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当前共找到 277 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-09-02 |
Combined protein and transcript single-cell RNA sequencing in human peripheral blood mononuclear cells
2022-09-01, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-022-01382-4
PMID:36045343
|
研究论文 | 本文开发了结合蛋白质和转录组的单细胞RNA测序方法，用于人外周血单个核细胞（PBMCs）的研究，并展示了其在临床研究中的适用性。 | 首次将40种抗体与转录组单细胞测序结合，在PBMCs中实现更高分辨率的细胞亚群鉴定，优于传统流式细胞术、质谱流式或单独的单细胞RNA测序。 | 仅基于摘要，具体局限性未提及。 | 开发并验证结合蛋白质和转录组的单细胞RNA测序方法，用于PBMCs的临床研究，以评估疾病相关变化。 | 31名女性跨机构HIV研究参与者的外周血单个核细胞（PBMCs）。 | 单细胞测序 | HIV感染及心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）结合蛋白质抗体标记 | Seurat UMAP和Louvain聚类 | 单细胞转录组和蛋白质数据 | 31名参与者，共41,611个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2026-08-25 |
Single-cell analysis of immune cell transcriptome during HIV-1 infection and therapy
2022-09-29, BMC immunology
IF:2.9Q3
DOI:10.1186/s12865-022-00523-2
PMID:36175869
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序分析HIV-1感染及抗逆转录病毒治疗期间的免疫细胞转录组变化，揭示治疗未完全恢复的细胞功能障碍及潜在治疗靶点 | 首次在单细胞水平上高分辨率描绘慢性HIV-1感染及ART治疗后免疫细胞转录组的持续性扰动，并鉴定表达HIV-1转录本的T细胞中的关键调控因子 | 摘要中未提及研究局限性，可能包括样本量有限或仅针对外周血细胞 | 理解HIV-1感染和ART期间免疫细胞景观的动态变化，以定义细胞功能障碍及其在治疗中的印记 | 慢性未治疗HIV-1个体、接受ART的HIV-1感染个体、HIV-1阴性个体，以及健康供者CD4+ T细胞的早期HIV-1感染原代细胞模型 | 单细胞转录组学 | HIV-1感染 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 慢性未治疗HIV-1个体、ART治疗HIV-1个体、HIV-1阴性个体（具体数量未提供）及健康供者CD4+ T细胞（用于原代感染模型） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2026-08-25 |
Multi-context genetic modeling of transcriptional regulation resolves novel disease loci
2022-09-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-33212-0
PMID:36171194
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CONTENT的计算方法，利用跨环境的基因表达相关性结构，提高转录组关联研究（TWAS）的效力，并正确调整多重检验，从而发现新的疾病位点。 | CONTENT方法首次利用多环境表达研究中的个体内相关性，进行跨环境的错误发现率校正，并生成环境特异性和共享的基因表达成分，显著提高了遗传预测基因的数量和位点-表型关联的发现率。 | 本文未明确讨论CONTENT方法的局限性，但可能包括对单细胞数据噪声的敏感性或计算资源需求。 | 开发一种高效的计算方法，以改进TWAS分析，利用多环境表达数据的相关性结构，提高复杂性状相关基因和位点的发现能力。 | 研究对象为多组织bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据集，以及22个复杂性状的关联分析。 | 机器学习 | 复杂性状疾病 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 使用了多组织bulk和单细胞RNA-seq数据集，具体样本数未在摘要中提及。 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-08-24 |
Single-cell RNA transcriptome analysis of CNS immune cells reveals CXCL16/CXCR6 as maintenance factors for tissue-resident T cells that drive synapse elimination
2022-Sep-24, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-022-01111-0
PMID:36153630
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析小鼠西尼罗病毒恢复期前脑中的免疫细胞，揭示CXCL16/CXCR6信号通路在维持组织驻留T细胞和驱动突触消除中的作用 | 首次鉴定CXCL16/CXCR6趋化因子信号通路作为小胶质细胞和CD8+ T细胞之间的相互作用连接，调控病毒恢复后中枢神经系统中组织驻留记忆T细胞的维持和突触消除 | 研究仅在小鼠模型中开展，临床转化需进一步验证；未完全阐明CXCL16/CXCR6调控T细胞功能的分子机制 | 探究中枢神经系统免疫细胞间的相互作用，特别是T细胞与小胶质细胞之间的信号通路，以理解病毒感染后认知功能障碍的机制 | 小鼠西尼罗病毒恢复期的前脑免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 西尼罗病毒感染的神经系统后遗症 | 单细胞RNA测序 | 聚类分析、差异基因分析 | 单细胞转录组数据 | 小鼠前脑免疫细胞（未提供具体数量） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2026-08-23 |
Adipocyte mesenchymal transition contributes to mammary tumor progression
2022-09-13, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111362
PMID:36103820
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研究论文 | 本研究探讨脂肪细胞间质转化在乳腺肿瘤进展中的作用，发现肿瘤浸润脂肪组织中的脂肪细胞去分化成成纤维细胞样前体细胞并促进肿瘤生长 | 首次揭示肿瘤细胞与脂肪细胞的代谢相互作用诱导脂肪细胞间质转化，并证明去分化脂肪细胞转化为多种细胞类型，且干预这一过程可影响肿瘤进展 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究肥胖与癌症关联的机制，特别是脂肪细胞在肿瘤微环境中通过间质转化促进肿瘤进展的机制 | 乳腺肿瘤中的脂肪细胞及其去分化过程 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2026-08-23 |
Cell type-specific inference of differential expression in spatial transcriptomics
2022-09, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-022-01575-3
PMID:36050488
|
研究论文 | 提出一种名为C-SIDE的统计方法，用于在空间转录组数据中识别细胞类型特异性的差异表达基因，并考虑其他细胞类型的空间定位。 | C-SIDE通过加性混合模型明确考虑其他细胞类型的存在，能够准确估计细胞类型特异性表达，并支持多种组织情境和多样本统计分析。 | 文章未在摘要中提及具体的局限性。 | 开发一种统计方法，以解决空间转录组中因细胞类型组成变化和像素混合导致的差异表达检测难题。 | 空间转录组数据中的基因表达，涉及不同细胞类型和组织背景。 | 生物信息学、空间转录组学 | 阿尔茨海默病、肿瘤 | 空间转录组测序技术（Slide-seq、MERFISH、Visium） | 统计模型（对数线性混合模型） | 空间转录组数据（基因表达矩阵） | 未在摘要中指明具体样本量。 | 10x Genomics（用于Visium） | 空间转录组学 | 10x Visium（用于Visium数据） | 未在摘要中提供平台配置细节。 |
| 7 | 2026-08-22 |
Drepmel-A Multi-Omics Melanoma Drug Repurposing Resource for Prioritizing Drug Combinations and Understanding Tumor Microenvironment
2022-09-16, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11182894
PMID:36139469
|
研究论文 | 开发了一个名为DRepMel的多组学黑色素瘤药物重定位资源，用于优先排序药物组合并理解肿瘤微环境 | 提出了一个基于多组学药物重定位计算方法的Shiny应用，能够从七万三千种组合中预测合理的联合治疗方案，并利用单细胞RNA-seq数据识别对肿瘤微环境的潜在治疗影响 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 为黑色素瘤患者提供合理的联合治疗预测，并理解治疗对肿瘤微环境的影响 | 黑色素瘤患者 | 机器学习和计算生物学 | 黑色素瘤 | 全外显子测序、RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | 基因组数据、转录组数据、单细胞转录组数据 | 两个独立患者队列的批量样本 | NA | bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2026-08-22 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Molecular Features of Heterogeneity in the Murine Retinal Pigment Epithelium
2022-Sep-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms231810419
PMID:36142331
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示了小鼠视网膜色素上皮细胞异质性的分子特征 | 首次在小鼠视网膜色素上皮中识别出六个不同的细胞亚群，并发现一个具有干细胞/祖细胞特征的细胞群，为理解RPE发育和代谢网络提供新视角 | 仅使用两只年轻成年雄性小鼠，样本量有限，可能无法完全代表RPE细胞的全部异质性 | 评估小鼠视网膜色素上皮细胞的异质性，并建立转录组基线，以用于未来研究 | 两只年轻成年雄性C57BL/6J小鼠的视网膜色素上皮细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 2只小鼠，共5513个RPE细胞（2667和2846个） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9 | 2026-08-22 |
Targeting Glutamine Metabolism to Enhance Immunoprevention of EGFR-Driven Lung Cancer
2022-09, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202105885
PMID:35861366
|
研究论文 | 该研究探讨了靶向谷氨酰胺代谢的JHU083药物与EGFR肽疫苗联合使用对EGFR驱动的小鼠肺癌发生具有显著抑制效果，并增强抗肿瘤免疫反应。 | 首次报道JHU083作为一种口服谷氨酰胺拮抗剂前药，在肿瘤微环境中优先激活，与EGFR肽疫苗联合使用时能显著抑制EGFR驱动的肺癌发生，并发现Th1细胞在谷氨酰胺抑制下上调氧化代谢并呈现激活和记忆样表型。 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证其效果和安全性。 | 评估JHU083对EGFR驱动肺癌的预防和治疗效果，并探索其与EGFR肽疫苗联合使用的免疫机制。 | EGFR驱动的小鼠肺肿瘤模型及肿瘤微环境中的免疫细胞。 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 细胞计数数据 | 小鼠模型，具体样本数量未提供 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 未提供具体平台配置 |
| 10 | 2026-08-21 |
Protocol for the isolation of CD8+ tumor-infiltrating lymphocytes from human tumors and their characterization by single-cell immune profiling and multiome
2022-09-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101649
PMID:36065294
|
研究论文 | 本文提出了一种从人类肿瘤中分离CD8+肿瘤浸润淋巴细胞并进行单细胞免疫谱和多重组学表征的实验方案 | 建立了结合单细胞RNA测序、VDJ谱分析和染色质结构分析的综合方案，为CD8 TILs的表征提供了详细指导 | 未明确说明局限性 | 建立用于表征人类肿瘤中CD8 TILs异质性和免疫生物学的实验方案 | 人类肿瘤中的CD8+肿瘤浸润淋巴细胞 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序、VDJ测序、染色质可及性分析 | NA | 单细胞测序数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、单细胞VDJ测序、单细胞ATAC-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'、10x Chromium单细胞VDJ、10x Chromium单细胞ATAC |
| 11 | 2026-08-21 |
Heterogeneity and transcriptome changes of human CD8+ T cells across nine decades of life
2022-09-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-32869-x
PMID:36050300
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序研究人类CD8+ T细胞在九十年生命跨度的异质性和转录组变化，并开发预测细胞年龄的机器学习模型 | 首次结合横断面和纵向样本，全面描述CD8+ T细胞在九十年间的异质性变化，并揭示年龄相关基因表达变化的三种模式，开发出基于转录组特征预测细胞年龄的机器学习模型，并在HIV感染和CAR T细胞扩增两个独立情境中验证 | 摘要未提及明显局限性 | 阐明人类CD8+ T细胞在衰老过程中异质性和转录组变化及其机制，并建立预测模型 | 人类CD8+ T细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型（具体类型未指定） | 单细胞转录组数据 | 横断面和纵向样本，具体数量未提及 | 未提及 | 单细胞RNA测序 | 未提及 | 未提及 |
| 12 | 2026-05-31 |
JAG1-NOTCH4 mechanosensing drives atherosclerosis
2022-09-02, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abo7958
PMID:36044575
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研究论文 | 以猪、小鼠动脉及培养的人冠状动脉内皮细胞为对象，发现扰动血流激活JAG1-NOTCH4信号通路驱动动脉粥样硬化，并揭示内皮细胞异质性的调控机制 | 首次揭示Notch通路（JAG1-NOTCH4）在扰动血流感知中的功能，并阐明其通过调控内皮细胞异质性增强动脉粥样硬化易感性的机制 | 未明确说明，但从标题和摘要推断可能包括：研究主要集中在动物模型和体外培养细胞，人类动脉粥样硬化的直接证据有限 | 探究扰动血流如何通过Notch通路驱动动脉粥样硬化 | 猪动脉、小鼠动脉、培养的人冠状动脉内皮细胞 | 计算机视觉 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、光片成像 | NA | 基因表达数据、图像 | 猪动脉、小鼠动脉及培养的人冠状动脉内皮细胞（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 13 | 2026-04-28 |
Unsupervised cell functional annotation for single-cell RNA-seq
2022-Sep-27, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.276609.122
PMID:35764397
|
研究论文 | 开发了一种无监督的细胞功能注释方法UNIFAN，用于单细胞RNA测序数据 | UNIFAN是一种同时进行聚类和注释的神经网络方法，利用已知基因集来确定聚类，显著优于传统聚类方法 | 可能依赖已知基因集的完整性和准确性，未提及在未知细胞类型或复杂组织中的性能 | 改进单细胞RNA测序数据中细胞类型分配的准确性和可解释性 | 人类和小鼠的scRNA-seq数据集，来自多个不同器官 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经网络 | 基因表达数据 | 人类和小鼠scRNA-seq数据集，具体样本数量未提供 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2026-04-18 |
SECANT: a biology-guided semi-supervised method for clustering, classification, and annotation of single-cell multi-omics
2022-Sep, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgac165
PMID:36157595
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研究论文 | 本研究开发了一种名为SECANT的生物学引导的半监督方法，用于单细胞多组学数据的聚类、分类和注释 | SECANT的创新点包括：1) 利用表面蛋白数据中识别出的可靠细胞类型标签指导细胞聚类；2) 为每个细胞簇提供可靠的细胞类型通用注释；3) 利用具有不确定或缺失细胞类型标签的细胞来提高性能；4) 能够准确预测scRNA-seq数据中的可靠细胞类型 | NA | 开发一种新的单细胞多组学数据分析方法 | 单细胞多组学数据（特别是CITE-seq数据） | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | 半监督模型 | 单细胞多组学数据 | 公共和内部数据集（来自多个组织） | NA | 单细胞RNA-seq, CITE-seq | NA | NA |
| 15 | 2026-04-04 |
Bone marrow-confined IL-6 signaling mediates the progression of myelodysplastic syndromes to acute myeloid leukemia
2022-09-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI152673
PMID:35900794
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研究论文 | 本研究揭示了骨髓微环境中IL-6信号通路在骨髓增生异常综合征向急性髓系白血病转化中的关键作用 | 建立了模拟年龄相关MDS向AML进展的小鼠模型，并首次证明骨髓微环境特异性IL-6信号是白血病转化的关键驱动因素 | 研究主要基于小鼠模型，人类患者样本验证相对有限，且未详细探讨IL-6信号下游的具体分子机制 | 探究骨髓增生异常综合征向急性髓系白血病转化的分子机制，特别是衰老微环境的作用 | mDia1/miR-146a双敲除小鼠模型、高风险MDS患者的CD34阳性细胞 | NA | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及小鼠模型和MDS患者细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2026-03-30 |
Fast intratumor heterogeneity inference from single-cell sequencing data
2022-09, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-022-00298-x
PMID:38177468
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研究论文 | 本文介绍了一种名为HUNTRESS的计算方法，用于从单细胞测序数据中推断肿瘤内异质性 | HUNTRESS方法在运行时间上具有线性与二次方的优势，且在合理条件下能高概率计算肿瘤的真实进展历史 | NA | 开发一种快速且准确的算法来推断肿瘤内异质性 | 单细胞测序数据中的基因型矩阵 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 基因型矩阵 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2026-03-06 |
Early life stress exacerbates obesity in adult female mice via mineralocorticoid receptor-dependent increases in adipocyte triglyceride and glycerol content
2022-Sep-01, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2022.120718
PMID:35714704
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研究论文 | 本研究探讨了早期生活压力通过盐皮质激素受体依赖机制加剧成年雌性小鼠肥胖，特别是通过增加脂肪细胞甘油三酯和甘油含量 | 揭示了早期生活压力（MSEW）通过盐皮质激素受体（MR）介导的机制，影响脂肪细胞甘油外流和甘油三酯储存，从而加剧肥胖的新途径 | 研究仅针对雌性小鼠，未涉及雄性；且主要关注内脏脂肪（gWAT），其他脂肪库的影响未明确 | 探究早期生活压力对脂肪组织稳态功能的具体影响，以及盐皮质激素受体在介导肥胖反应中的作用 | 雌性小鼠的性腺白色脂肪组织（gWAT） | NA | 肥胖 | 脂质组学、转录组学、单细胞RNA测序、体外脂解实验 | NA | 脂质组学数据、转录组学数据、单细胞RNA测序数据 | 未明确具体样本数量，但涉及肥胖雌性MSEW小鼠与对照组的比较 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2026-03-02 |
Transcription and splicing regulation by NLRC5 shape the interferon response in human pancreatic β cells
2022-09-16, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abn5732
PMID:36103539
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研究论文 | 本研究揭示了转录因子NLRC5在人类胰腺β细胞中调控干扰素反应、HLA I类分子表达及可变剪接的核心作用 | 首次发现NLRC5不仅调控HLA I类分子和抗原呈递相关基因的表达，还介导IFNα对可变剪接的影响，从而参与β细胞新抗原生成 | 研究主要基于体外诱导的多能干细胞来源的胰岛样细胞和EndoC-βH1细胞系，未在完整人体组织中进行验证 | 阐明IFNα在1型糖尿病早期通过NLRC5调控β细胞免疫原性反应的分子机制 | 人类诱导多能干细胞来源的胰岛样细胞、EndoC-βH1细胞系以及人类胰岛细胞 | 单细胞组学 | 1型糖尿病 | RNA测序、单细胞RNA测序、靶向基因/蛋白检测 | NA | RNA测序数据、单细胞RNA测序数据 | 未明确具体样本数量，涉及多能干细胞来源的胰岛样细胞、EndoC-βH1细胞系和人类胰岛细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2026-03-02 |
CST6 suppresses osteolytic bone disease in multiple myeloma by blocking osteoclast differentiation
2022-09-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI159527
PMID:35881476
|
研究论文 | 本研究揭示了CST6通过抑制破骨细胞分化和功能，在多发性骨髓瘤中抑制溶骨性骨病的作用机制 | 首次发现CST6表达升高与多发性骨髓瘤患者无溶骨性病变显著相关，并阐明其通过阻断cathepsin K活性和NF-κB/p100、TRAF3的切割来抑制破骨细胞分化的分子机制 | 研究主要基于相关性分析和体外/体内模型，临床转化应用仍需进一步验证 | 探究多发性骨髓瘤中溶骨性骨病缺失的分子基础 | 多发性骨髓瘤患者骨髓CD138+细胞及破骨细胞分化过程 | NA | 多发性骨髓瘤 | PET-CT、基因表达谱分析、酶联免疫吸附试验、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质水平数据、单细胞转录组数据 | 512名新诊断的多发性骨髓瘤患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2025-10-05 |
Comparative analysis of transcriptome remodeling in plaque-associated and plaque-distant microglia during amyloid-β pathology progression in mice
2022-Sep-24, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-022-02581-0
PMID:36153535
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研究论文 | 本研究通过激光捕获显微切割和RNA测序分析，比较了阿尔茨海默病小鼠模型中斑块相关和斑块远离小胶质细胞在疾病不同阶段的转录组重塑 | 首次结合细胞特异性激光捕获显微切割和RNA-seq技术，无预设地识别斑块相关和斑块远离小胶质细胞在疾病关键阶段的基因失调网络 | 研究基于小鼠模型，人类验证仅使用死后脑组织样本 | 揭示斑块相关和斑块远离小胶质细胞在阿尔茨海默病进展中的不同贡献 | 阿尔茨海默病小鼠模型中的小胶质细胞亚群 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 激光捕获显微切割，RNA-seq，单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 阿尔茨海默病小鼠模型在疾病早期、中期和晚期阶段的小胶质细胞样本 | NA | RNA-seq | NA | NA |