单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 250 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2024-08-08 |
Urological cancer organoids, patients' avatars for precision medicine: past, present and future
2022-Aug-19, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-022-00866-8
PMID:35986387
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综述 | 本文综述了泌尿系统癌症类器官在精准医疗中的应用，包括其历史、现状和未来发展 | 介绍了三维培养模型类器官的最新应用，如药物筛选、癌症起源调查和单细胞测序的结合 | 当前类器官研究面临标准化培养流程缺乏、培养基优化需求以及无法完全模拟体内免疫系统等瓶颈 | 总结类器官在泌尿系统癌症中的发展和应用及其面临的挑战 | 泌尿系统癌症类器官 | NA | 泌尿系统癌症 | NA | NA | NA | NA |
| 82 | 2024-08-08 |
The role of tetraspanins pan-cancer
2022-Aug-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104777
PMID:35992081
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研究论文 | 本研究分析了24个四跨膜蛋白家族基因在33种癌症类型中的表达及其与肿瘤特征的关系 | 首次全面分析了四跨膜蛋白家族基因在泛癌中的作用，并进行了多维度的研究，包括基因差异表达、免疫亚型分析、临床分析等 | NA | 探讨四跨膜蛋白在泛癌中的作用及其与肿瘤特征的关系 | 24个四跨膜蛋白家族基因及其在33种癌症类型中的表达 | 数字病理学 | 泛癌 | NA | NA | 基因表达数据 | 11,057个TCGA样本 |
| 83 | 2024-08-08 |
Identification of a drug-response gene in multiple myeloma through longitudinal single-cell transcriptome sequencing
2022-Aug-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104781
PMID:35992084
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研究论文 | 本研究通过纵向单细胞转录组测序分析了复发性多发性骨髓瘤患者的细胞，并识别了与药物反应相关的基因。 | 首次通过纵向单细胞转录组测序揭示了多发性骨髓瘤细胞在不同治疗阶段的亚群动态变化，并鉴定了一个新的候选药物反应基因。 | 研究仅基于单一患者的样本，可能需要更多样本以验证结果的普遍性。 | 旨在通过纵向单细胞转录组测序分析，深入理解多发性骨髓瘤细胞对药物反应的克隆动态，并识别药物反应基因。 | 复发性多发性骨髓瘤患者的骨髓瘤细胞。 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 单一患者样本 |
| 84 | 2024-08-08 |
Transcriptomic heterogeneity of cultured ADSCs corresponds to embolic risk in the host
2022-Aug-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104822
PMID:35992088
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研究论文 | 本研究通过功能性单细胞RNA测序技术，揭示了脂肪来源间充质干细胞在培养中的转录组异质性与宿主体内栓塞风险之间的关系 | 开发了一种功能性单细胞RNA测序程序，并利用基因集富集分析和监督机器学习验证了ADSCs的栓塞风险子群，同时建立了一个预测栓塞风险的数学模型 | NA | 探讨脂肪来源间充质干细胞在培养中的转录组异质性与宿主体内栓塞风险的关系 | 脂肪来源间充质干细胞 | 干细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | RNA | NA |
| 85 | 2024-08-08 |
Characterization of hemocytes and hematopoietic cells of a freshwater crayfish based on single-cell transcriptome analysis
2022-Aug-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104850
PMID:35996577
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析，研究了淡水小龙虾的血液细胞和造血细胞的特征 | 发现了先前未描述的循环中的血液细胞类型，并揭示了造血组织中具有明显前体特征的细胞群以及参与铁稳态的细胞，这些发现可能增进我们对甲壳动物及其他动物造血干细胞调控的理解 | NA | 为了更好地理解对不同病原体的免疫反应，识别具有不同功能的血液细胞亚群并了解这些细胞的形成过程 | 淡水小龙虾的血液细胞和造血细胞 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 86 | 2024-08-08 |
Spatially resolved transcriptomic profiling of ovarian aging in mice
2022-Aug-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104819
PMID:35996587
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术，分析了年轻和老年小鼠卵巢的转录组图谱，揭示了卵巢衰老过程中的细胞类型特异性变化 | 本研究首次采用空间转录组学技术，详细解析了卵巢衰老过程中的细胞类型特异性转录组变化，为理解卵巢衰老的分子机制提供了新的视角 | NA | 探讨卵巢衰老的生物学机制 | 年轻和老年小鼠的卵巢 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 年轻和老年小鼠的卵巢样本 |
| 87 | 2024-08-08 |
Heterogeneity of Cancer-Associated Fibroblasts and the Tumor Immune Microenvironment in Pancreatic Cancer
2022-Aug-18, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14163994
PMID:36010986
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综述 | 本文综述了胰腺癌中癌症相关成纤维细胞（CAFs）的异质性及其在肿瘤免疫微环境中的作用 | 近年来通过单细胞RNA测序揭示了CAFs的主要亚型及其功能，并探讨了针对CAFs的靶向治疗潜力 | NA | 阐明胰腺癌中肿瘤微环境的异质性，包括CAFs和肿瘤免疫，以建立有效的治疗策略 | 胰腺导管腺癌（PDAC）中的癌症相关成纤维细胞（CAFs）及其在肿瘤免疫微环境中的作用 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 88 | 2024-08-08 |
Detecting Fear-Memory-Related Genes from Neuronal scRNA-seq Data by Diverse Distributions and Bhattacharyya Distance
2022-08-17, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom12081130
PMID:36009024
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研究论文 | 本文提出了一种新的方法DEGman，用于从单细胞RNA测序数据中检测与恐惧记忆相关的差异表达基因 | DEGman方法利用多种可能的分布与Bhattacharyya距离相结合，自动选择最适合的基因表达水平分布，并通过排列测试检测差异表达基因 | NA | 旨在提高单细胞RNA测序数据中差异表达基因检测的精确度和鲁棒性 | 小鼠神经元的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个神经元集群 |
| 89 | 2024-08-08 |
Single-Cell and Bulk RNA Sequencing Reveal Malignant Epithelial Cell Heterogeneity and Prognosis Signatures in Gastric Carcinoma
2022-08-17, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11162550
PMID:36010627
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了胃癌恶性上皮细胞的异质性及其预后标志物 | 首次建立了全面的单细胞转录组图谱，以识别胃癌恶性上皮细胞的异质性，并结合单细胞和批量RNA测序数据生成和验证了预后标志物 | NA | 旨在理解胃癌的异质性，以促进准确的诊断和预后 | 胃癌的恶性上皮细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（bulk RNA-seq） | NA | 转录组数据 | 共分析了来自9名患者的49,994个细胞，包括配对的原发肿瘤和正常组织 |
| 90 | 2024-08-08 |
High IGKC-Expressing Intratumoral Plasma Cells Predict Response to Immune Checkpoint Blockade
2022-Aug-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23169124
PMID:36012390
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研究论文 | 本研究探讨了基底肿瘤微环境（TME）的组成，特别是高表达IGKC的肿瘤内浆细胞，在预测免疫检查点阻断（ICB）治疗反应和预后中的作用。 | 本研究揭示了基底肿瘤内高表达IGKC的浆细胞在ICB治疗中的重要作用，这一发现超越了T淋巴细胞的作用，为该领域带来了突破性的认识。 | 本研究的局限性在于缺乏强有力的生物标志物来预测ICB治疗的反应。 | 研究目的是探讨基底肿瘤微环境的组成，以预测免疫检查点阻断治疗的反应和预后。 | 研究对象包括肿瘤微环境中的浆细胞、T细胞受体（TCR）、B细胞受体（BCR）和人类白细胞抗原（HLA）。 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序、多光谱免疫荧光、机器学习 | 机器学习预测算法 | RNA序列数据 | 八个接受ICB治疗的转移性黑色素瘤队列 |
| 91 | 2024-08-08 |
Dissecting Molecular Heterogeneity of Circulating Tumor Cells (CTCs) from Metastatic Breast Cancer Patients through Copy Number Aberration (CNA) and Single Nucleotide Variant (SNV) Single Cell Analysis
2022-Aug-14, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14163925
PMID:36010918
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术研究了转移性乳腺癌患者循环肿瘤细胞（CTCs）的异质性 | 本文通过单细胞分析揭示了CTCs的独特突变特征及其与共同起源的分子痕迹，并识别了与抗性相关的异常 | 需要进一步阐明由相似CTCs组成的群体的转化意义 | 探索转移性乳腺癌患者循环肿瘤细胞的异质性 | 转移性乳腺癌患者的循环肿瘤细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 多个转移性乳腺癌患者的循环肿瘤细胞 |
| 92 | 2024-08-08 |
Multiscale Methods for Signal Selection in Single-Cell Data
2022-Aug-13, Entropy (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/e24081116
PMID:36010781
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研究论文 | 本文提出三种基于拓扑学的数学方法，用于单细胞数据中的无监督特征选择，考虑离散和连续的转录模式 | 提出的方法能够在多个尺度上同时考虑离散和连续的转录模式，并通过谱分解的拉普拉斯图、多尺度拉普拉斯分数和持久性瑞利商等技术进行信号或基因的排序 | NA | 开发新的数学方法以更好地分析单细胞转录组数据中的基因表达模式 | 单细胞转录组数据中的基因表达模式 | 生物信息学 | NA | 谱分解的拉普拉斯图、多尺度拉普拉斯分数、持久性瑞利商 | NA | 转录组数据 | 已发表的单细胞转录组数据集 |
| 93 | 2024-08-08 |
Laser Microdissection-Mediated Isolation of Butterfly Wing Tissue for Spatial Transcriptomics
2022-Aug-11, Methods and protocols
IF:2.3Q3
DOI:10.3390/mps5040067
PMID:36005768
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研究论文 | 本文介绍了一种激光显微切割技术，用于从蝴蝶幼虫和蛹翅组织中提取总RNA，并进行空间转录组学分析 | 该技术无需石蜡包埋或使用切片机，提供了无偏倚的基因表达发现和空间信息 | NA | 研究蝴蝶翅发育过程中特定区域的转录组 | 蝴蝶幼虫和蛹翅组织 | NA | NA | 激光显微切割 | NA | RNA | NA |
| 94 | 2024-08-08 |
DNA methylome and single-cell transcriptome analyses reveal CDA as a potential druggable target for ALK inhibitor-resistant lung cancer therapy
2022-08, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-022-00836-7
PMID:35999456
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研究论文 | 本研究通过体外模型和全基因组DNA甲基化分析结合单细胞RNA测序，揭示了胞苷脱氨酶（CDA）作为ALK抑制剂耐药性肺癌潜在药物靶点的可能性 | 首次发现CDA在ALK抑制剂耐药的非小细胞肺癌中低甲基化和上调，并验证了通过靶向CDA代谢的核苷类似物治疗耐药性的新策略 | 研究主要基于体外模型，需要进一步的临床试验验证 | 探索克服ALK抑制剂耐药性的新治疗策略 | ALK融合阳性非小细胞肺癌及其对ALK抑制剂的耐药性 | 数字病理学 | 肺癌 | 全基因组DNA甲基化分析，单细胞RNA测序 | NA | DNA甲基化数据，RNA序列数据 | 具体样本数量未在摘要中明确提及 |
| 95 | 2024-08-08 |
Snail-regulated exosomal microRNA-21 suppresses NLRP3 inflammasome activity to enhance cisplatin resistance
2022-08, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2022-004832
PMID:36002186
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研究论文 | 本文研究了Snail调控的外泌体微小RNA-21通过抑制NLRP3炎症小体活性来增强顺铂耐药性的机制。 | 揭示了上皮-间质转化（EMT）介导的耐药机制，超越了癌症干细胞的调节，通过调节治疗后炎症小体活性来影响肿瘤微环境（TME）的动态重塑。 | NA | 探讨非遗传适应介导的耐药策略，特别是炎症小体在癌症治疗中的动态响应。 | 肿瘤来源的外泌体、NLRP3炎症小体活性、微小RNA-21的传递及其在体内的影响。 | 数字病理学 | 头颈部癌症 | RNA测序、单细胞RNA测序、纳米粒子跟踪分析、透射电子显微镜 | NA | RNA | 使用了人类单核细胞THP细胞和鼠口腔癌MTCQ1细胞，以及C57BLJ/6J、BALB/C和C57BL/6J小鼠模型，还包括头颈部癌症患者样本。 |
| 96 | 2024-08-08 |
Dopamine and GPCR-mediated modulation of DN1 clock neurons gates the circadian timing of sleep
2022-08-23, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2206066119
PMID:35969763
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research paper | 本文研究了多巴胺和G蛋白偶联受体（GPCRs）在调节DN1时钟神经元对睡眠时间节律中的作用。 | 通过单细胞测序和基因编辑技术，揭示了GPCRs在果蝇大脑时钟网络中的高度富集和差异表达，以及它们在时钟神经元身份中的作用。 | NA | 探索多巴胺和GPCRs在调节睡眠时间节律中的作用。 | 果蝇大脑中的时钟神经元和GPCRs。 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 基因数据 | 特定神经元中的单个GPCRs |
| 97 | 2024-08-08 |
SC2sepsis: sepsis single-cell whole gene expression database
2022-08-18, Database : the journal of biological databases and curation
DOI:10.1093/database/baac061
PMID:35980286
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研究论文 | 本文介绍了SC2sepsis数据库，该数据库整合了来自45名脓毒症患者和26名健康对照者的外周血单个核细胞的单细胞RNA测序数据，共包含232,226个细胞 | SC2sepsis数据库提供了1988个在病理和健康条件下差异表达的基因检索功能和自动细胞类型注释，有助于深入理解脓毒症的免疫失调 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术揭示脓毒症相关的基因表达特征，以促进对脓毒症发病机制的理解 | 脓毒症患者的免疫细胞及其基因表达变化 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 45名脓毒症患者和26名健康对照者的外周血单个核细胞，共232,226个细胞 |
| 98 | 2024-08-08 |
Subtype and cell type specific expression of lncRNAs provide insight into breast cancer
2022-08-18, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-03559-7
PMID:35982125
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研究论文 | 本文通过分析长非编码RNA（lncRNA）在乳腺癌中的表达，揭示了lncRNA与乳腺癌临床病理特征的关联，并探讨了其在乳腺癌中的调控机制 | 本文通过共表达分析和单细胞RNA测序，发现了由细胞类型特异性表达驱动的三个不同的lncRNA簇，并进一步研究了驱动lncRNA表达的顺式调控区域 | NA | 探讨lncRNA在乳腺癌中的表达模式及其对乳腺癌基因调控网络的影响 | 乳腺癌中的长非编码RNA（lncRNA）及其与临床病理特征的关联 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 两个基于人群的队列：SCAN-B和TCGA |
| 99 | 2024-08-08 |
Heterogeneity of circulating CD4+CD8+ double-positive T cells characterized by scRNA-seq analysis and trajectory inference
2022-08-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-18340-3
PMID:35982155
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了猕猴循环系统中的CD4+CD8+双阳性T细胞的异质性，并通过轨迹推断揭示了其分化状态的多样性 | 发现了两个新的CD4+CD8+双阳性T细胞亚群，并揭示了猕猴与食蟹猴中DP T细胞分化状态的差异 | NA | 深入理解CD4+CD8+双阳性T细胞的特征及其在疾病中的作用 | 猕猴和食蟹猴的循环系统中的CD4+CD8+双阳性T细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 分析了来自猕猴的7601个细胞，检测到14,459个基因 |
| 100 | 2024-08-08 |
Single-cell atlas of diverse immune populations in the advanced biliary tract cancer microenvironment
2022-Aug-18, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-022-00300-9
PMID:35982235
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，全面分析了晚期胆道癌（BTC）中的免疫微环境，识别了多种免疫细胞亚群及其在肿瘤微环境中的相互作用 | 首次在单细胞水平上详细描述了晚期胆道癌中的免疫细胞亚群，特别是耗竭的CD8 T细胞、巨噬细胞和树突状细胞在肿瘤微环境中的作用 | 研究样本量较小，仅包括16个匹配样本，可能影响结果的普遍性 | 旨在深入了解晚期胆道癌的免疫微环境，以预测免疫治疗反应并开发新的免疫治疗方法 | 晚期胆道癌中的免疫细胞及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 胆道癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 45,851个细胞来自16个匹配样本 |