单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 250 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-08-08 |
A bifurcation concept for B-lymphoid/plasmacytoid dendritic cells with largely fluctuating transcriptome dynamics
2022-08-30, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111260
PMID:36044861
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研究论文 | 本文通过干湿结合的方法，研究了人类B-浆细胞样树突状细胞（pDC）在B/NK前体区域的转录组动态波动，并提出了一种基于波动的分化模型。 | 本文首次揭示了B/pDC分叉点在IL-7Rα区域的强烈波动，并通过计算方法将剪接动力学转化为扩散动力学，验证了这些预期。 | NA | 研究树突状细胞在淋巴细胞环境中的分化路径及其转录组动态波动。 | 人类B-浆细胞样树突状细胞（pDC）及其前体细胞。 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度生成模型 | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 62 | 2024-08-08 |
Time-resolved transcriptomes reveal diverse B cell fate trajectories in the early response to Epstein-Barr virus infection
2022-08-30, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111286
PMID:36044865
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研究论文 | 本文利用单细胞转录组学构建了EB病毒感染后B细胞命运的多状态模型 | 首次通过单细胞转录组学揭示了EB病毒感染后B细胞的多种命运轨迹 | NA | 探索EB病毒感染后B细胞的基本过程和命运决策 | EB病毒感染的B淋巴细胞 | 数字病理学 | 免疫疾病 | 单细胞转录组学 | 多状态模型 | 转录组数据 | NA |
| 63 | 2024-08-08 |
Meso-seq for in-depth transcriptomics in ultra-low amounts of FACS-purified neuronal nuclei
2022-08-22, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2022.100259
PMID:36046622
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Meso-seq的中尺度转录组测序方法，能够在极少量的FACS纯化神经元核中鉴定超过10,000个稳健表达的基因 | Meso-seq方法简化了技术流程，降低了成本，并适用于多种神经科学应用，包括在小鼠和非人灵长类动物的抗体标记皮质神经元中的转录组学研究 | NA | 开发一种适用于稀疏神经元群体的转录组测序方法，以深入研究神经回路的发育和可塑性的分子机制 | FACS纯化的神经元核 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 文本 | 最少50个FACS排序的神经元核 |
| 64 | 2024-08-08 |
[Modern research on Chinese medicine based on single-cell omics: technologies and strategies]
2022-Aug, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
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研究论文 | 本文介绍了基于单细胞组学技术在现代中医药研究中的应用，包括单细胞转录组测序、空间转录组学和单细胞多模态组学等技术及其应用模式 | 单细胞组学技术为解析中医药复杂性及阐明传统中医药理论的现代科学内涵提供了新的机遇 | NA | 探讨单细胞组学技术在现代中医药研究中的策略和应用 | 中医药的复杂性和传统中医药理论的科学内涵 | NA | NA | 单细胞转录组测序、空间转录组学、单细胞多模态组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 65 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals shared immunosuppressive landscapes of mouse and human neuroblastoma
2022-08, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2022-004807
PMID:36054452
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学技术，揭示了小鼠和人类神经母细胞瘤共享的免疫抑制微环境 | 首次展示了小鼠和人类神经母细胞瘤中免疫微环境的复杂性和相似性，并发现了具有免疫抑制功能的细胞亚群 | NA | 深入理解神经母细胞瘤的肿瘤微环境，为开发新的治疗策略提供数据支持 | 小鼠神经母细胞瘤模型和人类神经母细胞瘤患者的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 儿童癌症 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 10例人类神经母细胞瘤患者活检样本 |
| 66 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome and translatome dual-omics reveals potential mechanisms of human oocyte maturation
2022-08-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-32791-2
PMID:36042231
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研究论文 | 本文开发了一种单细胞转录组和翻译组双组学方法，通过T&T-seq技术分析了小鼠和人类卵母细胞成熟过程中的转录组和翻译组特征 | 首次结合转录组和翻译组双组学方法，更准确地揭示了卵母细胞成熟过程中的基因表达调控机制 | NA | 探究人类卵母细胞成熟过程中的基因表达调控机制 | 小鼠和人类卵母细胞 | 基因组学 | NA | T&T-seq | NA | 转录组和翻译组数据 | 单细胞卵母细胞样本 |
| 67 | 2024-08-08 |
Transcriptome Analysis of Peripheral Blood Mononuclear Cells Response in Patients with Severe COVID-19 Reveals Crucial Genes Regulating Protein Ubiquitination
2022-Aug-29, Medical science monitor : international medical journal of experimental and clinical research
IF:2.2Q3
DOI:10.12659/MSM.937532
PMID:36031751
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研究论文 | 本研究通过RNA测序分析严重COVID-19患者和健康对照者的外周血单个核细胞，揭示了调控蛋白质泛素化的关键基因 | 发现蛋白质泛素化在严重COVID-19患者中的重要作用，并识别出关键基因簇和转录因子 | 样本量较小，仅包括4名患者和4名健康对照 | 深入理解严重COVID-19的生物学特征 | 严重COVID-19患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 4名严重COVID-19患者和4名健康对照 |
| 68 | 2024-08-08 |
Accurate inference of genome-wide spatial expression with iSpatial
2022-Aug-26, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abq0990
PMID:36026447
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research paper | 本文开发了一种名为iSpatial的新算法，通过整合空间转录组学和单细胞RNA测序数据集，推导出整个转录组的空间模式 | iSpatial算法在预测基因表达和空间分布方面比现有方法具有更高的准确性，并减少了原始数据集中的假阳性和假阴性信号 | NA | 提供一种计算方法，以单细胞分辨率揭示整个转录组的空间组织 | 空间转录组学和单细胞RNA测序数据集 | digital pathology | NA | RNA-seq | algorithm | spatial transcriptomic data | 多个来自不同组织和技术的空间转录组数据集 |
| 69 | 2024-08-08 |
Shared regulation and functional relevance of local gene co-expression revealed by single cell analysis
2022-08-26, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-03831-w
PMID:36028576
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研究论文 | 本文利用单细胞数据集研究了人类细胞中基因共表达的现象，并探讨了其在单细胞层面的调控机制和功能相关性 | 首次利用单细胞数据集研究基因共表达现象，揭示了共表达基因对在单细胞层面的调控元素共享情况 | NA | 探究单细胞层面基因共表达的调控机制及其功能相关性 | 人类诱导多能干细胞（iPSCs）和淋巴母细胞系（LCLs）中的基因共表达现象 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞ATAC测序（scATAC-seq） | NA | 基因表达数据 | 超过85个个体 |
| 70 | 2024-08-08 |
The heterogeneous immune landscape between lung adenocarcinoma and squamous carcinoma revealed by single-cell RNA sequencing
2022-08-26, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-022-01130-8
PMID:36008393
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示肺腺癌和鳞状细胞癌之间的异质性免疫景观 | 发现了新的淋巴细胞相关巨噬细胞集群SELENOP-Mφ，并证实其在两种癌症类型中的抗肿瘤作用 | NA | 深入分析非小细胞肺癌患者的免疫景观，以指导免疫治疗策略的选择和临床反应的预测 | 肺腺癌和肺鳞状细胞癌的免疫细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 72,475个免疫细胞来自19名非小细胞肺癌患者的40个肿瘤和匹配的正常组织样本 |
| 71 | 2024-08-08 |
Human alveolar progenitors generate dual lineage bronchioalveolar organoids
2022-08-25, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-03828-5
PMID:36008580
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析成人肺部HTII-280/EpCAM群体，揭示了富集成人干细胞签名基因的亚群，并发现肺泡祖细胞在体外器官培养中表现出谱系可塑性，能够产生肺泡或支气管细胞类型的后代。 | 本研究首次展示了肺泡祖细胞在体外器官培养中的谱系可塑性，并揭示了Wnt通路独立调控肺泡分化的机制。 | NA | 旨在阐明肺泡上皮更新的机制，并研究肺泡祖细胞的特性。 | 成人肺部的肺泡祖细胞及其在体外器官培养中的分化能力。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 成人肺部的HTII-280/EpCAM群体 |
| 72 | 2024-08-08 |
scRNA-seq of gastric tumor shows complex intercellular interaction with an alternative T cell exhaustion trajectory
2022-08-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-32627-z
PMID:35999201
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了胃癌中的肿瘤微环境，揭示了肿瘤相关基质细胞和免疫细胞的复杂相互作用及T细胞耗竭的替代途径 | 首次展示了胃癌中肿瘤相关基质细胞与免疫细胞的相互作用，并发现了一种新的T细胞耗竭途径 | NA | 探究胃癌肿瘤微环境的特定特征及其对肿瘤控制的影响 | 胃癌患者的肿瘤组织、配对肿瘤旁组织及血液中的细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 10名胃癌患者的166,533个细胞 |
| 73 | 2024-08-08 |
Integrated single-cell RNA-seq and DNA methylation reveal the effects of air pollution in patients with recurrent spontaneous abortion
2022-08-23, Clinical epigenetics
IF:4.8Q1
DOI:10.1186/s13148-022-01327-2
PMID:35999615
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和DNA甲基化数据，探讨了空气污染对复发性自然流产患者的影响及其分子机制 | 首次结合单细胞RNA测序和DNA甲基化数据，揭示了空气污染通过影响IGF2BP1启动子甲基化水平导致妊娠丢失的机制 | NA | 旨在理解复发性自然流产的机制及其与空气污染暴露的关系 | 复发性自然流产患者的蜕膜组织 | 数字病理学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、简化代表性重亚硫酸盐测序（RRBS） | 逻辑回归模型 | RNA-seq数据、甲基化数据 | 涉及复发性自然流产患者和人工流产个体的蜕膜组织数据 |
| 74 | 2024-08-08 |
Disease-associated oligodendrocyte responses across neurodegenerative diseases
2022-08-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111189
PMID:36001972
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了阿尔茨海默病和多发性硬化症的小鼠模型中少突胶质细胞的三种不同激活状态，并探讨了这些状态在疾病过程中的作用 | 首次识别出三种不同的少突胶质细胞激活状态，并揭示了这些状态在疾病过程中的空间分布和转录特征 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据相对有限，且未涉及其他神经退行性疾病 | 旨在理解少突胶质细胞在神经退行性疾病中的激活状态及其对疾病进程的影响 | 少突胶质细胞在阿尔茨海默病和多发性硬化症中的激活状态 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 小鼠模型和人类单核RNA-seq数据集 |
| 75 | 2024-08-08 |
Pituitary adenomas evade apoptosis via noxa deregulation in Cushing's disease
2022-08-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111223
PMID:36001971
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了27594个细胞，研究了库欣病（CD）垂体腺瘤的转录组特征，并发现了一种通过选择性蛋白酶体抑制来稳定noxa并诱导凋亡的治疗方法。 | 本文首次通过单细胞RNA测序技术揭示了CD腺瘤细胞中noxa的异常调控，并验证了选择性蛋白酶体抑制剂bortezomib作为抗肿瘤药物的潜力。 | 研究受限于缺乏体外模型和正常人类垂体腺的控制样本。 | 研究库欣病中垂体腺瘤逃避凋亡的机制，并探索潜在的治疗方法。 | 研究对象包括25名患者的垂体腺瘤及其邻近正常腺体细胞。 | 数字病理学 | 库欣病 | 单细胞RNA测序（RNA-seq） | NA | 细胞 | 27594个细胞 |
| 76 | 2024-08-08 |
Integrated multi-omics reveals cellular and molecular interactions governing the invasive niche of basal cell carcinoma
2022-08-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-32670-w
PMID:35986012
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研究论文 | 本文通过结合单细胞和空间转录组学技术，研究了人类基底细胞癌的侵袭性微环境，定义了促进肿瘤进展的细胞贡献者 | 本文首次揭示了基底细胞癌侵袭性微环境中细胞间的相互作用及其转录重编程，展示了综合空间和单细胞多组学技术在解析癌症特异性侵袭特性及开发靶向疗法方面的潜力 | NA | 揭示基底细胞癌侵袭性微环境中的细胞和分子相互作用 | 人类基底细胞癌的侵袭性微环境 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 77 | 2024-08-08 |
HLJ1 amplifies endotoxin-induced sepsis severity by promoting IL-12 heterodimerization in macrophages
2022-08-19, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.76094
PMID:35983991
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研究论文 | 研究探讨了HLJ1在调节内毒素诱导的脓毒症严重程度中的作用及其分子机制 | 首次揭示了HLJ1通过促进IL-12异二聚体的形成在脓毒症中的作用，并提出了针对HLJ1的治疗潜力 | NA | 研究HLJ1在调节内毒素诱导的脓毒症中的作用及其分子机制 | HLJ1在脓毒症中的作用及其对IL-12和IFN-γ的影响 | NA | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用HLJ1敲除小鼠和LPS处理的小鼠进行实验 |
| 78 | 2024-08-08 |
Vasculogenesis in kidney organoids upon transplantation
2022-Aug-19, NPJ Regenerative medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41536-022-00237-4
PMID:35986027
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研究论文 | 研究通过鸡胚腹腔移植和单细胞RNA测序技术，诱导并研究了人诱导多能干细胞衍生的肾脏类器官中的血管生成 | 展示了人肾脏类器官衍生的内皮细胞在移植后重组形成有功能的毛细血管，并与宿主血管形成嵌合血管网络 | 需要进一步研究以实现在体外有意义的肾小球成熟和肾脏形态发生 | 探索人诱导多能干细胞衍生的肾脏类器官在移植后的血管生成及其对类器官成熟的影响 | 人诱导多能干细胞衍生的肾脏类器官及其血管生成 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 79 | 2024-08-08 |
Longitudinal single-cell transcriptomics reveals distinct patterns of recurrence in acute myeloid leukemia
2022-08-19, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-022-01635-4
PMID:35986270
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了急性髓系白血病（AML）复发时克隆异质性的遗传和转录水平差异 | 本研究首次揭示了即使在具有相同初始事件的患者中，AML复发时的转录组差异也与克隆组成和进化有关 | NA | 研究AML复发时的克隆异质性及其对治疗抵抗和疾病复发的潜在机制 | 急性髓系白血病（AML）的诊断（Dx）和复发（Re）样本 | 数字病理学 | 血液癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个AML患者的诊断和复发样本 |
| 80 | 2024-08-08 |
Tumor associated macrophages-derived exosomes facilitate hepatocellular carcinoma malignance by transferring lncMMPA to tumor cells and activating glycolysis pathway
2022-Aug-19, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-022-02458-3
PMID:35986343
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research paper | 研究肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）衍生的外泌体通过转移lncMMPA至肝细胞癌（HCC）细胞并激活糖酵解途径促进肝细胞癌恶性进展的机制 | 首次揭示了TAMs通过外泌体传递lncMMPA至HCC细胞，进而影响M2巨噬细胞极化和糖代谢的机制 | NA | 探究肝细胞癌细胞与肿瘤相关巨噬细胞之间的免疫代谢相互作用的潜在机制 | 肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）和肝细胞癌（HCC）细胞 | digital pathology | 肝细胞癌 | Smart-seq based scRNA-seq, qPCR, 免疫荧光, 免疫沉淀 | NA | RNA | 使用人肝细胞癌组织中的初级TAMs进行实验，并构建小鼠异种移植模型 |