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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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21 | 2024-09-04 |
Single cell RNA-seq analysis reveals temporally-regulated and quiescence-regulated gene expression in Drosophila larval neuroblasts
2022-08-24, Neural development
IF:4.0Q2
DOI:10.1186/s13064-022-00163-7
PMID:36002894
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了果蝇幼虫神经母细胞在发育关键时间点的基因表达调控特征 | 发现了多种前体细胞亚型在幼虫发育过程中的基因表达变化,并报道了每类前体细胞的新候选标记物 | NA | 探究神经多样性在发育过程中的生成机制 | 果蝇幼虫中枢神经系统的神经母细胞及其基因表达调控 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个发育关键时间点的果蝇幼虫中枢神经系统样本 |
22 | 2024-09-04 |
Macrophage-Specific, Mafb-Deficient Mice Showed Delayed Skin Wound Healing
2022-Aug-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23169346
PMID:36012611
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研究论文 | 研究了巨噬细胞特异性MAFB缺陷小鼠的皮肤伤口愈合过程 | 首次揭示了MAFB在巨噬细胞中的表达对伤口愈合过程的影响 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中进行验证 | 探讨MAFB在巨噬细胞中的作用及其对伤口愈合的影响 | 巨噬细胞特异性MAFB缺陷小鼠和对照小鼠的皮肤伤口愈合 | NA | NA | 流式细胞术,免疫组织化学染色,蛋白质组分析,RT-qPCR | NA | 细胞 | 巨噬细胞特异性MAFB缺陷小鼠和对照小鼠 |
23 | 2024-09-04 |
Integrated Analysis of Cortex Single-Cell Transcriptome and Serum Proteome Reveals the Novel Biomarkers in Alzheimer's Disease
2022-Aug-01, Brain sciences
IF:2.7Q3
DOI:10.3390/brainsci12081022
PMID:36009085
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研究论文 | 本研究通过整合阿尔茨海默病(AD)中的单核RNA测序和血清蛋白质组数据,识别出与AD相关的新型细胞类型特异性生物标志物 | 本研究首次通过整合多组学数据,从大脑和血清中识别出与AD相关的新型细胞类型特异性生物标志物,并通过ELISA验证 | NA | 旨在通过整合多组学方法,探索阿尔茨海默病的新型潜在生物标志物 | 阿尔茨海默病中的神经细胞和血清蛋白质 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单核RNA测序(snRNA-seq)、血清蛋白质组学 | NA | RNA、蛋白质 | 30个人类大脑皮质样本和11个血清样本 |
24 | 2024-09-04 |
Ordered and deterministic cancer genome evolution after p53 loss
2022-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-05082-5
PMID:35978189
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研究论文 | 本文通过小鼠模型研究了p53失活后的癌症基因组进化模式 | 发现p53失活后的癌症基因组进化具有可预测的顺序性和确定性 | NA | 探究p53失活后的癌症基因组进化模式及其对肿瘤发生的影响 | 小鼠胰腺导管腺癌模型中的单细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA |
25 | 2024-09-01 |
Establishment of a reference single-cell RNA sequencing dataset for human pancreatic adenocarcinoma
2022-Aug-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104659
PMID:35847558
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研究论文 | 本文构建了一个人类胰腺导管腺癌(PDAC)的单细胞RNA测序数据集,并展示了其在重分析先前的批量转录组队列和推断细胞间通信中的应用 | 本文构建了一个包含超过70个样本和13万多个细胞的PDAC单细胞图谱,并展示了其在研究肿瘤微环境和细胞异质性中的应用 | NA | 建立一个参考的单细胞RNA测序数据集,用于研究胰腺导管腺癌的肿瘤微环境和细胞异质性 | 胰腺导管腺癌(PDAC)的细胞异质性和微环境 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | NA | 单细胞RNA测序数据 | 超过70个样本和13万多个细胞 |
26 | 2024-09-01 |
Lessons from single-cell RNA sequencing of human islets
2022-08, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-022-05699-1
PMID:35482056
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研究论文 | 本文总结了单细胞RNA测序(scRNAseq)在增进对胰岛生物学及2型糖尿病发病机制理解方面的贡献,并探讨了面临的挑战及未来发展方向 | scRNAseq技术在解析每个胰岛细胞类型的转录组方面取得了突破,有助于揭示细胞类型特异性基因表达的调控机制 | scRNAseq技术成本极高,低水平表达的基因可能无法被检测,噪声可能未得到适当过滤,且存在对某些细胞类型的选择偏差。此外,常用的计算工具可能不适用于小规模研究的scRNAseq数据分析 | 增进对胰岛作为器官的理解,并可能促进2型糖尿病治疗的改进 | 人类胰岛细胞及其在2型糖尿病中的功能 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
27 | 2024-08-24 |
Integrated multi-omics analyses identify key anti-viral host factors and pathways controlling SARS-CoV-2 infection
2022-Aug-15, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-1910932/v1
PMID:36032971
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研究论文 | 本研究通过全基因组CRISPR敲除筛选和多组学数据的综合分析,揭示了控制SARS-CoV-2感染的关键抗病毒宿主因子和途径 | 本研究发现了先前研究中遗漏的多个宿主因子,包括V-ATP酶、ESCRT和N-糖基化途径的成分,以及作为新型抗病毒途径的凝聚体复合物 | NA | 揭示控制SARS-CoV-2感染的关键抗病毒宿主因子和途径 | SARS-CoV-2感染的抗病毒宿主因子和途径 | 基因组学 | COVID-19 | CRISPR, 全基因组关联研究, 单细胞RNA测序, 宿主-病毒蛋白质或蛋白质/RNA相互作用组 | NA | 多组学数据 | NA |
28 | 2024-08-05 |
A time-resolved, multi-symbol molecular recorder via sequential genome editing
2022-Aug, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-04922-8
PMID:35794474
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研究论文 | 本文描述了DNA打字机的系统,作为一种体内分子记录的通用方法 | 提出了一种新的分子记录方法,克服了现有DNA记忆设备的限制,能够捕捉事件的顺序和同时记录多个符号 | 尚未提及具体的限制因素 | 实现体内分子记录,记录复杂事件历史和短文本信息 | 使用单细胞RNA测序重建3,257个细胞的单系谱 | 数字病理学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 3,257个细胞 |
29 | 2024-08-05 |
Understanding the cellular interactome of non-alcoholic fatty liver disease
2022-Aug, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2022.100524
PMID:35845296
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综述 | 本文主要描述了非酒精性脂肪肝疾病的细胞相互作用网络。 | 介绍了快速发展的技术如何改变我们对NAFLD/NASH中细胞相互作用网络的理解,并利用这些信息开发新疗法。 | 未提及具体的实验数据和结果,只是综述现有的研究和技术。 | 探讨非酒精性脂肪肝疾病中的细胞相互作用及其对病理的影响。 | 主要关注非酒精性脂肪肝疾病(NAFLD)及其相关病理。 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝疾病 | 单细胞基因组学、空间转录组学、单细胞配体-受体分析 | NA | NA | NA |
30 | 2024-08-05 |
Distinct functional properties of murine perinatal and adult adipose progenitor subpopulations
2022-08, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-022-00613-w
PMID:35982290
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研究论文 | 本文揭示了小鼠外源性与成年脂肪前体细胞亚群的功能差异 | 本研究首先通过单细胞转录组学揭示了围产期和成年脂肪前体细胞之间在分子和功能上的重要差异 | 研究仅集中于小鼠模型,结果的可推广性仍需进一步验证 | 探讨围产期和成年白色脂肪组织中的脂肪前体细胞的功能特性 | 研究对象为小鼠中围产期和成年白色脂肪组织中的脂肪前体细胞 | 数字病理学 | 肥胖 | 单细胞转录组学 | NA | NA | 男性小鼠的围产期和成年脂肪组织亚群 |
31 | 2024-08-05 |
A new gene set identifies senescent cells and predicts senescence-associated pathways across tissues
2022-08-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-32552-1
PMID:35974106
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研究论文 | 本研究生成了一组基因集(SenMayo),用于识别衰老细胞并预测组织中的衰老相关通路 | 该基因集能在不同组织和物种中高效识别衰老细胞,具有重要的临床应用潜力 | 尚未讨论SenMayo在其他组织类型的识别能力 | 研究衰老细胞的识别和衰老相关通路的预测 | 研究对象包括人类和小鼠的骨髓及骨组织的衰老细胞 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因数据 | 来自两个老年人类队列的骨组织活检和小鼠的基因样本 |
32 | 2024-08-05 |
Metabolic transitions define spermatogonial stem cell maturation
2022-08-25, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deac157
PMID:35856882
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研究论文 | 本研究表明人类青春前的生精细胞经历了从氧化磷酸化到厌氧代谢的显著代谢转变。 | 首次揭示了青春期前人类生精干细胞的代谢特征及其向成人代谢转变的机制。 | 人类青春前组织样本稀缺,每个年龄组样本数量有限,功能状态仅通过基因富集分析给出指示。 | 探讨生精细胞在青春前发展期间是否经历代谢改变。 | 研究对象包括人类青春前的生精细胞、鼠类和猪的生精细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 总共分析了来自3只幼鼠和2只成年鼠的生精细胞,以及不同年龄的人类生精细胞 |
33 | 2024-08-05 |
Neuropeptides and small-molecule amine transmitters: cooperative signaling in the nervous system
2022-Aug-23, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-022-04451-7
PMID:35997826
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综述 | 本文回顾了神经肽和小分子胺类传递物质在神经系统中的协同信号传递 | 提出了神经肽如何与小分子胺类传递物质共同作用于神经传递的具体机制 | 对神经肽和小分子胺类传递物质的部分机制仍未完全阐明 | 探讨神经肽与小分子胺类传递物质在神经传递中的作用 | 关于神经肽及其受体的数据,以及它们在神经元释放后的作用 | 神经生物学 | NA | 药理学和遗传学功能丧失与获得实验 | NA | 数据 | NA |
34 | 2024-08-05 |
Transcriptional responses to injury of regenerative lung alveolar epithelium
2022-Aug-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104843
PMID:35996586
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研究论文 | 这篇文章探讨了转录因子在肺泡上皮细胞再生和增殖中的作用 | 首次揭示了ATF3和THRA转录因子在肺泡上皮细胞增殖中的关键作用 | 该研究主要基于小鼠模型,可能无法完全代表人类的生物学过程 | 了解肺泡上皮再生过程中AT2细胞增殖的机制 | 小鼠模型中的AT2细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 使用Ki67基因敲入小鼠模型进行分析 |
35 | 2024-08-05 |
Single cell full-length transcriptome of human subcutaneous adipose tissue reveals unique and heterogeneous cell populations
2022-Aug-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104772
PMID:35992069
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研究论文 | 这篇文章揭示了人类皮下脂肪组织的独特且异质的细胞群体 | 采用全长单细胞RNA测序技术,首次全面分析了白色脂肪组织的转录组组成 | 与脂肪组织相比,脂肪细胞的单细胞RNA测序无法匹配其异质性 | 识别影响代谢的白色脂肪组织细胞组成的潜在变化 | 人类的皮下白色脂肪组织及其相关细胞群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用整块组织、分离的脂肪细胞和基质血管分数的单细胞样本进行分析 |
36 | 2024-08-05 |
ELF5 is a potential respiratory epithelial cell-specific risk gene for severe COVID-19
2022-08-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-31999-6
PMID:35970849
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研究论文 | 本文优先考虑了与COVID-19结局相关的候选蛋白介导因子,ELF5被认为是严重COVID-19的潜在风险基因 | 该研究首次将ELF5作为与严重COVID-19相关的特定呼吸上皮细胞风险基因进行强调 | 研究可能未能识别所有潜在的遗传因素,且尚未对所有候选基因进行全面的功能验证 | 探讨主机遗传因素如何影响COVID-19感染的预后 | 研究对象包括ELF5及其他相关蛋白介导因子与COVID-19结局的关系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和免疫组化 | NA | NA | 大型人类遗传研究 |
37 | 2024-08-05 |
Sample-multiplexing approaches for single-cell sequencing
2022-Aug-05, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-022-04482-0
PMID:35927335
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研究论文 | 本文介绍了单细胞测序的样本多重化方法 | 提出了一系列创新的样本多重化方法,克服了当前单细胞测序的高成本和效率低下的问题 | 未详细讨论每种多重化方法的具体应用和潜在局限性 | 探索如何在转录组学、表观基因组学、基因组学和多组学中提升单细胞测序的效率 | 主要研究单细胞测序中样本多重化的方法和技术 | 数字病理学 | NA | 转录组学、表观基因组学、基因组学、多组学 | NA | 细胞数据 | NA |
38 | 2024-08-05 |
Transcriptional variability accelerates preleukemia by cell diversification and perturbation of protein synthesis
2022-08-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abn4886
PMID:35921412
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研究论文 | 转录变异通过细胞多样化和蛋白质合成干扰促进了前白血病的发展 | 探讨了转录变异在前白血病进展中的作用,揭示了其通过影响细胞命运转变促进癌症演变的机制 | 主要研究集中在小鼠细胞模型中,尚未在人体细胞中验证 | 研究转录变异如何促进前癌症向癌症的进展 | 小鼠细胞中的转录变异和前白血病的形成 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
39 | 2024-08-07 |
Live, die, or regenerate? New insights from multi-omic analyses
2022-08-17, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2022.07.026
PMID:35981522
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了视网膜神经保护和视神经再生的新策略 | 通过多组学筛选和单细胞RNA测序技术,发现了轴突损伤信号转导和再生过程中的关键转录调控因子 | NA | 探索视网膜神经保护和视神经再生的分子机制 | 视网膜神经保护和视神经再生中的关键分子 | 数字病理学 | NA | 多组学分析,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
40 | 2024-08-07 |
Resolution of the curse of dimensionality in single-cell RNA sequencing data analysis
2022-08-09, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202201591
PMID:35944930
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研究论文 | 本文提出了一种名为RECODE的高维统计方法,用于解决单细胞RNA测序数据分析中的维度灾难问题 | RECODE方法不涉及维度降低,能够恢复所有基因的表达值,包括低表达基因,实现细胞命运转变的精确描绘和罕见细胞的识别 | NA | 解决单细胞RNA测序数据分析中的维度灾难问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 众多单个细胞 |