单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 250 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-08-07 |
Resolution of the curse of dimensionality in single-cell RNA sequencing data analysis
2022-08-09, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202201591
PMID:35944930
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研究论文 | 本文提出了一种名为RECODE的高维统计方法，用于解决单细胞RNA测序数据分析中的维度灾难问题 | RECODE方法不涉及维度降低，能够恢复所有基因的表达值，包括低表达基因，实现细胞命运转变的精确描绘和罕见细胞的识别 | NA | 解决单细胞RNA测序数据分析中的维度灾难问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 众多单个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 62 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics reveals the identity and regulators of human mast cell progenitors
2022-08-09, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2022006969
PMID:35500226
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学分析揭示了人类肥大细胞前体细胞的身份及其调控因子 | 首次展示了FcεRI在肥大细胞前体阶段表达的时间关联，并揭示了外部刺激对肥大细胞前体FcεRI表达的调控作用 | NA | 探讨肥大细胞前体细胞的特征及其在疾病中的作用 | 人类肥大细胞前体细胞及其在过敏性哮喘和系统性肥大细胞增多症中的作用 | 数字病理学 | 过敏性疾病 | 单细胞转录组学分析 | NA | 转录组数据 | 成人外周血中的CD34+造血前体细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 63 | 2024-08-07 |
SCIFER: approach for analysis of LINE-1 mRNA expression in single cells at a single locus resolution
2022-Aug-26, Mobile DNA
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s13100-022-00276-0
PMID:36028901
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研究论文 | 介绍了一种名为SCIFER的方法，用于在单细胞RNA测序数据集中以单个位点分辨率量化移动元素的表达 | SCIFER通过唯一地比对单细胞RNA测序读取到基因组并提取单细胞的比对，提高了L1位点识别的准确性 | NA | 研究L1 mRNA在单细胞中的表达模式，特别是在单个位点分辨率下 | L1 mRNA在单细胞中的表达 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 使用了来自人类和小鼠的睾丸的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 64 | 2024-08-07 |
Single Cell Analysis of Cultivated Fibroblasts from Chronic Pancreatitis and Pancreatic Cancer Patients
2022-08-19, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11162583
PMID:36010660
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了来自慢性胰腺炎和胰腺癌患者的培养成纤维细胞，以探究癌症相关成纤维细胞（CAFs）和疾病相关成纤维细胞（DAFs）的异质性及其在胰腺疾病中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序和生物信息学分析比较了来自慢性胰腺炎和胰腺癌患者的CAFs/DAFs，并观察到在细胞周期回归后，慢性胰腺炎和胰腺癌患者中共有135个高度可变基因 | 需要进一步研究以选择和识别在慢性胰腺炎病例中DAFs的基质因子，这些因子可能在CAFs中普遍表达，潜在地促进胰腺癌的发展 | 探究胰腺癌患者中癌症相关成纤维细胞（CAFs）的肿瘤内异质性及其在癌症相关机制中的关键作用，并研究这些CAF亚型是否也存在于慢性胰腺炎中 | 来自慢性胰腺炎和胰腺癌患者的培养成纤维细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 来自慢性胰腺炎和胰腺癌患者的原代分离成纤维细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 65 | 2024-08-07 |
ID1 marks the tumorigenesis of pancreatic ductal adenocarcinoma in mouse and human
2022-08-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-17827-3
PMID:35941362
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研究论文 | 本研究通过分析多个单细胞RNA测序数据集，揭示了ID1在胰腺导管腺癌（PDAC）发展中的遗传程序，并探讨了ID1与PDAC恶性程度的相关性及其在人类PDAC细胞中的表达模式。 | 首次揭示ID1在PDAC发展中的关键作用，并证实ID1受EIF2信号通路调控，为PDAC的治疗提供了新的潜在靶点。 | NA | 探讨ID1在胰腺导管腺癌发展中的作用及其作为潜在恶性标志物的可能性。 | 胰腺导管腺癌（PDAC）在遗传修饰小鼠模型和人类中的发展过程。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个遗传修饰小鼠模型和人类PDAC及正常胰腺组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 66 | 2024-08-07 |
Cigarette smoke augments CSF3 expression in neutrophils to compromise alveolar-capillary barrier function during influenza infection
2022-08, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.02049-2021
PMID:35058252
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研究论文 | 研究吸烟如何通过增加中性粒细胞中CSF3表达来损害流感感染时的肺泡-毛细血管屏障功能 | 揭示了吸烟加剧流感感染的机制，并发现了潜在的治疗靶点（如过量的vRNA积累、水肿性CSF3R信号传导） | 临床上rCSF3治疗在病毒性传染病中的潜在限制 | 探讨吸烟与流感感染之间的免疫机制 | 吸烟对流感感染的影响及其免疫机制 | NA | 流感 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | RNA | 使用小鼠模型进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 67 | 2024-08-08 |
A novel cuproptosis-related lncRNA prognostic signature for predicting treatment and immune environment of head and neck squamous cell carcinoma
2022-08-19, Mathematical biosciences and engineering : MBE
DOI:10.3934/mbe.2022564
PMID:36653989
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据探索了头颈鳞状细胞癌（HNSCC）肿瘤微环境中铜死亡相关基因的表达，并构建了一个基于铜死亡相关长链非编码RNA（lncRNA）的预后模型 | 首次探索了铜死亡在HNSCC中的应用，并构建了一个新的铜死亡相关lncRNA预后模型 | NA | 研究铜死亡在头颈鳞状细胞癌治疗和免疫环境预测中的作用 | 头颈鳞状细胞癌（HNSCC）患者 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 不同风险评分的HNSCC患者 | NA | NA | NA | NA |
| 68 | 2024-08-08 |
Spotlight on liver macrophages for halting injury and progression in nonalcoholic fatty liver disease
2022-08, Expert opinion on therapeutic targets
IF:4.6Q1
DOI:10.1080/14728222.2022.2132145
PMID:36205054
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综述 | 本文综述了非酒精性脂肪肝病（NAFLD）中巨噬细胞的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 探讨了未来研究可能涉及的领域，如肠道微生物组、损伤相关分子模式（DAMPS）及其相关分子和通路，以及单细胞测序等高级分子生物学研究 | NA | 更新关于直接或间接影响NAFLD中巨噬细胞的药物研究，并讨论巨噬细胞生物标志物在监测疾病阶段和进展/逆转中的意义 | 非酒精性脂肪肝病（NAFLD）中的巨噬细胞及其相关药物和生物标志物 | NA | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 69 | 2024-08-08 |
[scRNA-sequencing uncovers metabolism and CD52 as new targets in ibrutinib-surviving mantle cell lymphoma cells]
2022-Aug, Pathologie (Heidelberg, Germany)
DOI:10.1007/s00292-022-01136-7
PMID:36222922
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了伊布替尼治疗后存活的外套细胞淋巴瘤细胞中的代谢变化和新靶点CD52 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了伊布替尼治疗后外套细胞淋巴瘤细胞的基因表达趋势和新的治疗靶点 | 研究仅使用了REC-1细胞系，可能无法完全代表所有外套细胞淋巴瘤细胞的反应 | 探索伊布替尼治疗外套细胞淋巴瘤后的细胞适应性和新的治疗靶点 | 外套细胞淋巴瘤细胞及其对伊布替尼治疗的反应 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用REC-1细胞系进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 70 | 2024-08-08 |
Clinical Characterization and Prognostic Value of TPM4 and Its Correlation with Epithelial-Mesenchymal Transition in Glioma
2022-Aug-24, Brain sciences
IF:2.7Q3
DOI:10.3390/brainsci12091120
PMID:36138856
|
研究论文 | 本研究探讨了TPM4在胶质瘤中的临床特征及其与上皮-间质转化的关系，以及其对患者预后的影响 | 首次系统分析了TPM4在胶质瘤中的表达模式及其与上皮-间质转化的关联，并评估了其作为预后标志物的潜力 | 研究依赖于现有数据库的数据，可能存在样本选择偏倚；未涉及TPM4在胶质瘤中的分子机制的深入探讨 | 确定TPM4在胶质瘤中的临床特征和预后价值 | TPM4在胶质瘤中的表达及其与上皮-间质转化的关系 | NA | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 998名胶质瘤患者 | NA | NA | NA | NA |
| 71 | 2024-08-08 |
A Human Stem Cell-Derived Neurosensory-Epithelial Circuitry on a Chip to Model Herpes Simplex Virus Reactivation
2022-Aug-24, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines10092068
PMID:36140168
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研究论文 | 本研究展示了在芯片上使用人干细胞衍生的背根神经节（DRG）器官样体建立稳定的神经感觉上皮连接 | 本研究通过在微流控芯片上重建人感觉神经元和角质形成细胞的有序连接，提供了一个强大的体外平台，用于模拟人类病毒病原体的潜伏和再激活 | NA | 开发一个可靠且可重复的体外系统，模拟不同人类感觉神经元与周围组织之间的连接，以深入理解病毒潜伏和再激活的细胞和分子机制 | 人干细胞衍生的背根神经节（DRG）器官样体，感觉神经元细胞类型，以及单纯疱疹病毒1（HSV-1）的关键受体 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 不同组合的关键受体表达于每种感觉神经元细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 72 | 2024-08-08 |
A Single-Cell Survey of Cellular Heterogeneity in Human Great Saphenous Veins
2022-08-31, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11172711
PMID:36078120
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，详细描述了人类大隐静脉中的细胞异质性及其表达调控机制 | 揭示了大隐静脉内皮细胞和瓣膜内皮细胞之间的功能适应性差异，以及淋巴管发育的潜在来源 | NA | 探索大隐静脉细胞成分及其表达调控，以减少静脉移植失败 | 人类大隐静脉样本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三个人类大隐静脉样本 | NA | NA | NA | NA |
| 73 | 2024-08-08 |
Sex Differences in Coronary Artery Disease and Diabetes Revealed by scRNA-Seq and CITE-Seq of Human CD4+ T Cells
2022-Aug-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23179875
PMID:36077273
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-Seq）和抗体测序（CITE-Seq）分析了人CD4+ T细胞在冠状动脉疾病（CAD）和糖尿病（DM）中的性别差异 | 首次结合scRNA-Seq和CITE-Seq技术，详细分析了CD4+ T细胞在CAD和DM中的性别差异及基因表达变化 | 研究样本仅限于接受心脏导管手术的61名男性和女性，可能限制了结果的普遍性 | 探讨CAD与性别和DM之间的关系 | 人CD4+ T细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | scRNA-Seq, CITE-Seq | NA | 单细胞转录组 | 61名男性和女性的外周血单个核细胞（PBMCs） | NA | NA | NA | NA |
| 74 | 2024-08-08 |
Dosage Compensation of the X Chromosome during Sheep Testis Development Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2022-Aug-24, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani12172169
PMID:36077890
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了绵羊睾丸发育三个关键阶段的剂量补偿机制 | 首次揭示了绵羊睾丸发育过程中X染色体的剂量补偿机制，并发现了MSL1和MSL2在早期生殖细胞中的表达及其在调控哺乳动物X染色体失活和激活中的作用 | 研究仅限于绵羊睾丸发育的三个特定阶段，未涵盖所有发育阶段 | 探讨绵羊雄性生殖细胞中X染色体的调控机制 | 绵羊睾丸发育过程中的X染色体剂量补偿 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 三个绵羊睾丸发育阶段的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 75 | 2024-08-08 |
The role of tumor-infiltrating B cells in the tumor microenvironment of hepatocellular carcinoma and its prognostic value: a bioinformatics analysis
2022-Aug, Journal of gastrointestinal oncology
IF:2.0Q3
DOI:10.21037/jgo-22-717
PMID:36092319
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析探讨了肿瘤浸润B细胞在肝细胞癌肿瘤微环境中的作用及其预后价值 | 本研究首次详细探讨了肿瘤浸润B细胞在肝细胞癌微环境中的作用，并验证了其与预后的关联 | 研究主要基于生物信息学分析，未来需要更多的实验验证 | 探讨肿瘤浸润B细胞在肝细胞癌中的作用及其预后价值 | 肝细胞癌肿瘤样本中的B细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列数据 | 使用了来自Gene Expression Omnibus数据库和TCGA-LIHC数据库的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 76 | 2024-08-08 |
Tumor-infiltrated activated B cells suppress liver metastasis of colorectal cancers
2022-08-30, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111295
PMID:36044847
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了B细胞在结直肠癌肝转移中的作用及其机制 | 首次发现激活的B细胞及其亚型iMPA在结直肠癌肝转移中的显著减少，并揭示了Wnt和TGF-β信号通路在促进B细胞迁移中的作用 | NA | 探讨结直肠癌肝转移中免疫细胞的作用及其机制 | 结直肠癌患者及其肝转移情况 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 77 | 2024-08-08 |
Spatial molecular anatomy of germ layers in the gastrulating cynomolgus monkey embryo
2022-08-30, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111285
PMID:36044859
|
研究论文 | 本文研究了猕猴胚胎在原肠胚形成期间的空间分子结构，通过重建三维数字模型和空间转录组学分析，揭示了不同胚层特有的基因表达谱及其在物种间的发育协调性 | 首次对猕猴胚胎原肠胚形成期间的空间分子动态进行了时空调查，并发现了鼠和灵长类动物在胚层分离上的发育协调性及物种特异的转录程序 | NA | 探究哺乳动物胚胎发育过程中基因表达和细胞信号的空间调控与谱系指定、组织前体模式化和胚层形态发生之间的关系 | 猕猴胚胎在原肠胚形成期间的空间分子结构 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 三维数字模型 | 从E17到E21的猕猴原肠胚形成胚胎，每日时间分辨率 | NA | NA | NA | NA |
| 78 | 2024-08-08 |
A bifurcation concept for B-lymphoid/plasmacytoid dendritic cells with largely fluctuating transcriptome dynamics
2022-08-30, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111260
PMID:36044861
|
研究论文 | 本文通过干湿结合的方法，研究了人类B-浆细胞样树突状细胞（pDC）在B/NK前体区域的转录组动态波动，并提出了一种基于波动的分化模型。 | 本文首次揭示了B/pDC分叉点在IL-7Rα区域的强烈波动，并通过计算方法将剪接动力学转化为扩散动力学，验证了这些预期。 | NA | 研究树突状细胞在淋巴细胞环境中的分化路径及其转录组动态波动。 | 人类B-浆细胞样树突状细胞（pDC）及其前体细胞。 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度生成模型 | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 79 | 2024-08-08 |
Time-resolved transcriptomes reveal diverse B cell fate trajectories in the early response to Epstein-Barr virus infection
2022-08-30, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111286
PMID:36044865
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研究论文 | 本文利用单细胞转录组学构建了EB病毒感染后B细胞命运的多状态模型 | 首次通过单细胞转录组学揭示了EB病毒感染后B细胞的多种命运轨迹 | NA | 探索EB病毒感染后B细胞的基本过程和命运决策 | EB病毒感染的B淋巴细胞 | 数字病理学 | 免疫疾病 | 单细胞转录组学 | 多状态模型 | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 80 | 2024-08-08 |
Meso-seq for in-depth transcriptomics in ultra-low amounts of FACS-purified neuronal nuclei
2022-08-22, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2022.100259
PMID:36046622
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Meso-seq的中尺度转录组测序方法，能够在极少量的FACS纯化神经元核中鉴定超过10,000个稳健表达的基因 | Meso-seq方法简化了技术流程，降低了成本，并适用于多种神经科学应用，包括在小鼠和非人灵长类动物的抗体标记皮质神经元中的转录组学研究 | NA | 开发一种适用于稀疏神经元群体的转录组测序方法，以深入研究神经回路的发育和可塑性的分子机制 | FACS纯化的神经元核 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 文本 | 最少50个FACS排序的神经元核 | NA | NA | NA | NA |