单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 250 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2024-08-08 |
Temporal profiling of the breast tumour microenvironment reveals collagen XII as a driver of metastasis
2022-08-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-32255-7
PMID:35933466
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研究论文 | 本研究通过时间蛋白质组学分析去细胞化的肿瘤，探讨了乳腺癌进展过程中基质组的变化，并揭示了胶原蛋白XII在调节胶原蛋白I组织和促进肿瘤转移中的关键作用 | 本研究首次揭示了胶原蛋白XII在乳腺癌转移中的作用，并通过结合蛋白质组学和单细胞转录组学，以及遗传操作模型，深入探讨了其机制 | NA | 探讨乳腺癌进展过程中肿瘤微环境的变化，特别是基质组和细胞外基质的作用 | 乳腺癌肿瘤微环境中的基质组和细胞外基质 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 蛋白质组学 | NA | 蛋白质组数据 | NA |
| 142 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome and cell type-specific molecular pathways of human non-alcoholic steatohepatitis
2022-08-05, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-16754-7
PMID:35931712
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研究论文 | 本研究旨在通过单细胞RNA测序技术，分析非酒精性脂肪性肝炎（NASH）患者的细胞类型特异性转录特征，以增进对该疾病的理解 | 本研究首次提供了NASH病理学的全面单细胞分析，描述了19,627个单细胞转录组，并发现NASH相关巨噬细胞的概念可以通过肝脏巨噬亚群的上调来解释 | NA | 研究非酒精性脂肪性肝炎（NASH）的细胞类型特异性转录特征 | NASH患者的肝脏活检样本 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪性肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 10名NASH患者和160名非酒精性脂肪肝病（NAFLD）患者及24名正常肝脏组织对照 |
| 143 | 2024-08-08 |
BASS: multi-scale and multi-sample analysis enables accurate cell type clustering and spatial domain detection in spatial transcriptomic studies
2022-08-04, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-022-02734-7
PMID:35927760
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研究论文 | 本文介绍了一种名为BASS的计算方法，该方法通过多尺度和多样本分析，实现了单细胞分辨率的空间转录组学研究中的细胞类型聚类和空间域检测 | BASS在单细胞尺度进行细胞类型聚类，并在组织区域尺度进行空间域检测，这两项任务在贝叶斯分层建模框架内同时进行 | NA | 开发一种能够进行多尺度和多样本分析的计算方法，以提高空间转录组学研究中的准确性 | 单细胞分辨率的空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 贝叶斯分层建模 | 贝叶斯分层模型 | 转录组数据 | 涉及三个数据集 |
| 144 | 2024-08-08 |
Fate mapping of hematopoietic stem cells reveals two pathways of native thrombopoiesis
2022-08-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-31914-z
PMID:35922411
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研究论文 | 本文通过计算整合命运图谱、有丝分裂追踪和单细胞RNA测序实验方法，揭示了造血干细胞（HSCs）产生细胞谱系的原生途径及其生理调控机制 | 发现了血栓形成的两条不同途径，并阐明了血栓生成素信号增强对短途径的差异化加速作用 | NA | 揭示造血干细胞的生理分化通量图谱及原生血栓形成的两条功能性不同途径 | 造血干细胞及其产生的细胞谱系 | NA | NA | 命运图谱、有丝分裂追踪、单细胞RNA测序 | NA | RNA | 单细胞 |
| 145 | 2024-08-08 |
Medulloblastoma group 3 and 4 tumors comprise a clinically and biologically significant expression continuum reflecting human cerebellar development
2022-08-02, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111162
PMID:35926460
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研究论文 | 本研究通过RNA测序分析了髓母细胞瘤第3组和第4组的转录连续性，并发现这种连续性与人类胎儿小脑发育中的转录细胞类型连续性相似 | 首次展示了髓母细胞瘤第3组和第4组在转录水平上的连续性，并将其与人类胎儿小脑发育的转录连续性相联系 | NA | 探讨髓母细胞瘤第3组和第4组的转录连续性及其与人类胎儿小脑发育的关系 | 髓母细胞瘤第3组和第4组的转录特征及其与人类胎儿小脑发育的关联 | 数字病理学 | 髓母细胞瘤 | RNA测序 | NA | RNA序列 | 大型且良好注释的髓母细胞瘤样本 |
| 146 | 2024-08-08 |
Wound healing in aged skin exhibits systems-level alterations in cellular composition and cell-cell communication
2022-08-02, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111155
PMID:35926463
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术，研究了年轻和老年皮肤在稳态和伤口愈合过程中的细胞组成和细胞间通讯的系统级变化 | 首次全面揭示了老年皮肤伤口愈合过程中细胞组成、动力学和分子特征的主要变化，以及细胞间通讯的系统级差异 | NA | 深入理解老年皮肤伤口愈合过程中的细胞和分子变化 | 年轻和老年皮肤在稳态和伤口愈合过程中的细胞类型和细胞间通讯 | 数字病理学 | 老年病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 年轻和老年皮肤样本 |
| 147 | 2024-08-08 |
CRISPR-Cas9-mediated gene editing of the BCL11A enhancer for pediatric β0/β0 transfusion-dependent β-thalassemia
2022-08, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-022-01906-z
PMID:35922667
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研究论文 | 本研究报道了使用CRISPR-Cas9技术编辑BCL11A增强子治疗儿童输血依赖型β地中海贫血的初步结果 | 首次在临床试验中使用CRISPR-Cas9技术编辑BCL11A增强子，以诱导γ球蛋白表达，从而治疗β地中海贫血 | 研究样本量较小，仅涉及两名患者，需要更大规模的研究来验证其安全性和有效性 | 评估基因编辑治疗在儿童输血依赖型β地中海贫血中的安全性和有效性 | 两名患有最严重类型输血依赖型β地中海贫血的儿童 | 基因编辑 | 地中海贫血 | CRISPR-Cas9 | NA | 骨髓细胞、外周血单个核细胞 | 两名儿童 |
| 148 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing of Plasmodium vivax sporozoites reveals stage- and species-specific transcriptomic signatures
2022-08, PLoS neglected tropical diseases
IF:3.4Q1
DOI:10.1371/journal.pntd.0010633
PMID:35926062
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了9,947个P. vivax子孢子的转录组，揭示了其在蚊子唾液腺中的不同发育状态和物种特异性基因表达模式 | 首次在单细胞分辨率下分析P. vivax子孢子的转录组，揭示了其与P. falciparum在基因使用模式上的异同 | NA | 探索P. vivax子孢子的转录组特征及其在疟疾传播中的作用 | P. vivax子孢子的转录组 | 数字病理学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 9,947个P. vivax子孢子 |
| 149 | 2024-08-08 |
A root phloem pole cell atlas reveals common transcriptional states in protophloem-adjacent cells
2022-08, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-022-01178-y
PMID:35927456
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研究论文 | 本文利用第二代单细胞测序技术，对根部的韧皮部极细胞进行高分辨率转录组分析，揭示了原生韧皮部筛分子（PSE）邻近细胞系的发育轨迹和基因调控网络的相似性 | 本文采用第二代单细胞测序技术，对根部韧皮部极细胞进行高分辨率分析，揭示了PSE邻近细胞系的共同转录状态和发育轨迹 | NA | 研究根部韧皮部极细胞的转录组特征及其在根发育中的功能 | 根部韧皮部极细胞及其邻近细胞系的转录组和发育轨迹 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未提及 |
| 150 | 2024-08-08 |
Intratracheally administered LNA gapmer antisense oligonucleotides induce robust gene silencing in mouse lung fibroblasts
2022-08-26, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac630
PMID:35920332
|
研究论文 | 研究通过三种不同方法评估了LNA gapmer反义寡核苷酸在肺纤维细胞中的基因沉默效果 | 首次应用单细胞RNA测序（scRNA-seq）评估寡核苷酸治疗药物的疗效 | 缺乏适当的分析方法来确定反义寡核苷酸在每种细胞类型中的有效性 | 研究反义寡核苷酸在肺部不同细胞类型中的基因沉默效果 | 肺纤维细胞和内皮细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 151 | 2024-08-08 |
SUMO Modification of Histone Demethylase KDM4A in Kaposi's Sarcoma-Associated Herpesvirus-Induced Primary Effusion Lymphoma
2022-08-24, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00755-22
PMID:35914074
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研究论文 | 本文研究了Kaposi肉瘤相关疱疹病毒（KSHV）感染引起的原发性渗出性淋巴瘤（PEL）中组蛋白去甲基酶KDM4A的SUMO化修饰及其对细胞存活、迁移和血管生成的影响 | 发现KDM4A的SUMO化修饰在KSHV激活和PEL细胞存活中起关键作用，并确定了IL-10作为KDM4A的新下游靶点 | 需要进一步研究KDM4A作为治疗PEL的潜在靶点的具体机制和疗效 | 探讨KDM4A的SUMO化修饰在KSHV诱导的PEL中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | KDM4A的SUMO化修饰及其对PEL细胞存活、迁移和血管生成的影响 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | ChIP-seq, RNA-seq, 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 多个PEL细胞样本 |
| 152 | 2024-08-08 |
Biogeographic and disease-specific alterations in epidermal lipid composition and single-cell analysis of acral keratinocytes
2022-08-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.159762
PMID:35900871
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研究论文 | 本文通过靶向脂质组学分析和单细胞RNA测序，研究了人体表皮脂质在12个不同解剖部位的生物地理变化以及肢端角质形成细胞的基因表达。 | 首次揭示了肢端皮肤中EOS酰基神经酰胺及其合成相关基因的低表达，以及与角质细胞保留增加相关的基因表达变化，并构建了用于银屑病诊断的2-分析物模型。 | NA | 探讨表皮脂质组成在不同身体部位的生物地理变化及其与疾病特异性改变的关系。 | 人体表皮脂质和肢端角质形成细胞的基因表达。 | 数字病理学 | 银屑病 | 靶向脂质组学分析，单细胞RNA测序 | NA | 脂质组学数据，基因表达数据 | 12个不同解剖部位的表皮脂质样本，肢端和非肢端部位的角质形成细胞 |
| 153 | 2024-08-08 |
Systematic exploration of dynamic splicing networks reveals conserved multistage regulators of neurogenesis
2022-08-18, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2022.06.036
PMID:35914530
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研究论文 | 本文通过筛选策略识别控制哺乳动物神经发生中动态剪接事件的因子，揭示了神经发生过程中剪接程序的调控机制 | 发现了先前未知的神经发生调控因子Rbm38和Puf60，并阐明了它们通过特定外显子调控剪接模式的机制 | NA | 探索神经发生过程中动态剪接网络的调控因子 | 哺乳动物神经发生中的动态剪接事件及其调控因子 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 涉及胚胎干细胞和不同阶段的鼠神经发生 |
| 154 | 2024-08-08 |
Elevated Myl9 reflects the Myl9-containing microthrombi in SARS-CoV-2-induced lung exudative vasculitis and predicts COVID-19 severity
2022-08-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2203437119
PMID:35895716
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研究论文 | 本研究通过结合场发射扫描电子显微镜和能量色散X射线光谱分析法对尸检肺样本进行组织学分析，以及对外周血单个核细胞进行单细胞RNA测序，探讨了COVID-19中血管炎和免疫血栓形成的病理机制 | 发现SARS-CoV-2在肺血管中积累，导致渗出性血管炎，并伴随出现表达血小板反应蛋白-1的非典型单核细胞和形成含有肌球蛋白轻链9（Myl9）的微血栓 | NA | 探讨COVID-19中血管炎和免疫血栓形成的病理机制 | COVID-19患者的肺部病理和免疫反应 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本和血液样本 | NA |
| 155 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing depicts the local cell landscape in thyroid-associated ophthalmopathy
2022-08-16, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2022.100699
PMID:35896115
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了甲状腺相关眼病（TAO）患者眼眶结缔组织中细胞成分的转录变化 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了TAO中局部细胞景观，包括RASD1表达的脂纤维母细胞、ACKR1内皮细胞和脂肪组织巨噬细胞在炎症和脂肪生成中的作用，以及CD8CD57细胞毒性T淋巴细胞在干扰素-γ产生中的作用 | NA | 旨在识别甲状腺相关眼病（TAO）中导致病理过程的局部细胞变化 | 甲状腺相关眼病（TAO）患者眼眶结缔组织中的细胞成分 | 数字病理学 | 甲状腺相关眼病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 未具体说明样本数量 |
| 156 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals Neutrophil as Orchestrator during β-Glucan-Induced Trained Immunity in a Teleost Fish
2022-08-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2200225
PMID:35896333
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研究论文 | 本研究在鲆鱼中建立了一个训练免疫激活模型，并通过单细胞RNA测序分析了中性粒细胞在β-葡聚糖诱导的训练免疫中的作用 | 首次揭示了硬骨鱼类中中性粒细胞作为训练免疫的调控者，并阐明了IL-1R信号通路在训练免疫诱导中的关键作用 | NA | 探究硬骨鱼类中训练免疫相关的免疫细胞及其分子机制 | 鲆鱼中的中性粒细胞和训练免疫 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 14个先天性和适应性免疫细胞群，以及两个血液细胞群 |
| 157 | 2024-08-08 |
Lung fibroblasts facilitate pre-metastatic niche formation by remodeling the local immune microenvironment
2022-08-09, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2022.07.001
PMID:35908547
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和免疫荧光技术，发现肺成纤维细胞通过表达环氧合酶2（COX-2）重塑肺部免疫微环境，促进乳腺癌转移前生态位的形成 | 首次揭示了肺成纤维细胞在乳腺癌转移前生态位形成中的关键作用，并证明了通过遗传或药物手段抑制COX-2活性可以逆转肺部免疫抑制状态，减少乳腺癌肺转移 | NA | 探究肺成纤维细胞在乳腺癌转移前生态位形成中的作用及机制 | 肺成纤维细胞、树突状细胞、单核细胞等肺部免疫细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、免疫荧光 | NA | 基因表达数据、免疫细胞图像 | 多个乳腺癌模型中的肺部组织样本 |
| 158 | 2024-08-08 |
Tumor-polarized GPX3+ AT2 lung epithelial cells promote premetastatic niche formation
2022-08-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2201899119
PMID:35914155
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术，发现肿瘤极化的GPX3+ AT2肺上皮细胞在促进肺转移前微环境形成中的作用 | 首次揭示了肿瘤极化的GPX3 AT2细胞在促进肺转移前微环境形成中的作用，并阐明了其分子机制 | NA | 研究肺转移前微环境形成的细胞和分子成分 | 肺上皮细胞中的GPX3+ AT2细胞及其在肺转移前微环境形成中的作用 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 159 | 2024-08-08 |
Single-cell and spatial mapping Identify cell types and signaling Networks in the human ureter
2022-08-08, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.07.004
PMID:35914526
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序、空间基因表达和免疫荧光技术，定义并空间映射了人类输尿管中的细胞群体，重点关注基质细胞和尿路上皮细胞，并分析了sonic hedgehog（SHH）信号通路在成年干细胞维持中的重要性。 | 首次通过单细胞和空间映射技术详细描述了人类输尿管的细胞类型和信号网络，并验证了SHH信号通路在输尿管组织稳态中的作用。 | NA | 深入理解输尿管组织再生的结构、细胞异质性和信号通路，为组织工程提供治疗策略。 | 人类输尿管的细胞群体和信号网络。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、空间基因表达、免疫荧光 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 160 | 2024-08-08 |
Glioblastoma hijacks neuronal mechanisms for brain invasion
2022-08-04, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2022.06.054
PMID:35914528
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研究论文 | 本文研究了胶质母细胞瘤如何利用神经机制进行脑部侵袭 | 首次揭示了胶质母细胞瘤细胞通过接收神经元输入并模仿神经迁移机制进行脑部侵袭的机制 | NA | 探讨胶质母细胞瘤细胞如何利用神经机制进行脑部侵袭 | 胶质母细胞瘤细胞及其与神经元的关系 | NA | 脑肿瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞数据 | 包括小鼠模型和人类疾病样本 |