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当前共找到 277 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome mapping identifies a local, innate B cell population driving chronic rejection after lung transplantation
2022-09-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.156648
PMID:36134664
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研究论文 | 本研究分析了肺移植后慢性排斥反应中细胞种群变化及其基因表达模式 | 首次识别了驱动肺移植后慢性排斥反应的局部固有B细胞群体及其在BOS中的作用 | 研究主要集中于小鼠模型，可能无法完全代表人类情况 | 理解B细胞在慢性排斥反应中的作用及其异质性 | 肺移植小鼠模型及人类BOS病例 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了2个不同的人类BOS队列和小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 82 | 2024-08-05 |
Genome-wide DNA hypermethylation opposes healing in patients with chronic wounds by impairing epithelial-mesenchymal transition
2022-09-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI157279
PMID:35819852
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研究论文 | 本研究探讨了慢性创伤患者中全基因组DNA高甲基化如何通过影响上皮间充质转化阻碍创伤愈合 | 该研究首次通过全基因组甲基组分析揭示了慢性创伤边缘组织中高甲基化与上皮间充质转化之间的关系 | 研究主要集中于小鼠实验，可能存在物种间差异 | 研究创伤微环境中的表观遗传机制及其在慢性创伤愈合中的作用 | 慢性创伤患者的创伤边缘组织和小鼠模型 | 数字病理学 | NA | RNA-Seq，亚硫酸盐测序 | NA | 基因组数据 | 慢性创伤患者创伤边缘组织4,689个差异甲基化区域 | NA | NA | NA | NA |
| 83 | 2024-08-05 |
Transcriptional and functional analyses of neoantigen-specific CD4 T cells during a profound response to anti-PD-L1 in metastatic Merkel cell carcinoma
2022-09, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2022-005328
PMID:36252564
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研究论文 | 本研究探讨了在转移性梅克尔细胞癌中对抗PD-L1的显著反应期间，特异性针对新抗原的CD4 T细胞的转录和功能分析 | 这是首次报告梅克尔细胞癌中针对新抗原的特异性T细胞反应的研究 | 研究仅关注一名病毒阴性梅克尔细胞癌患者，样本量较小 | 本研究的目的在于分析特异性针对新抗原的CD4 T细胞的功能和转录特征 | 研究对象为一位中年女性梅克尔细胞癌患者及其血液中的T细胞 | 数字病理学 | 梅克尔细胞癌 | 全外显子测序（WES）、ELISpot、流式细胞术和单细胞RNA序列分析 | NA | 血液样本 | 1名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 84 | 2024-08-05 |
Hippo signaling cofactor, WWTR1, at the crossroads of human trophoblast progenitor self-renewal and differentiation
2022-09-06, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2204069119
PMID:36037374
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研究论文 | 本文探讨了Hippo信号共因子WWTR1在人类滋养层前体自我更新和分化过程中的关键作用 | 揭示了WWTR1作为人类滋养层命运选择的主调控因子，并明确了其在自我更新和分化中的双重作用 | 对WWTR1在不同妊娠阶段的完全作用及其调控机制仍需进一步研究 | 揭示人类滋养层前体的自我更新与分化之间的分子机制 | 人类滋养层干细胞、初级滋养细胞和人类胎盘样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 多个胎盘样本，包括病理妊娠的胎盘 | NA | NA | NA | NA |
| 85 | 2024-08-05 |
Transcriptional profiling of mouse projection neurons with VECTORseq
2022-09-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101625
PMID:36035788
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研究论文 | 本文介绍了一种新技术VECTORseq，用于小鼠投射神经元的转录组特征分析 | 开发了VECTORseq技术，可以同时在单个实验中标记多个神经元群体 | 未提及具体的研究限制 | 提高投射神经元转录组特征分析的通量 | 小鼠脑中的不同投射神经元 | 数字病理学 | NA | 病毒条形码传递 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 86 | 2024-08-05 |
Modular derivation of diverse, regionally discrete human posterior CNS neurons enables discovery of transcriptomic patterns
2022-09-30, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abn7430
PMID:36179024
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研究论文 | 本文建立了一种模块化的单层分化范式，用于衍生具有区域特异性的多样化人类后中枢神经系统神经元 | 创新性地使用调节D/V信号来导向不同类型的后中枢神经系统神经元，并利用单细胞RNA测序和计算管道发现区域特异性的转录标记 | 研究可能在hPSCs的来源以及特定神经元类型的功能验证方面存在局限 | 旨在通过衍生人类后中枢神经系统神经元来加深对人类神经发育和疾病的理解 | 研究对象为由人类多能干细胞衍生的后中枢神经系统神经元前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 87 | 2024-08-05 |
Dissociation and inDrops microfluidic encapsulation of human gut tissues for single-cell atlasing studies
2022-09-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101570
PMID:35880121
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研究论文 | 本文详细介绍了人肠组织解离和在inDrops微流体平台上的单细胞RNA测序的步骤 | 创新点在于使用冷激活蛋白酶进行人肠组织解离，并在inDrops平台上进行单细胞封装 | 此方法的适用性尚需进一步验证，尤其是在不同类型的肠组织中 | 研究人肠组织的单细胞RNA测序，以帮助了解细胞的多样性和功能 | 人肠组织中的单个上皮细胞 | 数字病理 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 使用了多种病变和炎症状态的组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 88 | 2024-08-05 |
Neurons burdened by DNA double-strand breaks incite microglia activation through antiviral-like signaling in neurodegeneration
2022-09-30, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abo4662
PMID:36170369
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研究论文 | 该文章研究了含有DNA双链断裂的神经元如何通过抗病毒信号激活小胶质细胞，从而影响与神经退行性变相关的神经炎症 | 首次揭示了含有双链断裂的神经元在疾病相关神经炎症机制中的新作用 | 研究的模型仅限于CK-p25小鼠，可能限制了结果的普适性 | 探索含有DNA双链断裂的神经元对神经炎症的影响 | CK-p25小鼠模型中的含有DNA双链断裂的神经元 | 数字病理学 | 老年痴呆症 | 单核、整体和空间转录组技术 | NA | 转录组数据 | CK-p25小鼠脑组织 | NA | NA | NA | NA |
| 89 | 2024-08-05 |
Decoding the olfactory map through targeted transcriptomics links murine olfactory receptors to glomeruli
2022-09-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-32267-3
PMID:36050313
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研究论文 | 本研究探讨了小鼠嗅觉系统中嗅觉受体与嗅球小球之间的映射关系 | 采用了序列切片结合目标捕获富集测序的方法，成功克服了低丰度嗅觉受体表达的问题 | 过去低丰度的嗅觉受体表达限制了高通量映射的可能性 | 理解嗅觉受体如何映射到嗅球小球，以进一步探索嗅觉机制 | 小鼠的嗅觉受体及其在嗅球小球中的分布 | 数字病理学 | NA | 目标捕获富集测序 | NA | NA | 映射了86%的嗅觉受体 | NA | NA | NA | NA |
| 90 | 2024-08-05 |
Detecting retinal neural and stromal cell classes and ganglion cell subtypes based on transcriptome data with deep transfer learning
2022-09-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac514
PMID:35876552
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研究论文 | 本研究开发并评估了深度学习模型，通过单细胞RNA测序数据识别不同类型的视网膜细胞和视网膜神经节细胞亚型 | 使用深度域自适应模型，结合多种损失函数，以提高不同数据集间的准确性 | 研究中仅基于小鼠的视网膜细胞，可能无法推广到其他物种 | 旨在提高识别不同视网膜细胞类型及其亚型的准确性 | 采用不同小鼠来源的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习模型 | RNA数据 | 44,808个视网膜细胞和6,225个及35,699个视网膜神经节细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 91 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome profiling reveals intra-tumoral heterogeneity in human chordomas
2022-Sep, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-022-03152-1
PMID:35084549
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研究论文 | 这项研究探讨了人类软骨瘤中的肿瘤异质性 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了软骨瘤的转录组特征及其异质性 | 仅涉及6个软骨瘤样本，样本量较小 | 评估软骨瘤的肿瘤异质性并识别潜在的治疗靶点 | 六个软骨瘤样本和分析的33,737个细胞 | 数字病理 | 软骨瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞转录组数据 | 6个软骨瘤样本，分析了33,737个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 92 | 2024-08-07 |
Follicular Lymphoma Microenvironment Characteristics Associated with Tumor Cell Mutations and MHC Class II Expression
2022-09-06, Blood cancer discovery
IF:11.5Q1
DOI:10.1158/2643-3230.BCD-21-0075
PMID:35687817
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了滤泡性淋巴瘤（FL）的肿瘤微环境，并探讨了肿瘤细胞突变与主要组织相容性复合体II类（MHC II）表达之间的关系 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了FL的肿瘤和免疫细胞群体，并揭示了MHC II表达与T细胞表型特征的关联 | NA | 研究FL的肿瘤微环境特征及其与肿瘤细胞突变和MHC II表达的关系 | 滤泡性淋巴瘤的肿瘤微环境和免疫细胞群体 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 93 | 2024-08-07 |
Establishment of the large-scale longitudinal multi-omics dataset in COVID-19 patients: data profile and biospecimen
2022-Sep, BMB reports
IF:2.9Q3
PMID:35996834
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研究论文 | 本文建立了COVID-19患者的大规模纵向多组学数据集，并提供了数据概况和生物样本信息 | 本研究收集了300名COVID-19患者和120名健康对照的全面生物样本和纵向多组学数据，包括全基因组测序、单细胞RNA测序结合T细胞受体和B细胞受体测序等 | NA | 旨在帮助管理当前和未来的病毒介导的流行病，并促进对COVID-19感染中涉及的生物相互作用的理解 | COVID-19患者的生物样本和多组学数据 | 数字病理学 | COVID-19 | 全基因组测序、单细胞RNA测序结合T细胞受体和B细胞受体测序、批量TCR/BCR测序、细胞因子 profiling | NA | 生物样本和多组学数据 | 300名COVID-19患者和120名健康对照 | NA | NA | NA | NA |
| 94 | 2024-08-07 |
Imipridones affect tumor bioenergetics and promote cell lineage differentiation in diffuse midline gliomas
2022-09-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noac041
PMID:35157764
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research paper | 研究伊米普利酮类药物对弥漫中线胶质瘤的肿瘤生物能量学和细胞谱系分化的影响 | 首次详细描述了ONC201及其衍生物ONC206在弥漫中线胶质瘤中的抗癌机制，包括对肿瘤细胞代谢和线粒体损伤的影响，以及诱导细胞谱系分化的能力 | NA | 探究伊米普利酮类药物ONC201和ONC206在弥漫中线胶质瘤中的抗癌机制 | 弥漫中线胶质瘤的细胞和动物模型，以及患者样本 | digital pathology | 脑癌 | Seahorse XF Cell Mito Stress Test, MitoSOX, TMRM assay, 电子显微镜成像, bulk和单细胞RNA-seq | NA | 细胞, 动物模型, 患者样本 | 体外模型18个, 体内模型包括小鼠和斑马鱼, 患者样本20个 | NA | NA | NA | NA |
| 95 | 2024-08-07 |
Transcriptional Heterogeneity of Cellular Senescence in Cancer
2022-Sep-30, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.14348/molcells.2022.0036
PMID:35983702
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在解析癌症细胞衰老相关基因表达异质性中的应用 | 利用scRNA-seq技术揭示了癌症细胞中衰老相关基因表达的多样性及其在肿瘤恶性转化中的作用 | NA | 探讨衰老细胞在肿瘤恶性转化中的作用及衰老相关基因在肿瘤微环境中的功能 | 癌症细胞及肿瘤微环境中的基质细胞 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 96 | 2024-08-07 |
Singling out motor neurons in the age of single-cell transcriptomics
2022-09, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2022.03.016
PMID:35487823
|
research paper | 本文讨论了利用单细胞转录组学技术揭示成年动物运动神经元内在异质性的新兴技术及其对疾病和脊髓损伤的潜在影响 | 利用高吞吐量的单细胞转录组学技术，快速分离和分析运动神经元核，揭示了骨骼和自主神经系统的显著转录多样性 | NA | 定义成年运动系统中运动神经元的异质性，并探讨其对疾病和脊髓损伤的影响 | 运动神经元的异质性及其在健康和退化状态下的特性 | digital pathology | neuromuscular disease | single-cell transcriptomics | NA | transcriptomic data | NA | NA | NA | NA | NA |
| 97 | 2024-08-07 |
Inference on spatial heterogeneity in tumor microenvironment using spatial transcriptomics data
2022-Sep, Computational and systems oncology
DOI:10.1002/cso2.1043
PMID:36035873
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研究论文 | 本文提出了一种基于网络图的空间统计模型框架，用于分析空间转录组数据，以揭示肿瘤微环境中的模块性和空间异质性 | 首次提出使用网络图的空间统计模型来量化肿瘤微环境中的空间异质性 | 研究仅限于胰腺导管腺癌样本，可能不适用于其他类型的癌症 | 研究肿瘤微环境中的空间异质性及其对肿瘤生长和癌症特征的影响 | 肿瘤微环境中的细胞类型和通路特征的空间分布 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学 | 网络图 | 分子数据 | 胰腺导管腺癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 98 | 2024-08-07 |
Single Cell RNA-Seq Identifies Immune-Related Prognostic Model and Key Signature-SPP1 in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2022-Sep-29, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13101760
PMID:36292645
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术，结合在线数据库中的多个PDAC数据集，构建了一个基于免疫相关特征的胰腺导管腺癌（PDAC）预后模型 | 首次利用scRNA-seq技术识别出PDAC中的恶性导管细胞标记物，并开发了一种结合风险评分、N阶段和边缘状态的简易诺模图 | NA | 开发胰腺导管腺癌的早期诊断和预后评估的可靠生物标志物 | 胰腺导管腺癌（PDAC）患者的免疫相关预后模型和关键特征SPP1 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 多个PDAC数据集和TCGA_PAAD数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 99 | 2024-08-07 |
Multiple Perspectives Reveal the Role of DNA Damage Repair Genes in the Molecular Classification and Prognosis of Pancreatic Adenocarcinoma
2022-Sep-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms231810231
PMID:36142142
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研究论文 | 本研究通过转录组和基因组分析探讨了胰腺腺癌（PAAD）中DNA损伤修复（DDR）和免疫微环境的多样性，并基于DDR和免疫特征建立了一个5基因预后标志（DPRS），用于临床上区分高风险和低风险组。 | 本研究首次构建了一个基于DDR和免疫的胰腺腺癌风险评分模型，并验证了其在预测患者预后和药物反应中的可行性。 | NA | 研究胰腺腺癌中DNA损伤修复基因的作用及其在分子分类和预后中的角色。 | 胰腺腺癌患者及其DNA损伤修复和免疫微环境。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 转录组分析、基因组分析、单细胞测序、免疫组化 | NA | 基因表达数据 | 多个胰腺腺癌患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 100 | 2024-08-07 |
Increased expression of METTL3 in pancreatic cancer tissues associates with poor survival of the patients
2022-Sep-05, World journal of surgical oncology
IF:2.5Q1
DOI:10.1186/s12957-022-02743-7
PMID:36058919
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研究论文 | 本研究探讨了甲基转移酶样3（METTL3）在人胰腺癌（PC）组织中的表达及其对患者生存的临床意义 | 首次详细分析了METTL3在胰腺癌组织中的表达水平及其与患者生存率的关系 | 研究依赖于公开数据库的数据，可能存在样本选择偏倚 | 研究METTL3在胰腺癌中的预后价值和临床意义 | 胰腺癌组织中METTL3的表达及其对患者生存的影响 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 免疫组化, scRNA-seq | Cox模型分析 | mRNA表达数据 | 使用了TCGA, GTEx, 和GEO数据库中的样本 | NA | NA | NA | NA |