单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 250 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-06 |
Differentiation of crescent-forming kidney progenitor cells into podocytes attenuates severe glomerulonephritis in mice
2022-08-10, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abg3277
PMID:35947676
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研究论文 | 本研究揭示了新月体肾小球肾炎中新月体形成的细胞来源机制，并证明组蛋白去乙酰化酶抑制剂panobinostat可通过促进肾脏祖细胞向足细胞分化来缓解疾病 | 首次发现新月体来源于单个未成熟壁层上皮细胞的克隆扩增，并证实panobinostat可诱导未成熟壁层上皮细胞亚群向足细胞分化 | 研究主要基于小鼠模型，人类细胞仅进行了体外实验 | 探究新月体肾小球肾炎的分子机制和治疗策略 | Pax2Cre报告基因小鼠模型、人类肾脏祖细胞 | 肾脏病学 | 新月体肾小球肾炎 | 单细胞RNA测序, 三维共聚焦显微镜, 受激发射损耗超分辨率成像 | NA | 基因表达数据, 显微镜图像 | 两种小鼠模型和人类细胞体外实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 22 | 2025-10-06 |
SMaSH: a scalable, general marker gene identification framework for single-cell RNA-sequencing
2022-Aug-08, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-022-04860-2
PMID:35941549
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研究论文 | 提出一种可扩展的通用标记基因识别框架SMaSH，用于单细胞RNA测序数据分析 | 首个强调针对特定细胞表型进行下游研究的标记基因计算方法，在空间转录组学数据中验证了其识别高度局部化细胞区室的能力 | NA | 开发高效可靠的计算框架来识别细胞类型特异性标记基因 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型特异性基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 计算框架 | 基因表达数据 | 数十万细胞，跨越50多种细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 23 | 2025-10-06 |
Transcriptional variability accelerates preleukemia by cell diversification and perturbation of protein synthesis
2022-08-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abn4886
PMID:35921412
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研究论文 | 本研究探讨转录变异性通过细胞多样化和蛋白质合成扰动加速前白血病进展的机制 | 首次揭示转录变异性通过破坏核糖体生物发生和蛋白质合成促进白血病进展的新机制 | 研究基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 探究转录变异性在白血病前期向白血病转变过程中的作用机制 | 具有增强转录变异性的小鼠前白血病细胞 | 单细胞基因组学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 24 | 2025-10-06 |
Single cell multi-omics characterise discrete human tendon cells populations that persist in vitro and on fibrous scaffolds
2022-08-02, European cells & materials
IF:3.2Q1
DOI:10.22203/eCM.v044a01
PMID:35916474
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学技术鉴定并表征了在体外培养和纤维支架上持续存在的人类肌腱细胞亚群 | 首次结合单细胞表面蛋白质组学和单细胞转录组学(CITE-Seq)鉴定人类肌腱细胞亚群，并发现特定细胞亚群在排列电纺纤维支架上的选择性存活 | 研究仅使用健康人类腘绳肌腱细胞，未涉及病变肌腱组织；体外培养时间较短(8天) | 确定人类肌腱细胞亚群在体外培养条件下的持续性及其对纤维支架的响应 | 健康人类腘绳肌腱细胞 | 单细胞多组学 | 肌腱疾病 | CITE-Seq, 单细胞表面蛋白质组学, 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 表面蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 25 | 2025-10-06 |
Medulloblastoma group 3 and 4 tumors comprise a clinically and biologically significant expression continuum reflecting human cerebellar development
2022-08-02, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111162
PMID:35926460
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研究论文 | 本研究通过RNA测序分析发现髓母细胞瘤第3组和第4组肿瘤构成反映人类小脑发育的转录连续体 | 首次揭示髓母细胞瘤第3组和第4组构成双向转录连续体，并发现其与胎儿小脑发育细胞类型的对应关系 | NA | 探究髓母细胞瘤第3组和第4组的转录特征及其发育起源 | 髓母细胞瘤患者肿瘤样本 | 生物信息学 | 髓母细胞瘤 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据, 单细胞RNA测序数据 | 大型注释队列的髓母细胞瘤样本 | NA | RNA-seq, scRNA-seq | NA | NA |
| 26 | 2025-10-06 |
Into the multiverse: advances in single-cell multiomic profiling
2022-08, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2022.03.015
PMID:35537880
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综述 | 本文综述了单细胞多组学分析技术的最新进展及其在生物学研究中的应用 | 系统总结了单细胞多组学技术的最新发展，强调从单一转录组测量向多层级组学整合的转变 | NA | 探讨单细胞多组学分析技术在揭示细胞调控机制和功能方面的潜力 | 单个细胞的基因组、表观基因组、转录组和蛋白质组 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学分析 | NA | 基因组数据, 表观基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据 | 数千个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 27 | 2025-10-06 |
Pituitary corticotroph identity and receptor-mediated signaling: a transcriptomics perspective
2022-Aug, Current opinion in endocrine and metabolic research
DOI:10.1016/j.coemr.2022.100364
PMID:36177190
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综述 | 从转录组学角度探讨垂体促肾上腺皮质激素细胞的分子特征及其受体介导的信号通路 | 整合单细胞RNA测序数据与经典文献，首次系统揭示促肾上腺皮质激素细胞中G蛋白偶联受体及其下游信号通路的完整基因表达谱 | 基于已有数据的二次分析，缺乏实验验证；主要聚焦基因表达模式，未涉及蛋白功能验证 | 系统解析垂体促肾上腺皮质激素细胞的分子特征和信号传导机制 | 垂体促肾上腺皮质激素细胞及其受体信号通路相关基因 | 转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 28 | 2025-10-06 |
A root phloem pole cell atlas reveals common transcriptional states in protophloem-adjacent cells
2022-08, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-022-01178-y
PMID:35927456
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研究论文 | 通过单细胞测序技术构建根韧皮部细胞图谱，揭示原韧皮部筛管相邻细胞的共同转录状态 | 使用第二代单细胞方法对韧皮部进行超高分辨率分析，发现PAPL转录因子作为早期PSE相邻谱系的特征标记 | 特定细胞类型仍然难以捕获且代表性不足 | 研究根韧皮部细胞发育轨迹和基因调控网络 | 拟南芥根韧皮部细胞，特别是原韧皮部筛管相邻细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 29 | 2025-10-06 |
Circulating immune cell landscape in patients who had mild ischaemic stroke
2022-08, Stroke and vascular neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1136/svn-2021-001224
PMID:35264400
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析轻度缺血性卒中患者外周血单个核细胞的转录组变化 | 首次基于转录组分析发现轻度缺血性卒中患者NK细胞数量增加和新的单核细胞亚群 | 样本量较小（10例患者和9例对照），仅观察卒中后24小时内变化 | 了解轻度缺血性卒中后外周免疫反应机制 | 急性缺血性卒中患者和匹配对照的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 缺血性卒中 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | 10例急性缺血性卒中患者和9例种族/年龄/性别匹配的对照 | Illumina, BioRad | 单细胞RNA测序 | ddSeq, Illumina NovaSeq 6000 | ddSeqTM单细胞制备系统，Illumina NovaSeq 6000测序平台 |
| 30 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing profiling of mouse endothelial cells in response to pulmonary arterial hypertension
2022-08-24, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvab296
PMID:34528097
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析小鼠内皮细胞在肺动脉高压中的转录组变化 | 首次在单细胞分辨率下系统表征肺动脉高压中内皮细胞的动态变化，并发现跨物种保守的基因表达模式 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探究肺动脉高压中内皮细胞的功能失调机制 | 小鼠、大鼠和人类的内皮细胞 | 单细胞组学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠内皮细胞（对照和PAH模型），大鼠和人类PAH单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 31 | 2025-10-07 |
CD38 Mediates Lung Fibrosis by Promoting Alveolar Epithelial Cell Aging
2022-08-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202109-2151OC
PMID:35687485
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研究论文 | 本研究揭示了CD38通过促进肺泡上皮细胞衰老介导肺纤维化的机制 | 首次发现CD38作为主要NAD水解酶在肺泡上皮细胞衰老和肺纤维化中的关键作用，并提出靶向CD38的治疗策略 | 研究主要基于动物模型和体外实验，在人类患者中的直接证据仍需进一步验证 | 探究CD38在肺泡上皮细胞衰老和肺纤维化中的作用机制 | 肺泡上皮细胞、特发性肺纤维化患者肺组织、小鼠肺纤维化模型 | 细胞生物学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序、实时PCR、流式细胞术、Western blotting | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、细胞表型数据 | 人类IPF肺组织、年轻和年老小鼠纤维化肺组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 32 | 2025-10-07 |
Multiplexed LNP-mRNA vaccination against pathogenic coronavirus species
2022-08-02, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111160
PMID:35921835
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研究论文 | 开发针对多种致病性冠状病毒的LNP-mRNA多价疫苗并评估其免疫效果 | 首次开发针对SARS-CoV-2 Delta、SARS-CoV和MERS-CoV的三价LNP-mRNA疫苗，并通过单细胞RNA测序分析疫苗接种后的系统性免疫反应 | 研究仅在动物模型中进行，尚未进行人体临床试验 | 开发针对多种致病性冠状病毒的广谱疫苗 | SARS-CoV-2 Delta、SARS-CoV和MERS-CoV三种冠状病毒 | 疫苗开发 | 冠状病毒感染 | 单细胞RNA测序，LNP-mRNA疫苗技术 | NA | 基因表达数据，抗体反应数据 | 动物模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 33 | 2025-10-07 |
Low-ratio somatic NLRC4 mutation causes late-onset autoinflammatory disease
2022-08, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/annrheumdis-2021-221708
PMID:35428651
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研究论文 | 本文报道一例由NLRC4体细胞突变引起的晚发性自身炎症性疾病，并通过单细胞技术揭示了其发病机制 | 首次在单细胞转录组水平系统分析NLRC4体细胞突变导致的自身炎症性疾病，并发现靶向gasdermin D可有效抑制炎症因子产生 | 仅基于单个病例研究，样本量有限 | 探究晚发性自身炎症性疾病的遗传基础和致病机制 | NLRC4体细胞突变患者的免疫细胞 | 数字病理学 | 自身炎症性疾病 | 全外显子/基因组测序,数字液滴PCR,单细胞RNA测序,细胞内细胞因子染色,定量PCR,免疫组织化学,western blotting | NA | 基因组数据,转录组数据,蛋白质数据 | 1例患者 | NA | 单细胞RNA测序,全外显子测序,全基因组测序 | NA | NA |
| 34 | 2024-12-08 |
Differential expression of single-cell RNA-seq data using Tweedie models
2022-08-15, Statistics in medicine
IF:1.8Q1
DOI:10.1002/sim.9430
PMID:35656596
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研究论文 | 本文提出使用Tweedie广义线性模型来建模跨平台单细胞RNA测序数据的技术变异性，并比较了其与现有差异表达方法的性能 | 本文提出了一种新的Tweedie广义线性模型和零膨胀Tweedie模型，用于建模单细胞RNA测序数据中的技术变异性和零膨胀现象 | NA | 研究如何更好地识别单细胞RNA测序数据中的差异表达特征 | 单细胞RNA测序数据中的差异表达特征 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | Tweedie广义线性模型 | 基因表达数据 | 使用了合成数据和已发表的基于板和液滴的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 35 | 2024-12-08 |
A public antibody class recognizes an S2 epitope exposed on open conformations of SARS-CoV-2 spike
2022-08-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-32232-0
PMID:35927266
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研究论文 | 研究了SARS-CoV-2感染和疫苗接种引发的抗体起源和特性，特别是针对S蛋白S2亚基上的非中和表位的抗体 | 发现了一类针对SARS-CoV-2 S蛋白S2亚基上非中和表位的抗体，这些表位在疫苗使用的S蛋白从原生预融合状态转变时暴露 | NA | 理解SARS-CoV-2感染和疫苗接种引发的抗体的益处和潜在不足 | SARS-CoV-2 S蛋白反应性B细胞的特征和起源 | NA | NA | 流式细胞术和单细胞测序 | NA | 细胞 | 未暴露个体的SARS-CoV-2 S蛋白反应性B细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 36 | 2024-11-19 |
Stardust: improving spatial transcriptomics data analysis through space-aware modularity optimization-based clustering
2022-08-10, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giac075
PMID:35946989
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研究论文 | 提出了一种新的空间转录组数据聚类方法Stardust，通过空间感知模块化优化进行聚类，以提高空间转录组数据的分析效果 | Stardust方法能够灵活地结合空间和转录组信息进行聚类，并提供参数自动调整和无参数版本，动态调整空间信息的贡献 | 尚未明确空间信息与转录组信息结合对聚类结果的具体改进程度 | 改进空间转录组数据的聚类分析，提高后续下游分析的准确性 | 空间转录组数据中的数据点（spots）及其聚类结果 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 聚类算法 | 空间转录组数据 | 使用了10x Genomics网站上的空间转录组数据集进行评估 | NA | NA | NA | NA |
| 37 | 2024-10-26 |
The Dynamic Role of Cardiac Macrophages in Aging and Disease
2022-08, Current cardiology reports
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s11886-022-01714-4
PMID:35595950
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综述 | 本文综述了心脏免疫景观在衰老、血流动力学应激和心肌损伤中的动态变化，重点介绍了心脏免疫细胞类型及其在心肌损伤后重塑细胞景观和促进组织重塑中的作用 | 通过单细胞转录组学和效应机制的阐明，提供了关于多种心脏疾病发病机制的新见解，并可能为治疗提供新的靶点 | NA | 探讨心脏免疫细胞在衰老和疾病中的动态作用及其在心脏病理中的机制 | 心脏巨噬细胞及其在心肌损伤后的功能 | NA | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 38 | 2024-10-26 |
Towards precision medicine in lymphoid malignancies
2022-08, Journal of internal medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.1111/joim.13423
PMID:34875132
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综述 | 本文综述了淋巴恶性肿瘤中临床相关的诊断、预后和预测生物标志物，并讨论了综合分子分析的诊断方法如何为精准诊断/医学方法的实施铺平道路 | 讨论了单细胞测序和其他组学技术在解析淋巴恶性肿瘤克隆动态和进化中的应用 | NA | 探讨淋巴恶性肿瘤中的精准医学方法 | B细胞恶性肿瘤中的诊断、预后和预测生物标志物 | 数字病理 | 淋巴瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因组和表观基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 39 | 2024-10-24 |
DETECTING MULTIPLE REPLICATING SIGNALS USING ADAPTIVE FILTERING PROCEDURES
2022-Aug, Annals of statistics
IF:3.2Q1
DOI:10.1214/21-aos2139
PMID:39421244
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研究论文 | 本文介绍了一种新的多重测试程序AdaFilter，用于检测多个研究中重复出现的信号 | AdaFilter通过自适应过滤不可能是PC零假设的候选者来提高检测能力，并证明在研究间数据独立的情况下可以控制FWER和FDR | 仅在研究间数据独立的情况下有效 | 开发一种新的多重测试方法，以提高在多个研究中检测重复信号的能力 | 在不同实验室、不同人群、不同时间等条件下重复出现的信号 | 生物信息学 | NA | 多重测试 | AdaFilter | 基因数据 | 涉及多个微阵列研究、单细胞RNA测序和GWAS研究 | NA | NA | NA | NA |
| 40 | 2024-09-23 |
Donor Macrophages Modulate Rejection After Heart Transplantation
2022-08-23, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 研究捐赠者巨噬细胞在心脏移植后调节排斥反应的作用 | 首次揭示了捐赠者巨噬细胞在心脏移植排斥反应中的关键作用，并提出了通过靶向MYD88信号通路来抑制排斥反应的新疗法 | 研究仅在老鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 探讨捐赠者巨噬细胞在心脏移植后急性细胞排斥反应中的作用 | 捐赠者和受者的巨噬细胞及其在心脏移植后的功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序、基因敲除、细胞消融 | NA | RNA | 老鼠模型中的心脏移植样本 | NA | NA | NA | NA |