单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 250 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis reveals differences among iNKT cells colonizing peripheral organs and identifies Klf2 as a key gene for iNKT emigration
2022-Aug-02, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-022-00432-z
PMID:35915069
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了不同外周器官中不变自然杀伤T细胞（iNKT细胞）的差异，并揭示了Klf2转录因子在iNKT细胞迁移和分化中的关键作用 | 首次揭示了iNKT细胞在外周器官中的表型和功能差异，并发现了Klf2在iNKT细胞迁移和分化中的重要作用 | NA | 探究iNKT细胞在外周器官中的分布差异及其迁移机制 | iNKT细胞在外周器官中的表型和功能差异，以及Klf2在iNKT细胞迁移和分化中的作用 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 来自肝脏、脾脏和淋巴结的iNKT细胞 |
| 162 | 2024-08-08 |
Identification of the immune subtype of ovarian cancer patients by integrated analyses of transcriptome and single-cell sequencing data
2022-08-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-17645-7
PMID:35918500
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研究论文 | 本研究通过综合分析转录组和单细胞测序数据，构建了基于M1和M2巨噬细胞的巨噬细胞风险评分（MRS）和基于与MRS相关的预后基因的基因风险评分（GRS），以识别卵巢癌患者的免疫亚型 | 本研究首次构建了MRS和GRS模型，用于识别具有更好总体生存率和炎症性免疫微环境的卵巢癌免疫亚型，并探讨了M1和M2巨噬细胞通过与CD8 T细胞的信号交流影响卵巢癌预后的可能性 | NA | 旨在通过综合分析转录组和单细胞测序数据，识别卵巢癌患者的免疫亚型，并探讨其对免疫检查点抑制剂的敏感性 | 卵巢癌患者的免疫亚型及其对免疫治疗的响应 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 163 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics of staged oocytes and somatic cells reveal novel regulators of follicle activation
2022-08-01, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1530/REP-22-0053
PMID:35899878
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研究论文 | 本文描述了一种从原始卵泡中分离单个卵母细胞和体细胞的方法，并鉴定了驱动其激活的信号 | 开发了一种新的方法来收集和研究原始卵泡及其相关卵母细胞和体细胞，通过单细胞RNA测序揭示了卵母细胞和体细胞从原始到初级卵泡阶段过渡过程中的分子特征 | NA | 研究卵巢卵泡发育过程中的调控机制 | 原始卵泡中的卵母细胞和体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 新生小鼠卵巢中的原始卵泡及其相关卵母细胞和体细胞 |
| 164 | 2024-08-08 |
Evolution of multiple omics approaches to define pathophysiology of pediatric acute respiratory distress syndrome
2022-08-01, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.77405
PMID:35913450
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研究论文 | 本文综述了多组学技术在儿科急性呼吸窘迫综合征（PARDS）病理生理机制研究中的应用 | 引入了单细胞RNA测序（scRNA-seq）等新型分析方法，以更全面、无偏见地评估跨组织和细胞类型的病理生理机制 | 组学研究在儿童中的应用相对较少，且缺乏跨多种组织类型的分析 | 探索PARDS的分子机制，以期发现靶向治疗 | 儿科急性呼吸窘迫综合征（PARDS）的病理生理机制 | 组学 | 儿科疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据 | NA |
| 165 | 2024-08-08 |
Screening of cell-virus, cell-cell, gene-gene crosstalk among animal kingdom at single cell resolution
2022-08, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.886
PMID:35917402
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术分析了20个物种的多组织样本，并与公共资源整合，以探索病毒受体分布，揭示了从爬行动物到人类的基本细胞间和基因间交叉对话。 | 首次在单细胞分辨率下研究了动物界的细胞-病毒、细胞-细胞、基因-基因交叉对话，并构建了动物界的单细胞图谱。 | NA | 旨在揭示严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）的宿主范围和组织嗜性，以预防跨物种传播。 | 研究对象包括20个物种的多组织样本，以及45个涵盖26个物种的公共数据集。 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 20个物种的多组织样本，共30个数据集；整合45个公共数据集，涵盖26个物种。 |
| 166 | 2024-08-08 |
A ferroptosis-related gene signature for overall survival prediction and immune infiltration in lung squamous cell carcinoma
2022-08-31, Bioscience reports
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BSR20212835
PMID:35866375
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研究论文 | 本文构建了一个与铁死亡相关的基因特征，用于预测肺鳞状细胞癌的总体生存率和免疫浸润情况 | 首次系统地研究了铁死亡相关基因在肺鳞状细胞癌中的分子机制和预后价值 | 需要进一步的实验验证和临床试验来证实该基因特征的临床应用价值 | 研究铁死亡相关基因在肺鳞状细胞癌中的预后价值和免疫浸润情况 | 肺鳞状细胞癌患者的mRNA表达谱、甲基化数据和临床信息 | 数字病理学 | 肺鳞状细胞癌 | 实时PCR和单细胞RNA测序分析 | 多变量Cox回归分析 | mRNA表达谱和甲基化数据 | 使用了来自TCGA和GEO数据库的肺鳞状细胞癌患者数据 |
| 167 | 2024-08-08 |
Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9 is a psoriasis-susceptibility locus that is negatively related to IL36G
2022-08-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.141193
PMID:35862195
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研究论文 | 研究通过RNA测序和单细胞RNA测序技术，发现PCSK9基因与银屑病易感性相关，并揭示了PCSK9与IL36G表达的负相关关系 | 首次通过RNA测序和单细胞RNA测序技术，验证了PCSK9作为银屑病易感基因，并建立了PCSK9与炎症细胞因子表达之间的潜在联系 | NA | 探索PCSK9基因在银屑病易感性中的作用及其与IL36G表达的关系 | PCSK9基因、IL36G表达、银屑病易感性 | NA | 银屑病 | RNA测序、单细胞RNA测序、免疫组化 | NA | 基因组数据、RNA测序数据 | 独立获得的基因组和RNA测序数据集，以及培养的角质形成细胞和非病变人皮肤样本 |
| 168 | 2024-08-08 |
Primary Infection by E. multilocularis Induces Distinct Patterns of Cross Talk between Hepatic Natural Killer T Cells and Regulatory T Cells in Mice
2022-08-18, Infection and immunity
IF:2.9Q2
DOI:10.1128/iai.00174-22
PMID:35862712
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研究论文 | 研究了小鼠模型中E. multilocularis原发性感染期间肝自然杀伤T细胞（NKT细胞）和调节性T细胞（Tregs）之间的相互作用 | 首次使用单细胞RNA测序（scRNA-seq）评估了不同感染阶段肝CD3 T细胞的免疫反应网络，并揭示了NKT细胞和Tregs之间早期和持续的显著增加及其在肝病变形成中的作用 | NA | 探索E. multilocularis感染不同阶段小鼠肝脏中适应性免疫反应和局部调节途径 | E. multilocularis感染期间肝NKT细胞和Tregs的相互作用 | 免疫学 | 寄生虫病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 169 | 2024-08-08 |
Advances in Single-Cell Toxicogenomics in Environmental Toxicology
2022-08-16, Environmental science & technology
IF:10.8Q1
DOI:10.1021/acs.est.2c01098
PMID:35881918
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研究论文 | 本文总结了单细胞毒理基因组学在环境毒理学中的应用，并分析了其在环境污染物目标细胞识别、细胞亚型对污染物的异质性反应以及未知微生物中病原菌发现等方面的应用前景。 | 单细胞毒理基因组学技术提供了高分辨率、高通量和高特异性的分析方法，改变了我们对环境毒理学的认识。 | NA | 探讨单细胞毒理基因组学技术在环境毒理学中的应用及其对环境污染控制方法的影响。 | 单细胞毒理基因组学技术及其在环境毒理学中的应用。 | 环境毒理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 170 | 2024-08-08 |
Origin and function of activated fibroblast states during zebrafish heart regeneration
2022-08, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01129-5
PMID:35864193
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学和时空分析，研究了斑马鱼心脏再生过程中激活细胞状态的多样性及其功能。 | 本文首次详细描述了斑马鱼心脏再生过程中几种具有成纤维细胞特征的短暂细胞状态，并阐明了胶原蛋白-12表达成纤维细胞的促再生功能。 | NA | 研究斑马鱼心脏再生过程中激活成纤维细胞状态的起源和功能。 | 斑马鱼心脏再生过程中的激活成纤维细胞状态。 | NA | NA | 单细胞转录组学，时空分析，高通量谱系追踪 | NA | 转录组数据 | NA |
| 171 | 2024-08-08 |
Hijacking of transcriptional condensates by endogenous retroviruses
2022-08, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01132-w
PMID:35864192
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研究论文 | 研究报告了TRIM28蛋白的快速选择性降解触发转录凝聚体从超级增强子驱动的多能性基因位点解离，并与转录的ERV位点结合，影响小鼠胚胎干细胞的发育。 | 首次揭示了内源性逆转录病毒RNA在TRIM28降解后对转录凝聚体的劫持作用，以及这种作用对多能性细胞谱系的影响。 | 研究主要集中在小鼠胚胎干细胞中，可能需要进一步研究在其他物种或细胞类型中的普遍性。 | 探讨内源性逆转录病毒在早期发育中导致致命性的原因及其对转录凝聚体的劫持机制。 | 小鼠胚胎干细胞中的TRIM28蛋白、ERV RNA及转录凝聚体。 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | TRIM28敲除的小鼠胚胎 |
| 172 | 2024-08-08 |
Directed evolution of adeno-associated virus for efficient gene delivery to microglia
2022-08, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-022-01547-7
PMID:35879607
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研究论文 | 本文报道了通过定向进化腺相关病毒（AAV）衣壳蛋白，发现能够高效介导体外和体内小胶质细胞转导的AAV变体 | 通过定向进化AAV衣壳蛋白，成功开发出能够高效向小胶质细胞传递遗传物质的新型AAV变体 | NA | 开发有效且安全的转基因传递载体，以促进小胶质细胞生物学及其相关疾病机制的研究 | 小胶质细胞 | 基因传递 | 中枢神经系统疾病 | 定向进化 | NA | RNA测序 | NA |
| 173 | 2024-08-08 |
Integrated single-cell transcriptomics and proteomics reveal cellular-specific responses and microenvironment remodeling in aristolochic acid nephropathy
2022-08-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.157360
PMID:35852860
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研究论文 | 本文通过综合单细胞转录组学、批量转录组学和基于质谱的蛋白质组学分析，揭示了马兜铃酸肾病中细胞特异性反应和微环境重塑的机制。 | 首次综合运用单细胞RNA测序、批量RNA测序和蛋白质组学技术，详细阐明了马兜铃酸I引起的肾脏损伤的分子机制。 | 研究仅限于小鼠模型，可能限制了结果在人类中的直接应用。 | 旨在阐明马兜铃酸I引起的肾脏损伤的分子机制，并探索潜在的治疗干预途径。 | 研究对象为急性暴露于马兜铃酸I的小鼠肾脏。 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、质谱蛋白质组学 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据 | 小鼠肾脏样本 |
| 174 | 2024-08-08 |
Single-Cell Analysis Reveals the Range of Transcriptional States of Circulating Human Neutrophils
2022-08-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2200154
PMID:35858733
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术揭示了循环中人类中性粒细胞的转录状态多样性 | 本文通过改进数据分析流程，显著提高了单细胞RNA测序中人类中性粒细胞的检测率，并发现了中性粒细胞的四种可重复的转录簇 | NA | 研究人类中性粒细胞的转录异质性及其在健康和疾病中的潜在影响 | 人类循环中的中性粒细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 健康人类个体的样本 |
| 175 | 2024-08-08 |
Effective enrichment of stem cells in regenerating Xenopus laevis tadpole tails using the side population method
2022-Aug, Development, growth & differentiation
DOI:10.1111/dgd.12797
PMID:35839785
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研究论文 | 本文研究了使用侧群方法在再生非洲爪蟾蝌蚪尾巴中有效富集干细胞的方法 | 首次评估了侧群方法在非洲爪蟾蝌蚪尾巴再生中富集干细胞的有效性，并结合单细胞RNA测序进行分析 | 由于组织干细胞的稀有性，揭示其在尾巴再生过程中的行为动态较为困难 | 研究并分析在尾巴再生过程中稀有组织干细胞的行为动态 | 非洲爪蟾蝌蚪尾巴再生中的组织干细胞 | NA | NA | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从再生芽中提取的侧群细胞 |
| 176 | 2024-08-08 |
Ets21C sustains a pro-regenerative transcriptional program in blastema cells of Drosophila imaginal discs
2022-08-08, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2022.06.040
PMID:35820420
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研究论文 | 研究探讨了果蝇成虫盘细胞在损伤后通过局部增殖再生缺失部分的过程中，Ets21C转录因子如何维持再生特异性的转录程序 | 发现Ets21C转录因子在再生过程中调控特定基因表达网络，且这种机制可能被肿瘤利用以促进异常生长 | NA | 探究再生过程中基因调控网络的再激活与再生特异性转录程序的激活程度 | 果蝇成虫盘细胞及其再生过程中的基因表达 | 再生生物学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及再生翅盘中的两种特定细胞群Blastema1和Blastema2 |
| 177 | 2024-08-08 |
Cell plasticity in regeneration in the stomach and beyond
2022-08, Current opinion in genetics & development
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.gde.2022.101948
PMID:35809361
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research paper | 本文探讨了胃及其他器官在稳态和损伤后利用细胞可塑性程序招募祖细胞进行组织再生的机制 | 揭示了细胞可塑性在组织再生中的普遍性和重要性，以及其在病理过程中的潜在作用 | NA | 研究正常干细胞分化与可塑性在稳态和损伤后的相互作用，以及再生程序的共同特征 | 胃上皮细胞及其他器官的细胞可塑性和再生机制 | NA | NA | 细胞系追踪技术、类器官培养、单细胞RNA测序分析 | NA | NA | NA |
| 178 | 2024-08-08 |
Heterogeneity analysis of astrocytes following spinal cord injury at single-cell resolution
2022-08, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202200463R
PMID:35816276
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了小鼠脊髓损伤后不同时间点的星形胶质细胞转录组特征 | 揭示了六种转录上不同的星形胶质细胞状态，并分析了这些亚型在脊髓损伤后的动态演变过程 | NA | 旨在阐明星形胶质细胞在脊髓损伤后的异质性及其动态变化 | 星形胶质细胞在脊髓损伤后的亚型及其转录组特征 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠脊髓损伤后不同时间点的组织样本 |
| 179 | 2024-08-08 |
Characterization of Aldosterone-producing Cell Cluster (APCC) at Single-cell Resolution
2022-08-18, The Journal of clinical endocrinology and metabolism
DOI:10.1210/clinem/dgac394
PMID:35796577
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研究论文 | 本研究旨在通过单细胞分辨率分析醛固酮产生细胞簇（APCC）的转录组，并推断其发育轨迹 | 首次在单细胞分辨率下揭示了APCC的基因表达特征，并展示了部分ZG细胞重塑为APCC的过程 | NA | 分析APCC的转录组特征并推断其发育轨迹 | 成人肾上腺中的醛固酮产生细胞簇（APCC） | NA | 原发性醛固酮增多症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 2个成人肾上腺中的2928个肾上腺细胞 |
| 180 | 2024-08-08 |
ResPAN: a powerful batch correction model for scRNA-seq data through residual adversarial networks
2022-08-10, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac427
PMID:35771600
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研究论文 | 本文提出了一种名为ResPAN的轻量级深度学习框架，用于单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据的整合，通过残差对抗网络减少批次效应 | ResPAN结合了Wasserstein生成对抗网络（WGAN）、随机游走互最近邻配对和完全跳跃连接的自编码器，以减少批次间的差异 | NA | 解决多个scRNA-seq数据集整合分析中的批次效应问题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 残差对抗网络（WGAN） | 基因组数据 | 超过五十万细胞的数据集 |