单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 277 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-09-13 |
Comparative analysis of transcriptome remodeling in plaque-associated and plaque-distant microglia during amyloid-β pathology progression in mice
2022-Sep-24, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-022-02581-0
PMID:36153535
|
研究论文 | 本研究通过结合激光捕获显微切割和RNA测序技术，比较分析了阿尔茨海默病小鼠模型中斑块相关和斑块远离小胶质细胞在Aβ病理进展中的转录组重塑差异 | 首次直接分离并对比分析斑块相关和斑块远离小胶质细胞的转录组动态变化，避免了传统纯化方法引起的转录组改变，并保留了空间信息 | 研究基于小鼠模型，虽在人类死后脑组织中验证了部分发现，但仍需进一步临床验证 | 阐明斑块相关和斑块远离小胶质细胞在阿尔茨海默病Aβ病理进展中的不同贡献和作用机制 | APP/PS1转基因AD小鼠模型的小胶质细胞及人类死后脑组织 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 激光捕获显微切割, RNA-seq, scRNA-seq | NA | 转录组数据 | AD小鼠模型在疾病早期、中期和晚期三个关键阶段的小胶质细胞样本 |
| 2 | 2025-09-06 |
JAG1-NOTCH4 mechanosensing drives atherosclerosis
2022-09-02, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abo7958
PMID:36044575
|
研究论文 | 本研究揭示了JAG1-NOTCH4机械感应通路通过调节内皮细胞异质性促进动脉粥样硬化的机制 | 首次发现JAG1-NOTCH4信号通路在感知紊乱血流中的作用，并证明其通过调控内皮细胞亚群促进动脉粥样硬化 | NA | 探究紊乱血流通过JAG1-NOTCH4信号通路促进动脉粥样硬化的分子机制 | 猪和小鼠动脉、培养的人冠状动脉内皮细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、光片成像 | NA | 基因表达数据、成像数据 | 多种动物模型和细胞培养样本 |
| 3 | 2025-07-29 |
Uncoupling immune trajectories of response and adverse events from anti-PD-1 immunotherapy in hepatocellular carcinoma
2022-09, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2022.03.039
PMID:35430299
|
研究论文 | 本研究旨在解析肝细胞癌患者接受抗PD-1治疗时的免疫轨迹及反应机制，同时探讨免疫相关不良事件（irAEs）的关联 | 识别了与抗PD-1治疗反应和irAEs相关的CXCR3+CD8+效应记忆T细胞和CD11c+抗原呈递细胞，并提出了新的联合免疫治疗方案以增强疗效而不增加irAEs | 样本量相对较小（新加坡队列32例患者，韩国队列29例患者），且需要进一步验证新联合免疫治疗方案的临床效果 | 解析肝细胞癌患者接受抗PD-1治疗时的免疫轨迹及反应机制，并探讨免疫相关不良事件的关联 | 肝细胞癌患者 | 免疫治疗 | 肝细胞癌 | 飞行时间质谱流式细胞术、单细胞RNA测序、批量RNA测序 | 小鼠肝细胞癌模型 | 血液样本、肿瘤活检样本 | 新加坡队列32例患者（60份血液样本），韩国队列29例患者，20份肿瘤活检样本 |
| 4 | 2025-07-20 |
Single-cell transcriptome highlights a multilayer regulatory network on an invasive trajectory within colorectal cancer progression
2022-Sep, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-022-04020-2
PMID:35523976
|
研究论文 | 该研究通过单细胞转录组学揭示了结直肠癌进展中从癌症干细胞到侵袭性细胞的多层调控网络 | 构建了癌症干细胞到侵袭性细胞的转化路径（'stem-to-invasion path'）并揭示了多层调控网络，同时发现了一种新的组合生物标志物用于评估结直肠癌患者的预后 | 研究结果需要在更大规模的独立数据集中进一步验证 | 探索结直肠癌中癌症干细胞向侵袭性细胞转化的过程及其调控机制 | 结直肠癌中的癌症干细胞和侵袭性细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组学、生物信息学方法（聚类、伪时间分析、基因集变异分析、基因本体富集分析） | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确提及具体样本数量，但使用了独立的验证数据集 |
| 5 | 2025-06-05 |
Intratumor heterogeneity and T cell exhaustion in primary CNS lymphoma
2022-Sep-24, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-022-01110-1
PMID:36153593
|
研究论文 | 本研究通过流式细胞术、单细胞RNA测序和B细胞受体测序等方法，深入分析了原发性中枢神经系统淋巴瘤（PCNSL）的肿瘤内异质性和T细胞耗竭现象 | 首次在PCNSL中揭示了恶性B细胞的转录和空间肿瘤内异质性，并发现T细胞耗竭与恶性细胞共定位的现象 | 研究样本量有限，且仅来自活检、血液和脑脊液 | 探究PCNSL的肿瘤内异质性和免疫微环境特征 | 原发性中枢神经系统淋巴瘤（PCNSL）细胞和肿瘤微环境中的T细胞 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、B细胞受体测序、空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 | 来自活检、血液和脑脊液的PCNSL细胞 |
| 6 | 2025-04-06 |
Ensembles of endothelial and mural cells promote angiogenesis in prenatal human brain
2022-09-29, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2022.09.004
PMID:36179668
|
研究论文 | 研究揭示了人类胎儿大脑中血管细胞成熟的关键机制及其与神经发生的相互作用 | 首次在妊娠中期人类大脑中发现内皮细胞和周细胞亚型的组合，并揭示其通过胶原蛋白、层粘连蛋白和中期因子等信号机制促进细胞间通讯和成熟 | 研究主要关注妊娠中期，未涵盖整个胎儿发育过程 | 探索人类胎儿大脑血管细胞成熟的机制及其与神经发生的相互作用 | 人类胎儿大脑中的血管细胞（内皮细胞和周细胞） | 发育生物学 | NA | 荧光激活细胞分选、单细胞转录组学、组织学和超微结构分析 | NA | 单细胞转录组数据、组织学图像、超微结构数据 | 妊娠中期人类胎儿大脑样本 |
| 7 | 2025-03-19 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Molecular Features of Heterogeneity in the Murine Retinal Pigment Epithelium
2022-Sep-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms231810419
PMID:36142331
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术揭示了小鼠视网膜色素上皮（RPE）细胞的异质性分子特征 | 首次在小鼠RPE细胞中应用单细胞RNA测序技术，揭示了六种不同的细胞群体及其在RPE成熟过程中的基因表达变化 | 研究仅基于两只年轻成年雄性C57BL/6J小鼠的RPE细胞，样本量较小 | 评估RPE细胞的异质性，并识别影响RPE发育、维持、功能和疾病的细胞网络 | 小鼠视网膜色素上皮（RPE）细胞 | 生物信息学 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序 | PCA, UMAP, K-means聚类 | RNA测序数据 | 两只年轻成年雄性C57BL/6J小鼠的2667和2846个RPE细胞 |
| 8 | 2025-02-14 |
[Research advances on the role and mechanism of epidermal stem cells in skin wound repair]
2022-Sep-20, Zhonghua shao shang yu chuang mian xiu fu za zhi
|
综述 | 本文综述了表皮干细胞在皮肤自我更新和伤口修复中的作用及其机制 | 结合单细胞测序和基因敲除等新技术和新概念，揭示了表皮干细胞在表皮自我更新和伤口修复中的新机制 | NA | 探讨表皮干细胞在皮肤伤口修复中的作用和机制 | 表皮干细胞 | NA | NA | 单细胞测序, 基因敲除 | NA | NA | NA |
| 9 | 2025-01-16 |
Archetype tasks link intratumoral heterogeneity to plasticity and cancer hallmarks in small cell lung cancer
2022-09-21, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2022.07.006
PMID:35981544
|
研究论文 | 本文通过原型任务分析，将小细胞肺癌（SCLC）肿瘤内的异质性与可塑性及癌症标志联系起来 | 应用原型分析模型，通过多任务进化理论重新构建SCLC表型异质性，揭示了细胞状态转换与治疗适应性和生存率的关系 | 研究主要基于细胞系和肿瘤转录组数据，可能无法完全反映体内复杂情况 | 探索小细胞肺癌肿瘤内异质性与细胞可塑性及癌症标志的关系 | 小细胞肺癌（SCLC）肿瘤细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 转录组分析 | 原型分析模型 | 转录组数据 | 细胞系和肿瘤样本 |
| 10 | 2024-12-15 |
scAllele: A versatile tool for the detection and analysis of variants in scRNA-seq
2022-Sep-02, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abn6398
PMID:36054357
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为scAllele的工具，用于在单细胞RNA测序数据中检测和分析变异 | scAllele能够检测单核苷酸变异、插入、删除及其与剪接模式的等位基因连锁，并支持等位基因特异性剪接分析，这是其他方法不具备的独特功能 | NA | 开发一种能够从单细胞RNA测序数据中提取多层次信息并揭示新生物学见解的工具 | 单细胞RNA测序数据中的变异及其与剪接模式的关联 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 11 | 2024-12-12 |
Single-cell transcriptomics identifies conserved regulators of neuroglandular lineages
2022-09-20, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111370
PMID:36130520
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了刺胞动物Nematostella vectensis中神经和腺体细胞谱系的共同起源和调控机制 | 首次揭示了神经元、刺细胞和腺细胞来自一个共同的多能祖细胞，并发现了保守的转录因子SoxC在调控这些谱系中的关键作用 | 研究仅限于刺胞动物Nematostella vectensis，可能无法完全代表所有生物的神经和腺体细胞谱系 | 探讨神经元与其他分泌细胞类型的进化起源及其关系 | 刺胞动物Nematostella vectensis中的神经元、刺细胞和腺细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 12 | 2024-12-06 |
3D chromatin maps of the human pancreas reveal lineage-specific regulatory architecture of T2D risk
2022-09-06, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2022.08.014
PMID:36070683
|
研究论文 | 研究通过生成人类胰腺腺泡细胞、α细胞和β细胞的单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序和高分辨率Hi-C数据，揭示了T2D风险的细胞类型特异性调控架构 | 首次利用3D染色质组织图谱揭示了胰腺不同细胞类型在T2D风险中的特异性调控机制 | 研究主要集中在胰腺细胞类型，未涵盖其他可能影响T2D的细胞类型 | 理解糖尿病风险的细胞类型特异性调控架构 | 人类胰腺的腺泡细胞、α细胞和β细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、高分辨率Hi-C | NA | 基因组数据 | 4,750个潜在的因果变异-目标基因对，涉及194个T2D GWAS信号 |
| 13 | 2024-11-17 |
Integrated identification of growth pattern and taxon of bacterium in gut microbiota via confocal fluorescence imaging-oriented single-cell sequencing
2022-Sep, mLife
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mlf2.12041
PMID:38818223
|
研究论文 | 本文提出了一种结合荧光探针标记、共聚焦成像和单细胞测序的综合策略，用于识别小鼠肠道微生物群中细菌的生长模式和分类 | 本文的创新点在于将荧光探针标记、共聚焦成像和单细胞测序相结合，实现了对肠道细菌生长模式和分类的集成识别 | 本文的局限性在于仅在小鼠肠道微生物群中进行了验证，尚未在其他复杂细菌系统中进行广泛应用 | 本文的研究目的是开发一种高通量的方法，用于直接研究肠道微生物群中细菌的体内活动和过程 | 本文的研究对象是小鼠肠道微生物群中的细菌 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 图像 | 小鼠肠道细菌 |
| 14 | 2024-09-30 |
Spatially informed cell-type deconvolution for spatial transcriptomics
2022-09, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01273-7
PMID:35501392
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于条件自回归的解卷积方法（CARD），用于空间转录组学中的细胞类型解卷积 | CARD方法结合了单细胞RNA测序（scRNA-seq）的细胞类型特异性表达信息与细胞类型组成在组织位置间的相关性，能够提高解卷积的准确性，并能在没有scRNA-seq参考数据的情况下进行解卷积 | NA | 开发一种新的解卷积方法，以提高空间转录组学数据中细胞类型组成的准确性 | 空间转录组学数据中的细胞类型组成和基因表达水平 | 空间转录组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 条件自回归模型 | 基因表达数据 | 四个数据集，包括一个胰腺癌数据集 |
| 15 | 2024-09-23 |
Impact of T-cell immunity on chemotherapy response in childhood acute lymphoblastic leukemia
2022-09-29, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2021014495
PMID:35675514
|
研究论文 | 本文研究了T细胞免疫对儿童急性淋巴细胞白血病化疗反应的影响 | 首次系统评估了T细胞免疫对Ph+ ALL治疗结果的影响，并揭示了T细胞免疫在抑制耐药白血病细胞生长中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和少量儿童样本，需要进一步的人体临床研究验证 | 探讨T细胞免疫在儿童急性淋巴细胞白血病化疗反应中的作用 | T细胞免疫、Ph+ ALL、化疗反应 | NA | 白血病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 102名儿童 |
| 16 | 2024-09-23 |
DNMT3A mutations define a unique biological and prognostic subgroup associated with cytotoxic T cells in PTCL-NOS
2022-09-15, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2021015019
PMID:35639959
|
研究论文 | 研究探讨了DNMT3A突变在PTCL-NOS中的作用及其与细胞毒性T细胞的关系 | 首次发现DNMT3A突变在PTCL-TBX21中与细胞毒性T细胞基因特征的显著富集相关，并验证了其在免疫组化和基因表达层面的影响 | 研究主要集中在PTCL-TBX21和PTCL-GATA3亚型，其他PTCL亚型的研究较少 | 探讨DNMT3A突变在PTCL-NOS中的生物学意义及其对预后的影响 | PTCL-NOS中的DNMT3A突变及其与细胞毒性T细胞的关系 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括PTCL-TBX21和PTCL-GATA3亚型的多个病例，以及CD8+ T细胞系和原代CD3+ T细胞培养 |
| 17 | 2024-09-23 |
Single-cell analyses reveal early thymic progenitors and pre-B cells in zebrafish
2022-09-05, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20220038
PMID:35938989
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了斑马鱼骨髓和胸腺中的约70,000个细胞，揭示了斑马鱼免疫细胞发育的基因表达图谱 | 首次在斑马鱼中发现了早期胸腺祖细胞和前B细胞，并揭示了B细胞和T细胞的发育轨迹 | NA | 阐明斑马鱼淋巴细胞发育的关键方面，并探索其效应功能的广度 | 斑马鱼的免疫细胞发育 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 约70,000个细胞 |
| 18 | 2024-09-23 |
Secretory Cells Are the Primary Source of pIgR in Small Airways
2022-09, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2021-0548OC
PMID:35687143
|
研究论文 | 研究探讨了慢性阻塞性肺疾病（COPD）小气道中分泌性IgA（SIgA）丢失的原因及其与pIgR表达的关系 | 首次在单细胞分辨率下定义和量化了人类气道中pIgR表达的细胞类型，并评估了中性粒细胞弹性蛋白酶和非类型细菌分泌的蛋白酶对SIgA降解的影响 | 研究主要集中在人类和小鼠模型上，可能无法完全代表所有COPD患者的复杂情况 | 探讨COPD小气道中SIgA丢失的原因及其与pIgR表达的关系 | 人类和小鼠的气道细胞，特别是分泌细胞和纤毛细胞 | NA | 慢性阻塞性肺疾病 | RNA杂交、免疫染色、单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类和小鼠的气道细胞样本 |
| 19 | 2024-09-23 |
Single-cell Transcriptomics Reveals Dynamic Role of Smooth Muscle Cells and Enrichment of Immune Cell Subsets in Human Abdominal Aortic Aneurysms
2022-09-01, Annals of surgery
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/SLA.0000000000005551
PMID:35762613
|
研究论文 | 研究通过单细胞转录组学揭示了平滑肌细胞和免疫细胞亚群在人类腹主动脉瘤中的动态作用 | 首次全面描述了人类腹主动脉瘤组织中的细胞景观，并通过单细胞RNA测序识别了17个代表8种细胞谱系的集群 | NA | 确定与腹主动脉瘤发展相关的细胞特异性基因表达谱 | 腹主动脉瘤组织和对照组织中的细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 20 | 2024-09-23 |
Diverse stem cells for periodontal tissue formation and regeneration
2022-09, Genesis (New York, N.Y. : 2000)
DOI:10.1002/dvg.23495
PMID:35916433
|
研究论文 | 本文探讨了牙周组织形成和再生中多种干细胞的作用 | 利用单细胞RNA测序分析揭示了牙周组织中细胞的异质性和细胞类型特异性标记，以及它们与牙囊中前体细胞的发育关系 | NA | 揭示牙周组织中间充质祖细胞的基本特性，为未来开发更有效的基于干细胞的牙周组织再生疗法提供新知识 | 牙周组织中的间充质干细胞（PDLSCs）及其在牙周再生中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |