单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 277 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2024-08-08 |
Bone marrow-confined IL-6 signaling mediates the progression of myelodysplastic syndromes to acute myeloid leukemia
2022-09-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI152673
PMID:35900794
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研究论文 | 研究通过mDia1/miR-146a双敲除小鼠模型，探讨了骨髓中IL-6信号传导在骨髓增生异常综合征向急性髓系白血病转化中的作用 | 首次揭示了IL-6在骨髓增生异常综合征向急性髓系白血病转化中的关键作用，并证明了阻断IL-6信号传导对治疗高风险骨髓增生异常综合征的临床意义 | NA | 探讨骨髓增生异常综合征向急性髓系白血病转化的机制，特别是与衰老微环境相关的机制 | mDia1/miR-146a双敲除小鼠模型及高风险骨髓增生异常综合征患者 | NA | 骨髓增生异常综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | mDia1/miR-146a双敲除小鼠及高风险骨髓增生异常综合征患者 | NA | NA | NA | NA |
| 222 | 2024-08-08 |
Neutrophils, functions beyond host defense
2022-09, Cellular immunology
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.cellimm.2022.104579
PMID:35901576
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综述 | 本文综述了中性粒细胞在宿主防御之外的多功能性 | 利用单细胞测序等前沿技术揭示了中性粒细胞在稳态和炎症条件下的复杂性和可塑性 | NA | 探讨中性粒细胞在疾病和稳态环境下的异质性和功能 | 中性粒细胞及其与其他免疫细胞的相互作用 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 223 | 2024-08-08 |
Impact of single-cell RNA sequencing on understanding immune regulation
2022-09, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.17493
PMID:35906816
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术的发展及其在免疫相关生理状态、调控机制和疾病中的应用 | scRNA-seq技术揭示了以前未报告的细胞类型或状态，为疾病治疗和生物过程提供了新的启示 | 讨论了scRNA-seq在免疫调控中的机遇和挑战 | 深入理解细胞异质性及其对细胞发育和功能的重要性 | 单细胞RNA测序技术及其在免疫细胞异质性和疾病发病机制中的应用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 224 | 2024-08-08 |
SMGR: a joint statistical method for integrative analysis of single-cell multi-omics data
2022-Sep, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqac056
PMID:35910046
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研究论文 | 本文开发了一种名为SMGR的新方法，用于从不同样本的单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq）数据中检测一致的功能性调控信号和目标基因 | SMGR方法利用广义线性回归模型识别一致表达基因和峰的潜在表示，从而识别共调控程序并阐明调控机制 | NA | 旨在解决单细胞多组学数据整合分析中的挑战，提高分析的准确性 | 单细胞RNA测序和单细胞转座酶可及染色质测序数据 | 基因组学 | 急性混合表型白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq） | 广义线性回归模型 | 单细胞多组学数据 | 不同样本的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 225 | 2024-08-08 |
Gruffi: an algorithm for computational removal of stressed cells from brain organoid transcriptomic datasets
2022-09-01, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2022111118
PMID:35919947
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Gruffi的算法，用于从脑类器官转录组数据集中计算去除应激细胞 | 开发了一种新的计算算法Gruffi，通过粒度功能过滤来无偏地识别和去除应激细胞 | NA | 研究脑类器官中的细胞应激问题，并开发方法去除这些应激细胞以改善发育轨迹的划分 | 脑类器官和胎儿的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 约190,000个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 226 | 2024-08-08 |
CBLRR: a cauchy-based bounded constraint low-rank representation method to cluster single-cell RNA-seq data
2022-09-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac300
PMID:35870203
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研究论文 | 本文提出了一种基于柯西的边界约束低秩表示方法（CBLRR），用于聚类单细胞RNA测序数据 | 引入柯西损失函数（CLF）和有界核范数正则化，以增强细胞类型识别的鲁棒性并确保单细胞数据条目值在限制区间内 | NA | 旨在解决单细胞RNA测序数据聚类中的技术噪声和数据丢失问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 低秩表示方法 | 基因表达数据 | 15个单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 227 | 2024-08-08 |
FitDevo: accurate inference of single-cell developmental potential using sample-specific gene weight
2022-09-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac293
PMID:35870444
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research paper | 本文介绍了一种名为FitDevo的新方法，用于通过scRNA-seq数据推断细胞发育潜力 | FitDevo通过生成样本特定基因权重（SSGW）并计算其与基因表达的相关性来推断发育潜力，这种方法结合了样本特定信息和从训练数据集中学习的基因权重 | NA | 量化发育潜力，以确定发育阶段并识别单细胞研究中的关键分子特征 | 单细胞发育潜力 | natural language processing | NA | scRNA-seq | generalized linear model | scRNA-seq data | 训练数据集涵盖了17个已发表的数据集，测试数据集包括28个现有数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 228 | 2024-08-08 |
CST6 suppresses osteolytic bone disease in multiple myeloma by blocking osteoclast differentiation
2022-09-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI159527
PMID:35881476
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研究论文 | 研究通过结合PET-CT和基因表达谱分析，揭示了CST6在多发性骨髓瘤中抑制溶骨性骨病的作用机制 | 首次揭示了CST6在多发性骨髓瘤中通过抑制破骨细胞分化和功能来抑制溶骨性骨病的作用 | NA | 探究CST6在多发性骨髓瘤中抑制溶骨性骨病的分子机制 | 多发性骨髓瘤患者的骨髓CD138+细胞和破骨细胞分化 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | PET-CT, 基因表达谱分析, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 蛋白质水平数据 | 512名新诊断的多发性骨髓瘤患者 | NA | NA | NA | NA |
| 229 | 2024-08-08 |
Delineating COVID-19 immunological features using single-cell RNA sequencing
2022-Sep-13, Innovation (Cambridge (Mass.))
DOI:10.1016/j.xinn.2022.100289
PMID:35879967
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在揭示COVID-19患者不同严重程度下的免疫特征中的应用和发现 | 利用单细胞RNA测序技术详细描绘了COVID-19患者的细胞异质性和免疫反应特征 | 讨论了当前研究中的局限性，并展望了未来的发展方向 | 理解COVID-19的发病机制和免疫反应，为开发治疗方案提供依据 | COVID-19患者的免疫特征和细胞异质性 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 超过80项原始COVID-19单细胞RNA测序研究和许多二次分析研究 | NA | NA | NA | NA |
| 230 | 2024-08-08 |
Perfluorooctanoic acid (PFOA) exposure affects early embryonic development and offspring oocyte quality via inducing mitochondrial dysfunction
2022-09, Environment international
IF:10.3Q1
DOI:10.1016/j.envint.2022.107413
PMID:35863238
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研究论文 | 研究探讨了全氟辛酸（PFOA）暴露对早期胚胎发育和后代卵母细胞质量的影响及其机制 | 首次揭示了PFOA暴露在妊娠期间对早期胚胎发育和后代的影响，并通过单细胞转录组分析阐明了PFOA引起的卵母细胞质量下降的机制 | 研究主要集中在体外实验和小鼠模型上，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 探究PFOA暴露对早期胚胎发育和后代卵母细胞质量的影响及其潜在机制 | PFOA暴露对小鼠早期胚胎发育和后代卵母细胞质量的影响 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 小鼠胚胎和后代卵母细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 231 | 2024-08-08 |
Identification of differently expressed mRNAs by peripheral blood mononuclear cells in Vogt-Koyanagi-Harada disease
2022-Sep, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2021.06.002
PMID:35873021
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研究论文 | 本研究通过mRNA测序分析了Vogt-Koyanagi-Harada病（VKH）患者外周血单个核细胞（PBMC）的转录表达模式 | 首次揭示了VKH患者PBMC中差异表达基因及其潜在的生物学功能和信号通路 | 研究样本量较小，且仅限于特定治疗前后的比较 | 揭示VKH病的细胞和分子发病机制，探索新的治疗应用 | VKH病患者的外周血单个核细胞 | NA | Vogt-Koyanagi-Harada病 | mRNA测序 | NA | mRNA | 21个样本，包括7名VKH患者治疗前、7名治疗后及7名健康对照 | NA | NA | NA | NA |
| 232 | 2024-08-08 |
Latitudinal and longitudinal regulation of tissue macrophages in inflammatory diseases
2022-Sep, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2021.06.007
PMID:35873033
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综述 | 本文综述了组织巨噬细胞在炎症疾病中的横向和纵向调控机制 | 利用尖端技术如命运图谱、单细胞转录组学、诱导多能干细胞平台和纳米治疗材料等，深化了对巨噬细胞生物学及其在疾病发病机制中作用的认识 | NA | 总结组织巨噬细胞在炎症疾病中横向和纵向调控的最新进展 | 组织巨噬细胞及其在炎症疾病中的调控机制 | 免疫学 | 炎症性疾病 | 命运图谱、单细胞转录组学、诱导多能干细胞平台、纳米治疗材料 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 233 | 2024-08-08 |
Characterization of 2,2',4,4'-tetrabromodiphenyl ether (BDE47)-induced testicular toxicity via single-cell RNA-sequencing
2022-Sep, Precision clinical medicine
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/pcmedi/pbac016
PMID:35875604
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研究论文 | 本研究首次采用单细胞RNA测序技术分析了2,2',4,4'-四溴联苯醚（BDE47）诱导的小鼠青春前期睾丸毒性 | 首次利用单细胞RNA测序技术揭示了BDE47诱导的睾丸毒性的分子细胞图谱，提供了对BDE47相关睾丸损伤机制的新见解 | NA | 探讨BDE47诱导的男性生殖毒性的分子机制 | BDE47诱导的小鼠青春前期睾丸毒性 | 数字病理学 | 男性生殖疾病 | 单细胞RNA测序（ScRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 76,859个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 234 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome reveals effects of semaglutide on non-cardiomyocytes of obese mice
2022-09-24, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2022.07.034
PMID:35843090
|
研究论文 | 本研究使用单细胞转录组学方法探讨了Semaglutide对肥胖小鼠非心肌细胞的分子机制及其对心脏保护作用的影响 | 发现Semaglutide通过降低Serpinh1和Pcolce的表达，延缓心脏纤维化，从而具有心脏保护作用 | NA | 研究Semaglutide对肥胖小鼠心脏纤维化的分子机制及其心脏保护作用 | 肥胖小鼠的非心肌细胞 | 数字病理学 | 肥胖症 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | 15种非心肌细胞，其中大部分为成纤维细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 235 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptomics prediction from histology jointly through Transformer and graph neural networks
2022-09-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac297
PMID:35849101
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研究论文 | 本文开发了一种名为Hist2ST的深度学习模型，用于从组织学图像预测RNA-seq表达 | Hist2ST模型结合了Transformer和图神经网络模块，有效捕捉了2D视觉特征的内部关系和斑点间的空间依赖性 | NA | 旨在从相对容易且成本较低的组织学图像中预测基因表达 | 空间转录组学数据和组织学图像 | 数字病理学 | NA | 深度学习 | Transformer和图神经网络 | 图像 | 在癌症和正常数据集上进行了综合测试 | NA | NA | NA | NA |
| 236 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Profiling Reveals Intratumoral Heterogeneity and Molecular Features of Ductal Carcinoma In Situ
2022-Sep-16, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-0090
PMID:35852797
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序技术，揭示了原位导管癌（DCIS）的肿瘤内异质性和分子特征 | 首次通过单细胞转录组测序揭示了DCIS的转录异质性，并发现了与侵袭性表型相关的特定转录本 | NA | 探讨原位导管癌的生物学特征和肿瘤内异质性 | 原位导管癌（DCIS）及其侵袭性导管癌（IDC） | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 多个DCIS和IDC样本的单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 237 | 2024-08-08 |
Benchmarking computational methods for B-cell receptor reconstruction from single-cell RNA-seq data
2022-Sep, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqac049
PMID:35855325
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研究论文 | 评估六种现有方法从单细胞RNA测序数据中重建全长B细胞受体的能力 | 提出了选择最佳方法的指南，并验证了组装的B细胞受体在表达为单克隆抗体时能识别其预期目标 | 缺乏对影响性能的因素如测序深度、读长或体细胞超突变数量的全面评估 | 评估不同方法从单细胞RNA测序数据中重建全长B细胞受体的性能 | 六种现有方法和四种SMART-seq数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 一个模拟数据集和三个实验SMART-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 238 | 2024-08-08 |
A systematic evaluation of the computational tools for ligand-receptor-based cell-cell interaction inference
2022-09-16, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elac019
PMID:35822343
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研究论文 | 本文系统评估了用于推断基于配体-受体细胞间相互作用的计算工具 | 本文填补了关于当前基于配体-受体的细胞间相互作用预测工具在公共单细胞RNA测序数据集上的性能和运行结果的研究空白 | NA | 评估和比较用于预测基于配体-受体的细胞间相互作用的计算工具的性能 | 九种最新的基于配体-受体的细胞间相互作用预测计算工具 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-Seq) | NA | RNA | 15个经过充分研究的scRNA-Seq样本，对应约10万个单细胞在不同实验条件下的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 239 | 2024-08-08 |
Isolation of mouse ovarian follicles for single-cell RNA-seq and in vitro culture
2022-09-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101537
PMID:35830306
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研究论文 | 本文提供了一种结合单细胞基因组学和功能实验的方案，用于研究卵泡发育的逐步过程 | 该方案能够分离不同发育阶段的鼠卵巢卵泡，进行单细胞RNA测序和体外培养，从而解析和验证指导卵泡发育的关键分子事件 | NA | 研究卵泡发育的逐步过程 | 鼠卵巢卵泡 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 不同发育阶段的鼠卵巢卵泡 | NA | NA | NA | NA |
| 240 | 2024-08-08 |
Isolation of macrophages from mouse skin wounds for single-cell RNA sequencing
2022-Sep-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101488
PMID:35779263
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |