单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 250 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-06 |
A root phloem pole cell atlas reveals common transcriptional states in protophloem-adjacent cells
2022-08, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-022-01178-y
PMID:35927456
|
研究论文 | 通过单细胞测序技术构建根韧皮部细胞图谱，揭示原韧皮部筛管相邻细胞的共同转录状态 | 使用第二代单细胞方法对韧皮部进行超高分辨率分析，发现PAPL转录因子作为早期PSE相邻谱系的特征标记 | 特定细胞类型仍然难以捕获且代表性不足 | 研究根韧皮部细胞发育轨迹和基因调控网络 | 拟南芥根韧皮部细胞，特别是原韧皮部筛管相邻细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 22 | 2025-10-06 |
Origin and function of activated fibroblast states during zebrafish heart regeneration
2022-08, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01129-5
PMID:35864193
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和时空分析揭示了斑马鱼心脏再生过程中活化成纤维细胞状态的起源和功能 | 首次在斑马鱼心脏再生中发现表达胶原蛋白-12的成纤维细胞具有促再生功能，并确定这些细胞来源于心外膜和心内膜两个独立来源 | 研究仅限于斑马鱼模型，在哺乳动物中的适用性需要进一步验证 | 探索脊椎动物心脏再生的细胞机制和调控网络 | 斑马鱼心脏再生过程中的活化细胞状态 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序, 高通量谱系追踪, 时空分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 谱系追踪数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 23 | 2025-10-06 |
Circulating immune cell landscape in patients who had mild ischaemic stroke
2022-08, Stroke and vascular neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1136/svn-2021-001224
PMID:35264400
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析轻度缺血性卒中患者外周血单个核细胞的转录组变化 | 首次基于转录组分析发现轻度缺血性卒中患者NK细胞数量增加和新的单核细胞亚群 | 样本量较小（10例患者和9例对照），仅观察卒中后24小时内变化 | 了解轻度缺血性卒中后外周免疫反应机制 | 急性缺血性卒中患者和匹配对照的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 缺血性卒中 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | 10例急性缺血性卒中患者和9例种族/年龄/性别匹配的对照 | Illumina, BioRad | 单细胞RNA测序 | ddSeq, Illumina NovaSeq 6000 | ddSeqTM单细胞制备系统，Illumina NovaSeq 6000测序平台 |
| 24 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing profiling of mouse endothelial cells in response to pulmonary arterial hypertension
2022-08-24, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvab296
PMID:34528097
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析小鼠内皮细胞在肺动脉高压中的转录组变化 | 首次在单细胞分辨率下系统表征肺动脉高压中内皮细胞的动态变化，并发现跨物种保守的基因表达模式 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探究肺动脉高压中内皮细胞的功能失调机制 | 小鼠、大鼠和人类的内皮细胞 | 单细胞组学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠内皮细胞（对照和PAH模型），大鼠和人类PAH单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 25 | 2025-10-07 |
CD38 Mediates Lung Fibrosis by Promoting Alveolar Epithelial Cell Aging
2022-08-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202109-2151OC
PMID:35687485
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研究论文 | 本研究揭示了CD38通过促进肺泡上皮细胞衰老介导肺纤维化的机制 | 首次发现CD38作为主要NAD水解酶在肺泡上皮细胞衰老和肺纤维化中的关键作用，并提出靶向CD38的治疗策略 | 研究主要基于动物模型和体外实验，在人类患者中的直接证据仍需进一步验证 | 探究CD38在肺泡上皮细胞衰老和肺纤维化中的作用机制 | 肺泡上皮细胞、特发性肺纤维化患者肺组织、小鼠肺纤维化模型 | 细胞生物学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序、实时PCR、流式细胞术、Western blotting | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、细胞表型数据 | 人类IPF肺组织、年轻和年老小鼠纤维化肺组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 26 | 2025-10-07 |
Multiplexed LNP-mRNA vaccination against pathogenic coronavirus species
2022-08-02, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111160
PMID:35921835
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研究论文 | 开发针对多种致病性冠状病毒的LNP-mRNA多价疫苗并评估其免疫效果 | 首次开发针对SARS-CoV-2 Delta、SARS-CoV和MERS-CoV的三价LNP-mRNA疫苗，并通过单细胞RNA测序分析疫苗接种后的系统性免疫反应 | 研究仅在动物模型中进行，尚未进行人体临床试验 | 开发针对多种致病性冠状病毒的广谱疫苗 | SARS-CoV-2 Delta、SARS-CoV和MERS-CoV三种冠状病毒 | 疫苗开发 | 冠状病毒感染 | 单细胞RNA测序，LNP-mRNA疫苗技术 | NA | 基因表达数据，抗体反应数据 | 动物模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 27 | 2025-10-07 |
Low-ratio somatic NLRC4 mutation causes late-onset autoinflammatory disease
2022-08, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/annrheumdis-2021-221708
PMID:35428651
|
研究论文 | 本文报道一例由NLRC4体细胞突变引起的晚发性自身炎症性疾病，并通过单细胞技术揭示了其发病机制 | 首次在单细胞转录组水平系统分析NLRC4体细胞突变导致的自身炎症性疾病，并发现靶向gasdermin D可有效抑制炎症因子产生 | 仅基于单个病例研究，样本量有限 | 探究晚发性自身炎症性疾病的遗传基础和致病机制 | NLRC4体细胞突变患者的免疫细胞 | 数字病理学 | 自身炎症性疾病 | 全外显子/基因组测序,数字液滴PCR,单细胞RNA测序,细胞内细胞因子染色,定量PCR,免疫组织化学,western blotting | NA | 基因组数据,转录组数据,蛋白质数据 | 1例患者 | NA | 单细胞RNA测序,全外显子测序,全基因组测序 | NA | NA |
| 28 | 2024-12-08 |
Differential expression of single-cell RNA-seq data using Tweedie models
2022-08-15, Statistics in medicine
IF:1.8Q1
DOI:10.1002/sim.9430
PMID:35656596
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研究论文 | 本文提出使用Tweedie广义线性模型来建模跨平台单细胞RNA测序数据的技术变异性，并比较了其与现有差异表达方法的性能 | 本文提出了一种新的Tweedie广义线性模型和零膨胀Tweedie模型，用于建模单细胞RNA测序数据中的技术变异性和零膨胀现象 | NA | 研究如何更好地识别单细胞RNA测序数据中的差异表达特征 | 单细胞RNA测序数据中的差异表达特征 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | Tweedie广义线性模型 | 基因表达数据 | 使用了合成数据和已发表的基于板和液滴的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 29 | 2024-12-08 |
A public antibody class recognizes an S2 epitope exposed on open conformations of SARS-CoV-2 spike
2022-08-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-32232-0
PMID:35927266
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研究论文 | 研究了SARS-CoV-2感染和疫苗接种引发的抗体起源和特性，特别是针对S蛋白S2亚基上的非中和表位的抗体 | 发现了一类针对SARS-CoV-2 S蛋白S2亚基上非中和表位的抗体，这些表位在疫苗使用的S蛋白从原生预融合状态转变时暴露 | NA | 理解SARS-CoV-2感染和疫苗接种引发的抗体的益处和潜在不足 | SARS-CoV-2 S蛋白反应性B细胞的特征和起源 | NA | NA | 流式细胞术和单细胞测序 | NA | 细胞 | 未暴露个体的SARS-CoV-2 S蛋白反应性B细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 30 | 2024-11-19 |
Stardust: improving spatial transcriptomics data analysis through space-aware modularity optimization-based clustering
2022-08-10, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giac075
PMID:35946989
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研究论文 | 提出了一种新的空间转录组数据聚类方法Stardust，通过空间感知模块化优化进行聚类，以提高空间转录组数据的分析效果 | Stardust方法能够灵活地结合空间和转录组信息进行聚类，并提供参数自动调整和无参数版本，动态调整空间信息的贡献 | 尚未明确空间信息与转录组信息结合对聚类结果的具体改进程度 | 改进空间转录组数据的聚类分析，提高后续下游分析的准确性 | 空间转录组数据中的数据点（spots）及其聚类结果 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 聚类算法 | 空间转录组数据 | 使用了10x Genomics网站上的空间转录组数据集进行评估 | NA | NA | NA | NA |
| 31 | 2024-10-26 |
The Dynamic Role of Cardiac Macrophages in Aging and Disease
2022-08, Current cardiology reports
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s11886-022-01714-4
PMID:35595950
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综述 | 本文综述了心脏免疫景观在衰老、血流动力学应激和心肌损伤中的动态变化，重点介绍了心脏免疫细胞类型及其在心肌损伤后重塑细胞景观和促进组织重塑中的作用 | 通过单细胞转录组学和效应机制的阐明，提供了关于多种心脏疾病发病机制的新见解，并可能为治疗提供新的靶点 | NA | 探讨心脏免疫细胞在衰老和疾病中的动态作用及其在心脏病理中的机制 | 心脏巨噬细胞及其在心肌损伤后的功能 | NA | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 32 | 2024-10-26 |
Towards precision medicine in lymphoid malignancies
2022-08, Journal of internal medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.1111/joim.13423
PMID:34875132
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综述 | 本文综述了淋巴恶性肿瘤中临床相关的诊断、预后和预测生物标志物，并讨论了综合分子分析的诊断方法如何为精准诊断/医学方法的实施铺平道路 | 讨论了单细胞测序和其他组学技术在解析淋巴恶性肿瘤克隆动态和进化中的应用 | NA | 探讨淋巴恶性肿瘤中的精准医学方法 | B细胞恶性肿瘤中的诊断、预后和预测生物标志物 | 数字病理 | 淋巴瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因组和表观基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 33 | 2024-10-24 |
DETECTING MULTIPLE REPLICATING SIGNALS USING ADAPTIVE FILTERING PROCEDURES
2022-Aug, Annals of statistics
IF:3.2Q1
DOI:10.1214/21-aos2139
PMID:39421244
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研究论文 | 本文介绍了一种新的多重测试程序AdaFilter，用于检测多个研究中重复出现的信号 | AdaFilter通过自适应过滤不可能是PC零假设的候选者来提高检测能力，并证明在研究间数据独立的情况下可以控制FWER和FDR | 仅在研究间数据独立的情况下有效 | 开发一种新的多重测试方法，以提高在多个研究中检测重复信号的能力 | 在不同实验室、不同人群、不同时间等条件下重复出现的信号 | 生物信息学 | NA | 多重测试 | AdaFilter | 基因数据 | 涉及多个微阵列研究、单细胞RNA测序和GWAS研究 | NA | NA | NA | NA |
| 34 | 2024-09-23 |
Donor Macrophages Modulate Rejection After Heart Transplantation
2022-08-23, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 研究捐赠者巨噬细胞在心脏移植后调节排斥反应的作用 | 首次揭示了捐赠者巨噬细胞在心脏移植排斥反应中的关键作用，并提出了通过靶向MYD88信号通路来抑制排斥反应的新疗法 | 研究仅在老鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 探讨捐赠者巨噬细胞在心脏移植后急性细胞排斥反应中的作用 | 捐赠者和受者的巨噬细胞及其在心脏移植后的功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序、基因敲除、细胞消融 | NA | RNA | 老鼠模型中的心脏移植样本 | NA | NA | NA | NA |
| 35 | 2024-09-23 |
Droplet microfluidics for functional temporal analysis and cell recovery on demand using microvalves: application in immunotherapies for cancer
2022-08-23, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d2lc00435f
PMID:35904070
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研究论文 | 本文介绍了一种基于微阀的液滴微流控技术，用于实时功能分析和按需细胞回收，并应用于癌症免疫疗法 | 本文提出了一种自下而上的单细胞分析方法，通过微流控技术实现细胞的功能表型分析和后续的单细胞组学分析 | NA | 开发一种能够实时监测细胞毒性和空间协调性的微流控设备，并实现按需细胞回收，以应用于癌症免疫疗法 | 自然杀伤细胞（NK细胞）和肿瘤细胞 | 数字病理学 | 癌症 | 微流控技术 | NA | 细胞 | 每个液滴包含一个自然杀伤细胞和一个肿瘤细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 36 | 2024-09-23 |
Overlapping transcriptional programs promote survival and axonal regeneration of injured retinal ganglion cells
2022-08-17, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2022.06.002
PMID:35767994
|
研究论文 | 研究分析了三种干预措施对视网膜神经节细胞（RGCs）在视神经挤压（ONC）损伤后生存和轴突再生的转录程序的影响 | 通过单细胞转录组学分析，揭示了不同干预措施对RGCs生存和再生的基因表达模式，并发现过度表达与再生程序相关的基因可以增强生存和轴突再生 | 研究中使用的干预措施尚未达到临床应用的有效程度 | 揭示促进视网膜神经节细胞在损伤后生存和轴突再生的转录途径 | 视网膜神经节细胞（RGCs）及其在视神经挤压（ONC）损伤后的生存和轴突再生 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 46种视网膜神经节细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 37 | 2024-09-23 |
Single-cell transcriptome analysis of regenerating RGCs reveals potent glaucoma neural repair genes
2022-08-17, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2022.06.022
PMID:35952672
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析，研究了再生视网膜神经节细胞（RGCs）中的青光眼神经修复基因 | 开发了一种策略，能够特异性地标记和纯化再生RGCs和存活RGCs，并发现了新的再生相关基因Anxa2，其在Pten缺失诱导的轴突再生中具有显著作用 | NA | 研究青光眼神经修复的潜在基因 | 再生视网膜神经节细胞（RGCs）和存活RGCs | 数字病理学 | 青光眼 | Smart-Seq2单细胞转录组分析 | NA | 转录组 | 来自Pten缺失小鼠的再生RGCs和存活RGCs | NA | NA | NA | NA |
| 38 | 2024-09-23 |
Data-Rich Spatial Profiling of Cancer Tissue: Astronomy Informs Pathology
2022-08-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-19-3748
PMID:35522154
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研究论文 | 本文探讨了天文学中的大数据分析方法如何应用于癌症组织的空间特征分析，特别是通过多重免疫荧光（mIF）病理图像探索肿瘤微环境的组织结构 | 提出了AstroPath平台，该平台借鉴天文学的数据分析模式，用于生成和展示肿瘤免疫图谱，支持mIF免疫肿瘤生物标志物的开发 | NA | 研究天文学中的大数据分析方法如何应用于病理学，特别是肿瘤微环境的空间关系分析 | 癌症组织的空间关系，特别是肿瘤微环境的组织结构 | 数字病理学 | NA | 多重免疫荧光（mIF） | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 39 | 2024-09-23 |
Activation of Tumor-Cell STING Primes NK-Cell Therapy
2022-08-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0017
PMID:35678717
|
研究论文 | 研究报告了恶性胸膜间皮瘤细胞中STING的表达及其对STING激动剂的反应，并探讨了STING激动剂与自然杀伤细胞（NK细胞）和嵌合抗原受体NK细胞（CAR-NK细胞）联合治疗的效果 | 揭示了STING激动剂在人类肿瘤样本中激活先天性和细胞免疫疗法的基本重要性，并支持将STING激动剂与NK和CAR-NK细胞疗法结合进行测试 | NA | 研究STING激动剂在人类肿瘤中的作用机制，并开发激活有效先天性抗肿瘤免疫的联合疗法 | 恶性胸膜间皮瘤细胞、STING激动剂、自然杀伤细胞（NK细胞）和嵌合抗原受体NK细胞（CAR-NK细胞） | 免疫学 | 胸膜间皮瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 患者来源的器官型肿瘤球体 | NA | NA | NA | NA |
| 40 | 2024-09-19 |
Microenvironmental Landscape of Human Melanoma Brain Metastases in Response to Immune Checkpoint Inhibition
2022-08-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-21-0870
PMID:35706413
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研究论文 | 研究了黑色素瘤脑转移瘤（MBM）在免疫检查点抑制剂（ICI）作用下的肿瘤微环境（TME）特征 | 首次对MBM的TME进行了单细胞RNA测序和T细胞受体克隆型分析，揭示了TME中髓系细胞的异质性和中性粒细胞的不同状态，以及这些特征与ICI反应的关系 | 样本量较小，仅收集了32个新鲜MBM样本 | 探讨MBM在ICI作用下的TME特征及其与ICI反应的关系 | 黑色素瘤脑转移瘤（MBM）的肿瘤微环境（TME）和T细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 32个新鲜MBM样本 | NA | NA | NA | NA |