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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2024-08-08 |
Integrative spatial analysis of cell morphologies and transcriptional states with MUSE
2022-08, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01251-z
PMID:35347329
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为MUSE的多模态结构化嵌入方法,用于整合细胞形态学和空间解析的转录组数据,以表征细胞和组织区域 | MUSE能够发现单一模态可能遗漏的组织亚群,并补偿模态特定的噪声 | NA | 开发一种方法来整合细胞形态学和空间解析的转录组数据,以深入理解细胞状态、功能和复杂生物组织中的组织结构 | 细胞和组织区域 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | MUSE | 图像和转录组数据 | 多种数据集,包括健康和疾病的大脑皮质及肠道组织 | NA | NA | NA | NA |
| 242 | 2024-08-08 |
Endothelial OCT4 is atheroprotective by preventing metabolic and phenotypic dysfunction
2022-08-24, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvac036
PMID:35325071
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研究论文 | 本文探讨了OCT4在血管内皮细胞中的保护作用及其机制 | 首次证明了OCT4在血管内皮细胞中具有保护性的代谢功能,并揭示了OCT4/ABCG2轴在维持内皮细胞代谢稳态中的作用 | NA | 研究OCT4在血管内皮细胞中的功能及其对动脉粥样硬化的影响 | 血管内皮细胞中的OCT4 | NA | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 243 | 2024-08-08 |
Spatial charting of single-cell transcriptomes in tissues
2022-08, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01233-1
PMID:35314812
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研究论文 | 本文开发了一种名为CellTrek的计算方法,结合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,实现单细胞的空间映射 | CellTrek通过共同嵌入和度量学习方法,将单细胞转录组数据与空间信息相结合,实现了单细胞的空间映射 | NA | 开发一种能够结合单细胞RNA测序和空间转录组学数据的方法,以实现单细胞的空间映射 | 小鼠大脑和肾脏组织,以及两个原位导管癌组织 | 生物信息学 | 原位导管癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 共同嵌入和度量学习 | 转录组数据 | 两个原位导管癌组织 | NA | NA | NA | NA |
| 244 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome profile of mouse skin undergoing antigen-driven allergic inflammation recapitulates findings in atopic dermatitis skin lesions
2022-08, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2022.03.002
PMID:35300986
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了经抗原驱动的过敏性炎症的小鼠皮肤,并与特应性皮炎皮肤病变中的发现进行了比较 | 揭示了小鼠皮肤中与特应性皮炎皮肤病变相似的基因表达特征,并发现了可能参与过敏性皮肤炎症的新通路 | NA | 研究小鼠皮肤在抗原驱动过敏性炎症中的单细胞基因表达特征,并与人类特应性皮炎皮肤病变进行比较 | 小鼠皮肤细胞在抗原驱动过敏性炎症中的基因表达 | 数字病理学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 小鼠皮肤细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 245 | 2024-08-08 |
Transcriptional switch of hepatocytes initiates macrophage recruitment and T-cell suppression in endotoxemia
2022-08, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2022.02.028
PMID:35276271
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了在败血症中,肝脏细胞群及其相互通信在免疫防御调节中的关键作用 | 发现了促炎性肝细胞亚群,并阐明了其在败血症中通过CCL2-CCR2相互作用招募巨噬细胞的关键作用 | NA | 探究肝脏细胞在急性系统性感染中的免疫防御调节作用 | 健康和败血症小鼠的单个肝细胞 | NA | 败血症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 19,795个单个肝细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 246 | 2024-08-08 |
A decade of molecular cell atlases
2022-08, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2022.01.004
PMID:35105475
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评论 | 本文讨论了利用单细胞转录组测序技术创建细胞图谱的历史和技术创新 | 介绍了单细胞转录组测序技术在创建细胞图谱方面的进展 | NA | 探讨细胞图谱的发展及其对理解细胞类型多样性的贡献 | 细胞类型的分子特征 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 247 | 2024-08-08 |
Integrated Analysis of Single-Cell and Spatial Transcriptomics in Keloids: Highlights on Fibrovascular Interactions in Keloid Pathogenesis
2022-08, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2022.01.017
PMID:35123990
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术,分析了瘢痕疙瘩组织及其正常皮肤对照样本,揭示了瘢痕疙瘩发病机制中的纤维血管相互作用。 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,详细描绘了瘢痕疙瘩的细胞图谱,并发现了纤维细胞与内皮细胞之间的显著相互作用。 | 研究仅限于瘢痕疙瘩组织样本,未涉及其他类型的皮肤病变,可能限制了结果的普遍性。 | 探究瘢痕疙瘩的病理生理机制,特别是纤维细胞与内皮细胞在瘢痕疙瘩形成中的相互作用。 | 瘢痕疙瘩组织及其正常皮肤对照样本,以及患者匹配的瘢痕疙瘩和正常成熟瘢痕。 | 数字病理学 | 瘢痕疙瘩 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 248 | 2024-08-08 |
Translational pediatrics: clinical perspective for Phelan-McDermid syndrome and autism research
2022-08, Pediatric research
IF:3.1Q1
DOI:10.1038/s41390-021-01806-x
PMID:34702975
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研究论文 | 本文探讨了Phelan-McDermid综合征(PMS)及其与自闭症谱系障碍(ASD)的关系,利用诱导多能干细胞(iPS)技术开发脑类器官和微胶质细胞,并通过单细胞RNA测序探索神经发育障碍的病理生理学 | 利用iPS细胞技术开发脑类器官和微胶质细胞,以及通过单细胞RNA测序揭示人类特异性基因在皮质发育中的独特表达 | NA | 旨在通过患者来源的疾病模型识别SHANK3在人类大脑发育中的未知功能,并为PMS和其他疾病提供治疗见解 | Phelan-McDermid综合征患者及其脑类器官和微胶质细胞 | 数字病理学 | 自闭症 | 单细胞RNA测序 | 脑类器官 | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 249 | 2024-08-08 |
Lineage tracing and single-cell analysis reveal proliferative Prom1+ tumour-propagating cells and their dynamic cellular transition during liver cancer progression
2022-08, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2021-324321
PMID:34588223
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研究论文 | 本研究通过体内谱系追踪和单细胞RNA测序揭示了Prom1+肝细胞癌细胞的异质性和动态变化 | 结合体内谱系追踪和单细胞RNA测序技术,首次揭示了Prom1+肝细胞癌细胞的异质性和动态变化,以及其在肝细胞癌进展中的机制作用 | NA | 研究肝细胞癌中Prom1+细胞的异质性和特性 | 肝细胞癌中的Prom1+细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用Prom1C-L/+; Rosa26tdTomato/+和Prom1C-L/+; Rosa26DTA/+小鼠模型进行研究 | NA | NA | NA | NA |
| 250 | 2024-08-08 |
Residual homing of α4β7-expressing β1+PI16+ regulatory T cells with potent suppressive activity correlates with exposure-efficacy of vedolizumab
2022-08, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2021-324868
PMID:34462337
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研究论文 | 研究探讨了抗α4β7整合素抗体vedolizumab在治疗炎症性肠病(IBD)中的非线性暴露-疗效特性及其机制 | 发现了vedolizumab治疗中一种具有显著调节特性的'抵抗'α4β7表达β1+PI16+调节T细胞亚群 | NA | 确定vedolizumab在治疗炎症性肠病中非线性暴露-疗效特性的机制 | 超过500个样本,来自300多名受试者的T细胞 | 免疫学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 超过500个样本,来自300多名受试者 | NA | NA | NA | NA |