经元的异质性，并探讨其对疾病和脊髓损伤的影响 | 运动神经元的异质性及其在健康和退化状态下的特性 | digital pathology | neuromuscular disease | single-cell transcriptomics | NA | transcriptomic data | NA | NA | NA | NA | NA |
| 90 | 2024-08-07 |
Inference on spatial heterogeneity in tumor microenvironment using spatial transcriptomics data
2022-Sep, Computational and systems oncology
DOI:10.1002/cso2.1043
PMID:36035873
|
研究论文 | 本文提出了一种基于网络图的空间统计模型框架，用于分析空间转录组数据，以揭示肿瘤微环境中的模块性和空间异质性 | 首次提出使用网络图的空间统计模型来量化肿瘤微环境中的空间异质性 | 研究仅限于胰腺导管腺癌样本，可能不适用于其他类型的癌症 | 研究肿瘤微环境中的空间异质性及其对肿瘤生长和癌症特征的影响 | 肿瘤微环境中的细胞类型和通路特征的空间分布 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学 | 网络图 | 分子数据 | 胰腺导管腺癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 91 | 2024-08-07 |
Single Cell RNA-Seq Identifies Immune-Related Prognostic Model and Key Signature-SPP1 in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2022-Sep-29, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13101760
PMID:36292645
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术，结合在线数据库中的多个PDAC数据集，构建了一个基于免疫相关特征的胰腺导管腺癌（PDAC）预后模型 | 首次利用scRNA-seq技术识别出PDAC中的恶性导管细胞标记物，并开发了一种结合风险评分、N阶段和边缘状态的简易诺模图 | NA | 开发胰腺导管腺癌的早期诊断和预后评估的可靠生物标志物 | 胰腺导管腺癌（PDAC）患者的免疫相关预后模型和关键特征SPP1 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 多个PDAC数据集和TCGA_PAAD数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 92 | 2024-08-07 |
Multiple Perspectives Reveal the Role of DNA Damage Repair Genes in the Molecular Classification and Prognosis of Pancreatic Adenocarcinoma
2022-Sep-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms231810231
PMID:36142142
|
研究论文 | 本研究通过转录组和基因组分析探讨了胰腺腺癌（PAAD）中DNA损伤修复（DDR）和免疫微环境的多样性，并基于DDR和免疫特征建立了一个5基因预后标志（DPRS），用于临床上区分高风险和低风险组。 | 本研究首次构建了一个基于DDR和免疫的胰腺腺癌风险评分模型，并验证了其在预测患者预后和药物反应中的可行性。 | NA | 研究胰腺腺癌中DNA损伤修复基因的作用及其在分子分类和预后中的角色。 | 胰腺腺癌患者及其DNA损伤修复和免疫微环境。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 转录组分析、基因组分析、单细胞测序、免疫组化 | NA | 基因表达数据 | 多个胰腺腺癌患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 93 | 2024-08-07 |
Increased expression of METTL3 in pancreatic cancer tissues associates with poor survival of the patients
2022-Sep-05, World journal of surgical oncology
IF:2.5Q1
DOI:10.1186/s12957-022-02743-7
PMID:36058919
|
研究论文 | 本研究探讨了甲基转移酶样3（METTL3）在人胰腺癌（PC）组织中的表达及其对患者生存的临床意义 | 首次详细分析了METTL3在胰腺癌组织中的表达水平及其与患者生存率的关系 | 研究依赖于公开数据库的数据，可能存在样本选择偏倚 | 研究METTL3在胰腺癌中的预后价值和临床意义 | 胰腺癌组织中METTL3的表达及其对患者生存的影响 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 免疫组化, scRNA-seq | Cox模型分析 | mRNA表达数据 | 使用了TCGA, GTEx, 和GEO数据库中的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 94 | 2024-08-07 |
Spatially restricted drivers and transitional cell populations cooperate with the microenvironment in untreated and chemo-resistant pancreatic cancer
2022-09, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01157-1
PMID:35995947
|
研究论文 | 本研究通过单细胞/核RNA测序、蛋白质组学、空间转录组学和细胞成像技术，分析了31名胰腺癌患者的83个空间样本，揭示了胰腺导管腺癌的复杂亚结构及其与化疗耐药性的关系 | 本研究首次展示了化疗耐药样本中炎症性癌症相关成纤维细胞的富集及其上调金属硫蛋白的情况，为胰腺导管腺癌的治疗提供了新的见解 | NA | 深入理解胰腺导管腺癌肿瘤的复杂亚结构，以帮助改善患者的治疗 | 胰腺导管腺癌肿瘤的亚群及其与化疗耐药性的关系 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞/核RNA测序、蛋白质组学、空间转录组学、细胞成像 | NA | 空间样本 | 31名患者，83个空间样本 | NA | NA | NA | NA |
| 95 | 2024-08-08 |
Construction of a three commitment points for S phase entry cell cycle model and immune-related ceRNA network to explore novel therapeutic options for psoriasis
2022-09-15, Mathematical biosciences and engineering : MBE
DOI:10.3934/mbe.2022630
PMID:36654055
|
研究论文 | 本文构建了S期进入细胞周期的三个承诺点（CP1-3）模型和免疫相关的ceRNA网络，以探索银屑病的新治疗方案 | 首次探索了ceRNA调控机制在银屑病中角质形成细胞与免疫系统相互作用中的作用，并基于ceRNA网络筛选潜在的治疗药物 | NA | 探索银屑病中角质形成细胞增殖和分化的机制及ceRNA网络在其中的作用，并寻找新的治疗药物 | 银屑病中的角质形成细胞和免疫系统 | 生物信息学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序，基因集富集分析，分子对接 | NA | 基因表达数据 | 基于银屑病皮肤活检的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 96 | 2024-08-08 |
Unravelling Tumour Microenvironment in Melanoma at Single-Cell Level and Challenges to Checkpoint Immunotherapy
2022-Sep-28, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13101757
PMID:36292642
|
综述 | 本文综述了黑色素瘤肿瘤微环境在单细胞水平上的复杂性及其对免疫检查点疗法的挑战 | 强调了使用单细胞测序和空间平台解析肿瘤异质性的机会 | 并非所有癌症患者都能对免疫疗法产生长期持久的反应，且部分患者会产生耐药性 | 探讨肿瘤异质性和微环境复杂性对当前癌症免疫疗法研究的主要挑战 | 黑色素瘤的肿瘤微环境及其对免疫疗法的影响 | NA | 黑色素瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因组和转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 97 | 2024-08-08 |
Gene Signatures of T-Cell Activation Can Serve as Predictors of Functionality for SARS-CoV-2-Specific T-Cell Receptors
2022-Sep-27, Vaccines
IF:5.2Q1
DOI:10.3390/vaccines10101617
PMID:36298482
|
研究论文 | 本研究展示了基于近期肽刺激诱导的T细胞激活基因签名来区分高度功能性和旁观者TCR的可能性 | 本研究通过CRISPR-Cas9介导的基因编辑和单细胞RNA测序，验证了T细胞激活基因签名可以准确识别和预测SARS-CoV-2特异性TCR | NA | 探索T细胞在控制SARS-CoV-2感染中的功能，并提高抗原特异性TCR库功能分析的通量 | SARS-CoV-2特异性T细胞受体（TCR）的功能性 | 生物技术 | NA | CRISPR-Cas9, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 98 | 2024-08-08 |
Identification of the Thyrotropin-Releasing Hormone (TRH) as a Novel Biomarker in the Prognosis for Acute Myeloid Leukemia
2022-Sep-23, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom12101359
PMID:36291567
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，发现促甲状腺素释放激素（TRH）作为急性髓系白血病（AML）的新型生物标志物，并探讨其在AML患者中的表达模式及临床意义 | 首次揭示TRH作为AML的生物标志物，并验证其在不同AML患者群体中的表达差异 | 对TRH在AML中的临床和遗传特征理解不足 | 探索TRH作为AML预后标志物的潜在价值 | 急性髓系白血病患者 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括TCGA AML数据集及三个其他AML队列（Beat AML n=223，GSE6891 n=461，GSE17855 n=237） | NA | NA | NA | NA |
| 99 | 2024-08-08 |
Single Cell Sequencing Reveals Mechanisms of Persistent Truncus Arteriosus Formation after PDGFRα and PDGFRβ Double Knockout in Cardiac Neural Crest Cells
2022-Sep-23, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13101708
PMID:36292593
|
研究论文 | 本文通过构建持久性动脉干（PTA）小鼠模型，研究了心脏神经嵴细胞中PDGFRα和PDGFRβ双敲除后导致PTA的机制 | 利用单细胞RNA测序技术，揭示了双敲除组中心脏神经嵴细胞衍生细胞在心脏流出道的分隔和重塑过程中的异常 | NA | 探讨心脏神经嵴细胞中PDGFRα和PDGFRβ双敲除后导致持久性动脉干形成的机制 | 心脏神经嵴细胞及其在心脏流出道的分隔和重塑过程中的作用 | 数字病理学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 100 | 2024-08-08 |
FTH1- and SAT1-Induced Astrocytic Ferroptosis Is Involved in Alzheimer's Disease: Evidence from Single-Cell Transcriptomic Analysis
2022-Sep-22, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ph15101177
PMID:36297287
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析探讨了阿尔茨海默病中星形胶质细胞铁死亡的作用及其分子机制 | 首次揭示了FTH1和SAT1在星形胶质细胞中诱导的铁死亡与阿尔茨海默病病理过程的关系 | 研究主要基于数据库中的单细胞RNA测序数据，未来需通过实验进一步验证 | 探索阿尔茨海默病中星形胶质细胞的铁死亡机制及其对疾病进程的影响 | 阿尔茨海默病患者和健康对照者的脑组织细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自Gene Expression Omnibus (GEO)数据库的阿尔茨海默病患者和健康对照者的样本 | NA | NA | NA | NA |