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当前共找到 277 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-04-28 |
Unsupervised cell functional annotation for single-cell RNA-seq
2022-Sep-27, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.276609.122
PMID:35764397
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研究论文 | 开发了一种无监督的细胞功能注释方法UNIFAN，用于单细胞RNA测序数据 | UNIFAN是一种同时进行聚类和注释的神经网络方法，利用已知基因集来确定聚类，显著优于传统聚类方法 | 可能依赖已知基因集的完整性和准确性，未提及在未知细胞类型或复杂组织中的性能 | 改进单细胞RNA测序数据中细胞类型分配的准确性和可解释性 | 人类和小鼠的scRNA-seq数据集，来自多个不同器官 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经网络 | 基因表达数据 | 人类和小鼠scRNA-seq数据集，具体样本数量未提供 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2026-04-18 |
SECANT: a biology-guided semi-supervised method for clustering, classification, and annotation of single-cell multi-omics
2022-Sep, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgac165
PMID:36157595
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研究论文 | 本研究开发了一种名为SECANT的生物学引导的半监督方法，用于单细胞多组学数据的聚类、分类和注释 | SECANT的创新点包括：1) 利用表面蛋白数据中识别出的可靠细胞类型标签指导细胞聚类；2) 为每个细胞簇提供可靠的细胞类型通用注释；3) 利用具有不确定或缺失细胞类型标签的细胞来提高性能；4) 能够准确预测scRNA-seq数据中的可靠细胞类型 | NA | 开发一种新的单细胞多组学数据分析方法 | 单细胞多组学数据（特别是CITE-seq数据） | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | 半监督模型 | 单细胞多组学数据 | 公共和内部数据集（来自多个组织） | NA | 单细胞RNA-seq, CITE-seq | NA | NA |
| 3 | 2026-04-04 |
Bone marrow-confined IL-6 signaling mediates the progression of myelodysplastic syndromes to acute myeloid leukemia
2022-09-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI152673
PMID:35900794
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研究论文 | 本研究揭示了骨髓微环境中IL-6信号通路在骨髓增生异常综合征向急性髓系白血病转化中的关键作用 | 建立了模拟年龄相关MDS向AML进展的小鼠模型，并首次证明骨髓微环境特异性IL-6信号是白血病转化的关键驱动因素 | 研究主要基于小鼠模型，人类患者样本验证相对有限，且未详细探讨IL-6信号下游的具体分子机制 | 探究骨髓增生异常综合征向急性髓系白血病转化的分子机制，特别是衰老微环境的作用 | mDia1/miR-146a双敲除小鼠模型、高风险MDS患者的CD34阳性细胞 | NA | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及小鼠模型和MDS患者细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-03-30 |
Fast intratumor heterogeneity inference from single-cell sequencing data
2022-09, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-022-00298-x
PMID:38177468
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研究论文 | 本文介绍了一种名为HUNTRESS的计算方法，用于从单细胞测序数据中推断肿瘤内异质性 | HUNTRESS方法在运行时间上具有线性与二次方的优势，且在合理条件下能高概率计算肿瘤的真实进展历史 | NA | 开发一种快速且准确的算法来推断肿瘤内异质性 | 单细胞测序数据中的基因型矩阵 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 基因型矩阵 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2026-03-06 |
Early life stress exacerbates obesity in adult female mice via mineralocorticoid receptor-dependent increases in adipocyte triglyceride and glycerol content
2022-Sep-01, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2022.120718
PMID:35714704
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研究论文 | 本研究探讨了早期生活压力通过盐皮质激素受体依赖机制加剧成年雌性小鼠肥胖，特别是通过增加脂肪细胞甘油三酯和甘油含量 | 揭示了早期生活压力（MSEW）通过盐皮质激素受体（MR）介导的机制，影响脂肪细胞甘油外流和甘油三酯储存，从而加剧肥胖的新途径 | 研究仅针对雌性小鼠，未涉及雄性；且主要关注内脏脂肪（gWAT），其他脂肪库的影响未明确 | 探究早期生活压力对脂肪组织稳态功能的具体影响，以及盐皮质激素受体在介导肥胖反应中的作用 | 雌性小鼠的性腺白色脂肪组织（gWAT） | NA | 肥胖 | 脂质组学、转录组学、单细胞RNA测序、体外脂解实验 | NA | 脂质组学数据、转录组学数据、单细胞RNA测序数据 | 未明确具体样本数量，但涉及肥胖雌性MSEW小鼠与对照组的比较 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2026-03-02 |
Transcription and splicing regulation by NLRC5 shape the interferon response in human pancreatic β cells
2022-09-16, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abn5732
PMID:36103539
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研究论文 | 本研究揭示了转录因子NLRC5在人类胰腺β细胞中调控干扰素反应、HLA I类分子表达及可变剪接的核心作用 | 首次发现NLRC5不仅调控HLA I类分子和抗原呈递相关基因的表达，还介导IFNα对可变剪接的影响，从而参与β细胞新抗原生成 | 研究主要基于体外诱导的多能干细胞来源的胰岛样细胞和EndoC-βH1细胞系，未在完整人体组织中进行验证 | 阐明IFNα在1型糖尿病早期通过NLRC5调控β细胞免疫原性反应的分子机制 | 人类诱导多能干细胞来源的胰岛样细胞、EndoC-βH1细胞系以及人类胰岛细胞 | 单细胞组学 | 1型糖尿病 | RNA测序、单细胞RNA测序、靶向基因/蛋白检测 | NA | RNA测序数据、单细胞RNA测序数据 | 未明确具体样本数量，涉及多能干细胞来源的胰岛样细胞、EndoC-βH1细胞系和人类胰岛细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2026-03-02 |
CST6 suppresses osteolytic bone disease in multiple myeloma by blocking osteoclast differentiation
2022-09-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI159527
PMID:35881476
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研究论文 | 本研究揭示了CST6通过抑制破骨细胞分化和功能，在多发性骨髓瘤中抑制溶骨性骨病的作用机制 | 首次发现CST6表达升高与多发性骨髓瘤患者无溶骨性病变显著相关，并阐明其通过阻断cathepsin K活性和NF-κB/p100、TRAF3的切割来抑制破骨细胞分化的分子机制 | 研究主要基于相关性分析和体外/体内模型，临床转化应用仍需进一步验证 | 探究多发性骨髓瘤中溶骨性骨病缺失的分子基础 | 多发性骨髓瘤患者骨髓CD138+细胞及破骨细胞分化过程 | NA | 多发性骨髓瘤 | PET-CT、基因表达谱分析、酶联免疫吸附试验、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质水平数据、单细胞转录组数据 | 512名新诊断的多发性骨髓瘤患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2025-10-05 |
Comparative analysis of transcriptome remodeling in plaque-associated and plaque-distant microglia during amyloid-β pathology progression in mice
2022-Sep-24, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-022-02581-0
PMID:36153535
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研究论文 | 本研究通过激光捕获显微切割和RNA测序分析，比较了阿尔茨海默病小鼠模型中斑块相关和斑块远离小胶质细胞在疾病不同阶段的转录组重塑 | 首次结合细胞特异性激光捕获显微切割和RNA-seq技术，无预设地识别斑块相关和斑块远离小胶质细胞在疾病关键阶段的基因失调网络 | 研究基于小鼠模型，人类验证仅使用死后脑组织样本 | 揭示斑块相关和斑块远离小胶质细胞在阿尔茨海默病进展中的不同贡献 | 阿尔茨海默病小鼠模型中的小胶质细胞亚群 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 激光捕获显微切割，RNA-seq，单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 阿尔茨海默病小鼠模型在疾病早期、中期和晚期阶段的小胶质细胞样本 | NA | RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2025-10-06 |
JAG1-NOTCH4 mechanosensing drives atherosclerosis
2022-09-02, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abo7958
PMID:36044575
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研究论文 | 本研究揭示了JAG1-NOTCH4信号通路通过感知紊乱血流促进动脉粥样硬化的机制 | 首次发现JAG1-NOTCH4通路在感知紊乱血流中的作用及其通过调节内皮细胞异质性促进动脉粥样硬化的新机制 | 研究主要基于动物模型和体外细胞实验，需要进一步验证在人类疾病中的直接相关性 | 探究紊乱血流通过JAG1-NOTCH4信号通路促进动脉粥样硬化的分子机制 | 猪和鼠的动脉组织、培养的人类冠状动脉内皮细胞 | 心血管生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,光片成像 | NA | 基因表达数据,成像数据 | 多种动物模型和细胞培养体系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2025-10-06 |
Omnibus and robust deconvolution scheme for bulk RNA sequencing data integrating multiple single-cell reference sets and prior biological knowledge
2022-09-30, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac563
PMID:35980155
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研究论文 | 提出一种整合多个单细胞参考集和先验生物知识的稳健反卷积算法InteRD，用于从批量RNA测序数据推断细胞类型比例 | 开发了带惩罚回归和新评估标准的反卷积算法，能有效整合多个单细胞数据集并利用先验生物信息进行校准 | 算法性能仍依赖于外部数据源的质量和先验信息的准确性 | 开发更准确和稳健的细胞类型反卷积方法 | 批量RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, scRNA-seq | 惩罚回归模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2025-10-06 |
Ensembles of endothelial and mural cells promote angiogenesis in prenatal human brain
2022-09-29, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2022.09.004
PMID:36179668
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研究论文 | 本研究揭示了产前人类大脑中内皮细胞和周细胞协同促进血管生成的新机制 | 首次在人类产前大脑中发现内皮细胞和周细胞亚型组成的功能性集合体，并揭示其通过胶原蛋白、层粘连蛋白和中动蛋白等信号机制促进血管成熟 | 研究主要聚焦于妊娠中期的发育阶段，缺乏对其他发育时期的比较分析 | 探索产前人类大脑血管细胞成熟阶段的分子机制和细胞相互作用 | 产前人类大脑血管系统中的内皮细胞和周细胞 | 单细胞生物学 | NA | 荧光激活细胞分选, 单细胞转录组学, 组织学分析, 超微结构分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 组织图像数据 | 妊娠中期人类大脑样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2025-10-06 |
Uncoupling immune trajectories of response and adverse events from anti-PD-1 immunotherapy in hepatocellular carcinoma
2022-09, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2022.03.039
PMID:35430299
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了肝细胞癌患者接受抗PD-1免疫治疗的应答和不良反应的免疫轨迹机制 | 首次在肝细胞癌中识别出与抗PD-1治疗应答和不良反应相关的CXCR3+CD8+效应记忆T细胞和CD11c+抗原呈递细胞，并提出了抗PD-1与抗TNFR2联合治疗新策略 | 样本量相对有限（新加坡队列32例，韩国队列29例），需要在更大规模研究中验证 | 解析肝细胞癌患者接受抗PD-1免疫治疗的应答和免疫相关不良反应的免疫机制 | 肝细胞癌患者和小鼠肝细胞癌模型 | 免疫学 | 肝细胞癌 | 飞行时间质谱流式细胞术, 单细胞RNA测序, 流式细胞术验证, 批量RNA测序 | 小鼠肝细胞癌模型 | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据, 批量RNA测序数据 | 新加坡队列32例患者60份外周血样本，韩国队列29例患者，20份治疗前后肿瘤活检样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 13 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome highlights a multilayer regulatory network on an invasive trajectory within colorectal cancer progression
2022-Sep, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-022-04020-2
PMID:35523976
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示结直肠癌中从癌症干细胞到侵袭性细胞的多层调控网络 | 首次构建了结直肠癌中'干细胞-侵袭路径'的分支轨迹，并建立了多层调控网络来阐明肿瘤细胞获得侵袭特性的关键机制 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步的实验验证 | 探索结直肠癌中癌症干细胞向侵袭性细胞转化的分子机制 | 结直肠癌肿瘤微环境中的细胞，特别是恶性上皮细胞 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序，生物信息学分析 | 聚类分析，伪时间分析，基因集变异分析，基因本体富集分析 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2025-10-06 |
The promising role of new molecular biomarkers in prostate cancer: from coding and non-coding genes to artificial intelligence approaches
2022-09, Prostate cancer and prostatic diseases
IF:5.1Q1
DOI:10.1038/s41391-022-00537-2
PMID:35422101
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综述 | 本文系统综述了前列腺癌新型分子标志物（包括编码和非编码基因）及人工智能方法的最新研究进展 | 整合了转录组学、基因组学和人工智能方法在前列腺癌生物标志物发现中的协同应用 | NA | 概述通过转录组学、基因组学和人工智能发现新型分子标志物的最新进展，以改善前列腺癌患者的临床管理 | 前列腺癌相关分子标志物和人工智能分析方法 | 自然语言处理 | 前列腺癌 | 全基因组测序, RNA测序, 外显子组测序, 空间转录组学 | 机器学习, 深度学习 | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 全基因组测序, 外显子组测序, RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2025-10-06 |
Intratumor heterogeneity and T cell exhaustion in primary CNS lymphoma
2022-Sep-24, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-022-01110-1
PMID:36153593
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研究论文 | 本研究通过多组学技术分析原发性中枢神经系统淋巴瘤的肿瘤异质性和T细胞耗竭特征 | 首次结合单细胞RNA测序、B细胞受体测序和空间转录组学技术系统揭示PCNSL的瘤内异质性及T细胞耗竭空间分布特征 | 样本量有限且仅来自活检组织、血液和脑脊液，可能无法完全代表肿瘤整体特征 | 深入表征原发性中枢神经系统淋巴瘤的肿瘤异质性和免疫微环境特征 | 原发性中枢神经系统淋巴瘤患者活检组织、血液和脑脊液样本 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 流式细胞术,单细胞RNA测序,B细胞受体测序,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,B细胞受体序列数据 | 未明确具体样本数量（包含活检组织、血液和脑脊液样本） | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 16 | 2025-10-06 |
Single cell and spatial transcriptomic analyses reveal microglia-plasma cell crosstalk in the brain during Trypanosoma brucei infection
2022-09-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-33542-z
PMID:36180478
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组分析揭示布氏锥虫感染期间大脑中微胶质细胞与浆细胞的相互作用机制 | 首次发现稳态微胶质细胞与CD138浆细胞通过IL-10和BAFF信号传导的新型相互作用 | 对慢性布氏锥虫感染期间大脑转录和功能反应的理解仍不完整 | 研究布氏锥虫感染期间大脑的分子和细胞反应机制 | 小鼠大脑组织 | 空间转录组学 | 寄生虫感染疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 17 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing reveals activation of core transcription factors in PRC2-deficient malignant peripheral nerve sheath tumor
2022-09-20, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111363
PMID:36130486
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研究论文 | 通过单细胞测序揭示PRC2缺陷型恶性外周神经鞘瘤中核心转录因子的激活机制 | 发现PRC2缺失通过双重致癌机制：重塑二价染色质和增强子景观，同时降低I型干扰素信号和抗原呈递 | NA | 阐明PRC2缺失在恶性外周神经鞘瘤中的致癌机制 | PRC2缺陷型恶性外周神经鞘瘤细胞和正常雪旺细胞 | 单细胞测序 | 恶性外周神经鞘瘤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 18 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics identifies conserved regulators of neuroglandular lineages
2022-09-20, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111370
PMID:36130520
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了刺胞动物神经和腺体细胞谱系的共同起源和调控机制 | 首次在刺胞动物中证明神经元、刺细胞和腺细胞来源于共同的多能祖细胞群体，并鉴定SoxC为神经腺体谱系的关键上游调控因子 | 研究仅针对一种刺胞动物模型，在其他物种中的保守性需要进一步验证 | 探究神经系统分泌细胞类型的进化起源和发育调控机制 | 海葵Nematostella vectensis的神经腺体细胞谱系 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 转基因技术 | NA | 单细胞转录组数据 | 海葵从胚胎到成体的多个发育阶段样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2025-10-06 |
Benchmarking methods for detecting differential states between conditions from multi-subject single-cell RNA-seq data
2022-09-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac286
PMID:35880426
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研究论文 | 对18种多主体单细胞RNA测序数据中条件间差异状态检测方法进行全面比较 | 首次对多主体scRNA-seq数据中检测条件间差异状态的所有现有方法进行系统性比较 | 研究仅针对特定类型的多主体实验设计，可能不适用于所有单细胞研究场景 | 评估不同统计方法在多主体单细胞RNA测序数据中检测条件间差异状态的性能 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型特异性差异表达 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 伪批量方法、混合模型、潜在变量模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2025-10-06 |
SimBu: bias-aware simulation of bulk RNA-seq data with variable cell-type composition
2022-09-16, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac499
PMID:36124800
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研究论文 | 开发了一个名为SimBu的R软件包，用于模拟具有可变细胞类型组成的bulk RNA-seq数据 | 首个能够模拟伪bulk RNA-seq数据的软件，具有独特的细胞类型特异性mRNA偏倚建模功能 | 依赖于单细胞RNA-seq数据作为输入，模拟结果的准确性受输入数据质量影响 | 为细胞类型反卷积方法评估创建计算金标准数据集 | bulk RNA-seq数据的模拟生成 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | 统计模拟模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |